Vitor Barbanti Pereira Leite

obteve Bacharelado em Física, pelo Instituto de Física e Química de São Carlos (IFSC), Universidade de São Paulo (1983), mestrado em Física Aplicada pela Universidade de São Paulo (1988) e doutorado (Ph.D.) em Physics/Biophysics - University of California, San Diego (1995). Atualmente é professor Livre Docente na Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, campus no Campus de São José do Rio Preto. Tem experiência na área de Biofísica, com ênfase em Reações de Transferência de Carga e Enovelamento de Proteinas.

Informações coletadas do Lattes em 30/10/2019

Acadêmico

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Formação acadêmica

Doutorado em PhD Physics/Biophysics

1989 - 1995

University of California, San Diego
Título: Structure and dynamics of solvent landscapes in charge-transfer reactions
Orientador: José Nelson Onuchic
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Electron transfer reactions; Proton transfer reactions; solvent dynamics; Landscape theory; Spin glass models.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.

Mestrado em Física

1985 - 1988

Universidade de São Paulo
Título: Estudo do fluxo de fluidos em tomografia por ressonância magnética,Ano de Obtenção: 1988
Orientador: Horacio Carlos Panepucci
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Imagens por ressonância magnética; Medidas de fluxo; Ressonância magnética nuclear.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada / Especialidade: Ressonância Mag. e Relax. na Mat. Condens; Efeitos Mosbauer; Corr. Ang. Pertubada. Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Física / Subárea: Física da Matéria Condensada / Especialidade: Ressonância Mag. e Relax. na Mat. Condens; Efeitos Mosbauer; Corr. Ang. Pertubada. Setores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.

Graduação em Bacharelado Em Física São Carlos

1981 - 1983

Universidade de São Paulo

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Pós-doutorado

2007

Livre-docência. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Título: Modelos minimalistas em biofísica, Ano de obtenção: 2007., Palavras-chave: enovelamento de proteinas; modelos de rede; Transferência de elétrons; Transferência de prótons; Dinâmica de solvente., Grande área: Ciências Biológicas

1997 - 1998

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

1996 - 1997

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Formação complementar

1992 - 1992

College on Biophysics. , International Centre for Theoretical Physics, ICTP, Itália.

1991 - 1991

Princeton Lectures on Biophysics. , NEC Research Institute, NEC, Estados Unidos.

1988 - 1988

College on Neurophysics. , International Centre for Theoretical Physics, ICTP, Itália.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

    Grande área: Ciências Sociais Aplicadas / Área: Economia / Subárea: Métodos Quantitativos em Economia/Especialidade: Métodos e Modelos Matemáticos, Econométricos e Estatísticos.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Organização de eventos

CLEMENTI, C. ; WITHFORD, P. ; LEITE, V. B. P. . José Onuchic 60th Birthday Symposium. 2018. (Congresso).

KNELLER, G. ; LIWO, A. ; NIEMI, A. ; LEITE, V. B. P. . Workshop on Physics and Biology of Proteins. 2017. (Outro).

LEITE, V. B. P. ; Petrilli, H.M. . 1o. Workshop em Biofísica Molecular. 2015. (Congresso).

LEITE, V. B. P. ; Petrilli, H.M. ; WITHFORD, P. ; OLIVEIRA, O.N. ; Onuchic, José N. . Symposium on Current Topics in Molecular Biophysics: The Diversity of Biology: From Quantum Mechanics to Cellular Dynamics. 2014. (Congresso).

LEITE, V. B. P. . IV Semana da Física Biológica. 2007. (Congresso).

LEITE, V. B. P. . III Semana da Física Biológica. 2006. (Congresso).

LEITE, V. B. P. . XVI Semana da Matemática. 2004. (Congresso).

CALDEIRA, A. O. ; OLIVEIRA, L. N. ; LEITE, V. B. P. . XXII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. 1999. (Congresso).

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Participação em eventos

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Speeding Up Protein Folding by Non­Native Cooperative Effects. 2018. (Congresso).

Protein Biophysics at the End of the World. Protein Folding Funnels and Applications using Coarse-Grained Models. 2017. (Congresso).

Protein Folding, Evolution and Interactions.Non-native Interactions Explain the Folding Rate Differences in α-Spectrin Domains and the Origin of Internal Friction Effects. 2017. (Simpósio).

XLII Congress of the Brazilian Biophysical Society (SBBf). Distinguishing Pathways and Metastable States in Protein Folding. 2017. (Congresso).

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Study of Agonist­Antagonist Conformational Transitions of Estrogen Receptor using a Dual­Basin Structure Based Mode. 2016. (Congresso).

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Visualization of protein folding funnels in lattice models. 2014. (Congresso).

ISCB-LA / X-Meeting / BSB / SolBio. 2014. (Congresso).

Latin American Student Council Symposium.Analyzing the effect of homogeneous frustration in protein folding. 2014. (Simpósio).

VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.Analyzing the effect of homogeneous frustration in protein folding. 2014. (Outra).

XLIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. 2014. (Congresso).

Black Forest Focus 9: Protein Dynamics: From Water Hydration to Crowding Effects. 2013. (Oficina).

International Symposium on Physical Principles and Underlying Mechanisms of Bio-molecules and Materials.Visualization of protein folding funnels using simplified models. 2013. (Simpósio).

Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis. 2013. (Oficina).

3 Encontro da rede nBioNet, Films and Sensors. 2012. (Encontro).

7th International Symposium on Advanced Materials and Nanostructures (7th ISAMN).Protein folding studies of optimum frustration regimes in structure-based models. 2012. (Simpósio).

8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting. 2012. (Congresso).

CECAM-ETHZ- Protein Folding: Integrating theory, simulation and experiment.Quantified Topography of Funneled Landscape Determines the Thermodynamics and Kinetics of Protein Folding. 2012. (Oficina).

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Kinetics and thermodynamics of protein folding: when does a little frustration help?. 2012. (Congresso).

II Conferencia USP em Nanotecnologia. 2012. (Encontro).

VI Escola de modelagem molecular em sistemas biologicos. Visualizacao e caracterizacao de funis de enovelamento usando modelos simplificados. 2012. (Congresso).

II Workshop da Rede de Nanobiotecnologia em Filmes Finos.Energy Landscape and Minimalist Models Applied to Macromolecules. 2011. (Outra).

IUPAC 7th International Conference on Biological Physics. uantified Topography of Funneled Landscape Determines the Thermodynamics and Kinetics of Protein Folding. 2011. (Congresso).

Simpósio Interdisciplinar Física + Bioinformática.Characterizing protein folding funnels using coarse-grained models. 2011. (Simpósio).

V Encontro de Ciencias da Vida.Tecnologias Aplicadas a Biologia/Bioinformatica. 2011. (Encontro).

24th Symposium of The Protein Society.Role of Hydrophobicity in Protein Evolution. 2010. (Simpósio).

I Workshop da Rede Nanobiotecnologica em Filmes Finos. 2010. (Outra).

Workshop on Second Generation Bioethanol: enzimatic hydrolysis by fungi. 2010. (Outra).

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Configurational Dependent Diffusion Can Shift the Transition State and Barrier Height of Protein Folding. 2008. (Congresso).

XIV Simpósio Brasileiro de Química Teórica.Construção de um modelo PLS utilizando propriedades teóricas para descrever a toxicidade de diversos fenóis. 2007. (Simpósio).

XXX Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada.Análise da relação entre homologia de sequências e grau de hidrofobicidade. 2007. (Encontro).

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. 2006. (Congresso).

XXXVII Latin American School of Physics.Latin American School of Physics. 2006. (Outra).

XIII Simposio Brasileiro de Química Teórica. XIII Simposio Brasileiro de Química Teórica. 2005. (Congresso).

5th International Conference on Biological Physics. 5th International Conference on Biological Physics. 2004. (Congresso).

Curso de Verão em Biofísica Molecular. Modelos de sistemas complexos em biofísica. 2004. (Congresso).

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. 2004. (Congresso).

Curso de Verão em Biofísica Molecular.Reações de Transferência de Carga em Sistemas Biológicos. 2003. (Encontro).

Escola ?Computação de Alto Desempenho para Sistemas Complexos.. Enovelamento de proteínas: Estudo de superfícies de potencial e parâmetros de ordem.. 2003. (Congresso).

Venha nos Conhecer.Física Biológica. 2003. (Oficina).

Biophysics Seminar.Kinetic and Thermodynamic behavior of mutations on optimally designed protein sequences.. 2002. (Seminário).

Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. Gordon Research Conference on Protein Folding Dynamics. 2002. (Congresso).

Venha nos Conhecer.Física Biológica. 2002. (Oficina).

Worshop de Sistemas Complexos e Aplicações de 2002.Dinâmica de solventes em reações de transferência de elétrons e enovelamento de proteínas.. 2002. (Seminário).

Departmental Colloquium.Reaction coordinates and order parameters in complex biophysical problems: Solvent dynamics in electron transfer reactions and protein folding. 2001. (Seminário).

Seminário do Departamento de Física Geral - IF - USP.Coordenadas de reação e parâmetros de ordem em problemas de biofísica.. 2001. (Seminário).

Colóquio especial.Modelos simples para problemas complexos em biofísica.. 2000. (Seminário).

Seminário do Departamento de Física - UFPB.Coordenadas de reação e parâmetros de ordem em problemas de biofísica.. 2000. (Seminário).

Seminário do Departamento de Física - IBILCE - UNESP.Aspectos de reações de transferência de carga. 1997. (Seminário).

Seminário do DFCM - IFSC USP.Modelos simples de dinâmica de solvente em reações de transferência de carga. 1996. (Seminário).

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Participação em bancas

Aluno: Ronaldo Junio de Oliveira

LEITE, V. B. P.; ARAUJO, A. F. P.; CALIRI, A.. Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteínas na rede. 2007. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista.

Aluno: Luiz Paulo Rodrigues de Freitas Parreiras

VICENTE, R.LEITE, V. B. P.CATICHA, N.. Arbitragem estatística e inteligência artificial. 2007. Dissertação (Mestrado em Modelagem Matemática em Finanças) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Andre Luiz Martins

CHAHINE, Jorge; SILVA, M. A. A.;LEITE, V. B. P.. Predição de Estruturas de Proteínas Utilizando o Algoritmo da Rede Elastica. 2005. Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista.

Aluno: Patrícia Targon Campana

LEITE, V. B. P.; Beltramini, L. M.. Desnaturação e reenovelamento da frutalina, uma lectina ligante de D-galactose. 1998. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Bruno Herbert B

LEITE, V. B. P.Moraes, F.. Lima. Sóliltons acoplados e o transporte de carga em sistemas de pontes de hidrogênio. 1998. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Marcelo K

LEITE, V. B. P.Sanches, R.. K. Nakaema. Estudos espectroscópicos do processo de transferência de elétrons em um meio rígido. 1996 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ricardo Hildebrand Theodoro da Silva

LEITE, V. B. P.; CALIRI, A.; YAMAGISHI, M.; SCOTT, L.P.B.; CARVALHO, S. J.. Efeitos de hidrofobicidade em evolução de proteínas. 2009. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Linder Cândido da Silva

OLIVEIRA, O.N.; Petrilli, H.M.; BARBOSA, M. C. B.; LIBERO, V. L.;LEITE, V. B. P.. Simulações por dinâmica molecular aplicadas ao estudo de defeitos em cristais coloidais bidimensionais. 2008. Tese (Doutorado em Doutorado em Fisica Aplicada) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alexandre Ferreira Ramos

Hornos, J.E.M.; Barata, J.C.A.; Bich, P.M.; ONODY, R. N.;LEITE, V. B. P.. Simetrias de Lie e modelagem estocastica da regulação da expressão gênica. 2008. Tese (Doutorado em Fisica (Sc)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leandro Cristante de Oliveira

LEITE, V. B. P.; Martinez, A.S.; CALIRI, A.; ARAUJO, A. F. P.; Ruggiero, J.R.. Aspectos de topologia e mutação no processo de enovelamento e evolução de proteínas. 2008. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luciana Claudia de Paula Alonso

LEITE, V. B. P.; SILVA, F. L. B.; Freitas, L.C.G.; ANDRADE, P. C.; DRIGO FILHO, E.. Dinâmica de modelos minimalistas de solvente em reações de transferência de elétrons: aplicação à experimentos de única molécula. 2006. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista.

Aluno: Otávio Luís de Santana

GAMA, A. A. S.;LEITE, V. B. P.. Desenvolvimento de Métodos e Aplicativos para o Estudo de Transporte de Elétrons em Sistemas-Modelo. 2004. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Luis Paulo Barbour Scott

CHAHINE, Jorge;LEITE, V. B. P.; GARRATT, R. C.; PASCUTTI, P. G.; SILVA, F. L. B.. Investigação da Utilização de Algorítimos Genáticos e Redes Neurais Artificiais na Predição de Estruturas Protéicas. 2003. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista.

Aluno: Paulo Cesar Peres de Andrade

LEITE, V. B. P.; ONUCHIC, José Nelson. Novo método teórico para calcular elementos de matriz de tunelamento entre centros doadores e receptores de elétrons em matéria condensada. 1998. Tese (Doutorado em Física) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ronaldo Junio de Oliveira

LEITE, V. B. P.; DRIGO FILHO, E.; Ruggiero, J.R.. Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteína. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Lessandra Eller

SILVA, M. A. A.; Ruggiero, J.R.;LEITE, V. B. P.. Simulação do enovelamento de modelos proteicos utilizando o método de crescimento de cadeis. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ricardo Hildebrand Theodoro da Silva

LEITE, V. B. P.; RUGGIERO NETO, J.; CARVALHO, S. J.. Análise da hidrofobicidade na evolução de proteínas. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ricardo Alexandre do Santos Silva

DRIGO FILHO, E.; CHAHINE, Jorge;LEITE, V. B. P.. Modelo vibracional para a molécula de DNA. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luciana Claudia de Paula Alonso

LEITE, V. B. P.; DRIGO FILHO, E.; Ruggiero, J.R.. Dinâmica de modelos minimalistas de solvente em reações de transferência de elétrons: aplicação à experimentos de única molécula. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Carlos Emidio Sampaio Nogueira

Ruggiero, J.R.; CHAHINE, Jorge;LEITE, V. B. P.. Estudo Estrutural por Dinâmica Molecular do Exopolissacarídeo da Burkholderia Cepacia. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Antonio Bento de Oliveira

LEITE, V. B. P.. Modelo computacional minimalista em enovelamento de proteínas - visualização do funil de enovelamento de proteína. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Juliana Sartori Pinto

LEITE, V. B. P.; CHAHINE, Jorge; Ruggiero, J.R.. Estudo de modos normais de vibração em proteínas. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Débora Tavares de Lima

LEITE, V. B. P.; CHAHINE, Jorge; Ruggiero, J.R.. Estudo de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estrutura. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Vinícius Contessoto

LEITE, V. B. P.; CHAHINE, Jorge; Ruggiero, J.R.. Estudo de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos Baseados em Estrutura. 2009. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Mariane Lopes de Paiva

LEITE, V. B. P.; CHAHINE, Jorge. Estudo de Funil de Enovelamento de Proteína em Rede Utilizando Análise de Componentes Principais. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista.

Colombo, MF;LEITE, V. B. P.; NERY, J. G.. Professor Substituto - Física II. 2010. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

CHAHINE, Jorge;LEITE, V. B. P.; CARVALHO, S. J.. Professor Substituto em Física I e Física Geral I. 2009. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

ALVES, N. A.; ONODY, R. N.; CALIRI, A.;LEITE, V. B. P.; OLIVEIRA, P. M. C.. Professor Doutor. 2008. Universidade de São Paulo.

LEITE, V. B. P.; AGOSTINHO NETO, A.; RUGGIERO NETO, J.. Professor Substituto - Eletromagnetismo e Física Matemática I. 2007. Universidade Estadual Paulista.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Comissão julgadora das bancas

Horacio Carlos Panepucci

LEITE, V. B. P.;PANEPUCCI, H. C.. IFQSC/USP. 1988. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

Mario Engelsberg

ENGELSBERG, M.; PANEPUCCI, Horacio Carlos. Instrumentação para imagens por RMN. 1988. Dissertação (Mestrado em Física) - Universidade de São Paulo.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Orientou

Fernando Bruno da Silva

Estudo dos estados meta-estáveis protéicos por simulações computacionais utilizando modelos simplificados; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Jorge Enrique Hernández González

Identificação in silico de novos inibidores competitivos e alostéricos das falcipaínas 2 e 3; Início: 2016; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Tiago Tambonis

Predição de epítopos usando o método Suvrel; Início: 2015; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Vinícius de Godoy Contessoto

Início: 2017; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Murilo Nogueira Sanches

Comparação de potenciais não-específicos com potenciais baseados em estrutura no estudo de enovelamento de proteínas; Início: 2018; Iniciação científica (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Fernando Bruno da Silva

Compreendendo a Cinética de Enovelamento da alfa-Espectrina por meio de Interações Não Nativas; 2017; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Lais Ozerin

Correlações entre valores-Phi, variabilidade sequencial e hidrofobicidade de proteínas; 2015; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Tiago Tambonis

Análise estatística em expressão diferencial de genes a partir de RNA-Seq; 2015; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho,; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Paulo Ricardo Mouro

Estudo da interação não-nativa no enovelamento de proteínas; 2014; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Antonio Bento de Oliveira Junior

Visualização do Funil de Enovelamento de Proteínas em Modelo de Rede; 2013; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Débora Tavares de Lima

Caracterização termodinâmica de proteínas com modelos baseados em estruturas; 2012; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Vinicius de Godoi Contessoto

Estudo do efeito da adição de frustração no enovelamento de proteínas utilizando modelos baseados em estruturas; 2012; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Rafael Rodrigues do Nascimento

Estudo conformacional do peptídeo IAN e seus fragmentos pelo método de análise sistemática reduzida; 2009; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Ronaldo Junio de Oliveira

Estudo do coeficiente de difusão no enovelamento de proteínas na rede; 2007; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Ricardo Hildebrand Theodoro da Silva

Comportamento termodinâmico e a cinética de mutações de proteínas otimamente desenhadas em modelo de rede; 2002; Dissertação - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Paulo Ricardo Mouro

Estudo do enovelamento da enzima SOD1 por simulações de dinâmica molecular; 2019; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Vinícius Martins de Oliveira

Efeito das interações eletrostáticas e de pH no enovelamento e estabilidade de proteínas; 2017; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Antonio Bento de Oliveira Junior

Visualização do Funil de Enovelamento de Proteínas em Modelos Baseados em Estrutura; 2017; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Vinicius de Godoi Contessoto

Estudo de interações eletrostáticas no processo de enovelamento e na estabilidade de proteínas utilizando modelos simplificados; 2016; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Marcelo Boareto do Amaral

Tópicos em sinalização celular e bioinformática: Princípios de funcionamento do circuito de sinalização Notch e aprendizagem supervisionada variacional de relevância; 2015; Tese (Doutorado em doutorado em física IFUSP) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Ronaldo Junio de Oliveira

Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas; 2011; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Ricardo H

Theodoro da Silva; Efeitos de hidrofobicidade em evolução de proteínas; 2009; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Leandro Cristante de Oliveira

Aspectos de topologia e mutação no processo de enovelamento e evolução de proteínas; 2008; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Luciana Claucia Paula Alonso

Dinâmica de modelos minimalistas de solvente em reações de transferência de elétrons: aplicação a experimentos de única molécula; 2006; 95 f; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Vinícius Martins de Oliveira

2018; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Vitor Barbanti Pereira Leite;

Gabriel G Slade

2015; Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Vitor Barbanti Pereira Leite;

Ronaldo Junio de Oliveira

Modelos baseados em estrutura no estudo de enzimas envolvidas na geração de bioetanol; 2013; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Vitor Barbanti Pereira Leite;

Leandro Cristante de Oliveira

2013; Associação Brasileira de Tecnologia de Luz Síncrotron, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Vitor Barbanti Pereira Leite;

Folashade Oluwatuyi

Predição por Ferramentas de Bioinformática de Estrutura Secundária da Proteína não-estrutural do Vírus da Hepatite C para Validação de Estrutura Terciária; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Antonio Bento de Oliveira Junior

Simulação Computacional em Enovelamento de Proteínas - Visualização do Funil de Enovelamento de Proteínas; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Juliana Sartori Pinto

Estudo de modos normais de vibração em proteínas; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Marcelo Boareto do Amaral

Predição de classes de enzimas por meio de agrupamento superparamagnético; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Aryane Tofanello de Souza

Novas ferramentas em Bioinformática: VCAKE, SSAKE, SHARCGS; 2008; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Fernando Bruno da Silva

Dinâmica de defeitos topológicos em cristais coloidais bidimensionais; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Matheus Pietro de Melo Lago

Estudos em enovelamento de proteínas; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Stéfanie Miranda

Estudos em enovelamento de proteínas; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Física) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Victoria Alves

Estudos em enovelamento de proteínas; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Física) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Rafael Gombrade

Utilização do Modelo Baseado em Estrutura Aplicado em Proteína Relacionada à Atividade Cancerígena; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

CLEBER FERNANDES FERREIRA

Prospecção de relações estrutura-função de glicosil-hidrolases com aplicações na produção de bioetanol; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Tiago Tambonis

Análise estatística baseada em métrica aplicada em expressão diferencial de genes a partir de RNA-Seq; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Lais Ozerin

Efeitos de valores-Phi e hidrofobicidade na variabilidade sequencial de proteínas; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

André Schraider Maizel

Papel da hidrofobicidade na evolução e variabilidade seqüencial de proteínas; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Débora Tavares de Lima

Estudo de Proteínas de Rápido Enovelamento com modelos C-alpha; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Vinícius Contessoto

Estudo de Proteínas de Rápido Enovelamento com Modelos C-alpha; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Fernando Rossales Castro

Topologia e dinâmica de defeitos em cristais colodais bidimensionais; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Marcelo Boareto do Amaral

Predição de classes de enzimas por meio agrupamento super-paramagnético; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Mariane Lopes de Paiva

Estudo de funil de enovelamento de proteínas em rede utilizando análise de componentes principais; 2007; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Rafael Rodrigues do Nascimento

Análise conformacional de pequenos peptídeos usando quimiometria; 2007; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Maria Teresa de Oliveira

Introdução ao estudo de enovelamento de proteínas; 2007; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Universidade Estadual Paulista; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Aline Barbizan

Determinação da Relação entre Estrutura-Propriedade de Diversos Fenóis Utilizando Descritores Teóricos e Quimiometria; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Química Ambiental) - Universidade Estadual Paulista, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Leonardo da Silva Lessa

Estudo do Coeficiente de Difusão no Enovelamento de Proteínas em modelos C-alpha; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Everaldo R

Nunes; Transferência de elétrons em sistemas desordenados; 2001; Iniciação Científica; (Graduando em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Vitor Barbanti Pereira Leite;

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Produções bibliográficas

  • 2019 HERNANDEZ GONZALEZ, JORGE ENRIQUE ; HERNANDEZ ALVAREZ, LILIAN ; PASCUTTI, PEDRO GERALDO ; Leite, Vitor B.P. . Prediction of Non-Competitive Inhibitor Binding Mode Reveals Promising Site for Allosteric Modulation of Falcipain-2. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B , v. 123, p. 7327-7342, 2019.

  • 2019 YANG, HUAN ; BANDARKAR, PRASAD ; HORNE, RANSOM ; Leite, Vitor B. P. ; CHAHINE, Jorge ; Whitford, Paul C. . Diffusion of tRNA inside the ribosome is position-dependent. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS , v. 151, p. 085102, 2019.

  • 2018 MARTINS DE OLIVEIRA, VINÍCIUS ; GODOI CONTESSOTO, VINÍCIUS DE ; BRUNO DA SILVA, FERNANDO ; ZAGO CAETANO, DANIEL LUCAS ; JURADO DE CARVALHO, SIDNEY ; PEREIRA LEITE, VITOR BARBANTI . Effects of pH and Salt Concentration on Stability of a Protein G Variant Using Coarse-Grained Models. BIOPHYSICAL JOURNAL , v. 114, p. 65-75, 2018.

  • 2018 CONTESSOTO, V. G. ; OLIVEIRA JUNIOR, A. B. ; Chahine, J. ; OLIVEIRA, R. J. ; LEITE, V.B.P. . Introdução ao problema de enovelamento de proteínas: uma abordagem utilizando modelos computacionais simplificados. Revista Brasileira de Ensino de Física (São Paulo) , v. 40, p. e4307, 2018.

  • 2018 BRUNI, Aline Thais ; CARVALHO, P. O. M. ; RODRIGUES, C. H. P. ; LEITE, V.B.P. . In silico methods in forensic science: quantum chemistry and multivariate analysis applied to infrared spectra of new amphetamine- and cathinone-derived psychoactive substances. Forensic Chemistry , v. 9, p. 21-34, 2018.

  • 2018 TAMBONIS, T. ; BOARETO, M. ; LEITE, V. B. P. . Differential expression analysis in RNA-seq data using a geometric approach. JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY , v. 25, p. 1-9, 2018.

  • 2018 CONTESSOTO, VINÍCIUS G. ; DE OLIVEIRA, VINÍCIUS M. ; FERNANDES, BRUNO R. ; SLADE, GABRIEL G. ; Leite, Vitor B. P. . TKSA-MC: A Web Server for rational mutation through the optimization of protein charge interactions. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS , v. 2018, p. 1-5, 2018.

  • 2018 HERNÁNDEZ-GONZÁLEZ, JORGE E. ; SALAS-SARDUY, EMIR ; HERNÁNDEZ RAMÍREZ, LUISA F. ; PASCUAL, MARÍA J. ; ÁLVAREZ, DIEGO E. ; PABÓN, ADRIANA ; Leite, Vitor B.P. ; PASCUTTI, PEDRO G. ; VALIENTE, PEDRO A. . Identification of (4-(9H-fluoren-9-yl) piperazin-1-yl) methanone derivatives as falcipain 2 inhibitors active against Plasmodium falciparum cultures. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS , v. 1862, p. 2911-2923, 2018.

  • 2018 B. DA SILVA, FERNANDO ; CONTESSOTO, VINÍCIUS G. ; MARTINS DE OLIVEIRA, VINÍCIUS M. ; CLARKE, JANE ; Leite, Vitor B.P. . Non-Native Cooperative Interactions Modulate Protein Folding Rates. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B , v. xxx, p. acs.jpcb.8b08990-xxx, 2018.

  • 2017 EBERLE, RAPHAEL ; ARNI, RAGHUVIR ; KAWAI, LIEGE ; Leite, Vitor ; CONTESSOTO, VINÍCIUS ; OLIVEIRA, VINICIUS ; CARUSO, ICARO ; CORONADO, MONIKA . Cold Shock Protein A from Corynebacterium pseudotuberculosis: Role of Electrostatic Forces in the Stability of the Secondary Structure. Protein and Peptide Letters , v. 24, p. 358-367, 2017.

  • 2016 CONTESSOTO, VINÍCIUS G. ; DE OLIVEIRA, VINÍCIUS M. ; DE CARVALHO, SIDNEY J. ; Oliveira, Leandro C. ; Leite, Vitor B. P. . NTL9 Folding at Constant pH: The Importance of Electrostatic Interaction and pH Dependence. Journal of Chemical Theory and Computation , v. 12, p. 3270-3277, 2016.

  • 2016 MOURO, PAULO RICARDO ; DE GODOI CONTESSOTO, VINÍCIUS ; CHAHINE, Jorge ; JUNIO DE OLIVEIRA, RONALDO ; PEREIRA LEITE, VITOR BARBANTI . Quantifying Nonnative Interactions in the Protein-Folding Free-Energy Landscape. Biophysical Journal (Print) , v. 111, p. 287-293, 2016.

  • 2015 BOARETO, M. ; CESAR, J. ; Leite, Vitor B. P. ; CATICHA, N. . Supervised Variational Relevance Learning, an analytic geometric feature selection with applications to omic data sets. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Print) , v. 12, p. 705-711, 2015.

  • 2015 BAKER, A. L. ; MATHERLY, C. ; Leite, Vitor B.P. . Successful U.S.-Brazilian Research Collaborations Require Key U.S. Institutional Competencies. International Research and Review , v. 4, p. 1-14, 2015.

  • 2014 DE MENDONÇA, MATHEUS R. ; RIZZI, LEANDRO G. ; CONTESSOTO, VINICIUS ; Leite, Vitor B. P. ; ALVES, NELSON A. . Inferring a weighted elastic network from partial unfolding with coarse-grained simulations. Proteins (Print) , v. 84, p. 119-129, 2014.

  • 2014 OLIVEIRA, ANTONIO B. ; FATORE, FRANCISCO M. ; PAULOVICH, FERNANDO V. ; OLIVEIRA, OSVALDO N. ; Leite, Vitor B. P. . Visualization of Protein Folding Funnels in Lattice Models. Plos One , v. 9, p. e100861, 2014.

  • 2014 BRUNI, Aline Thais ; VELHO, J. A. ; FERREIRA, A. S. L. ; TASSO, M. J. ; FERRARI, R. S. ; YOSHIDA, R. L. ; DIAS, M. S. ; Leite, Vitor B.P. . Analysis of the procedures used to evaluate suicide crime scenes in Brazil: A statistical approach to interpret reports. Journal of Forensic and Legal Medicine , v. 26, p. 29, 2014.

  • 2014 NOEL, J. K. ; CHAHINE, Jorge ; LEITE, V. B. P. ; WITHFORD, P. . Capturing Transition Paths and Transition States for Conformational Rearrangements in the Ribosome. Biophysical Journal (Print) , v. 107, p. 2872-2881, 2014.

  • 2013 Paula, Luciana C. ; ANDRADE, P. C. ; LEITE, V. B. P. . MARCUS MODEL, TUNNELING MATRIX ELEMENT, SOLVENT EFECTS AND NUCLEAR CONTROL IN ELECTRON TRANSFER REACTIONS. Revista Brasileira de Ensino de Física (Impresso) , v. 35, p. 2315-1-2315-13, 2013.

  • 2013 CONTESSOTO, V. G. ; Débora Tavares Liima ; Oliveira, Ronaldo J. ; BRUNI, A.T. ; Chahine, J. ; LEITE, V. B. P. . Analyzing the effect of homogeneous frustration in protein folding. Proteins (Print) , v. 81, p. 1727-1737, 2013.

  • 2013 MANDELLI, F. ; FRANCO CAIRO, J.P.L. ; CITADINI, A.P.S. ; BÜCHLI, F. ; ALVAREZ, T.M. ; OLIVEIRA, R.J. ; LEITE, V.B.P. ; PAES LEME, A.F. ; MERCADANTE, A.Z. ; SQUINA, F.M. . The characterization of a thermostable and cambialistic superoxide dismutase from Thermus filiformis . Letters in Applied Microbiology , v. n/a, p. n/a-n/a, 2013.

  • 2013 COTA, JUNIO ; Oliveira, Leandro C. ; DAMÁSIO, ANDRÉ R.L. ; CITADINI, ANA P. ; HOFFMAM, ZAIRA B. ; ALVAREZ, THABATA M. ; CODIMA, CARLA A. ; Leite, Vitor B.P. ; PASTORE, GLAUCIA ; DE OLIVEIRA-NETO, MARIO ; MURAKAMI, MARIO T. ; RULLER, ROBERTO ; SQUINA, FABIO M. . Assembling a xylanase-lichenase chimera through all-atom molecular dynamics simulations. Biochimica et Biophysica Acta. Proteins and Proteomics , v. 1834, p. 1492-1500, 2013.

  • 2013 HOFFMAM, ZAIRA B. ; Oliveira, Leandro C. ; COTA, JUNIO ; ALVAREZ, THABATA M. ; DIOGO, JOSÉ A. ; OLIVEIRA NETO, MARIO ; CITADINI, ANA PAULA S. ; Leite, Vitor B. P. ; SQUINA, FABIO M. ; MURAKAMI, MARIO T. ; RULLER, ROBERTO . Characterization of a Hexameric Exo-Acting GH51 α-l-Arabinofuranosidase from the Mesophilic Bacillus subtilis. Molecular Biotechnology , v. n/a, p. n/a, 2013.

  • 2012 Xu, Weixin ; Xu, Weixin ; Lai, Zaizhi ; Oliveira, Ronaldo J. ; Leite, Vitor B. P. ; WANG, Jin ; WANG, Jin ; Lai, Zaizhi ; Leite, Vitor B. P. ; Oliveira, Ronaldo J. . Configuration-Dependent Diffusion Dynamics of Downhill and Two-State Protein Folding. Journal of Physical Chemistry. B , v. 116, p. 5152-5159, 2012.

  • 2012 Wang, J. ; OLIVEIRA, R. J. ; CHU, X. ; WHITFORD, P. C. ; Chahine, J. ; HAN, W. ; WANG, E. ; ONUCHIC, J. N. ; LEITE, V. B. P. . Topography of funneled landscapes determines the thermodynamics and kinetics of protein folding. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 109, p. 15763-15768, 2012.

  • 2012 BOARETO, MARCELO ; YAMAGISHI, MICHEL E.B. ; CATICHA, NESTOR ; Leite, Vitor B.P. . Relationship between global structural parameters and Enzyme Commission hierarchy: Implications for function prediction. Computational Biology and Chemistry (Print) , v. 40, p. 15-19, 2012.

  • 2010 Oliveira, Ronaldo J. ; Whitford, Paul C. ; CHAHINE, Jorge ; WANG, Jin ; Onuchic, José N. ; LEITE, V. B. P. . The Origin of Nonmonotonic Complex Behavior and the Effects of Nonnative Interactions on the Diffusive Properties of Protein Folding. Biophysical Journal (Print) , v. 99, p. 600-608, 2010.

  • 2010 Oliveira, Ronaldo J. ; Whitford, Paul C. ; CHAHINE, Jorge ; Leite, Vitor B.P. ; WANG, Jin . Coordinate and time-dependent diffusion dynamics in protein folding. Methods (San Diego, Calif., Print) , v. 52, p. 91-98, 2010.

  • 2008 Paula, Luciana C. ; WANG, Jin ; LEITE, V. B. P. . Statistics and kinetics of single-molecule electron transfer dynamics in complex environments: A simulation model study. Journal of Chemical Physics , v. 129, p. 224504, 2008.

  • 2007 VICENTE, R ; PEREIRA, C ; LEITE, V ; CATICHA, N . Long term economic relationships from cointegration maps. Physica. A (Print) , v. 380, p. 317-324, 2007.

  • 2007 Chahine, J. ; OLIVEIRA, R. J. ; LEITE, V. B. P. ; Wang, J. . Configuration-dependent diffusion can shift the kinetic transition state and barrier height of protein folding. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 104, p. 14646-14651, 2007.

  • 2006 VICENTE, R ; DETOLEDO, C ; LEITE, V ; CATICHA, N . Underlying dynamics of typical fluctuations of an emerging market price index: The Heston model from minutes to months. Physica. A (Print) , Estados Unidos, v. 361, n.1, p. 272-288, 2006.

  • 2006 Oliveira, Leandro C. ; Silva, Ricardo T. H. ; Leite, Vitor B. P. ; CHAHINE, Jorge . Frustration and hydrophobicity interplay in protein folding and protein evolution. The Journal of Chemical Physics , Melville, New York, v. 125, p. 084904, 2006.

  • 2005 Leite, Vitor ; Alonso, Luciana ; Newton, Marshall ; WANG, Jin . Single Molecule Electron Transfer Dynamics in Complex Environments. Physical Review Letters (Print) , Estados Unidos, v. 95, n.11, p. 118301, 2005.

  • 2004 Leite, Vitor B.P. ; Onuchic, José N. ; STELL, George ; WANG, Jin . Probing the Kinetics of Single Molecule Protein Folding. Biophysical Journal (Print) , EUA, v. 87, n.6, p. 3633-3641, 2004.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Outras produções

LEITE, V. B. P. . Modelos minimalistas em física biológica molecular. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Projetos de pesquisa

  • 2017 - 2019

    Relevo de superfícies de energia de macromoléculas biológicas com aplicações em biotecnologia e em biomedicina, Descrição: Projeto de Pesquisa Regular. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (6) . , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2015 - 2019

    Elucidating the role of disorder during biomolecular function, Descrição: FAPESP-Northeastern University Partnership Processo FAPESP 2014/50739-5 - SPRINT (Edição 2/2014). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (4) . , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador / Chahine, J. - Integrante / WHITFORD, P. C. - Integrante / Antonio José Costa-Filho - Integrante / David Budil - Integrante / Carla Mattos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Cooperação.

  • 2014 - 2018

    Disorder, tRNA composition and energy transduction in the ribosome, Descrição: NSF CARRIER AWARD. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Integrante / CHAHINE, Jorge - Integrante / WHITFORD, P. C. - Coordenador.

  • 2014 - 2016

    Estudos computacionais em enovelamento de proteínas e engenharia de enzimas envolvidas na geração de bioetanol, Descrição: Programas Regulares / Auxílios a Pesquisa / Projeto de Pesquisa para a aquisição de um cluster de computadores Valores outorgados: R$ 88.738,28 (nacional) e US$ 52.136,40 (importação). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2013 - 2013

    Using High Performance Computing to Reveal the Functional Dynamics of the Ribosome, Descrição: Tempo computacional em sistemas de computacionais de alta performance (HPC). Foram concedidas 2 milhões de horas de computação (core-hours).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Integrante / Paul Withford - Coordenador.

  • 2012 - 2014

    Estudos computacionais em enovelamento de proteínas e aplicações no estudo de enzimas envolvidas na geração de bioetanol, Descrição: Programas Regulares / Auxílios a Pesquisa / Projeto de Pesquisa para a aquisição de um cluster de computadores Valores outorgados: R$ 79.047,11 (nacional) e US$ 72.950,00 (importação). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2014

    Centro para Estudo de Sistemas Naturais e Artificiais de Processamento de Informação (CNAIPS), Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Nestor Felipe Caticha Alfonso em 04/03/2013., Descrição: Núcleos de Apoio à Pesquisa (NAPs) da Universidade de São Paulo. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (7) Doutorado: (3) . , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Integrante / Caticha, N. - Coordenador / VICENTE, R - Integrante.

  • 2009 - 2014

    Filmes Nanoestruturados com materiais de interesse biológico: ênfase em modelos de membrana e biossensores, Descrição: Projeto de Rede Nanobiotec-Brasil da Capes. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Integrante / Osvaldo Novaes de Oliveira Jr - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

  • 2009 - Atual

    Desenvolvimento e/ou Incorporação de Ferramentas para Mineração de Dados Genômicos, Descrição: Este é um projeto componente do Projeto Genômica Animal "Rede Nacional para desenvolvimento e Incorporação de Informações e Ferramentas de Genômica Animal para Avanço dos Processos de Melhoramento Genético e Produção Pecuária" da Embrapa.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Integrante / Michel Yamagishi - Coordenador., Financiador(es): Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Cooperação.

  • 2008 - 2012

    Estudos em enovelamento de proteínas, Descrição: Projeto de Colaboração Internacional Brasil-Estados Unidos. Instituições: DF - IBILCE - UNESP (Brasil), Center for Theoretical Biological Physics, Universidade da California, San Diego (Estados Unidos), Chemistry Department, State University of New York, Stony Brook (Estados Unidos). Valor: R$ 20.000,00/ano.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador / José Nelson Onuchic - Integrante / Jin Wang - Integrante / CHAHINE, Jorge - Integrante., Financiador(es): National Science Foundation - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Cooperação.

  • 2007 - Atual

    Modelos computacionais em física biológica molecular, Descrição: Bolsa de Produtividade em Pesquisa do CNPq - Nível 2. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2006 - 2009

    Modelos computacionais em física biológica molecular, Descrição: Neste projeto um cluster de computadores será implementado e dedicado ao estudo de modelos computacionais em física biológica molecular. O grau de sofisticação e complexidade dos problemas nesta área tem demandado um poder computacional crescente. Os principais tópicos a serem abordados neste projeto serão: (1) Estudo de dinâmica de solventes em reações de transferência de elétrons aplicados a experimentos de uma única molécula; (2) Estudos de otimização e mutação no enovelamento de heteropolímeros na rede: o papel da hidrofobicidade e suas implicações na evolução de proteínas; (3) Visualização de funis de enovelamento e estudo conformacional de peptídeos através de análise multivariada; (4) Estudos do coeficiente de difusão no enovelamento de proteínas; (5) Agrupamento não-paramétrico de aminoácidos. Estes problemas requerem um alto poder computacional, pois investigam espaços conformacionais muito grandes e/ou dinâmicas em baixas temperaturas do tipo das associadas a vidros de spin. Valor concedido: R$99.195,25 + US$2345,00. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2001 - 2003

    Estudos de superfícies de potencial em enovelamento de proteínas e em dinâmica de solventes em reações de transferência de elétrons., Descrição: Projeto de Colaboração Internacional Brasil-Estados Unidos. Instituições: DF - IBILCE - UNESP (Brasil) e Department of Physics, Universidade da California, San Diego (Estados Unidos). Valor: US$ 12.000,00/ano.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador / José Nelson Onuchic - Integrante., Financiador(es): National Science Foundation - Cooperação / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 1998 - 2001

    Modelos teóricos em reações de transferência de carga., Descrição: Projeto FAPESP de Apoio a Jovens Pesquisadores em Centros Emergentes. Processo FAPESP n° 1997/06267-4. Valor: R$ 48.000,00.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

  • 1996 - 1998

    Modelos simples para o estudo de dinâmica de solventes em reações de transferência de carga., Descrição: Projeto de Pesquisa FAPESP. Processo FAPESP n° 1996/ 06280-8. Valor: R$ 23.000,00.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Vitor Barbanti Pereira Leite - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

Histórico profissional

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Endereço profissional

  • Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física. , Rua Cristovão Colombo, 2265, Jd. Nazareth, 15054000 - São José do Rio Preto, SP - Brasil, Telefone: (17) 32212467, Fax: (17) 32212247, URL da Homepage:

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Experiência profissional

  • 2017 - 2017

    Universidade Federal do Rio Grande do Norte

    Vínculo: , Enquadramento Funcional:

  • 2014 - Atual

    Northeastern University

    Vínculo: , Enquadramento Funcional:

  • 1982 - 1988

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Sem enquadramento funcional

    Outras informações:
    - Inicição científica orientada pelo Dr. Robert Lee Zimermann. - Colaborador no desenvolvimento de projeto coordenado pelo Dr. Horacio Carlos Panepucci.

    Atividades

    • 08/1988 - 11/1988

      Ensino, Escola de Engenharia de São Carlos, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Monitor bolsista do curso Física Geral I.

    • 07/1983 - 12/1983

      Ensino, Bacharelado Em Física São Carlos, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Monitor bolsista do curso de Física.

    • 08/1982 - 07/1983

      Estágios , Instituto de Física de São Carlos, .,Estágio realizado, Iniciação Científica - Instrumentação Eletrônica..

  • 2007 - Atual

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Livre Docente, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2004 - 2007

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Assistente Dr., Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2002 - 2004

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor colaborador, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 1998 - 2002

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Pesquisador associado, Enquadramento Funcional: Pesquisador pela FAPESP, Carga horária: 0, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 10/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro do Conselho do Departamento de Física.

    • 06/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro do Conselho de Pós-Graduação em Biofísica Molecular.

    • 08/2014 - 12/2014

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (30h), Termodinâmica e Introdução a Física Estatística (60h)

    • 03/2014 - 07/2014

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Enovelamento e Transferência de Carga em Proteínas - 120h

    • 08/2013 - 12/2013

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformatica (60 hs), Introdução ao Sistema Operacional Linux para Físicos (30 hs)

    • 03/2013 - 07/2013

      Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral I (60 hs)

    • 03/2013 - 07/2013

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral II (60hs)

    • 04/2010 - 03/2013

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Vice-Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Biofísica Molecular.

    • 08/2012 - 12/2012

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática (60hs)

    • 03/2012 - 07/2012

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo (90hs), Física III (90hs)

    • 08/2011 - 12/2011

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática - 60hs, Física II - 90hs

    • 03/2011 - 07/2011

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral II - 60hs

    • 03/2011 - 07/2011

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Termodinâmica - 60hs

    • 08/2010 - 12/2010

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática - 60h, Física II - 60h

    • 03/2010 - 07/2010

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Termodinâmica - 60h

    • 04/2010 - 06/2010

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Enovelamento e Transferência de Carga em Proteínas - 120h

    • 08/2009 - 12/2009

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisica Geral III - 60h

    • 08/2009 - 12/2009

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática - 60h

    • 02/2009 - 07/2009

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisica Geral II - 120h

    • 08/2008 - 12/2008

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática - 60 horas

    • 08/2008 - 12/2008

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral I - 60 horas

    • 03/2008 - 07/2008

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Enovelamento e Transferência de Carga em Proteínas - 120 horas

    • 03/2008 - 07/2008

      Ensino, Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física II - 60 horas

    • 03/2007 - 12/2007

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática - 2o. semestre - 60 horas, Física IV - 60 horas, Bioinformática - 1o. semestre - 60 horas, Física III - 60 horas

    • 10/2005 - 10/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro do Conselho do Departamento de Física.

    • 07/2006 - 12/2006

      Ensino, Engenharia de Alimentos, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral II

    • 03/2006 - 12/2006

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental II - 120 horas

    • 03/2006 - 07/2006

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo - 90 horas

    • 03/2005 - 12/2005

      Ensino, Física Biológica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Eletromagnetismo, Fisica II, Fisica III

    • 03/2005 - 07/2005

      Ensino, Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física II

    • 03/2004 - 12/2004

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisica Geral e Experimental I

    • 03/2002 - 03/2004

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Matemática.,Cargo ou função, Membro do conselho de graduação.

    • 07/2003 - 12/2003

      Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Reaçoes de tranferência de carga em sistemas biológicos

    • 03/2003 - 12/2003

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Física Geral e Experimental I

    • 07/2002 - 12/2003

      Ensino, Matemática, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Fisica Geral e Experimental I

    • 10/1999 - 12/2001

      Direção e administração, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Coordenador dos seminários da pós-graduação da Biofísica.

    • 09/1998 - 08/2001

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, Departamento de Física.,Linhas de pesquisa

  • 1996 - 1997

    Universidade Federal de São Carlos

    Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Pesquisador no grupo do Dr. L.C.G. Freitas, com bolsa do CNPq (Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico), proc n. 301578/95-8.

    Atividades

    • 02/1996 - 07/1997

      Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia, Departamento de Química.,Linhas de pesquisa

  • 1989 - 1993

    University of California, San Diego

    Vínculo: Estudante de Pós-Graduação, Enquadramento Funcional: Livre, Carga horária: 20

    Atividades

    • 09/1989 - 09/1993

      Ensino, Lower division physics, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Lower division physics

  • 1995 - 1995

    San Diego City College

    Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor de matemática, Carga horária: 10

    Atividades

    • 01/1995 - 06/1995

      Ensino, Algebra, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, General algebra