Rafael Luiz Buogo Coan

Possui graduação em Medicina Veterinária pela Universidade do Estado de Santa Catarina (2008). Doutor e mestre pelo programa de pós-graduação em Ciências Biológicas (Genética) do Instituto de Biociências da UNESP de Botucatu, no Laboratório de Bioinformática e Biofísica Computacional (LBBC). Atualmente é pesquisador de pós-doutorado na Università degli Studi di Perugia (Itália). Usa como métodos de estudo o sequenciamento de larga escala (NGS), as análises de bioinformática (RNA-Seq, ChIP-Seq e biologia de sistemas) e as técnicas laboratoriais para entender os problemas biológicos.

Informações coletadas do Lattes em 01/12/2024

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)

2017 - 2022

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Biologia de sistemas aplicada ao estudo da progressão do sarcoma de Ewing
Ney Lemke. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)

2014 - 2016

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Análise genômica em larga escala de elementos repetitivos com foco em cromossomos B do ciclídeo Astatotilapia latifasciata
, Ano de Obtenção: 2016.Cesar Martins.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Morfologia / Subárea: Citologia e Biologia Celular.

Graduação em Medicina Veterinária

2003 - 2008

Universidade do Estado de Santa Catarina
Título: Relatório de Estágio Curricular Obrigatório
Orientador: Eduardo Santiago Ventura de Aguiar

Pós-doutorado

2022

Pós-Doutorado. , Università degli Studi di Perugia, UNIPG, Itália.

Formação complementar

2015 - 2015

Innovation & Entrepreneurship in Biotechnology. (Carga horária: 20h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2015 - 2015

Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 38h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2015 - 2015

I Curso em Genômica. (Carga horária: 40h). , Fundação de Estudos e Pesquisas Agrícolas e Florestais, FEPAF, Brasil.

2015 - 2015

How to perform and to apply ChIP in cytogenetics. (Carga horária: 3h). , 4ª Reunião Brasileira de Citogenética, RBC, Brasil.

2013 - 2013

Fundamentos de Biologia Sistêmica. (Carga horária: 6h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2013 - 2013

6.00.1x: Introduction to Computer Science (Online). , Massachusetts Institute of Technology, MIT, Estados Unidos.

2013 - 2013

Statistics: Making Sense of Data (Online). , University of Toronto, UTORONTO, Canadá.

2013 - 2013

7.00x: Introduction to Biology (Online). , Massachusetts Institute of Technology, MIT, Estados Unidos.

2009 - 2009

Curso de Odontologia. (Carga horária: 8h). , Associação Nacional de Clínicos Veterinários de Pequenos Animais - SC, ANCLIVEPA-SC, Brasil.

2008 - 2008

Curso Internacional de Cardiologia. (Carga horária: 16h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.

2007 - 2007

Rotulagem de Produtos de Origem Animal. (Carga horária: 8h). , Universidade do Estado de Santa Catarina, UDESC, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Italiano

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Participação em eventos

X-meeting eXperience 2020. 2020. (Congresso).

5º Workshop de Técnicas Experimentais do CEATOX. 2018. (Outra).

Frontiers in Molecular Oncology. 2018. (Congresso).

Second AACR International Conference - Translational Cancer Medicine: Cancer Discoveries for Clinical Application. 2018. (Congresso).

Plant and Animal Genome XXIV Conference. 2016. (Congresso).

XVI Workshop de Genética.Minicurso: Navegando no mar de dados genômicos: Naufrágio à vista?!. 2016. (Outra).

4ª Reunião Brasileira de Citogenética. 2015. (Congresso).

6º Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas - Genética. 2015. (Simpósio).

I Workshop Pró-Amazônia.Explorando DNAs Repetitivos com Base na Ferramenta RepeatExplorer. 2015. (Outra).

XV Workshop de Genética. 2015. (Outra).

5º Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas - Genética.Análise genômica em larga escala de elementos repetitivos com foco em cromossomos B do ciclídeo Atatotilapia latifasciata. 2014. (Simpósio).

I Simpósio Sul Brasileiro de Oncologia Clinica e Cirúrgica. 2013. (Simpósio).

XIII Workshop de Genética. 2013. (Oficina).

33º Congresso Brasileiro da ANCLIVEPA. 2012. (Congresso).

I Simpósio Sul Brasileiro de Dermatologia de Pequenos Animais. 2011. (Simpósio).

Palestra de Neurologia. 2008. (Outra).

Destaques do Curso de Medicina Veterinária. 2007. (Seminário).

XXVIII Congresso Brasileiro da ANCLIVEPA. 2007. (Congresso).

XIV Semana Acadêmica de Medicina Veterinária do Centro de Ciências Agroveterinárias da UDESC. 2006. (Seminário).

Ciclo de Debates da Associação Catarinense dos Estudantes de Medicina Veterinária. 2004. (Seminário).

XIII Semana Acadêmica de Medicina Veterinária e do Minicurso de Eqüino do Centro de Ciências Agroveterinárias da UDESC. 2004. (Seminário).

Dia de Divulgação da Pesquisa em Medicina Veterinária da UDESC. 2003. (Seminário).

Produções bibliográficas

WOLF, IVAN RODRIGO ; MARQUES, LUCAS FARINAZZO ; DE ALMEIDA, LAUANA FOGAÇA ; LÁZARI, LUCAS CARDOSO ; DE MORAES, LEONARDO NAZÁRIO ; CARDOSO, LUIZ HENRIQUE ; ALVES, CAMILA CRISTINA DE OLIVEIRA ; NAKAJIMA, RAFAEL TAKAHIRO ; SCHNEPPER, AMANDA PIVETA ; GOLIM, MARJORIE DE ASSIS ; CATALDI, THAIS REGIANI ; NIJLAND, JEROEN G. ; PINTO, CAMILA MOREIRA ; FIORETTO, MATHEUS NAIA ; ALMEIDA, RODRIGO OLIVEIRA ; DRIESSEN, ARNOLD J. M. ; SIM'ES, RAFAEL PLANA ; LABATE, MÔNICA VENEZIANO ; GROTTO, REJANE MARIA TOMMASINI ; COAN, R. L. B. ; et.al . Integrative Analysis of the Ethanol Tolerance of Saccharomyces cerevisiae. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 24, p. 5646, 2023.
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COAN, R. L. B. . Minicurso: Navegando no mar de dados genômicos: Naufrágio à vista?!. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).
COAN, R. L. B. . Explorando DNAs Repetitivos com Base na Ferramenta RepeatExplorer. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).
COAN, R. L. B. . Análise genômica em larga escala de elementos repetitivos com foco em cromossomos B do ciclídeo Atatotilapia latifasciata. 2014. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Projetos de pesquisa

2018 - Atual

Biologia de sistemas aplicada ao estudo da progressão do sarcoma de Ewing, Descrição: O Sarcoma de Ewing é um tumor de células redondas que acomete especialmente o tecido ósseo, com maior predisposição para o sexo masculino, entre os 10 aos 24 anos de idade. Sua iniciação está relacionada a translocação entre os cromossomos 11 e 22 e consequente formação de uma proteína fusionada, EWS-FLI1, que está presente em torno de 90% dos casos. A incidência de metástase ao diagnóstico é de 30%, sendo um dos fatores que resultam na baixa sobrevida dos pacientes. O sequenciamento de nova geração abriu novas possibilidades para o estudo da progressão do câncer e descoberta de seus mecanismos. Neste cenário, a biologia de sistemas auxilia na interpretação das interações que ocorrem entre as moléculas, dentro da célula cancerígena. Novas moléculas, como os RNAs longos não-codificantes (lncRNA), têm mostrado importância na iniciação, promoção e progressão do câncer, e são potenciais marcadores dos diferentes estágios da doença e em seu tratamento. Desta forma, este estudo visa entender as interações que ocorrem entre os lncRNAs e os diversos componentes celulares, a fim de identificar potenciais moléculas envolvidas na progressão do sarcoma de Ewing. Utilizaremos sequenciamento em larga escala de RNA (RNA-Seq) de tumores primários, em pacientes com e sem metástase, para identificar potenciais lncRNA envolvidos na cascata metastática. Com os achados, construiremos redes biológicas que demonstrem as interações entre RNA mensageiro (mRNA), proteínas e lncRNA. Através da análise topológica das redes biológicas, buscaremos compreender as interações que ocorrem neste modelo e elucidar processos regulatórios. O entendimento de tais processos abre caminho para outros achados, que visam melhorar a sobrevida dos pacientes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Luiz Buogo Coan - Coordenador / Ney Lemke - Integrante.
2014 - 2016

High scale genomic analysis of repetitive elements focusing on B chromosomes of Astatotilapia latifasciata cichlid, Descrição: B chromosomes (B) are supernumerary elements, non-homologous to the normal (A) set of chromosomes, found in many taxonomic groups. B chromosomes have been recognized as parasitic elements, but recent studies propose new models to their origin, evolution and function inside the cell. Bs heterochromatic constitution is caused by massive presence of repetitive elements. Previous genomic analysis and next generation sequencing were performed in Astatotilapia latifasciata cichlid and revealed high proportion of repetitive elements in their B chromosomes. Repetitive elements in next generation sequencing data can now be analyzed in a novel approach, without a reference genome, using a graph-base sequence clustering algorithm. Implementation of graph-base clustering and analysis of repetitive sequences is made through RepeatExplorer pipeline. Using a computer model, real time PCR (qPCR) and fluorescence in situ hybridization (FISH), this project focus in the identification and characterization of repetitive elements using A. latifasciata as a model, trying to explain the role of these repeats in the constitution and evolution of B chromosomes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rafael Luiz Buogo Coan - Integrante / Cesar Martins - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 4