Karla Lopes de Almeida

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Veiga de Almeida (2010). Atualmente é aluno de mestrado de Engenharia Biomédica da Universidade Federal do Rio de Janeiro. Tem experiência na área de Engenharia Biomédica, com ênfase em Bioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: modelagem estatística, análise de dados e análise multivariada, com experiência no programa estatístico R.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Mestrado em Engenharia Biomédica

2014 - 2017

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Análise e classificação da expressão gênica durante o Eritema Nodoso Hansênico através de dados de microarranjo,Ano de Obtenção: 2017
Flavio Fonseca Nobre.Coorientador: Euzenir Nunes Sarno. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Microarranjo; Expressão Gênica; Eritema Nodoso Hansênico; Hanseníase.Grande área: EngenhariasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica. Grande Área: Ciências da Saúde / Área: Medicina / Subárea: Clínica Médica / Especialidade: Doenças Infecciosas e Parasitárias.

Graduação em Ciências Biológicas

2007 - 2010

Universidade Veiga de Almeida
Título: Avaliação prévia da Agenda 21 nas escolas do município do Rio de Janeiro
Orientador: Cecília BUENO Moacyr de Lima e Silva

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Formação complementar

2014 - 2014

Avaliação de tecnologias em saúde no contexto de e. (Carga horária: 4h). , Sociedade Brasileira de Engenharia Biomédica, SBEB, Brasil.

2009 - 2009

Genetica mol. e a conservacao de mamiferos marinho. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2007 - 2007

Atualizacao Ambiental. (Carga horária: 50h). , Cruz Vermelha Brasileira, CVB, Brasil.

2007 - 2007

Atualizacao em temas Biomedicos. (Carga horária: 8h). , Conselho Regional de Biologia, CRBIO, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Francês

Compreende RazoavelmenteLê Razoavelmente.

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Áreas de atuação

    Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Bioinformática.

    Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Genética Humana e Médica.

    Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Análise de Dados.

    Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Análise Multivariada.

    Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

    Grande área: Engenharias / Área: Engenharia Biomédica / Subárea: Biologia Molecular.

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Organização de eventos

ALMEIDA, K. L. . Concurso de Bio Fotografia. 2008. (Concurso).

ALMEIDA, K. L. . VI Forum de Biologia da UVA. 2008. (Outro).

ALMEIDA, K. L. . I Fórum de Zoologia da UVA. 2008. (Outro).

ALMEIDA, K. L. . I Exposição de Trabalhos Científicos da UVA. 2008. (Exposição).

ALMEIDA, K. L. ; Souza, D. R. ; Bandeira, R. R. C. ; SILVA, Maria Alice Mariano da ; Wrencher, F. A. . I Fórum de Botânica da UVA. 2008. (Outro).

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Participação em eventos

Congresso Brasileiro de Engenharia Biomédica. 2014. (Congresso).

Workshop de Biologia Computacional. 2014. (Oficina).

Feira FAPERJ.FAPERJ 30 ANOS. 2010. (Encontro).

55° Congresso de Genética. MiR319 é diferencialmente expresso em cana-de-açúcar sob estresse por baixa temperatura. 2009. (Congresso).

55º Congresso Brasileiro de Genetica. 2009. (Congresso).

Curso de genética de animais marinhos brasileiros. 2009. (Oficina).

II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas.Biologia de pequenos RNAs. 2009. (Seminário).

II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas.Analysis of the differential expression of miRNAs in response to abiotic stress in sugarcane. 2009. (Simpósio).

Curso de Ecologia de Campo.Ecologia de Mamíferos. 2008. (Oficina).

Curso de miRNA.Apresentação Prática. 2008. (Seminário).

Atualização Ambiental ( Educação e Saúde Ambiental). 2007. (Oficina).

Atualização de Temas Biomédicos (Células Tronco e Transgênicos animal e vegetal). 2007. (Seminário).

Congresso de Ecologia. 2007. (Congresso).

Curso de Biologia Marinha. 2007. (Oficina).

I Encontro Científico do Instituto de Bioquímica Médica UFRJ.Regulação da Expressão Gênica por microRNAs em cana-de-açúcar. 2007. (Encontro).

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Comissão julgadora das bancas

Vera Lúcia Vaz Agarez

BUENO, Cecília;AGAREZ, V. L. V.; Mariano da Sil va, Maria Alice. Avaliação prévia da Agenda 21 nas Escolas do Município do RJ. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciëncias Biologicas) - Universidade Veiga de Almeida.

Rosimary Terezinha de Almeida

NOBRE, Flavio Fonseca; SARNO, E. N.;Almeida, RT; MORAES, M. O.. ANÁLISE E CLASSIFICAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA DURANTE O ERITEMA NODOSO HANSÉNICO ATRAVÉS DE DADOS DE MICROARRANJO. 2017. Dissertação (Mestrado em Engenharia Biomédica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Rosimary Terezinha de Almeida

NOBRE, Flavio FonsecaALMEIDA, R. T.. Discriminação de formas clínicas da hanseníase usando expressão gênica de dados de microarranjos.. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia Biomédica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

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Foi orientado por

Paulo Cavalcanti Gomes Ferreira

Regulação epigenética de estresse hídrico em cana-de-açúcar; 2010; Iniciação Científica - Universidade Veiga de Almeida, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Paulo Cavalcanti Gomes Ferreira;

Cecília Bueno Moacyr de Lima e Silva

Avaliação prévia da Agenda 21 nas escolas do município do Rio de Janeiro; 2010; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Veiga de Almeida; Orientador: Cecília BUENO Moacyr de Lima e Silva;

Euzenir Nunes Sarno

Análise e classificação da expressão gênica durante o eritema nodoso hansênico através de dados de microarranjo; 2017; Dissertação (Mestrado em Engenharia Biomédica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Euzenir Nunes Sarno;

Flavio Fonseca Nobre

Análise e Classificação da Expressão Gênica Durante o Eritema Nodoso Hansênico Através de Dados de Microarranjo; 2017; Dissertação (Mestrado em Engenharia Biomédica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Flavio Fonseca Nobre;

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Produções bibliográficas

  • THIEBAUT, FLÁVIA ; ROJAS, CRISTIAN A. ; ALMEIDA, KARLA L. ; GRATIVOL, CLÍCIA ; DOMICIANO, GISELLI C. ; LAMB, CAREN REGINA C. ; DE ALMEIDA ENGLER, JANICE ; HEMERLY, ADRIANA S. ; FERREIRA, PAULO C. G. . Regulation of miR319 during cold stress in sugarcane. Plant, Cell and Environment (Print) , v. 35, p. 502-512, 2012.

  • Rojas CA, ; Thiebaut, F. ; ALMEIDA, K. L. ; Chabregas, S ; Guimaraes, A ; Vicentini, R ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . miRNA Regulation During Biotic And Abiotic Stress In Sugarcane. In: Plant & Animal Genome XVIII, 2010, San Diego. Plant & Animal Genome XVIII, 2010.

  • Rojas CA, ; ALMEIDA, K. L. ; TORRES, S. ; LANFRANCO, P. M. ; LIMA, M. F. ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . Epigenetic regulation of endophytic diazotrophic bacteria interaction with maize. In: 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010, Búzios. 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010.

  • Thiebaut, F. ; Rojas CA, ; ALMEIDA, K. L. ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . Regulação do miR319 em diferentes genótipos de cana-de-açúcar submetidos ao frio. In: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

  • Rojas CA, ; ALMEIDA, K. L. ; TORRES, S. ; Thiebaut, F. ; LANFRANCO, P. M. ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . Estudo da regulação de microRNAs em cana-de- açúcar em resposta a bactérias patogênicas. In: 56º Congresso Brasileiro de Genética, 2010, Guarujá. 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2010.

  • Thiebaut, F. ; Rojas CA, ; ALMEIDA, K. L. ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . MiR319 é diferencialmente expresso em cana-de-açúcar sob estresse por baixa temperatura. In: 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2009, Águas de Lindóia. 55º Congresso Brasileiro de Genética, 2009.

  • Thiebaut, F. ; Rojas CA, ; ALMEIDA, K. L. ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . Analysis of the differential expression of miRNAs in response to abiotic stress in sugarcane. In: II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2009, Búzios. II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2009.

  • Rojas CA, ; ALMEIDA, K. L. ; Thiebaut, F. ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . Sugarcane MicroRNAs Regulated in Plant-Pathogen Interaction. In: II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2009, Búzios. II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas, 2009.

  • Rojas CA, ; ALMEIDA, K. L. ; HERMELY, A. S. ; FERREIRA, P. C. G. . Regulação da Expressão Gênica por microRNAs em cana-de-açúcar. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

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Outras produções

Souza, D. R. ; ALMEIDA, K. L. ; Bandeira, R. R. C. ; VENTURA, L. C. S. ; Neves, D. A. A. . Reação em Cadeia. 2008. Vídeo.

ALMEIDA, K. L. . Evolução. 2007. Fotografia.

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Projetos de pesquisa

  • 2014 - Atual

    Análise Computacional de dados genômicos relativos à hanseníase., Descrição: Através de dados de microarranjo, podem ser utilizadas técnicas computacionais para a interpretação e estudo da expressão gênica das diversas formas clínicas da hanseníase. As análises englobam desde uma análise descritiva às análises estatísticas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Karla Lopes de Almeida - Integrante / Flávio Fonseca Nobre - Coordenador / Euzenir Nunes Sarno - Integrante / Rosimary Terezinha de Almeida - Integrante.

  • 2008 - 2011

    Regulação por microRNAs de estresses bióticos em cana de açúcar, Descrição: Trabalhos recentes mostraram que os miRNAs têm um papel importante na resposta das plantas a estresses abióticos Alguns microRNAs são diferencialmente expressos em stresses oxidativos, regulam a resposta das plantas na ausência de fósforo e enxofre no solo, são regulados por estresse salino, resposta ao frio e estresse hídrico. Mais importante ainda, quando os alvos dos microRNAs foram modificados para se tornarem resistentes a degradação, resultaram em plantas resistentes aos estresses correspondentes. E mais importantes ainda, porque a inibição de alvos específicos por microRNAs produz muito menos efeitos pleiotrópicos do que em trabalhos onde foi feita a superxpressão apenas. Por esta razão, a identificação nesta proposta de alvos regulados por microRNA em plantas de cana-de-açúcar submetidas a estresse hídrico permitirá a geração de plantas transgênicas com grande potencial de resistência a seca. O objetivo principal deste projeto é entender qual o papel dos processos epigenéticos, em particular dos microRNAs, nos controles transcricionais e pós-transcricionais de genes de cana de açúcar em resposta ao estresse hídrico.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Karla Lopes de Almeida - Integrante / Cristian Antonio Rojas - Integrante / Paulo Cavalcante G Ferreira - Coordenador / Flávia Thiebaut - Integrante.

  • 2008 - 2011

    microRNAs de cana-de-açúcar diferencialmente expressos em presença de bactérias endofíticas fixadoras de nitrogênio e bactérias patogênicas, Descrição: Recentemente, foi mostrado que microRNAs estão envolvidos na sinalização das interações planta-bactéria. Em Arabidopsis, a resistência a P. syringae depende da expressão do microRNA 393a, que é induzido por um peptídeo derivado do flagelo da bactéria. A expressão do microRNA 393a regula negativamente a expressão de genes envolvidos na síntese de auxina e contribui para a resistência a doença. Por outro lado também foi mostrado que para a infecção com Agrobacterium ocorra eficientemente, é necessário que as vias de síntese de microRNAs estejam intactas, uma vez que em diversos mutantes envolvidos na síntese de microRNAs a infecção com Agrobacterium é inibida. Existem também evidências de que em interações benéficas, como a simbiose em leguminosas, microRNAs contribuem para o sucesso da interação. Além disto, foi demonstrado que em alfafa o microRNA 169 regula a expressão do fator de transcrição do tipo HAP2-1, restringindo sua expressão à zona meristemática e em nódulos onde este microRNA tem a expressão inibida, não há diferenciação. As respostas a estresse bióticos dependem de uma cadeia complexa de regulação da expressão gênica. O objetivo principal deste projeto é entender qual o papel dos processos epigenéticos, em particular dos microRNAs, nos controles transcricionais e pós-transcricionais de genes de cana-de-açúcar em resposta ao estresse biótico, principalmente a bactérias patogênicas como Xanthomonas albilineans, Acidovorax avenae e Leifsonia xyli.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Karla Lopes de Almeida - Integrante / Cristian Antonio Rojas - Integrante / Paulo Cavalcante G Ferreira - Coordenador / Flávia Thiebaut - Integrante.

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Prêmios

2009

Prêmio Painel Pós-Graduação de melhor trabalho na área de GENÉTICA, EVOLUÇÃO E MELHORAMENTO DE PLANTAS, Sociedade Brasileira de Genética..

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Federal do Rio de Janeiro, Programa de Engenharia Biomédica - COPPE. , Avenida Horácio Macedo, 2030, Centro de Tecnologia, COPPE/UFRJ, Bloco H, Sala 329, Cidade Universitária, 21941598 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil, Telefone: (21) 25628600, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2014 - Atual

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Aluno de mestrado em Engenharia Biomédica - PEB/COPPE/UFRJ

  • 2008 - 2011

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 32, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 03/2014

      Pesquisa e desenvolvimento , Programa de Engenharia Biomédica - COPPE, .,Linhas de pesquisa

  • 2007 - 2007

    Museu Nacional do Rio de Janeiro

    Vínculo: Estagiária, Enquadramento Funcional: Estagiária, Carga horária: 12

    Atividades

    • 03/2007 - 09/2007

      Estágios , Instituto de Botânica, Herbário.,Estágio realizado, Limpeza, Catalogação e Organização das coleções botânicas.