Renata Carmona e Ferreira
Possui Graduação em Biologia pela Universidade Estadual de Campinas (2002) e Doutorado em Microbiologia e Imunologia pela Universidade Federal de São Paulo (2007). Fez Pós-Doutorado na Disciplina de Infectologia (2009 - 2012) pela Universidade Federal de São Paulo e Pós-doutorado em Neurociência 92014 - 2016) pela Penn State University. Atualmente é Chief Scientific Officer (CSO) da empresa Epigene. O principal objetivo da minha pesquisa é compreender a dinâmica evolutiva e os mecanismos moleculares que controlam a expressão de genes eucarióticos, através da análise de dados genômicos, transcriptômicos e epigenômicos. Eu trabalho neste campo desde o meu doutorado e tive a oportunidade de fazer contribuições em pesquisas básicas: (1) um modelo matemático da dinâmica de expressão de genes individuais que mostram que o ruído mínimo não corresponde a genes obedecendo a uma dinâmica estritamente deterministas; (2) a descoberta de que a recombinação intragênica é um mecanismo fundamental na determinação da diversidade alélica de linhagens híbridas de Trypanosoma cruzi; (3) e a genômica de tripanosomatídeos e (4) a primeira demonstração em retinas de mamíferos que a HDAC1 é essencial regulador epigenético na transição de células progenitoras para os bastonetes terminalmente diferenciados, bem como a investigação clínica (5) um método baseado em PCR em tempo real ensaio TaqMan MGB, usando DNA mitocondrial (mtDNA) como alvo, que identificam com precisão as três espécies do complexo de espécies Candida parapsilosis. Eu estou trabalhando atualmente nos mecanismos moleculares que controlam a expressão de genes na Esclerose Lateral Amiotrófica com foco em dados genômicos e epigenômicos. Também estou estudando as variações genômicas encontradas em gêmeos monozigótiocos discordantes para Narcolepsia do tipo 1 que possam explicar a variação encontrada no fenótipo desses indivíduos.
Informações coletadas do Lattes em 09/11/2024
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Microbiologia e Imunologia
2002 - 2007
Universidade Federal de São Paulo
Título: Análise da adaptação dos códons como ferramenta para predizer a abundância de uma proteina e sua correlação com o ruído na expressão gênica
Marcelo Ribeiro da Silva Briones. Coorientador: Francisco de Assis Bosco. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Pós-doutorado
2014 - 2016
Pós-Doutorado. , Pennsylvania State University, PSU, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.
2009 - 2012
Pós-Doutorado. , Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada / Especialidade: Microbiologia Médica. , Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação / Especialidade: Banco de Dados.
Formação complementar
2013 - 2013
48th Curso de Formação Profissional em Pesquisa Clínica. (Carga horária: 160h). , Invitare Pesquisa Clínica Auditoria e Consultoria, INVITARE, Brasil.
2010 - 2010
Workshop on Molecular Evolution. , Marine Biological Association Of The United Kingdom, Inglaterra.
2010 - 2010
PHP módulo 1. (Carga horária: 40h). , Impacta Certificação e Treinamento, IMPACTA, Brasil.
2010 - 2010
PHP módulo 2. (Carga horária: 40h). , Impacta Certificação e Treinamento, IMPACTA, Brasil.
2010 - 2010
MySQL módulo 1. (Carga horária: 40h). , Impacta Certificação e Treinamento, IMPACTA, Brasil.
2010 - 2010
MySQL módulo 2. (Carga horária: 32h). , Impacta Certificação e Treinamento, IMPACTA, Brasil.
2009 - 2009
Introdução à Lógica de Programação. (Carga horária: 40h). , Impacta Certificação e Treinamento, IMPACTA, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Clínica Médica/Especialidade: Neurologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Farmacologia / Subárea: Farmacologia Bioquímica e Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Organização de eventos
FERREIRA, R. C. . Introduction to Molecular Epidemiology of Tropical Diseases. 2005. (Outro).
Participação em eventos
XXII International Congress of Genetics. Mitochondrial Genome Polymorphisms Associated With Amyotrophic Lateral Sclerosis. 2018. (Congresso).
III Encontro de Atualização em Neurologia. 2017. (Encontro).
ARVO. Histone deacetylase 1 (HDAC1) is essential for rod differentiation in the mouse retina. 2015. (Congresso).
Eye and Vision Research Day. Histone deacetylase 1 (HDAC1) is essential for rod differentiation in the mouse retina. 2015. (Congresso).
Eye and Vision Research Day. 2014. (Congresso).
MOSTRATEC.Efeitos das condições de Crescimento na Morfologia Mitocondrial de Candida albicans. 2012. (Outra).
Yeast Genetics and Molecular Biology Meeting. Comparative genomics of Candida albicans mtDNA reveals intergenic regions under neutrality that readily identify geographic variants with clinical relevance for Candidemia. 2012. (Congresso).
How to Teach, how to learns the sciences - research based development and implementation. 2010. (Seminário).
Workshop on Molecular Evolution.Participante do Extended Topics. 2010. (Outra).
XIII International Congress of Protistology. Intragenic Recombination in Trypanossoma cruzi and its implication for the phylogeny of hibrid strains. 2009. (Congresso).
Gene Transcription in Yeast. Gene Expression Noise of Essential and Non-Essential Genes in Yeast. 2006. (Congresso).
Yeast Genetics and Molecular Biology Meeting. Noise and Essentiality in Yeast Gene Expression. 2006. (Congresso).
Congresso de Filogenia e Taxonomia de Fungos. 2005. (Congresso).
International Conference on BioInformatics and Computational Biology. 2004. (Congresso).
3 International Symposium of Mathematical and Computational Biology. 2003. (Congresso).
4 Congresso Nacional de Genética. 2002. (Congresso).
Participação em bancas
Ferreira, RC; INNOCENTINI, G.; MELLO, I.. Método de aprendizado de máquina não supervisionado aplicado ao estudo da propagação de ciclo único do HIV em cultivo celular. 2019. Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
EDMUNDO CARLOS GRISARD; ETHEL BAYER SANTOS;E FERREIRA, RENATA CARMONA. Secretoma e interactoma comparativo de Trypanosoma cruzi e Trypanosoma rangeli. 2017. Dissertação (Mestrado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo.
Renata C. Ferreira. O uso do escore poligênico como uma ferramenta de determinação de risco de esquizofrenia. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Biologia Estrutural e Funcional) - Universidade Federal de São Paulo.
Ferreira, RC; X, I.. Método de aprendizado de máquina não supervisionado aplicado ao estudo da propagação de ciclo único do HIV em cultivo celular. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.
E FERREIRA, RENATA CARMONA; Ana Lucia Brunialti Godard; Cléia Baiotto; Luciana Tovo-Rodrigues; JR. SOBRINHO, I. S.; Marilu Fiegenbaum; BERGAMO, N. A.;Marcelo R. Briones; Tabita Hunemeir; Regina Célia Mingroni-Neto; Tiago Campos Pereira; Rafael Hencke Tresbach; Celso Teixeira Mendes Junior; Claiton Henrique Dotto Bau; Mariana Rodrigues Botton. XXII International Congress of Genetics. 2018. Sociedade Brasileira de Genética.
Ferreira, RC. Membro Relator do Comitê de Ética em Pesquisa. 2018. Associação de Pais Amigos dos Excepcionais de São Paulo.
Orientou
Aspectos genéticos em narcolepsia: um estudo em gêmeos discordantes; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Psicobiologia) - Universidade Federal de São Paulo; (Coorientador);
Polimorfismos no genoma mitocondrial associados à Esclerose Lateral Amiotrófica; Início: 2016; Dissertação (Mestrado profissional em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);
Desenvolvimento de métodos de detecção de mutações patogênicas no genoma mitocondrial por novos algoritmos de redução da razão sigma to noise em dados de GWAS; ; Início: 2018; Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);
Distribuição de polimorfismos neandertais no genoma mitocondrial humano; 2017; Dissertação (Mestrado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Renata Carmona e Ferreira;
Identificação molecular e análise filogenética das espécies do complexo Candida parapsilosis utilizando genes mitocondriais; 2012; Dissertação (Mestrado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Renata Carmona e Ferreira;
Análise de polimorfismos como ferramenta para identificação de espécies do complexo Candida; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Renata Carmona e Ferreira;
Caracterização e análise da expressão do Gene Hipotético CaYLR339c de Candida albicans; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Centro Universitário Fundação Santo André; Orientador: Renata Carmona e Ferreira;
Aplicativo auxiliar a famílias de portadores de microcefalia; 2018; Orientação de outra natureza - Escola Antonietta e Leon Feffer; Orientador: Renata Carmona e Ferreira;
A influência do hormônio cortisol na Síndrome de Tourette; 2018; Orientação de outra natureza - Escola Antonietta e Leon Feffer- Uniidade Hebraica; Orientador: Renata Carmona e Ferreira;
Farmacogenômica na Síndrome de Chediak-Higashi; 2018; Orientação de outra natureza - Escola Antonietta e Leon Feffer; Orientador: Renata Carmona e Ferreira;
Produções bibliográficas
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Marcelo R. Briones ; Amanda M. Snyder ; Renata C. Ferreira ; Elizabeth B. Neely ; Janes R. Connor ; James R. Broach . A Possible Role for Platelet-Activating Factor Receptor in Amyotrophic Lateral Sclerosis Treatment. Frontiers in Neurology , v. 9, p. 39, 2018.
-
ANTONELI, FERNANDO ; Ferreira, Renata C. ; Briones, Marcelo R.S. . A model of gene expression based on random dynamical systems reveals modularity properties of gene regulatory networks. Mathematical Biosciences , v. 276, p. 82-100, 2016.
-
FERREIRA, RENATA C ; POPOVA, EVGENYA Y ; JAMES, JESSICA ; BRIONES, MARCELO RS ; ZHANG, SAMUEL S ; BARNSTABLE, COLIN J . Histone deacetylase 1 is essential for rod photoreceptor differentiation by regulating acetylation at histone H3 lysine 9 and histone H4 lysine 12 in the mouse retina. The Journal of Biological Chemistry (Print) , v. 292, p. jbc.M116.756643, 2016.
-
FRANCO, JAQUES ; Ferreira, Renata C. ; Ienne, Susan ; Zingales, Bianca . ABCG-like transporter of Trypanosoma cruzi involved in benznidazole resistance: Gene polymorphisms disclose inter-strain intragenic recombination in hybrid isolates. Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 31, p. 198, 2015.
-
IRINYI, L. SERENA, C. GARCIA-HERMOSO, D. ARABATZIS, M. DESNOS-OLLIVIER, M. VU, D. CARDINALI, G. ARTHUR, I. NORMAND, A.-C. GIRALDO, A. DA CUNHA, K. C. SANDOVAL-DENIS, M. HENDRICKX, M. NISHIKAKU, A. S. DE AZEVEDO MELO, A. S. MERSEGUEL, K. B. KHAN, A. ROCHA, J. A. P. SAMPAIO, P. DA SILVA BRIONES, M. R. CARMONA E FERREIRA, R. MUNIZ, M. D. M. CASTANON-OLIVARES, L. R. ESTRADA-BARCENAS, D. CASSAGNE, C. , et al. MARY, C. DUAN, S. Y. KONG, F. SUN, A. Y. ZENG, X. ZHAO, Z. GANTOIS, N. BOTTEREL, F. ROBBERTSE, B. SCHOCH, C. GAMS, W. ELLIS, D. HALLIDAY, C. CHEN, S. SORRELL, T. C. PIARROUX, R. COLOMBO, A. L. PAIS, C. DE HOOG, S. ZANCOPE-OLIVEIRA, R. M. TAYLOR, M. L. TORIELLO, C. DE ALMEIDA SOARES, C. M. DELHAES, L. STUBBE, D. DROMER, F. RANQUE, S. GUARRO, J. CANO-LIRA, J. F. ROBERT, V. VELEGRAKI, A. MEYER, W. ; International Society of Human and Animal Mycology (ISHAM)-ITS reference DNA barcoding database--the quality controlled standard tool for routine identification of human and animal pathogenic fungi. Medical Mycology (Oxford. Print) , v. 53, p. 313-337, 2015.
-
MERSEGUEL, KARINA BELLINGHAUSEN ; NISHIKAKU, ANGELA SATIE ; RODRIGUES, ANDERSON MESSIAS ; PADOVAN, ANA CAROLINA ; E FERREIRA, RENATA CARMONA ; SALLES DE AZEVEDO MELO, ANALY ; DA SILVA BRIONES, MARCELO RIBEIRO ; COLOMBO, ARNALDO LOPES . Genetic diversity of medically important and emerging Candida species causing invasive infection. BMC Infectious Diseases (Online) , v. 15, p. 57, 2015.
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NUNES, J. M. ; BIZERRA, F. C. ; FERREIRA, R. C. ; COLOMBO, A. L. . Molecular Identification, Antifungal Susceptibility Profile, and Biofilm Formation of Clinical and Environmental Rhodotorula Species Isolates. Antimicrobial Agents and Chemotherapy (Online) , v. 57, p. 382-389, 2012.
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BARTELLI, T. F. ; FERREIRA, R. C. ; COLOMBO, A. L. ; BRIONES, M. R. S. . Intraspecific comparative genomics of Candida albicans mitochondria reveals non-coding regions under neutral evolution. Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 14, p. 302-312, 2012.
-
Ienne, Susan ; Pedroso, Aurélio ; FERREIRA, R. C. ; Briones, Marcelo R.S. ; Zingales, Bianca . Network genealogy of 195-bp satellite DNA supports the superimposed hybridization hypothesis of Trypanosoma cruzi evolutionary pattern?. Infection, Genetics and Evolution (Print) , p. 601-606, 2010.
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FERREIRA, R. C. ; BOSCO, F. ; BRIONES, M. R. S. . Scaling properties of transcription profiles in gene networks. International Journal of Bioinformatics Research and Applications (Online) , v. 05, p. 178-186, 2009.
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FERREIRA, R. C. ; BOSCO, F. ; PAIVA, P.B. ; BRIONES, M. R. S. . Minimization of transcriptional temporal noise and scale invariance in the yeast genome. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 6, p. 397-414, 2007.
-
KRAUCHENCO, S. ; SILVA, J.A. ; NAGEM, R.A.P. ; BRANDÃO, J.R. ; FORRER, V.P. ; FERREIRA, R. C. ; MACEDO, J.C. ; MARANGONI, S. ; POLIKARPOV, I. . Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a novel trypsin inhibitor from seed of Copaifera langsdorffii. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION D, BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY , v. D57, p. 1316-1318, 2001.
-
Ferreira, Renata C. . Neuroepigenética: Padrões de acetilação de histonas no desenvolvimento da retina de mamíferos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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Ferreira, Renata C. . Neuroepigenética: Padrões de acetilação de histonas no desenvolvimento da retina de mamíferos. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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Ferreira, Renata C. ; POPOVA, E. ; JAMES, J. ; ZHANG, S. ; BARNSTABLE, C. J. . Histone Deacetylase 1 (HDAC1) is essential for rod differentiation in the mouse retina. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Ferreira, Renata C. . Neuroepigenética: Padrões de acetilação de histonas no desenvolvimento da retina de mamíferos. 2015. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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FERREIRA, R. C. ; BOSCO, F. ; BRIONES, M. R. S. . Scaling Properties of Transcription Profiles in Gene Networks. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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BOSCO, F. ; FERREIRA, R. C. ; BRIONES, M. R. S. . Decay of gene expression auto-correlation and emergence of decoherence in cell population. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. C. ; BOSCO, F. ; BRIONES, M. R. S. . Noise and essentiality in yeast gene expression. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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FERREIRA, R. C. ; BOSCO, F. ; BRIONES, M. R. S. . Gene Expression Noise of essential and non-essential genes in yeast. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
Projetos de pesquisa
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2019 - Atual
A Privação de sono e suas possíveis alterações cardíacas em um modelo da Doença de Parkinson induzida por 6-hidroxidopamina em ratos: compreensão para a morte súbita na Doença de Parkinson (SUDPAR)., Descrição: A doença de Parkinson (DP) é uma das doenças neurodegenerativas mais comuns relacionados à idade. Além disso, estudos epidemiológicos mostraram que pessoas com DP têm maior probabilidade de morrer prematuramente do que aquelas sem DP, e uma importante categoria de morte relacionada à DP é a morte súbita na doença de Parkinson (SUDPAR). Além disso, a causa da SUDPAR ainda é desconhecida; entretanto, os mecanismos comumente sugeridos são anormalidades cardíacas encontradas nos indivíduos com DP. Apesar da necessidade de estudos translacionais, alguns fatores de risco tem sido relacionados com a SUDPAR, tais como como idade de início, duração da DP, sexo, gravidade motora, doença cardíaca e pulmonar concomitante, tratamento medicamentoso (polifarmácia) e distúrbios do sono. As alterações do sono estão presentes em mais de 50% dos pacientes com DP e causam prejuízo na saúde e qualidade de vida dos pacientes. Nesse sentido, os objetivo desse estudo será investigar diversos parâmetros cardíacos (fisiológicos, inflamatórios e moleculares) através da privação de sono em um modelo da DP induzida por 6-hidroxidopamina.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Renata Carmona e Ferreira - Coordenador / Marcelo Ribeiro da Silva Briones - Integrante / Fulvio Alexandre Scorza - Integrante / Fernando Luiz Affonso Fonseca - Integrante / Mariana Bocca Nejm Abou Haidar - Integrante / Monica Levy Andersen - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Auxílio financeiro.
Prêmios
2018
Projeto de Ciências da Regional Sudeste na 9 Olimpíada Brasileira de Saúde e Meio Ambiente intitulado: "Aplicativo auxiliar a famílias de portadores de microcefalia", Fundação Oswaldo Cruz.
2013
Prêmio ?80 anos de Pesquisa? da Escola Paulista de Medicina ? com Fernanda Bartelli e Marcelo R.S. Briones, Universidade Federal de São Paulo.
2012
Segundo lugar na Categoria Biologia Celular e Molecular, Microbiologia - com Barbara Cohen e Marcelo R.S. Briones, 27 Mostra Brasileira de Ciência e Tecnologia (MOSTRATEC).
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade Federal de São Paulo, Departamento de Neurologia/Neurocirurgia, Disciplina de Neurologia Clínica. , Rua Pedro de Toledo, 669 quarto andar - fundos, Vila Clementino, 04023062 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (011) 55764537, Ramal: 3, Fax: (011) 55711095, URL da Homepage:
Experiência profissional
2017 - Atual
Universidade Federal de São PauloVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40
Outras informações:
Departamento de Neurologia, Setor de Doenças Neuromusculares
2009 - 2012
Universidade Federal de São PauloVínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pós-Doc, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2002 - 2007
Universidade Federal de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
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08/2018
Ensino, Informática e Saúde (Experimental), Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática
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07/2017
Pesquisa e desenvolvimento, Departamento de Neurologia/Neurocirurgia, Disciplina de Neurologia Clínica.,Linhas de pesquisa
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08/2018 - 11/2018
Ensino, Microbiologia e Imunologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Genômica Médica
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03/2018 - 06/2018
Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Módulo de Medicina de Precisão dentro do Curso de Semiologia do Adulto
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07/2002 - 11/2007
Pesquisa e desenvolvimento, Departamento de Microbiologia Imunobiologia e Parasitologia.,Linhas de pesquisa
2017 - Atual
Escola Antonietta e Leon Feffer - Unidade ParaisópolisVínculo: , Enquadramento Funcional:
2014 - 2016
Pennsylvania State UniversityVínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Pos-Doutorado, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
-
04/2014 - 03/2016
Pesquisa e desenvolvimento, Applied Research Laboratory, Neural and Behavioral Science.,Linhas de pesquisa
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Depois do processo concluído, quem acessar essa página será redirecionado para seu cantinho no Escavador, seunome.escavador.com. Onde você poderá fazer a sua reputação, conhecer gente antenada, se informar e até mesmo ganhar clientes. Tudo isso de graça!

Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Renata Carmona e Ferreira e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário

Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todas as movimentações desse processo e sempre que o processo aparecer em publicações dos Diários Oficiais e nos Tribunais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
Confirma a exclusão?