Amanda Fanelli de Souza

Doutora em Biotecnologia Industrial pela Universidade de São Paulo (EEL-USP), com um ano de doutorado sanduíche nos Estados Unidos (PDSE-CAPES) no U.S Dairy Forage Research Center, United States Department of Agriculture (USDA-ARS), em Madison, Wisconsin, Estados Unidos. Engenheira Bioquímica pela Universidade de São Paulo (EEL-USP). Atuo na área de biotecnologia vegetal e conversão de biomassa. Tenho conhecimento nas áreas de bioquímica, biologia molecular e bioinformática. Tenho experiência em projetos focados na modificação da composição química da parede celular de plantas por meio de engenharia genética, gerando plantas modelo que podem ser utilizadas em biorefinarias para produção mais eficiente de bioprodutos e bioenergia.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biotecnologia

2015 - 2019

Universidade de São Paulo
Título: Análise filogenética e caracterização funcional de genes BAHD de cana-de-açúcar potencialmente envolvidos com a incorporação de ácidos hidroxicinâmicos na parede celular
Orientador: em United States Department of Agriculture ( Ronald D. Hatfield)
com Elisson Antonio da Costa Romanel. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Cana-de-açúcar; Conversão de biomassa; Biologia molecular.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Graduação em Engenharia Bioquímica

2011 - 2015

Universidade de São Paulo

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Formação complementar

2019 - 2019

I Curso de Verão em Biotecnologia do ICT-UNIFESP. (Carga horária: 80h). , Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.

2019 - 2019

CRISPR-Cas9 Introdução e aplicação na edição de genomas. (Carga horária: 4h). , Customer Experience Center, Thermo FIsher Scientific, CEC, Brasil.

2019 - 2019

Redação de Patentes, Além dos Guias. (Carga horária: 12h). , Axonal Consultoria Tecnológica, AXONAL, Brasil.

2018 - 2018

Estatistica Experimental no Software R. (Carga horária: 8h). , Experimental Analytics Corporation, EAC, Brasil.

2016 - 2016

Introdução à Bioinformática genômica e à filogenômica. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2014 - 2014

Introdução ao Lean Six Sigma. (Carga horária: 8h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

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Participação em eventos

VII Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas. Genome-wide identification of the BAHD superfamily in grasses and functional analysis of maize lines overexpressing putative coding p-hydroxycinnamates sugarcane gene. 2019. (Congresso).

62 Congresso Brasileiro de Genética. Phylogenetics and expression analysis of BAHD acyltransferases in sugarcane. 2016. (Congresso).

II Workshop on Bioenergy, Renewable Energy and Green Building.Phylogenomics of BAHD acyltransferases in grasses. 2016. (Simpósio).

VII Semana de Biotecnologia.Filogenômica e transcriptômica da família BAHD aciltransferase em cana-de-açúcar. 2016. (Simpósio).

VI Semana de Biotecnologia Industrial - Transgênicos na Indústria e e no agronegócio.Identificação e Evolução de genes BAHD aciltransferases em gramíneas. 2015. (Simpósio).

Workshop next generation sequencing. 2015. (Outra).

V Semana de Biotecnologia Industrial. 2014. (Simpósio).

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Participação em bancas

Aluno: Larissa Wurzbacher Crema

SEGATO, F.;SOUZA, A. F.; RODRIGUES, R. C. L. B.. Avaliação da viabilidade de produção do composto terpinen-4-ol por vias biotecnológicas. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Camila Lima de Souza Carvalho

SOUZA, A. F.. Desenvolvimento de análise de transcriptomas para identificação de genes alvo. 2020. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

FANELLI, A.. 26 SIICUSP - Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da Universidade de São Paulo. 2018. Universidade de São Paulo.

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Comissão julgadora das bancas

Fernando Segato

Segato, F.. Identificação e evolução de genes transferases nos vegetais. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Bioquímica) - Escola de Engenharia de Lorena - USP.

Igor Cesarino

FERREIRA, M. A.; FERRAZ, A. L.;CESARINO, I.; ROMANEL, E. A. C.. Análise filogenética e caracterização funcional de genes BAHD de cana-de-açúcar potencialmente envolvidos com a incorporação de ácidos hidroxicinâmicos na parede celular. 2019. Tese (Doutorado em Biotecnologia Industrial) - Universidade de São Paulo.

Elisson Antônio da Costa Romanel

Romanel, Elisson; CESARINO, IGOR; FERRAZ, A. L.; ALVES-FERREIRA, M.. Análise filogenética e caracterização funcional de genes BAHD de cana-de-açúcar potencialmente envolvidos com a incorporação de ácidos hidroxicinâmicos na parede celular. 2019. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Biotecnologia Industrial) - Escola de Engenharia de Lorena/Universidade de São Paulo.

Elisson Antônio da Costa Romanel

ROMANEL, E. A. C.; Correa, Regis L; RIANO-PACHON, D. M.. Genômica comparativa e caracterização funcional de genes de cana-de-açúcar envolvidos na incorporação de ácidos hidroxicinâmicos na parede celular. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia Industrial) - Escola de Engenharia de Lorena/Universidade de São Paulo.

Germano Andrade Siqueira

SIQUEIRA, Germano Andrade. Identificação e evolução de genes transferases nos vegetais. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Engenharia Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

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Orientou

Fernanda Montanger Pinheiro

Genotipagem e análise da expressão gênica de milho (Zea mays L; ) Contendo genes de cana-de-açúcar (Saccharum spp; ) envolvidos na incorporação de ácidos hidroxicinâmicos; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Programa Unificado de Bolsas para Estudantes de Graduação; Orientador: Amanda Fanelli de Souza;

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Foi orientado por

Elisson Antônio da Costa Romanel

Analise filogenética e caracterização funcional de genes BAHD de cana-de-açúcar potencialmente envolvidos com a incorporação de ácidos hidroxicinâmicos na parede celular; 2019; Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Biotecnologia Industrial) - Escola de Engenharia de Lorena/Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Elisson Antonio da Costa Romanel;

Elisson Antônio da Costa Romanel

Identificação e Evolução de Genes Transferase em Vegetais; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Engenharia Bioquímica) - Escola de Engenharia de Lorena/Universidade de São Paulo; Orientador: Elisson Antonio da Costa Romanel;

Elisson Antônio da Costa Romanel

Identificação de Genes Transferase em Cana-de-Açúcar; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia Bioquímica) - Escola de Engenharia de Lorena/Universidade de São Paulo; Orientador: Elisson Antonio da Costa Romanel;

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Produções bibliográficas

  • FANELLI, AMANDA ; RANCOUR, DAVID M. ; SULLIVAN, MICHAEL ; KARLEN, STEVEN D. ; RALPH, JOHN ; RIAO-PACHÓN, DIEGO MAURICIO ; VICENTINI, RENATO ; SILVA, TATIANE DA FRANCA ; FERRAZ, ANDRÉ ; HATFIELD, RONALD D. ; ROMANEL, ELISSON . Overexpression of a Sugarcane BAHD Acyltransferase Alters Hydroxycinnamate Content in Maize Cell Wall. Frontiers in Plant Science , v. 12, p. 1, 2021.

  • FANELLI, AMANDA ; REINHARDT, LAURIE ; MATSUOKA, SIZUO ; FERRAZ, ANDRÉ ; DA FRANCA SILVA, TATIANE ; HATFIELD, RONALD D. ; ROMANEL, ELISSON . Biomass composition of two new energy cane cultivars compared with their ancestral Saccharum spontaneum during internode development. BIOMASS & BIOENERGY , v. 141, p. 105696, 2020.

  • MOURA, MARIANNA O. ; FAUSTO, ANNA KAROLINE S. ; FANELLI, AMANDA ; GUEDES, FERNANDA A. DE F. ; SILVA, TATIANE DA F. ; ROMANEL, ELISSON ; VASLIN, MAITE F. S. . Genome-wide identification of the Dicer-like family in cotton and analysis of the DCL expression modulation in response to biotic stress in two contrasting commercial cultivars. BMC PLANT BIOLOGY , v. 19, p. 503, 2019.

  • CESARINO, IGOR ; SIMÕES, MARCELLA SIQUEIRA ; DOS SANTOS BRITO, MICHAEL ; FANELLI, AMANDA ; DA FRANCA SILVA, TATIANE ; ROMANEL, ELISSON . Building the wall: recent advances in understanding lignin metabolism in grasses. Acta Physiologiae Plantarum , v. 38, p. 1-14, 2016.

  • FANELLI, A. ; KARLEN, S. D. ; RALPH, J. ; RANCOUR, D. M. ; RIANO-PACHON, D. M. ; VICENTINI, R. ; FERRAZ, A. L. ; SILVA, T. F. ; HATFIELD, R. D. ; ROMANEL, ELISSON . Genome-wide identification of the BAHD superfamily in grasses and functional analysis of maize lines overexpressing putative coding p-hydroxycinnamates sugarcane gene. In: VII Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas, 2019, Campos do Jordão. VII Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas, 2019.

  • PINHEIRO, F. M. ; FANELLI, AMANDA ; ROMANEL, ELISSON . Análise da Expressão de genes BAHD em cana-de-açúcar (Saccharum spontaneum) potencialmente envolvidos na incorporação de ácidos hidroxicinâmicos. In: 27 Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP, 2019, Lorena. 27 Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP, 2019.

  • FANELLI, AMANDA ; RANCOUR, D. M. ; RIANO-PACHON, D. M. ; VICENTINI, R. ; FERRAZ, A. L. ; SILVA, T. F. ; HATFIELD, R. D. ; ROMANEL, ELISSON . Caracterização Funcional de Milho Geneticamente Modificado contendo os Genes de Cana-de-Açúcar (Saccharum spp.) possivelmente envolvidos na Biossíntese dos Ácidos Hidroxicinâmicos. In: IX Semana de Biotecnologia Industrial, 2018, Lorena. IX Semana de Biotecnologia Industrial, 2018.

  • FANELLI, A. ; FALCAO, T. ; PIOVEZANI, A. ; BUCKERIDGE, M. ; SANTOS, R. V. ; RIANO-PACHON, D. M. ; FERRAZ, A. L. ; SILVA, T. F. ; ROMANEL, ELISSON . Identificantion, phylogeny and expression analysis of putative coding p-hydroxicinnamates genes from Saccharum spp. In: Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2017, Campos do Jordão-SP. Proceedings of the brazilian bioenergy science and technology conference 2017 (BBEST 2017), 2017. p. 72-73.

  • SOUZA, A. F. ; ROMANEL, E. A. C. . Filogenômica dos genes BAHD aciltransferases em gramíneas. In: II Workshop on Bioenergy, Renewable Energy and Green Building, 2016, Guaratinguetá. Book of Abstracts and Posters of II Workshop on Bioenergy, Renewable Energy and Green Building, 2016. p. 3-4.

  • FANELLI, A. ; FERRAZ, G. ; VICENTINI, R. ; ROMANEL, E. A. C. . Phylogenetics and expression analysis of BAHD acyltransferases in sugarcane. In: 62 Congresso Brasileiro de Genética, 2016, Caxambu-MG. 62 Congresso Brasileiro de Genética, 2016.

  • FALCAO, T. ; FANELLI, A. ; PIOVEZANI, A. ; BUCKERIDGE, M. ; HEMERLY, A. ; VICENTINI, R. ; RIANO-PACHON, D. M. ; ROMANEL, E. A. C. . Caracterização genômica e evolutiva dos MADS-box em cana-de-açúcar envolvidos na biossíntese de biomassa, fibras e florescimento. In: VII Semana de Biotecnologia Industrial, 2016, Lorena-SP. VII Semana de Biotecnologia Industrial, 2016.

  • LEAL, D. S. G. ; FANELLI, A. ; VICENTINI, R. ; BRITO, M. S. ; ROMANEL, E. A. C. . Identificação, filogenia e expressão gênica dos fatores transcricionais NAC e MYB em cana-de-açúcar envolvidos na biossíntese da parede celular. In: 24 Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP, 2016, Lorena-SP. 24 Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP, 2016.

  • FANELLI, A. ; FERRAZ, G. ; PIOVEZANI, A. ; VICENTINI, R. ; BUCKERIDGE, M. ; RIANO-PACHON, D. M. ; SILVA, T. F. ; ROMANEL, E. A. C. . Filogenômica e transcriptômica da família BAHD aciltransferases em cana-de-açúcar. In: VII Semana de Biotecnologia Industrial, 2016, Lorena-SP. VII Semana de Biotecnologia Industrial, 2016.

  • SOUZA, A. F. ; FERRAZ, G. ; VICENTINI, R. ; BUCKERIDGE, M. ; PIOVEZANI, A. . Identificação e evolução de genes BAHD aciltransferases em gramíneas. In: VI Semana de Biotecnologia industrial, 2015, Lorena-SP. Semana de Biotecnologia Industrial.

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Projetos de pesquisa

  • 2017 - 2018

    Regulando a Recalcitrância da Parede Celular de Milho através dos Genes de Cana-de-Açúcar (Saccharum spp.) envolvidos na Biossíntese dos Ácidos Hidroxicinâmicos, Descrição: Doutorado Sanduíche no U.S. Dairy Forage Research Center, com foco na análise da composição química da parede celular de linhagens transgênicas de milho com potencial para uso em biorefinarias. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Fanelli de Souza - Coordenador / Elisson Antonio da Costa Romanel - Integrante / HATFIELD, RONALD D. - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

  • 2015 - 2019

    Genômica Comparativa e Estrutural de Enzimas envolvidas na Modificação do Conteúdo dos Ácidos Hidroxicinâmicos em Cana-de-Açúcar, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Fanelli de Souza - Integrante / Elisson Antonio da Costa Romanel - Coordenador.

  • 2014 - 2015

    Estudo e identificação de genes transferase em cana de açúcar, Descrição: Estudo e identificação de genes transferases envolvidos no processo de lignificação.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Amanda Fanelli de Souza - Integrante / Elisson Antonio da Costa Romanel - Coordenador.

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Prêmios

2018

Melhor pôster na IX semana de Biotecnologia Industrial, Centro Acadêmico de Engenharia Bioquímica.

2015

Conclusão do curso de Engenharia bioquímica em 1lugar na 24turma, Escola de Engenharia de Lorena , Universidade de São Paulo (EEL-USP).

2015

1lugar na modalidade apresentação oral da VI Semana de Biotecnologia Industrial, Escola de Engenharia de Lorena , Universidade de São Paulo (EEL-USP).

2015

Prêmio CREA-SP formação profissional, CREA-SP.

2015

Prêmio Instituto de Engenharia melhor aluno da turma de formandos 2015, Instituto de Engenharia.

2010

Menção honrosa-XXVI Olimpíada de matemática da Unicamp, Instituto de Matemática, Estatística e Computação científica-UNICAMP.

2009

Superior Achievment-High School Contest(2008-2009), The Mathematics League.

Histórico profissional

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Experiência profissional

2015 - 2019

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Aluna de doutorado direto no programa de Biotecnologia Industrial

2011 - 2015

Universidade de São Paulo

Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Estudante de Engenharia Bioquímica, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 02/2019 - 06/2019

    Estágios , Escola de Engenharia de Lorena.,Estágio realizado, Estágio Supervisionado em Docência, Programa de Aperfeiçoamento do Ensino (PAE) na disciplina Engenharia Genética.

  • 07/2016 - 11/2016

    Estágios , Escola de Engenharia de Lorena.,Estágio realizado, Estágio Supervisionado em Docência, Programa de Aperfeiçoamento do Ensino (PAE) na disciplina Engenharia de Segurança do Trabalho e Biossegurança.

  • 12/2014 - 07/2015

    Estágios , Escola de Engenharia de Lorena.,Estágio realizado, Estágio em Iniciação Científica Identificação de Genes Transferases em Cana-de-Açúcar.

  • 02/2013 - 12/2013

    Estágios , Escola de Engenharia de Lorena.,Estágio realizado, Monitoria em Química Geral I, Programa de Estímulo ao Ensino na Graduação.

  • 03/2012 - 12/2012

    Estágios , Escola de Engenharia de Lorena.,Estágio realizado, Monitoria em Química Geral II.

2017 - 2018

United States Department of Agriculture

Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: PhD exchange student, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Bolsista PDSE-CAPES, no Dairy Forage Research Center, United States Department of Agriculture (Madison, Wisconsin)