José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck
possui graduação em Medicina (1987) pela Universidade de São Paulo, mestrado (1993) e doutorado (1997) em Fisiologia Comparativa do Metabolismo Energético pelo Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo e doutorado (2006) em Engenharia Elétrica pela Escola Politécnica da Universidade de São Paulo. É professor associado (livre docente) do Departamento de Fisiologia do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Fisiologia Geral, Comparativa, Cardiovascular e do Metabolismo Energético, com ênfase em nos seguintes temas: modelagem matemática, sistemas dinâmicos, geração de entropia em processos biológicos, escala biológica, efeitos da temperatura, métodos de medição e estimativa. Faixa preta de Kung Fu estilo Tang Lang (2018).
Informações coletadas do Lattes em 20/07/2024
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Engenharia Elétrica
2001 - 2006
Universidade de São Paulo
Título: Controle metabólico frente a mudanças na temperatura corpórea
Luiz Henrique Alves Monteiro. Palavras-chave: sistemas dinâmicos; efeitos da temperatura; taxa metabólica.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Geral / Especialidade: Metabolismo Energético. Grande Área: Engenharias / Área: Engenharia Elétrica. Setores de atividade: Outros.
Doutorado em Ciências (Fisiologia Geral)
1993 - 1997
Universidade de São Paulo
Título: Fisiologia respiratória, termal e metabólica de beija-flores: avanços e dificuldades proporcionados pelo modelo experimental
Orientador: José Eduardo Pereira Wilken Bicudo
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: respirometria; consumo de oxigênio; beija-flor; ventilação; depressão metabólica.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada / Especialidade: Respiração. Setores de atividade: Outros.
Mestrado em Ciências (Fisiologia Geral)
1990 - 1993
Universidade de São Paulo
Título: Consumo de oxigênio, quociente respiratório, controle da temperatura e atividade muscular durante a eutermia, torpor e fase pré-torpor em duas espécies de beija-flor, Ano de Obtenção: 1993
Orientador: José Eduardo Pereira Wilken Bicudo
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: respirometria; controle da temperatura corpórea; eutermia; consumo de oxigênio; depressão metabólica; beija-flor. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada / Especialidade: Respiração. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada / Especialidade: Depressão Metabólica. Setores de atividade: Outros.
Especialização - Residência médica
1989 - 1990
Universidade de São Paulo
Residência médica em: Clínica médicaNúmero do registro: CRM-SP 0085. Palavras-chave: medicina interna.Grande área: Ciências da SaúdeSetores de atividade: Cuidado À Saúde das Pessoas.
Pós-doutorado
2006
Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: Um Modelo Térmico Dinâmico para Análise de Alguns Problemas de Escala do Metabolismo Energético, Ano de obtenção: 2006., Palavras-chave: alometria; consumo de oxigênio; taxa metabólica; controle da temperatura corpórea; sistemas dinâmicos; termodinâmica, análise. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada / Especialidade: Metabolismo Energético. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada / Especialidade: Evolução.
1997 - 1998
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunologia Celular / Especialidade: Bioestatística.
Formação complementar
1991 - 1992
Divisão de Métodos Gráficos. (Carga horária: 320h). , Instituto do Coração da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, INCOR, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada/Especialidade: Modelagem Matemática.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia do Esforço.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada/Especialidade: Metabolismo Energético.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia de Órgãos e Sistemas/Especialidade: Fisiologia Cardiovascular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia de Órgãos e Sistemas/Especialidade: Fisiologia da Respiração.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Fisiologia / Subárea: Fisiologia Comparada/Especialidade: Fisiologia Comparativa.
Participação em eventos
38th world congress of The International Union of Physiological Sciences. EFFECT OF TIME TO EXHAUSTION ON THE BEHAVIOUR OF ELECTROMYOGRAM?S FREQUENCY PROFILE OF ANTAGONIST AND AGONIST MUSCLE DURING REPEATED CONTRACTIONS UNTIL FATIGUE. 2017. (Congresso).
Brics inaugural conference of exercise and sports science 2017. Applicability of an interactive MATLAB graphic interface code on the identification of electrical muscle activity during dynamic Biceps Brachii contractions. 2017. (Congresso).
Brics inaugural conference of exercise and sports science 2017. Correlations among Estimators of Heart-Rate Variability and Complexity in the Transition from Rest to Low Intensity Physical Activity. 2017. (Congresso).
Brics inaugural conference of exercise and sports science 2017. Changes in heart-rate variability associated with age in fitness-matched subjects under high intensity exercise. 2017. (Congresso).
Brics inaugural conference of exercise and sports science 2017. Effects of speed and slope on muscle activation variability during treadmill running. 2017. (Congresso).
XXXII Reunião da FeSBE. Investigation of electromyogram complexity via a1ApEn during isometric exercises of different intensities. 2017. (Congresso).
8a Semana Temática do Institutod e Biociências/USP.O Homem que Não Calculava e Suas Histórias Biológicas. 2005. (Encontro).
XX FeSBE. Teoria de Controle de Fluxo Metabólico. 2005. (Congresso).
Size as a Determinant of Biological Processes.Control of Metabolic Rate is a Hidden Variable in Alometric Scaling of Homeotherms. 2004. (Simpósio).
I Painel de Profissões.Ciências Biomédicas. 2003. (Seminário).
XVIII reunião FeSBE. Controle Metabólico. 2003. (Congresso).
XVII Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental. Imunologia Comparativa e Teórica. 2002. (Congresso).
Curso Análise e Quantificação de Sinais Respirométricos. Análise e Quantificação de Sinais Respirométricos. 1998. (Congresso).
XI Reunião da FESBe. Sigh in Birds: adaptive and functional significances. 1996. (Congresso).
XI Reunião FESBe. Q10 Effects in Vertebrate Heterotherms. 1996. (Congresso).
Palestra. Endothermy and Metabolic Shifts in Hummingbirds. 1995. (Congresso).
Curso Influência de Parâmetros Físicos e Químicos nos Níveis Celular e Molecular. Pressão hidrostática. 1994. (Congresso).
Curso Extremos Fisiológicos: Aspectos Comparativos. Adaptações a hipóxia e às grandes altitudes. 1993. (Congresso).
Orientou
Variabilidade cardíaca ao longo do ciclo mesntrual; Início: 2022; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Geral) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);
Análise da geração de entropia na evolução de nefrons de mamíferos; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Pesquisa em Biologia) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo; (Orientador);
Modelagem da variabilidade cardíaca por sistemas dinâmicos; Início: 2023; Iniciação científica (Graduando em Engenharia Elétrica) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Avaliação da relação testosterona/cortisol em maratonistas submetidos a provas de 10 e 42Km; 2016; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Geral) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo,; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Análise do Controle Cardíaco no Duplo Equivalente Mecânico da Locomoção Terrestre; 2016; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Geral) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Complexidade de Passadas no Duplo Equivalente Mecânico da Locomoção Terrestre; 2016; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Geral) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
ELETROMIOGRAMA E COMPLEXIDADE DO SINAL PARA AVALIAR EFEITOS DE SUPLEMENTAÇÃO COM BETA-ALANINA NA PROGRESSÃO PARA FADIGA EM ISOMETRIA; 2016; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Geral) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Entropia informacional na ontogênese de ritmo metabólico em Apis melifera; 2011; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Comparativa) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo,; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Otimização da Demanda Energética em Pequenos Endotermos; 2009; Dissertação (Mestrado em Biomatemática) - Escola Politécnica da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Modelagem da minimização do processamento de informação na comunicação; 2009; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Comparativa) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Aspectos da transmissão e processamento de informação em canto de anuros; 2009; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Comparativa) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Investigação do Caráter Evolutivo/Adaptativo do Comportamento Doente na Transmissão de Agentes Infecciosos; 2009; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Comparativa) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Modelagem do Controle Motor para Minimização da Geração de Entropia em Processos Mecânicos Periféricos; 2008; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Comparativa) - Instituto de Biociências da USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Aspectos Comparativos dos Efeitos da Temperatura em Sistemas de Lise Celular; 2003; 0 f; Dissertação (Mestrado em Fisiologia Comparativa Instituto de Biociências) - Universidade de São Paulo,; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
BUSCA POR UMA OTIMIZAÇÃO DE PROCESSOS DE DESCOMPRESSÃO APLICADOS AO MERGULHO NÃO COMERCIAL; 2017; Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências (Fisiologia Geral)) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo,; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Investigação da influência de alterações associadas com a corrida no controle cardíaco e motor; 2015; Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências (Fisiologia Geral)) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Estudo in silico de Centros Geradores de Padrão: arquiteturas mínimas de funcionamento e fluxo interno de informação; 2013; Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Ciências (Fisiologia Geral)) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo,; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Transporte de água durante a regulção de volume em células de melanoma murino linhagem S-91submetidas a condições anisosmóticas; ; 2007; Tese (Doutorado em Fisiologia Comparativa) - Instituto de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Regulação de volume celular em hemócitos do mexilhão marinho Perna perna; 2005; 0 f; Tese (Doutorado em Fisiologia Comparativa Instituto de Biociências) - Universidade de São Paulo,; Coorientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Integração numérica de modelo de descompressão com bolhas e inflamação; 2020; Iniciação Científica; (Graduando em Pesquisa em Biologia) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Análise da geração de entropia e otimização do processo de entrada e saída da depressão metabólica; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Pesquisa em Biologia) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
INFLUÊNCIA DE UMA ESTRATÉGIA DISSOCIATIVA SOBRE ÍNDICES DE CONTROLE CARDÍACO E NA TAXA DE PERCEPÇÃO DE ESFORÇO DURANTE ATIVIDADE FÍSICA; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Pesquisa em Biologia) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Perfil eletromiográfico do tríceps braquial como antagonista em contrações cíclicas não isométricas do bíceps até a fadiga; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Pesquisa em Biologia) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
El Dash; Análise de Complexidade Cardíaca via Entropia Informacional em Voluntários Durante o Repouso; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Pesquisa em Biologia) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Análise da Complexidade Cardíaca via Entropia Informacional em Voluntários Durante Exercício de Baixa Intensidade; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Pesquisa em Biologia) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Modelagem matemática do controle posicional e cinemático da musculatura esquelética; 2011; Iniciação Científica - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Modelo para crescimento celular com base em Sistemas Dinâmicos; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Estratégias de busca em ambientes homogêneos; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Massoline; Variabilidade da Freqüência Cardíaca em Anuros sob Estresse Térmico; 2004; Iniciação Científica; (Graduando em Fisiologia) - Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Variabilidade da Freqüência Cardíaca em Anuros sob Estresse Térmico; 2004; Iniciação Científica; (Graduando em Fisiologia) - Universidade de São Paulo, Pro-Reitoria de Pesquisa da USP; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Simulações das condições de coexistência de duas populações em ambiente restrito; 2004; Iniciação Científica; (Graduando em Matemática Aplicada em Biociências) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
A resposta imunitária e o exercício físico em anfíbios; 2003; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Fisiologia) - Universidade de São Paulo, Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Cientifica do Centro Universi; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Aspectos comparativos da influência da temperatura na dinâmica da interação antígeno-anticorpo em vertebrados; 2003; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Fisiologia) - Universidade de São Paulo, Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Cientifica do Centro Universi; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Análise da concentração de monócitos no compartimento sanguineo através da treoria de sistemas dinâmicos; 2002; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Fisiologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Mapa neural da minimização do trabalho ventilatório; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Fisiologia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Integração numérica de modelo de descompressão com bolhas e inflamação; 2020; Orientação de outra natureza; (Estágio obrigatório) - Insituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Comparação da performance entre corredores de provas curtas e ultramaratonistas em diferentes estados de hidratação; 2014; Orientação de outra natureza; (Estágio em pesquisa científica) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Variabilidades cardíaca e de passadas em atletas amadores; 2013; Orientação de outra natureza; (Fisiologia Geral) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Estabelecimento de plataforma para simulações matemáticas de sistemas complexos; 2004; Orientação de outra natureza; (Matemática Aplicada em Biociências) - Universidade de São Paulo, Pro-Reitoria de Pesquisa da USP; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Estudo aberto e não-comparativo da segurança e eficácia da atorvastatina no controle da dislipidemia mista em diabéticos tipo II; 2004; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Elaboração de um CD-ROM para ensino e pesquisa envolvendo dados de metabolismo aeróbio; 2003; 0 f; Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo, Pró Reitoria de Pós Graduação da Universidade de São Paulo; Orientador: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck;
Produções bibliográficas
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BARBUTO, J. A. M. . Introdução de erro em contagem de células. In: XV reunião da FeSBE, 2000, Caxambu. Caderno de Resumos da XV reunião da FeSBE, 2000.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; MONTEIRO, L. H. A. . O valor heurístico do Q10 calculado para a variação na taxa metabólica. In: XV reunião da FeSBE, 2000, Caxambu. Caderno de Resumos da XV reunião da FeSBE, 2000.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BARBUTO, J. A. M. . Análise da possibilidade de validação do uso da regressão linear em LDA. In: XIII reunião da FeSBE, 1998, Caxambu. Caderno de Resumos da XIII reunião da FeSBE, 1998.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Euthermia and torpor in two species of brazilian hummingbirds. In: International Conference on Comparative Physiology and Biochemistry - Animal Function, 1997, Skukuza. caderno de resumops da reunião, 1997.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Um erro crucial em pletismografia aberta: a confusão entre fluxo e volume. In: IX reunião da FeSBE, 1994, Caxambú. Caderno de Resumos da IX reunião da FeSBE, 1994.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Ausência de queda no quociente respiratório em beija-flores. In: IX reunião da FeSBE, 1994, Caxambú. Caderno de Resumos da IX reunião da FeSBE, 1994.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Uma distorção em respirometria aberta: a necessidade de se absorver CO2. In: IX reunião da FeSBE, 1994, Caxambú. Caderno de Resumos da IX reunião da FeSBE, 1994.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Alterações metabólicas incomuins em beija-flores em jejum. In: IX reunião da FeSBE, 1994, Caxambu. Caderno de Resumos da IX reunião da FeSBE, 1994.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Open-flow plethysmography: a new approach to measure Vt. In: American Physiological Society International Meeting, 1994, San Diego. The Physiologist, 1994. v. 37. p. 51-51.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Low RQ values in hummingbirds under fasting conditions. In: American Physiological Society International Meeting, 1994, San Diego. The Physiologist, 1994. v. 37. p. 90-90.
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Chaui-Berlinck, J. G. ; BICUDO, J. E. P. W. . Tem o ganho de oxigênio importância para insetos mergulhadores?. In: FeSBE, 1991, Caxambu. Caderno de REsumos da IV reunião da FeSBE, 1991.
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Chaui-Berlinck, JG . Sistema Cardiovascular. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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NAVAS, C. A. ; Chaui-Berlinck, J. G. . Biologia Humana. São Paulo: Dreampix Comunicação, 2004 (Apostila de apoio didático (programa pró-universitário usp / módulo 3)).
Outras produções
Chaui-Berlinck, J. G. ; MARTINS, R. . A.R. - Análise Respirométrica. 2003.
Chaui-Berlinck, José Guilherme . As Rotas de Propagação do Virus. 2020; Tema: Revisão sobre os meios de contágio do SARS-CoV-2 e um tutorial simples de interpretação de dados e modelos em epidemiologia. (Site).
Chaui-Berlinck, J. G. . Modelagem Matemática. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
Chaui-Berlinck, J. G. . Efeitos das Grandes Altitudes. 2001 (entrevista para televisão) .
Projetos de pesquisa
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2023 - Atual
GERAÇÃO DE ENTROPIA E CONTROLE DE FLUXOS FISIOLÓGICOS, Descrição: A manutenção da vida depende da manutenção do sistema orgânico fora de equilíbrio termodinâmico. Isto, por sua vez, implica na existência de fluxos tanto cruzando as fronteiras do sistema quanto internamente, devido às diferenças de potenciais sustentadas. O processo evolutivo por seleção natural, a despeito de não teleológico, gera otimizações nos sistemas biológicos. Esta afirmação é, contudo, menos simples do que podemos ser levados a crer, por dois motivos: os supostos ótimos não são ótimos globais pois dependem das restrições históricas do sistema em foco e o processo seletivo está sempre em marcha. Além disso, e essencial, é o fato de que a busca por reconhecer uma otimização implica em se ter um modelo do processo, o reconhecimento das restrições impostas/inerentes e a especificação do critério de performance utilizado (Kirk 2004). Neste último quesito, as otimizações biológicas são vistas, majoritariamente, como decorrentes de otimização energética em um dado fluxo. Por um outro viés, os fluxos devem ser regulados para a manutenção do meio interno (homeostase) em decorrência das condições tanto externas quanto internas vivenciadas num dado momento. Fluxos estão associados à geração de entropia pelo sistema, o que significa perda de capacidade de realização de trabalho útil. Assim, a questão das otimizações pode ser vista pelo viés entrópico, ou seja, qual o melhor caminho para se controlar um fluxo de forma a minimizar a geração de entropia associada a essa regulação. Para esta abordagem foi desenvolvido o coeficiente de controle de fluxo e geração e entropia (equação (7) no texto). Este coeficiente indica o impacto entrópico que um dado parâmetro de controle k causa no fluxo regulado, e o coeficiente foi recentemente utilizado para solucionar dois problemas de escala filogenética (constância da pressão arterial e proporção do volume sanguíneo). A presente proposta visa explorar o uso deste coeficiente em outros cenários, como a regulação do débito cardíaco; termorregulação e depressão metabólica; evolução de néfrons em mamíferos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / Pedro Goes Nogueira-de-Sá - Integrante / Franz Masatoshi Yuri - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Universidade de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
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2017 - Atual
Busca por uma otimização de processos de descompressão aplicados ao mergulho não comercial, Descrição: A redução da pressão ambiente após exposição a um ambiente pressurizado está relacionada um mal conhecido como Doença Descompressiva (Decompression Sickness, ou simplesmente DD). Os sintomas da Doença Descompressiva são divididos em dois grupos: músculo-esquelético (tipo I) e neurológico (tipo II). Até o final da década de 1970, quando técnicas de ultrassonografia começaram a ser utilizadas para a investigação do problema, acreditava-se que a DD estava relacionada ao aparecimento de bolhas na circulação venosa (definidas para efeito desta pesquisa como venous gas emboli ou VGE). Com a utilização de técnicas de ultrassonografia progressivamente mais precisas, porém, foi constatado que em praticamente toda descompressão há formação de bolhas na circulação venosa, as quais são filtradas pelo pulmão e não estão associadas necessariamente ao aparecimento de sintomas de DD. Embora existam indícios de que casos de DD tipo II estejam associados à passagem destas bolhas para a circulação arterial via algum shunt (pulmonar ou cardíaco), não há claro entendimento sobre a questão. Além do aparecimento de bolhas, há importantes alterações fisiológicas associadas à descompressão. Alterações na função endotelial com surgimento de marcadores bioquímicos na corrente sanguínea e o desencadeamento de respostas imunológicas, que, ultimamente, podem levar ao aparecimento de sintomas de DD, foram extensivamente documentadas em estudos anteriores. Recentemente, obtivemos resultados quanto à variabilidade cardíaca que podem estar associados às alterações endoteliais/imunitárias acima citadas. O presente estudo visa associar alterações fisiológicas, particularmente quanto à variabilidade/complexidade cardíaca e expressão de marcadores de superfície em leucócitos, ao perfil de descompressão, e formular propostas de mudanças nos limites de supersaturação dos compartimentos teóricos admitidos pelos algoritmos existentes, com base na identificação do padrão de alterações observadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / EL-DASH, VIVIAN - Integrante / EL-DASH, INGIRD - Integrante / Sérgio Rhein Schirato - Integrante.
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2014 - 2017
ENTROPIA APROXIMADA DA ÁREA 1: VALIDAÇÃO DA FERRAMENTA DE ANÁLISE EM DADOS EMPÍRICOS, Descrição: A Entropia Aproximada (ApEn) é uma ferramenta de análise não-linear extremamente popular. Contudo, devido à escolha arbitrária de parâmetros para a aplicação da ferramenta, os resultados podem perder consistência: duas séries claramente distintas poderão ser classificadas de maneiras opostas dependendo da escolha feita pelo observador. Identificam-se duas tentativas para suplantar esta falta de consistência. Uma destas, pApEn, obtém o valor de pico de ApEn num vetor de tolerâncias. A outra, vApEn, é baseada no duplo somatório de valores de ApEn ao longo de todas as janelas e tolerâncias possíveis numa dada série temporal. pApEn é muito mais robusta que ApEn, contudo, devido à escolha de janela, ainda há subjetividade na análise. Mais ainda, recentes testes pelo nosso grupo indicam que certas inconsistências podem ocorrer. Por outro lado, a vApEn é uma ferramenta de altíssima demanda computacional, e se torna proibitiva para séries com mais que 400 pontos, mesmo em potentes plataformas convencionais. Desta forma, ainda há necessidade de melhorias na ferramenta. Recentemente, nosso grupo desenvolveu uma outra abordagem, baseada na área de janela 1 (a1ApEn), que mostramos ser mais consistente e robusta que as anteriores. Neste sentido, falta ser feita uma validação da a1ApEn em séries temporais reais, obtidas experimentalmente, de modo a expor o potencial da ferramenta. O presente projeto pretende fazer esta validação através da análise de dados de frequência cardíaca obtidos em condições bastante controladas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / José Eduardo Pereira Wilken Bicudo - Integrante / José Eduardo Soubhia Natali - Integrante / Vivian Machado Cusin Ahmed El-Dash - Integrante / Ingrid Machado Cusin Ahmed El-Dash - Integrante / Paulo Nogueira Starzynski - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 6
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2009 - 2011
Modelo para crescimento celular com base em Sistemas Dinâmicos, Descrição: O foco do presente estudo é a formulação de modelos matemáticos quantitativos que permitam analisar as possíveis variáveis e dinâmicas envolvidas no processo de crescimento celular que ocorre durante a morfogênese. Tais modelos serão construidos por meio de um sistema formado por equações diferencias não-lineares capazes de descrever a dinâmica de crescimento entre duas populações celulares com auto-catálise e indução/inibição cruzada. Busca-se um modelo que apresente a propriedade de manter proporções celulares constantes, sendo que tal manutenção indica a robustez do modelo (e do sistema biológico simulado), aqui entendida como a manutenção de funções de maneira pouco sensível a flutuações nos componentes do sistema.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / Gustavo Bueno Romero - Integrante., Número de produções C, T & A: 1
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2006 - 2010
Geração de entropia em fluxos biológicos generalizados, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (5) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 10
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2004 - 2006
Variabilidade da Frequencia Cardíaca em Anuros, Descrição: o projeto se encontra inserido como um sub-projeto do temático fapesp 03/01577-8. Pretendemos abordar o nível de estresse a que o organismo (anfíbios) fica submetido em função das variações da temperatura ambiente. Esse nível será quantificado através da variabilidade da frequencia cardiaca dos animais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / Francine Rodrigues Massoline - Integrante / Breno Teixeira Santos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
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2004 - 2006
Reconstituição informacional no córtex motor, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador.
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2004 - 2005
Simulação de condições de subsistência em biorreatores, Descrição: O projeto se encontra como um sub-projeto dentro do temático fapesp 03/01577-8. Visamos simular diversas condições dentro de um biorreator, envolvendo a mobilidade dos organismos simulados, condições de coexistência de populações, convecção/difusão de substratos energéticos, propagação de doenças infecciosas, etc.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / Ricardo Martins - Integrante / Marco Antônio Oliveira da Silva - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2
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2002 - 2004
Mapa Neural do Trabalho Ventilatório, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / Ricardo Martins - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1
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2001 - 2003
Alometria do Compartimento de Linfócitos B, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / Francine Rodrigues Massoline - Integrante / Juliana Aparecida Corrêa - Integrante / Ana Paula Dantas Passos - Integrante., Número de produções C, T & A: 6
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2000 - 2001
Análise da concentração de monócitos no compartimento sanguineo através da teoria de sistemas dinâmicos, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: José Guilherme de Souza Chaui Mattos Berlinck - Coordenador / Kátia Iadocicco - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2
Prêmios
2009
Professor homenageado, Formandos 2004/2005 IBUSP.
2008
Paraninfo, Formandos 2003/2004 IBUSP.
2007
Paraninfo, Formandos 2002/2003 IBUSP.
2005
Professor homenageado, Formandos 2001/2002 IBUSP.
2004
Professor homenageado, Formandos 2000/2001 IBUSP.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade de São Paulo, Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral. , Rua do Matão 101, Butantã, 05508090 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30918075, URL da Homepage:
Experiência profissional
2003 - 2008
South American Society of Comparative Physiology and BiochemistryVínculo: sócio, Enquadramento Funcional: Tesoureiro
1998 - Atual
Universidade de São PauloVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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01/2002
Ensino, Fisiologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisiologia II (sistema cardiovascular)
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05/1998
Direção e administração, Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral.,Cargo ou função, Professor.
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05/1998
Pesquisa e desenvolvimento, Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral.,Linhas de pesquisa
-
06/2009 - 01/2013
Direção e administração, Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral.,Cargo ou função, Coordenador do Programa de Pós Graduação.
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01/2011 - 07/2012
Direção e administração, Instituto de Biociências.,Cargo ou função, Presidente da Comissão de Pós Graduação.
-
06/2001 - 12/2009
Ensino, Ciências (Fisiologia Geral), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, AlometriaI: forma e metabolismo, Fluidos e sistemas biologicos de transporte, Respirometria
-
07/2002 - 07/2008
Ensino, Fisiologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biomatamática I: fundamentos, Biomatemática II: equações diferenciais, Biomatemática III: dinâmica populacional
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08/2001 - 04/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral.,Cargo ou função, Membro de comissão permanente.
-
06/2000 - 04/2004
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral.,Cargo ou função, Membro de comissão temporária.
-
12/2001 - 12/2003
Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral.,Cargo ou função, Membro de comissão permanente.
-
05/1998 - 12/2001
Ensino, Fisiologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisiologia I (neurociências)
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09/2001 - 10/2001
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Departamento de Fisiologia Geral.,Atividade de extensão realizada, Curso de atualização.
1988 - 1988
Exército BrasileiroVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Outro (segundo-tenente médico), Carga horária: 40
Outras informações:
Serviço militar obrigatório como médico do exército
Atividades
-
01/1988 - 12/1988
Serviços técnicos especializados , Infantaria, 47 Batalhão de Infantaria.,Serviço realizado, médico do quartel.
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