Leilane Oliveira Gonçalves

Doutoranda do Programa de Pós Graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz. Mestre em Ciências pelo Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde do Instituto René Rachou - Fiocruz Minas (2017) e Bacharel em Ciências Biológicas com ênfase em Biotecnologia e Meio Ambiente pelo Centro Universitário UNA. Foi bolsista de iniciação científica e apoio técnico também no Instituto René Rachou. Tem experiência em análises e integração de dados de genômica, transcriptômica e proteômica, particularmente em Anotação Genômica, Genômica Comparativa, Montagem genômica utilizando dados gerados por plataformas NGS (Next Generation Sequencing) e análise de dados de RNAseq. Atualmente trabalha com a integração de dados ômicos em Tripanossomatídeos visando um melhor entendimento dos mecanismos de infectividade e de resistência desses parasitos além da identificação de possíveis candidatos vacinais contra essas doenças.

Informações coletadas do Lattes em 17/06/2019

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Biologia Computacional e Sistemas

2017 - Atual

Fundação Oswaldo Cruz
Título: Integração e análise de dados multi-ômicos visando a identificação computacional de potenciais candidatos vacinais em Leishmania infantum e Trypanossoma cruzi,
Jeronimo Conceição Ruiz. Coorientador: Daniela de Melo Resende. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Transcriptômica; Proteômica; Polimorfismos; Candidatos vacinais; Leishmaniose visceral; Doença de Chagas. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Multidisciplinar. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunologia Aplicada.

Mestrado em Ciências da Saúde

2015 - 2017

Fundação Oswaldo Cruz
Título: Análise de dados de sequenciamento de RNA voltados a comparação da expressão gênica visando a um melhor entendimento dos mecanismos de resistência aos antimoniais,Ano de Obtenção: 2017
Jeronimo Conceição Ruiz.Coorientador: Silvane Maria Fonseca Murta. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Leishmaniose visceral; Resistência; Antimonio trivalente; RNA-Seq; Expressão gênica; Leishmania infantum. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Multidisciplinar.

Graduação em Ciências Biológicas

2010 - 2014

Centro Universitário UNA
Título: Estudo de abordagens computacionais para a identificação de grupos ortólogos associados ao dimorfismo de fungos patogênicos
Orientador: Jeronimo Conceição Ruiz
Bolsista do(a): Programa Universidade para Todos, PROUNI, Brasil.

Ensino Médio (2º grau)

2006 - 2008

Escola Estadual Coronel Adelino Castelo Branco

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Formação complementar

2019 - 2019

Identifying Gene Regulatory Networks from Gene Expression Data. (Carga horária: 45h). , Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas, CPQRR, Brasil.

2018 - 2018

Reconstrução, modelagem e análise de redes metabólicas. (Carga horária: 15h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2018 - 2018

Análise de transcritomas e microRNAs. (Carga horária: 36h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2017 - 2017

Prevenção e Vigilância da Malária na Região Amazônica. (Carga horária: 80h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2015 - 2015

Bioinformática Integrada. (Carga horária: 60h). , Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, FIOCRUZ-BAHIA, Brasil.

2015 - 2015

Introdução a Metagênomica. (Carga horária: 30h). , Fundação Oswaldo Cruz (MG), FIOCRUZ, Brasil.

2015 - 2015

Introdução a estatística não paramétrica. (Carga horária: 15h). , Fundação Oswaldo Cruz (MG), FIOCRUZ, Brasil.

2014 - 2014

Extensão universitária em Biologia Celular e Molecular I. (Carga horária: 60h). , Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas, CPQRR, Brasil.

2014 - 2014

Princípios de Bioestatística no R. (Carga horária: 15h). , Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas, CPQRR, Brasil.

2014 - 2014

Curso de Verão em Bioinformática. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2014 - 2014

Mineração de dados e textos. (Carga horária: 15h). , Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas, CPQRR, Brasil.

2014 - 2014

Tópicos avançados em Bioinformática. (Carga horária: 45h). , Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas, CPQRR, Brasil.

2013 - 2013

Extensão universitária em Tópicos em Bioinformática. (Carga horária: 40h). , Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas, CPQRR, Brasil.

2013 - 2013

Biologia Molecular. (Carga horária: 8h). , Centro Universitário UNA, UNA, Brasil.

2013 - 2013

Reverse Vaccinology. (Carga horária: 3h). , X-meeting, X-MEETING, Brasil.

2012 - 2012

Fertilização in vitro. (Carga horária: 10h). , Centro Universitário UNA, UNA, Brasil.

2012 - 2012

Capacitação em acidentes com animais peçonhentos. (Carga horária: 3h). , Fundação Ezequiel Dias, FUNED, Brasil.

2012 - 2012

Bioinformática Aplicada: uma abordagem forense. (Carga horária: 10h). , Centro Universitário UNA, UNA, Brasil.

2012 - 2012

Licenciamento Ambiental. (Carga horária: 20h). , Universidade Federal de Minas Gerais, UFMG, Brasil.

2012 - 2012

Toxicologia forense. (Carga horária: 8h). , Renova Cursos, RC, Brasil.

2011 - 2011

Extensão universitária em Empreendedorismo. (Carga horária: 14h). , SENAI - Departamento Regional de Minas Gerais, SENAI/DR/MG, Brasil.

2011 - 2011

Extensão universitária em Agentes Ambientais. (Carga horária: 120h). , Universidade Estadual do Ceará, UECE, Brasil.

2011 - 2011

Extensão universitária em Segurança do Trabalho. (Carga horária: 14h). , SENAI - Departamento Regional de Minas Gerais, SENAI/DR/MG, Brasil.

2011 - 2011

Extensão universitária em Educação Ambiental. (Carga horária: 14h). , SENAI - Departamento Regional de Minas Gerais, SENAI/DR/MG, Brasil.

2011 - 2011

Técnicas de Biologia Molecular. (Carga horária: 8h). , Centro Universitário UNA, UNA, Brasil.

2011 - 2011

Ciência e tecnologia. (Carga horária: 15h). , Fundação Getulio Vargas, FGV, Brasil.

2011 - 2011

Análise Forense de DNA. (Carga horária: 8h). , Renova Cursos, RC, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Espanhol

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioinformática.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Multidisciplinar.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

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Organização de eventos

CASALI, A. K. ; PUERTO, H. L. ; GONÇALVES, L. O. ; FREITAS, A, C. ; ALMEIDA, D. C. . VI Mostra de Biologia. 2013. (Outro).

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Participação em eventos

XXXIII Anual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology.Comparative transcriptome analysis of antomony resistant ans susceptible Leishmania infantum lines. 2017. (Outra).

XXXIII Anual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology.Comparative transcriptome analysis of antomony resistant ans susceptible Leishmania infantum lines. 2017. (Outra).

Campus Party Minas Gerais 2016.Bioinformática: ciência de fronteira que faz a ponte entre exatas e biológicas. 2016. (Outra).

Campus Party Minas Gerais 2016.Bioinformática: ciência de fronteira que faz a ponte entre exatas e biológicas. 2016. (Outra).

III Congresso de Saúde e Meio Ambiente UNA. Bioinformática: Uso de Biossistemas para Identificação d e Espécies Patogênicas. 2016. (Congresso).

23th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology 14h European Conference on Computational Biology. RNA-Seq analysis in Leishmania infantum reveals differentially expressed genes related to drug resistance. 2015. (Congresso).

III Seminário de Extensão e Iniciação Científica.Representação Sistêmica de processamento de informação genética durante síntese proteíca. 2013. (Seminário).

Symposium in honor of Ron Dickman.Periodic properties of amino acids in the secondary structures of polypeptide chains. 2013. (Simpósio).

X-Meeting. Comparative Genomic Between Yeasts of Biotechological Interest. 2013. (Congresso).

X-Meeting. A strain of Paracoccidioides brasiliensis defective in the thermodimorphic shift: A genomic comparative approach. 2013. (Congresso).

XXI Reunião Anual de Iniciação Científica.Estudo de abordagens computacionais para a identificação de grupos ortólogos associados ao dimorfismo de fungos patogênicos. 2013. (Outra).

Congresso de Saúde e Meio Ambiente UNA. Cigarro: a droga legalizada. 2012. (Congresso).

9º Seminário Meio Ambiente e Cidadania. 2011. (Seminário).

IV Fórum Internacional de Comunicação e Sustentabilidade. 2011. (Outra).

IV Simpósio Acadêmico - PUC/MG. 2011. (Simpósio).

V Mostra de Biotecnologia e Meio Ambiente. 2011. (Outra).

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Participação em bancas

Aluno: Paul Anderson Souza Guimarães

GONÇALVES, L. O.; OLIVEIRA, L. M.; RUIZ, J. C.. TriatoKey: atualização e desenvolvimento de uma chave virtual para identificação de triatomíneos brasileiros - projeto triatokey versao 2. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Centro Universitário UNA.

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Comissão julgadora das bancas

Flávio Marcos Gomes de Araújo

Pais, f; TOLEDO, J. S.; RUIZ, J. C.;ARAÚJO, F. M. G.. Analise de dados de sequenciamento de RNA voltados a comparação da expressão gênica visando a um melhor entendimento dos mecanismos de resistência aos antimoniais. 2017. Dissertação (Mestrado em Curso de Pós Graduação em Ciência da Saúde) - Centro de Pesquisa Rene Rachou.

Daniela de melo Resende

RESENDE, D. M.RUIZ, J. C.; Oliveira, Luciana M.; Costa, D.A.. Estudo de abordagens computacionais para a identificação de grupos ortólogos associados ao dimorfismo de grupos patogênicos. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Centro Universitário UNA.

Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais

PAIS, FABIANO SVIATOPOLK-MIRSKY; TOLEDO, J. S.. Análise de dados de sequenciamento de RNA voltados a comparação da expressão gênica visando um melhor entendimento dos mecanismos de resistência aos antimoniais. 2017. Dissertação (Mestrado em Pós-graduação em Ciências da Saúde) - Centro de Pesquisas René Rachou / Fundação Oswaldo Cruz.

Jerônimo Conceição Ruiz

RUIZ, J. C.; Oliveira, L. M.; COSTA, D. A.;RESENDE, D. M.. Estudo de abordagens computacionais de identificação de grupos ortólogos associados a virulência de fungos patogênicos. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Centro Universitário UNA.

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Orientou

Arthur Rocha de Abreu

Identificação computacional de polimorfismos de base única, que possam estar associados à resistência ao antimônio trivalente, em cepas de Leishmania infantum; 2018; Iniciação Científica - Instituto René Rachou; Orientador: Leilane Oliveira Gonçalves;

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Foi orientado por

Luciana Márcia de Oliveira

Estudo de abordagens computacionais para a identificação de grupos ortólogos associados ao dimorfismo de fungos patogênicos; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas-Meio Ambiente e Biotecnologia) - centro universitário UNA, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Luciana Márcia de Oliveira;

Daniela de melo Resende

Integração e análise de dados multi-ômicos visando à identificação computacional de potenciais candidatos vacinais em Leishmania infantum e Trypanossoma cruzi; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Jerônimo Conceição Ruiz

Integração e análise de dados multi ômicos de tripanosomatídeos visando a identificação computacional de potenciais candidatos vacinais; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz; (Orientador);

Jerônimo Conceição Ruiz

Análise de expressão diferencial via sequenciamento em larga escala de RNA (RNA-Seq) em organismos com importância na saúde pública; 2015; Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde) - Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jeronimo Conceição Ruiz;

Jerônimo Conceição Ruiz

Estudo de abordagens computacionais de identificação de grupos ortólogos associados a virulência de fungos patogênicos; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Centro Universitário UNA, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jeronimo Conceição Ruiz;

Jerônimo Conceição Ruiz

Estudo de abordagens computacionais para identificação de grupos ortólogos associados ao dimorfismo em fungos patogênicos; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Centro Universitário UNA, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Jeronimo Conceição Ruiz;

Silvane Maria Fonseca Murta

Análise de dados de sequenciamento de RNA voltados à comparação de expressão gênica visando a um melhor entendimento dos mecanismos de resistência aos antimoniais; 2017; Dissertação (Mestrado em Ciências da Saúde Área de Concentração Biologia Ce) - Centro de Pesquisas René Rachou,; Coorientador: Silvane Maria Fonseca Murta;

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Produções bibliográficas

  • LATORRE-ESTIVALIS, JOSE MANUEL ; ROBERTSON, HUGH M. ; WALDEN, KIMBERLY K. O. ; RUIZ, JERÔNIMO ; GONÇALVES, LEILANE OLIVEIRA ; GUARNERI, ALESSANDRA A. ; LORENZO, MARCELO GUSTAVO . The molecular sensory machinery of a Chagas disease vector: expression changes through imaginal moult and sexually dimorphic features. Scientific Reports , v. 7, p. 40049, 2017.

  • GONÇALVES, LEILANE O ; LUCIANA, M DE OLIVEIRA ; GRASIELLE, C D?ÁVILA PESSOA ; ROSA, ALINE CL ; BUSTAMANTE, MARINELY G ; BELISÁRIO, CARLOTA J ; RESENDE, DANIELA M ; DIOTAIUTI, LILEIA G ; RUIZ, JERONIMO C . Insights from tissue-specific transcriptome sequencing analysis of Triatoma infestans. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ , v. 112, p. 456-457, 2017.

  • OLIVEIRA, LUCIANA M. ; RESENDE, DANIELA M. ; DORNELES, ELAINE M. S. ; HORÁCIO, ELVIRA C. A. ; ALVES, FERNANDA L. ; GONÇALVES, LEILANE O. ; TAVARES, GRACE S. ; STYNEN, ANA PAULA R. ; LAGE, ANDREY P. ; RUIZ, JERONIMO C. . Complete Genome Sequence of Type Strain subsp. ATCC 27374. Genome Announcements , v. 4, p. e01344-16, 2016.

  • GUIMARAES, F. G. ; GONÇALVES, L. O. ; RESENDE, D. M. ; RUIZ, J. C. . A modular methodology to integrate gene expression and proteomics data into protein-protein interaction (PPI) networks, using public databases and open source softwares. In: XXXIII Anual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2017, Caxambu. Anais da XXXIII Anual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2017.

  • VELLOSO, J. P. L. ; GUIMARAES, P. A. S. ; BRITO, R. C. F. ; GONÇALVES, L. O. ; GUIMARAES, F. G. ; TAVARES, G. S. ; RESENDE, D. M. ; REIS, A. B. ; RUIZ, J. C. . Immune-structural association between epitopes and predicted disordered regions. In: XXXIII Anual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2017, Caxambu. Anais da XXXIII Anual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology, 2017.

  • GONÇALVES, L. O. ; GUIMARAES, F. G. ; GUIMARAES, P. A. S. ; TOLEDO, H. ; RESENDE, D. M. ; MURTA, S. M. F. ; RUIZ, J. C. . SNP discovery in Leishmania infantum transcriptome using RNA sequencing approach. In: ISMB, 2017, Praga. Proceedings of ISMB, 2017.

  • GUIMARAES, F. G. ; GONÇALVES, L. O. ; TOLEDO, H. ; RESENDE, D. M. ; RUIZ, J. C. . Integrating gene expression and proteomics data into protein-protein interactions networks using a modular methodology based on open source software. In: ISMB, 2017, Praga. Proceedings of ISMB, 2017.

  • GOUVEIA-EUFRASIO, L. ; TAVARES, G. S. ; GONÇALVES, L. O. ; RUIZ, J. C. ; SANTOS, D. A. . Genômica Comparativa de Vias Metabólicas de Cryptococcus spp.. In: IV Simpósio de Microbiologia da UFMG, 2017, Belo Horizonte. Anais do IV Simpósio de Microbiologia da UFMG, 2017.

  • FERREIRA, F. C. ; DIOTAIUTI, L. G. ; GRANATO, A. F. ; GONÇALVES, L. O. ; MOURA, L. V. ; KOERICH, L. B. ; RUIZ, J. C. ; BELISARIO, C. J. . IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE MARCADORES MICROSSATÉLITES PARA ESTUDO POPULACIONAL DE Panstrongylus megistus (REDUVIIDAE: TRIATOMINAE). In: VIII Encontro de Pesquisa em Parasitologia - Esquecidas por quem? Doenças negligenciadas: da pesquisa à sociedade, um elo perdido., 2017, Belo Horizonte. VIII Encontro de Pesquisa em Parasitologia, 2017.

  • VELLOSO, J. P. L. ; GONÇALVES, L. O. ; GUIMARAES, F. G. ; GUIMARAES, P. A. S. ; RESENDE, D. M. ; RUIZ, J. C. . A knowledge shared database of trypanosomatids: Integrating RNAi and genomic data. In: XXXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XLIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2016, Caxambu. Proceedings of XXXII Meeting of the Brazilian Society of Protozoology XLIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas? Disease, 2016.

  • GONÇALVES, L. O. ; GUIMARAES, F. G. ; VELLOSO, J. P. L. ; RESENDE, D. M. ; EL-SAYED, N. ; AHMAD, R. ; BURLEIGH, B. ; MANNING-CELA, R. G. ; RUIZ, J. C. . System biology of T. cruzi infectivity: A transcriptomics and shotgun proteomics study of infective and non infective strains. In: XXXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XLIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2016, Caxambu. Proceedings of XXXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XLIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease, 2016.

  • GUIMARAES, F. G. ; GONÇALVES, L. O. ; VELLOSO, J. P. L. ; RESENDE, D. M. ; EL-SAYED, N. ; AHMAD, R. ; BURLEIGH, B. ; MANNING-CELA, R. G. ; PIRES, D. E. V. ; RUIZ, J. C. . Bringing to light biological information: integrating massive RNA and shotgun proteomics in protein-protein interaction networks. In: XXXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XLIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease in Caxambu, 2016, Caxambu. Proceedings of XXXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology / XLIII Annual Meeting on Basic Research in Chagas Disease in Caxambu, 2016.

  • TAVARES, G. S. ; HORACIO, E. C. A. ; GONÇALVES, L. O. ; RESENDE, D. M. ; RUIZ, J. C. . Addressing the protein disorder content in Cryptococcus spp. genomes.. In: ISMB/ECCB 2015, 2015, 2015, Dublin. Proceedins of ISMB/ECCB, 2015.

  • GUIMARAES, F. G. ; GONÇALVES, L. O. ; ANDRADE, J. ; RESENDE, D. M. ; PESCHER, P. ; SPAETH, G. ; MURTA, S. M. F. ; PIRES, D. E. V. ; RUIZ, J. C. . Integration of gene expression data of Leishmania infantum via biological interaction networks.. In: X meeting, 2015, São Paulo. Proceedins of X-Meeting 2015, 2015.

  • GONÇALVES, L. O. ; ANDRADE, J. ; DELFINO, R. G. ; RESENDE, D. M. ; PESCHER, P. ; SPAETH, G. ; MURTA, S. M. F. ; RUIZ, J. C. . RNA-Seq analysis in Leishmania infantum reveals differentially expressed genes related to drug resistance. In: ISMB/ECCB 2015, 2015, Dublin. Proceedins of ISMB/ECCB 2015, 2015.

  • GONÇALVES, L. O. ; SEMENCHENKO, A. ; EPIFÂNIO, C. A. ; CRUZ, B. P. . Análise de processamento de sinais genéticos. In: Congresso de Saúde e Meio Ambiente UNA, 2012, Belo Horizonte. ANAIS DO I CONGRESSO DE SAÚDE E MEIO AMBIENTE UNA, 2012.

  • FREITAS, A, C. ; GONÇALVES, L. O. ; ALMEIDA, D. C. ; OLIVEIRA, N. ; ESTEFÂNIA, A. ; EVANGELISTA, G. . Cigarro: a droga legalizada. In: Congresso de Saúde e Meio Ambiente UNA, 2012, Belo Horizonte. ANAIS DO I CONGRESSO DE SAÚDE E MEIO AMBIENTE UNA, 2012.

  • GONÇALVES, L. O. ; GUIMARAES, F. G. ; RESENDE, D. M. ; VELLOSO, J. P. L. ; LIARTE, D. B. ; ANDRADE, J. ; OLIVEIRA, L. M. ; DELFINO, R. G. ; PESCHER, P. ; SPAETH, G. ; MURTA, S. M. F. ; RUIZ, J. C. . Comparative transcriptome analysis of antomony resistant ans susceptible Leishmania infantum lines. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • GONÇALVES, L. O. ; ANDRADE, J. ; DELFINO, R. G. ; RESENDE, D. M. ; PESCHER, P. ; SPAETH, G. ; MURTA, S. M. F. ; RUIZ, J. C. . RNA-Seq analysis in Leishmania infantum reveals differentially expressed genes related to drug resistance. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • GUIMARAES, F. G. ; GONÇALVES, L. O. ; ANDRADE, J. ; RESENDE, D. M. ; PESCHER, P. ; SPAETH, G. ; MURTA, S. M. F. ; PIRES, D. E. V. ; RUIZ, J. C. . Integration of gene expression data of Leishmania infantum via biological interaction networks. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • TAVARES, G. S. ; HORACIO, E. C. A. ; GONÇALVES, L. O. ; RESENDE, D. M. ; RUIZ, J. C. . Addressing the protein disorder content in Cryptococcus spp. genomes. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • GONÇALVES, L. O. ; SEMENCHENKO, A. . Representação sistêmica de processamento de informação genéticadurante síntese proteíca. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • GONÇALVES, L. O. ; SEMENCHENKO, A. . Periodic properties of amino acids in the secondary structures of > polypeptide chains. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • COSTA, D. A. ; DINIZ, R. H. S. ; GONÇALVES, L. O. ; HORACIO, E. C. A. ; SILVEIRA, W. B. ; GONZALEZ-SISO, M. I. ; CERDAN, M. E. ; FIETTO, L. G. ; PASSOS, F. M. L. ; RUIZ, J. C. . Comparative Genomic Between Yeasts of Biotechological Interest. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • OLIVEIRA, L. M. ; RESENDE, D. M. ; GONÇALVES, L. O. ; CRUZ, R. C. ; RIBEIRO, J. M. ; RUIZ, J. C. ; CISALPINO, P. S. . A strain of Paracoccidioides brasiliensis defective in the thermodimorphic shift: a comparative genomic approach. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • GONÇALVES, L. O. ; OLIVEIRA, L. M. ; CISALPINO, P. S. ; RUIZ, J. C. . Estudo de abordagens computacionais de identificação de grupos ortólogos associados a virulência de fungos patogênicos. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • GONÇALVES, L. O. ; FREITAS, A, C. ; ALMEIDA, D. C. ; OLIVEIRA, N. ; ESTEFÂNIA, A. ; EVANGELISTA, G. . Cigarro: a droga legalizada. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

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Outras produções

GONÇALVES, L. O. . Bioinformática: um apanhado global de técnicas e abordagens do cotidiano científico. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

GONÇALVES, L. O. . Bioinformática: Uso de Biossistemas para Identificação d e Espécies Patogênicas. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

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Projetos de pesquisa

  • 2017 - Atual

    Integração e análise de dados multi-ômicos visando a identificação computacional de potenciais candidatos vacinais em ​ Leishmania infantum ​ e ​ Trypanossoma cruzi, Descrição: A origem do que hoje chamamos de ?Sequenciamento de Nova Geração? foi impulsionada pelo sequenciamento do genoma humano e pela necessidade de inovações técnicas, tecnológicas e computacionais que viabilizassem o projeto e reduzissem os custos e o tempo de análise. Tais desdobramentos tecnológicos possibilitaram, de uma maneira sem precedentes, o aumento dos estudos de genômica, transcriptômica e proteômica e, consequentemente, o volume de dados gerados. Nesse contexto, a integração de dados ômicos podem se tornar uma grande aliada na pesquisa biomédica. Isso porque abordagens computacionais direcionadas à integração de dados têm o potencial de proporcionar uma visão holística e de viabilizar a produção de conhecimento biológico a partir de múltiplos conjuntos de dados, o que é impossível de ser alcançado quando um conjunto isolado de informações é analisado. Um grupo de organismos de grande interesse em saúde pública e causadores do conjunto de doenças negligenciadas conhecidas como leishmanioses são os parasitos protozoários do gênero Leishmania. Considerando que esses microrganismos são agentes etiológicos de uma importante doença negligenciada, pesquisas que tragam novas perspectivas para o entendimento dos mecanismos de resistência aos compostos antimoniais são de particular importância. Nessa pesquisa analisaremos o transcriptoma de duas cepas de Leishmania infantum (MHOM/BR/74/PP75), uma suscetível (LiWTS) e outra resistente ao antimônio trivalente (SbIII) (LiSbR), que foram sequenciadas na plataforma Illumina HiSeq 2000. Diante disso, e tendo como meta a busca de alvos para o desenvolvimento de uma vacina contra leishmaniose visceral, integraremos, em um banco de dados relacional modelado em função da complexidade do problema biológico em estudo: dados de expressão gênica (​RNASeq); dados de expressão proteica (​shotgun proteomics); dados relacionados a vias metabólicas; dados relacionados à taxa de divergência das proteínas (frequência relativa de SNPs); dados relacionados à similaridade de sequências do parasito com seus hospedeiros (homologia) e dados relacionados à predição computacional de epítopos (imunoinformática). Com este trabalho esperamos obter uma melhor compreensão das bases moleculares e dos mecanismos bioquímicos envolvidos no processo de resistência ao SbIII em L. infantum, assim como as alterações metabólicas relacionadas a esses mecanismos, visando monitorar a progressão do processo de resistência e também aprimorar o entendimento das formas mais eficazes de intervenção profilática ou melhoria da quimioterapia utilizada atualmente contra este parasito.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Leilane Oliveira Gonçalves - Integrante / Jeronimo Conceição Ruiz - Coordenador / Daniela de Melo Resende - Integrante / Silvane Maria Fonseca Murta - Integrante / Arthur Rocha de Abreu - Integrante.

  • 2017 - Atual

    Resistência vs Susceptibilidade A Piretróides Em Triatomíneos: Caracterizando Perfis Transcricionais, Descrição: Causada pelo Trypanosoma cruzi Chagas 1909, a doença de Chagas (DC) é considerada uma enfermidade tropical, endêmica da América Latina e incluída na lista das doenças negligenciadas pela World Health Organization (WHO). A distribuição geográfica da infecção chagásica humana, incluindo reservatórios silvestres e vetores, se estende desde os Grandes Lagos da América do Norte até o sul da Argentina e do Chile sendo exceções às espécies do gênero Linchosteus e o complexo Rubrofasciata (COURA & DIAS, 2009).O controle químico foi bem sucedido na maioria dos países do Cone Sul. Uruguai, Chile e Brasil foram certificados como livres da transmissão vetorial pelo T.infestans nos últimos anos. Contudo, o sucesso é limitado no Chaco da Argentina, Bolívia e Paraguai, e apesar dos esforços contínuos, a transmissão endêmica continua alta nestas regiões. Entre os vários fatores que podem explicar tal limitação de controle, podem-se considerar principalmente: a resistência dos triatomineos aos inseticidas, a dificuldade de controlar o vetor nas estruturas peridomésticas e a presença de focos silvestres (GÜRTLER, 2009). Na busca de um melhor entendimento dos fatores associados aos mecanismos de resistência de triatomíneos aos inseticidas, acreditamos que um dos mais relevantes cenários seria a análise comparativa de transcriptomas pelo desenvolvimento de uma metodologia computacional integrativa associada à um banco de dados modelado especificamente aos dados gerados. Para tal escolha pressupõe-se a existência de populações de T. infestans suscetíveis e resistentes aos inseticidas de interesse. Tal conhecimento, contemplando suas variações pode representar uma ferramenta importante para o entendimento de elementos funcionais do genoma associados à resistência aos piretróides com potencial de trazer à luz aspectos ainda desconhecidos de tal temática.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leilane Oliveira Gonçalves - Integrante / Luciana Márcia de Oliveira - Integrante / Jeronimo C. Ruiz - Integrante / Daniela de Melo Resende - Integrante / Aline C. L. Rosa - Integrante / Carlota J. Belisário - Integrante / Lileia G. Diotaiuti - Coordenador.

  • 2015 - Atual

    GENÔMICA COMPUTACIONAL DE TRIPANOSOMATÍDEOS: INTEGRAÇÃO DE DADOS GENÔMICOS, DE TRANSCRIPTOMA E PROTEOMA VISANDO O ESTUDO DOS MECANISMOS DE RESISTÊNCIA À DROGAS, Descrição: O projeto tem como objetivo integrar dados genômicos, proteômicos e de transcriptoma de tripanosomatídeos através do estabelecimento de um banco de dados modelado segundo o modelo knowledge base (KB) visando o entendimento do fenômeno de resistência à drogas em Leishmania. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leilane Oliveira Gonçalves - Integrante / Luciana Márcia de Oliveira - Integrante / Jeronimo C. Ruiz - Coordenador / Juvana Andrade - Integrante / Daniela de Melo Resende - Integrante / Pascale Pescher - Integrante / Gerald Spaeth - Integrante / Silvane Maria Fonseca Murta - Integrante / TAVARES, GRACE S. - Integrante.

  • 2014 - Atual

    Análise de expressão diferencial (RNASeq) de organismos de importância em saúde pública, Descrição: Talvez um dos principais desafios da biologia moderna, senão o maior, esteja associado à conversão da avalanche de dados gerada pelas tecnologias de alta vazão de dados em conhecimento biológico.Integração de dados de diferentes origens, abordagens de estudo e a geração de modelos de predição matemáticos que direcionam a experimentação assertiva, são aspectos chave desse processo. Com relação as leishmanioses (grupo de doenças zoonóticas causadas por protozoários parasitas do gênero Leishmania) insucessos terapêuticos têm sido reportados no Brasil em volume que chega a abranger 25% dos casos tratados. Dentro da perspectiva de biologia de sistemas e tendo como objetivo central a elucidação das interações moleculares (DNA, RNA e proteína) associadas aos mecanismos biológicos de resistência à antimoniais, o presente projeto visa a integração computacional de dados de sequenciamento de nova geração de RNA (RNASeq) de cepas de sensíveis e resistentes à antimoniais, genômica comparativa entre diferentes espécies de Leishmania e redes de interação de proteínas em um banco de dados relacional modelado de forma a albergar e explorar a diversidade de informações genômicas analisadas. Complementarmente, como a abordagem de genômica computacional integrativa visando a elucidação dos mecanismos de resistência a drogas ainda é pouco explorada nos genomas de tripanosomatídeos, esse projeto deverá contribuir para o entendimento de aspectos ainda desconhecido biologia complexa desses parasitos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leilane Oliveira Gonçalves - Integrante / Jeronimo C. Ruiz - Coordenador.

  • 2013 - 2014

    Estudo de abordagens computacionais para a identificação de grupos ortólogos associados ao dimorfismo de fungos patogênicos, Descrição: A biologia de sistemas é uma área emergente que viabiliza determinar como as vias de interação convergem e atuam sobre um organismo. Um dos organismos modelos que podem se beneficiar da biologia de sistemas são os fungos. Nesse contexto a biologia de sistemas pode ser utilizada, por exemplo, para identificação de fatores de virulência e dimorfismo. Os objetivos propostos com o desenvolvimento do trabalho são: a) identificar grupos ortólogos associados ao dimorfismo e virulência nos fungos do complexo Paracoccidioides, agente etiológico causador da paracoccidioidomicose (PCM); e b) Utilizar abordagens de genomica comparativa para avaliar a relação entre os demais fungos patogênicos caracterizados como fungos dimórficos. As informações obtidas para a realização desse estudo foram extraídas da base de dados do Broad Institute of MIT and Harvard e os algoritmos utilizados para o agrupamento de dados, ou seja, clusters para a análise de ortologia foram OrthoMCL o BlastClust. Como resultados dessas análises foram identificados 15.444 clusters gênicos classificados como ortólogos para a categoria de fungos dimórficos e 7.454 para os organismos do complexo Paracoccidioides. As características mais relevantes observadas foram às associadas aos genes de resistência a múltiplas drogas, proteínas de heat shock e também um grande número de proteínas anotadas como hipotéticas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leilane Oliveira Gonçalves - Integrante / Luciana Márcia de Oliveira - Integrante / Jeronimo C. Ruiz - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2012 - 2013

    Representação sistêmica do processamento de informação genética durante síntese proteíca, Descrição: O projeto visa estudar os elementos das células vivas responsáveis pelo processamento de informação genética. Estes elementos serão abstraídos dos detalhes bioquímicos. Somente as características, propriedades e comportamentos relativos ao processamento de informação serão mantidos na abstração. Estes elementos serão estudados com as técnicas de processamento de sinais, modelagem e analise de sistemas. Os sinais de entrada e sinais de saída são as sequências genéticas representadas numericamente. As funções de transferência, representações por meio de equações de estado ou por meio de S-systems serão identificados por meio de cálculos numéricos. O conhecimento gerado será empregado para entender o comportamento computacional envolvido na transformação das sequências genéticas. Com isto, o projeto, pretende contribuir na explicação do fenômeno de otimização de codons.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Leilane Oliveira Gonçalves - Integrante / Anton Semenchenko - Coordenador.

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Prêmios

2016

Menção honrosa pelo trabalho: Bringing to light biological information: integrating massive RNA and shotgun proteomics in protein-protein interaction networks, Sociedade Brasileira de Protozoologia.

2013

Destaque acadêmico pelo trabalho: Manejo integrado de pragas na cultura do arroz (Oryza sativa), Centro Universitário UNA.

2011

Destaque acadêmico pelo trabalho: "Introdução de espécies não nativas de peixes no meio urbano", Centro Universitário UNA.

2011

Destaque acadêmico pelo trabalho: "Tabaco: a droga legalizada", Centro Universitário UNA.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Fundação Oswaldo Cruz (MG), Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas. , Avenida Augusto de Lima - de 1001 ao fim - lado ímpar, Barro Preto, 30190002 - Belo Horizonte, MG - Brasil - Caixa-postal: 31748503, Telefone: (31) 33497798, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2018 - 2018

    Fundação Oswaldo Cruz

    Vínculo: Monitora, Enquadramento Funcional: Monitora, Carga horária: 20

    Outras informações:
    Monitora na disciplina Identificação de alvos vacinais através da vacinologia reversa (IOC15009)

  • 2015 - Atual

    Fundação Oswaldo Cruz (MG)

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estudante de Mestrado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2014 - 2015

    Fundação Oswaldo Cruz (MG)

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Apoio Técnico, Carga horária: 20

  • 2013 - 2014

    Fundação Oswaldo Cruz (MG)

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 07/2013

      Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Pesquisa René Rachou - FIOCRUZ Minas, .,Linhas de pesquisa

  • 2018 - 2018

    Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

    Vínculo: Monitora, Enquadramento Funcional: Monitora, Carga horária: 45

    Outras informações:
    Monitora no I ciclo de capacitação em Bioinformática ? UNESP Araraquara

  • 2012 - 2013

    Centro Universitário UNA

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista de Iniciação Científica, Carga horária: 16

    Atividades

    • 07/2012 - 06/2013

      Pesquisa e desenvolvimento , Centro Universitário UNA, .,Linhas de pesquisa

  • 2013 - 2013

    Museu de História Natural e Jardim Botânico da UFMG

    Vínculo: Estágiaria, Enquadramento Funcional: Voluntária, Carga horária: 20