Joseane Biso de Carvalho

Graduada em Agronomia pela Universidade Estadual de Maringá (2003) e em Tecnologia em Análise e Desenvolvimento de Sistemas pela UNESA (2018). Mestre em Agronomia, pela Universidade Estadual de Maringá (2006) e doutorado em Fitotecnia-Fitopatologia pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2009). Atuou na área de bioinformática, com análises de variantes genéticas a partir de dados de sequenciamento de exoma, análises de transcriptoma, pequenos RNAs e lncRNAs no Laboratório de Bioinformática do Laboratório Nacional de Computação Científica-LNCC. Experiência nas áreas de Microbiologia (diagnóstico molecular), Biologia Molecular e Ciência de dados. Atualmente atua como pesquisadora na Neoprospecta Microbiome Technologies na área de Food Safety.

Informações coletadas do Lattes em 23/06/2020

Acadêmico

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Formação acadêmica

Doutorado em Fitotecnia

2006 - 2009

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Desenvolvimento e validação de qPCR para detecção de pectobactérias e Ralstonia solanacearum em tubérculos de batata
Valmir Duarte. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências AgráriasGrande Área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Fitossanidade / Especialidade: Fitopatologia. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos. Setores de atividade: Agricultura, Pecuária e Serviços Relacionados Com Essas Atividades.

Mestrado em Agronomia

2004 - 2006

Universidade Estadual de Maringá
Título: Potencial fungitóxico de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii à Colletotrichum sp., e proteção pós-colheita de frutos de pimentão,Ano de Obtenção: 2006
Orientador: Kátia Regina de Freitas Schwan-Estrada
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: controle alternativo de doenças; extrato bruto aquoso e óleos essencias de plantas; compostos fungitóxicos; Indução de Resistência; Pós-colheita.Grande área: Ciências AgráriasGrande Área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia. Grande Área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Fitossanidade / Especialidade: Fisiologia do parasitismo. Setores de atividade: Produção Vegetal.

Graduação em Análise e Desenvolvimento de Sistemas

2015 - 2018

Universidade Estácio de Sá

Graduação em Agronomia

1998 - 2003

Universidade Estadual de Maringá

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Pós-doutorado

2015 - 2017

Pós-Doutorado. , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

2011 - 2014

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia Vegetal.

2010 - 2011

Pós-Doutorado. , VITATEC Consultoria e Desenvolvimento em Biotecnologia, VITATEC, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Formação complementar

2017 - 2017

Análise de Dados. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2017 - 2017

Gerência de Grande Volume de Dados. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Métodos de Análise Filogenética e Filogenômica. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Análise de transcritomas e microRNAs. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Instalação e Treinamento - Sequenciador MiSeq da Illumina. (Carga horária: 28h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

Simpósio de Bioinformática. (Carga horária: 28h). , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

2011 - 2011

Identificação e controle de Fitoplasmas. (Carga horária: 5h). , Sociedade Brasileira de Fitopatologia, SBF, Brasil.

2010 - 2010

Bioinformática UNITIG2010. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

2009 - 2009

Diagnose e terapia em Fitopatógenos. , Sociedade Brasileira de Fitopatologia, SBF, Brasil.

2003 - 2003

Inglês. (Carga horária: 360h). , Classy Language School, CLS, Brasil.

1999 - 1999

Análise Morfológica Para Farmacognosia. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Maringá, UEM, Brasil.

1999 - 1999

Cromatografia Líquida de Alta Eficiência. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Maringá, UEM, Brasil.

1998 - 1998

Coco Anão Uma Alternativa Para Pequena Propriedade. (Carga horária: 16h). , Universidade Estadual de Maringá, UEM, Brasil.

1996 - 1997

Informática. (Carga horária: 180h). , Centro de Desenvolvimento à Informática, CDI, Brasil.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Idiomas

Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Lê Razoavelmente.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Botânica / Subárea: Fisiologia Vegetal.

    Grande área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Fitossanidade/Especialidade: Fitopatologia.

    Grande área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Fitossanidade/Especialidade: Microbiologia Agrícola.

    Grande área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Fitossanidade/Especialidade: Defesa Fitossanitária.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Organização de eventos

CARVALHO, J. B. . I Congresso Sul Brasileiro de Plantas Medicinais. 1999. (Congresso).

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Participação em eventos

IV Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 2013. (Simpósio).

63 Congresso Nacional de Botânica. Mecanismo antioxidante em resposta ao excesso de ferro em arroz sob condições de manejo de irrigação com intermitência. 2012. (Congresso).

44° Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Detecção e identificação de Dickeya spp. por PCR quantitativo seguido por análise da curva de dissociação de alta resolução. 2011. (Congresso).

UNITIG 2010 - Novas tecnologias em análise e sequenciamento de ácidos nucléicos. 2010. (Encontro).

II Bioanalysis Conference MN in Brazil. 2009. (Seminário).

II Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 2009. (Simpósio).

Primeira Reunião Geral do Centro Colaborador em Defesa Agropecuária para a Biossegurança de Eucalipto GM.Análises moleculares: detecção de plantas transgênicas (folhas)/ Desenvolvimento de kits de PCR quantitativa (qPCR). 2009. (Outra).

XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Desenvolvimento e validação de QPCR para detecção de infecções latentes de Pectobacterium e Dickeya spp. em tubérculos-semente de batata. 2009. (Congresso).

XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia. 2009. (Congresso).

XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Padronização do método FTA (Whatman) para detecção molecular de Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis. 2007. (Congresso).

XXXIX Congresso Brasileiro de Fitopatologia. Proteção pós-colheita de frutos de pimentão contra Colletotrichum sp. utilizando extratos de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii. 2006. (Congresso).

II Congresso Brasileiro de Plantas Oleaginosas, Óleos, Gorduras e Biodiesel. Avaliação de genótipos de girassol em Maringá, estado do Paraná.. 2005. (Congresso).

XI Encontro Anual de Iniciação Científica.Efeito da Adubação no rendimento e nos teores de nutrientes, proteína e triptofano nos grãos de feijão Pérola.. 2002. (Encontro).

I Congresso Sul brasieliro de plantas medicinais. Contribuição de um herbário contendo informações agronômicas, na produção de Plantas Medicinais. 1999. (Congresso).

XVII Ciclo de Debates Agronômicos. 1998. (Outra).

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Participação em bancas

CARVALHO, JOSEANE B. Comissão Julgadora da Sessão Biologia Vegetal 2 - SIC2013 - XXV Salão de Iniciação Científica da UFRGS. 2013. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

CARVALHO, J. B.. Comissão Julgadora da Sessão Fitossanidade 2 - SIC2012 - XXIV Salão de Iniciação Científica da UFRGS. 2012. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Comissão julgadora das bancas

Maria Eugênia da Silva Cruz

SCHWANESTRADA, Kátia Regina FreitasCRUZ, M. E. S.BONALDO, Solange MariaSTANGARLIN, José Renato. Potencial fungitóxico de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii a Colletotrichum sp. e proteção pós-colheita de frutos de pimentão.. 2006. Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá.

Norimar DAvila Denardin

DUARTE, Valmir; Oliveira, A.R.M.; Gravina, M. de;DENARDIN, N.D.. Desenvolvimento e validação de qPCR para detecção de pectobactérias (Dickeya e Pectobacterium spp.) e Ralstonia solanacearum em tubérculos de batata.. 2009. Tese (Doutorado em Fitotecnia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

ANDRÉIA MARA ROTTA DE OLIVEIRA

OLIVEIRA, Andréia Mara Rotta; DENARDIN, N.;MORAES, Marcelo Gravina de. Desenvovlimento e validação de qPCR para detecção de Pectobactérias(Dickeya e Pextobacterium spp.) e Ralstonia solanacearum em tubérculos de batata. 2009. Tese (Doutorado em Fitotecnia - Área de Concentração Fitopatologia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

ANDRÉIA MARA ROTTA DE OLIVEIRA

OLIVEIRA, Andréia Mara Rotta; Del Ponte; MARTINELI, J. A.. Caracterização e expressão de genes de patogenicidade e virulência em Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis associada à canela-preta da batata. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Fitotecnia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Valmir Duarte

DENARDIN, Norimar Dávila;MORAES, Marcelo Gravina de; OLIVEIRA, Andreia Mara Rotta de;DUARTE, V.. Desenvolvimento e validação de qPCR para detecção de pectobactérias (Dickeya e Pectobacterium spp.) e Ralstonia solanacearum em tubérculos de batata. 2009. Tese (Doutorado em Fitotecnia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Rubem Silvério de Oliveira JúnioR

FREITAS, P. S. L.;OLIVEIRA JR, R.S.. Estágio (trabalho de conclusãop de curso) - Levantamento, Diagnóstico e Planejamento do Sítio Santo Antonio (20/03/2003). 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá.

Emerson Medeiros del Ponte

DEL PONTE, Emerson Medeiros; MARTINELLI, J. A.; DUARTE, Valmir; OLIVEIRA, A. M. R.. Estratégias de detecção de espécies de Dickeya e Pectobacterium em batata-semente. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Fitotecnia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Solange Maria Bonaldo

SCHWAN-ESTRADA, K.R.FBONALDO, S. M.CRUZ, M.E.S.STANGARLIN, J.R. Potencial fungitóxico de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii a Colletotrichum sp. e proteção pós-colheita de frutos de pimentão.. 2006. Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá.

Kátia Regina Freitas SchwanEstrada

SCHWANESTRADA, K. R. F.STANGARLIN, José RenatoCRUZ, Maria Eugênia da SilvaBONALDO, Solange Maria. Potencial fungitóxico de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii a Colletotrichum sp e proteção pós-colheita de frutos de pimentão. 2006. Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá.

Jose Antonio Martinelli

DUARTE, Valmir;MARTINELLI, J. A.; OLIVEIRA, A. M. R.; PONTE, E. M.. Caracterização e expressão de genes de patogenicidade e virulência em Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis associada à canela-preta em batata. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Fitotecnia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Orientou

Ronaldo da Silva Francisco Junior

Diagnóstico genômico de agamaglobulinemia a partir de dados de sequenciamento de exoma utilizando ferramentas de Biologia Computacional; 2019; Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Laboratório Nacional de Computação Científica,; Coorientador: Joseane Biso de Carvalho;

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Foi orientado por

Valmir Duarte

Desenvolvimento e validação de qPQR para detecção de pectobactérias e Ralstonia solanacearum em tubérculos de batata; 2010; Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Fitotecnia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Valmir Duarte;

Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos

2019; Laboratório Nacional de Computação Científica, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos;

Kátia Regina Freitas SchwanEstrada

Potencial fungitóxico de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii a Colletotrichum sp e proteção pós-colheita de frutos de pimentão; 2006; 60 f; Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Kátia Regina Freitas Schwan-Estrada;

Paulo Sérgio Lourenço de Freitas

Levantamento, diagnóstico e Planejamento de uma propriedade agropecuária; 2003; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá; Orientador: Paulo Sérgio Lourenço de Freitas;

José Renato Stangarlin

Potencial fungitóxico de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii a Colletotrichum sp; e proteção pós-colheita de frutos de pimentão; 2006; 60 f; Dissertação (Mestrado em Agronomia) - Universidade Estadual de Maringá,; Coorientador: José Renato Stangarlin;

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Produções bibliográficas

  • MESSIAS, CAROLINA V. ; LOSS-MORAIS, GUILHERME ; CARVALHO, JOSEANE BISO DE ; GONZÁLEZ, MARIELA N. ; CUNHA, DANIELA P. ; VASCONCELOS, ZILTON ; ARGE, LUIS W. P. ; FARIAS-DE-OLIVEIRA, DÉSIO A. ; GERBER, ALEXANDRA L. ; PORTARI, ELYZABETH A. ; FERREIRA, NILMA ; RAPHAEL, LIDIANE M. S. ; BONALDO, MYRNA C. ; RIEDERER, INGO ; LOPES MOREIRA, MARIA E. ; COTTA-DE-ALMEIDA, VINICIUS ; VASCONCELOS, ANA T. R. ; MENDES-DA-CRUZ, DANIELLA A. ; SAVINO, WILSON . Zika virus targets the human thymic epithelium. Scientific Reports , v. 10, p. 1378, 2020.

  • AGUIAR, RENATO S. POHL, FABIO MORAIS, GUILHERME L. NOGUEIRA, FABIO C. S. CARVALHO, JOSEANE B. GUIDA, LETÍCIA ARGE, LUIS W. P. MELO, ADRIANA MOREIRA, MARIA E. L. CUNHA, DANIELA P. GOMES, LEONARDO PORTARI, ELYZABETH A. VELASQUEZ, ERIKA MELANI, RAFAEL D. PEZZUTO, PAULA DE CASTRO, FERNANDA L. GEDDES, VICTOR E. V. GERBER, ALEXANDRA L. AZEVEDO, GIRLENE S. SCHAMBER-REIS, BRUNO L. GONÇALVES, ALESSANDRO L. JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, INÁCIO NISHIYAMA, MILTON Y. HO, PAULO L. SCHANOSKI, ALESSANDRA S. , et al. SCHUCH, VIVIANE TANURI, AMILCAR CHIMELLI, LEILA VASCONCELOS, ZILTON F. M. DOMONT, GILBERTO B. VASCONCELOS, ANA T. R. NAKAYA, HELDER I. ; Molecular alterations in the extracellular matrix in the brains of newborns with congenital Zika syndrome. Science Signaling , v. 13, p. eaay6736, 2020.

  • DE CARVALHO, JOSEANE BISO ; DE MORAIS, GUILHERME LOSS ; VIEIRA, THAYS CRISTINE DOS SANTOS ; RABELO, NATANA CHAVES ; LLERENA, JUAN CLINTON ; GONZALEZ, SAYONARA MARIA DE CARVALHO ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO . miRNA Genetic Variants Alter Their Secondary Structure and Expression in Patients With RASopathies Syndromes. Frontiers in Genetics , v. 10, p. 1144, 2019.

  • ASTUDILLO, PATRICIO ; ANGULO, JENNIFFER ; PINO, KARLA ; DE CARVALHO, JOSEANE BISO ; DE MORAIS, GUILHERME LOSS ; PEREZ, SEBASTIÁN ; DE VASCONCELOS, ANA TEREZA RIBEIRO ; FERRÉS, MARCELA ; LÓPEZ-LASTRA, MARCELO . Correlation between female sex, IL28B genotype, and the clinical severity of bronchiolitis in pediatric patients. Pediatric Research , v. 4, p. 785-795, 2019.

  • Molina, Lorrayne Gomes ; Cordenonsi da Fonseca, Guilherme ; Morais, Guilherme Loss de ; de Oliveira, Luiz Felipe Valter ; Carvalho, Joseane Biso de ; Kulcheski, Franceli Rodrigues ; Margis, Rogerio ; CARVALHO, J. B. . Metatranscriptomic analysis of small RNAs present in soybean deep sequencing libraries. Genetics and Molecular Biology (Impresso) , v. 35, p. 292-303, 2012.

  • PASQUALI, GIANCARLO ; ASTARITA, LEANDRO V ; SANTARÉM, ELIANE R ; MARGIS, ROGÉRIO ; ROESLER, RAFAEL ; CASSEL, EDUARDO ; LUCAS, ALINE M ; GERHARDT, JULIANA ; LIMA, MARIA N M ; CARVALHO, JOSEANE B ; FREITAS, KAREN A ; KIRCH, ROCHELE P . Environmental and health risk assessments of genetically modified eucalypts in Brazil. BMC Proceedings , v. 5, p. O57, 2011.

  • CARLOS, M. M. ; SCHWAN-ESTRADA, K. R. F. ; ITAKO, A. T. ; MESQUINI, R. M. ; CARVALHO, J. B. ; STANGARLIN, J. R. . Efeito de extrato bruto e óleo essencial de Achillea millefolium em desenvolvimento in vitro de Corynespora cassiicola e proteção de pepino a mancha de corinespora.. Arquivos do Instituto Biológico (Online) , v. 77, p. 309-316, 2010.

  • CARVALHO, J. B. ; SCHWAN-ESTRADA, K. R. F. ; BONALDO, S. M. ; CRUZ, Maria Eugênia da Silva ; CARLOS, M. M. ; STANGARLIN, J. R. . Fungitoxicidade de Cymbopogon citratus e Cymbopogon martinii a Colletotrichum gloeosporioides em frutos de pimentão. Revista Brasileira de Plantas Medicinais , v. 10, p. 88-93, 2008.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Outras produções

CARVALHO, J. B. . KIT, PROCESSO, MARCADOR MOLECULAR DE ÁCIDOS NUCLÉICOS E SEU USO PARA DETECÇÃO, IDENTIFICAÇÃO, MEDIÇÃO E MONITORAMENTO DE FITOPATÓGENOS. 2011.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Projetos de pesquisa

  • 2016 - Atual

    Apoio à manutenção da infraestrutura do centro multiusuário Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA), Descrição: A Unidade de Genômica Computacional ?Darcy Fontoura de Almeida? (UGCDFA), inaugurada no final de 2008, é uma Unidade Multiusuário destinada a atender aos projetos genomas do Estado do Rio de Janeiro bem como do país e do exterior e está associada ao Laboratório Nacional de Bioinformática (LABINFO) do LNCC. A UGCDFA atua em sincronia com o LABINFO sendo este um centro de excelência em Bioinformática no Brasil e no exterior. Esta associação tem como finalidade integrar as atividades de sequenciamento em larga-escala de DNA e de bioinformática, utilizando a infraestrutura de Computação de Alto Desempenho do LNCC, permitindo maior agilidade no processamento e análise dos dados gerados pelos sequenciadores de DNA de nova geração instalados na UGCDFA. Recentemente, com a instalação do supercomputador Santos Dumont, com um total de 18.144 núcleos de CPU, as sequências geradas na UGCDFA poderão ser processadas com maior velocidade atendendo de forma mais eficiente as várias redes genômicas, grupos parceiros e colaboradores. Até o momento, foram sequenciados cerca de 450 genomas, metagenomas, transcritomas totalizando, aproximadamente, 60Tb de dados gerados pela UGCDFA e processados pelo LABINFO. É importante destacar que para todos os projetos desenvolvidos em colaboração, fazemos parte do alicerce central, visto que somos responsáveis pela geração e processamento das informações genômicas. Esta proposta tem por objetivo a manutenção da infraestrutura da UGCDFA visando continuar gerando grandes quantidades de dados para diversos modelos biológicos e disponibilizando serviços para instituições de pesquisa e acadêmicas, nacionais e internacionais. Ressaltamos que devido ao número de sequenciamentos realizados, processados e analisados na UGCDFA/LABINFO, atualmente, o Estado do Rio de Janeiro tem um papel de destaque nacional na área de genômica computacional/bioinformática, pois foi o que mais gerou, depositou e analisou dados de genomas, transcritomas e metagenomas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Guilherme Loss de Morais - Integrante / Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Coordenador / Luciane Prioli Ciapina - Integrante / Kary Ann Del Carmem Ocaa Gautherot - Integrante / Fabíola Marques de Carvalho - Integrante / Rafael Lucas Guedes - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

  • 2016 - Atual

    Genomica Computacional do Virus da Zika (ZIKV)-SAIZIKA, Descrição: Este projeto pretende investigar a interacao do microorganismo-hospedeiro (SAIZIKA) atraves do sequenciamento de cultivos (primarios ou linhagens estabelecidas) de celulas humanas de diferentes tecidos considerados como alvos potenciais de infeccao, incluindo neuronios/neuroblastos, celulas de Schwann, trofoblasto, queratinocitos, fibroblastos, epiteliais timicas e celulas- tronco de sangue de cordao, seguidas por analises de bioinformatica. Para isso, realizaremos uma analise comparativa do transcritoma humano em cultivos celulares de amostras sadias e infectadas pelo ZIKV. Nessa etapa, pretende-se identificar e caracterizar as funcoes biologicas e vias metabolicas dos genes humanos diferencialmente expressos e que estejam envolvidos na padronizacao do neuro-eixo e malformacoes encefalicas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Guilherme Loss de Morais - Integrante / Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Coordenador / Luciane Prioli Ciapina - Integrante / Kary Ann Del Carmem Ocaa Gautherot - Integrante / Rafael Lucas Guedes - Integrante / Marisa Fabiana Nicolás - Integrante / Luiz Gonzaga Paula Almeida - Integrante / Alexandra L. Gerber - Integrante / Ana Paula Guimarães - Integrante / Mauro Freitas Ortiz - Integrante., Financiador(es): Financiadora de Estudos e Projetos - Auxílio financeiro.

  • 2010 - 2014

    Caracterização funcional de transportadores vacuolares de metais em plantas de arroz, Descrição: O grão de arroz é pobre nos nutrientes ferro e zinco, responsáveis pelas deficiências minerais mais comuns em humanos. Nas plantas, as concentrações destes minerais devem ser finamente reguladas, pois tanto a sua deficiência quanto excesso causam extensos danos. É necessário que os mecanismos que controlam o armazenamento e a redistribuição de metais entre os diferentes órgãos da planta e entre diferentes compartimentos subcelulares sejam compreendidos para que abordagens bem sucedidas de biofortificação com Fe ou Zn em cereais possam ser implementadas. O vacúolo é um compartimento importante para a manutenção da homeostase de minerais na célula vegetal, com grande potencial para aplicações práticas em fitorremediação e biofortificação. Realizamos buscas para encontrar genes de arroz ortólogos aos transportadores vacuolares de Fe e Zn já descritos em plantas. Quatro genes foram identificados: OsNRAMP7, OsMTP1, OsVIT1 e OsZIFL4. A regulação da expressão destes genes será investigada ?in silico? e experimentalmente, com avaliações da expressão gênica em várias partes da planta, fases do desenvolvimento e sob diferentes tratamentos. A localização potencial das proteínas transportadoras no tonoplasto será investigada em experimentos de fusão com GFP. A capacidade de transportar diferentes metais, sua especificidade e afinidade serão avaliadas em experimentos de complementação de leveduras deficientes no transporte vacuolar de Fe ou Zn com as proteínas em estudo. Informações adicionais sobre a função dos quatro transportadores serão obtidas avaliando-se plantas de arroz contendo mutações nas regiões codificantes dos genes, assim como plantas de Arabidopsis com sua expressão aumentada.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Janette Palma Fett - Coordenador / Paloma Koprovski Menguer - Integrante / Lívia Scheunemann dos Santos - Integrante / Felipe Klein Ricachenevsky - Integrante / Karina Letícia Lopes - Integrante / Raul Antônio Sperotto - Integrante / Michael A. Grusak - Integrante / David Salt - Integrante / Marcelo Menossi Teixeira - Integrante.

  • 2010 - 2011

    Desenvolvimento de kit diagnóstico de doenças degenerativas, Descrição: O presente projeto visa o desenvolvimento de um conjunto de diagnóstico e acompanhamento do tratamento de indivíduos com Doença de Parkinson e alfa-sinucleinopatias associadas por PCR quantitativa a partir de amostras de sangue. A metodologia do conjunto diagnóstico está baseada na descoberta que alguns miRNAs são expressos em diferentes níveis em sangue periférico quando avaliado pacientes com Doença de Parkinson em relação a indivíduos sem a doença. Esta observação permite considerar a utilização de sangue periférico na avaliação desta patologia. A comparação pode ser feita entre os níveis de miRNA em sangue venoso de um determinado indivíduo em relação a controles. A comparação pode ser feita de forma direta ou pelo cálculo da razão entre os microRNAs e a determinação da presença da patologia (e sua evolução ou remissão) se a relação exceder a limites de 25, 50 ou 75% em relação aos níveis observados em indivíduos controle, sem a doença. O Brasil está carente do desenvolvimento de métodos de análise e conjuntos diagnósticos oriundos de técnicas que empreguem PCR quantitativo. A utilização da PCR até o momento estava mais restrita a análise qualitativas ou apenas semi-quantitativas. Com a possibilidade da quantificação do número de cópias ou níveis de expressão de mRNAs específicos, abre-se um novo campo diagnóstico em relação ao qual, o meio acadêmico-científico nacional deve transferir o conhecimento existente e gerado, de forma ao desenvolvimento de produtos de aplicação social.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Rogério Margis - Coordenador / Regina Margis - Integrante / Marcia Maria Auxiliadora Naschenveng Pinheiro Margis - Integrante / Carlos Roberto Rieder - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2006 - 2014

    Absorção e Homeostase do Ferro em Plantas de Arroz, Descrição: Objetivo geral: Contribuir para a elucidação dos mecanismos envolvidos na homeostase do ferro em plantas de arroz (absorção, transporte interno, armazenamento, mecanismos de toxidez e resistência, respostas à deficiência, alocação para o grão). Objetivos específicos: 1- Caracterizar a expressão de genes de arroz identificados como possivelmente envolvidos na homeostase do ferro (das famílias ZIP, Yellow Stripe, FRO, NRAMP e Ferritina) em plantas de arroz com diferentes graus de resistência ao metal e submetidas à deficiência, excesso e concentração controle de ferro (usando a técnica de PCR em tempo Real), identificando o órgão da planta (raiz, colmo, folhas, folha bandeira e panícula) em que ocorrem variações na expressão destes genes. 2- Identificar genes cuja expressão é significativamente aumentada ou reduzida em raízes e folhas de plantas de arroz submetidas a deficiência e excesso de ferro em comparação a níveis normais deste metal (usando a técnica de Representational Difference Analysis, RDA) 3- Identificar e caracterizar linhagens mutantes de arroz (oriundas de bancos públicos de mutantes) que contenham inserções em genes das cinco famílias gênicas mencionadas no item 1. 4- Identificar e avaliar a expressão de genes importantes para a alocação de ferro para o grão em plantas de arroz. Metas: - Fornecer novos subsídios para a compreensão dos mecanismos de regulação da homeostase do ferro em plantas. - Identificar genes envolvidos nos mecanismos de resistência ao excesso de ferro em arroz, nas respostas à deficiência e na alocação de ferro para o grão (genes candidatos a serem usados no melhoramento genético da cultura). - Treinar alunos de graduação e pós-graduação no uso de técnicas modernas e na sistemática de trabalho da pesquisa científica. Observação: Este projeto inclui as atividades previstas no projeto "Identification and Expression Analysis of Genes Important for Iron Translocation to the Rice Grain", coordenado por Janette Palma Fett e financiado pelo programa internacional HarvestPlus (www.harvestplus.org), o qual é mantido por órgãos internacionais como o Banco Mundial e a Fundação Gates.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Janette Palma Fett - Coordenador / Paloma Koprovski Menguer - Integrante / Lívia Scheunemann dos Santos - Integrante / Felipe Klein Ricachenevsky - Integrante / Karina Letícia Lopes - Integrante / Raul Antônio Sperotto - Integrante / Vinícius de Abreu Waldow - Integrante / César P. Martinez - Integrante / Michael A. Grusak - Integrante / Sérgio Gindri Lopes - Integrante.

  • 2004 - 2006

    Análise comparativa de desempenho das variedades Freedom e Marble de Euphorbia Pulcherrima na utilização de diferentes substratos, Descrição: O trabalho terá como objetivo avaliar as diferenças na utilização de um novo substrato, considerando o desenvolvimento de Euphorbia Freedom e Euphorbia Marble, através de análise comparativa durante dois períodos utilizando mudas certificadas de qualidade e procedência.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Arney Eduardo do Amaral Ecker - Integrante / Bruno Luiz Domingos De Angelis - Coordenador / Claudia Regina Scapim - Integrante / Daniel Simeoni de Oliveira - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

  • 2003 - 2011

    Etiologia e Epidemiologia de Pectobacterium spp. associadas à canela-preta da batata, Descrição: (1) Identificar e caracterizar estirpes de pectobactérias oriundas de batata-semente (2) Determinar as implicações epidemiológicas da presença de tais estirpes na incidência de podridão mole e canela preta na batata. (2.1) Determinar a incidência destas estirpes em tubérculos de batata-semente de diferentes cultivares e classes (pré-básica, básica, registrada e certificada); (2.2.) Testar a capacidade de indução de Canela-Preta das estirpes; (2.3) Avaliar a capacidade de maceração e a virulência das estirpes; (2.4) Verificar a presença de P. atrosepticum, P. brasiliensis, P. wasabiae e Dicheia chrysanthemi; (2.5) Determinar a incidência de pectobactérias em plantas de batata oriundas de lavouras.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Valmir Duarte - Coordenador / Rogério Margis - Integrante / Cátia Cristina Rommel - Integrante / Andréia Mara Rotta de Oliveira - Integrante / José Ricardo Pfeifer Silveira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2000 - 2002

    Absorção de nutrientes, crescimento e produção de cultivares de feijoeiro em dois níveis de produtividade em duas épocas de semeadura em condições de campo., Descrição: Estudou-se o comportamento das cultivares de feijão Pérola, Aporé e Ruda, adubadas para atingiras metas de produtividades de até 1200 kg/ha e maiores que 2000 kg/ha na safra das águas e seca, na região de Maringá-PR. Foi avaliado a absorção de nutrientes, o crescimento e a produtividade das 3 cultivares.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (3) . , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Carlos Alberto de Bastos Andrade - Coordenador / Sandra Magda Sanches Patroni - Integrante / David Martins Jacinto - Integrante / Elson Borges dos Santos - Integrante / Andre Leonardo Scatambulo - Integrante / Marcos de Araújo Rodovalho - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 1998 - 2014

    Investigação dos mecanismos de resistência ao excesso de ferro em arroz., Descrição: Objetivo geral: Contribuir para a elucidação dos mecanismos de resistência ao excesso de ferro em arroz. Objetivos específicos: - Avaliar a distribuição e as formas de ocorrência do ferro em plantas de arroz de variedades com distintos graus de resistência ao excesso de ferro. - Avaliar o papel da atividade de enzimas peroxidases de parede das raízes de plantas de arroz no mecanismo de exclusão (concentração de ferro no apoplasto) em plantas de arroz de variedades com distintos graus de resistência ao excesso de ferro. - Avaliar a importância da síntese de ferritinas para o mecanismo de resistência ao excesso de ferro em arroz. - Avaliar o papel da atividade de enzimas superóxido dismutases e peroxidases solúveis no mecanismo de tolerância ao excesso de ferro em arroz. - Procurar genes de arroz envolvidos no metabolismo do ferro que sejam potencialmente úteis para o melhoramento genético da cultura, com vistas ao aumento da sua resistência ao excesso de ferro.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Joseane Biso de Carvalho - Integrante / Janette Palma Fett - Coordenador / Janete Mariza Adamski - Integrante / Felipe Carmona - Integrante / Fernanda Otesbelgue Pinto - Integrante / Denise Cargnelutti - Integrante / Arthur Germano Fett Neto - Integrante / Guilherme Leitão Duarte - Integrante / Julio César de Lima - Integrante / Tatiana de Freitas Terra - Integrante.

Histórico profissional

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Endereço profissional

  • Neoprospecta Microbiome Technologies. , Avenida Luiz Boiteux Piazza - 1302, Canasvieiras, 88054700 - Florianópolis, SC - Brasil, Telefone: (48) 33690830

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Experiência profissional

  • 2019 - Atual

    Neoprospecta Microbiome Technologies

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2018 - 2019

    Laboratório Nacional de Computação Científica

    Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2015 - 2018

    Laboratório Nacional de Computação Científica

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 05/2015 - 09/2017

      Pesquisa e desenvolvimento , Unidade de Genômica Computacional Darcy Fontoura de Almeida (UGCDFA), .,Linhas de pesquisa

    • 01/2016 - 02/2016

      Ensino, Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, GA-047-Bionformática I: Banco de dados do ponto de vista biológico

  • 2014 - 2014

    Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Sul de Minas Gerais

    Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor substituto Ensino médio e Superior, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Curso Técnico em Agropecuária, IFSuldeminas-Campus Inconfidentes, MG.

    Atividades

    • 10/2014

      Ensino, Agronomia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Cafeicultura, Olericultura

  • 2011 - 2014

    Universidade Federal do Rio Grande do Sul

    Vínculo: Bolsista Pós-Doutorado PNPD, Enquadramento Funcional: Pós-Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2006 - 2009

    Universidade Federal do Rio Grande do Sul

    Vínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Pesquisador (estudante de doutorado), Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 12/2011 - 09/2014

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências, Departamento de Botânica.,Linhas de pesquisa

    • 08/2012 - 12/2012

      Ensino, Botânica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, BOT00016-Biotecnologia de plantas

    • 03/2006 - 12/2009

      Pesquisa e desenvolvimento , Faculdade de Agronomia, Departamento de Fitossanidade.,Linhas de pesquisa

    • 08/2008 - 12/2008

      Ensino, Agronomia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, AGR 04001- Manejo Integrado de Pragas e Doenças

    • 08/2007 - 12/2007

      Ensino, Agronomia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, AGR04401-Microbiologia Agrícola A

    • 05/2006 - 05/2006

      Treinamentos ministrados , Instituto de Letras, .,Treinamentos ministrados, Proficiência em língua espanhola

  • 2010 - 2011

    Vitatec-Consultoria e Desenvolvimento em Biotecnologia Ltda.

    Vínculo: Bolsista recém-doutor (SET-3B), Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 02/2010 - 11/2011

      Pesquisa e desenvolvimento , Vitatec (Desenvolvimento), .,Linhas de pesquisa

  • 2004 - 2006

    Universidade Estadual de Maringá

    Vínculo: Pesquisador, Enquadramento Funcional: Pesquisador (estudante de mestrado), Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 04/2005 - 04/2005

      Treinamentos ministrados , Centro de Ciências Humanas Letras e Artes, Departamento de Letras.,Treinamentos ministrados, Proficiência em língua inglesa

    • 08/2004 - 12/2004

      Treinamentos ministrados , Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Agronomia.,Treinamentos ministrados, Estágio em docência na disciplina de Plantas medicinais, jardins e paisagismo sob orientação do Prof. Dr. Bruno Luiz Domingo de Angelis

    • 09/2002 - 05/2003

      Treinamentos ministrados , Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Agronomia.,Treinamentos ministrados, Monitoria da disciplina de Irrigação e Drenagem

    • 08/2001 - 07/2002

      Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Agronomia.,Linhas de pesquisa

    • 07/2001 - 07/2001

      Treinamentos ministrados , Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Agronomia.,Treinamentos ministrados, Dia de campo na Cocamar na disciplina de extensão rural

    • 04/2001 - 07/2001

      Treinamentos ministrados , Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Agronomia.,Treinamentos ministrados, Monitoria da disciplina de Entomologia

    • 04/2000 - 11/2000

      Estágios , Centro de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia.,Estágio realizado, Estágio com bolsa Trabalho no Laboratório de Micologia/Departamento de Biologia com carga horária de 360 horas.

    • 12/1998 - 11/1999

      Outras atividades técnico-científicas , Centro de Ciências Agrárias, Centro de Ciências Agrárias.,Atividade realizada, Projeto de ensino "Elaboração de um herbário contendo informações agronômicas de plantas medicinais" com carga horária de 80 horas-aula..

Propriedade Intelectual

Patentes (1)