João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Rio de Janeiro e doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro. Experiência em análise de dados oriundos de plataformas NGS utilizando técnicas de aprendizado de máquina, incluindo montagem e anotação de genomas e análise de trascriptomas. Também possui experiência nas áreas de modelagem e dinâmica molecular.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)

2008 - 2013

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Modelagem molecular aplicada a genômica estrutural e funcional de espécies de Vibrio no estudo do regulon PHO
Paulo Mascarello Bisch. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Mestrado em Biotecnologia Vegetal

2005 - 2007

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Bioinformática Aplicada no Desenho de Iniciadores para genes funcionais. Estudo de caso: degradação do herbicida 2,4-D.,Ano de Obtenção: 2007
Andrew Macrae.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Bioinformática, Bancos de dados, filogenia; biodegradação; herbicida.

Graduação em Ciências Biológicas: Microbiologia e Imunologia

1999 - 2005

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Avaliação criteriosa das seqüências dos genes rrr, rpoB e gyrB como ferramentas em taxonomia microbiana
Orientador: Andrew Macrae
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

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Formação complementar

2017 - 2017

Single Cell RNAseq Analysis. (Carga horária: 8h). , International Society for Computational Biology, ISCB, Estados Unidos.

2015 - 2015

Introduçãoao OpenMP e ao OpenAcc. (Carga horária: 7h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Modelagem Computacional de Fenômenos Biológicos. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Programação Paralela de Aceleradores em OpenCL. (Carga horária: 5h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2015 - 2015

Programação Paralela em CUDA. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2014 - 2014

RNA-Seq and ChiP-Seq Data Analysis Course. (Carga horária: 40h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2013 - 2013

Genome Sequencer Software Summer School. (Carga horária: 40h). , Produtos Roche Quimicos e Farmaceuticos, PRODUTOS ROCHE, Brasil.

2013 - 2013

Amber Workshop 2013. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal de Pernambuco, UFPE, Brasil.

2012 - 2012

How to set up a high performance computer cluster. (Carga horária: 3h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2010 - 2010

Escola de Modelagem Computacional em Sistemas Biol. (Carga horária: 35h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2010 - 2010

Postgraduate Program of Biophysics Course. (Carga horária: 40h). , Pós Graduação Latino-Americana de Biofísica, POSLATAM, Brasil.

2009 - 2009

II Encontro Acadêmico em Modelagem Computacional. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Monte Carlo para simulação de líquidos. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Python for Bioinformatics. (Carga horária: 4h). , Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, AB3C, Brasil.

2008 - 2008

Predição de Est. de Ptns via Modelagem Comparativa. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Introdução à Dinâmica Molecular. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

MM prop Eletrostáticas de Proteínas e Complexos. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Método LIE para cálculo de Energia Livre.. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Efeito Solvente a Metodologia AGOA. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Cálc. Quânticos SemiEmpíricos de Estr. Eletrônica. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Cálculos Quânticos ab initio de Estrut. Eletrônica. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Predição de Est. de Ptns por Primeiros Princípios. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

First Workshop Proteomics of the New World. (Carga horária: 40h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

IV Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biol. (Carga horária: 40h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Dinâmica Molecular. (Carga horária: 8h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Cálculos Quânticos ab initio. (Carga horária: 4h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Programação em Shell Script. (Carga horária: 15h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Simulando Líquidos Utilizando o Método Monte Carlo. (Carga horária: 4h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Modelagem Comparativa. (Carga horária: 4h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Modelagem Molecular das Propriedades Eletrostática. (Carga horária: 4h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Cálculos Quânticos semi-empíricos. (Carga horária: 4h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

III Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biol. (Carga horária: 40h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2005 - 2005

Extensão universitária em Evolução Molecular. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2005 - 2005

Introdução ao Linux. (Carga horária: 10h). , Loboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2004 - 2004

Biologia Molecular. (Carga horária: 30h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2003 - 2003

Produção de Vacinas. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2002 - 2002

Enzimologia Industrial. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2002 - 2002

Hematopoiese. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

1999 - 1999

Programação em C. (Carga horária: 20h). , Universidade Estácio de Sá, UNESA, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Molecular Modeling.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Bioinformatics.

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Organização de eventos

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Introdução ao Linux e a Bioinformática. 2008. (Outro).

MACRAE, Andrew ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . INTRODUÇÃO AO LINUX E BIOINFORMÁTICA. 2006. (Outro).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Introdução a Bioinformática e a Filogenia. 2005. (Outro).

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Participação em eventos

ISMB/ECCB 2017 - International Society for Computational Biology. 2017. (Congresso).

7th International Conference on Proteomics & Bioinformatics. Whole transcriptome analysis reveals that Zika virus halts cell cycle progression and disrupts neuronal differentiation in human neurospheres. 2016. (Congresso).

V SSCABBA - Simpósio de simulação computacional e avaliação biológica de biomoléculas na amazônia.Vírus zika nas américas: primeiros resultados epidemiológicos e genéticos. 2016. (Simpósio).

XXVI Congresso Brasileiro de Virologia. 2015. (Congresso).

VII Iberoamerican congress of biophysics. 2009. (Congresso).

CEM - Curso de introdução ao linux e a bioinformática.Introdução ao Linux e a Bioinformática. 2008. (Oficina).

IV Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.PREDIÇÃO DE ESTRUTURAS DE PROTEÍNAS VIA MODELAGEM COMPARATIVA. 2008. (Outra).

CEM - Curso de Introdução ao Linux e a Bioinformática.Introdução ao Linux e a Bioinformática. 2006. (Outra).

III Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.III Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2006. (Outra).

CEM - Curso de Introdução à Bioinformática.Professor Auxiliar: Introdução à Bioinformática (Centro de Extensão em Microbiologia). 2005. (Outra).

XIII Congresso Brasileiro de Microbiologia. XIII Congresso Brasileiro de Microbiologia. 2005. (Congresso).

X-meeting - International Conference of the AB3C. 1st Internacional Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, AB3C: X-meeting. 2005. (Congresso).

International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICOBICOBI). ICOBICOBI II (International Conference on Bioinformatics and Computational Biology). 2004. (Congresso).

IX Semana de Microbiologia e Imunologia.Professor Auxiliar - IX Semana de Microbiologia e Imunologia: Introdução à Bioinformática. 2004. (Encontro).

X Semana de Microbiologia e Imunologia.X Semana de Microbiologia e Imunologia. 2004. (Encontro).

IX Semana de MIcrobiologia e Imunologia.IX Semana de Microbiologia e Imunologia. 2003. (Encontro).

VIII Semana de MIcrobiologia e Imunologia.VIII Semana de Microbiologia e Imunologia. 2001. (Encontro).

XXIII Jornada de Iniciação Científica.XXIII Jornada de Iniciação científica. 2001. (Encontro).

VII Semana de Microbiologia e Imunologia.VII Semana de Microbiologia e Imunologia. 2000. (Encontro).

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Participação em bancas

Aluno: Maria Karoliny da Silva Torres

FREITAS, F. B.; FEITOSA, R. N. M.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.. Análise do perfil de resistência aos inibidores de integrase em pessoas vivendo com HIV/AIDS virgens de terapia antirretroviral atendidos em Belém, Pará. 2018. Dissertação (Mestrado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Camila Margalho Braga

CRUZ, A. C. R.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.; CARVALHO, V. L.. Metagenomica viral de mosquitos e animais silvestres provenientes da area do complexo minerador de carajas. 2017. Dissertação (Mestrado em BIOLOGIA PARASITÁRIA NA AMAZÔNIA) - Universidade do Estado do Pará.

Aluno: Ivy Tsuya Essashika Prazeres

CARNEIRO, A. R.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.; CRUZ, A. C. R.. Caracterização genética do Vírus Juruaçá isolado de morcego no Estado do Pará. 2016. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas.

Aluno: Diene Conceição Poiares Aranha

MORAES, L. L. C. S.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.; SAGICA, F. E. S.; SOUSA, M. S.. Ocorrência do VHA 1 e sua relação com os atuais indicadores de contaminação em água destinada ao consumo humano no município de Belém, Pará, Brasil. 2016. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas.

Aluno: Denise Suellén Amorim de Sousa Santos

SOUSA, M. S.;VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G.; RESQUE, H. R.. Detecção molecular e genotipagem do vírus da hepatite A em praias da ilha de mosqueiro, estado do Pará, Brasil. 2015. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas.

Aluno: Kauê Santana da Costa

BRASIL, D. S. B.; SILVA, A. L. C.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.. Análise estrutural do Fator de Infecção Viral e sua interação com as proteínas EloB, EloC e A3G. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Daniel Rios Garza

MORAES, L. L. C. S.; NUNES, M. R. T.; RAMOS, R. T. J.;VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G.. Estudo da relação entre lisogenia e diversificação ecotípica na evolução rápida do Vibrio cholerae. 2014. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas.

Aluno: Daniel Rios Garza

NUNES, M. R.; RAMOS, R. T. J.;VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G.. Estudo da relação entre lisogenia e diversificação ecotípica mediada por fagos na evolução rápida do Vibrio cholerae. 2014. Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas.

Aluno: Poliana da Silva Lemos

NUNES, M. R. T.; MASCARENHAS, B. M.; VASCONCELOS, P. F. C.; RIBEIRO, N. A. B.;VIANEZ-JUNIOR, J. L. D. S. G.. Caracterização citogenética e Molecular de Haemagogus janthinomys Dyar, 1921. 2014. Dissertação (Mestrado em BIOLOGIA PARASITÁRIA NA AMAZÔNIA) - Universidade do Estado do Pará.

Aluno: Anderson Henrique Lima e Lima

BRASIL, D. S. B.; MOLFETTA, F. A.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.. Métodos computacionais aplicados ao estudo de peptídeos inibidores e mecanismos de reações enzimáticas. 2016. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Layanna Freitas de Oliveira

BURBANO, R. M. R.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.; MAIA, M. H. T.; KAYATH, A. S.; LAMARAO, L. M.. Perfil de Expressão de miRNAs Hepáticos regulam Apoptose, Lesões Vasculares e Resposta Imune na Dengue. 2016. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: José Rogério de Araújo Silva

ALVES, C. N.; SILVA, J. L.; CARNEIRO, A. S.;VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G.; SANTOS, L. S.; SILVA, J. K. R.. Estudo computacional da enzima L,D-Transpeptidase 2 de Mycobacterium tuberculosis: Perspectivas para o desenvolvimento de antibóticos. 2015. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Gleiciane Leal Moraes Pinheiro

SILVA, J. L.; ALVES, C. N.; CARNEIRO, A. S.; MOLFETTA, F. A.;VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G.; DEUS, R. J. A.. Modelagem de Proteinas das Bactérias C. pseudotuberculosis e M. Tuberculosis. 2015. Tese (Doutorado em Química) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Janaína Mota de Vasconcelos

SAMPAIO, M. I. C.; MEDEIROS, D. B. A.;VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G.; RODRIGUES, S. G.. Emergência e potencial propagação do Chikungunya virus (CHIKV) no Brasil. 2015. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Juliana das Merces Hernandez

MACHADO, L. F. A.; SIQUEIRA, J. A. M.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.. Evolução molecular dos genes da polimerase e capsídeo de variantes de GII.4 de norovírus em estados da amazônia brasileira. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Jakelyne Machado Lima Silva

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.GONCALVES, E. C.; SANTOS, A. S.; COUTO, D. C. C.. Análise genômica do fungo Penicillium sp.: minerando enzimas de interesse biotecnológico. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em BIOTECNOLOGIA) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Alex Ranieri Jerônimo Lima

GONCALVES, E. C.VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G.; SILVA, J. L.. Potencial biotecnológico de cianobactérias amazônicas na produção de hidrocarbonetos - da montagem de genomas a modelagem molecular comparativa. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Amanda Araújo Serrão de Andrade

PONTES, T. B.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.. Perfil de expressao de isoformas e novos micrornas hepaticos na dengue hemorragica. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Faculdades Integradas Brasil Amazônia.

Aluno: Geovani de Oliveira Ribeiro

MORAIS, L. L. C. S.; RAMOS, R. T. J.;VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G.. Filogenômica aplicada na epidemiologia do Vibrio cholerae. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: JOÃO AUGUSTO PEREIRA DA ROCHA

ALVES, C. N.; MOLFETTA, F. A.;VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G.. MODELGAGEM MOLECULAR POR HOMOLOGIA DA ENZIMA DIIDROOROTATO DESIDROGENASE DA LEISHMANIA MAJOR E APLICAÇÃO DE TÉCNICAS DE DOCAGEM E DINÂMICA MOLECULAR. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Universidade Federal do Pará.

Aluno: Davi Toshio Inada

RAMOS, R. T. J.;Vianez-Júnior, João Lídio S.G.. MONTAGEM GENÔMICA DE QUATRO NOVOS VÍRUS SEQUENCIADOS POR PIROSEQUENCIAMENTO, ATRAVÉS DA UTILIZAÇÃO DE UMA ABORDAGEM DE NOVO. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará.

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Comissão julgadora das bancas

Fabiano Lopes Thompson

THOMPSON, F. L.; ROSADO, A. S.; MOTTA, F. F.. Bioinformática Aplicada no Desenho de Iniciadores para genes funcionais. Estudo de caso: degradação do herbicida 2,4-D. 2007. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Ronaldo da Silva Mohana Borges

P. G. Pascutti; C.C. Thompson; A. Macrae;BORGES, R.S.M.. Modelagem Molecular Aplicada a Genômica Estrutural e Funcional de Espécies de Vibrio: Estudo do Regulon PHO. 2013. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas - Fisiologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Fabio Faria da Mota

da Mota, F.F.ROSADO, Alexandre Soares; Thompson, Fabiano Lopes. Aplicação da Bioinformática no Desenho de Iniciadores para PCR. Estudo de Caso: Via TFD de Degradação do Herbicida 2,4-D. 2007. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Cristiane Carneiro Thompson

COELHO, A. M. A.;Thompson C. C.. Anotação e modelagem comparativa de membros do regulon pho em espécies do gênero Vibrio.. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

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Orientou

Jeisianny Drienny Dias da Costa

ANÁLISE DO PERFIL DE EXPRESSÃO GÊNICA DE CÉLULAS ÚNICAS NA INVESTIGAÇÃO DA RESPOSTA DA INFECÇÃO PELO VÍRUS ZIKA EM CÉREBRO DE FETOS DE CAMUNDONGOS; ; Início: 2017; Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Rafael Souza

Estudo computacional de peptídeos antivirais: desenvolvimento de peptídeos capazes de inibir o processo replicação do Vírus da Hepatite C; ; Início: 2016; Dissertação (Mestrado em EPIDEMIOLOGIA E VIGILÂNCIA EM SAÚDE) - Instituto Evandro Chagas; (Orientador);

ANA PAULA FERNANDES FIGUEIREDO VIDAL

MICROVIRINA E MICROVIRINA MODIFICADA: ESTUDO DO POTENCIAL ANTIVIRAL SOBRE O ZIKA VÍRUS; Início: 2016; Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Gabriela de Medeiros Muniz

ALTERAÇÕES CONFORMACIONAIS DA PROTEINA DE ENVELOPE DE FLAVIVIRUS MEDIADAS POR TEMPERATURA; Início: 2018; Tese (Doutorado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas; (Orientador);

Alessandra Pereira da Silva

SIMULAÇÃO COMPUTACIONAL DOS DERIVADOS DE LIGNANAS COMO POTENCIAIS INIBIDORES DE SERINO PROTEASE DO VÍRUS DA HEPATITE C; Início: 2017; Tese (Doutorado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Eduardo Lana

lterações no perfil proteico de células de carcinoma hepatocelular humano HepG2 experimentalmente infectados com Vírus da Febre Amarela, Cepa H111 (Flaviviridae: Flavivirus); Início: 2014; Tese (Doutorado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Gabriela de Medeiros Muniz

INFLUÊNCIA DA TEMPERATURA NA MUDANÇA CONFORMACIONAL DA PROTEÍNA E DO VÍRUS ZIKA E SUAS CONSEQUÊNCIAS NA INFECTIVIDADE VIRAL; 2017; Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Carolina Koury Nassar Amorim

Análise do transcriptoma de células de neuroblastoma e glioblastoma humanos infectadas in vitro por vírus Zika (ZIKV) e Herpes Simples (HSV); ; 2016; Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas,; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Poliana da Silva Lemos

CARACTERIZAÇÃO CITOGENÉTICA E MOLECULAR DE Haemagogus janthinomys, Dyar, 1921 (DIPTERA: CULICIDAE); 2014; Dissertação (Mestrado em BIOLOGIA PARASITÁRIA NA AMAZÔNIA) - Universidade do Estado do Pará,; Coorientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Anderson Franco da Cruz Lima

CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA E EVOLUÇÃO DO VÍRUS TVP 19261 ISOLADO EM IQUITOS, PERU; 2014; Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas,; Coorientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Diego Reymão Moreira

ANÁLISE DE VIROMAS EM DIFERENTES ESPÉCIES DE PRIMATAS NÃO HUMANOS MANTIDOS EM CATIVEIRO NO CENTRO NACIONAL DE PRIMATAS, ANANINDEUA, PARÁ; ; 2014; Dissertação (Mestrado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas,; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Bruna Laís Sena do Nascimento

Caracterização Genética de Dois Arbovírus Não Grupados Isolados na Amazônia Brasileira Entre os Anos de 1999 e 2000; 2014; Dissertação (Mestrado em BIOLOGIA PARASITÁRIA NA AMAZÔNIA) - Universidade do Estado do Pará, Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa; Coorientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Andrei Santos Siqueira

CARACTERIZAÇÃO IN SILICO DA RIBULOSE-1,5-BIFOSFATO CARBOXILASE/OXIGENASE DE Cyanobium sp; CACIAM 14 (CYANOBACTERIA); 2014; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Pará,; Coorientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

JOÃO AUGUSTO PEREIRA DA ROCHA

Docagem molecular e cálculos de energia livre de neolignanas com possível atividade inibitória na enzima diidroorotato desidrogenase da Leishmania Major; 2014; Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Clayton Pereira Silva de Lima

Diagnóstico da Dengue utilizando microarranjos de DNA (BIOCHIPS); 2016; Tese (Doutorado em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários) - Universidade Federal do Pará, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Jorge Fernado Soares Travassos da Rosa

SEQUENCIAMENTO COMPLETO, CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR E ANÁLISE FILOGEOGRÁFICA DE CEPAS DO VÍRUS OROPOUCHE ( Bunyaviridae, Orthobunyavirus) ISOLADAS NAS AMÉRICAS; 2014; Tese (Doutorado em Virologia) - Instituto Evandro Chagas,; Coorientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Renan Patrick da Penha Valente

Efeitos da mutação T198F na estabilidade da proteína de envelope do vírus West Nile; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Química) - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Pará, Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Rafael Souza

Desenvolvimento de Potenciais Inibidores de Fusão do HIV: Estudo Computacional da Interação de Mutantes da Lectina Microvirina com Açúcares da Glicoproteína GP120, utilizando Cálculos de Energia Livre MM-PBSA e MM-GBSA; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Faculdades Integradas Brasil Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Jeisianny Drienny Dias da Costa

PREDIÇÃO DA FLUTUAÇÃO DO NÚMERO DE CASOS DE FEBRE CHIKUNGUNYA EM FEIRA DE SANTANA ? BAHIA, UTILIZANDO TÉCNICAS DE APRENDIZADO DE MÁQUINA; ; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Escola Superior da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Rafael Conceição de Souza

Desenvolvimento de Potenciais Inibidores de Fusão do HIV: Estudo Computacional da Interação de Mutantes da Lectina Microvirina com Açúcares da Glicoproteína GP120, utilizando Cálculos de Energia Livre MM-PBSA e MM-GBSA; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Faculdades Integradas Brasil Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Jeissiany Drienny Dias da Costa

Predição do risco de importação de agentes virais utilizando técnicas de aprendizado de máquina; Estudo de caso: Virus Chikungunya; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Escola Superior da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Jeissiany Drienny Dias da Costa

Uso de placas de programação de baixo custo para obtenção de genomas utilizando dados oriundos de sequenciadores de nova geração; Estudo de caso: monitoramento do vírus da dengue no Brasil; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Escola Superior da Amazônia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Jade Aieska das Chagas Brabo

DESENVOLVIMENTO DE POTENCIAIS INIBIDORES DE FUSÃO DO HIV: ESTUDO COMPUTACIONAL DA INTERAÇÃO DA LECTINA MICROVIRINA COM A GLICOPROTEÍNA GP120; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Alex Ranieri Jerônimo Lima

laboração de um pipeline para montagem de genomas virais e bacterianos utilizando dados oriundos de sequenciadores de nova geração; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

Alex Ranieri Jerônimo Lima

DESENVOLVIMENTO DE ESTRATÉGIAS DE MONTAGEM PARA NOVOS GENOMAS DO GÊNERO ORTHOBUNYAVIRUS UTILIZANDO DADOS OBTIDOS POR PIROSSEQUENCIAMENTO; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Pará, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior;

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Foi orientado por

Paulo Mascarello Bisch

Modelagem Molecular Aplicada a Genômica Estrutural e Funcional de Espécies de Vibrio: Estudo do Regulon PHO; ; 2013; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Paulo Mascarello Bisch;

Andrew Macrae

Avaliação criteriosa dos genmes rrn, rpoB e gyrB como ferramenta em taxonima microbiana; 2005; 69 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Microbiologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Andrew Macrae;

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Produções bibliográficas

  • BARATA, RAFAEL R. ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. ; NUNES, MÁRCIO R. T. . Transcriptomic Analysis of Mucor irregularis Containing a Negative Single-Stranded RNA Mycovirus. Microbiology Resource Announcements , v. 8, p. 1-2, 2019.

  • SCERNI MACHADO, R. ; LIMA FERREIRA, J. ; SANTOS ALVES, J. C. ; SILVA BANDEIRA, R. ; SILVA LEMOS, P. ; CHAVES FRANCO FILHO, L. ; FERREIRA CARDOSO, J. ; SILVA GONÇALVES VIANEZ-JUNIOR, J. L. ; NETO TAVARES, F. . Nearly Complete Genome Sequences of Enterovirus 96 and Enterovirus 99 Strains Isolated in the Northern Region of Brazil. Microbiology Resource Announcements , v. 8, p. 1, 2019.

  • TORRES, MARIA K.S. ; AVELINO, MARIA E.S. ; IRIAS, SUSAN D.F. ; SANTOS, MIKE B. ; PEREIRA, DANILO L.A. ; LIMA, ANA BEATRIZ FIGUEIREDO ; LEMOS, POLIANA SILVA ; LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA ; OLIVEIRA, RENATO RENISON MOREIRA ; FRANCÊS, REGIANE SILVA KAWASAKI ; VIANEZ JR, JOÃO LÍDIO DA SILVA CONÇALVES ; MACHADO, LUIZ FERNANDO ALMEIDA . Low prevalence of HIV-1 integrase resistance among antiretroviral-naive patients newly diagnosed with HIV-1 from Belém, Pará, Amazon Region of Brazil. AIDS Research and Human Retroviruses , v. 1, p. 1, 2019.

  • DE MELO, ARISTIDES BEZERRA ; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL ; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI ; CARVALHO, VALÉRIA LIMA ; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI ; TOLARDO, ALINE LAVADO ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; CARDOSO, JEDSON FERREIRA ; DE OLIVEIRA CHIANG, JANNIFER ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ, JOÃO LÍDIO ; DO SOCORRO DA SILVA AZEVEDO, RAIMUNDA ; FIGUEIREDO, LUIZ TADEU MORAES ; DA COSTA VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; DE ALMEIDA MEDEIROS, DANIELE BARBOSA . Genomic characterization and evolution of Tacaiuma orthobunyavirus ( Peribunyaviridae family) isolated in Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 1, p. 1, 2018.

  • WATANABE, LUCIANA ; GOMES, FÁTIMA ; VIANEZ, JOÃO ; NUNES, MÁRCIO ; CARDOSO, JEDSON ; LIMA, CLAYTON ; SCHNEIDER, HORACIO ; SAMPAIO, IRACILDA . De novo transcriptome based on next-generation sequencing reveals candidate genes with sex-specific expression in Arapaima gigas (Schinz, 1822), an ancient Amazonian freshwater fish. PLoS One , v. 13, p. e0206379, 2018.

  • SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; AGUIAR, DELIA CRISTINA FIGUEIRA ; SANTOS, ALBERDAN SILVA ; VIANEZ JÚNIOR, JOÃO LÍDIO DA SILVA GONÇALVES ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . Genomic screening of new putative antiviral lectins from Amazonian cyanobacteria based on a bioinformatics approach. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS , v. 1, p. 1, 2018.

  • LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; VASCONCELOS, JANAINA MOTA DE ; PEREIRA, JAMES SIQUEIRA ; AZEVEDO, JULIANA SIMÃO NINA DE ; MORAES, PABLO HENRIQUE GONÇALVES ; AGUIAR, DÉLIA CRISTINA FIGUEIRA ; DE LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO LÍDIO SILVA GONÇALVES ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; XAVIER, LUCIANA PEREIRA ; DALL?AGNOL, LEONARDO TEIXEIRA ; GONCALVES, EVONNILDO COSTA . Insights Into Limnothrix sp. Metabolism Based on Comparative Genomics. Frontiers in Microbiology , v. 9, p. 1-1, 2018.

  • GARCEZ, PATRICIA P. ; NASCIMENTO, JULIANA MINARDI ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; MADEIRO DA COSTA, RODRIGO ; DELVECCHIO, RODRIGO ; TRINDADE, PABLO ; LOIOLA, ERICK CORREIA ; HIGA, LUIZA M. ; CASSOLI, JULIANA S. ; VITÓRIA, GABRIELA ; SEQUEIRA, PATRICIA C. ; SOCHACKI, JAROSLAW ; AGUIAR, RENATO S. ; FUZII, HELLEN THAIS ; DE FILIPPIS, ANA M. BISPO ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ JÚNIOR, JOÃO LÍDIO ; TANURI, AMILCAR ; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL ; REHEN, STEVENS K. . Zika virus disrupts molecular fingerprinting of human neurospheres. Scientific Reports , v. 7, p. 40780, 2017.

  • GOMES, FÁTIMA ; WATANABE, LUCIANA ; NOZAWA, SÉRGIO ; OLIVEIRA, LAYANNA ; CARDOSO, JEDSON ; VIANEZ, JOÃO ; NUNES, MÁRCIO ; SCHNEIDER, HORACIO ; SAMPAIO, IRACILDA . Identification and characterization of the expression profile of the microRNAs in the Amazon species Colossoma macropomum by next generation sequencing. GENOMICS , v. 1, p. 1-1, 2017.

  • SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; JER?NIMO LIMA, ALEX RANIERI ; CONCEI??O DE SOUZA, RAFAEL ; SANTOS, ALBERDAN SILVA ; L?DIO DA SILVA GON?ALVES VIANEZ J?NIOR, JO?O ; GON?ALVES, EVONNILDO COSTA . Anti-dengue virus activity of scytovirin and evaluation of point mutation effects by molecular dynamics and binding free energy calculations. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS , v. 1, p. 1, 2017.

  • SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; DE SOUZA, RAFAEL CONCEIÇÃO ; SANTOS, ALBERDAN SILVA ; VIANEZ JÚNIOR, JOÃO LÍDIO DA SILVA GONÇALVES ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . In silico analysis of the cyanobacterial lectin scytovirin: new insights into binding properties. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS , v. 1, p. 1, 2017.

  • WANZELLER, A. L. ; NUNES, M. R. T. ; TAVARES, F. ; PINTO, W. ; JUNIOR, E. ; LIMA, C. ; OLIVEIRA, L. ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. ; CARDOSO, J. F. ; VASCONCELOS, P. F. . Inhangapi Virus: Genome Sequencing of a Brazilian Ungrouped Rhabdovirus Isolated in the Amazon Region. Genome Announcements , v. 4, p. e01525-15, 2016.

  • SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; DALL?AGNOL, LEONARDO TEIXEIRA ; DE AZEVEDO, JULIANA SIMÃO NINA ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ, JOÃO LÍDIO ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . Comparative modeling and molecular dynamics suggest high carboxylase activity of the Cyanobium sp. CACIAM14 RbcL protein. Journal of Molecular Modeling (Print) , v. 22, p. 1, 2016.

  • FARIA, N. R. AZEVEDO, R. D. S. D. S. KRAEMER, M. U. G. SOUZA, R. CUNHA, M. S. HILL, S. C. THEZE, J. BONSALL, M. B. BOWDEN, T. A. RISSANEN, I. ROCCO, I. M. NOGUEIRA, J. S. MAEDA, A. Y. VASAMI, F. G. D. S. MACEDO, F. L. D. L. SUZUKI, A. RODRIGUES, S. G. CRUZ, A. C. R. NUNES, B. T. MEDEIROS, D. B. D. A. RODRIGUES, D. S. G. NUNES QUEIROZ, A. L. SILVA, E. V. P. D. HENRIQUES, D. F. TRAVASSOS DA ROSA, E. S. , et al. DE OLIVEIRA, C. S. MARTINS, L. C. VASCONCELOS, H. B. CASSEB, L. M. N. SIMITH, D. D. B. MESSINA, J. P. ABADE, L. LOURENCO, J. ALCANTARA, L. C. J. LIMA, M. M. D. GIOVANETTI, M. HAY, S. I. DE OLIVEIRA, R. S. LEMOS, P. D. S. OLIVEIRA, L. F. D. DE LIMA, C. P. S. DA SILVA, S. P. VASCONCELOS, J. M. D. FRANCO, L. CARDOSO, J. F. VIANEZ-JUNIOR, J. L. D. S. G. MIR, D. BELLO, G. DELATORRE, E. KHAN, K. CREATORE, M. COELHO, G. E. DE OLIVEIRA, W. K. TESH, R. PYBUS, O. G. NUNES, M. R. T. VASCONCELOS, P. F. C. ; Zika virus in the Americas: Early epidemiological and genetic findings. Science (New York, N.Y.: Online) , v. 1, p. 1-9, 2016.

  • GIOVANETTI, MARTA ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; NUNES, MARCIO ROBERTO TEIXEIRA ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; LOURENÇO, JOSÉ ; RODRIGUES, SUELI GUERREIRO ; VIANEZ, JOAO LIDIO ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; LEMOS, POLIANA SILVA ; TAVARES, FERNANDO NETO ; MARTIN, DARREN PATRICK ; DO ROSÁRIO, MATEUS SANTANA ; SIQUEIRA, ISADORA CRISTINA ; CICCOZZI, MASSIMO ; PYBUS, OLIVER G. ; DE OLIVEIRA, TULIO ; ALCANTARA, LUIZ CARLOS . Zika virus complete genome from Salvador, Bahia, Brazil. Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 41, p. 142-145, 2016.

  • DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL ; ACRANI, GUSTAVO OLSZANSKI ; ROMEIRO, MARILIA FARIGNOLI ; JÚNIOR, OSVALDO REIS ; TOLARDO, ALINE LAVADO ; DE ANDRADE, AMANDA ARAÚJO SERRÃO ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ JÚNIOR, JOÃO LÍDIO ; DE ALMEIDA MEDEIROS, DANIELE BARBOSA ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; FIGUEIREDO, LUIZ TADEU MORAES . Complete genome sequence of Piry vesiculovirus. Archives of Virology , v. 1, p. 1, 2016.

  • OLIVEIRA, K.G. ; SANTOS, R.R. ; LEÃO, D.L. ; QUEIROZ, H.L. ; PAIM, F.P. ; VIANEZ-JÚNIOR, J.L.S.G. ; DOMINGUES, S.F.S. . Testicular biometry and semen characteristics in captive and wild squirrel monkey species (Saimiri sp.)'. Theriogenology , v. 86, p. 879-887, 2016.

  • DA SILVA, FÁBIO DANIEL FLORÊNCIO ; LIMA, ALEX RANIERI JERÔNIMO ; MORAES, PABLO HENRIQUE GONÇALVES ; SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; DALL?AGNOL, LEONARDO TEIXEIRA ; BARAÚNA, ANNA RAFAELLA FERREIRA ; MARTINS, LUISA CARÍCIO ; OLIVEIRA, KAROL GUIMARÃES ; DE LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO LÍDIO SILVA GONÇALVES ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA . Draft Genome Sequence of sp. Strain CACIAM 66H1, a Heterotrophic Bacterium Associated with Cyanobacteria. Genome Announcements , v. 4, p. e00399-16, 2016.

  • SILVESTRE, RODRIGO VELLASCO DUARTE ; DE SOUZA, ALEX JUNIOR SOUZA ; JÚNIOR, EDIVALDO COSTA SOUSA ; SILVA, ALLAN KAIO ; DE MELLO, WYLLER ALENCAR ; NUNES, MARCIO ROBERTO T. ; JÚNIOR, JOÃO LÍDIO S. G. V. ; CARDOSO, JEDSON FERREIRA ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; DE OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; DA SILVA, ADRIANA MARQUES J. ; FRIES, BRIGIDA GOMES ; SUMMA, MARIA EUGÊNIA L. ; DE SÁ, LILIAN ROSE M. . First New World Primate Papillomavirus Identification in the Atlantic Forest, Brazil:. Genome Announcements , v. 4, p. e00725-16, 2016.

  • CONCEIÇÃO DE SOUZA, RAFAEL ; DE MEDEIROS MUNIZ, GABRIELA ; SIQUEIRA, ANDREI SANTOS ; DE MELO LIMA, ADONIS ; DA SILVA, ALESSANDRA PEREIRA ; GONÇALVES, EVONNILDO COSTA ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ JÚNIOR, JOÃO LÍDIO . Investigating the effects of point mutations on the affinity between the cyanobacterial lectin microvirin and high mannose-type glycans present on the HIV envelope glycoprotein. Journal of Molecular Modeling (Print) , v. 22, p. 269, 2016.

  • NAVARRO, J.-C. ; GIAMBALVO, D. ; HERNANDEZ, R. ; AUGUSTE, A. J. ; TESH, R. B. ; WEAVER, S. C. ; MONTANEZ, H. ; LIRIA, J. ; LIMA, A. ; TRAVASSOS DA ROSA, J. F. S. ; DA SILVA, S. P. ; VASCONCELOS, J. M. ; OLIVEIRA, R. ; VIANEZ, J. L. S. G. ; NUNES, M. R. T. . Isolation of Madre de Dios Virus (Orthobunyavirus; Bunyaviridae), an Oropouche Virus Species Reassortant, from a Monkey in Venezuela. The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene , v. 1, p. 1, 2016.

  • NUNES, MÁRCIO R. T. ; SILVA, SANDRO P. ; CARVALHO, VALÉRIA L. ; VASCONCELOS, JANAINA M. ; DA SILVA, DAISY E. A. ; OLIVEIRA, LAYANNA F. ; NUNES NETO, JOAQUIM P. ; RODRIGUES, SUELI G. ; AZEVEDO, RAIMUNDA S. S. ; MONTEIRO, HAMILTON A. O. ; CARDOSO, JEDSON F. ; GUZMAN, HILDA ; TESH, ROBERT ; VASCONCELOS, PEDRO F. C. ; VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. ; MARTINS, LÍVIA C. . Emergence of New Insect-Restrictive Viruses in the Amazon Region. Genome Announcements , v. 3, p. e00131-15, 2015.

  • NUNES, MARCIO ROBERTO TEIXEIRA ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; GOLDING, NICK ; KRAEMER, MORITZ UG ; DE OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS ; AZEVEDO, RAIMUNDA DO SOCORRO DA SILVA ; DA SILVA, DAISY ELAINE ANDRADE ; DA SILVA, ELIANA VIEIRA PINTO ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; DE CARVALHO, VALÉRIA LIMA ; COELHO, GIOVANINI EVELIN ; CRUZ, ANA CECÍLIA RIBEIRO ; RODRIGUES, SUELI GUERREIRO ; DA SILVA GONÇALVES VIANEZ, JOAO LÍDIO ; NUNES, BRUNO TARDELLI DINIZ ; CARDOSO, JEDSON FERREIRA ; TESH, ROBERT B ; HAY, SIMON I ; PYBUS, OLIVER G ; DA COSTA VASCONCELOS, PEDRO FERNANDO . Emergence and potential for spread of Chikungunya virus in Brazil. BMC Medicine , v. 13, p. 102, 2015.

  • NUNES, MARCIO R.T. ; VIANEZ, JOÃO LÍDIO ; NUNES, KELEY N.B. ; DA SILVA, SANDRO PATROCA ; LIMA, CLAYTON P.S. ; GUZMAN, HILDA ; MARTINS, LÍVIA C. ; CARVALHO, VALÉRIA L. ; TESH, ROBERT B. ; VASCONCELOS, PEDRO F.C. . Analysis of a Reverse Transcription Loop-mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) for Yellow fever diagnostic. Journal of Virological Methods , v. 1, p. 1, 2015.

  • LEMOS, POLIANA DA SILVA ; MONTEIRO, HAMILTON ANTÔNIO DE OLIVEIRA ; CASTRO, FRANCISCO CORRÊA ; LIMA, CLAYTON PEREIRA SILVA DE ; SILVA, DAISY ELAINE ANDRADE DA ; VASCONCELOS, JANAÍNA MOTA DE ; OLIVEIRA, LAYANNA FREITAS DE ; SILVA, SANDRO PATROCA DA ; CARDOSO, JEDSON FERREIRA ; VIANEZ JÚNIOR, JOÃO LÍDIO DA SILVA GONÇALVES ; NUNES, MÁRCIO ROBERTO TEIXEIRA . Characterization of mitochondrial genome of (Diptera: Culicidae). Mitochondrial DNA , v. 1, p. 1-2, 2015.

  • RIBEIRO, JOSÉ M. C. GENTA, FERNANDO A. SORGINE, MARCOS H. F. LOGULLO, RAQUEL MESQUITA, RAFAEL D. PAIVA-SILVA, GABRIELA O. MAJEROWICZ, DAVID MEDEIROS, MARCELO KOERICH, LEONARDO TERRA, WALTER R. FERREIRA, CLÉLIA PIMENTEL, ANDRÉ C. BISCH, PAULO M. LEITE, DANIEL C. DINIZ, MICHELLE M. P. JUNIOR, JOÃO LÍDIO DA S. G. V. DA SILVA, MANUELA L. ARAUJO, RICARDO N. GANDARA, ANA CAROLINE P. BROSSON, SÉBASTIEN SALMON, DIDIER BOUSBATA, SABRINA GONZÁLEZ-CABALLERO, NATALIA SILBER, ARIEL MARIANO ALVES-BEZERRA, MICHELE , et al. GONDIM, KATIA C. SILVA-NETO, MÁRIO ALBERTO C. ATELLA, GEORGIA C. ARAUJO, HELENA DIAS, FELIPE A. POLYCARPO, CARLA VIONETTE-AMARAL, RAQUEL J. FAMPA, PATRÍCIA MELO, ANA CLAUDIA A. TANAKA, APARECIDA S. BALCZUN, CARSTEN OLIVEIRA, JOSÉ HENRIQUE M. GONÇALVES, RENATA L. S. LAZOSKI, CRISTIANO RIVERA-POMAR, ROLANDO DIAMBRA, LUIS SCHAUB, GÜNTER A. GARCIA, ELÓI S. AZAMBUJA, PATRÍCIA BRAZ, GLÓRIA R. C. OLIVEIRA, PEDRO L. ; An Insight into the Transcriptome of the Digestive Tract of the Bloodsucking Bug, Rhodnius prolixus. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online) , v. 8, p. e2594, 2014.

  • LIMA, A. R. J. ; SIQUEIRA, A. S. ; DOS SANTOS, B. G. S. ; DA SILVA, F. D. F. ; LIMA, C. P. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G. ; NUNES, M. R. T. ; GONCALVES, E. C. . Draft Genome Sequence of Blastomonas sp. Strain CACIA 14H2, a Heterotrophic Bacterium Associated with Cyanobacteria. Genome Announcements , v. 2, p. e01200-13-e01200-13, 2014.

  • LIMA, A. R. J. ; SIQUEIRA, A. S. ; DOS SANTOS, B. G. S. ; DA SILVA, F. D. F. ; INADA, D. T. ; LIMA, C. P. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ-JUNIOR, J. L. S. G. ; NUNES, M. R. T. ; GONCALVES, E. C. . Draft Genome Sequence of Rhodobacter sp. Strain CACIA 14H1, a Heterotrophic Bacterium Obtained from a Nonaxenic Culture of a Cyanobium Species. Genome Announcements , v. 2, p. e01116-13-e01116-13, 2014.

  • WANZELLER, A. L. M. ; MARTINS, L. C. ; DINIZ JUNIOR, J. A. P. ; DE ALMEIDA MEDEIROS, D. B. ; CARDOSO, J. F. ; DA SILVA, D. E. A. ; DE OLIVEIRA, L. F. ; DE VASCONCELOS, J. M. ; NUNES, M. R. T. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Xiburema Virus, a Hitherto Undescribed Virus within the Family Rhabdoviridae Isolated in the Brazilian Amazon Region. Genome Announcements , v. 2, p. e00454-14-e00454-14, 2014.

  • SILVA, S. P. ; DILCHER, M. ; WEBER, F. ; HUFERT, F. T. ; WEIDMANN, M. ; CARDOSO, J. F. ; CARVALHO, V. L. ; CHIANG, J. O. ; MARTINS, L. C. ; LIMA, C. P. ; SILVA, D. E. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; POPOV, V. L. ; ROSA, A. P. T. ; TESH, R. B. ; VASCONCELOS, P. F. ; NUNES, M. R. . Genetic and biological characterization of selected Changuinola viruses (Reoviridae, Orbivirus) from Brazil. Journal of General Virology (Print) , v. 1, p. 35-39, 2014.

  • LIMA, A. R. J. ; SIQUEIRA, A. S. ; DOS SANTOS, B. G. S. ; DA SILVA, F. D. F. ; LIMA, C. P. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; DALL'AGNOL, L. T. ; MCCULLOCH, J. A. ; NUNES, M. R. T. ; GONCALVES, E. C. . Draft Genome Sequence of the Brazilian Cyanobium sp. Strain CACIAM 14. Genome Announcements , v. 2, p. e00669-14-e00669-14, 2014.

  • RODRIGUES, D. S. G. ; MEDEIROS, D. B. D. A. ; RODRIGUES, S. G. ; MARTINS, L. C. ; DE LIMA, C. P. S. ; DE OLIVEIRA, L. F. ; DE VASCONCELOS, J. M. ; DA SILVA, D. E. ; CARDOSO, J. F. ; DA SILVA, S. P. ; VIANEZ-JUNIOR, J. L. D. S. G. ; NUNES, M. R. T. ; VASCONCELOS, P. F. D. C. . Pacui Virus, Rio Preto da Eva Virus, and Tapirape Virus, Three Distinct Viruses within the Family Bunyaviridae. Genome Announcements , v. 2, p. e00923-14-e00923-14, 2014.

  • MEDEIROS, D. B. D. A. ; DINIZ JUNIOR, J. A. P. ; CARDOSO, J. F. ; SILVA, S. P. ; DA SILVA, D. E. A. ; DE OLIVEIRA, L. F. ; E VASCONCELOS, J. M. ; CHIANG, J. O. ; DIAS, A. A. ; NUNES, M. R. T. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. D. S. G. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Nearly Complete Genome Sequence of Curionopolis Virus, a Culicoides-Related Rhabdovirus Isolated in the Brazilian Amazon Region. Genome Announcements , v. 2, p. e01158-14-e01158-14, 2014.

  • Maranhão, Adriana Gonçalves ; Vianez-Júnior, João Lídio S.G. ; Benati, Fabrício José ; Bisch, Paulo Mascarello ; Santos, Norma . Polymorphism of Rotavirus Genotype G1 in Brazil: in silico analysis of variant strains circulating in Rio de Janeiro from 1996 to 2004. Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 12, p. 1397-1404, 2012.

  • Andrade, I. S. ; Vianez, J. L. ; Goulart, C. L. ; Homble, F. ; Ruysschaert, J.-M. ; von Kruger, W. M. A. ; BISCH, P. M. ; De Souza, W. ; Mohana-Borges, R. ; MOTTA, M. C. M. . Characterization of a porin channel in the endosymbiont of the trypanosomatid protozoan Crithidia deanei. Microbiology (Reading. Print) , v. epub, p. epub-epub, 2011.

  • Capaci Rodrigues, Giseli ; Palermo Aguiar, Alcino ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew ; Cristina Nogueira de Melo, Ana ; Beatriz Vermelho, Alane . Peptidase Inhibitors as a Possible Therapeutic Strategy for Chagas Disease. Current Enzyme Inhibition , v. 6, p. 183-194, 2010.

  • Carolina L. Goulart ; Letícia M.S. Lery ; Michelle M.P. Diniz ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; Ana Gisele C. Neves-Ferreira ; Jonas Perales ; Paulo M. Bisch ; Wanda M.A. von Krüger . Molecular analysis of VCA1008: a putative phosphoporin of. FEMS Microbiology Letters , v. 298, p. 241-248, 2009.

  • ROCHA, J. A. P. ; ALENCAR, N.A.N ; PINHEIRO, A. S ; SILVA, K. A. ; Vianez-Júnior, João Lídio S.G. ; ALVES, C. N. ; MOLFETTA, F. A. . Estudo de Homologia e Docagem de inibidores da enzima Diidroorotato Desidrogenase da Leishmania major. In: VI Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biólogicos, 2012, Petrópolis-RJ. Anais VI Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biólogicos, 2012.

  • COSTA, R. A ; ROCHA, J. A. P. ; PINHEIRO, A. S ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; ALVES, C. N. ; MOLFETTA, F. A. . Theorical Study of the Dihydroorotate Dehydrogenase enzyme from Leishmania major. In: XXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012, Natal-RN. XXVIII Congress of Theoretical Chemists of Latin Expression, 2012,, 2012.

  • SILVA, D. E. A. ; INADA, D. T. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; CARDOSO, J. F. ; LIMA, C. P. S. ; SOUSA JUNIOR, E. C. ; NUNES, K. N. B. ; NUNES, M. R. T. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Full-Lenght genome determination of Bimiti virus using the pyrosequencing method. In: XXIII Congresso Brasileiro de Virologia - VII Encontro de Virologia do Mercosul, 2012, Foz do Iguaçu. Anais do XXIII Congresso Brasileiro de Virologia - VII Encontro de Virologia do Mercosul, 2012.

  • OLIVEIRA, R. S. ; CHAPARRO, P. J. P. ; BARATA, R. R. ; LIMA, C. P. S. ; CARDOSO, J. F. ; RAIOL, R. P. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; ROGEZ, H. L ; GONCALVES, E. C. ; SANTOS, A. S ; NUNES, M. R. T. ; MCCULLOCH, J. A. . PIROSSEQUENCIAMENTO DO DNA TOTAL OBTIDO DO MICROCOSMO DA MICROBIOTA ENDOFÍTICA DE FRUTOS DE ELAEIS GUINEENSIS JACQ, REVELA RICA FONTE DE BIOCATALIZADORES. In: XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia (XXI ALAM), 2012, Santos - SP. Anais do XXI Congresso Latinoamericano de Microbiologia (XXI ALAM), 2012.

  • SOUSA JUNIOR, E. C. ; CARDOSO, J. F. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; Oliveira, R. L. S. ; INADA, D. T. ; LIMA, C. P. S. ; FRANCO, E. C. S. ; SILVA, F. R. ; NUNES, K. N. B. ; NUNES, M. R. T. ; VASCONCELOS, P. F. C. . Sequencing and modeling of the envelope protein of a yellow fever virus strain (BEAR378600) isolated in the brazilian amazon. In: XXIII Congresso Brasileiro de Virologia - VII Encontro de Virologia do Mercosul, 2012, Foz do Iguaçu. Anais do XXIII Congresso Brasileiro de Virologia - VII Encontro de Virologia do Mercosul, 2012.

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; CARVALHO, V. L. ; SILVA, D. E. A. ; NUNES, M. R. T. ; CARDOSO, J. F. . A simple genome assembly strategy for new viruses (Orthobunyavirus) using mixed pyrosequencing data. In: 8th International COnference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012, Campinas - SP. Anais do 8th International COnference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology, 2012.

  • CARDOSO, J. F. ; NUNES, M. R. T. ; SOUSA JUNIOR, E. C. ; INADA, D. T. ; OLIVEIRA, R. L. S. ; NASCIMENTO, S. B. ; PINHEIRO, S. S. ; LIMA, J. L. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Molecular Modeling and docking study of dengue virus 4 NS2B/NS3 protein using peptidc inhibitors. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2012, São Paulo. Anais do 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2012.

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; CARVALHO, L. M. . DEVELOPMENT OF AN WORKFLOW FOR LARGE-SCALE EPITOPE PREDICTION: DENGUE VIRUS AS A STUDY OF CASE. In: 7th International Conference of th Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2011, Florianópolis - SC. Anais 7th International Conference of th Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2011.

  • FERREIRA, N. S. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; FRANCO, M. N. ; MACRAE, Andrew . Impact of 16S rDNA sequence heterogeneity and redundancy on the phylogeny, diversity and identification of bacteria of the order Firmicutes.. In: International Workshop on Genomic Databases, 2007, Sociedade Brasileira de Comput. IWGD'07 proceedings, 2007.

  • DIREITO, I. C. N. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MENDONÇA-HAGLER, L. C. S. ; MACRAE, Andrew . Bioprospecção de microrganismos degradadores do herbicida 2,-d em solo sob manejo orgânico. In: 24 Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2007, Brasília. Proceedings do 24 Congresso Brasileiro de MIcrobiologia, 2007.

  • FERREIRA, N. S. ; SANTOS, V. B. S. ; FRANCO, M. N. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; DIREITO, I. C. N. ; MACRAE, Andrew . Divergência e redundância de seqüências de 16S rDNA em genomas da ordem Firmicutes com múltiplos operons. In: XXIX Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ, 2007, Rio de Janeiro. Livro de resumos da XXIX Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Artística e Cultural da UFRJ, 2007, 2007. p. 262-262.

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . PCR primer design for 2,4-D degradation genes using BLOCKS and the CDD database. In: Inteligent Systems For Molecular Biology 2006 - ISMB 2006, 2006, Fortaleza. Proceeding of the ISMB 2006, 2006.

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Phylogeny of the Nitrogenase complex provides evidence for horizonta gene transfer between bacteria and archaea. In: X-meeting, 2005, Caxambu. In Anals of 1st International Conference of the AB3C, X-meeting, Caxambu, MG, 2005, 2005. v. 1.

  • MIRANDA, K. R. ; ANTUNES, L.C.M ; ALVIANO, C.S. ; FERREIRA, E.O. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; AVELAR, K.E.S. ; OELEMANN, W.M.R ; FERREIRA, M.C.S. ; DOMINGUES, R.M.C.P . Caracterização preliminar do gene luxS, da molécula do tipo AI-2 de B. fragilis e sua interferência na expressão de proteínas. In: XXIII CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 2005, Santos. Anais do XXIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2005.

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Avaliação criteriosa dos genes rrn, rpoB e gyrB como ferramentas em taxonomia microbiana. In: International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (ICOBICOBI), 2004, Angra dos Reis. Anais do International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, 2004. p. 28.

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; FONSECA, Leila de Souza . Proposta de um esquema simples para a diferenciação de bactérias do gênero Nocardia de outros actinomicetos aeróbios de importância clínica.. In: XXii Jornada de Iniciação Científica da UFRJ, 2001, Rio de Janeiro, 2001.

  • DE ANDRADE, AMANDA ARAÚJO SERRÃO ; FRANCO FILHO, L. ; BARATA, R. R. ; VIANEZ, J. L. S. G. ; NUNES, MÁRCIO R. T. . Metagenomic analysis for coronavirus detection in bats anal and tracheal swab samples. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • COSTA, J. D. D. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Prediction of the fluctuation of the case numbers of chikungunya fever in feira de santana, bahia, using techniques of machine learning. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; GARCEZ, P. P. ; NASCIMENTO, J. M. ; COSTA, R. M. ; DELVECCHIO, R. ; TRINDADE, P. ; LOIOLA, E. C. ; HIGA, L. M. ; CASSOLI, J. S. ; VITORIA, G. ; FUZII, H. T. ; SOCHACKI, J. ; TANURI, A. ; FILIPPIS, A. M. B. ; REHEN, S. K. . Whole transcriptome analysis reveals that Zika virus halts cell cycle progression and disrupts neuronal differentiation in human neurospheres. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • OLIVEIRA, L. F. ; VIANEZ-JÚNIOR, J.L.S.G. ; CARDOSO, J. F. ; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA ; BURBANO, R. M. R. ; NUNES, M. R. T. ; SANTOS, E. J. M. . Hepatic miRNA profile in dengue hemorrhagic fever and association with apoptosis regulation, vascular injury and inflamation. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • VIANEZ-JUNIOR, J. L. D. S. G. . Usando o computador como um microscópio:modelagem computacional de biomoléculas. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; LEITE, D. M. C. ; Carolina L. Goulart ; Wanda M.A. von Krüger ; BISCH, P. M. . Annotation and comparative modeling of members of the pho regulon in Vibrio cholerae and related species. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; Carolina L. Goulart ; Wanda M.A. von Krüger ; Paulo M. Bisch . Investigating putative low pi-induced porins of pathogenic vibrio species. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; ANDRADE, I. ; PROBST, C. M. ; SOUZA, W. ; KRIEGE, M. A. ; Paulo M. Bisch ; BORGES, R. S. M. ; MOTTA, M. C. M. . Molecular modeling and sequence analysis of a porin-like channel in the endosymbiont of crithidia deanei. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • DIREITO, I. C. N. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; FERREIRA, N. S. ; ABBES, B. B. ; O'Donnell, A. G. O ; MACRAE, Andrew . TFD gene distribution in agriculture soils of Brazil. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; DIREITO, I. C. N. ; FERREIRA, N. S. ; O'Donnell, A. G. O ; MENDONÇA-HAGLER, L. C. S. ; MACRAE, Andrew . Rationalizing PCR-Primer Design for functional anlyses - making the most of public databases. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • LEITE, D. M. C. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; BISCH, P. M. . Comparative modeling of proteins involved in Vibrio cholerae Pi-starvation response. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • FERREIRA, N. S. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; FRANCO, M. N. ; DIREITO, I. C. N. ; MACRAE, Andrew . Curvas de rarefação para predição de unidades taxonomicas operacionais no filo firmicutes para gênero e espécies. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; FERREIRA, N. S. ; FERNANDES, C. ; MACRAE, Andrew . Differences in 16S rDNA copy number and intra­genomic variability influences in diversity, identification and phylogeny of the Firmicutes and Actinobacteria. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . PCR primer design for 2,4-D degradation genes using BLOCKS and the CDD database. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Phylogeny of the Nitrogenase complex provides evidence for horizonta gene transfer between bacteria and archaea. 2005. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Avaliação criteriosa dos genes rrn, rpoB e gyrB como ferramentas em taxonomia microbiana. 2004. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; FONSECA, Leila de Souza . Proposta de um esquema simples para diferenciação de bactérias do gênero Nocardia de outros actinomicetos aeróbios de importância clínica. 2002. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Avaliação criteriosa das sequencias dos genes 16S rRNA, rpoB e gyrB como ferramentas em taxonomia e filogenia microbiana 2005 (Monografia).

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Outras produções

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . DE. 2016.

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Anotador de contigs. 2014.

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Ion Assembler. 2013.

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . 454 assembler. 2013.

FERREIRA, N. S. ; FRANCO, M. N. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; SANTOS, V. B. S. ; DIREITO, I. C. N. ; MACRAE, Andrew . Website do LBSBM (Laboratório de Biotecnologia Sustentável e Bioinformática Microbiana).. 2006.

VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. ; CARDOSO, J. F. . Introdução à Anlálises Filogenéticas e FIlogeografia. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. . Introdução à Programação em Shell Script. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. ; CARDOSO, J. F. . Introdução ao Linux. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIANEZ-JÚNIOR, JOÃO L. S. G. ; CARDOSO, J. F. . Introdução à montagem de genomas. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Introdução ao Linux e a Bioinformática. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Bioinformática no Auxilio do Desenho de Iniciadores para PCR. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Alinhamento de Sequencias e Análises Filogenéticas. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Bioinformática no auxilio do desenho de iniciadores para PCR para investigação de genes funcionais no ambiente. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Introdução ao Linux e a Bioinformática. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Introdução a Bioinformatica - Semana de Microbiologia. 2006. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

MACRAE, Andrew ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; DIREITO, I. C. N. . CD-ROM Introdução a Bioinformática. 2006. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - CD-ROM).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; MACRAE, Andrew . Introdução a Bioinformática e a Filogenia. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

MACRAE, Andrew ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Bioinformática. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; Gualter, K ; Wilson, F. . Mostra de Dança e Diálogos - IV Seminário Interno do Departamento de Arte Corporal - Conhecendo e Reconhecendo a Dança na UFRJ: Dança, tradição e contemporaneidade.. 2007. Coreográfica.

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Projetos de pesquisa

  • 2017 - Atual

    Análise do transcriptoma e miRnoma em organoides cerebrais humanos e NSCs infectados in vitro por vírus zika (ZIKV)., Descrição: Universal CNPq 2016. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior - Coordenador / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante / Rodrigo S Oliveira - Integrante / Jedson F. Cardoso - Integrante / Layanna F oliveira - Integrante / Janaína Mota de vasconcelos - Integrante / LEMOS, POLIANA DA SILVA - Integrante / Luciano Franco Filho - Integrante / Patrícia P Garcez - Integrante / Stevens K Rehen - Integrante / Teka Mayara Corrêa de Araújo - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2014 - Atual

    Filogeografia e modelagem matemática da dispersão de patógenos virais, Descrição: O Brasil tem sido alvo da introdução de diversos patógenos virais nos últimos anos. Alguns exemplos incluem os vírus DENV4, CHIKV e ZIKV. A capacidade de determinar os fatores que determinam a movimentação destes patógenos, assim como os respectivos períodos de introdução destes agentes virais, são de fundamental importância para a predição da dispersão e curso de epidemias, assim como para ajudar a direcionar politicas públicas de saúde. O presente projeto tem como objetivo aplicar métodos de aprendizado de máquina, modelagem estatística e sequenciamento de nova geração a fim de predizer a probabilidade de importação de patógenos no território brasileiro.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: João Lídio da Silva Gonçalves Vianez Júnior - Coordenador / Marcio Roberto Teixeira Nunes - Integrante / Clayton Pereira Silva Lima - Integrante / Jedson F. Cardoso - Integrante / NUNO R FARIA - Integrante / Simon I Hay - Integrante / Oliver G Pybus - Integrante / DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA - Integrante., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

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Prêmios

2014

Guardião da Tradição Samurai, Instituto Cultural Niten.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Instituto Evandro Chagas, Centro de Inovaçoes Tecnologicas. , Rodovia BR-316 km 7 s/n, Levilândia, 67030000 - Ananindeua, PA - Brasil, Telefone: (91) 32142295, Fax: (91) 32142299, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2011 - Atual

    Instituto Evandro Chagas

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Tecnologista em Pesquisa, Carga horária: 40

    Outras informações:
    Bioinformata no Centro de Inovações Tecnológicas - IEC - Ministério da Saúde http://www.iec.pa.gov.br/index.php/gcPagina/index/40

    Atividades

    • 03/2016

      Direção e administração, Programa de Pós-Graduação em Virologia, .,Cargo ou função, Coordenador substituto.

    • 01/2014

      Ensino, Virologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática

    • 11/2011

      Direção e administração, Centro de Inovaçoes Tecnologicas, .,Cargo ou função, Coordenador Núcleo de Bioinformática.

  • 2005 - 2007

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Bolsista CAPES - Estudante, Enquadramento Funcional: Bolsista CAPES - Estudante, Carga horária: 0

  • 2005 - 2005

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Monitor - Bolsa Monitoria, Enquadramento Funcional: Monitor - Treinamento Científico I, Carga horária: 0

  • 2000 - 2002

    Universidade Federal do Rio de Janeiro

    Vínculo: Bolsista CNPq, Enquadramento Funcional: Estudante - Bolsista CNPq, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 04/2005

      Extensão universitária , Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes, Centro de Extensão Em Microbiologia.,Atividade de extensão realizada, Professor: Curso de extensão de Introdução a Bioinformática.

    • 11/2003 - 04/2005

      Estágios , Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes, .,Estágio realizado, Avaliação criteriosa dos genes rrn, gyrB e rpoB em taxonomia microbiana.

    • 03/2004 - 03/2005

      Treinamentos ministrados , Instituto de Microbiologia Professor Paulo de Góes, .,Treinamentos ministrados, Monitor: Treinamento Científico I - IMPPG

    • 09/2002 - 09/2003

      Estágios , Instituto de Biofísica, .,Estágio realizado, Atividade Anti-tumoral de produtos naturais.

    • 08/2001 - 08/2002

      Estágios , Escola de Química, .,Estágio realizado, Avaliação da biorremediação em solos contaminados por petróleo.

    • 11/2000 - 07/2001

      Estágios , Instituto de MIcrobiologia Professor Paulo de Góes, .,Estágio realizado, Proposta de um esquema simples para a diferenciação de bactérias do gênero Nocardia de outros actinomicetos aeróbios de importância clínica.