Alexandre Hild Aono

Bacharel em Ciência e Tecnologia (2016) e Ciência da Computação (2018) pelo Instituto de Ciência e Tecnologia da Universidade Federal de São Paulo (ICT-Unifesp). Atuou como monitor das disciplinas Algoritmos e Estruturas de Dados I e II e Probabilidade e Estatística, instrutor de cursos de Programação e Bioinformática oferecidos na instituição e participante de projetos de extensão relacionados ao ensino de Computação/Matemática para diferentes níveis de conhecimento e Estatística Aplicada a questões socioeconômicas, culturais e ambientais. Atualmente, faz parte do Laboratório de Análise Genética e Molecular (LAGM) do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética da Universidade Estadual de Campinas (CBMEG/UNICAMP). Possui experiência em manipulação de dados de sequenciamento de nova geração, análise da variação genética de plantas poliplóides, análise metagenômica e proteômica, processamento de imagens e aprendizado de máquina.

Informações coletadas do Lattes em 03/06/2019

Acadêmico

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Formação acadêmica

Mestrado em andamento em Genética e Biologia Molecular

2019 - Atual

Universidade Estadual de Campinas
Orientador: Anete Pereira de Souza;

Graduação em Ciência da Computação

2017 - 2018

Universidade Federal de São Paulo
Título: Desenvolvimento de uma Ferramenta para Análise de Diversidade Genética com Marcadores Moleculares Utilizando Programação de Alto Desempenho
Orientador: Álvaro Luiz Fazenda

Graduação em Ciência e Tecnologia

2014 - 2016

Universidade Federal de São Paulo

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Formação complementar

2018 - 2018

9a. Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo. (Carga horária: 30h). , Sociedade Brasileira de Computação - Porto Alegre, SBC, Brasil.

2018 - 2018

Workshop em Análises Genéticas. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2018 - 2018

XIV Curso de Inverno de Genética. (Carga horária: 20h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2018 - 2018

Utilização de Marcadores Moleculares no Melhoramento Genético de Plantas. (Carga horária: 20h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2018 - 2018

Microssatélites para Estudos Genéticos de Eucariotos. (Carga horária: 195h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2017 - 2017

Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2017 - 2017

Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 24h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2017 - 2017

Theoretical and Practical Approaches to Metagenomics and Viral Discovery. (Carga horária: 30h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2017 - 2017

Curso de Detecção de Variantes. (Carga horária: 3h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2017 - 2017

MOOC Principles and Trends in Genomics and Computational Biology. (Carga horária: 30h). , Institut Pasteur, PASTEUR, França.

2017 - 2017

Métodos de Análise Filogenética. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2016 - 2016

Exploring and Retrieving Genomic Data Using the Ensembl Genome Browser. (Carga horária: 2h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação.

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Organização de eventos

COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; MATOS, B. C. ; PAZ, H. E. S. ; KUROSHU, R.M. . II Curso de Inverno em Bioinformática do ICT-UNIFESP. 2018. (Outro).

AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; NAGAI, J. S. ; KUROSHU, R.M. . Curso de Inverno em Bioinformática Unifesp. 2017. (Outro).

FERREIRA, M. L. ; CONCEICAO, K. ; AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. . Exposição "Matemática + Zebrafish" e "Plataforma Zebrafish - A construção de uma rede". 2017. (Exposição).

AONO, A. H. ; DIAS, M. O. S. ; CESPEDES, J. G. . III Workshop de Probabilidade e Estatística Aplicada. 2017. (Congresso).

MARTINS, C. B. ; SAVII, R. M. ; AONO, A. H. . SEMaComp - Semana de Matemática, Estatística e Computação. 2016. (Congresso).

AONO, A. H. ; RAMIRES, R. F. ; BARBOSA, L. A. ; KUROSHU, R. M. . Curso Intensivo de Inverno para Maratona de Programação. 2016. (Outro).

FARIA, F. A. ; ALMEIDA, J. G. ; CAPPABIANCO, F. A. M. ; KORTING, T. S. ; AONO, A. H. . SIBGRAPI 2016 - 29th Conference on Graphics, Patterns and Images. 2016. (Congresso).

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Participação em eventos

IV Congresso Acadêmico da Unifesp - Universidade e Sociedade: Saberes em Diálogo no ano de 2018. 2018. (Congresso).

X-Meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C. 2018. (Congresso).

62a. Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria (RBras) e 17o. Simpósio de Estatística Aplicada à Experimentação Agronômica (SEAGRO). Ferramenta Web para Análise Estatística de Genética de Populações. 2017. (Congresso).

GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics. Identification of putative GBS-based SNPs in a sugarcane map population associated with functional genes. 2017. (Congresso).

III Congresso Acadêmico - Unifesp. Desenvolvimento de um pipeline automatizado para identificação de variações genéticas a partir de Genotipagem por Sequenciamento utilizando o GATK. 2017. (Congresso).

XIII Encontro Estatístico do CONRE-3 - Erros Estatísticos e Formas de Evitá-los. 2017. (Encontro).

X-Meeting 2017 - 13th International Conference of the AB3C. Preliminary association of putative GBS-based SNPs with brown rust resistance phenotypes in a sugarcane map population using GWAS and machine learning methods. 2017. (Congresso).

XXXVII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. A Utilização do Scratch como Ferramenta no Ensino de Pensamento Computacional para Crianças. 2017. (Congresso).

II Congresso Acadêmico Unifesp. Apoio à Aprendizagem nas UCs de Algoritmos e Estruturas de Dados I e II ofertadas pelo Instituto de Ciência e Tecnologia. 2016. (Congresso).

II Congresso Acadêmico Unifesp. Projeto de Aprendizagem de Programação para Olimpíadas. 2016. (Congresso).

RSG Brazil - 1st Student Council Symposium. 2016. (Simpósio).

SIBGRAPI 2016 - 29th Conference on Graphics, Patterns and Images. 2016. (Congresso).

Workshop de Probabilidade e Estatística Aplicada. Costumes e Práticas de Lazer dos Alunos de Graduação do ICT-UNIFESP. 2016. (Exposição).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C. Preliminary analysis of functional SNPs mining from GBS data using GATK in a sugarcane map population. 2016. (Congresso).

ACM International Collegiate Programming Contest.ACM International Collegiate Programming Contest. 2015. (Outra).

II Semana de Estatística, Matemática e Computação - Unifesp. Projeto de Ensino e Aprendizagem de Programação para Olimpíadas. 2015. (Congresso).

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Comissão julgadora das bancas

Gabriel Rodrigues Alves Margarido

MARGARIDO, G. R. A.; RIBEIRO, R. V.; VICENTINI, R.. Seleção genômica ampla em cana-de-açúcar via aprendizado de máquina e redes complexas para caracteres de importância econômica. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

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Foi orientado por

Estela Araújo Costa

DESENVOLVIMENTO DE UM PACOTE EM R PARA ANÁLISE DE DIVERSIDADE GENÉTICA COM USO DE MARCADORES MOLECULARES; Início: 2018; Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Paulo- campus São José dos Campos; (Orientador);

Reginaldo Massanobu Kuroshu

Estudo e Aplicação do GATK (Genome Analysis Toolkit) para identificação de variações genéticas a partir de genotipagem por sequenciamento de uma população de cana-de-açúcar; Início: 2016; Iniciação científica (Graduando em Ciência e Tecnologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Álvaro Luiz Fazenda

Desenvolvimento de uma Ferramenta para Análise de Diversidade Genética com Marcadores Moleculares Utilizando Programação de Alto Desempenho; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de São Paulo; Orientador: Álvaro Luiz Fazenda;

Anete Pereira de Souza

Seleção genômica ampla em cana-de-açúcar via aprendizado de máquina e redes complexas para caracteres de importância econômica; Início: 2019; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

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Produções bibliográficas

  • AONO, A. H. . Numa parceria com Cemaden, estudantes desenvolvem site com dados sobre chuvas. Plantão News, 01 jan. 2017.

  • AONO, A. H. . Estudantes criam site com dados sobre chuvas. Jornal A União - Superintendência da Imprensa e Editora A União, Governo da Paraíba, 28 dez. 2016.

  • AONO, A. H. . Numa parceria com Cemaden, estudantes desenvolvem site com dados sobre chuvas. Sala de Imprensa - Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações, 27 dez. 2016.

  • AONO, A. H. . Projeto de site permite ampliar participação da comunidade no monitoramento de chuvas. Notícias do Centro Nacional de Monitoramento e Alertas de Desastres Naturais (Cemaden), 19 dez. 2016.

  • NAGAI, J. S. ; PAZ, H. E. S. ; AONO, A. H. ; LORENA, A. C. ; KUROSHU, R. M. . Gene Essentiality Prediction Using Topological Features from Metabolic Networks. In: 7th Brazilian Conference on Intelligent Systems, 2018, São Paulo. IEEE Proceedings of the Brazilian Conference on Intelligent Systems (BRACIS 2018), 2018.

  • AONO, A. H. ; OLIVEIRA, R. ; FRANCHI, B. O. ; NAGAI, J. S. ; PAZ, H. E. S. ; CHAVES, A. A. ; MARTINS, C. B. . A Biased Random-key Genetic Algorithm with Local Search Applied to Unsupervised Clustering of Cultural Data. In: Symposium on Knowledge Discovery, Mining and Learning (KDMiLe), 2018, São Paulo. Proceedings of KDMiLe 2018, 2018.

  • AONO, A. H. ; SILVA, H. R. V. ; MUSA, D. L. ; PEREIRA, V. A. ; ALMEIDA, J. G. . A Utilização do Scratch como Ferramenta no Ensino de Pensamento Computacional para Crianças. In: XXXVII Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, 2017, São Paulo. Anais do XXXVII CSBC (CSBC'2017). Porto Alegre, RS, Brazil: Sociedade Brasileira de Computação, 2017. p. 1-10.

  • AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; SANTOS, S. R. S. ; CESPEDES, J. G. ; SILVA, L. F. . PluviApp: Ferramenta Web para análise e visualização de dados pluviométricos. In: XIV Encontro Nacional de Engenharia e Desenvolvimento Social, 2017, Itajubá. Anais do XIV ENEDS, Movendo Outras Engrenagens, 2017.

  • AONO, A. H. ; FAZENDA, A. L. . Otimização de desempenho de software para análises de diversidade genética utilizando programação paralela. In: 10a. Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo (ERAD-SP), 2019, Campinas. Anais da 10a. Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo (ERAD-SP), 2019.

  • AONO, A. H. ; SUZUKI, J. ; SOUZA, G. I. M. H. ; OYAMA, L. M. ; VASQUES, T. ; ESPOSITO, E. . Análise Metagenômica da Microbiota do Cólon de Camundongos Submetidos a Dietas Normo e Hiperlipídicas. In: XIV Curso de Inverno de Genética, 2018, Jaboticabal. Ciência e Tecnologia, 2018. v. 10.

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; NAGAI, J. S. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Identificação e Caracterização Funcional de SNPs em uma População de Mapeamento de Cana-de-açúcar. In: XIV Curso de Inverno de Genética, 2018, Jaboticabal. Ciência e Tecnologia, 2018. v. 10.

  • SILVA, C. M. ; PEREIRA, W. A. ; AONO, A. H. . Identidade entre primers RAPD e sequências para o peptídeo sinal de CDSs de LRRs putativas de feijão (Phaseolus vulgaris). In: XXI Simpósio Internacional de Atualização em Genética e Melhoramento de Plantas, 2018, Lavras. Anais do XXI Simpósio Internacional de Atualização em Genética e Melhoramento de Plantas, 2017.

  • SAVII, R. M. ; AONO, A. H. ; MARTINS, C. B. . Meta-analysis tool with R and Shiny. In: 63a. Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria, 2018, Curitiba. Anais da 63a. Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria, 2018.

  • LIMA, B. P. S. ; AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; ALBERICI, L. C. ; ZELANIS, A. ; CAMPOS, C. B. L. . Proteomic analysis applied to the study of lipid bodies: association with calcineurin in the fungus Paracoccidioides brasiliensis. In: Reunião da Federação de Sociedade de Biologia Experimental (FeSBE), 2018, Campos do Jordão. Anais da Reunião da Federação de Sociedade de Biologia Experimental (FeSBE), 2018.

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; NAGAI, J. S. ; PAZ, H. E. S. ; ISHIMOTO, C. K. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Multivariate and clustering allelic expression analyses reveal putative molecular markers associated with sugarcane sucrose metabolism using GBS data. In: X-Meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C, 2018, São Pedro. Proceedings X-Meeting 2018, 2018.

  • AONO, A. H. ; PAZ, H. E. S. ; NAGAI, J. S. ; ISHIMOTO, C. K. ; OKIMOTO, L. C. ; COSTA, E. A. ; LORENA, A. C. ; KUROSHU, R.M. . A novel approach based on complex networks and machine learning techniques for a deeper biological insight into Parkinson?s gut metagenomics. In: X-Meeting 2018 - 14th International Conference of the AB3C, 2018, São Pedro. Proceedings X-Meeting 2018, 2018.

  • ISHIMOTO, C. K. ; AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; PAZ, H. E. S. ; MIRANDA, A. R. L. ; ARAUJO, A. ; KUROSHU, R.M. ; ESPOSITO, E. . Network topology and multivariate analyses for identification of highly connected microbial genera within Fluviosol soil. In: X-Meeting 2018 - 14h International Conference of the AB3C, 2018, São Pedro. Proceedings X-Meeting 2018, 2018.

  • AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; SILVA, H. R. V. ; COSTA, E. A. ; CESPEDES, J. G. . Ferramenta Web para Análise Estatística de Genética de Populações. In: 62a. Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria (RBras) e 17o. Simpósio de Estatística Aplicada à Experimentação Agronômica (SEAGRO), 2017, Lavras. Anais da 62a. Reunião Anual da Região Brasileira da Sociedade Internacional de Biometria (RBras) e 17o. Simpósio de Estatística Aplicada à Experimentação Agronômica (SEAGRO), 2017.

  • NAGAI, J. S. ; SILVA, H. R. V. ; AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; KUROSHU, R.M. . CINDEX: a software for protein ranking through network modeling based on graph theory. In: X-Meeting 2017 - 13th International Conference of the AB3C, 2017, São Pedro. Proceedings X-Meeting 2017, 2017.

  • COSTA, E. A. ; AONO, A. H. ; SILVA, H. R. V. ; NAGAI, J. S. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Ploidy level analysis of functional SNPs from GBS data in a sugarcane map population. In: X-Meeting 2017 - 13th International Conference of the AB3C, 2017, São Pedro. Proceedings X-Meeting 2017, 2017.

  • AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; SANTOS, F. R. C. ; PINTO, L. R. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Preliminary association of putative GBS-based SNPs with brown rust resistance phenotypes in a sugarcane map population using GWAS and machine learning methods. In: X-Meeting 2017 - 13th International Conference of the AB3C, 2017. Proceedings X-Meeting 2017.

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; NAGAI, J. S. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Identification of putative GBS-based SNPs in a sugarcane map population associated with functional genes. In: Brazilian-International Congress of Genetics, 2017, Águas de Lindoia. Genética 2017, Brazilian-International Congress of Genetics, 2017.

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; NAGAI, J. S. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R. M. . Preliminary analysis of functional SNPs mining from GBS data using GATK in a sugarcane map population. In: X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Proceedings X-Meeting 2016, 2016.

  • NAGAI, J. S. ; SILVA, H. R. V. ; COSTA, E. A. ; AONO, A. H. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . GBS data from a population of modern sugarcane variety reveals duplicate genes retained by breeding process. In: X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the AB3C, 2016, Belo Horizonte. Proceedings X-Meeting 2016, 2016.

  • SOUZA, M. C. ; AONO, A. H. ; KUROSHU, R. M. ; RODRIGUES, T. O. ; FRANCA, C. S. . Algoritmos para o Alinhamento de Sequências Biológica: Uma Revisão da Literatura. In: SLAB - Simpósio Latino-Americano de Biotecnologia do Nordeste, 2015. Revista Brasileira de Biodiversidade e Biotecnologia, 2015. v. 1.

  • AONO, A. H. ; FAZENDA, A. L. . Otimização de desempenho de software para análises de diversidade genética utilizando programação paralela. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. . Introdução ao R. 2018. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • AONO, A. H. ; SUZUKI, J. ; SOUZA, G. I. M. H. ; OYAMA, L. M. ; VASQUES, T. ; ESPOSITO, E. . Análise Metagenômica da Microbiota do Cólon de Camundongos Submetidos a Dietas Normo e Hiperlipídicas. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; NAGAI, J. S. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Identificação e Caracterização Funcional de SNPs em uma População de Mapeamento de Cana-de-açúcar. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; KUROSHU, R.M. . Mineração e Avaliação de Marcadores SNPs Utilizando Técnicas de Seleção de Atributos. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • AONO, A. H. ; MATOS, B. C. ; KUROSHU, R.M. . Integração de Pipelines para Descoberta de Marcadores SNPs em Espécies Poliplóides. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; LIMA, B. P. S. ; ZELANIS, A. ; CAMPOS, C. B. L. . Proteômica Aplicada ao Estudo de Corpúsculos Lipídicos e sua Relação com a Atividade da Fosfatase Calcineurina do Fungo Paraccocidioides Brasiliensis. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. . Metagenômica: Desafios e Aplicações. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. . Programação em R para Análises Estatísticas. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; NAGAI, J. S. ; PAZ, H. E. S. ; ISHIMOTO, C. K. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Multivariate and clustering allelic expression analyses reveal putative molecular markers associated with sugarcane sucrose metabolism using GBS data. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; PAZ, H. E. S. ; NAGAI, J. S. ; ISHIMOTO, C. K. ; OKIMOTO, L. C. ; COSTA, E. A. ; LORENA, A. C. ; KUROSHU, R.M. . A novel approach based on complex networks and machine learning techniques for a deeper biological insight into Parkinson?s gut metagenomics. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; LIMA, B. P. S. ; ZELANIS, A. ; CAMPOS, C. B. L. . Análise de Bioinformática do Proteoma de Paracoccidioides Brasiliensis. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; KUROSHU, R.M. . Desenvolvimento de um pipeline automatizado para identificação de variações genéticas a partir de Genotipagem por Sequenciamento utilizando o GATK. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; FARIA, F. A. . Apoio à Aprendizagem nas UCs de Algoritmos e Estruturas de Dados I e II ofertadas pelo Instituto de Ciência e Tecnologia. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; ALMEIDA, J. G. . Projeto de Ensino e Aprendizagem de Pensamento Computacional, Algoritmos e Programação. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; MARTINS, C. B. . Perfil Cultural dos Estudantes de Graduação do ICT/UNIFESP. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; SILVA, H. R. V. ; COSTA, E. A. ; CESPEDES, J. G. . Ferramenta Web para Análise Estatística de Genética de Populações. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; SILVA, H. R. V. ; MUSA, D. L. ; PEREIRA, V. A. ; ALMEIDA, J. G. . A Utilização do Scratch como Ferramenta no Ensino de Pensamento Computacional para Crianças. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; NAGAI, J. S. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R.M. . Identification of putative GBS-based SNPs in a sugarcane map population associated with functional genes. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; CESPEDES, J. G. . Apoio ao Cálculo e Estatística Aplicada. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; KUROSHU, R.M. . Preliminary association of putative GBS-based SNPs with brown rust resistance phenotypes in a sugarcane map population using GWAS and machine learning methods. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; FARIA, F. A. ; KUROSHU, R.M. . Desenvolvimento de um Pipeline para Predição de Genes Utilizando o Augustus com Aplicação de Métodos de Classificação para Identificação de Erros. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. ; FERREIRA, H. G. ; TRAMASSO, L. M. ; ALMEIDA, J. G. . Apoio à Aprendizagem nas UCs de Algoritmos e Estruturas de Dados I e II ofertadas pelo Instituto de Ciência e Tecnologia. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • RAMIRES, R. F. ; BARBOSA, L. A. ; AONO, A. H. ; KUROSHU, R. M. . Projeto de Ensino e Aprendizagem de Programação para Olimpíadas. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; AONO, A. H. . Por que sequenciar um genoma? Os desafios biocomputacionais. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. . Tópicos em Teoria dos Números - Implementações. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. . Programação Dinâmica - Implementações. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; NAGAI, J. S. ; SILVA, H. R. V. ; SOUZA, A. P. ; KUROSHU, R. M. . Preliminary analysis of functional SNPs mining from GBS data using GATK in a sugarcane map population. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • KUROSHU, R. M. ; CONCEIÇÃO, A.F. ; ALMEIDA, J. ; NASCIMENTO, M.C.V. ; AONO, A. H. ; BARBOSA, L. A. ; SOUZA, M. C. ; RAMIRES, R. F. . Projeto de Ensino e Aprendizagem de Programação para Olimpíadas. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

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Outras produções

FERREIRA, M. L. ; CONCEICAO, K. ; AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. . Aplicativo 'A Matemática do Zebrafish'. 2017.

AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; CESPEDES, J. G. . PluviApp - Aplicativo para análise de dados pluviométricos e identificação de vulnerabilidade ambiental. 2016.

AONO, A. H. . I Curso de Verão em Bioinformática - Análises Ômicas. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; SOUZA, K. K. W. ; MORENO, C. C. ; RODRIGUES, L. G. ; PASSOS, L. O. M. P. ; MUSA, D. L. . Algoritmos e Estruturas de Dados para Crianças. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; MATOS, B. C. ; PAZ, H. E. S. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. ; KUROSHU, R.M. . II Curso de Inverno em Bioinformática do ICT-UNIFESP. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. . Identificação de Marcadores Moleculares SNPs em Dados de Sequenciamento de Nova Geração. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. . Curso de Programação em R. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. ; SATO, T. A. ; SILVA, H. R. V. ; KUROSHU, R. M. . Introdução à Utilização da Linha de Comando em Linux e Ferramentas para Análise de Dados de Sequenciamento Genômico. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. ; ALMEIDA, J. . Introdução à Computação usando Scratch. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

ZELANIS, A. ; KITANO, E. S. ; AONO, A. H. ; FUKUSHIMA, I. . Proteômica: fundamentos e introdução à análise de dados. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; KUROSHU, R.M. . Ferramentas de bioinformática para análise metagenômica em estudos de microbiota intestinal. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

AONO, A. H. . Introdução ao Software R. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. ; COSTA, E. A. ; SILVA, H. R. V. . Curso de Genética, Genômica e Bioinformática. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. ; LIMA, D. T. L. ; ALMEIDA, J. G. . Curso de Programação em Java. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MARTINS, C. B. ; SAVII, R. M. ; FRANCHI, B. O. ; AONO, A. H. ; NAGAI, J. S. . Introdução ao R/Shiny. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

AONO, A. H. ; RAMIRES, R. F. ; SAVII, R. M. ; OKIMOTO, L. C. ; WEIERS, N. L. ; PEREIRA, V. A. ; ALMEIDA, J. . Curso de Introdução ao Pensamento Computacional com o Uso de Jogos Educativos. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

AONO, A. H. ; ALMEIDA, J. G. . Curso de Introdução ao Pensamento Computacional. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

RAMIRES, R. F. ; AONO, A. H. ; BARBOSA, L. A. ; KUROSHU, R. M. . Curso de C++ para resolução de problemas. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

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Projetos de pesquisa

  • 2018 - Atual

    Ciclosporina A como ferramenta para identificação de vias de sinalização ou processos metabólicos necessários para a integridade celular do fungo patogênico Paracoccidioides brasiliensis, Descrição: A ciclosporina A (CsA) é um peptídeo cíclico produzido pelo metabolismo secundário do Tolypocladium inflatum, um fungo encontrado no solo de regiões temperadas do Planeta. Mais conhecida por sua propriedade imunossupressora, a CsA tem como mecanismo de ação a inibição da calcineurina, uma fosfatase de serina e treonina dependente de cálcio e calmodulina, que se dá pela associação da droga com ciclofilinas específicas e formação de um complexo inativo CsA-calcineurina-ciclofilina. Embora não se conheça o papel da CsA na biologia do T. inflatum na natureza, sugere-se que seja o de limitar o acesso de competidores ao substrato, ou seja, de demarcar seu nicho ecológico, precisamente por sua ação inibidora sobre a calcineurina e ciclofilinas. De fato, a calcineurina apresenta papel essencial na biologia de algumas espécies fúngicas e é bastante conhecido seu papel na integridade celular de fungos patogênicos para humanos, plantas e insetos. No entanto, pouco se conhece a respeito dos alvos moleculares da calcineurina e ciclofilinas em fungos e, aparentemente, os alvos da calcineurina divergem entre diferentes espécies. O fator de transcrição Crz1p, por exemplo, ativado pela calcineurina, foi inicialmente descrito em Saccharomyces cerevisiae, e posteriormente encontrado em espécies de Candida e Aspergillus, mas não foi encontrado no genoma do Paracoccidioides brasiliensis, o fungo patogênico objeto deste projeto. Sendo assim, é importante conhecer os mecanismos específicos através dos quais a calcineurina exerce sua função reguladora da homeostase em diferentes espécies de fungos para se obter um panorama geral dos mecanismos através dos quais esta enzima regula vias de sinalização e processos bioquímicos para se definir se há um alvo ou um processo em específico que seja comum e que possa ser objeto de intervenção em fungos de interesse médico e agronômico.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Hild Aono - Integrante / André Zelanis - Integrante / Beatriz Pereira de Sousa Lima - Integrante / Claudia Barbosa Ladeira de Campos - Coordenador.

  • 2015 - 2017

    Avaliação de um novo alimento funcional à base de proteínas do soro de queijo, quitosana e galactooligossacarídeos na modulação da via inflamatória, microbiota intestinal e perfil lipídico em camundongos com obesidade induzida, Descrição: O consumo de uma dieta hiperlipídica, conhecida como um dos fatores que levam a obesidade, pode levar, concomitantemente, a alterações da microbiota intestinal através do desbalanço entre os dois principais filos de micro-organismos colonizadores: Firmicutes e Bacteroidetes. A alteração da microbiota pode gerar a endotoxemia devido à grande produção de LPS (lipopolissacarídios) pelas bactérias intestinais gram-negativas. O LPS aumentado pode gerar resposta inflamatória a partir do intestino atingindo nível sistêmico pela ativação de receptores da via toll-like e secreção de todas as adipocinas envolvidas nesse processo, caracterizando a inflamação subclínica característica à obesidade. Além disso, dieta hiperlipídica pode gerar alterações no perfil de ácidos graxos dos fosfolipídios das membranas intestinais. Essa alteração de composição pode levar a alteração de diversos receptores de membrana, entre eles os da família toll-like já que estes receptores estão ancorados nas membranas. Vários estudos demonstram que as proteínas do soro do leite tem atividade bioativa na prevenção da obesidade, assim como fibras prebióticas como galactooligossacarídeos GOS, induzem a proliferação de bactérias benéficas no cólon. No entanto, a proposta deste projeto é o estudo da associação das proteínas do soro coacervadas em quitosana e galactooligossacarideos (GOS) sobre a modulação do estado inflamatório e perfil de ácidos graxos dos fosfolipídios de membrana em animais com obesidade induzida por dieta, o que ainda não está demonstrado na literatura.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Alexandre Hild Aono - Integrante / Elisa Esposito - Coordenador / Gabriel Inácio Morais Honorato de Souza - Integrante / Bruno Rodrigues - Integrante / Lila Missae Oyama - Integrante / Vanessa Nessner Kavamura - Integrante / Juliana Suzuki - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    Biologia Computacional na Análise de Variação Genética, Descrição: Este projeto tem como objetivo formar recursos humanos em uma temática multidisciplinar envolvendo a biologia computacional e genética, visando a preparação de profissionais que possam contribuir para a inclusão do País na fronteira moderna da pesquisa mundial nesta área. Desenvolve-se como parte do projeto Estudo e Aplicação do GATK (Genome Analysis Toolkit) para identificação de variações genéticas a partir de genotipagem por sequenciamento de uma população de cana-de-açúcar. CAPES n° 51/2013.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Alexandre Hild Aono - Integrante / Reginaldo Massanobu Kuroshu - Integrante / Anete Pereira Souza - Coordenador / Antonio Augusto Franco Garcia - Integrante / Cláudio Benicio Cardoso Silva - Integrante / Renato Vicentini - Integrante / Michel Vincentz - Integrante / Sérgio Furtado dos Reis - Integrante / Gabriel Rodrigues Alves Margarido - Integrante / Maria Imaculada Zucchi - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

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Prêmios

2019

Aluno Destaque da Turma de 2018/2 do curso de Bacharelado em Ciência da Computação da Universidade Federal de São Paulo, Sociedade Brasileira de Computação.

2019

Melhor Artigo da Sessão de Iniciação Científica, "Otimização de Desempenho de Software para Análises de Diversidade Genética Utilizando Programação Paralela", 10a. Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo (ERAD-SP), Sociedade Brasileira de Computação.

2018

1o. Lugar, Melhor Trabalho Científico na Área de Agronomia, "Identificação e Caracterização Funcional de SNPs em uma População de Mapeamento de Cana-de-açúcar", XIV Curso de Inverno de Genética, Fundação de Apoio a Pesquisa, Ensino e Extensão - Unesp/FCAV.

2018

Menção Honrosa, IV Congresso Acadêmico da Unifesp, "Mineração e Avaliação de Marcadores SNPs Utilizando Técnicas de Seleção de Atributos", Instituto de Ciência e Tecnologia, Universidade Federal de São Paulo.

2017

Menção Honrosa, Workshop sobre Educação em Computação (WEI), "A Utilização do Scratch como Ferramenta no Ensino de Pensamento Computacional", Congresso da Sociedade Brasileira de Computação (CSBC'2017), Sociedade Brasileira de Computação.

2017

Menção Honrosa, Prêmio Graduação - Genômica e Bioinformática, "Identification of putative GBS-based SNPs in a sugarcane map population associated with functional genes", Brazilian-International Congress of Genetics (GENÉTICA - 2017), Sociedade Brasileira de Genética.

2015

2a. colocação, II Maratona de Programação da Unifesp; Semana da Estatística, Matemática e Computação (SEMaComp), Instituto de Ciência e Tecnologia - Universidade Federal de São Paulo.

2015

Honorable Mention, The 2015 ACM International Collegiate Programming Contest, Association for Computing Machine (ACM).

Histórico profissional

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Experiência profissional

  • 2016 - Atual

    Universidade Federal de São Paulo

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20

    Outras informações:
    Projeto: Estudo e Aplicação do GATK (Genome Analysis Toolkit) para identificação de variações genéticas a partir de genotipagem por sequenciamento de uma população de cana-de-açúcar.

  • 2017 - 2017

    Universidade Federal de São Paulo

    Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitoria, Carga horária: 4

    Outras informações:
    Monitoria da disciplina Probabilidade e Estatística

  • 2016 - 2016

    Universidade Federal de São Paulo

    Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitoria, Carga horária: 4

    Outras informações:
    Monitoria da disciplina Algoritmos e Estruturas de Dados II

  • 2016 - 2016

    Universidade Federal de São Paulo

    Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitoria, Carga horária: 4

    Outras informações:
    Monitoria da disciplina Algoritmos e Estruturas de Dados I

  • 2015 - 2015

    Universidade Federal de São Paulo

    Vínculo: Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitoria, Carga horária: 4

    Outras informações:
    Monitoria da disciplina Algoritmos e Estruturas de Dados I