Matheus Carvalho Bürger

Possui complementação técnica em informática pela UNICAMP e graduação em Informática Biomédica pela USP. Em 2009 iniciou seus estudos em bioinfomática no Laboratório de Genética Molecular e Bioinformática (Departamento de Genética - FMRP), adquirindo experiência em análise de expressão gênica e de microRNAs através de microarranjos. Atualmente realiza o mestrado no Programa de Pós-Graduação em Bioinformática sob a orientação do Prof. Dr. Helder Nakaya.

Informações coletadas do Lattes em 28/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Mestrado em Bioinformática

2014 - 2017

Universidade de São Paulo
Título: Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue: Insights Sobre Mecanismos de Regulação Gênica,Ano de Obtenção: 2017
Helder Takashi Imoto Nakaya.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: RNAs não codificares longos; Transcriptômica; Bioinformática.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Informática Biomédica

2009 - 2013

Universidade de São Paulo
Título: Uma Abordagem Computacional para Identificação de Vias Gênicas Reguladas por microRNAs
Orientador: Wilson Araújo Da Silva Junior

Curso técnico/profissionalizante

2007 - 2008

Universidade Estadual de Campinas

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Formação complementar

2010 - 2010

VI Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 70h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Lê Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Lê Razoavelmente.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Software Básico.

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Organização de eventos

AMGARTEN, DEYVID ; BÜRGER, M. C. ; CICONELLE, A. C. M. ; DURHAM, A. M. ; Gianluca Major M. S. ; LIMA, F. P. ; MOURA, L. M. S ; REGO, F. O. R. ; RUSSO, P. S. T. ; SETUBAL, J. C ; VILLAR, C. M. . Curso de Verão em Bioinformática. 2016. (Outro).

BÜRGER, M. C. ; ANTONIO, D. S. M. ; PAULA, M. G. ; PINHEIRO, D. G. ; TARLA, M. V. C. ; COETZEE, S. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; NOUSHMEHR, H. . IX Curso de Verão em Bioinformática. 2013. (Outro).

BÜRGER, M. C. ; SOUZA, J. E. S. ; NOUSHMEHR, H. ; PINHEIRO, D. G. ; PAULA, M. G. ; COETZEE, S. ; Silva Jr, WA ; SALGADO, L. R. . Escola de estudos avançados em Genômica - "Decodificando o DNA não-codificador". 2013. (Outro).

BÜRGER, M. C. ; PINHEIRO, D. G. ; de Sousa, R. G. M. A. ; PAULA, M. G. ; SALGADO, L. R. ; Silva Jr, WA . VIII Curso de Verão em Bioinformática. 2012. (Outro).

BÜRGER, M. C. ; PINHEIRO, D. G. ; Tojal, I. ; PAULA, M. G. ; de Sousa, R. G. M. A. ; CARDENAS, R.G.C.C.L. ; Silva Jr, WA . VII Curso de Verão em Bioinformática. 2011. (Outro).

BÜRGER, M. C. ; ANTONIO, D. S. M. ; PAULA, M. G. ; PINHEIRO, D. G. ; TARLA, M. V. C. ; COETZEE, S. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; NOUSHMEHR, H. . IX Curso de Verão em Bioinformática. 2013. (Outro).

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Participação em eventos

Curso de Verão em Bioinformática.Curso Prático de Introdução ao UNIX Shell. 2016. (Oficina).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C). Long Noncoding RNAs in Patients with Dengue: Insights into Gene Regulation. 2016. (Congresso).

I International Stymposium on Pathophysiology and Toxicology. 2015. (Congresso).

VI Simpósio de Pós-graduação em Análises Clínicas - SIMPAC. 2015. (Simpósio).

X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. 2015. (Congresso).

IV Workshop do Programa de Pós-Graduação em Genética da FMRP-USP. 2013. (Outra).

A Bioinformática no Século 21. 2012. (Outra).

Cancer Genome Workshop. 2012. (Oficina).

Workshop de Informatica Biomédica.Análise da Expressão Gênica e de MicroRNAs em Larga Escala do Carcinoma Espinocelular de Laringe. 2012. (Outra).

Ferramentas de Bioinformática Aplicadas à Análise de Sequências Genômicas, Metagenômicas e Transcriptomicas - CBAB.Alinhamento de Seqüências de cDNA em Genoma Referência (Monitor). 2011. (Outra).

Ferramentas de Bioinformática Aplicadas à Análise de Sequências Genômicas, Metagenômicas e Transcriptomicas - CBAB.Montagem de Transcriptomas (Monitoria). 2011. (Outra).

Workshop de Informatica Biomédica (WIBm-11).Análise Computacional de Microarranjos no Estudo da Diferenciação de Células Tronco Mesenquimais em Pacientes com Osteogênese Imperfeita. 2011. (Outra).

VI Curso de Verão em Bioinformática. 2010. (Outra).

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Comissão julgadora das bancas

Andre Fujita

FUJITA, A.. Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue: Insights Sobre Mecanismos de Regulação Gênica. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Helder Takashi Imoto Nakaya

NAKAYA, H. I.; HASHIMOTO, R. F.; SILVEIRA, E. L. V.. Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue. 2017. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Eduardo Lani Volpe da Silveira

NAKAYA, H. I.;SILVEIRA, EDUARDO L.V.; Hashimoto, R. F.. Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue. 2017. Dissertação (Mestrado em PROGRAMA INTERUNIDADES DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA) - Universidade de São Paulo.

Eduardo Lani Volpe da Silveira

SILVEIRA, EDUARDO L.V.; REIS, E.; FUJITA, A.. Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue: Insights Sobre Mecanismos de Regulação Gênica. 2016 - Faculdade de Ciências Farmacêuticas (Universidade de São Paulo).

Jorge Estefano Santana de Souza

SILVA JUNIOR, W. A.;DE SOUZA, JORGE E. S.; RUIZ, E. E. S.. Uma abordagem computacional para a identificação de vias gênicas reguladas por micro RNAs. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Informática Biomédica) - Universidade de São Paulo.

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Foi orientado por

Helder Takashi Imoto Nakaya

Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya;

Daniel Guariz Pinheiro

Estudo crítico dos métodos de análise de expressão gênica em larga escala; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Informática Biomédica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (USP), Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Daniel Guariz Pinheiro;

Jorge Estefano Santana de Souza

Analises de expressão gênica diferencial em osteogenese imperfeita; ; 2012; Orientação de outra natureza - Universidade de São Paulo; Orientador: Jorge Estefano Santana de Souza;

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Produções bibliográficas

  • REESE, TIFFANY A. ; BI, KEVIN ; KAMBAL, AMAL ; FILALI-MOUHIM, ALI ; BEURA, LALIT K. ; BÜRGER, MATHEUS C. ; PULENDRAN, BALI ; SEKALY, RAFICK-PIERRE ; JAMESON, STEPHEN C. ; MASOPUST, DAVID ; HAINING, W. NICHOLAS ; VIRGIN, HERBERT W. . Sequential Infection with Common Pathogens Promotes Human-like Immune Gene Expression and Altered Vaccine Response. Cell Host & Microbe , v. 20, p. 1, 2016.

  • SILVA, CLÁUDIA REGINA SANTOS ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; SILVA, WILSON ARAUJO ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, M. C. ; Goloni-Bertollo, Eny Maria ; PAVARINO, E.C. . Differential Expression of Inflammation-Related Genes in Children with Down Syndrome. Mediators of Inflammation , v. 2016, p. 1-8, 2016.

  • IM, SE JIN ; HASHIMOTO, MASAO ; GERNER, MICHAEL Y. ; LEE, JUNGHWA ; KISSICK, HAYDN T. ; BURGER, MATHEUS C. ; SHAN, QIANG ; HALE, J. SCOTT ; LEE, JUDONG ; NASTI, TAHSEEN H. ; SHARPE, ARLENE H. ; FREEMAN, GORDON J. ; GERMAIN, RONALD N. ; NAKAYA, HELDER I. ; XUE, HAI-HUI ; AHMED, RAFI . Defining CD8+ T cells that provide the proliferative burst after PD-1 therapy. Nature , v. 537, p. 417-421, 2016.

  • KASTURI, SUDHIR PAI ; KOZLOWSKI, PAMELA A. ; NAKAYA, HELDER I ; BURGER, MATHEUS C. ; RUSSO, PEDRO ; PHAM, MATHEW ; KOVALENKOV, YEVGENIY ; SILVEIRA, EDUARDO L. V. ; HAVENAR-DAUGHTON, COLIN ; BURTON, SAMANTHA L. ; KILGORE, KATIE M. ; JOHNSON, MATHEW J. ; NABI, RAFIQ ; LEGERE, TRACI ; SHER, ZARPHEEN JINNAH ; CHEN, XUEMIN ; AMARA, RAMA R. ; HUNTER, ERIC ; BOSINGER, STEVEN E. ; SPEARMAN, PAUL ; CROTTY, SHANE ; VILLINGER, FRANCOIS ; DERDEYN, CYNTHIA A. ; WRAMMERT, JENS ; PULENDRAN, BALI . Adjuvanting an SIV vaccine with TLR ligands encapsulated in nanoparticles induces persistent antibody responses and enhanced protection in TRIM5α restrictive macaques. Journal of Virology (Print) , v. 1, p. JVI.01844-16-1, 2016.

  • ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; BISELLI-PÉRICO, JOICE MATOS ; DE SOUZA, JORGE ESTEFANO SANTANA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; SILVA JÚNIOR, WILSON ARAÚJO ; GOLONI-BERTOLLO, ENY MARIA ; PAVARINO, ÉRIKA CRISTINA . Altered Expression of Immune-Related Genes in Children with Down Syndrome. Plos One , v. 9, p. e107218, 2014.

  • ALVES, CLEIDSON PÁDUA ; FONSECA, ALINE SIMONETI ; MUYS, BRUNA RODRIGUES ; DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; BÜRGER, MATHEUS CARVALHO ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; VALENTE, VALERIA ; ZAGO, MARCO ANTONIO ; SILVA, WILSON ARAÚJO . The lincRNA Hotair is required for epithelial-to-mesenchymal transition and stemness maintenance of cancer cells lines. Stem Cells (Dayton, Ohio) , v. n/a, p. n/a-n/a, 2013.

  • ZAMPIERI, BRUNA LANCIA ; BISELLI-PERICO, J.M. ; BÜRGER, M. C. ; SOUZA, J.E.S. ; SILVA JUNIOR, W.A. ; FERREIRA, E.N. ; CARRARO, D.M. ; GOLONI-BERTOLLO, E.M. ; PAVARINO, E.C. . Analysis of microRNA and gene expression profile in Down syndrome children.. In: XLIII Congreso Argentino de Genética,, 2014, San Carlos de Bariloche. BAG. Journal of basic and applied genetics, 2014.

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  • TORRES, H. A. M. ; BÜRGER, M. C. ; ANTONIO, D. S. M. ; COETZEE, S. ; URUSHIBATA, E. T. ; SABEDOT, T. S. ; SOUZA, J. E. S. ; PINHEIRO, D. G. ; DELFINI, M. G. ; MIORANZA, A. ; PAULA, M. G. ; Silva Jr, WA ; NOUSHMEHR, H. . Biomics+: A bioconductor package for integrating plublicly available genomic data sets. In: 59º Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindóia. Resumos do 59o Congresso Brasileiro de Genética, 2013. p. 41-41.

  • BISELLI, J. M. ; ZAMPIERI, B. L. ; SILVA, C. R. S ; BÜRGER, M. C. ; SOUZA, J. E. S. ; Silva Jr, WA ; FERREIRA, E. N. ; CARRARO, D. M. ; GOLONI-BERTOLLO, E. M. ; PAVARINO, E. C. . Padrão de expressão de microRNAs em células sanguíneas de crianças com síndrome de Down. In: XV Congresso Latinoamericano de Genética, 2012, Rosario - Argentina. Journal of Basic and Applied Genetics.. Argentina: Argentina: Sociedad Argentina de genética, 2012. v. XXII. p. 148-149.

  • BÜRGER, M. C. ; PINHEIRO, D. G. ; DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; ARAUJO, A. G. ; FIGUEIREDO, D. L. A. ; MAMEDE, R. C. M. ; Silva Jr, WA . Análise da Expressão Gênica e de MicroRNAs em Larga Escala do Carcinoma Espinocelular de Laringe. In: X Semana da Informática Biomédica, 2012, Ribeirão Preto. II Workshop de Informática Biomédica, 2012. v. 2. p. 95-98.

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  • BÜRGER, M. C. ; PINHEIRO, D. G. ; KANETO, C. M. ; SILVA JUNIOR, W. A. . Análise Computacional de Microarranjos no Estudo da Diferenciação de Células Tronco Mesenquimais em Pacientes com Osteogênese Imperfeita.. In: I Workshop de Informatica Biomédica, 2011, Ribeirao Preto. Anais do Workshop de Informática Biomédica, 2011. v. 1.

  • Passos, F. M. ; RUSSO, P. S. T. ; BÜRGER, M. C. ; HIRATA, T. D. C. ; NAKAYA, HELDER I. . Using Systems Biology to understand Immunosenescence. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • RUSSO, P. S. T. ; Ferreira, G. R. ; Medina, C. A. P. ; BÜRGER, M. C. ; Cardozo, Lucas ; Fonseca, L. S. ; HIRATA, T. D. C. ; Hermosilla, G. S. ; Coutinho, V. M. ; NAKAYA, HELDER I. . CEMiTool: Co-expression Modules Identification Tool. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • BÜRGER, M. C. ; Cardozo, Lucas ; HIRATA, T. D. C. ; NAKAYA, HELDER I. . Long Noncoding RNAs in Patients with Dengue: Insights into Gene Regulation. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • BÜRGER, M. C. ; PINHEIRO, D. G. ; KANETO, C. M. ; Silva Jr, WA . Análise Computacional de Microarranjos no Estudo da Diferenciação de Células Tronco Mesenquimais em Pacientes com Osteogênese Imperfeita. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).