Simone Raposo Cotta

Bacharel em Microbiologia e Imunologia pela UFRJ, possui o Mestrado e o Doutorado em Ciências (Microbiologia) também pela UFRJ. Atualmente realiza o pós-doutorado no CENA/USP onde o projeto visa avaliar a funcionalidade e a biogeografia das comunidades microbianas associadas as Lagoas Salino-Alcalinas do Pantanal. Possui experiência no estudo de microrganismos associados ao ciclo do nitrogênio e do fósforo além do estudo de elementos genéticos móveis em diferentes ambientes e seu impacto na estruturação e no funcionamento dos diferentes microbiomas. Realizou doutorado sanduíche na University of Groningen (Rijksuniversiteit Groningen).

Informações coletadas do Lattes em 24/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciências (Microbiologia)

2009 - 2013

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Análise do impacto do cultivo de milho (Zea mays) geneticamente modificado sobre as comunidades microbianas em solos brasileiros
Orientador: em University of Groningen ( Jan Dirk van Elsas)
com Lucy Seldin. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Milho transgênico; Diversidade Microbiana; Fósforo; Nitrogênio.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Agricultura, Pecuária e Serviços Relacionados.

Mestrado em Ciências (Microbiologia)

2007 - 2009

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Caracterização das substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos e identificação das estirpes produtoras,Ano de Obtenção: 2009
Lucy Seldin.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Substâncias antimicrobianas; Fungos dermatófitos; Paenibacillus.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada / Especialidade: Microbiologia Médica.

Graduação em Ciencias Biológicas Microbiologia e Imunologia

2003 - 2006

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitos
Orientador: Lucy Seldin

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Pós-doutorado

2019

Pós-Doutorado. , Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo, CENA / USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

2014 - 2018

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

2015 - 2016

Pós-Doutorado. , University of Groningen, RUG, Holanda.

2013 - 2014

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Agrárias

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Formação complementar

2017 - 2017

Análise do perfil de rDNA 16S a partir de dados de NGS. , Brazilian Microbiome Project, BMP, Brasil.

2009 - 2009

Treinamento de Usuários do Equipamento LightCycler 1.5. , Roche Applied Science, ROCHE, Brasil.

2007 - 2007

Introdução a espectometria de massa. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2007 - 2007

Tópicos Especiais em Biotecnologia Vegetal. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2005 - 2005

Corrosão microbiológica no setor de óleo e gas. , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2004 - 2004

Extensão universitária em Curso de Microbiologia Industrial. (Carga horária: 16h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2004 - 2004

Controle de qualidade microbiológica na indústria. , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2003 - 2003

Conceitos Fundamentais de Imunologia. , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada.

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Organização de eventos

COTTA, SIMONE R. . III Simpósio de Microbiologia Agrícola. 2017. (Outro).

COTTA, S. R. . ESALQSHOW: Feira de Inovação Tecnológica para o Agronegócio Sustentável. 2017. .

COTTA, S. R. ; CEDROLA, S. ; Duarte, Mariana . Conhecendo a UFRJ. 2006. (Outro).

COTTA, SIMONE R. . III Simpósio de Microbiologia Agrícola. 2017. (Outro).

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Participação em eventos

28 Congresso Brasileiro de Microbiologia. A rizosfera como consequência da mudança no uso do solo. 2015. (Congresso).

15th International Symposium on Microbial Ecology - ISME. Towards the Role of Mobile Elements in the Adaptation to Life in Mangrove Soil. 2014. (Congresso).

Meta-Omics and Bioinformatics in Microbial Ecology. 2014. (Simpósio).

XIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental. The Role of Genetics Mobile Elements in the Adaptation to Life in Mangrove Soils. 2014. (Congresso).

12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology - BAGECO. Assessment of the effect of genetic modified (GM) Maize cultivation on ammonia-oxidazing bacterial and archaeal communities. 2013. (Congresso).

27 CBM - Congresso Brasileiro de Microbiologia. Poster. 2013. (Congresso).

14th. International Symposium on Microbial Ecology - ISME. Temporal dynamics of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystems. 2012. (Congresso).

FertBio. Avaliação do possível impacto de milho geneticamente modificado na ciclagem do nitrogenio em solo de cerrado. 2012. (Congresso).

XX Congreso Latinoamericano de Microbiología. Diversidade da comunidade bacteriana presente na rizosfera de milho transgênico e na sua respectiva linhagem isogênica não transgênica. 2010. (Congresso).

25o. Congresso Brasileiro de Microbiologia. PRODUÇÃO DE SUBSTÂNCIAS ANTIMICROBIANAS ATIVAS CONTRA O FUNGO DERMATÓFITO TRICOPHYTON RUBRUM PELA ESPÉCIE PAENIBACILLUS KRIBBENSIS. 2009. (Congresso).

XI Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental.Produção de substância antimicrobianas ativas contra fungos dermatófios pela estirpe POC115 de Paenbacillus kribbensis. 2008. (Encontro).

I Semana de Pós-Graduação do Instituto de Bioquímica Médica.Identificação de estirpes produtoras de substâncias antimicrobianas (SAM) ativas contra fungos dermatófitos e caracterização parcial dessas SAM. 2007. (Outra).

XXIV Congresso Brasileiro de Microbiologia. Identificação de estirpes de Paenibacillus produtoras de substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos. 2007. (Congresso).

XXXVI Annual Meeting/ Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular-SBBq. Production of antimicrobial substance by Paenibacillus strains against dermatophytes fungi. 2007. (Congresso).

XII Semana de Microbiologia e Imunologia.Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitos. 2006. (Encontro).

XXVIII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ.Produção de substâncias ativas contra fungos dermatófitos por estirpes pertencentes ao gênero Paenibacillus. 2006. (Outra).

XI Semana de Microbiologia e Imunologia.Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitos. 2005. (Encontro).

XXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ.Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus com atividade contra fungos dermatófitos. 2005. (Encontro).

XXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ.Atividade imunomodulatória da warifteína purificada do extrato da Cissampelos sympodialis EICH (menispermaceae) sobre linfócitos B in vitro e in vivo. 2005. (Encontro).

II Bienal de Museologia, Ciências e Saúde - Fórum de Ciências Farmacêuticas.Modulação da resposta de linfócitos B pela warifteína purificada do extrato de Cissampelos sympodialis. 2004. (Outra).

Inflamation and Chemokines. Modulação da resposta dos linfócitos B a warifteína purificada extraída do extrato de Cissampelos sympodialis. 2004. (Congresso).

X Semana de Microbiologia e Imunologia.Modulação da resposta dos linfócitos B a warifteína purificada extraída do extrato de Cissampelos sympodialis. 2004. (Encontro).

XXVI Jornada de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ.Modulação da resposta de linfócitos B pela warifteína purificada do extrato de Cissampelos sympodialis. 2004. (Encontro).

IX Semana de Microbiologia e Imunologia. 2003. (Encontro).

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Participação em bancas

Aluno: Fernanda de Almeida Godoy

Mendes, R.; Melo, I.S.; TAKETANI, R. G.;Cotta, Simone Raposo. Identificação de bactérias promotoras de crescimento de trigo e seu impacto na comunidade bacteriana da rizosfera. 2020. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Shilton Reino Cavalcante

COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.;Cotta, Simone Raposo. Identificação da microbiota cecal de duas linhagens de galinha caipira e associação com consumo alimentar residual. 2020. Dissertação (Mestrado em Ciência Animal e Pastagens) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Bruna Andréia Bacco Lopes

Cotta, Simone Raposo; MUI, T. S.; CARDOSO, E. J. B. N.; Gonçalves, J.L.M. Fungos micorrízicos arbusculares e espécies de Eucalyptus com diferentes níveis de tolerância ao estresse hídrico. 2019. Dissertação (Mestrado em Solos e Nutrição em Plantas) - Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz".

Aluno: Iara Donadão Preto

COTTA, S. R.; Lacava, P.T.;AZEVEDO, J. L.. Identificação do potencial biotecnológico de microrganismos endofíticos na produção de compostos inseticidas e biorremediação. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduação em Ciências) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maiele Cintra Santana

COTTA, SIMONE R.; CARDOSO, E. J. B. N.; Robin, A.A.; Almeida, A.. Análise da comunidade de fungos em áreas de monocultura e consórcio de Eucalyptos grandis e Acacia mangium. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Iara Donadão Preto

AZEVEDO, J. L.; Lacava, P.T.;Cotta, Simone Raposo. Identificação do potencial biotecnológico de microrganismos endofíticos na produção de compostos inseticidas e biorremediação. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduação em Ciências) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Yasmin Florentino Rodriguez

Cotta, Simone Raposo; Seldin, L.;Andreote F.D.; Rossman, M.. Influência da diversidade microbiana presente na rizosfera do milho na disponibilização de fósforo. 2018. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Laura Bononi

Melo, I.S.; LACERDA JUNIOR, G. V.; FIORE, M. F.;Cotta, Simone Raposo. Bioprospecção de Trichoderma spp. envolvidas na solubilização de fosfato e controle biológico de Sclerotinia scleotiorium em soja. 2020. Tese (Doutorado em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Andressa Monteiro Venturini

Cotta, Simone Raposo; MUI, T. S.; PELLIZARI, VIVIAN HELENA; Souza, J.A.M. Conversão floresta-pastagem na Amazônia Oriental: impacto sobre as comunidades microbianas do metano do solo. 2019. Tese (Doutorado em Biologia na Agricultura e no Ambiente) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leandro Nascimento Lemos

Cotta, Simone Raposo; MUI, T. S.;Andreote F.D.; Varani, A.M. Modelagem integrativa e in silico de dados multi-ômicos de filos de Archaea e Bacteria em solos amazônicos. 2019. Tese (Doutorado em Biologia na Agricultura e no Ambiente) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Silvia Eugenia Barrera Berdugo

LUCHETA, A. R.; SILVA, A. P. D.;Andreote, F. D.; LAMBAIS, M. R.;COTTA, S. R.. Redes ecológicas em comunidades bacterianas da filosfera, dermosfera e rizosfera de espécies árboreas da Mata Atlântica. 2016. Tese (Doutorado em Solos e Nutrição de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Elisa Rabelo Matos

LAMBAIS, M. R.; TORRADO, P. V.; AZEVEDO, L. C. B.; FRACETTO, G. G. M.;COTTA, S. R.. Variações das estruturas das comunidades de bactérias e fungos em Espadossolos sob deferentes regimes de drenagem. 2015. Tese (Doutorado em Microbiologia agrícola) - Universidade de São Paulo.

Aluno: German Andres Estrada Bonilla

Melo, I.S.; CARDOSO, E. J. B. N.;COTTA, S. R.; VASCONCELLOS, R. L. F.; PAVINATO, P. S.. Efeito da inoculação de bactérias mobilizadoras de fósforo na compostagem e no desenvolvimento da cana-de-açúcar. 2015. Tese (Doutorado em Solos e Nutrição de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Joice Andrade Bonfim

CARDOSO, E. J. B. N.; SILVA, A. P. D.; TRUFEM, S. F. B.; MURAOKA, T.;COTTA, S. R.. Fungos micorrízicos arbusculares e endofíticos dark septate em áreas de mata atlântica em um gradiente altitudinal. 2015. Tese (Doutorado em Solos e Nutrição de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Maryiemy Varon Lopez

COTTA, S. R.; SALLES, J. F.; FIORE, M. F.; TAKETANI, R. G.;Andreote, F. D.. Descrição da microbiota relacionada às transformações do enxofre em sedimentos de manguezais. 2013. Tese (Doutorado em Doutorado em Microbiologia Agrícola) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luis Fernando Merloti

Mendes, R.; FERNANDO, DINI ANDREOTE;Cotta, Simone Raposo. Dinâmica de oxidantes de amônio em solos de Mata Atlântica: impacto da conversão floresta-pastagem e da adubação nitrogenada. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Júlia Brandão Gontijo

Cotta, Simone Raposo; Camargo, P.B; Nakayama, C.R.. Dinâmica das comunidades microbianas associadas ao ciclo do metano e do enxofre em solos inundáveis amazônicos. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia na Agricultura e no Ambiente) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maiele Cintra Santana

Gonçalves, J.L.M; Mendes, L.W.;Cotta, Simone Raposo. Remoção de resíduos em florestas de eucalipto: influência na comunidade de fungos e na ciclagem do fósforo no solo. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Kelly Jaqueline Alves

Cotta, Simone Raposo; Mendes, R.; Regitano, J.B.. A interação entre o microbioma do solo e o uso de pesticidas agrícolas - um enfoque ecológico. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Gabriela Garcia Medeiros

COTTA, SIMONE R.; Monteiro, R.T.R; Medeiros, A.O.. Decomposição foliar em rios sob diferentes intensidades de perturbação. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Química na Agricultura e no Ambiente) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Miriam Gonçalves de Chaves

Cotta, Simone Raposo; FIORE, M. F.; Souza, J.A.M. Abordagem multianalitica no estudo da composição e funcionalidade da microbiota associada aos ciclos do C e do N em solos agrícolas e naturais. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia na Agricultura e no Ambiente) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gercino Ferreira Virginio Junior

Mourão, G.B; Gomes, V;Cotta, Simone Raposo. Modulação do microbioma gastrointestinal de bezerros pelo fornecimento de diferentes dietas líquidas e sólidas. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência Animal e Pastagens) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Laura Bononi

FIORE, M. F.; Santos, S.N;COTTA, S. R.. Bioprospecção de Trichoderma spp. envolvidas na solubilização de fosfato e no controle biológico de Sclerotinia sclerotiorum. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Juliana Dos Santos Costa

Monteiro, R.T.R; Fostier, A.H.;COTTA, S. R.. Comunidades microbianas e genes funcionais associados com a ciclagem de arsênio em lagoas salino-alcalinas. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Bruna Arruda

COTTA, SIMONE R.; Cherubin, M.R.; MURAOKA, T.. Interação entre a fertilização fosfatada e a diversidade microbiana do solo na colonização de plantas por fungos micorrízicos arbusculares. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Solos e Nutrição de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Bruno Costa Evangelista de Souza

Rocha, O; Rossman, M.;COTTA, S. R.. Biogeografia microbiana em lagoas salino-alcalinas do Pantanal da Nhecolândia, MS. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Marcos Altomani Neves Dias

COTTA, S. R.; DOURADO NETO, D.; AMBROSANO, E. J.. Changes in early mycorrhization of soybean due to seed treatment with seaweed extracts. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Fitotecnia) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Arthur Prudêncio de Araujo Pereira

PAVINATO, P. S.; Gonçalves, J.L.M;COTTA, S. R.. O microbioma do solo associado a ciclagem de nitrogênio em florestas de Eucalypto e Acacia. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Solos e Nutrição de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Gabriela Ferraz Leone

COTTA, S. R.; KLUGE, R. A.; PIOTTO, K. D. B.. Estudo da atuação de flavonóides na rizôgenese de eucalipto e sua participação na atividade rizosférica. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Fisiologia e Bioquímica de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Mylenne Calciolari Pinheiro da Silva

Cotta, Simone Raposo; Dias, A. C. F.; FIORE, M. F.. Bioprospecção e caracterização de xilanase em biblioteca metagenômica de manguezal do estado de São Paulo. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia agrícola) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Mariley de Cassia da Fonseca

COTTA, S. R.; Navarrete, A.A.; Linhares, F.S.. Fósforo e sua dinâmica no solo decorrente das interações de fatores bióticos e abióticos. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós Graduação em Ciências) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Lucianne Ferreira Paes de Oliveira

COTTA, SIMONE R.; Lira, S.P.; QUECINE, M. C.. Bioprospecção de compostos produzidos por Actinobacterias isoladas de ilhas do Litoral Norte de São Paulo. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Júlia Brandão Gontijo

Moreira, M.Z.; COSTA, M. F.;COTTA, S. R.. Genes funcionais do ciclo do metano em sedimentos de áreas alagadas dos rios Tapajós e Amazonas. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós Graduação em Ciências) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ricardo Luiz Dália

BASSO, L. C.; DIAS, A. C. F.;COTTA, S. R.. Isolamento e caracterização de leveduras em melaço de cana-de-açúcar concentrado. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Bruno Weiss

COTTA, S. R.; FIORE, M. F.; DIAS, A. C. F.. Genômica comparativa da cianobactéria Microcystis aeruginosa SPC777 com ênfase em genes envolvidos com síntese de produtos naturais. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Osni Florêncio Junior

BASSO, L. C.;COTTA, S. R.; Rigonato, J. Obtenção de leveduras tolerantes aos inibidores presentes no hidrolisado lignocelulósico de bagaço de cana-de-açúcar mediante a hibridação e evolução adaptativa. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Julia Capozzi Franke

Andreote F.D.Cotta, Simone Raposo; Rodriguez, Y.F.. Influência da palha de cana-de-açúcar em microrganismos disponibilizadores de fósforo no solo. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Agronomia) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

Aluno: Filipe Rafael Salvetti Nunes

COTTA, S. R.; Vitorello, C.. Composição e participação da comunidade microbiana responsável pela disponibilização de fósforo nos sedimentos de manguezais utilizando técnicas independentes de cultivo. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Agronomia) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

COTTA, S. R.. SIICUSP - Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da Universidade de São Paulo. 2018. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP.

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Comissão julgadora das bancas

Irene von der Weid Andrade Oliveira

VON DER WEID, I.. "Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitos". 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Maria Auxiliadora Coelho Kaplan

KAPLAN, Maria Auxiliadora Coelho. Produção de substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos pela estirpe Paenibacillus kribbensis POC115. 2009. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Eliana Barreto Bergter

ALVIANO, C. S.RODRIGUES, M. L.Barreto Bergter,E; Kaplan MA. Produção de substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos pela estirpe Paenibacillus kribbensis POC115. 2009. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Instituto de Microbiologia.

Eliana Barreto Bergter

Barreto Bergter,E; COELHO, R. R. R.; WEID, I. V. D.. Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus ativas contra alguns fungos dermatófitos. 2006. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia.

MARCIO ALVES FERREIRA

Alves-Ferreira, Marcio. Análise do impacto de milho (Zea mays) geneticamente modificado sobre as comunidades microbianas em solos brasileiros. 2013. Tese (Doutorado em Ciências (Microbiologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Fernando Dini Andreote

ANDREOTE, F. D.; ALVIANO, C. S.; ALVES, M.; PEIXOTO, R.;SELDIN, L.. Análise do impacto de milho (Zea mays) geneticamente modificado sobre as comunidades microbianas em solos brasileiros. 2013. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Celuta Sales Alviano

ALVIANO, C. S.RODRIGUES, Marcio L; KAPLAN, M. A. C.;SANTOS, A. L. S.; BARRETO-BERGTER, E. Produção de substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos pela estirpe Paenibacillus kribbensis POC115. 2009. Dissertação (Mestrado em CIÊNCIAS (MICROBIOLOGIA)) - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Goes.

Celuta Sales Alviano

ALVIANO, C. S.. Produção de substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos pela estirpe Paenibacillus kribbensis POC115. 2009 - Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes - UFRJ.

Andrew Macrae

MACRAE, A.. " Diversidade da comunidade Bacteriana presente na Rizosfera de milho transgênico e não transgênico, com ênfase na população fixadora de nitrogênio e/ou solubilizadora de fosfato ".. 2009. Tese (Doutorado em Doutorado) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

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Orientou

Yasmin Florentino

Efeito da diversidade microbiana do solo na disponibilização de fósforo; 2017; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Simone Raposo Cotta;

Débora Alves

Análise da comunidade endofítca de milhos geneticamente modificados; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Ciencias Biológicas Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Simone Raposo Cotta;

Carlos Eduardo Souza

Análise comparativa da comunidade endofítica presente na raiz de milho transgênico e de sua respectiva linhagem isogênica não transgênica; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Ciencias Biológicas Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Simone Raposo Cotta;

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Foi orientado por

Ligia Maria Torres Pecanha

Modulacao da funcao imunologica por produtos naturais; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado Em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ligia Maria Torres Pecanha;

Ivanildo Evodio Marriel

Impactos de plantas geneticamente modificadas sobre a estrutura e função de microrganismos na rizosfera de milho; 2010; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Ivanildo Evódio Marriel;

Fernando Dini Andreote

2018; Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Fernando Dini Andreote;

Lucy Seldin

Produção de substâncias antimicrobianas ativas contra fungos dermatófitos pela estirpe Paenibacillus kribbensis POC115; 2009; Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Lucy Seldin;

Lucy Seldin

Análise do impacto de milho (Zea mays) geneticamente modificado sobre as comunidades microbianas em solos brasileiros; 2013; Tese (Doutorado em Doutorado em Ciências (Microbiologia)) - Instituto de Microbiologia - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Lucy Seldin;

Lucy Seldin

Produção de substâncias antimicrobianas por Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitos; 2006; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Microbiologia e Imunologia) - Instituto de Microbiologia Prof Paulo de Góes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Lucy Seldin;

Daniela Sales Alviano

Produção de substâncias antimicrobianas por estirpes de Paenibacillus spp; ativas contra fungos dermatófitos; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Bacharelado em ciencias biológicas: Microbiologia) - Instituto de Microbiologia / UFRJ, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Daniela Sales Alviano Moreno;

Fabio Faria da Mota

Substâncias antimicrobianas produzidas por estirpes de Paenibacillus ativas contra fungos dermatófitos; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas (Microbiologia e Imunologia)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Fabio Faria da Mota;

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Produções bibliográficas

  • ALVES, KELLY JAQUELINE ; DA SILVA, MYLENNE CALCIOLARI PINHEIRO ; Cotta, Simone Raposo ; OTTONI, JÚLIA RONZELLA ; van Elsas, Jan Dirk ; DE OLIVEIRA, VALERIA MAIA ; ANDREOTE, FERNANDO DINI . Mangrove soil as a source for novel xylanase and amylase as determined by cultivation-dependent and cultivation-independent methods. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 51, p. 217-228, 2020.

  • GUMIERE, THIAGO ; ROUSSEAU, ALAIN N. ; DA COSTA, DIOGO PAES ; CASSETARI, ALICE ; Cotta, Simone Raposo ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; GUMIERE, SILVIO J. ; PAVINATO, PAULO SERGIO . Phosphorus source driving the soil microbial interactions and improving sugarcane development. Scientific Reports , v. 9, p. 4400, 2019.

  • SIMONE, RAPOSO COTTA ; Dias, A. C. F. . O microbioma da rizosfera e sua potencialidade. Revista RG News , v. 5, p. 42-47, 2019.

  • Cotta, Simone Raposo ; CADETE, LUANA LIRA ; van Elsas, Jan Dirk ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO . Exploring bacterial functionality in mangrove sediments and its capability to overcome anthropogenic activity. MARINE POLLUTION BULLETIN , v. 141, p. 586-594, 2019.

  • DA COSTA, DIOGO PAES ; DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; Cotta, Simone Raposo ; VILELA, DANIELLA ; DE ANDRADE, PEDRO AVELINO MAIA ; PELLIZARI, VIVIAN HELENA ; ANDREOTE, FERNANDO DINI . Changes of bacterial communities in the rhizosphere of sugarcane under elevated concentration of atmospheric CO. Global Change Biology Bioenergy , v. 10, p. 137-145, 2018.

  • PEREIRA, ARTHUR P. A. ; ZAGATTO, MAURÍCIO R. G. ; BRANDANI, CAROLINA B. ; MESCOLOTTI, DENISE DE LOURDES ; COTTA, SIMONE R. ; GONÇALVES, JOSÉ L. M. ; CARDOSO, ELKE J. B. N. . Acacia Changes Microbial Indicators and Increases C and N in Soil Organic Fractions in Intercropped Eucalyptus Plantations. Frontiers in Microbiology , v. 9, p. 655, 2018.

  • PEDRO, AVELINO MAIA DE ANDRADE ; ARMANDO, CAVALCANTE FRANCO DIAS ; SIMONE, RAPOSO COTTA ; DIOGO, PAES DA COSTA ; JOÃO, TIAGO CORREIA OLIVEIRA ; LUCIANNE, FERREIRA PAES DE OLIVEIRA ; FERNANDO, JOSÉ FREIRE ; FERNANDO, DINI ANDREOTE ; JULIA, KUKLINSKY-SOBRAL . Differential niche occupation and the biotechnological potential of Methylobacterium species associated with sugarcane plants. AFRICAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY RESEARCH , v. 12, p. 595-605, 2018.

  • VOLLÚ, RENATA ESTEBANEZ ; COTTA, S. R. ; JURELEVICIUS, DIOGO ; LEITE, DEBORAH CATHARINE DE ASSIS ; PARENTE, CLÁUDIO ERNESTO TAVEIRA ; MALM, OLAF ; MARTINS, DENIZE CARVALHO ; RESENDE, ÁLVARO VILELA ; MARRIEL, I. E. ; SELDIN, Lucy . Response of the Bacterial Communities Associated With Maize Rhizosphere to Poultry Litter as an Organomineral Fertilizer. FRONTIERS IN ENVIRONMENTAL SCIENCE , v. 6, p. 1-13, 2018.

  • DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; Cotta, Simone Raposo ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; van Elsas, Jan Dirk . The parA Region of Broad-Host-Range PromA Plasmids Is a Carrier of Mobile Genes. MICROBIAL ECOLOGY (ONLINE) , v. 75, p. 479-486, 2017.

  • ANDREOTE, FERNANDO DINI ; Cotta, Simone Raposo ; DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO . Microbioma de Solos Brasileiros: Uma visão geral. Microbiologia in Foco , v. 6, p. 22-39, 2015.

  • Cotta, Simone Raposo ; CAVALCANTE FRANCO DIAS, ARMANDO ; Seldin, Lucy ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; van Elsas, Jan Dirk . The diversity and abundance of phytase genes (BPP) in bacterial communities of the maize rhizosphere. Letters in Applied Microbiology , v. 62, p. n/a-n/a, 2015.

  • SÁ, ANDRÉ LUÍS BRAGHINI ; DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; QUECINE, MARIA CAROLINA ; Cotta, Simone Raposo ; FASANELLA, CRISTIANE CIPOLA ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; MELO, ITAMAR SOARES DE . Screening of endoglucanase-producing bacteria in the saline rhizosphere of Rhizophora mangle. Brazilian Journal of Microbiology (Impresso) , v. 45, p. 193-197, 2014.

  • COTTA, S. R. ; Dias, A. C. F. ; MARRIEL, I. E. ; Andreote, F. D. ; Seldin, L. ; van Elsas, J. D. . Different Effects of Transgenic Maize and Nontransgenic Maize on Nitrogen-Transforming Archaea and Bacteria in Tropical Soils. Applied and Environmental Microbiology (Print) , v. 80, p. 6437-6445, 2014.

  • DA SILVA, DÉBORA ALVES FERREIRA ; Cotta, Simone Raposo ; VOLLÚ, RENATA ESTEBANEZ ; DE JURELEVICIUS, DIOGO AZEVEDO ; MARQUES, JOANA MONTEZANO ; MARRIEL, IVANILDO EVÓDIO ; Seldin, Lucy . Endophytic microbial community in two transgenic maize genotypes and in their near-isogenic non-transgenic maize genotype. BMC Microbiology (Online) , v. 14, p. 332, 2014.

  • Cotta, Simone Raposo ; DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; MARRIEL, IVANILDO EVÓDIO ; GOMES, ELIANE APARECIDA ; ELSAS, JAN DIRK ; Seldin, Lucy . Temporal dynamics of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystems. Antonie Van Leeuwenhoek (Dordrecht. Online) , v. 103, p. 589-601, 2013.

  • COTTA, S. R. ; da Mota, Fabio Faria ; Tupinambá, Gleiser ; Ishida, Kelly ; Rozental, Sonia ; e Silva, Davi Oliveira ; da Silva, Antônio Jorge Ribeiro ; Bizzo, Humberto Ribeiro ; Alviano, Daniela Sales ; Alviano, Celuta Sales ; Seldin, Lucy . Antimicrobial activity of Paenibacillus kribbensis POC 115 against the dermatophyte Trichophyton rubrum. World Journal of Microbiology & Biotechnology , v. 28, p. 953-962, 2012.

  • Jurelevicius, Diogo ; Cotta, Simone Raposo ; Peixoto, Raquel ; Rosado, Alexandre Soares ; Seldin, Lucy . Distribution of alkane-degrading bacterial communities in soils from King George Island, Maritime Antarctic. European Journal of Soil Biology , v. 51, p. 37-44, 2012.

  • Dias, A. C. F. ; Pereira e Silva, M. d. C. ; COTTA, S. R. ; Dini-Andreote, F. ; Soares, F. L. ; Salles, J. F. ; AZEVEDO, J. L. ; van Elsas, J. D. ; Andreote, F. D. . Abundance and Genetic Diversity of nifH Gene Sequences in Anthropogenically Affected Brazilian Mangrove Sediments. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY , v. 78, p. 7960-7967, 2012.

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Projetos de pesquisa

  • 2018 - Atual

    O uso de comunidades microbianas sintéticas (SynCom) na melhoria da eficiência da fertilização fosfatada de plantas, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Raposo Cotta - Coordenador / Lucy Seldin - Integrante / Fernando Dini Andreote - Integrante / Victor Satler Pylro - Integrante.

  • 2014 - 2017

    PLASMIDOMA DE SOLOS DE MANGUEZAIS, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Armando Cavalcante Franco Dias em 24/11/2014., Descrição: Os manguezais são áreas localizadas nas planícies de inundação das marés, compondo um dos ambientes naturais mais degradados no Brasil. O uso de metodologias que acessam a estrutura e o funcionamento dos grupos microbianos nos manguezais, bem como a descrição dos plasmídeos que hospedam genes relacionados a importantes transformações neste sistema, é importante no avanço do conhecimento sobre este ambiente diverso, encontrado apenas em regiões tropicais e subtropicais de nosso planeta. Este projeto tem como objetivo compreender os mecanismos adaptativos das comunidades microbianas presentes nos solos de manguezais por meio da descrição da composição dos plasmídeos desse sistema. Essas adaptações são vitais para a manutenção e para o funcionamento do sistema.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Raposo Cotta - Integrante / Armando Cavalcante Franco Dias - Coordenador / Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / ANDREOTE, FERNANDO DINI - Integrante.

  • 2013 - 2016

    Ecologia das comunidades microbianas que disponibilizam fósforo na rizosfera de cana de açúcar, Descrição: O fósforo é um dos elementos químicos mais importantes da natureza, sendo essencial para a manutenção da vida, atuando como componente de moléculas energéticas e de estruturais vitais como DNA e o RNA. É um dos nutrientes que mais limitam o crescimento vegetal, pois sua disponibilidade na natureza é bastante reduzida devido ao elevado poder reativo dos íons fosfatos, que quando presentes na solução dos solos, rapidamente se ligam a íons metálicos e as cargas do solo, tornando-se indisponível. Mesmo solos considerados férteis podem apresentar deficiência deste nutriente. Deficiências nos níveis de fósforo podem levar a danos no crescimento vegetal com comprometimento no desenvolvimento de raízes e partes aéreas. Atualmente, a correção dessa deficiência é realizada através da utilização de fertilizantes químicos, sendo essa medida essencial para culturas que possuem uma elevada demanda nutricional, como no caso da cultura de cana-de-açúcar. A utilização maciça de fertilizantes na agricultura vem causando danos irreversíveis à natureza, poluindo aquíferos e lençóis freáticos, e gerando preocupação por se tratar de uma fonte não renovável e finita de fertilidade. Além disso, este uso excessivo diminui a capacidade nutritiva de grande parte dos solos, visto que muitos dos fertilizantes utilizados se acumulam nas partículas de solo, fazendo com que devam ser aplicadas altas doses de fertilizantes para obter o efeito desejado. Uma alternativa que tem sido proposta é o uso de rochas fosfatadas associadas a micro-organismos. Esse uso combinado se deve ao fato de que muitos micro-organismos possuem a capacidade de disponibilizar o fósforo para o consumo das plantas a partir de desta fonte. Apesar da sua importância indiscutível, os processos envolvidos na disponibilização do fósforo, a ecologia das comunidades microbianas envolvidas e os fatores limitantes e essenciais para a renovação do mesmo no ambiente ainda são pouco conhecidos. O desconhecimento desses processos dificulta a aplicação dessas metodologias, além de se não obter o aproveitamento máximo deste recurso. O principal objetivo deste projeto é avaliar a estrutura e a diversidade das comunidades microbianas associadas à rizosfera de cana-de-açúcar e sua participação nos processos de solubilização e mineralização de distintas fontes de fósforo no solo. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Simone Raposo Cotta - Integrante / Seldin, Lucy - Integrante / ANDREOTE, FERNANDO DINI - Coordenador.

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Prêmios

2018

Prêmio Aluno Destaque - SIICUSP, ESALQ/USP.

2013

Melhor trabalho da área de Microbiologia Ambiental, 27 - Congresso Brasileiro de microbiologia.

2013

Melhor trabalho de Iniciação científica do Centro de Ciências da Saúde - UFRJ, Universidade Federal do Rio de Janeiro.

2006

Menção honrosa da XII Semana de Microbiologia e Imunologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro.

2006

Diploma de Dignidade Acadêmica grau Cum Laude, Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Campus Luiz de Queiroz. , Av Pádua Dias, 11 CP 09, Agronomia, 13400970 - Piracicaba, SP - Brasil, Telefone: (19) 34172123

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Experiência profissional

  • 2013 - 2018

    Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz

    Vínculo: Pós doutorado, Enquadramento Funcional: Pós doutoranda, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 12/2013

      Pesquisa e desenvolvimento , Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ESALQ, .,Linhas de pesquisa

  • 2009 - 2013

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Estudante, Enquadramento Funcional: Estudante de Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2007 - 2009

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: estudante de mestrado, Enquadramento Funcional: estudante de mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2005 - 2006

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Estagiário de In. Científica, Enquadramento Funcional: Estagiário de Iniciação Científica, Carga horária: 20

    Outras informações:
    Laboratório de Genética Microbiana

  • 2003 - 2005

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Estagiário de In. Científica, Enquadramento Funcional: Estagiária de Iniciação Científica, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Laboratório de Imunofarmacologia

    Atividades

    • 02/2013

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, .,Linhas de pesquisa

    • 02/2009

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, .,Linhas de pesquisa

    • 03/2009 - 02/2013

      Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes.,Atividade realizada, Estudante de Doutorado.

    • 02/2007 - 02/2009

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, .,Linhas de pesquisa

    • 02/2007 - 12/2008

      Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes.,Atividade realizada, Estudante de Mestrado.

    • 05/2005 - 12/2006

      Estágios , Instituto de Microbiologia Prof. Paulo de Góes, Ccs.,Estágio realizado, Lab. Genética Microbiana Prof. Lucy Seldin.

  • 2013 - 2018

    Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz/ USP

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós doutoranda

    Outras informações:
    Atividades Ensino; Nível: Pós Graduação Disciplinas Ministradas: Fundamentos em Microbiologia

    Atividades

    • 08/2015

      Ensino, Programa de Pós Graduação em Microbiologia Agrícola, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos em Microbiologia

  • 2019 - Atual

    Centro de Energia Nuclear na Agricultura - Universidade de São Paulo

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós doutoranda

    Atividades

    • 01/2019

      Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Energia Nuclear na Agricultura, .,Linhas de pesquisa