Ruth Barros de Paula

Possui Bacharelado em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Minas Gerais (2019). Tem experiência como estudante de iniciação científica nas áreas de biotecnologia e saúde, trabalhando principalmente com as seguintes técnicas: ensaio de CAM, PCR convencional, microcultivo fúngico, ELISPOT, ELISA, clonagem e técnicas de bioinformática relacionadas a genômica e transcritômica. Foi estudante de iniciação científica em laboratórios de micologia e farmacologia (UFMG) e malária (FIOCRUZ - Minas), e participou da equipe iGEM UFMG 2016-2018. Em 2018, participou de um programa de pesquisa de verão na Universidade de Lausanne - Suíça, trabalhando com RNAs longos não codificadores, e, depois disso, desenvolveu TCC no laboratório de Biologia Molecular Computacional de Fungos da UFMG a respeito do perfil transcricional da mitocôndria de fungos de Hypocreales. Atualmente é estudante de mestrado em Biomedical Sciences - Genetics and Epigenetics na University of Texas - MD Anderson Cancer Center, atuando na investigação do papel biológico de uma recém cristalizada estrutura de DNA G4.

Informações coletadas do Lattes em 22/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Mestrado em andamento em Biomedical Sciences

2019 - Atual

The University of Texas Health Science Center at Houston, UTHealth
Orientador: John A;Tainer;Bolsista do(a): MD Anderson Cancer Center, MDACC, Estados Unidos. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Ciências Biológicas

2015 - 2019

Universidade Federal de Minas Gerais
Título: Perfil transcricional do genoma mitocondrial de fungos da ordem Hypocreales (Ascomycota)
Orientador: Aristóteles Góes Neto

Ensino Médio (2º grau)

2012 - 2014

Colégio Santo Agostinho (BH)

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Formação complementar

2019 -

Estágio de curta duração. (Carga horária: 12h). , Myleus Análises Genéticas, MYLEUS, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Clínica Médica/Especialidade: Doenças Infecciosas e Parasitárias.

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Organização de eventos

FERREIRA, R. S. ; PAULA, R. B. ; CASTRO, R. N. F. ; CURVELLANO, F. L. L. ; CAIXETA, E. ; SILVA, N. C. ; MOREIRA, J. . I Curso de Biologia Sintética UniBH - módulo prático. 2017. (Outro).

VILELA, L. F. F. ; FERREIRA, R. S. ; PIGNOLATI, C. L. P. ; PAULA, R. B. ; CASTRO, R. N. F. . III Curso de Engenharia de Máquinas Biológicas - UFMG - Módulo Prático Biomol. 2016. (Outro).

VILELA, L. F. F. ; FERREIRA, R. S. ; PIGNOLATI, C. L. P. ; PAULA, R. B. ; CASTRO, R. N. F. . III Curso de Engenharia de Máquinas Biológicas - UFMG - Módulo Prático Biomol. 2016. (Outro).

FERREIRA, R. S. ; PAULA, R. B. ; CASTRO, R. N. F. ; CURVELLANO, F. L. L. ; CAIXETA, E. ; SILVA, N. C. ; MOREIRA, J. . I Curso de Biologia Sintética UniBH - módulo prático. 2017. (Outro).

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Participação em eventos

Science Night - Graduate School of Biomedical Sciences - UTHealth. Teaching thermodinamics and general science to children. 2020. (Exposição).

TAGC 2020 Online - The Allied Genetics Conference. 2020. (Congresso).

Simpósio Edição de genomas com CRISPR: avanços para a saúde humana e suas implicações éticas e regulatórias. 2019. (Simpósio).

II Curso de Verão em Bioinformática da UFMG. 2018. (Outra).

II Curso de Verão em Bioinformática - Minicurso "Metagenômica". 2018. (Outra).

Summer Undergraduate Research Programme - UNIL.Entendendo lincRNAs: Avaliando o impacto de miRNAs nos níveis de lincRNAs. 2018. (Outra).

XXVI Reunião Anual de Iniciação Científica - FIOCRUZ.Avaliação da resposta de células B de memória na malária causada por Plasmodium vivax. 2018. (Encontro).

69ª Reunião Anual da Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência (SBPC). 2017. (Outra).

Django Girls Belo Horizonte. 2017. (Outra).

I Curso de Verão em Bioinformática - Minicurso "A arte de construir oráculo". 2017. (Outra).

I Curso Introdutório para os alunos de Iniciação Científica e PROVOC. 2017. (Outra).

Jamboré Brasuca.Framework para a utilização de Leishmania sp. como um novo chassi na Biologia Sintética. 2017. (Encontro).

Jornada Fiocruz Minas - 2017 | IV Jornada de Pós-graduação, XXV Reunião Anual de Iniciação Científica.Avaliação da resposta de células B de memória na malária causada por Plasmodium vivax. 2017. (Encontro).

Biomaker Battle/Biostartup Lab - Biominas Brasil.Blood Scan. 2016. (Outra).

II Curso de Engenharia de Máquinas Biológicas.Clap Cruzi. 2016. (Outra).

Inovação e Empreendedorismo Desmistificados. 2016. (Outra).

I Simpósio Nacional de Nanobiotecnologia/II Workshop de Nanobiotecnologia da UFMG - Avanços & Aplicações. 2016. (Simpósio).

IV Simpósio Acadêmico de Biomedicina da UFMG. 2016. (Simpósio).

VIII Workshop PPG em Biologia Vegetal UFMG - Revisão como método de pesquisa e síntese nas ciências ambientais. 2016. (Oficina).

XXIV Reunião Anual de Iniciação Científica - FIOCRUZ.Avaliação da resposta de células B na malária por Plasmodium vivax em uma população exposta à malária. 2016. (Outra).

II Simpósio de Microbiologia da UFMG - Microbiologia Translacional: Do Ambiente Natural às Aplicações Biotecnológicas.Revisão sobre métodos diagnósticos para Aspergilose: Descrições e estudos comparativos. 2015. (Simpósio).

Manejo de Serpentes - IRV Ambiental. 2015. (Outra).

Oficina Pedagógica da 8ª Olimpíada Brasileira de Saúde e Meio Ambiente. 2015. (Oficina).

XV Curso de Campo Prof. Mário de Maria. 2015. (Outra).

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Foi orientado por

Diogo Coelho de Pádua Oliveira

Avaliação da aplicação da técnica da reação em cadeia da polimerase para o diagnóstico das aspergiloses invasivas no Hospital das Clínicas da UFMG; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Diogo Coelho de Pádua Oliveira;

Luzia Valentina Modolo

Ação anti-radicalar e antifúngica de metabólitos de Genipa americana (jenipapo); 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luzia Valentina Modolo;

Paula Luize Camargos Fonseca

Perfil transcricional do genoma mitocondrial de fungos da ordem Hypocreales (Ascomycota); 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Minas Gerais; Orientador: Paula Luize Camargos Fonseca;

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Produções bibliográficas

  • FONSECA, PAULA L. C. ; BADOTTI, FERNANDA ; DE-PAULA, RUTH B. ; ARAÚJO, DANIEL S. ; BORTOLINI, DENER E. ; DEL-BEM, LUIZ-EDUARDO ; AZEVEDO, VASCO A. ; BRENIG, BERTRAM ; AGUIAR, ERIC R. G. R. ; GÓES-NETO, ARISTÓTELES . Exploring the Relationship Among Divergence Time and Coding and Non-coding Elements in the Shaping of Fungal Mitochondrial Genomes. Frontiers in Microbiology , v. 11, p. 765, 2020.

  • PIRES, CAMILLA V. ; ALVES, JESSICA R. S. ; LIMA, BARBARA A. S. ; PAULA, RUTH B. ; COSTA, HELENA L. ; TORRES, LETICIA M. ; SOUSA, TAÍS N. ; SOARES, IRENE S. ; SANCHEZ, BRUNO A. M. ; FONTES, COR J. F. ; NTUMNGIA, FRANCIS B. ; ADAMS, JOHN H. ; KANO, FLORA S. ; CARVALHO, LUZIA H. . Blood-stage Plasmodium vivax antibody dynamics in a low transmission setting: A nine year follow-up study in the Amazon region. PLoS One , v. 13, p. e0207244, 2018.

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Outras produções

PAULA, R. B. ; FONSECA, P. L. C. ; GOES NETO, A. ; MODOLO, L. V. . Relatório final - Laboratório de Biologia Molecular e Computacional de Fungos - UFMG. 2019. (Relatório de pesquisa).

PAULA, R. B. . Relatório final - Laboratório de Biologia Molecular e Imunologia da Malária - FIOCRUZ Minas. 2018. (Relatório de pesquisa).

FERREIRA, R. S. ; MOREIRA, J. ; THOMAZ, J. H. ; GONCALVES, C. ; TAGLIAFERRI, T. ; PIGNOLATI, C. L. P. ; CARVALHAIS, N. ; MOREIRA, C. ; CASTRO, R. N. F. ; PAULA, R. B. ; DO VALLE, T. ; SILVA, N. C. ; D'ASSUMPÇÃO, M. L. ; LEONEL, C. ; CAIXETA, E. . I Curso de Biologia Sintética da UniBH. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

PAULA, R. B. ; LIU, S. M. ; ALMEIDA, R. B. ; OLIVEIRA, D. C. P. . Relatório final - Laboratório de Micologia - Faculdade de Medicina da UFMG. 2016. (Relatório de pesquisa).

PAULA, R. B. ; LIMA, B. A. S. ; CARVALHO, L. H. ; KANO, F. S. . Avaliação da resposta de células B na malária por Plasmodium vivax em uma população exposta à malária da região amazônica. 2016 (Projeto de pesquisa) .

OLIVEIRA, D. C. P. ; PAULA, R. B. ; CUNHA JUNIOR, A. S. . Implantes intravítreos de ácido poli lático-co-glicólico (PLGA) contendo lupeol: avaliação da atividade antiangiogênica. 2014 (Projeto de pesquisa) .

OLIVEIRA, D. C. P. ; PAULA, R. B. ; STOIANOFF, M. A. R. ; ALMEIDA, R. B. ; CLEMENTE, W. T. . Avaliação da Aplicação da Técnica de Reação em Cadeia de Polimerase para o Diagnóstico das Aspergiloses Invasivas no Hospital das Clínicas / UFMG. 2013 (Projeto de pesquisa) .

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Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    Unveiling the role of G-quadruplex DNA and L1-G4 in human genetics, Descrição: The human genome still holds mysteries that are important to solve for biology and medicine. Many human diseases have complex genetic traits, and finding the main variables to explain these pathologies has been a challenge. Recent advances unveil an important role for epigenetics in genomic regulation and, likewise, show that open chromatin can assume different states that alter transcription and translation factor binding capabilities. A prototypical example is provided by G-quadruplex (G4) structures, a family of non-B DNA folds often stabilized by potassium ions that are formed by repetitive guanines spaced by random nucleotides. These sequences are enriched in gene regulatory regions, such as promoters, 5?-UTR and 3?-UTR and have distinct regulatory roles (Ravichandran et al., 2019). They can also block DNA replication causing double strand breaks and genome instability (Van Kregten & Tijsterman, 2014), which are important factors in cancer. Our laboratory recently published a study that correlates cancer mutational burden to G4 DNA contained within SVA transposons (Bacolla et al., 2019); furthermore, we crystalized a 22 nt parallel-type G4 sequence (not published) that is found exclusively at L1 transposons (L1-G4) and is expected to have a biological relevance. Although previous studies had reported the distribution and prevalence of G4 throughout the human genome (Huppert, 2005; Verma et al., 2009), it is still not clear how these sequences correlate with gene expression in a location-dependent manner and how relevant they are for genetic diseases and cancer; this is especially true for the L1-G4 discovered by our research group. To answer key questions regarding G4 DNA in health and disease states, the long-term research goal is to unveil the distribution and expression patterns of genes that contain G4 DNA, with a focus on genes linked to the novel L1-G4 sequence. The objectives for this study are: 1) to assess the G4 DNA distribution and patterns in the human genome and its correlation with gene expression; 2) to categorize G4 DNA within transposons; 3) to assess how genes with the novel L1-G4 DNA behave in disease contexts; and 4) to assess the biological role of the L1-G4 DNA structure.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Ruth Barros de Paula - Coordenador / Albino Bacolla - Integrante / Zamal Ahmed - Integrante / John A. Tainer - Integrante., Financiador(es): Cancer Prevention and Research Institute of Texas - Auxílio financeiro.

  • 2018 - 2019

    Perfil transcricional do genoma mitocondrial de fungos da ordem Hypocreales (Ascomycota), Descrição: O reino Fungi é composto por organismos versáteis e ubíquos. A ordem Hypocreales (Ascomycota) é composta por sete famílias que apresentam espécies de fungos com diferentes funções ecológicas e de interesse biotecnológico. Alguns trabalhos recentes demonstram a presença de elementos móveis incorporados no genoma mitocondrial fúngico de gêneros da ordem Hypocreales, fazendo com que o genoma desses organismos expandisse de tamanho e tivesse fases de leitura alteradas, resultando em íntrons e fases de leitura aberta sem função definida (uORFs). Estes íntrons e uORFs podem vir a ser transcritos, gerando novos elementos móveis self-splicing, que, por sua vez, podem mudar a sequência de genes codificantes e sua transcrição, ou RNAs longos não codificadores de proteínas (lncRNAs). Os genes codificantes de proteínas mitocondriais têm sofrido constantes mudanças devido ao processo co-evolutivo entre a organela e o organismo eucarioto, sendo, por vezes, translocados para o genoma nuclear ou modificados a ponto de perderem sua sequência e/ou função originais. Os lncRNAs, mesmo não sendo traduzidos, podem possuir funções regulatórias relacionadas ao controle de expressão gênica de forma indireta, por meio do sequestro de micro RNAs (miRNAs), ou direta, por meio de contato direto lncRNA-DNA. Esse tipo de RNA não-codificante está amplamente presente no transcritoma dos eucariotos, mas ainda é pouco estudado; além disso, não há qualquer estudo esclarecendo o papel dos lncRNAs nas mitocôndrias de fungos. Logo, os objetivos do presente estudo são: (1) revisar sistematicamente a literatura a respeito de transcrição de lncRNAs em fungos; (2) analisar o perfil genômico geral e o perfil transcricional da mitocôndria de fungos da ordem Hypocreales; (3) triar possíveis lncRNAs em mitocôndrias de espécies da ordem Hypocreales; (4) analisar os possíveis lncRNAs encontrados quanto à estrutura e potencial de ligação com miRNAs.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ruth Barros de Paula - Integrante / Paula Luize Camargos Fonseca - Integrante / Aristóteles Góes Neto - Coordenador.

  • 2018 - 2018

    Entendendo lincRNAs: Avaliando o impacto de miRNAs nos níveis de lincRNAs, Descrição: Em humanos, DNA não codificador compõe ~98% do genome, e em torno de 58% das regiões transcritas em humanos codificam RNAs não codificadores do tipo longo. Apesar disso, essas moléculas continuam sendo pouco compreendidas. Nosso laboratório investiga os papeis de RNAs não codificadores longos e intergênicos (lincRNAs), que são RNAs não codificadores de proteínas, maiores que 200 nucleotídeos e transcritos de regiões que não sobrepõem genes codificadores de proteínas. Neste trabalho, nós tentamos contribuir para a investigação dos efeitos de miRNAs, outro tipo de RNA não codificador (ncRNA), nos níveis de lincRNAs; além disso, nós tentamos investigar o papel específico de partes da sequência de um lincRNA transcrito a partir de enhancer, usando o sistema de CRISPR/Cas9.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ruth Barros de Paula - Integrante / Adriano Biasini - Integrante / Ana Claudia Marques - Coordenador., Financiador(es): Institut Suisse de Recherches Experimentales Sur Le Cancer - Auxílio financeiro.

  • 2016 - 2018

    Avaliação da resposta de células B de memória na malária causada por Plasmodium vivax, Descrição: A proteção mediada por anticorpos contra os antígenos de fase sanguínea de Plasmodium spp é um componente importante da imunidade naturalmente adquirida. No caso do P. vivax, principal espécie causadora de malária no Brasil, a invasão dos reticulócitos é altamente dependente da ligação da proteína Duffy Binding Protein ? região II (DBPII) ao antígeno de grupo sanguíneo Duffy Antigen Receptor Chemokines (DARC), presente na superfície dos reticulócitos, o que faz desta proteína um importante candidato à vacina. Como na malária causada por P. vivax parece existir uma deficiência no estabelecimento da resposta de células B de memória (MBCs) de longa duração, a hipótese a ser investigada é se após uma única e curta exposição ao P. vivax e após um longo período sem reexposição ao parasito os indivíduos são capazes de gerar e manter as MBCs específicas. Utilizando os métodos de ELISA e ELISpot para analisar amostras de sangue de uma população exposta somente uma vez à malária (surto de malária ? Sousa, MG), foram obtidos resultados que comprovaram a existência de MBCs específicas após 8 anos do surto.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ruth Barros de Paula - Integrante / Luzia Helena Carvalho - Integrante / Flora Satiko Kano - Coordenador / Barbara Andreza Soares Lima - Integrante.

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Prêmios

2020

Best elevator speech - 1st place - Graduate Student Research Day, The University of Texas UTHealth Graduate School of Biomedical Sciences.

2018

Melhores apresentações orais - Avaliação da resposta de células B de memória na malária causada por Plasmodium vivax - RAIC 2018, FIOCRUZ Minas.

2017

TOEFL ITP - level B2, ETS.

2016

Melhores pôsteres - Avaliação Da Resposta De Células B Na Malária Por Plasmodium Vivax Em Uma População Exposta À Malária - RAIC 2016, FIOCRUZ Minas.

2014

Cambridge English Level B2 Certificate in ESOL International (First), Cambridge English Language Assessment.

2014

Desafio Bio.Lógico - 1 lugar, AppProva; Colégio Santo Agostinho - Unidade Belo Horizonte.

2013

Voluntariado Pastoral - Hospital Mário Penna, Colégio Santo Agostinho - Unidade Belo Horizonte.

2013

Language Proficiency Attained: Advanced 2 - Completed with Distinction, Quest Language Studies - Languages Canada.

Histórico profissional

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Experiência profissional

2019 - Atual

The University of Texas MD Anderson Cancer Center

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2018 - 2018

Universite de Lausanne

Vínculo: Estudante de curso de verão, Enquadramento Funcional: Estudante de curso de verão, Carga horária: 40

2015 - Atual

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Aluno de graduação, Enquadramento Funcional: Estudante de graduação

2018 - 2019

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Iniciação Científica, Carga horária: 20

2016 - 2018

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Iniciação Científica, Carga horária: 20