Pedro de Sá Tavares Russo

Formado no curso de Bacharelado em Biotecnologia pela Universidade Federal de São Carlos (2014). Atualmente sou aluno de Doutorado Direto do Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática sob orientação do Prof. Dr. Helder Takashi Imoto Nakaya, no Laboratório de Biologia de Sistemas Computacional na Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo. Estou desenvolvendo uma ferramenta para a obtenção de módulos de coexpressão gênica através de dados de transcriptoma. Auxiliei no desenvolvimento de uma ferramenta SharePoint para os documentos do departamento de Regulatory Crop Protection da Dow AgroSciences- São Paulo (2014) Desenvolvi um banco de dados para documentos do departamento de Regulatory Seeds and Regulatory Affairs da Dow AgroSciences - RIbeirão Preto. (2014) Realizei Trabalho de Conclusão de Curso em estudos comportamentais a respeito do período da memória emocional em que a droga Clorfeniramina age na amídala de camundongos no Laboratório de Neurociências no Departamento de Fisioterapia da Universidade Federal de São Carlos, sob orientação da Profa. Dra. Rosana Mattioli. (2013) Participei do programa Ciência Sem Fronteiras patrocinado pela agência governamental CAPES, permanecendo como aluno do curso de graduação em Biology da Rensselaer Polytechnic Institute em Troy, NY durante o período letivo de 2012. Realizei um projeto de Iniciação Científica com bolsa PIBIC do CNPq em Biologia Molecular visando a otimização de obtenção de processos enzimáticos, orientado pela Profa. Dra. Rosineide Gomes da Silva do Departamento de Engenharia Química da Universidade Federal de São Carlos. (2011)

Informações coletadas do Lattes em 02/06/2022

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em andamento em Bioinformática

2016 - Atual

Universidade de São Paulo
Título: ConsensusGraph: Avaliando a Estabilidade de Redes Gênicas,
Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya

Mestrado interrompido em 2016 em Bioinformática

2015 - interrompida

Universidade de São Paulo
Título: ConsensusGraph: Avaliando a Estabilidade de Redes Gênicas,Orientador:
Helder Takashi Imoto Nakaya.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Ano de interrupção: 2016

Graduação em Biotecnologia

2009 - 2014

Universidade Federal de São Carlos

Graduação em Biology

2012 - 2013

Rensselaer Polytechnic Institute
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Formação complementar

2015 - 2015

Curso de Verão em Bioinformática 2015. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2015 - 2015

miRNAs e proteínas de união a RNA em neurogêneses. (Carga horária: 1h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2013 - 2013

Células Tronco: Implicações para a Medicina e Biot. (Carga horária: 5h). , Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.

2013 - 2013

PCR em Tempo Real - Teoria, Aplicações e Análises. (Carga horária: 5h). , Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.

2010 - 2010

MicroRNAs e Câncer: atualizações. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2010 - 2010

Epigenética, suas funções e sua relação com doença. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Organização de eventos

RUSSO, P. S. T. ; BURGER, M. C. ; CICONELLE, A. C. M. ; DURHAM, A. M. ; SETUBAL, J. C. ; COUTO, C. M. V. ; AMGARTEN, D. E. ; LIMA, F. P. ; REGO, F. O. R. ; MAJOR, G. ; MOURA, L. M. S. . Curso de Verão em Bioinformática. 2016. (Outro).

RUSSO, P. S. T. ; BURGER, M. C. ; CICONELLE, A. C. M. ; DURHAM, A. M. ; SETUBAL, J. C. ; COUTO, C. M. V. ; AMGARTEN, D. E. ; LIMA, F. P. ; REGO, F. O. R. ; MAJOR, G. ; MOURA, L. M. S. . Curso de Verão em Bioinformática. 2016. (Outro).

Participação em eventos

X-Meeting 2017 - 13th International Conference of the AB3C. Cancer immunology of Cutaneous Melanoma: A Systems Biology Approach. 2017. (Congresso).

X-Meeting 2017 - 13th International Conference of the AB3C. CEMiTool: Coexpression Modules identification Tool. 2017. (Congresso).

X-Meeting 2017 - 13th International Conference of the AB3C. 2017. (Congresso).

Brazilian Summer School in Machine Learning 2016. 2016. (Oficina).

Hospital Innovation Show 2016. 2016. (Feira).

Workshop Beyond Zika - A Tripartite Initiative - USP/ Institut Pasteur/ FioCruz. 2016. (Oficina).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. Using Systems Biology to Understand Immunosenescence. 2016. (Congresso).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. CEMiTool: Co-expression Modules Identification Tool. 2016. (Congresso).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. Cancer Immunology of Cutaneous Melanoma: A Systems Biology Approach. 2016. (Congresso).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. CEMiTool: Co-expression Modules Identification Tool. 2016. (Congresso).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. 2016. (Congresso).

2º Minicurso: Transcriptômica com RNAseq. 2015. (Oficina).

CBAB 2015 - Use of Bioinformatics for the Study of Vaccines.WGCNA. 2015. (Encontro).

II International Symposium on Pathophysiology and Toxicology. 2015. (Simpósio).

UGPN Doctoral Seminar 2015: 'From cells to societies: the roles of modelling in improving health outcomes?.Assessing the Stability of Gene Networks. 2015. (Seminário).

VII Simposio de Pós-Graduação em Análises Clínicas. 2015. (Simpósio).

V Four Biotec - Quatro Dias Pela Biotecnologia. 2013. (Seminário).

V Simpósio de Transtornos Cognitivos e Demências. 2013. (Simpósio).

COBEQ 2012 - XIX Congresso Brasileiro de Engenharia Química. Transformação por Protoplastos de Três Linhagens de Bacillus Megaterium Visando a Produção de Penicilina G Acilase Recombinante. 2012. (Congresso).

III Four Biotec - Quatro Dias Pela Biotecnologia. 2011. (Seminário).

56o Congresso Brasileiro de Genética. 2010. (Congresso).

II Four Biotec - Quatro Dias Pela Biotecnologia. 2010. (Seminário).

I Four Biotec - Quatro Dias Pela Biotecnologia. 2009. (Seminário).

Comissão julgadora das bancas

Davilene Gigo Benato

MATTIOLI, R.; SERAFIM, K. R.;Gigo-Benato, Davilene. Papel da Clorfeniramina microinjetada na amídala de camundongos na memória emocional.. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos.

Kelly Regina Serafim

K.R. SERAFIM; Mattioli, R; BENATO, Davilene Gigo.. Papel da clorfeniramina microinjetada na amidala de camundongos na memória emocional. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos.

Diego Mauricio Riano Pachon

Russo, P;RIAO-PACHÓN, D.M.; SIMOES, A. C. Q.; REIS, E. M. R.; NAKAYA, H. T. I.. Desenvolvimento de uma Ferramenta Computacional para Análise de Co-Expressão Gênica e sua Aplicação na Biologia de Sistemas. 2019. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Helder Takashi Imoto Nakaya

NAKAYA, H. I.; RIANO, D. M.; SIMOES, A. C. Q.; REIS, E. M. R.. Desenvolvimento de uma Ferramenta Computacional para Análise de Co-Expressão Gênica e sua Aplicação na Biologia de Sistemas. 2019. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Helder Takashi Imoto Nakaya

NAKAYA, H. I.; REIS, E. M. R.; IAMBARTSEV, A.. CEMiTool: Uma ferramenta para a obtenção de módulos de coexpressão gênica. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Foi orientado por

Rosineide Gomes da Silva Cruz

Estudo da Técnica de Transformação por Eletroporação de Microrganismos para Produção de Penicilina G Acilase Recombinante; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Curso de Biotecnologia) - Universidade Federal de São Carlos, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Rosineide Gomes da Silva Cruz;

Helder Takashi Imoto Nakaya

Desenvolvimento de uma Ferramenta Computacional para Análise de Co-Expressão Gênica e sua Aplicação na Biologia de Sistemas; 2019; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya;

Produções bibliográficas

  • RUSSO, PEDRO S. T. ; FERREIRA, GUSTAVO R. ; CARDOZO, LUCAS E. ; BÜRGER, MATHEUS C. ; ARIAS-CARRASCO, RAUL ; MARUYAMA, SANDRA R. ; HIRATA, THIAGO D. C. ; LIMA, DIÓGENES S. ; PASSOS, FERNANDO M. ; FUKUTANI, KIYOSHI F. ; LEVER, MELISSA ; SILVA, JOÃO S. ; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS ; NAKAYA, HELDER I. . CEMiTool: a Bioconductor package for performing comprehensive modular co-expression analyses. BMC BIOINFORMATICS , v. 19, p. 1, 2018.

  • KASTURI, SUDHIR PAI ; KOZLOWSKI, PAMELA A. ; NAKAYA, HELDER I. ; BURGER, MATHEUS C. ; RUSSO, PEDRO ; PHAM, MATHEW ; KOVALENKOV, YEVGENIY ; SILVEIRA, EDUARDO L. V. ; HAVENAR-DAUGHTON, COLIN ; BURTON, SAMANTHA L. ; KILGORE, KATIE M. ; JOHNSON, MATHEW J. ; NABI, RAFIQ ; LEGERE, TRACI ; SHER, ZARPHEEN JINNAH ; CHEN, XUEMIN ; AMARA, RAMA R. ; HUNTER, ERIC ; BOSINGER, STEVEN E. ; SPEARMAN, PAUL ; CROTTY, SHANE ; VILLINGER, FRANCOIS ; DERDEYN, CYNTHIA A. ; WRAMMERT, JENS ; PULENDRAN, BALI . Adjuvanting a Simian Immunodeficiency Virus Vaccine with Toll-Like Receptor Ligands Encapsulated in Nanoparticles Induces Persistent Antibody Responses and Enhanced Protection in TRIM5α Restrictive Macaques. Journal of Virology (Print) , v. 91, p. e01844-16, 2017.

  • SERAFIM, K.R. ; RUSSO, P.S.T. ; FERNANDES, C.E.M. ; GIANLORENÇO, A.C.L. ; MATTIOLI, R. . Intra-amygdala microinjections of chlorpheniramine impair memory formation or memory retrieval in anxiety- and fear-mediated models. Brain Research Bulletin , v. 125, p. 127-133, 2016.

  • ESCALLON, A. M. V. ; RUSSO, P. S. T. ; ZANUCOLI, F. S. M. ; GOTO, L. S. ; CRUZ, R. G. S. ; GIORDANO, R. L. C. . Transformação por Protoplastos de Três Linhagens de Bacillus megaterium visando a Produção de Penicilina G Acilase Recombinante.. In: XIX Congresso Brasileiro de Engenharia Química, 2012, Búzios. Anais do XIX Congresso BRasileiro de Engenharia Química, 2012.

  • ESCALLON, A. M. V. ; RUSSO, P. S. T. ; ZANUCOLI, F. S. M. ; GOTO, L. S. ; CRUZ, R. G. S. ; GIORDANO, R. L. C. . Transformação por Protoplastos de Três Linhagens de Bacillus megaterium visando a Produção de Penicilina G Acilase Recombinante. In: XIX Congresso Brasileiro de Engenharia Química, 2012, Búzios, Rio de Janeiro. Anais de Resumo do XIX Congresso Brasileiro de Engenharia Química, 2012. p. 330.

Projetos de pesquisa

  • 2015 - Atual

    ConsensusGraph: Analisando a Estabilidade de Redes Gênicas, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Pedro de Sá Tavares Russo - Coordenador / Helder Takashi Imoto Nakaya - Integrante / Gustavo Rodrigues Ferreira - Integrante.

  • 2013 - 2013

    Clorfeniramina Induz Déficit na Aquisição da Memória Emocional em Camundongos Reexpostos ao Labirinto Em Cruz Elevado, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Pedro de Sá Tavares Russo - Coordenador / Rosana Mattioli - Integrante / Kelly Regina Saraiva - Integrante., Número de produções C, T & A: 1

  • 2011 - 2011

    Estudo da Técnica de Transformação por Eletroporação de Microrganismos para Produção de Penicilina G Acilase Recombinante, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Pedro de Sá Tavares Russo - Coordenador / Rosineide Gomes da Silva Cruz - Integrante / Ana Maria Velez Escallón - Integrante.

Prêmios

2017

Honorable Mention Award - Systems Biology and Networks - Poster "CEMiTool: Co-Expression Modules identification Tool ", AB3C.

2016

Vencedor do Hackathon Hack4Health, GE & Optum.

Histórico profissional

Experiência profissional

2016 - Atual

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2015 - 2016

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Mestrando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2014 - 2014

Dow Brasil

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 01/2014 - 12/2014

    Estágios , Regulatory Sciences and Regulatory Affairs, .,Estágio realizado, Regulatory Intern.

2013 - 2013

Universidade Federal de São Carlos

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluno de Trabalho de Conclusão de Curso, Carga horária: 40

2011 - 2011

Universidade Federal de São Carlos

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20