Luiz Carlos Junior Alcântara

Pesquisador Titular da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ). Pesquisador Visitante do Depto. de Genética da Universidade Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Possui graduação em Farmácia pela Universidade Federal de Ouro Preto (1992), mestrado em Bioquímica pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (1994) e doutorado em Biologia Celular e Molecular pela Fundação Oswaldo Cruz (2002). Possui também 2 pós-doutorados, sendo o último realizado no Instituto Nacional do Cancer, no Instituto Nacional de Saúde dos EUA. Tem experiência na área de Bioquímica, Biologia Molecular e Bioinformática dos Retrovírus Humanos (HIV e HTLV) e Arbovírus Humanos (Chikungunya, Zika, Dengue, Febre Amarela etc), atuando principalmente nos seguintes temas: Vigilância genômica, epidemiologia molecular e evolução dos vírus humanos, Polimorfismos nos genes dos hospedeiros de vírus humanos, Correlações clínico-epidemiológicas nas viroses humanas, Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para estudo dos genes dos vírus humanos/hospedeiros. Atua também como orientador/professor permanente do curso de Pós Graduação em Genética da UFMG, bem como na UFRJ; orientador/professor permanente do curso de Pós graduação em Bioinformática (área de Virologia) da UFMG; orientador/professor colaborador do curso de Pós Graduação em Saúde Coletiva da Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS) e também como orientador/professor colaborador do curso de Pós Graduação em Vigilância Sanitária do INCQS/FIOCRUZ. Atua também como professor de bioinformática, desde 2004, no International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology (VEME), e como membro das redes RENEZIKA do Ministério da Saúde e RELDA e VIGENDA da Organização Pan-Americana de Saúde. Além de bolsista em produtividade nível 1 do CNPq, é bolsista em produtividade Cientista do Nosso Estado, da FAPERJ.

Informações coletadas do Lattes em 24/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biologia Celular e Molecular

1998 - 2002

Fundação Oswaldo Cruz
Título: Estudo do polimorfismo genético dos vírus linfotrópicos de células T humanas do tipo 1 e 2 (HTLV-1 e HTLV-2) em Salvador, Bahia, Brasil e em tribos indígenas brasileiras
Bernardo Galvão Castro Filho. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Epidemiologia Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Mestrado em Bioquímica

1992 - 1994

Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo
Título: Expressão em E. coli, purificação e caracterização parcial do domínio ligante de calmodulina da miosina-V de cérebro de galinha,Ano de Obtenção: 1996
Roy Edward Larson.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Farmácia

1987 - 1992

Universidade Federal de Ouro Preto

Curso técnico/profissionalizante em Contabilidade

1983 - 1985

Escola Estadual Maurício Augusto Azevedo

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Pós-doutorado

2009 - 2011

Pós-Doutorado. , Vaccine Branch/National Cancer Institute/National Institutes of Health, VB/NCI/NIH, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Biológicas

2005 - 2006

Pós-Doutorado. , Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz/Fundação Oswaldo Cruz /BA, FIOCRUZ, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB, Brasil.

2002 - 2004

Pós-Doutorado. , Nelson Mandela Medical School Durban,NMMS,África do Sul, NMMS, África do Sul. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB, Brasil. , Grande área: Ciências da Saúde

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Formação complementar

2006 - 2006

Estagio:Desenvolver software HTLV Subtyping Tool. (Carga horária: 160h). , University of Oxford, OX, Inglaterra.

2005 - 2005

Estágio:aperfeiçoamento no Banco de dados HIV-Base. (Carga horária: 96h). , Universidade da Flórida-Gainesville-Flórida, UFL, Estados Unidos.

2002 - 2002

Estágio: epidemiologia molecular do HTLV na África. (Carga horária: 720h). , Nelson Mandela Medical School-Durban, NMSM, África do Sul.

2000 - 2000

Estágio:Ferramentas de bioinformática em virologia. (Carga horária: 240h). , Rega Institut - Universidade Católica de Leuven, REGA, Bélgica.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Epidemiologia/Especialidade: Filogenia dos Retrovírus Humanos.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Medicina Preventiva.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: Saúde Pública.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica Básica e Metabólica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática/Especialidade: Epidemiologia Molecular de Retrovirus.

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Organização de eventos

AZEVEDO, V. A. C. ; ALCANTARA, L. C. J. . Curso Internacional de Bioinformática em Epidemiologia Molecular e Evolução Viral. 2017. (Outro).

CERQUEIRA, E. M. ; LIMA, M. M. ; SANTANA, E. B. ; GOES, C. B. ; ALCANTARA, L. C. J. . Seminário Dengue, Chikungunya, Zika - Situação atual e desafios. 2015. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. ; SANTOS,L.A ; ARAUJO, T.H.A. ; REGO, F. F. A. ; OLIVEIRA, T. . 2º Workshop Internacional de Bioinformática em Evolução e Biologia Molecular Viral. 2014. (Outro).

OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, LC . Bioinformatics in the Tropics - Uganda 2014. 2014. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. ; RISTOW, P. ; OLIVEIRA, T. . 1º Workshop Internacional de Bioinformática em Evolução e Biologia Molecular Viral. 2013. (Outro).

OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, LUIZ C J . Bioinformatics in the tropics - South Africa 2013. 2013. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. . 21ª Reunião Anual de Iniciação Científica. 2013. (Outro).

GALVAO-CASTRO, B. ; ALCANTARA, L. C. J. . Bioinformatics capacity to HIV/AIDS research: data management and data mining. 2007. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. . Training for database HIV-Base use.. 2005. (Outro).

CASTRO FILHO, B. G. ; ALCANTARA, L. C. J. . Treinamento em bioinformática no Núcleo de Bioinformática para estudo do HIV e HTLV no LASP/CPqGM/FIOCRUZ. 2004. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. . Second Brazilian Workshop on virus Evolution and Molecular Epidemiology - HIV and HTLV. 2004. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. . Course of Genic Therapy. 2004. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. ; GALVAO-CASTRO, B. . Estudos Avançados em Bioinformática e Análises Genéticas e Evolutivas Virais. 2004. (Outro).

GALVÃO-CASTRO, B. ; ALCANTARA, L. C. J. ; BRÍGIDO, L. F. M. ; VANDAMME, A. M. . The First Brazilian Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology. 2002. (Congresso).

ALCANTARA, L. C. J. . VI Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil. 2000. (Congresso).

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Participação em eventos

International Conference and Exhibition on Genome Science - Genome USA 2018. .. 2018. (Congresso).

22nd International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology (VEME). Sequence alignments and editing: practical computer session / Constructing phylogenetic trees: practice (NJ, ML). 2017. (Congresso).

Curso Internacional de Bioinformática em Epidemiologia Molecular e Evolução Viral.Organização e alinhamento dos genomas. 2017. (Oficina).

First International Asian-Latin American Workshop on Diagnosis, Clinical Management and Dengue Surveillance. Palestrante. 2017. (Congresso).

First International Conference on Zika Virus. An automated method for the identification of Dengue, Zika, Yellow Fever and Chikungunya virus species and genotypes. 2017. (Congresso).

II International Symposium on Biological Sciences.Mobile surveillance of Zika, Yellow Fever and Chikungunya viruses in Brazil using the minION nanopore technology. 2017. (Simpósio).

Reunión Anual de la Red de Laboratorios de Diagnóstico de Arbovirus (RELDA).Nuevas metodologías de diagnóstico y caracterización de arbovirus. 2017. (Seminário).

Reunión de seguimiento del Proyecto VIGENDA.Reunión de seguimiento del Proyecto VIGENDA. 2017. (Encontro).

2nd Penn in Latin America & Caribbean (PLAC). Responses to emerging viral diseases in Latin America and the Caribbean. 2016. (Congresso).

Seminário Marco Zero - Chamada Pública n 14/2016 - Prevenção e Combate ao Vírus Zika.ZIBRA 2: Análise em Tempo Real do vírus zika no Brasil: Segunda etapa. 2016. (Seminário).

Taller Regional sobre Vigilancia, Control y Manejo de Zika, Dengue y Chikungunya en la Región Amazónica.Cartografía de la Enfermedad. Estado actual del trabajo de descripción genética del Zika.. 2016. (Oficina).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology (AB3C). An automated method for the identification of Dengue, Zika, Yellow Fever and Chikungunya virus species and genotypes. 2016. (Congresso).

ZIKAlliance - Kick-off Meeting. 2016. (Encontro).

20th International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology (VEME). Constructing phylogenetic trees: practice (NJ, ML). 2015. (Congresso).

Seminário Dengue, Chikungunya, Zika - Situação atual e desafios.Apresentação do Projeto CHIKV submetido à FAPESB. 2015. (Seminário).

VI Semana Científica 2015.Estudo da genética reversa do HTLV como suporte para o desenvolvimento de uma estratégia vacinal anti-HTLV-1. 2015. (Encontro).

19th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2014. (Outra).

IX Encontro de Virologia do Mercosul.HTLV: codon usage and other molecular insights. 2014. (Encontro).

Oficina Gestão de Projetos de Cooperação Técnica. 2014. (Oficina).

XXV Congresso Brasileiro de Virologia. HTLV: codon usage and other molecular insights. 2014. (Congresso).

16th International Conference on Human Retrovirology: HTLV and Related Viruses. HTLV in Brazil. 2013. (Congresso).

18th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2013. (Outra).

1st Symposium on Big Data and Public Health. 2013. (Simpósio).

3 Congresso Brasileiro sobre HIV-AIDS e Vírus Relacionados. Diversidade Genética do Vírus HIV-1 na Transmissão Materno-Infantil em Salvador-Bahia. 2013. (Exposição).

I Simpósio de Genômica Funcional e Biologia Sistêmica de Microorgan.Métodos de Análises de Sequências. 2013. (Simpósio).

VIII Simpósio sobre Avanços na Patogenia e Manejo da AIDS. Diversidade Genética do Vírus HIV-1 na Transmissão Materno-Infantil em Salvador-Bahia. 2013. (Exposição).

2° BIO Reunião " A Bioinformática no Século 21". 2012. (Encontro).

I Workshop Internacional em Bioinformática.Practical use of phylogenetic analysis: free computer time. 2011. (Outra).

Sessões Científicas. O reverso genético do HTLV-1 em pacientes infectados. 2011. (Olimpíada).

16th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Phylodynamics analysis of HIV-1 strains in Mother-to-Child. 2010. (Oficina).

I Simpósio Paulista de HTLV. 2010. (Simpósio).

Workshop on Viruses, Genes and Cancer. 2010. (Outra).

15th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2009. (Outra).

16 HIV Dynamics and Evolution.Choosing the most frequent codons in the host genes could not be an intelligent choice for virus adaptation. 2009. (Seminário).

I Congresso de Saúde do Sudoeste da Bahia:" Avanços e Desafios". Aspectos Sócio-demográficoas e Soroprevalência do HTLV em gestantes do Sul da Bahia. 2009. (Congresso).

14th International Bio Informatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Avanços no estudo da Epidemiologia Molecular e Evolução dos Retrovírus Humanos no Brasil. 2008. (Simpósio).

12th International Bioinformatics workshop on virus evolution and molecular epidemiology.Professor. 2006. (Outra).

13th HIV dynamics& Evolution. Epitope Mapping Viral sequences from Brazil for Vaccine Development. 2006. (Congresso).

Congresso da associação Latino-Americana de Antropologia Biológica (a ser realizado). Tracing the pos-Columbian origin of the Brazilian HTLV-1 strains using the viral and host genetic markers. 2006. (Congresso).

IX Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil.Molecular Epidemiology of HTLV-I. 2006. (Simpósio).

The AIDS Vaccine 2006 Conference.Mapping epitope candidates from HIV-_ Brazilian sequences fpr vaccine development. 2006. (Outra).

8 Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil.The Genetic Characteristics Study of the Brazilian HTLV-1 isolates Suggests the Pre and Postocolombian Origin Of The Virus In This Country. 2005. (Simpósio).

Educação em Transformação: Novas Metodologias e Formas de Avaliação - II Fórum Pedagógico da FBDC/EBMSP.Utilização da Arte Dramática no Ensino de Bioquímica. 2005. (Oficina).

VIII International Symposium abot HTLV-1 in Brazil.Correlação Molecular entre Isolados de HTLV-I Precedentes da África do Sul e de Salvador. 2005. (Simpósio).

VI Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS.The HIV-1 Genetic Data Analysis is Essential for Developing Better Treatment Strategies and for Selecting Strains for Vaccine Programs. 2005. (Simpósio).

VI Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS.Mapping the Genetic Characteristics of the Brazilian HIV-1 Strains Suggesting the Potential Epitope to Vaccine Candidate with the Development of the Viral Bioinformatics Laboratory at Salvador,Bahia,Brazil. 2005. (Simpósio).

V Mostra Científica e Cultural e III Jornada de Iniciação Científica/PIBIC.A Bioquímica do HTLV. 2005. (Oficina).

10th International Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2004. (Outra).

1 Seminário dos Centros Nacionais de Referência para Pesquisa e Assistência ao Paciente com HTLV.1 Seminário dos Centros Nacionais de Referência para Pesquisa e Assistência ao Paciente com HTLV. 2004. (Seminário).

Encontro Sul-Americano de Pesquisadores do HTLV-I/II.O Contexto do HTLV nos Países (Argentina,Chile,Peru,Colômbia,Venezuela e Brasil;Grupos de Trabalho (epidemiologia,PET/HAM,ATLL e outras patologias;Virologia/Imunologia);Redação final do relatório. 2004. (Encontro).

IV Mostra Científica e Cultural e II Jornada de Iniciação Científica.Mapeamento das características genéticas brasileiras do HIV-1 e do HTLV-1 com a implantação do laboratório de bioinformática do LASP em Salvador,Bahia,Brasil. 2004. (Outra).

Prata da Casa.Situação e Origem do HTLV1 em Salvador,cidade com maior prevalência no Brasil. 2004. (Encontro).

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Participação em bancas

Aluno: Bárbara Maria Nascimento de Oliveira

SOARES, M. B. P.; CARVALHO, L. P.; SILVA, L. K.;Alcantara, L.C.J.. Produção IL-7 canina no sistema baculovírus-células de inseto. 2016. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Julliana Stolze Conceição Góes

BRAGA, A. L. L.; ARAS JUNIOR, R.;ALCANTARA, L. C. J.; FONSECA, A. M.. Efeito da administração in bolus de heparina sódica no remodelamento de partículas lipoprotéicas associadas ao transporte reverso do colesterol. 2015. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Leandro de Oliveira Cedraz

BORGES, V. M.; BESSA, T. C. B.;ALCANTARA, L. C. J.; SIQUEIRA, I. C.. Concentração plasmática de citocinas e quimiocinas em indivíduos com dermatite infecciosa associada ao HTLV-1 (DIH). 2015. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Leandro de Oliveira Cedraz

BORGES, VALÉRIA M.;ALCANTARA, L. C. J.; BESSA, T.. Concentrações plasmáticas de citocinas e quimiocinas em indivíduos com a dermatite infecciosa associada ao HTLV-1 (DIH). 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Leandro de Oliveira Cedraz

Alcantara, L.C.J.; BORGES, VALÉRIA M.; BESSA, T.. Avaliação sérica de citocinas em pacientes diagnosticados com dermatite infecciosa associada ao HTLV-1 (DIH). 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Maria Isabel Magalhães Andrade dos santos

SCHINONI, M. I.; LYRA, A. C.; SILVA JUNIOR, H. P.;ALCANTARA, L. C. J.. Perfil das mutações de resistência dos vírus da Hepatite B aos análogos de núcleos(t)ídeos entre pacientes com Hepatite B crônica. 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Raquel Gois Bastos

ALCANTARA, L. C. J.GADELHA, S. R.; MELO, P. R. S.; SANTOS, M. V. F. D. L.. Estudos de agentes infecciosos de transmissão vertical e epidemiologia molecular de retrovírus em gestantes do sul da Bahia. 2013. Dissertação (Mestrado em Biologia e Biotecnologia de Microrganismos) - Universidade Estadual de Santa Cruz.

Aluno: Isabela Archanjo Nuñes

ADORNO, E. V.; SANDES, K. A.;ALCANTARA, L. C. J.. Expressão dos genes virais do HTLV-1 tax e HBZ na Leucemis/linfoma de células T do adulto (ATL). 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Katia Kaori Otaguiri

ALCANTARA, L. C. J.; KASHIMA, S.; CARBOLANTE, E. M. S. R.. Estudo funcional de microRNAs na infecção pelo HTLV-1. 2013. Dissertação (Mestrado em Biociências Aplicadas à Farmácia da FCFRP-USP) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Tarsila dos Santos Araújo

PASSOS, L. C. S.; FREITAS, L. A. R.; REIS, M. G.;ALCANTARA, L. C. J.. Impacto da cirurgia de revascularização miocárdica com circulação extracorpórea no metabolismo das lipoproteínas de alta densidade (HDL): atividade da paraoxonase e da peroxidase endógena. 2013. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Nadja de Jesus Gonçalves dos Santos

ALCANTARA, L. C. J.. Hemoglobina fetal em indivíduos com doença falciforme e persistência hereditária da hemoglobina fetal. 2011. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: João Paulo Sena Chagas de Oliveira

ALCANTARA, L. C. J.. Avaliação do Polimorfismo Genético em Isolados de Leishmania Amazonensis. 2006. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz-FIOCRUZ.

Aluno: Joana Paixão Monteiro

ALCANTARA, L. C. J.. Caracterização Molecular e Biológica de Isolados do Subtipo C de HI-1 circulantes no Brasil. 2006. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Instituto Oswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Hermes Pedreira da Silva Filho

ALCANTARA, L. C. J.. Aplicabilidade dos Genes Pr--S e S do Vírus da Hepatite B (VHB) nos estudos de Diversidade Genômica. 2005. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz -Fundação Instituto Oswaldo Cruz.

Aluno: Andréa Bomura Rosato

ALCANTARA, L. C. J.. Avaliação do Polimorfismo Genético de Leishmania viannia brasiliensis. 2004. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz -Fundação Instituto Oswaldo Cruz.

Aluno: Denize Duizit Colin

COLIN, D. D.;ALCANTARA, L. C. J.TAVARES NETO, J.; ALVARENGA, R. M. P.. Prevalência de Infecção por HTLV-I/II em doadores de Sangue da Cidade de Rio Branco, Acre.. 2003. Dissertação (Mestrado em Medicina e Saúde) - Curso de Mestrado Em Medicina e Saúde Ufba Governo do Acre.

Aluno: Cláudio Lima Souza

SOUZA, C. L.;ALCANTARA, L. C. J.; BONFIM, M. G.; FONSECA, S. F.. Investigação Molecular das Anormalidades Cromossômicas e dos Polimorfismos Gênicos da Glutationa S-Transferase em um Grupo de Portadores de Leucemia Mielóide Crônica (LMC) e Leucemia Mielóide Aguda (M3) de Salvador-BA.. 2003. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Instituto Oswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Viviana Nilla Olavarria Gallazzi

ALCANTARA, L. C. J.; FERNANDEZ, J. C. C.; VICENTE, A. C. P.. Prevalência das mutações que conferem resistência aos anti-retrovirais em um grupo de indivíduos infectados pelo HIV-1, em Salvador, Bahia. 2003. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Instituto Oswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Adjile Edjide Roukiyath Amoussa

KHOURI, RICARDO; CARVALHO, L. P.; MONTEIRO, J. P.; SIQUEIRA, I. C.;ALCANTARA, L. C. J.; BESSA, T. C. B.. Origem do HTLV-1aA no Brasil: conexão entre o Oeste e Sul do continente africano. 2018. Tese (Doutorado em Pós-graduação em Patologia Experimental) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Rita Terezinha de Oliveira Carneiro

ALCANTARA, L. C. J.; MACHADO JUNIOR, A. S.; RAMOS, P. I.. Diversidade genética de isolados de Mycobacterium tuberculosis resistentes a fármacos circulantes em Salvador, Bahia, Brasil. 2018. Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Victor Figueiredo Pimentel

ABECASIS, A.;Alcantara, Luiz Carlos Júnior; ROMANO, C. M.; SUCUPIRA, M. C. A.; BRIGIDO, L. F. M.. Estudo da diversidade genética do HIV e intra-hospedeiro em pacientes soroconvertores recentes. 2016 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ricardo Durães de Carvalho

ARNS, C. W.; WERNECK, C. C.; LANCELLOTTI, M.; ORSI, M. A.;ALCÂNTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR. Investigação e caracterização filogenética de Coronavírus na biota de aves silvestres e sinantrópicas provenientes das regiões Sul e Sudeste do Brasil. 2015. Tese (Doutorado em Programa de Pós Graduação em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Everton da Silva Batista

ALCANTARA, L. C. J.; SIQUEIRA, ISADORA; OLIVEIRA, P. D.; CARDOSO, T. M. S.. Avaliação Quantitativa de Genes da Região pX na Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATL) e na Dermatite Infecciosa Associada ao HTLV-1 (DIH). 2015. Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

Aluno: Dennis Maletich Junqueira

BENTANCOR, G. J. B.; VIEIRA, G. F.;ALCANTARA, LUIZ C J. Dinâmica Epidemiológica das Transmissões do HIV-1 Subtipo B no Brasil. 2015. Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Marcelo Magalhães Silva

ALCANTARA, L. C. J.. Estudo de alterações genéticas associadas à leucemia/linfoma das células T do adulto no Estado da Bahia. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Andrea Mendonça Gusmão Cunha

ALCANTARA, L. C. J.; FONSECA, B. A. L.; ALBERTO, F. L.; CASTRO, M. L. R. B.; COSTA, S. C. B.. Soroprevalência e Epidemiologia Molecular do Herpesvírus homano 8 (HHV-8) em Populações Brasileiras. 2005.

Aluno: André Luiz Barbosa Báfica

ALCANTARA, L. C. J.. Influência de Polimorfismos dos Receptores do Tipo Toll nas Leishmanioses. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Curso de Pós-Graduação em Patologia) - Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz-FIOCRUZ.

Aluno: Elisangela Vitória Adorno

ALCANTARA, L. C. J.. Fatores Transcricionais,região promotora dos genes gama e o sítio HS2-LCR:análise da interação em portadores de anemia falciforme de Salvador-Bahia. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Curso de Pós-Graduação em Patologia) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz -Fundação Instituto Oswaldo Cruz.

Aluno: Tamiris Tatiane Dias

ALCANTARA, L. C. J.. Clonalidade do vírus da hepatite C (VHC) e implicação na transmissão intrauterina e eliminação espontânea da infecção viral em recém-nascidos. 2012.

Aluno: Isabela Arcanjo Nunez

ALCANTARA, L. C. J.. Expressão dos genes virais tax e HTLV-1 b ZIP factor (HBZ) na Leucemia/Linfoma de células T do adulto (ATL). 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Mariana Tomazini Pinto

ALCANTARA, L. C. J.. Perfil de expressão gênica de linfócitos T CD4+ na infecção pelo HTLV-1. 2011.

Aluno: Patrícia de Souza Abreu

ALCANTARA, L. C. J.. Contribuições de Análise de Sequências de DNA à reconstrução Filogenética dos grandes Grupos de Anura. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biologia) - Universidade Federal da Bahia.

Aluno: Chandra Mara Santana de Carvalho

ALCANTARA, L. C. J.FERRARO, G. A.; VILAS BOAS, L.. Caracterização Molecular de Sequências Brasileiras de HIV-1 através de uma nova Ferramenta de Bioinformática. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biologia) - Universidade Federal da Bahia.

NASCIMENTO, R. J. M.; VERAS, P. S. T.; SOARES, M. B. P.; ALMEIDA, M. C. C.;Alcantara, Luiz C. J.. Banca Examinadora de Promoção Funcional para Professor Titular. 2017. Universidade Federal da Bahia.

NASCIMENTO, R. J. M.;ALCANTARA, L. C. J.Grassi MFR; AZEVEDO, V. A. C.; PATEL, B. N.. Banca Examinadora para Promoção a Professora Titular. 2016. Universidade Federal da Bahia.

NASCIMENTO, R. J. M.;Alcantara, Luiz Carlos JuniorGrassi MFR; PATEL, B. N.; AZEVEDO, V. A. C.; ARAUJO, R. P. C.; CARVALHO, R. C.; ASSIS, S. A.. Banca Examinadora de Promoção Funcional para Professor Titular. 2016. Universidade Federal da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.; SOARES, M. A.; SANTOS, N. S. O.. Banca examinadora para cargo de Pesquisador em Saúde Pública. 2016. Fundação Oswaldo Cruz.

ALCANTARA, L. C. J.. Concurso público para professor em nível de assistente da disciplina Bioquímica, conforme edital 007/2003 da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia - Departamento de Química e Exatas, Jequié.. 2003. Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca examinadora de progressão de assistente para adjunto. 2003. Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca Examinadora de Progressão na carreira de auxiliar para assistente. 2003. Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca examinadora de progressão na carreira de auxiliar para assistente. 2003. Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.; RIBAS, L.; OLIVEIRA, S.. Concurso Público para Docente de Nível Superior, Classe Auxiliar, conforme edital 031/2001, para a disciplina Bioquímica da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Jequié, Bahia, em outubro/2001 (Membro da Comissão Organizadora).. 2001. Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

LEPIKSON, L. M. N.;Alcântara, Luiz C.J.; SOUZA, M. J. A.; QUEIROZ, M. P.. Comissão de Revisão do Código de Conduta do CPqGM. 2014. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

BESSA, T.; ALMEIDA, M. C. C.;ALCANTARA, L. C. J.. Banca de seleção de alunos de mestrado e doutorado para o Curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ. 2013. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

VERAS, P.; ALMEIDA, M. C. C.;ALCANTARA, L. C. J.. Seleção de alunos de mestrado e doutorado para o Curso de Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ. 2012. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca de seleção para professor assistente da disciplina Virologia. 2005. Fundação Bahiana para Desenvolvimento das Ciências.

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Comissão julgadora das bancas

Mitermayer Galvão dos Reis

Reis, Mitermayer G.. Estudo do Polimorfismo Genético dos Vírus Linfotrópicos de Células-T Humanas dos tipos I e II (HTLV-I e HTLV-II), em Salvador-BA, Brasil e em Tribus Indígenas Brasileiras. 2002. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Fundação Oswaldo Cruz.

ANGELINA XAVIER ACOSTA

ZAGO, Marco Antonio; CASTRO, M. G.; CAROLINA, A.; COSTA, M. C. R.;ACOSTA, A. X.. Estudo do Polimorfismo Genético dos Vírus Linfotrópicos de Células-T Humanas dos Tipos I e II (HTLV-I e HTLV-II) em Salvador, Bahia, Brasil e em Tribos Indígenas Brasileiras. 2002. Tese (Doutorado em Curso de Pós Graduação Em Biologia Molecular e Cel) - Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz Fundação Oswaldo Cruz.

Francisco de Assis Leone

LEONE, F. A. ou LEONE FDA. LUIZ CARLOS JÚNIOR ALCÂNTARA. 1994. Exame de qualificação (Mestrando em Bioquímica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

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Orientou

Ronaldo Jesus

; ; Início: 2020; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Hegger Machado Fritsch

; ; Início: 2020; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Joilson Xavier dos Santos Júnior

Utilização do sequenciamento multiplex por nanoporos para o diagnóstico molecular de arbovírus; Início: 2019; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Flávia Löwen Levy Chalhoub

Pesquisa de Genomas de arboviroses em equinos do Rio de Janeiro; Início: 2018; Tese (Doutorado em Genetica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Allison de Araujo Fabri

Investigação molecular de arbovírus em primatas não-humanos durante epizootias de febre amarela no Brasil; Início: 2018; Tese (Doutorado em Genetica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Talite Emile Ribeiro Adelino

Investigação da interação microrganismo-hospedeiro nas infecções agudas causadas pelos vírus da zika, chikungunya e febre amarela em Minas Gerais; Início: 2018; Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Felipe Campos de Melo Iani

Vigilância Genômica de arboviroses emergentes em Minas Gerais e região Centro Oeste do Brasil; ; Início: 2017; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Álvaro Salgado de Abreu

Da vigilância à inovação tecnológica no Brasil: construindo o conhecimento sobre o vírus Zika, epidemiologia da infecção e diferentes manifestações clínicas relacionadas, através do uso de aprendizado de máquina; ; Início: 2017; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Coorientador);

Vagner de Souza Fonseca

Desenvolvimento de um Banco de Dados e de Ferramentas de Bioinformática para Caracterização Molecular dos Arbovírus Emergentes e Reemergentes no Brasil; Início: 2017; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais; (Orientador);

Mauricio Teixeira Lima

Início: 2020; Universidade Federal de Minas Gerais;

Marta Giovanetti

Início: 2017; Fundação Oswaldo Cruz;

Maria Aparecida Oliveira Lima

Distribuição Espaço-Temporal da Dengue, Chikungunya e Zika em Feira de Santana - BA; 2017; Dissertação (Mestrado em SAÚDE COLETIVA) - Universidade Estadual de Feira de Santana,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Stephane Fraga de Oliveira Tosta

Caracterização ??in silico? dos produtos proteicos das cepas circulantes doZIKV e suas interações com o hospedeiro; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade Federal de Minas Gerais,; Coorientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Joilson Xavier dos Santos Júnior

Avaliação da diversidade genética e história evolutiva do vírus Zika (ZIKV) no semiárido baiano; 2017; Dissertação (Mestrado em Patologia Humana) - Universidade Federal da Bahia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Jaqueline Goes de Jesus

Avaliação da interação entre os produtos da ORF-1 do HTLV-1 com a proteína da célula hospedeira Paxilina; ; 2014; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Murilo Freire Oliveira Araújo

Desenvolvimento de uma ferramenta de filotipagem para o Vírus Linfotrópico de Células-T Humanas do Tipo 1 (HTLV-1); 2014; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Vagner de Souza Fonseca

Desenvolvimento de uma ferramenta didática para avaliação de fatores de risco e prevenção de agentes causadores de doenças sexualmente transmissíveis: HIV-1 e HTLV-1; 2014; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Fernanda Khouri Barreto

Utilização do HTLV-2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV-1; 2013; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Márcio de Oliveira Silva

Avaliação da história epidemiológica da infecção pelo HIV-1 no estado da Bahia - Brasil; ; 2012; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Sara Nunes Vaz

EVOLUÇÃO DOS VÍRUS HIV-1 E HTLV-1 EM CRIANÇAS E ADOLESCENTES COINFECTADOS EM SALVADOR-BAHIA; 2012; Dissertação (Mestrado em Medicina e Saúde (Curso Novo)) - Universidade Federal da Bahia,; Coorientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Thessika Hialla Almeida Araújo

DESENVOLVIMENTO DE UM BANCO DE DADOS (HTLV-1 MOLECULAR EPIDEMIOLOGY DATABASE) PARA DATAMINING E DATA MANAGEMENT DE SEQUÊNCIAS DO HTLV-1; 2011; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Domingos Ramon Moreau da Cunha

LASP-HIV1-RESToll: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática a para análise de resistência do HIV-1; 2010; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em saúde e medicina investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Luciane Amorim Santos

Uso de Ferramentas de Bioinformática para Estudos de Epidemiologia Molecular, Filogeografia e Filodinâmica Viral; 2010; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Filipe Ferreira de Almeida Rego

Mutações na Região LTR do HTLV e sua implicação na presença do vírus na saliva e origem na Bahia; 2010; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Giselle Calazans de Souza Costa

Investigação das Correlações entre os Polimorfismos nas Regiões Promotoras e Regulatórias do Gene Humano GLUT1,a Expressão e Exposição de Proteína na Membrana e o Desenvolvimento de TSP/HAM em Indivíduos Infectados por HTLV1; 2007; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz/Fundação Oswaldo Cruz /BA, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Edson de Souza Santos

ANÁLISE GENOTÍPICA DOS ISOLADOS DO HIV-1 NA TRANSMISSÃO VERTICAL; 2007; Dissertação (Mestrado em Medicina e Saúde Humana) - Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Aline Cristina Andrade Mota Miranda

Caracterização das mutações nos dominios imunodominantes da glicoproteina de superficie (gp46) do HTLV-1 e sua contribuição para o padrão soroindeterminado no Western Blot; ; 2007; Dissertação (Mestrado em Mestrado Acadêmico em Biotecnologia e Medicina Inv) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Víctor José Uchôa Carvalho

Análise Clínica das Manifestações Orais e Investigação Laboratorial da Secreção Salivar em Pacientes Portadores de HTLV-1 com Síndrome de SJÖGREN; 2006; Dissertação (Mestrado em Medicina e saúde humana) - Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Maricelia Maia de Lima

Os processos de capacitação em Vigilância Epidemiológica: um estudo de caso; 2017; Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Saúde Coletiva) - Universidade Estadual de Feira de Santana,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Luciane Amorim Santos

Identificação de SNPs no genoma da Leptospira interrogans sorovar Copenhageni e possível associação ao desfecho clínico e Síndrome Hemorrágica Pulmonar; 2015; Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Jaqueline Goes de Jesus

Análise molecular em tempo real e sequenciamento de genomas completos dos arbovírus CHIKV e ZIKV emergentes no Brasil; 2015; Tese (Doutorado em Pós-graduação em Patologia Experimental) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Filipe Ferreira de Almeida Rego

Correlação entre análise in vitro das mutações na região LTR do HTLV-1 com diferentes perfis clínicos e carga proviral dos indivíduos infectados; 2014; Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Maria Ines Valderrama Restovic

Desenvolvimento de uma Ferramenta de Filotipagem para o Vírus da Dengue; 2014; Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Adjile Edjide Roukiyath Amoussa

The origin of the HTLV-1 in Brazil studying the connection between the West and Southern Africa continent; 2014; Tese (Doutorado em Patologia Humana) - Universidade Federal da Bahia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Marco Antônio Gomes Mello

Soroprevalência e subtipagem do vírus linfotrópico de células T humanas (HTLV) e avaliação da transmissão materno-fetal em gestantes da região sul da Bahia; 2013; Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Fernanda Khouri Barreto

Utilização do HTLV-2 atenuado como vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV-1; 2013; Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Giselle Calasans de Souza Costa

Investigação de mutações nos genes da CCR5 e da Langerina e sua associação com a infecção pelo HIV-1; 2012; Tese (Doutorado em Biotecnologia em saúde e medicina investigativa) - Fundação Oswaldo Cruz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Thessika Hialla Almeida Araújo

Caracterização de genomas completos do vírus linfotrópico de células T do tipo I (HTLV-1) provenientes de pacientes com diferentes perfis clínicos; 2012; Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Aline Cristina Andrade Mota Miranda

Estudo molecular de proteínas estruturais (gp21 e gp46) e regulatórias (HBZ) do HTLV-1 em indivíduos com diferentes perfis clínicos; 2012; Tese (Doutorado em Biotecnologia em saúde e medicina investigativa) - Laboratório Avançado de Saúde Pública Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz Fun,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Joana Paixão Monteiro

Análise da variabilidade genética do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) - Epidemiologia molecular no estado da Bahia; 2009; Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Sandra Rocha Gadelha

Estudo do Polimorfismo nos Promotores de IL2, R-IL2 e IL6 em Indivíduos Infectados com o HTLV-1, Sintomáticos e Assintomáticos, em Salvador, Bahia, Brasil; 2007; Tese (Doutorado em Patologia humana) - Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ - Salvador, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Adriano Fernando da Silva Araújo

Análise proteômica e funcional da alça V3 da gp120 dos isolados do HIV-1 de Salvador-BA e do domínio N-terminal do receptor de quimiocina CCR5 de pacientes infectados e não infectados; 2007; Tese (Doutorado em Biotecnologia e Medicina Investigativa (CPqGM)) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Augusto Cesar de Andrade Mota

Estudo de Caso-controle dos Determinantes de Risco da Infecção pelo HTLV em Doadores de Sangue no Estado da Bahia; ; 2006; Tese (Doutorado em Medicina e Saúde Humana) - Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública,; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Sergio de Araujo Pereira

Estudo do Polimorfismo Genetico da Região LTR dos Isolados do HTLV-1 Provenientes de Indivíduos Infectados com o HTLV-1, Sintomáticos e Assintomáticos, em Salvador, Bahia, Brasil; 2003; Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Francielly Morais Rodrigues da Costa

2020; Universidade Federal de Minas Gerais,; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Willian de Almeida Marques

2019; Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Fernanda Khouri Barreto

2018; Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Rodrigo Dias de Oliveira Carvalho

2017; Universidade Federal de Minas Gerais,; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Adriano Queiroz Silva

2017; Fundação Oswaldo Cruz,; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Rui Milton Patrício da Silva Júnior

2017; Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo,; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Maria Fernanda de Castro Amarante

2015; Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Ana Rita Ferraz

2015; Fundação Oswaldo Cruz,; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Marcia Weber Carneiro

2014; Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Joana Paixão Monteiro Cunha

2009; Fundação Oswaldo Cruz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Diego Gervásio Frias

2008; Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz,; Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Chandra Mara de Carvalho

Mapeando as Características genéticas das sequências de HIV-1 gene gag) no Brasil com o desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador ,Bahia, Brasil; 2006; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em biologia) - Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ - Salvador, Ministério da Saúde; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Alessandra Gonzalez do Nascimento

Investigação do papel da infecção pelo vírus Zika na epidemia de recém-nascidos com microcefalia em Salvador-BA: um estudo de prevalência em gestantes e neonatos; 2017; Iniciação Científica - Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Breno Lima de Almeida

Investigação do papel da infecção pelo vírus Zika na epidemia de recém-nascidos com microcefalia em Salvador-BA: um estudo de prevalência em gestantes e neonatos; 2016; Iniciação Científica - Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Aline Sousa de Oliveira

Investigação do papel da infecção pelo vírus Zika na epidemiologia de recém-nascidos com microcefalia em Salvador-BA de prevalência em gestantes e neonatos; ; 2016; Iniciação Científica - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Aline Dórea Luz Menezes

Caracterização molecular dos genomas completos do HTLV-1 provenientes de pacientes com diferentes perfis clínicos; 2014; Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Marielle de Freitas Guimarães

Análise Funcional de Mutações na glicoproteina de superfície do HTLV-1; 2013; Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Stephane Fraga Tosta

Utilização do HTLV-2 atenuado vomo vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV-1; 2013; Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Bruna de Sousa Carvalho Reis

Análise Funcional de Mutações na Glicoproteína de superfície do HTLV-1; 2013; Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Luis Felipe Ivanoff de Menezes

Caracterização Molecular do Genoma Completo do HTLV-1; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Loianna Mascarenhas da Fonseca

UTILIZAÇÃO DO HTLV-2 PSEUDOTIPADO COMO VETOR VACINAL CONTRA A INFECÇÃO PELO HTLV-1; 2012; Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Matheus Santos Rodrigues Silva

Correlação entre análise in vitro das mutações na região LTR do HTLV-1 com diferentes perfis clínicos e carga proviral dos indivíduos infectados; 2012; Iniciação Científica - Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Ricardo dos Santos Almeida Nunes

AVALIAÇÃO DA HISTÓRIA EPIDEMIOLÓGICA DA INFECÇÃO PELO HIV-1 NO ESTADO DA BAHIA - BRASIL; 2012; Iniciação Científica - Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Erika Andrade Rocha

AVALIAÇÃO DA HISTÓRIA EPIDEMIOLÓGICA DA INFECÇÃO PELO HIV-1 NO ESTADO DA BAHIA - BRASIL; 2012; Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Fernanda Khouri Barreto

Caracterização Molecular da Glicoproteína de Superfície (gp46) do HTLV-1 em indivíduos assintomáticos e com HAM/TSP; 2011; Iniciação Científica - Fundação Oswaldo Cruz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Jaqueline Goes de Jesus

INVESTIGAÇÃO DE MUTAÇÕES NO GENE CODIFICANTE DA PROTEÍNA LANGERINA EM INDIVÍDUOS INFECTADOS PELO HIV-1; 2010; Iniciação Científica - Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Aline Cristina Andrade Mota Miranda

Mapeando as Características genéticas das sequências de HTLV-1 no Brasil com o desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador, Bahia, Brasil; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ - Salvador, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Artur Trancoso Lopo de Queiróz

Mapeando as Características genéticas das sequências de HIV-1 no Brasil com o desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador ,Bahia, Brasil; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ - Salvador, Ministério da Saúde; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Giselle Calazans de Souza Costa

Correlações do Polimorfismo Genético do Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do Tipo I (HTLV-I) como o Polimorfismo dos genes do Hospedeiro Envolvidos no Desenvolvimento de HAM/TSP em, Salvador; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Biologia) - Universidade Federal da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Vinicius Alencar Fernandes da Silva

Desenvolvimento de uma nova ferramenta de bioinformática para seleção de regiões protéicas potenciais dos isolados brasileiros do HIV-1, para dar suporte aos projetos de prótotipos vacinais ligados ao PN-DST/AIDS, MS; ; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Gabriel Muricy Cunha

Investigação da correlação entre polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias da proteína GLUT-1; ; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Saul Vislei Simões da Silva

?Determinação de Polimorfismos nas regiões promotoras dos genes de IL-2 e receptor de IL-2 em indivíduos infectados pelo Vírus Linfotrópico de Células-T Humanas do Tipo I (HTLV-I) e estudo de correlação entre os polimorfismos detectados e o desenvolvimento de Paraparesia Espástica Tropical/Mielopatia Associada ao HTLV-I (TSP/HAM)?; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em farmácia) - Faculdade de Tecnologia e Ciências; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Ricardo Durães de Carvalho

Correlação entre polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias do gene da GLUT1, expressão e exposição da proteína na membrana e o desenvolvimento de TSP/HAM em indivíduos infectados pelo HTLV-I; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Instituto Mantenedor de Ensino Superior da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Maria Fernanda de Oliveira Barros

Estudo dos casos Tax-defectivos nos indivíduos HTLV-1 positivos, com sorologia indeterminada no Western-Blot; ; 2005; Iniciação Científica - Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz-FIOCRUZ, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Chandra Mara Carvalho

Mapeando as Características genéticas das correntes de HIV-1 e HTLV-1 no Brasil com o desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador,Bahia,Brasil; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Biologia) - Universidade Federal da Bahia; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Luciane Amorim Santos

Mapeando as Características genéticas das sequências de HIV-1 no Brasil com o desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador,Bahia,Brasil; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz-FIOCRUZ, Ministério da Saúde; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

FRED LUCIANO NEVES SANTOS

Impacto do HTLV-I na origem e evolução da epidemia e na imunogênese da doença; 1999; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal da Bahia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Cesar Augusto Costa Machado

Diversidade filogenética do HTLV-I no Brasil e correlações com as devidas manifestações clínicas; 1998; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina) - Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Helineide Ramos do Amaral

Apoio Técnico em Extensão no País do CNPq - Nível B; 2017; Orientação de outra natureza - Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

Túlio de Paiva Nazareth Andrade de Oliveira

The tale of two interlinked epidemics: The origin and clinical relationship of the African and Brazilian HIV-1 and HTLV-1 epidemics; 2013; Orientação de outra natureza; (Pesquisador PVE Ciências Sem Fronteiras) - Nelson Mandela Medical School Durban,NMMS,África do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcantara;

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Produções bibliográficas

  • PEREIRA GUSMÃO MAIA, ZUINARA ; MOTA PEREIRA, FELICIDADE ; DO CARMO SAID, RODRIGO FABIANO ; FONSECA, VAGNER ; GRÄF, TIAGO ; DE BRUYCKER NOGUEIRA, FERNANDA ; BRANDÃO NARDY, VANESSA ; XAVIER, JOILSON ; LIMA MAIA, MARICELIA ; ABREU, ANDRÉ L. ; CAMPELO DE ALBUQUERQUE, CARLOS F. ; KLEBER OLIVEIRA, WANDERSON ; CRODA, JULIO ; DE FILIPPIS, ANA MARIA BISPO ; VENANCIO CUNHA, RIVALDO ; LOURENÇO, JOSE ; de Oliveira, Tulio ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; JUNIOR ALCANTARA, LUIZ CARLOS ; GIOVANETTI, MARTA . Return of the founder Chikungunya virus to its place of introduction into Brazil is revealed by genomic characterization of exanthematic disease cases. Emerging Microbes & Infections , v. 9, p. 53-57, 2020.

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  • ALCANTARA, L. C. J. ; VAN DOOREN, S. ; GONÇALVES, M. ; KASHIMA, S. ; COSTA, M. C. R. ; SANTOS, F. L. N. ; BITTENCOURT, A. ; DOURADO, I. ; FILHO, A. A. ; COVAS, D. T. ; VANDAMME, A. M. ; GALVAO-CASTRO, B. . Globin haplotypes of human T-cell lymphotropic virus type I (HTLV-I) infected individuals in Salvador, Bahia, Brazil suggest a post-columbian African origin of this virus.. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes (1999) , Philadelphia, v. 33, p. 536-542, 2003.

  • Colin, Denise Duizit ; Alcântara, Luiz Carlos Júnior ; Santos, Fred Luciano Neves ; Uchôa, Rita ; Tavares-Neto, José ; ALCANTARA, L. C. J. . Prevalência da infecção pelo vírus linfotrópico humano de células T e fatores de risco associados à soropositividade em doadores de sangue da cidade de Rio Branco, AC, Brasil (1998-2001). Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical (Impresso) , BRA, v. 36, n.6, p. 677-983, 2003.

  • VAN DOOREN, S. ; Alcantara, Luiz Carlos Junior . The Low Evolutionary Rate of Human T-Cell Lymphotropic Virus Type-1 Confirmed by Analysis of Vertical Transmission Chains. Molecular Biology and Evolution , E.U.A, v. 21, p. 603-611, 2003.

  • DOURADO, I. ; ALCANTARA, L. C. J. ; Maurício L. Barreto ; Maria da Glória Teixeira ; GALVAO-CASTRO, B. . HTLV-1 in the General population of Salvador,Brazil- A City with African Ethnic and Sociodemographic Characteristics. J Acquire Immune Defic Syndr, v. 34, p. 527-531, 2003.

  • Shindo, Nice ; Alcantara, Luiz C.J. ; Van Dooren, Sonia ; Salemi, Marco ; Costa, Maria C.R. ; Kashima, Simone ; Covas, Dimas T. ; Teva, Antonio ; Pellegrini, Marco ; Brito, Ivo ; Vandamme, Anne-Mieke ; Galvao-Castro, Bernardo . Human Retroviruses (HIV and HTLV) in Brazilian Indians: Seroepidemiological Study and Molecular Epidemiology of HTLV Type 2 Isolates. AIDS Research and Human Retroviruses , E.U.A, v. 18, n.1, p. 71-77, 2002.

  • Porto, Aurelia F. ; Neva, Franklin A. ; Bittencourt, Helito ; Lisboa, Waldir ; Thompson, Robert ; Alcantara, Luis ; Carvalho, Edgar M. . HTLV-1 decreases Th2 type of immune response in patients with strongyloidiasis. Parasite Immunology , Inglaterra, v. 23, p. 503-507, 2001.

  • BITTENCOURT, A. ; DOURADO, I. ; FILHO, P. B. ; SANTOS, M. ; VALADÃO, E. ; ALCANTARA, L. C. J. ; GALVÃO-CASTRO, B. . Human T-cell lymphotropic virus type 1 infection among pregnant women in northeastern Brazil. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes (1999) , Filadelfia-USA, v. 26, n.26, p. 490-494, 2001.

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Outras produções

FONSECA, V. S. ; GIOVANETTI, M. ; Deforche, K. ; Alcantara, Luiz Carlos Júnior ; OLIVEIRA, T. . Genome Detective Coronavirus Typing Tool for rapid identification and characterization of novel coronavirus genomes. 2020.

FONSECA, V. ; Deforche, Koen ; Alcantara, Luiz Carlos Júnior ; Vandamme, A.-M. ; OLIVEIRA, T. . Genome Detective. 2018.

FONSECA, V. ; GIOVANETTI, MARTA ; RESTOVIC, M. I. ; FREIRE, M. ; ALCANTARA, L. C. ; THEYS, K. ; Libin, Pieter ; Cuypers L. ; ABECASIS, A. ; VANDAMME, A. M. ; FARIA, NUNO R ; PYBUS, O. G. ; NUNES, MARCIO ROBERTO TEIXEIRA ; SANTIAGO, G. A. ; Deforche, Koen ; DE OLIVEIRA, TULIO . Yellow Fever Virus Phylogenetic Typing Version 1.0. 2016.

FONSECA, V. ; GIOVANETTI, MARTA ; RESTOVIC, M. I. ; FREIRE, M. ; ALCÂNTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR ; THEYS, K. ; Libin, Pieter ; Cuypers L. ; ABECASIS, A. ; VANDAMME, A. M. ; FARIA, NUNO RODRIGUES ; PYBUS, O. G. ; NUNES, M. R. ; SANTIAGO, G. A. ; Deforche, Koen ; DE OLIVEIRA, TULIO . Dengue, Zika & Chikungunya Viruses Typing Tool Version 1.0. 2015.

FONSECA, V. ; FREIRE, M. ; RESTOVIC, M. I. ; ARAÚJO, THESSIKA HIALLA ALMEIDA ; Alcantara, L.C.J. ; THEYS, K. ; Libin, Pieter ; Cuypers L. ; ABECASIS, A. ; VANDAMME, A. M. ; Deforche, Koen ; OLIVEIRA, T. . Human T-cell Lymphotropic Virus Typing Tool Version 1.0. 2015.

MOREAU, D. R. ; FERNANDEZ, J. C. C. ; OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, L. C. J. . HIV1-RESTOOL. 2012.

ARAUJO, T.H.A. ; SOUZA-BRITO, L. I. ; Libin, P. ; Deforche, K. ; ALCANTARA, L. C. J. . HTLV-1 Molecular Epidemiology database. 2011.

ALCANTARA, L. C. J. ; Deforche, K. ; Libin, P. ; OLIVEIRA, T. . Virus Genotyping Tools. 2009.

ALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. . Desenvolvimento de um software para análise filogenética do HTLV-1 on-line e de acesso livre. 2006.

ALCANTARA, L. C. J. . Projeto Zibra permite sequenciamento de 54 genomas do vírus zika. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

ALCANTARA, L. C. J. . Nature Podcast. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Alcantara, L.C.J. ; LOMAN, N. J. . ZIBRA. 2016. (Blog).

ALCANTARA, L. C. J. . Tópicos Avançados em Bioinformática. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Curso de Pos Graduação em Biotecnologia em Saúde E medicina Investigativa (PgBSMI). 2014. (Vice-Coordenador).

ALCANTARA, L. C. J. . Curso de Pós Graduação em Patologia Humana e Experimental. 2014. (Membro Permanente).

ALCANTARA, L. C. J. . Comité de Etica em Pesquisa. 2014. (Membro).

ALCANTARA, L. C. J. . Algorítmos utilizados para alinhamento e edição de sequências de nucleotídeos e aminoácidos utilizando os programas ClustalX, BioEdit, Dambe, GenDoc, etc, no 14th International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology. 2008. .

ALCANTARA, L. C. J. . Introduzione alle tecniche di bioinformatica per analisi epidemioligico-molecolari. 2007. .

ALCANTARA, L. C. J. . Radicais Livres em Patologia Humana. 2007. .

ALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. ; GALVAO-CASTRO, B. . Capacitação em Bioinformática para pesquisa em HIV-AIDS:. 2007. .

ALCANTARA, L. C. J. . Radicais Livres em Patoligia Humana (Formação em Oertomolecular). 2006. .

ALCANTARA, L. C. J. . Treinamento para utilização da Database HIV-Bae. 2005. .

ALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. . The Bioinformatics Tools for viral sequence analysis. 2005. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Bioquímica dos Radicais Livres em Patologia Humana. 2005. .

ALCANTARA, L. C. J. . 10th International Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology - Advanced Module. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

ALCANTARA, L. C. J. . The Brazilian AIDS program data. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . HIV Data Management and Data Mining for Antiretroviral Drug Resistence Workshop. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Alinhamento de sequência gênicas utilizando os programas DAMBE, BIOEDIT, CLUSTALX e GENEDOC, e análise filogenética utilizando os programas PHYLIP e TREE-PUZZLE. 2004. .

ALCANTARA, L. C. J. ; FERNANDES, F. M. . Phylogenetic tree interpretation. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

ALCANTARA, L. C. J. . Aplicação da Bioinformática no Estudo Viral. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

ALCANTARA, L. C. J. . Fologenia de Retrovirus. 2003. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Métodos de Investigação da patogênese viral 4: análise filogenética. 2003. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

ALCANTARA, L. C. J. . VIII EUROPEAN WORKSHOP ON VIRUS EVOLUTION AND MOLECULAR EPIDEMIOLOGY, Leuven-Bélgica.. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. . Radicais Livres em Patologia Humana. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Análise filogenética de Retrovírus. Realizado na Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto-SP. 2000. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

ALCANTARA, L. C. J. . Development of the LASP HTLV-1 Automed Subtyping Tool. 2006 (Cientista Visitante) .

ALCANTARA, L. C. J. . Training in the HIV-Base Database. 2005 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . Investigação das Mutações C282Y e H63D no gene da Hemocromatose Hereditária Clássica (HFE) em Recém - Nascidos e em Portadores de Anemia Falciforme de Salvador - Bahia. 2004 (Revisor de Tese de Mestrado) .

ALCANTARA, L. C. J. . Trabalho experimental realizado no laboratório e unidade de bioinformática da Escola de Medicina da Universidade de Natal-Durban-África do Sul. 2004 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . VIII European Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology. 2004 (Professor Assistente) .

ALCANTARA, L. C. J. . Training in the HTLV/HIV Bioinformatics Tools. 2002 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . Análise filogenética de retrovírus (Rega Instituto para Pesquisas Médicas, Universidade Católica de Leuven, Bélgica). 2001 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . Análise filogenética de retrovírus (Rega Instituto para Pesquisas Médicas, Universidade Católica de Leuven, Bélgica). 2000 (Estágio no exterior (Coordenado pela Dra. Anne-Mieke Vandamme)) .

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Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    Diagnóstico das arboviroses humanas baseado no sequenciamento diferencial de terceira geração, Descrição: Desenvolver um diagnóstico molecular de arboviroses baseado no sequenciamento diferencial, utilizando a tecnologia de sequenciamento de terceira geração do minION, para ser utilizado nos laboratórios de referências para arboviroses da Secretaria de Vigilância em Saúde do Ministério da Saúde (SVS/MS). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Marta Giovanetti - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / ANA BISPO DE FILIPPIS - Integrante / FABRI, ALLISON - Integrante / Flavia levi - Integrante., Financiador(es): Fundação Oswaldo Cruz - Auxílio financeiro.

  • 2019 - Atual

    Monitoramento genômico dos vírus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela e detecção precoce de potenciais vírus emergentes no Brasil, Descrição: o presente estudo tem como objetivos entender a dinâmica da disseminação espaço-temporal dos vírus Zika, Chikungunya, Dengue e Febre Amarela (ZIKV, CHIKV, DENV, YFV) circulantes e co-circulantes no Brasil; definir os possíveis determinantes envolvidos em sua dispersão e/ou desfechos clínicos; e identificar vírus emergentes em potencial por metagenômica. Os dados genômicos gerados neste projeto permitirão ao Ministério da Saúde e às Secretárias de Vigilância Epidemiológica ampliar a compreensão da disseminação geográfica e temporal dos arbovírus circulantes no país. Dessa forma, será possível adotar medidas adequadas para controlar epidemias, monitorar a dinâmica e a disseminação de novas estirpes virais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (3) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Marta Giovanetti - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / ANA BISPO DE FILIPPIS - Integrante / FABRI, ALLISON - Integrante / FRAGA DE OLIVEIRA TOSTA, STEPHANE - Integrante / Flavia levi - Integrante., Financiador(es): Organizacão Pan-Americana da Saude/Organizacão Mundial da Saude - Auxílio financeiro.

  • 2018 - Atual

    FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS DE GENOTIPAGEM PARA ARBOVÍRUS ASSOCIADAS AO SOFTWARE GENOME DETECTIVE DANDO SUPORTE A VIGILÂNCIA DAS ARBOVIROSES NO BRASIL, Descrição: O Genome Detective é um pipeline baseado na web, e de livre acesso, que permite que dados NGS brutos sejam montados em genomas virais completos de novo de maneira rápida e precisa. Assim, torna-se necessário darmos amplitude ao software Genome Detective, permitindo ao mesmo identificar dados brutos (input) provenientes da mais nova tecnologia de sequenciamento baseada em nanoporos, denominada minION, cujo pipeline ainda é muito complicado para o usuário, fornecendo a este não só os datasets das sequências geradas e montadas no formato fasta, mas também os datasets das sequências dos reads, com cobertura ampla ou parcial, além de todos os resultados, tipagem, genotipagem, total de reads, porcentagem de cobertura, etc. Torna-se também necessária ampliarmos as ferramentas de genotipagem para arbovírus. Pois até o momento só existem quatro. E para ampliarmos esta genotipagem, será necessário gerarmos mais genomas completos de outros arbovírus circulates no nosso país e nos nossos países vizinhos, bem como nos países vizinhos destes nossos países vizinhos. Isto faz com este processo seja de extrema importância para a vigilância das arboviroses nos Brasil, pois contribuiremos com o MS e OMS na vigilância de arbovírus que estão silenciosos e possam ser possíveis agentes de surtos futuros. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Vagner Fonseca - Integrante / DE OLIVEIRA, TULIO - Integrante / FABRI, ALLISON - Integrante / Flavia levi - Integrante / Alvaro Salgado - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2016 - Atual

    Estudo da interação microrganismo-hospedeiro: Diversidade Genética e Patogenicidade do ZIKV x Hospedeiro, Descrição: A disseminação rápida do vírus Zika (ZIKV) em um país tropical como o Brasil, onde o vírus da Dengue já se tornou endêmico, exige uma resposta urgente, dada a emergência em saúde pública que se instalou nos últimos meses. Sendo um patógeno emergente e ainda pouco conhecido, fatores relacionados à interação microrganismo-hospedeiro não são completamente conhecidos. Estudos prévios sugerem a possível associação do ZIKV com efeitos deletérios potenciais sobre o feto em mulheres grávidas e, portanto, a identificação rápida da espécie e genótipo do vírus replicante, assim como a compreensão dos mecanismos infecciosos e patogênicos do ZIKV são fundamentais para o esclarecimento da relação entre o vírus e o hospedeiro. Atualmente há uma escassez de sequências genômicas completas do ZIKV, impedindo tentativas para determinar as suas origens, epidemiologia e base genômica para a microcefalia e outras doenças relacionadas. Portanto, o sequenciamento do genoma completo viral permitirá o monitoramento da diversidade viral e o entendimento do surgimento e espalhamento desta epidemia. Além disso, com esses resultados será possível identificar cepas com maior potencial epidêmico e avaliar genótipos que possuam maior poder de cobertura pelas vacinas potenciais. Faz-se necessário também avaliar os mecanismos de infecção viral. Aqui propomos, através de ensaios in vitro, identificar a taxa de infecção do ZIKV, a localização das proteínas virais e a possível co-localização de proteínas do ZIKV com proteínas motoras. Visando melhor entendimento do comportamento viral, torna-se de extrema importância além da avaliação das características genéticas e patogênicas avaliar fatores relacionados ao hospedeiro, uma vez que estes podem auxiliar no estabelecimento de uma associação definitiva entre o ZIKV e as pressupostas consequências clínicas. Sabe-se que apesar de haver evidências de uma possível associação causal da exposição ao ZIKV com a Síndrome de Guillain-Barré e com defeitos congênitos, ainda não há evidências definitivas referentes a estas associações. Assim, propomos a investigação clínica e genética dos pacientes com diagnóstico confirmado ou com história sugestiva de infecção pelo ZIKV, com ênfase para o envolvimento neurológico, como a Síndrome de Guillain-Barré e a microcefalia.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (3) / Mestrado acadêmico: (9) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Espreafico, E. M. - Integrante / Oliveira, Antonio Marcos - Integrante / Acosta, Angelina Xavier - Integrante / Marcio Roberto T Nunes - Integrante / AMARANTE, MARIA F C - Integrante / Elisângela Vitória Adorno - Integrante / BARRETO, FERNANDA KHOURI - Integrante / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante / DE SOUZA GONÇALVES, MARILDA - Integrante / ARAÚJO, THESSIKA HIALLA ALMEIDA - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / Erenilde Marques de Cerqueira - Integrante / MAIA DE LIMA, MARICÉLIA - Integrante / DO ROSÁRIO, MATEUS SANTANA - Integrante / Maria Inés Restovic - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Murilo Freire - Integrante / MAFFILI, VITOR V. - Integrante / DE OLIVEIRA, TULIO - Integrante / AMOUSSA, ADJILE EDJIDE ROUKIYATH - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / Isadora Cristina de Siqueira - Integrante / Luiz Antônio Rodrigues de Freitas - Integrante / Cristina Borges Goes - Integrante / Ana Rita Queiroz Ferraz - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / Paloma Viana da Silva - Integrante / Melina Mosquera Navarro Borba - Integrante / Daiana Carlos dos Santos - Integrante / Carlos Letacio S. L. da Silva - Integrante / Marcela Câmara Machado Costa - Integrante / Fernanda Washington de Mendonça Lima - Integrante / Cynara Gomes Barbosa - Integrante / Fabiana Porto - Integrante / Tacyane Cardoso Santos da Silva Paim - Integrante / Célia Maria Stolze Silvany - Integrante / Antonio Marcos dos Santos - Integrante / Daniele de Araújo Freitas - Integrante / Helen Regina Silva Sodre - Integrante / Karoline Brito Caetano Andrade Coelho - Integrante / Julia Gonçalves Carvalho Montenegro - Integrante.

  • 2016 - Atual

    ZIKAlliance - A Global Alliance for Zika Virus Control and Prevention, Descrição: Major tasks are ahead of the scientific and public health community and need urgent resolution, in particular: ? the assessment of the scale of the problem absolute and relative risk of fetal damage in relation to time of infection during pregnancy, and postnatally; ? understanding the natural history of the infection at different scales from cellular mechanisms to human infection and circulation of the virus in the environment. These are essential prerequisites to the development of modes of prevention or treatment, to the assessment of the socioeconomic and disability burden of the disease, and to the implementation of informed public health decisions to reduce disease burden and the risk of further spread of the pandemic. The threeyear multidisciplinary ZIKAlliance project will link large observational multicentre cohort studies with basic scientific research to address the above questions, (i) with longstanding shared work experience on arboviral diseases in basic, clinical and applied sciences; (ii) with an established network of clinical cohorts currently studying Dengue Fever in Latin America & the Caribbean; (iii) guided by the principles of One Health approach to respond to the challenges of vectorborne epidemics.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / BARRETO, FERNANDA K - Integrante / AMARANTE, MARIA F C - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / MAIA DE LIMA, MARICÉLIA - Integrante / AMOUSSA, ADJILE EDJIDE ROUKIYATH - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / Isadora Cristina de Siqueira - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante.

  • 2016 - Atual

    ZIBRA 2: Análise em Tempo Real, no Brasil, do Vírus ZIKA: Segunda etapa, Descrição: No grupo das doenças infecciosas emergentes e re-emergentes, os arbovírus transmitidos por mosquitos, como Dengue (DENV), Chikungunya (CHIKV) e Zika (ZIKV), são considerados importantes desafios para a saúde pública. Além do cenário causado pelo DENV, endêmico em quase todo o país e responsável por epidemias há décadas, a introdução do CHIKV e principalmente do ZIKV no Brasil traz preocupação quanto aos desafios em saúde pública. Os arbovírus são transmitidos por mosquitos do gênero Aedes, particularmente Ae. Aegypti. As doenças causadas pelos arbovírus estão associadas a grandes epidemias e um consequente aumento dos custos financeiros relacionados ao diagnóstico e ao tratamento. O diagnóstico clínico é considerado complexo devido a semelhança clínica com outras doenças, a presença de doença clinicamente assintomática ou oligossintomática, dificuldade de acesso aos laboratórios de referência que podem realizar um diagnóstico molecular e/ou sorológico diferencial e reações sorológicas cruzadas, especialmente em regiões endêmicas. Uma grande epidemia do ZIKV está em curso na América Latina, e há evidências de uma associação entre esta infecção e microcefalia em recém-nascidos e síndrome de Guillain-Barré em adultos. Devido a escassez de sequências genômicas completas deste vírus, recentemente realizamos o sequenciamento em tempo real de 156 isolados do ZIKV provenientes de um projeto piloto, financiado pela Medical Research Council (MRC-Inglaterra), para dar suporte a quatro LACENs do Nordeste do Brasil no diagnóstico molecular desta infecção. Neste novo projeto, propomos estender o suporte ao diagnóstico a 23 LACENs do país, resultando na caracterização genética e evolutiva das cepas circulantes desse flavivírus nas diferentes regiões geográficas do Brasil, buscando o melhor entendimento das cadeias de transmissão e suas características, traçando a origem e a disseminação dessas infecções no Brasil. Assim, a identificação e a caracterização das cepas circulantes permitirão a procura de associação entre o perfil genético das cepas, o perfil clínico e epidemiológico dos indivíduos infectados e a história epidemiológica da infecção; além de ser muito importante para o desenvolvimento de novas técnicas diagnósticas e modelos vacinais. Os resultados deste projeto trarão novos conhecimentos sobre a patogênese molecular deste vírus e permitirão a identificação de marcadores moleculares e possíveis alvos terapêuticos, com a perspectiva de novas abordagens imunoterapêuticas diferenciais. Além disso, o estudo combinado dos dados epidemiológicos com os dados de genômica evolutiva e estrutural nos possibilitará investigar melhor a interação microrganismo-hospedeiro humano e microrganismo-vetor para estabelecer uma base de dados sobre a infecção aguda e suas consequências.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / CUNHA, JOANA P M - Integrante / Maria Fernanda de Castro-Amarante - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / MAIA DE LIMA, MARICÉLIA - Integrante / DO ROSÁRIO, MATEUS SANTANA - Integrante / Maria Inés Restovic - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Murilo Freire - Integrante / DE OLIVEIRA, TULIO - Integrante / AMOUSSA, ADJILE EDJIDE ROUKIYATH - Integrante / ARAUJO, THESSIKA HIALLA A - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / Ana Rita Queiroz Ferraz - Integrante / Jéssica Costa da Silva Sena - Integrante / Joilson Xavier dos Santos Junior - Integrante / Paloma Viana da Silva - Integrante / Melina Mosquera Navarro Borba - Integrante / Daiana Carlos dos Santos - Integrante / Carlos Letacio S. L. da Silva - Integrante / Eddy Oliveira - Integrante / Antônio Carlos dos Santos - Integrante / Siane Campos de Souza - Integrante.

  • 2016 - Atual

    Zika: Open genomic surveillance of Zika virus in Brazil using a novel portable real-time sequencing device, Descrição: Este é um projeto itinerante de investigação molecular dos genótipos do ZIKV circulantes em 10 cidades do Brasil (Salvador, Aracaju, Recife, Maceio, João Pessoa, Natal, Fortaleza, Terezina, São Luis e Belém). Adaptamos um trailer, cedido pela Instituição Evandro Chagas do Pará (com motorista), para funcionar como um laboratório móvel, onde serão realizados os seguintes experimentos: extração de RNA (robô extrator cedido pela QIAGEN), qPCR em tempo real multiplex, para os três arbovírus circulantes, DENV, CHIKV e ZIKV), e sequenciamento da região do envelope do ZIKV. As amostras que serão utilizadas foram disponibilizadas pelo Ministério da Saúde. O mínimo de amostras ZIKV+ previstas para sequenciamento do envelope serão 800. Vamos utilizar o sequenciador Oxford NanoporeMinIon portátil com capacidade de sequenciamento de até 12 amostras em uma única corrida, que emprega 9 amplicons sobrepostos e podendo gerar genótipos precisos com cobertura de > 99,7% do gene de interesse. As atividades terão inicio em Salvador no inicio da segunda quinzena de maio/2016 e permanecerá por 45 dias, encerrando em Belém. A FIOCRUZ-Bahia fornecerá um ônibus com dois motoristas para transporte dos participantes. Este sequenciador já foi adquirido neste projeto, e no final deste um ficará na FIOCRUZ-Bahia (LHGB-CPqGM) e outro do Instituto Evandro Chagas, Pará.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (4) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / O G Pybus - Integrante / Marcio Roberto T Nunes - Integrante / FARIA, N. R. - Integrante / Miles Carroll - Integrante / Edward Holmes - Integrante / Paul Klenerman - Integrante / Matt Loose - Integrante / Andrew Rambaut - Integrante / Jared Simpson - Integrante / Nicholas James Loman - Integrante., Financiador(es): Medical Research Council - London - Auxílio financeiro.

  • 2015 - Atual

    Caracterização Genômica do HTLV-1 e Transcriptômica de Pacientes Infectados, Descrição: O HTLV-1 é conhecido por ser o agente etiológico da paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV (HAM/TSP). Esta doença é caracterizada como uma doença neurológica crônico-degenerativa que atinge o sistema nervoso central. Porém, muitos pacientes permanecem assintomáticos para HAM/TSP e ainda não se sabe o que determina a manifestação de doença em alguns indivíduos. Vale ressaltar que ainda não existe um tratamento específico e eficaz contra essa infecção. Assim, o entendimento dos fatores virais e do hospedeiro que levam à permanência no estado assintomático ou ao desenvolvimento da doença neurológica torna-se importante para o desenvolvimento de vacinas e terapias necessárias. O presente projeto tem como objetivo realizar uma análise de interatoma, ou seja, avaliar todas as interações moleculares (genes e proteínas) na célula. Inicialmente, serão caracterizados os genomas completos do HTLV-1 oriundos de indivíduos da Bahia, com diferentes formas clínicas, além de informações epidemiológicas e da carga proviral destes indivíduos. Em seguida, será realizada a análise de expressão gênica (transcriptoma) do hospedeiro. Para alcançarmos este objetivo, utilizaremos análises dos SNPs nas distintas regiões gênicas das diferentes populações obtidas nas análises de pirosequenciamento e, junto com os resultados das análises de microarranjo, utilizaremos ferramentas de bioinformática para data mining, data management e análises de redes neurais. Os estudos que associam as análises genômicas e transcriptômicas, sendo a primeira relacionada ao vírus e a segunda mais especificamente ao hospedeiro, poderão favorecer na construção do conhecimento a cerca da patogenicidade viral, identificando uma assinatura gênica que determine o desenvolvimento ou não da doença.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Luciane Amorim Santos - Integrante / AMARANTE, MARIA F C - Integrante / BARRETO, FERNANDA KHOURI - Integrante / GIOVANETTI, MARTA - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / ARAUJO, THESSIKA HIALLA A - Integrante / DE JESUS, JAQUELINE GOES - Integrante / ALINE DÓREA LUZ MENEZES - Integrante / ANTONIO DE SOUZA ANDRADE FILHO - Integrante / BARBARA SOUZA DE ARAÚJO - Integrante / MARCIA WEBER CARNEIRO - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2015 - Atual

    Estudo da Diversidade Genética e História Evolutiva do vírus Chikungunya, bem como co-evolução com outros arbovirus humanos no semiárido baiano e na região metropolitana de Salvador, e caracterização clínica/epidemiológica/hematológica dos indivíduos infe, Descrição: Neste projeto inicialmente pretendemos implantar a técnica de PCR em tempo real, diferencial entre o CHIKV, DENGUE e ZIKA, para dar como suporte ao diagnóstico mais preciso desta infecção pelo CHIKV. Seguiremos com a caracterização genética e evolutiva das cepas circulantes, para assim, através de programas de bioinformática, traçarmos a origem e a disseminação desta infecção no Brasil e testarmos a hipótese do relógio molecular durante a distribuição geográfica da epidemia do CHIKV, durante a onda de epidemias. Pretendemos também conhecer melhor o perfil genético da população infectada com maior agrave da doença. Avaliaremos as alterações no perfil hematológico, bioquímico, imunológico e inflamatório destes pacientes triados para anemia falciforme e infectados pelo CHIKV, associando ao perfil fenotípico, histórico clínico, marcadores clássicos de prognóstico na anemia falciforme e o genótipo do vírus envolvido. Os processos infecciosos (como pelo CHIKV) emergem como fatores de risco para pacientes com anemia falciforme pela modulação de citocinas, aumento do estresse oxidativo e predisposição a eventos oclusivos. O curso clínico de pacientes com infecções virais podem cursar com eventos de dor, síndrome torácica aguda, alterações ósseas e úlcera de perna (Neto et al., 2011; George et al., 2011). No mais, finalizaremos este projeto, com a mineração e organização dos dados obtidos, provenientes do vírus e do hospedeiro, para desenvolvimento de um banco de dados e de um software (CHIKV Genotyping Tool) de livre acesso para genotipagem do CHIKV, como os que já desenvolvemos anteriormente para vários vírus, como o HIV-1, o HTLV-1, o HCV, o HBV, o HHV8 e o HPV [Alcantara et al., 2009; Araujo et al, 2012], que estará hospedado no servidor do CPqGM e da UEFS e disponibilizado com livre acesso na WEB. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Marcio Roberto T Nunes - Integrante / Marta Giovanetti - Integrante / Elinalva Maciel Paulo - Integrante / Erenilde Marques de Cerqueira - Integrante / Maricélia Maia de Lima - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2014 - 2014

    2o Workshop Internacional de Bioinformática sobre Evolução Viral e Epidemiologia Molecular 2014, Descrição: A Filogenia molecular e genética populacional são técnicas estabelecidas com importância para a compreensão de epidemias e dinâmicas virais. Por exemplo, a análise filogenética tem sido utilizada até o momento para explicar a origem do HIV-1 e HIV-2 e suas epidemias em humanos, para estudar a epidemiologia molecular da gripe em aves selvagens e suas conexões com pandemias humanas, assim como estudar a epidemiologia molecular de muitos outros vírus. Muitos dos trabalhos envolvendo estas técnicas estão sendo publicados em revistas internacionais de alto impacto. Novos métodos de mineração de dados estão se tornando cada vez mais importantes para organizar e explorar a enorme quantidade de dados de sequências de vírus que foi gerado nos últimos anos. Por exemplo, a mineração de dados é extremamente importante para o estudo das respostas às terapias antivirais. Além disso, a combinação da mineração de dados com análises filogenéticas permitem uma melhor compreensão do comportamento dos diversos vírus. A utilização destes métodos já foi aplicada ao estudo de mutações de resistência às drogas e tais técnicas podem ser aplicadas a muitos outros campos de pesquisa de vírus. 2. Detalhes sobre o Workshop O Workshop Internacional sobre a utilização da Bioinformática para estudos de Evolução e Epidemiologia Molecular dos vírus foi organizado nos últimos 17 anos pela Profa. Anne-Mieke Vandamme, do Laboratório de Virologia Clínica e Epidemiologia da Katholieke Universiteit Leuven (Rega Institut), Bélgica, e desde 2003 viaja ao redor do globo (http://regaweb.med.kuleuven.be/workshop). Este workshop está dividido em três módulos: Básico, análises filogenéticas avançadas e Mineração de Dados. Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 20 por módulo) só poderão candidatar-se a um dos módulos. Todos os módulos conterão aulas teóricas e práticas (cerca de 50/50). Haverá também tempo reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de pôster, pa. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / AnneMieke Vandamme - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2014 - Atual

    Desenvolvimento de uma Ferramenta de Filotipagem do Vírus da Dengue, Descrição: Devido à história evolutiva do Vírus da Dengue (DENV), a variabilidade genética entre os sorotipos é grande e incomum, no entanto, a variabilidade genética intra-sorotípica é menor e dá origem aos subtipos ou genótipos, como são denominadas, a partir de um critério arbitrário, as cepas que divergem acima de 6% nas suas sequências nucleotídicas. Estudos recentes demonstram que a diversidade dos DENVs está aumentando, assim como, a virulência diferencial das cepas virais e, como consequência, no futuro nós poderemos estar expostos a vírus com uma gama maior de propriedades patogênicas. Por esse motivo, torna-se importante compreender o processo que gera a variabilidade genética em populações naturais de DENV. A completa caracterização filogenética dos vírus da dengue permitirá o monitoramento da transmissão de genótipos e filotipos virais associados ao aparecimento e/ou aumento de casos graves da doença, bem como contribuirá na identificação de áreas de alta diversidade viral e padrões de fluxo gênico. As ferramentas de bioinformática são fundamentais para acompanhar a evolução da diversidade viral, dando suporte aos estudos de análise de sequências genômicas sendo crucial para a vigilância do polimorfismo viral, no desenvolvimento de novas estratégicas terapêuticas, no desenvolvimento de produtos vacinais ou na escolha adequada destes produtos. O único programa de bioinformática, de livre acesso, utilizados para classificação do perfil genético dos subtipos/genótipos/subgrupos/grupos dos DENVs se baseia no emprego de ferramentas de procura de similaridade (BLAST, por exemplo) para determinar o genótipo de uma nova sequência (http://www.viprbrc.org/brc/viprTutorials.spg?decorator=flavi_dengue). A nova ferramenta proposta para o vírus da Dengue, que será desenvolvida utilizando a mesma metodologia destas sete últimas ferramentas, deixará de ser somente um software para classificação de genótipos/subtipos/subgrupos e permitirá também ao usuário a obtenção do filotipo viral, isto é, uma genotipagem baseada em sequências referências do genoma total ou somente do envelope, contendo informações epidemiológicas e filogeográficas, datas das epidemias observadas nos últimos 20 anos no mundo. Portanto, será um programa contendo um banco de dados de sequências referências representativo. Após o desenvolvimento da ferramenta, pretendemos testar a eficiência da mesma analisando sequências disponíveis no GenBank e liberaremos a utilização para testagem, aos colaboradores neste projeto que possuem novas sequências do vírus da dengue e ainda não publicadas, assim como são especialistas em genotipagem viral.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Luciane Amorim Santos - Integrante / Jose Pereira Moura Neto - Integrante / DE SOUZA GONÇALVES, MARILDA - Integrante / ARAÚJO, THESSIKA HIALLA ALMEIDA - Integrante / Maria Inés Restovic - Integrante / Vagner Fonseca - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante / Bruna de Sousa Carvalho Reis - Integrante / Bruno Antonio Veloso Cerqueira - Integrante.

  • 2014 - Atual

    Desenvolvimento de ferramenta didática para avaliação de fatores de risco e prevenção de agentes causadores de doenças sexualmente transmissíveis (HIV-1/HTLV-1), Descrição: EDITAL PPSUS: Este estudo objetiva desenvolver uma ferramenta web para avaliar a evolução do conhecimento de jovens e adolescentes residentes em áreas de risco para as infecções causadas pelo HIV-1 e HTLV-1 na cidade. O estudo caracterizar-se-á por ser uma coorte de intervenção prospectiva, composta por 25 educadores, que irão participar das etapas de identificação dos fatores de risco e avaliação do nível de conhecimento acerca da infecção pelo HIV/HTLV. A execução do mesmo se dará no Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz (CPqGM) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) e na sedes do projeto parceiro Adolescente Aprendiz, situadas nos bairros do Pau Miúdo e Rio Vermelho. Este estudo trará como contribuição no desenvolvimento de um banco de dados e de um algoritmo capaz de contabilizar o número de acessos ao conteúdo disponibilizado pela ferramenta; e a organização estatística das informações provenientes do mesmo. Além disso, prevê-se a elaboração de material lúdico/didático (impressos e audiovisuais) a ser disponibilizado para ações de promoção da saúde do Serviço Único de Saúde (SUS) e caracterização do nível de conhecimento acerca da infecção por retrovírus humanos em áreas de risco. Espera-se também, propor novas medidas de promoção da saúde mais específicas para jovens e adolescentes residentes nessas áreas. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Carlos Brites - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Marilda Souza Gonçalves - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2014 - Atual

    INTERAÇÃO ENTRE OS PRODUTOS DAS ORFs I E IV DO HTLV-1 COM AS PROTEÍNAS DO CITOESQUELETO MIOSINA Va E PAXILINA RESPECTIVAMENTE, Descrição: Pela análise das estruturas primarias de p12I/p8I e da Paxilina, hipotetiza-se que não há interação física entre elas, entretanto a presença de regiões ricas em prolina em ambas as proteínas, e pelo fato da Paxilina ser um dos componentes das adesões focais, sugere que elas participem do complexo de polarização do citoesqueleto no momento do contato e transmissão do HTLV-1 célula-célula. Como a Paxilina está mais expressa em indivíduos TSP/HAM, é possível que a expressão da proteína Tax, transativador viral, interfira na expressão de Paxilina. Assim o estudo inicial da possível interação entre essas proteínas é importante para melhor compreensão da significância do aumento de expressão da Paxilina em indivíduos com TSP/HAM. Por outro lado, acredita-se que a miosina Va esteja envolvida no tráfego de p8I partindo de Golgi até a membrana plasmática. Considerando que p8I exerce importante função na transmissibilidade viral, participando ativamente da sinapse virológica e da formação dos conduítes celulares, o estudo das interações proteicas que contemplam o mecanismo de transporte desta proteína, desde sua formação até seu sítio de atuação, pode estabelecer um ponto inicial para a elucidação desta via, além de sugerir possíveis alvos terapêuticos para redução da infectividade, e transmissibilidade viral, e consequentemente, um controle da disseminação do vírus nos indivíduos infectados. Assim, pretendemos avaliar a interação entre os produtos das ORFs I e IV do HTLV-1 com as proteínas do citoesqueleto Paxilina e Miosina Va, respectivamente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Simone Kashima - Integrante / Maria Fernanda Castro-Amarante - Integrante / Jaqueline Goes de Jesus - Integrante / Marilda Souza Gonçalves - Integrante / Maria Enilza Espreafico - Integrante.

  • 2013 - 2013

    WORKSHOP INTERNACIONAL DE BIOINFORMÁTICA SOBRE EVOLUÇÃO VIRAL E EPIDEMIOLOGIA, Descrição: O workshop está dividido em dois módulos: Análises Básicas de Bioinformática, Análises filogenéticas Avançadas. Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 25 por módulo) só podem candidatar-se a um dos módulos. Todos os módulos contem aulas teóricas e práticas (cerca de 50 alunos num total). Possui também um tempo reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão de pôster, para discutir e analisar os seus conjuntos de dados com os professores e discutir possíveis colaborações entre os alunos e professores. O curso terá a duração de cinco dias. Para nosso conhecimento, nenhum outro curso semelhante é organizado mundialmente, contendo teoria e aplicações práticas de técnicas de bioinformática, aplicados aos estudos de evolução viral, e aberto a um fórum internacional de estudantes de mestrado e doutorado, jovens pesquisadores, e até mesmo aos pesquisadores seniores. Salientamos que não haverá custo de inscrição no Workshop, e das 50 vagas, 80% serão destinadas preferencialmente a brasileiros e as vagas restantes para estrangeiros, tendo preferência inscritos da América Latina. Os alunos que participam deste workshop são convidados a submeter um resumo, e apresentam o seus trabalhos na forma de poster. Assim, estes alunos terão a oportunidade de discutir o trabalho de pesquisa que eles apresentaram com os professores e outros alunos. Depois da oficina, e tendo em consideração os comentários e discussões recebidos no workshop sobre o seu trabalho, cada aluno terá o seu resumo publicado na IGE (Infection, Genetics and Evolution, uma revista do grupo Elsevier que tem a Dra. Anne-Mieke Vandamme no Editorial Board) numa edição regular, mas inteiramente dedicado ao Workshop, e também terá um tempo para melhorar a qualidade do seu trabalho, sendo então convidado a submeter um artigo, a esta mesma revista científica, que sempre publicou (dos workshops anteriores) e os trabalhos dos alunos apresentados na forma de poster durante o works. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / AnneMieke Vandamme - Integrante / Tulio de Oliveira - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante / Paula Carvalhal Lage von B. Ristow - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2013 - Atual

    The tale of two interlinked epidemics: The origin and clinical relationship of the African and Brazilian HIV-1 and HTLV-1 epidemics, Descrição: This project will use genomics and bioinformatics to further study the origin of the Brazilian and South African Human Immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and Human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1). In addition, it will study co-infected individuals, as there is growing evidence that HIV-1 and HTLV-1 co-infection affects the course of the AIDS disease. This project is built on a long-standing collaboration between two Brazilian researchers, Dr. Luiz Carlos Junior Alcantara from F CPqGM/FIOCRUZ Foundation and Dr. Tulio de Oliveira from the Africa Centre for Health and Population Studies, Nelson Mandela School of Medicine. This partnership has already given rise to a number of peer-reviewed publications, the graduation of post-graduate students and training workshops in Brazil. At present, the two researchers are co-supervising a PhD student from Brazil. This project, if funded, will allow this successful collaboration to continue and a Brazilian researcher (Dr. Tulio de Oliveira) living outside the country to continue to contribute to local research and the training of post-graduate students in Brazil. Previous results of this collaboration: One of the reasons why we believe that this exchange project will be successful is due to the previous results that have been produced by this collaboration. The collaborators have been working together since 2001. During this time, Dr. Tulio de Oliveira has been based in Durban and Cape Town, South Africa and in Oxford, the U.K., whereas Dr. Luiz Carlos Alcantara has been based in Salvador, Brazil and in Washington, the U.S.A. They have made many exchange visits. They have also produced many collaborative publications on the study of the origin of the HIV-1 and HTLV-1 epidemics in Brazil, which will be one of the topics to be studied in this project. For example, they have shown that HTLV-1 strains from South Africa (sampled and produced during a visit by Dr. Alcantara to the Dr. de Oliveira group in 2005) are directe. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Tulio de Oliveira - Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2014

    Avaliação da história epidemiológica da infecção pelo HIV-1 no estado da Bahia - Brasil, Descrição: Estudo de coorte transversal com amostragem de conveniência que avaliará amostras sanguíneas de pacientes, no período de 1 de Março de 2012 à 31 de Setembro de 2012. A população do estudo será formado por pacientes com idade igual ou superior à 18 anos, soro-reagentes para HIV-1 sem uso de Terapia Antirretroviral (TARV), que após assinarem termo de consentimento livre, respondam a questionário epidemiológico e permita a coleta de 10 ml de sangue para o estudo. A amostra para o estudo será obtida durante coleta sanguínea, no Laboratório de Retrovírus do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa, para realização de carga viral do HIV ou estudo das subpopulações linfocitárias. O questionário epidemiológico será preenchido pelo pesquisador e equipe, esse o documento conterá informações sobre identificação, data de nascimento, gênero, data do diagnóstico do HIV-1, uso de TARV, provável forma de aquisição, orientação sexual e discordância sorológico dos parceiros atuais. Será descartado aleatoriamente 1 das amostras de pacientes com concordância sorológica entre parceiros ou transmissão vertical. O projeto e o termo de consentimento livre e esclarecido será submetido, previamente a qualquer fase do estudo, ao Comitê de Ética em Pesquisa da Fundação Gonçalo Muniz, do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa.A extração do DNA das amostras usará o kit de extração QIAmp Blood Kit (Qiagen Inc., Valencia, CA, USA) segundo protocolo do fabricante. Os genes pol e env serão amplificados através da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os produtos das PCR serão purificados e posteriormente sequenciados. Os objetivos são: Caracterizar a epidemiologia molecular do HIV-1 na Bahia através de estudos evolutivos nos genótipos B, F e formas recombinantes BF, buscando inferir a história evolutiva deste retrovírus na nossa população. Estimar a taxa evolutiv. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Carlos Brites - Integrante / Genoveffa Franchini - Integrante / Erika Andrade - Integrante / Marcio Oliveira Silva - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2013

    Banco de Dados sobre o HTLV-1/paciente infectado, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Tulio de Oliveira - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Antonio Eduardo de Albuquerque-Junior - Integrante.

  • 2012 - Atual

    ?Implantação e Consolidação do Centro Integrado de Biodesenvolvimento da Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública no Parque Tecnológico da Bahia, Descrição: Luiz Alcantara coordena um subprojeto, especificamente ?Utilização do HTLV-2 Pseudotipado como Vetor Vacinal contra a Infecção pelo HTLV-1?. O presente projeto faz parte do esforço da Secretaria de Ciência, Tecnologia e Inovação do Estado da Bahia ? SECTI, através do Parque Tecnológico da Bahia, para implantação dos Laboratórios Compartilhados dos Equipamentos Dinamizadores, que serão consolidados na segunda etapa do Parque. Neste esforço, composto por dez plataformas agregadas que integram parceiros públicos e privados operando em conjunto, tem como objetivo comum o fortalecimento da rede de pesquisa nas áreas de Biotecnologia e Saúde do Estado.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Maria Luisa Carvalho Soliani - Coordenador / Luiz Erlon Araujo Rodrigues - Integrante.

  • 2012 - Atual

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Bioinformática é a coleção, organização e análise de grandes quantidades de dados biológicos utilizando uma rede de computadores e bancos de dados. Implica na análise de seqüências de genes e seus produtos (proteínas), mas o campo tem sido expandido para a gerência, processamento, análise e visualização de grandes quantidades de dados genômicos, proteômicos, triagem de drogas e química medicinal. Hoje a bioinformática já é considerada uma ciência, que além de ser indispensável ao melhor entendimento da genética, da bioquímica, da imunologia, da biologia celular e molecular e das outras ciências, vem se tornando uma área cada vez mais independente. Procuramos, com a implantação de um laboratório de bioinformática, criar uma infraestrutura que permita ao aluno de mestrado e doutorado, do curso de pós-graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa, ter a possibilidade de conhecer melhor esta ciência, não só na disciplina Bioinformática, mas também nas outras disciplinas, podendo também contar com a estrutura necessária para procurar desenvolver ferramentas de bioinformática que lhes possam auxiliar em responder questões importantes dos seus projetos. Será também possível, ensinando uma bioinformática mais completa a estes estudantes, fornecer recursos e o treinamento em banco de dados e programas relacionados à estrutura macromolecular, permitindo a estes cientistas da área biológica o acesso a esta rica fonte de informações, desenho de tutoriais, etc.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    Utilização do HTLV-2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV-1, Descrição: O Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do tipo 1 (HTLV-1) é conhecido por ser o agente etiológico de doenças de natureza neoplásica, como a Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL) (Yoshida et al., 1982). Além disso, a infecção pelo HTLV-1 é endêmica em diferentes regiões geográficas do mundo, sendo Salvador a cidade brasileira com a mais alta prevalência entre a população geral, atingindo valores próximos a 1,8% (Dourado et al., 2003). As glicoproteínas do envelope viral são reconhecidas de maneira específica pelos receptores de linfócitos B (anticorpos de membrana), por anticorpos neutralizantes e por receptores de células T (TCR) de linfócitos-T citotóxicos (CTL), o que proporciona posteriormente uma resposta imune protetora. Estas glicoproteínas poderiam representar importantes . Para explorar as propriedades imunológicas em potencial do envelope viral como candidato à vacina, pretendemos utilizar as glicoproteínas gp46 e gp21 do HTLV-1, como um imunógeno. Há três anos firmamos uma colaboração internacional com o grupo de vacinas do Instituto Nacional do Câncer, do Instituto Nacional de Saúde do Governo dos EUA (Vaccine Branch ? NCI/NIH), liderado pela Dra. Genoveffa Franchini, resultando no desenvolvimento de um vetor vacinal anti-HTLV-1. Este vetor foi baseado no HTLV-2 atenuado, sendo desenhado por mim e construído pela GeneArt (USA). Este vetor foi cedido pela Dra Franchini para o CPqGM/FIOCRUZ, para montagem do vetor recombinante, ensaios in vitro e ex-vivo e testes bioquímicos e imunológicos (a serem realizados no CPqGM/FIOCRUZ). Após estes experimentos, os testes em modelo animal, utilizando coelhos serão realizados utilizando coelhos e macacos no NCI-NIH.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Genoveffa Franchini - Integrante / Maria Fernanda Castro-Amarante - Integrante / Fernanda Khouri Barreto - Integrante / Loianna Mascarenhas - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    Caracterização de genomas completos do vírus da Leucemia de células T do adulto do tipo 1 (HTLV-1) provenientes de pacientes com diferentes perfis clínicos, Descrição: Embora o HTLV-1 tenha sido convincentemente associado à Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL), é observado que a grande maioria dos indivíduos infectados permanece assintomática (95-98%). Ainda não se sabe por que isto ocorre, assim como não é conhecido os motivos pelos quais alguns indivíduos desenvolvem algum tipo de doença, seja ela de natureza neoplásica ou inflamatória, bem como os fatores que direcionam o curso clínico ao longo da infecção. Acredita-se que as diversas manifestações clínicas possam ser influenciadas pelo tipo e magnitude da resposta imune do hospedeiro para os antígenos do HTLV-1, bem como pelo local ou órgão no qual a reação inflamatória predominantemente acontece. Fatores relacionados às variantes genéticas do vírus e fatores referentes ao hospedeiro também têm sido sugeridos. Alguns trabalhos ainda apontam que fatores ambientais, como idade, modo de transmissão e características étnicas (Gadelha et al., 2005; Miller et al., 1994; Vine et al., 2002; Sabouri et al., 2005) podem contribuir para a manifestação de doença em indivíduos infectados. A análise de indivíduos, com diferentes status clínicos da doença, porém apresentando níveis semelhantes de carga proviral, demonstrou que células de pacientes assintomáticos produzem menores níveis das citocinas inflamatórias: TNF- (Fator de necrose tumoral ) e IFN- (Interferon ) (Nishimura et al., 2000), sugerindo que esta baixa produção seria importante para a manutenção do estado assintomático, e que outros fatores, além da carga proviral, também devem influenciar a sintomatologia da infecção (Furukawa et al, 2003). Visto isto, pretendemos estudar a diversidade genética no genoma total do HTLV-1 mais prevalente em cada grupo de indivíduos infectados: 10 com TSP/HAM, ATLL, 10 com dermatite infecciosa, 10 com dermatite infecciosa e TSP/HAM e 10 assintomáticos. Todos os indivíduos com idade superior a 45 anos e mediana da carga proviral de 1.500 copias/106 PBMC.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Marcio Roberto T Nunes - Integrante / Luis Felipe Ivanoff de Menezes - Integrante.

  • 2011 - Atual

    Identificação de SNPs no genoma da Leptospira interrogans sorovar Copenhageni e possível associados ao desfecho clínico e Síndrome Hemorrágica Pulmonar, Descrição: O estudo molecular de sequências do genoma completo da L. interrogans sorovar Copenhageni possibilita testar a hipótese de que mutações estejam associadas a diferentes desfechos e fenótipos clínicos. Além disso, é possível ainda identificar grupamentos filogenéticos de isolados com características epidemiológicas, como tempo e espaço, que tenham associação com um maior sucesso na transmissão de um determinado clone. Objetivo: Identificar polimorfismos genéticos associados ao desfecho clínicos da leptospirose e ao sucesso de transmissão em determinado tempo e espaço. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Luciane Amorim Santos - Integrante / Albert Ko - Integrante / Mitermayer Galvão dos Reis - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante., Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro.

  • 2010 - 2011

    Identificação in silico de Retrovírus Endógenos Humanos usando a região LTR de PTLV-1, PTLV-2 e PTLV-3, Descrição: O HTLV-1 foi o primeiro retrovírus humano descrito, seguido pelo HTLV-2 e HTLV-3. Acredita-se que HTLV-1, HTLV-2 e HTLV-3 se originaram independentemente e teriam emergido do contato entre humanos e primatas não-humanos infectados com STLV. Durante o ciclo de replicação desses retrovírus pode ocorrer a formação de retroelementos, os elementos com repetições terminais longas. Estima-se que mais de 40% do genoma humano seja composto de retroelementos, sendo 8% de elementos LTR. Sugere-se ainda que os HERVs estão no genoma humano por um período de aproximadamente 30 milhões de anos, e alguns eventos de transposição envolvendo-os podem ter modificado a expressão gênica celular, conferindo ao hospedeiro uma vantagem seletiva. Esse estudo tem como objetivo identificar a presença de isolados de HTLV-1, HTLV-2, HTLV-3, STLV-1, STLV-2 e STLV-3 como retrovírus internos humanos. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Costa, Giselle Calasans Souza - Integrante / Fernanda Khouri Barreto - Integrante / Jaqueline Goes de Jesus - Integrante / Aline Cristina Mota Miranda - Integrante.

  • 2010 - 2011

    ESTUDO DA DIVERSIDADE DO HIV-1 NA BAHIA - BUSCA E ANÁLISE DE NOVAS FORMAS RECOMBINANTES CIRCULANTES (CRF) DO HIV, Descrição: Após quase três décadas do início da epidemia de AIDS, inúmeros esforços vêm sendo feitos no combate ao HIV, porém até o momento não se chegou à uma vacina capaz de prevenir a infecção ou medicamentos capazes de eliminar o vírus. A intensa variabilidade genética do HIV-1 reflete-se no surgimento de isolados virais com comportamentos biológicos diversos e esta característica representa o principal obstáculo para a eficiência do funcionamento do sistema imune humano e para o desenvolvimento de vacinas e terapias universais. Estudos anteriores realizados pelo nosso grupo indicaram uma grande diversidade de genótipos de HIV-1 na Bahia e a prevalência de uma forma recombinante ainda não identificada, apresentando o mesmo padrão genético, em cerca de 6% da população infectada. O objetivo deste trabalho é investigar a existência de uma nova forma recombinante circulante (CRF) do HIV-1 na Bahia e a identificação de propriedades moleculares relacionadas com a adaptação e dispersão destas variantes. Para tanto, será realizado o seqüenciamento do genoma total de isolados previamente caracterizados em dois genes virais: gag e env. Estas seqüências de DNA serão então submetidas às análises filogenéticas e de recombinação através de ferramentas de Bioinformática. Este estudo poderá contribuir para o melhor entendimento a respeito das propriedades evolutivas do HIV, para vigilância da epidemia local de AIDS e para a escolha adequada de medidas de controle.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / joana Paixão Monteiro - Integrante / Adriano Fernando Araujo - Integrante.

  • 2009 - 2014

    O reverso genetico de pacientes infectados pelo HTLV-1, Descrição: As proteinas da ORF-1 do HTLV-1 (p12 e p8) provenientes de 140 pacientes infectados pelo HTLV-1 com diferentes status clinicos foram analisadas quanto ao padrao mutagenico. As mutacoes estatisticamente significantes quanto a carga proviral e status clinicos foram criadas in vitro utilizando o vetor de expressao pME-p12-p8. Estes vetores (mutantes e WT) foram utilizados para transfeccao de celulas 293-TN (ensaios de expressao) e HeLa (ensaios de co-localizacao por microscopia confocal). Estas mutacoes foram utilizadas para criacao de lentivirus mutantes para ensaios de infectividade e modelo animal utilizando macaco Rhesus.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Rego, Filipe Ferreira de Almeida - Integrante / Genoveffa Franchini - Integrante / Maria Fernanda Castro-Amarante - Integrante / Fernanda Khouri - Integrante., Financiador(es): National Institutes of Health - Auxílio financeiro.

  • 2009 - 2013

    Soroprevalência e subtipagem do vírus linfotrópico de células T humanas (HTLV) e avaliação da transmissão materno-fetal em gestantes da região sul da Bahia, Descrição: o projeto pretende: (1) conhecer a prevalência dos vírus HTLV e CMV em gestantes na nossa região, a fim de conhecer o perfil da infecção nessa população; (2) informar, conscientizar e alertar aos profissionais de saúde sobre a importância da realização da pesquisa dos vírus nas gestantes; (3) minimizar os riscos de infecção materno-fetal, possibilitando que intervenções e medidas de educação em saúde sejam implementadas; (4) fornecer dados para elaborar projetos e políticas de saúde para essa população vulnerável.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Sandra Rocha Gadelha - Coordenador / Filipe F A Rêgo - Integrante / Melo, Marco Antônio Gomes - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2009 - Atual

    Desenvolvimento de vacina anti-HIV-1 utilizando modelo animal e vetor contendo regioes LTR do HTLV-1, Descrição: Os genes pol, gag e env do SIV-1 foram inseridos no vetor pMA contendo o gene GFP e as regioes 3' e 5' do HTLV-1. A insercao foi realizada de maneira que os gene da GFP ficou sobre controle do LTR 5' e os genes do SIV sobre controle da regiao LTR 3' contendo o sinal de hipermetilacao. Este vetor foi utilizado para transfeccao de celulas 293-T, 293-TN e HeLa. Foram medidas a expressao de GFP, expressao dos produtos genicos gag-pro e env do SIV. Este vetor expressando porcoes conservadas de varios genes do SIV-HIV sera utilizado em testes utilizando modelo animal (SIVmac251 macaque model).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Genoveffa Franchini - Coordenador., Financiador(es): National Institute Of Health - Outra.

  • 2008 - 2013

    Contribuição de polimorfismos nas proteínas gp46, gp21 e HBZ, para a manifestação da HAM/TSP., Descrição: Embora o HTLV-1 tenha sido convincentemente associado a doenças, a grande maioria dos indivíduos infectados permanece assintomática (95-98%). Ainda não se sabe por que isto ocorre, assim como, não é conhecido o motivo pelo qual alguns indivíduos desenvolvem uma síndrome neurológica, enquanto outros desenvolvem uma leucemia ou outras patologias inflamatórias. Assim, as diversas manifestações clínicas podem depender do tipo e magnitude da resposta imune do hospedeiro para os antígenos do HTLV-1, bem como do local ou órgão no qual a reação inflamatória predominantemente acontece. A avaliação das proteínas gp46, gp21 e HBZ, de isolados do HTLV-1 provenientes de indivíduos com diversos estados de sintomatologia, neste estudo, poderá contribuir para o conhecimento da presença de polimorfismos nestas proteínas. Estas investigações inter-hospedeiros permitirão avaliar a dinâmica das variantes virais correlacionando com o perfil clínico de cada paciente. Além disso, ao avaliar o mesmo indivíduo infectado, em diferentes tempos, é possível analisar o movimento das cepas do HTLV-1 e o curso da infecção, além de estimar mudanças no tamanho da população viral efetiva, ao longo do tempo. Também é possível obter um maior entendimento HTLV-1 quando comparando a dinâmica da evolução do vírus com os dados clínicos do paciente. Justifica-se assim, a análise de proteínas virais e o estudo filodinâmico do vírus para contribuir para o melhor entendimento do HTLV-1 e sua relação com as manifestações clinicas e progressão do paciente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Viviana Galazzi - Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida - Integrante / Miranda, Aline Cristina Andrade Mota - Integrante / Galvao-Castro, Bernardo - Integrante / Fernanda Khouri Barreto - Integrante.

  • 2008 - 2012

    Avaliação filodinâmica de isolados do HIV-1 na transmissão materno-fetal, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Marco Salemi - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Adriano Fernando Araujo - Integrante / Santos, Edson - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2008 - 2011

    EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DO HTLV EM MULHERES PORTADORAS DE HIV-1 E ANÁLISE DAS VARIAÇÕES GENÉTICAS DO HTLV-1 EM DIFERENTES COMPARTIMENTOS DO HOSPEDEIRO, Descrição: O HTLV-1 é o agente etiológico da ATL, HAM/TSP e outras perturbações inflamatórias. Alguns estudos tentam analisar as variações do HTLV-1 em diferentes fluidos corpóreos e seu impacto sobre a infecção pelo HTLV. A coinfecção HTLV/HIV-1 é associada com graves manifestações clínicas, imunodeficiência marcante e infecções oportunistas, bem como comportamento de risco. Salvador, capital do Estado da Bahia, Brasil, tem a maior prevalência para o HTLV-1 (1,74%) encontrada no país. Poucos estudos descrevem esta coinfecção em Salvador e áreas vizinhas, e muito menos investigam como estes vírus circulam ou avaliam a relação entre eles. Para descrever a epidemiologia molecular do HTLV-1 e as características da coinfecção HTLV/HIV-1 em mulheres, nós realizamos um corte transversal envolvendo 107 mulheres infectadas com HIV-1 do centro de referência da DST/HIV/AIDS, localizado na cidade de Feira de Santana. Amostras das pacientes foram testadas por ELISA e a infecção pelo HTLV confirmada usando o WB e PCR. A análise filogenética foi realizada nas seqüências LTR do HTLV para obter mais informações sobre a epidemiologia molecular e a origem deste vírus na Bahia. Quatro das cinco amostras reativas no ELISA foram confirmadas como HTLV-1 no WB e PCR e uma amostra confirmada como HTLV-2. A soroprevalência da infecção pelo HTLV nestas mulheres foi de 4,7%, menor que o esperado, provavelmente pela baixa prevalência da infecção pelo HTLV esta área ou devido a medidas de controle de DST/AIDS implementadas desde a realização do estudo anterior. A análise filogenética da região LTR das quatro seqüências do HTLV-1 revelou que todos os isolados foram classificados como subgrupo Transcontinental do subtipo Cosmopolita e se agrupam no principal grupo latino-americano, que possui um ancestral comum com isolados da África do Sul, sugerindo uma introdução pós Colombiana deste vírus na Bahia. A seqüência de HTLV-2 foi classificada como subtipo c, a variante brasileira do subtipo 2a. Também foi obs. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Vitor Uchoa Carvalho - Integrante / Liliane Lins - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para seleção de regiões protéicas potenciais, dos isolados brasileiros do HIV-1, para dar suporte aos projetos de desenvolvimento de protótipos vacinais vinculados ao PN-DST/AIDS, Ministério da Saúde, Descrição: Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática de fácil manuseio, gerando novos da-dos sobre as nossas sequências do HIV-1, e treinamento dos investigadores que atuam na área de resistência do HIV-1 às drogas antiretrovirais e na pesquisa de vacinas contra HIV-1/AIDS, capacitando-os nos diversos aspectos teóricos e práticos de ?data management? e ?data mining? das seqüências dos isolados brasileiros deste retrovírus, bem como nos aspectos práticos de ?designer?, armazenamento, recuperação e análise dos dados genéticos, epidemiológicos e clíni-cos provenientes dos bancos de dados locais e públicos. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2008 - 2009

    Desenvolvimento de uma ferramenta de rastreamento de mutações em árvores filogenéticas, para o estudo da evolução dos isolados do HIV-1, Descrição: O projeto de pesquisa tem como objetivo o desenvolvimento de uma nova ferramenta de bioinformática para auxiliar os pesquisadores e clínicos nos projetos de pesquisa visando um melhor conhecimento das seqüências dos isolados do HIV-1, podendo ser estendida posteriormente para o estudo das seqüências de outros patógenos de importância epidemiológica no Brasil como o HTLV-1, HCV, HBV, HPV, HHV8, vírus da dengue, Leishmania, Tripanossoma, etc. A nova ferramenta permitirá, de uma forma intuitiva e simples, rastrear mutações presentes nas seqüências destes patógenos (inicialmente, do HIV-1) representando-as graficamente nos grupamentos monofiléticos das árvores filogenéticas, reconstruídas conforme o protocolo de pesquisa do LASP. Cada mutação identificada nas seqüências será avaliada quanto a sua relação com a resistência às drogas anti-HIV/AIDS e procurar-se-á na estrutura da árvore, quando esta mutação ocorreu, a partir do processo de especiação. Desta forma os pesquisadores e clínicos poderão responder várias questões importantes que não podem ser facilmente inferidas com as ferramentas de bioinformática existentes, como por exemplo: (a) Quais mutações são responsáveis pela diferenciação entre duas seqüências ou entre um grupo delas, sejam de um mesmo cluster ou de clusters diferentes; (b) Quais dessas mutações podem estar relacionadas com resistência a anti-retrovirais, e quando (onde) essas mutações apareceram; (c) Quais dessas mutações induzem sítios de modificações pós-traducionais, principalmente glicosilação, fosforilação e miristilação; (d) Quais das mutações presentes numa seqüência estão em sítios com pressão seletiva positiva; (e) Se as mutações observadas na seqüência em estudo ocorreram freqüentemente em outros clusters ou predominantemente apenas no seu próprio cluster. Assim, esta ferramenta permitirá rastrear uma mutação de interesse ao longo da árvore filogenética de forma gráfica interativa, permitindo a extração de informações essenciais de forma r. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Diego Gervásio Frias - Integrante.

  • 2007 - 2010

    variabilidade genética dos isolados do HIV-1 num grupo de mulheres e crianças infectadas do Município de Feira de Santana/Bahia/ Brasil, Descrição: A intensa variabilidade genética do HIV-1 ao longo do tempo exige estudos para compreender a dinâmica do seu advento em determinada comunidade, seu padrão de transmissão e evolução, que permitam estabelecer uma estratégia eficaz de combate a tão sério problema de saúde publica. No Brasil, os trabalhos com o genoma do HIV-1 vêm sendo desenvolvidos desde a década passada para mapear a sua epidemiologia molecular, nas diversas regiões do país, constatando a maior prevalência do subtipo B, do C, do F e dos recombinantes B/F e outros. Estudos mais recentes na Bahia mostram um alto grau de diversidade genotípica neste Estado, decorrente da circulação de diversas formas de recombinantes. Constata-se também uma elevada taxa de resistência aos antirretrovirais o que pode facilitar a difusão destas cepas para outras localidades. A difusão do HIV-1 para as cidades de médio e pequeno porte, o aumento da transmissão heterossexual, afetando cada vez mais as mulheres mais jovens e pobres justificaram este trabalho na cidade de Feira de Santana. Ela é a segunda cidade mais importante do estado, abrangendo uma região de mais de 1.000.000 de habitantes. É um entroncamento de três grandes rodovias federais, constituindo-se na porta de entrada de um grande fluxo migratório de várias partes do país, tornando-a vulnerável a surtos de doenças transmissíveis. Já foram registrados no Centro de Referência para DST/AIDS, 791 casos de pacientes soropositivos, sendo que 180 foram mulheres e 32 foram crianças. Não há relato de nenhum estudo sobre a diversidade genética do HIV-1 nesta população, porém os resultados oriundos da população de Salvador podem refletir a realidade do Município de Feira de Santana, pois este se localiza a 110 km de distância da capital. Assim, pretendemos com este projeto: Verificar a freqüência e distribuição dos subtipos do HIV-1, em relação ao gene pol, na população estudada. Descrever a variabilidade genética do gene pol dos novos isolados do HIV-1 relacionada. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Luciane Amorim Santos - Integrante / Adriano Fernando Araujo - Integrante / Santos, Edson de Souza - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2007 - 2010

    Utilização de códons pelos retrovírus humanos 'in silico", Descrição: Desenvolver uma nova ferramenta para analisar o comportamento dos diferentes transcritos dos genes do HIV-1 e HTLV-1, provenientes do GenBank, em relação a utilização de códons e disponibilidade de tRNA da célula hospedeira. Considerando que as informações sobre o ?codon usage? e número de cópias de genes para tRNA do Homo sapiens é conhecido, é possível inferir sobre a dinâmica evolutiva intra-celular do HIV-1. Assim, estas análises contribuirão para o melhor entendimento a respeito da dinâmica e da adaptação viral. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Diego Gervásio Frias - Integrante / joana Paixão Monteiro - Integrante.

  • 2007 - 2009

    Correlação entre Polimorfismos nas Regiões Promotora e Regulatórias do Gene da GLUT1, Expressão e Exposição da Proteína na Membrana e o Desenvolvimento de TSP/HAM em Indivíduos infectados pelo HTLV-1, Descrição: A infecção pelo HTLV-1 é endêmica em Salvador, onde a prevalência é de 1,8%. O desenvolvimento de manifestações clínicas associadas ao HTLV-1, como a doença neurológica paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV-1 (TSP/HAM) ocorre em 2-4% da população infectada e ainda não se sabe porque esta infecção permanece assintomática na maioria dos portadores. Recentemente foi demonstrado que a glicoproteína transportadora de glicose do tipo 1 (GLUT1) funciona como receptor para a infecção do linfócito-T CD4+ e que sua expressão aumenta a susceptibilidade ao HTLV-1. Tem sido demonstrado que polimorfismos em um único nucleotídeo (SNPs) nas regiões promotora e regulatórias do gene da GLUT1 estão associados à susceptibilidade a nefropatia diabética em diferentes populações. Estes polimorfismos poderiam influenciar a expressão da proteína GLUT1 na membrana celular e, no caso da infecção pelo HTLV-1, poderiam facilitar a entrada do vírus na célula e a transmissão célula-célula do mesmo, levando a um aumento na carga proviral e, posteriormente, ao desenvolvimento de TSP/HAM. Entretanto, não existem estudos que avaliem a associação entre os polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias do gene da GLUT1 e a infecção pelo HTVL-1. O objetivo deste projeto é verificar possíveis correlações entre polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias do gene humano da GLUT1 com o desenvolvimento de TSP/HAM.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo GalvaoCastro - Integrante / Sandra Rocha Gadelha - Integrante / Gisele Calazans Costa - Integrante / Gabriel Muricy - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2006 - 2011

    Perfil da Saúde Bucal em pacientes infectados pelo HTLV-1: Análise clínica, carga proviral e analise molecular do vírus na saliva., Descrição: Este estudo objetiva descrever o perfil bucal de carreadores assintomáticos do HTLV-1 e pacientes infectados e com HAM/TSP, para investigar a associação entre carga proviral na saliva e severidade de doença periodontal. Também pretendemos analisar as variações intra-hospedeiro, de PBMCs e células na saliva destes indivíduos infectados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Simone Kashima - Integrante / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Rochele Azevedo - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Vitor Uchoa Carvalho - Integrante / Liliane Lins - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2006 - 2010

    Analise dos polimorfismos genotípicos do HIV-1 e estudo ?in silico? de como estas mutações podem interferir na maquinaria de tradução da célula hospedeira, Descrição: A utilização do HMA como técnica de subtipagem tem sido eficaz em áreas com índices elevados de infecção pelo HIV, pois além de ser rápida é economicamente mais viável. Além disso, o estudo de duas regiões genômicas, tais como env e gag tem auxiliado na identificação de formas recombinantes64. Entretanto, dado o crescente numero de formas recombinantes circulantes e únicas sendo reportadas no país, se faz necessária uma reavaliação na eficiência deste método em detectar estas variantes virais. Ainda que não seja completamente esclarecido que os vários grupos, subtipos e CRFs de HIV-1 tenham diferenças biológicas, ao menos no que diz respeito à transmissibilidade e ao curso de progressão para AIDS, torna-se claro que o conhecimento da prevalência e das mudanças temporais na incidência dessas variantes em diferentes áreas geográficas, seja importante para auxiliar na avaliação da dinâmica de propagação da epidemia na região, podendo também ser útil para o desenho de vacinas adaptadas especificamente para variantes do HIV circulantes em cada área e na atualização dos teste sorológicos de triagem. O alto polimorfismo do HIV representa um dos principais obstáculos para o desenvolvimento de terapias e vacinas anti-HIV. O principal mecanismo de escape viral é a grande quantidade de substituições sinônimas, quando comparadas com as substituições não-sinônimas (pressão seletiva positiva), nos diferentes genes do HIV-1, contribuindo para a alta diversidade viral no hospedeiro65Pretendemos assim, estimar a prevalência de subtipos genéticos de HIV-1 no estado da Bahia; investigar a existência de eventos de recombinação entre isolados de HIV-1 de diferentes subtipos com base na caracterização dos genes gag e env e sua importância nesta população; verificar a existência de possíveis associações entre os subtipos de HIV-1 e variáveis clínicas e sócio-demográficas; vvaliar a eficiência do Ensaio de Mobilidade de Heteroduplexes (HMA) na determinação dos subtipos de HIV-1 em compar. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Bernardo Galvao Castro - Coordenador / joana Paixão Monteiro - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2006 - 2010

    DIVERSIDADE MOLECULAR DO VÍRUS DA IMUNODEFICIENCIA HUMANA TIPO 1 NO ESTADO DA BAHIA, Descrição: A análise de sequências genômicas é uma forma poderosa de se estudar a diversidade do HIV-1 e sua expansão nas populações, além de ser crucial para dar suporte à vigilância epidemiológica e ao desenvolvimento de terapias e vacinas eficazes. Neste estudo foram geradas sequências dos genes gag e env de 61 pacientes infectados em Salvador e do pol de 58 em Feira de Santana, Bahia, Brasil. A bioinformática foi utilizada para subtipar, genotipar as mutações de resistência, determinar a pressão seletiva e predizer o uso de coreceptor. Em Salvador, 92,6% das amostras foram do subtipo B e 7,4% foram recombinantes BF1. Em Feira de Santana, 67,2% foram do subtipo B, 6,9% F1, 1,7% C e 24,1% BF1. Onze (19,0%) destes isolados apresentaram mutações de resistência. Pacientes infectados pelo B tinham em média 0,4 mutações de resistência e nenhuma mutação deste tipo foi observada em BF1. Com base na caracterização da alça V3 do B de 43 amostras de Salvador, foram encontradas 18,2% de variantes brasileiras (B?-GWGR), 46,5% de GPGR e 34,9% de GXGX. O grupo de sequencias GPGR mostrou passar por maior pressão seletiva. O tempo médio de diagnóstico positivo foi de 13 anos para o B' e 9 anos para o B (GPGR + GXGX). Setenta e seis por cento destes vírus fazem uso do coreceptor CCR5, enquanto 24% foram classificados como capazes de usar o CXCR4. Encontramos uma associação entre o B? e um maior tempo desde o diagnóstico. As prevalências de B' e de B/F1 em Salvador foram menores do que as encontradas em estudos anteriores na Bahia e no Brasil, por outro lado, em Feira de Santana foi encontrada uma alta prevalência de B/F1.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Carlos Brites - Integrante / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / joana Paixão Monteiro - Integrante / Adriano Fernando Araujo - Integrante., Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro.

  • 2006 - 2009

    Caracterização Étnica/geográfica da população de Salvador e de Portadores do HIV-1 e a Correlação entre o Índice de Ancestralidade Africana e Vulnerabilidade ao HIV/AIDS, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Inês Dourado - Integrante / Bernardo Galvão Castro Filho - Coordenador / Flora Maria Fernandes - Integrante / Angelina Xavier Acosta - Integrante / Geraldo Argolo Ferraro - Integrante / Taís Bomfim - Integrante / Kyoko Abe Sandes - Integrante., Financiador(es): Ministério da Saúde - Auxílio financeiro.

  • 2005 - 2007

    Avaliação das alterações no metabolismo ósseo e mineral de indivíduos portadores de retrovírus (HIV/HTLV) e correlações destas alterações com polimorfismos no promotor de IL-6 e nos níveis de osteocalcina, Descrição: Visa avaliar as alterações do metabolismo ósseo e mineral de individuos portadores de retrovírus e correlações dessas alterações com polimorfismos no promotor de IL-6 e nos níveis de osteocalcina. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Bernardo Galvão Castro Filho - Coordenador / Sandra Rocha Gadelha - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2003 - 2006

    ESTUDO DOS DETERMINANTES DE RISCO PARA INFECÇÃO PELO HTLV EM DOADORES DE SANGUE DO ESTADO DA BAHIA E CARACTERIZAÇÃO GENOTÍPICA DOS ISOLADOS VIRAIS, Descrição: Objetivo: Caracterizar epidemiologicamente a infecção pelo HTLV em doadores de sangue do Estado da Bahia e analisar filogeneticamente os isolados virais. Material e métodos: entre 01/2000 e 12/2003 foram entrevistados 91 doadores infectados pelo HTLV-I (casos) e 195 doadores não infectados (controles), dos quais foram obtidas informações de ordem demográfica, sócio-econômica, educacional, bem como relativas ao comportamento sexual, através de um questionário padronizado aplicado por um único entrevistador. Isolados virais de 25 doadores foram seqüenciados e analisados filogeneticamente. Resultados: Na análise multivariada foram identificados como fatores de risco independentes para infecção pelo HTLV sexo feminino, baixa renda familiar, DST prévia, uso inconsistente de preservativos e número de parceiros sexuais durante a vida. Observamos diferenças significativas de comportamento sexual entre homens e mulheres infectados. Todos os isolados virais analisados pertenciam ao subgrupo transcontinental, subgrupo cosmopolita. Pela primeira vez foi observado um isolado da África do Sul inserido no grupamento latino-americano. Conclusão: Os resultados deste estudo revelam uma associação entre baixo nível sócio-econômico e práticas sexuais não seguras e infecção pelo HTLV. A menor prevalência observada confirma dados epidemiológicos recentes e pode ser decorrente de uma melhor triagem clínica, da redução da prevalência de infecção pelo HTLV na população geral, ou de um efeito dilucional no universo de doadores ocasionado pela exclusão definitiva ao longo dos anos dos doadores infectados. Os dados da comparação entre homens e mulheres reforçam a tese de que a principal via de transmissão de HTLV-I no nosso meio seja a sexual. A análise filogenética demonstrou pela primeira vez que a África do Sul pode ter contribuído na introdução do HTLV-I no Brasil.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Bernardo Galvao Castro - Coordenador / Sergio Araujo Pereira - Integrante / Artur Trancoso Lopo Queiróz - Integrante / Flora Maria Fernandes - Integrante / Augusto Cesar Andrade Mota - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia - Auxílio financeiro.

  • 2003 - 2005

    Correlações dos Polimorfismos Genéticos do HTLV-I/II e da Resposta Imune do Hospedeiro com a Infecção e/ou Patogênese, Descrição: Avaliar o genoma do HTLV-1 e do hospedeiro,bem como da resposta imune,para melhor compreensão dos mecanismos biológicos envolvidos na infecção e/ou patogenia viral. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (5) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Bernardo Galvao Castro - Coordenador / Angelina Xavier Acosta - Integrante / Fernada Grazzi - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2002 - 2005

    Correlações do Polimorfismo Genético do HTLV-I/II com o Polimorfismo dos genes do Hospedeiro envolvidos no Desenvolvimento de Paraparesia Espática Tropical/Mielopatia Associada (TSP/HAM) em Salvador, Descrição: Transferência de tecnologia para um núcleo emergente no Nordeste do país; Estabelecer as correlações entre fatores virais e do hospedeiro assintomático e sintomático com TSP/HAM; Caracterização molecular do genoma proviral (TAX) dos indivíduos infectados; Anáilise dos polimorfismos destas regiões,relacionando os mesmos com a sintomatologia TSP/HAM;Caracterização molecular dos genes do hospedeiro envolvido no mecanismo de transativação por Tax (NF-KB,IK-B,CREB,SRFp50,p65,p52,c-Rel,p-16) em indivíduos infectados assintomáticos e com TSP/HAM, correlacionando estes resultados com as alterações genotípicas do hospedeiro.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Integrante / Bernardo Galvao Castro - Coordenador / Marilda Gonçalves - Integrante.

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Projetos de desenvolvimento

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise . , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população. . , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2012 - 2014

    IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DAR SUPORTE AO CURSO DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE E MEDICINA INTERNA DO CPQGM, Descrição: Implantação de um laboratório de bioinformática no CPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilância molecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, e consequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso de pós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador.

  • 2010 - Atual

    Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV-1, Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório público para as sequências do HTLV-1, similar à iniciativa do Banco de Dados de Sequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) e de Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso em estudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos, caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nosso Banco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudo do HTLV-1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número de informações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatores ambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobre infecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataforma em Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis Management Environment, que constitui-se como um banco de dados com ferramentas, que pode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos e epidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seu trabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação, estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência em bioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatos vacinais, não só em relação ao HIV-1/AIDS, mas também em relação ao HTLV-1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando a metodologia de análise. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo - Integrante / Dustin Edwards - Integrante / Leandro I Souza-Brito - Integrante.

  • 2007 - 2010

    LASP-HIV1-ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais, Descrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta de bioinformática para análise de resistência do HIV-1 aos antirretrovirais. Esta ferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ para domínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV-1. Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicas previamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aos antirretrovirais, comparar seqüências de HIV-1 dos bancos de dados públicos, identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e a protease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizado nas terapias anti-HIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitará localizar sitios pós-traducionais e traçar um perfil de distribuição das seqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência, quanto por sítios pós-traducionais, para servirem de parâmetro de comparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / José Carlos Couto Fernandez - Integrante / Joana Paixão Monteiro-Cunha - Integrante.

  • 2005 - 2006

    Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência em Bioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidos pelo PN-DST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases), Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referência em bioinformática para dar suporte ao PN-DST/AIDS do Ministério da Saúde na criação de um repositório de sequências genétias do HIV-1;Ministrar treinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede e transferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformática no Brasil. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Filipe F A Rêgo - Integrante / Luciane Amorim Santos - Integrante / Saul Vislei - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

  • 2003 - 2005

    Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte ao Monitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente e Incidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento de Vacinas, Descrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ e EBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância do polimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional de HIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina e resistência anti-retroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente os isolados de HTLV-I e II circulantes no Brasil; Determinar as alterações polimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV-1 que poderiam influenciar no desenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética e evolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV-1 e HTLV-1. 3.Avaliar a taxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequências dos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmo indivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética das sequências dos genes env e gag do HIV-1 circulantes na cidade de Salvador. 5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV-1 dos subtipos não B,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais e relacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfil epidemiológico desses variantes na população.. , Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcantara - Coordenador / Bernardo Galvao Castro - Integrante / Domingos Ramon Moreau - Integrante / Aline Cristina Andrade Mota-Miranda - Integrante / de Oliveira, Tulio - Integrante / Queiroz, Artur TL - Integrante / Carvalho, Chandra Mara - Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha - Integrante.

Seção coletada automaticamente pelo Escavador

Prêmios

2017

(Melhor experiência) Projeto Aconchego: compartilhando emoções e experiências, CONASEMS - Conselho Nacional de Secretarias Municipais de Saúde.

2016

Reconhecimento pela participação e contribuição como Vice-Coordenador da Pós-Graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM, CPqGM - Fiocruz.

2014

Medalha de Mérito Barão de Corutuba, Câmara Municipal de Janaúba.

2005

HTLV-1 Travel Scholar, 12th International Conference on Human Retrovirology - Montego Bay (Jamaica).

2005

Prêmio da IX Jornada Científica de Pós-graduação, FIOCRUZ.

2005

(Melhor Painel) The Genetic Characteristic Study of the Brazilian HTLV-1 Isolates Suggests the Pre and Post-Columbian Origin of the Virus in this Country, 8 Simpósio Internacional Sobre HTLV.

2002

(Melhor Tese de Doutorado em Virologia no Brasil em 2002) Prêmio Helio Gelli Pereira no XIII Encontro Nacional de Virologia - Setembro/2002., Sociedade Brasileira de Virologia - Águas de Lindóia (SP).

1999

Fellowship Award, Nineth International Conference on Human Retrovirology: HTLV and Related Viruses - Kagoshima - Japão.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Instituto Oswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz, Laboratório de Flavivírus. , Avenida Brasil, 4365, Manguinhos, 21040360 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil, Telefone: (21) 25621707, Fax: (21) 25621779, URL da Homepage:

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Experiência profissional

2019 - Atual

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2013 - 2017

Universidade Estadual de Feira de Santana

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor e Pesquisador, Carga horária: 40

Outras informações:
Professor de Bioquímica e Pesquisador (cursos de Farmácia, Biologia e Enfermagem)

2009 - 2011

National Institute Of Health

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pos-doctoral Fellow, Carga horária: 40

2017 - Atual

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador Titular, Carga horária: 40

Outras informações:
Pesquisador Titular do Laboratório da Patologia Experimental - LAPEX.

2008 - 2017

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador Titular, Carga horária: 40

Outras informações:
Pesquisador Vice-Chefe do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia Computacional (LHGB) do CPqGM/FIOCRUZ

2002 - 2007

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40

Outras informações:
Laboratório Avançado de Saúde Pública - LASP Atua como pesquisador em Biologia molecular, Bioquímica, Epidemiologia molecular e Bioinformática aplicada aos retrovírus humanos (HIV-1, HTLV-1, HTLV-2). Atua também como professor/orientador colaborador no Curso de Pós-Graduação Strictu Senso em Biotecologia em Saúde e Medicina Investigativa.

Atividades

  • 05/2017

    Pesquisa e desenvolvimento , Centro De Pesquisas Gonçalo Moniz, .,Linhas de pesquisa

  • 02/2013 - 05/2017

    Direção e administração, Centro De Pesquisas Gonçalo Moniz, .,Cargo ou função, Subchefe e Chefe Substituto.

2002 - 2007

Laboratório Avançado de Saúde Pública-Centro de Pesq. Gonçalo Moniz FIOCRUZ

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40

Outras informações:
Atua como pesquisador em Biologia molecular, Bioquímica, Epidemiologia molecular e Bioinformática aplicada aos retrovírus humanos (HIV-1, HTLV-1, HTLV-2). Atua também como professor/orientador colaborador no Curso de Pós-Graduação Strictu Senso em Biotecologia em Saúde e Medicina Investigativa.

Atividades

  • 03/2006

    Direção e administração, Fundação Oswaldo Cruz/CPqGM, .,Cargo ou função, Pesquisador do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia Computacional.

  • 03/2005

    Ensino, Patologia Experimental, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática na Biologia Molecular

  • 01/2004

    Treinamentos ministrados , Laboratório Avançado de Saúde Pública- BA Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz, .,Treinamentos ministrados, Estudos Avançados em Bioinformática e Análises Evolutivas Virais (14 a 19 de Junho/2004), Segundo Workshop Brasileiro em Evolução Viral e Epidemiologia Molecular (HIV e HTLV) (08 a 13 de novembro/2004), Treinamento para a Utilização da Database HIV-Base (15 a 18 de novembro/2005)

  • 01/2004

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Avançado de Saúde Pública- BA Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz, Laboratório Avançado de Saúde Pública- BA Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz.,Atividade realizada, Implantação e Coordenação do Laboratório de Bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ.

  • 04/2002

    Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Avançado de Saúde Pública, .,Linhas de pesquisa

2002 - 2007

Faculdade de Tecnologia e Ciências

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 20

Outras informações:
Professor de Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, bioquímica Clínica e Bioinformática no Curso de Farmácia.

Atividades

  • 02/2002 - 07/2007

    Ensino, Farmacia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, Bioquímica Clínica e Bioinformática

2000 - 2013

Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública

Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40

Outras informações:
Atuou como professor nas disciplinas, Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, Bioinformática, Seminários Interdisciplinares, Bioquímica Médica e Biofunção 1 nos cursos de Odontologia, Biomedicina e Medicina, nos sistemas de ensino clássico e PBL. Atuou também como orientador colaborador do curso de pós-graduação strictu senso em Medicina e Saúde Humana.

Atividades

  • 01/2002 - 01/2013

    Ensino, Medicina e saúde humana, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Seminários em retrovirologia

  • 01/2002 - 01/2013

    Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática, Bioquímica

1994 - 1995

Associação das Pioneiras Sociais

Vínculo: Empregatício, Enquadramento Funcional: Farmacêutico Hospitalar do Hospital do Aparel, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Trabalhou durante os seis primeiros meses no Hospital do Aparelho Locomotor Sarah em Brasília e posteriormente foi transferido para a filial de Salvador-Bahia

Atividades

  • 09/1994 - 12/1995

    Direção e administração, Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Lider do Serviço de Farmácia Hospitalar.,Cargo ou função, Lider do Setor de Farmácia Hospitalar e Clínica.

  • 09/1994 - 12/1995

    Serviços técnicos especializados , Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Setor de Farmácia Hospitalar.,Serviço realizado, Implantação do Serviço de Farmácia Hospitalar e Farmácia Clínica.

  • 09/1994 - 12/1995

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Laboratório de Análises Clínicas do Hospital Sarah Salvador.,Cargo ou função, Membro da Comissão de Controle das Infecções Hospitalares.

  • 01/1995 - 03/1995

    Treinamentos ministrados , Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de Salvador, Enfermarias do Hospital Sarah Salvador.,Treinamentos ministrados, Treinamento ao Corpo de Enfermagem e Médico sobre a Biologia Molecular, Imunologia e Patogenia do HTLV-I; Treinamento em Prevenção das interações Medicamentosas no Hospital.

2014 - 2015

Universidade Salvador

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor

2018 - Atual

Instituto Oswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador Titular, Carga horária: 40