Juliana Domett Siqueira
Juliana Domett Siqueira é graduada em Biomedicina pela Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (UNIRIO) e Mestre (2012) e Doutora (2017) em Oncologia com ênfase em Oncovirologia pelo Programa de Pós Graduação em Oncologia do Instituto Nacional de Câncer. É atualmente Pós-Doutoranda do Instituto Nacional de Câncer, desenvolvendo pesquisa no Programa de Oncovirologia com ênfase em identificação de vírus e outros microorgnismos em diferentes tumores. Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Molecular e de Microorganismos; Virologia e Biologia Molecular.
Informações coletadas do Lattes em 25/06/2022
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Oncologia
2013 - 2017
Instituto Nacional de Câncer
Título: Análise da adaptabilidade e da diversidade dos tipos de HPV ao longo do tempo por Sequenciamento de Nova Geração em gestantes HIV+
Orientador: em Blood Systems Research Institute ( Eric Delwart)
com Esmeralda Augusta Jardim Machado Soares. Bolsista do(a): Ministério da Saúde, MS, Brasil. Palavras-chave: HPV; câncer cervical; HIV-1; gravidez; infecção múltipla.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Mestrado em Oncologia
2011 - 2012
Instituto Nacional de Câncer
Título: Caracterização Molecular do HPV em Gestantes HIV -Positivas e fatores de risco para a Persistência da Infecção pelo HPV após o Parto,Ano de Obtenção: 2012
Esmeralda Augusta Jardim Machado Soares.Bolsista do(a): Ministério da Saúde, MS, Brasil.
Graduação em Biomedicina
2007 - 2010
Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro
Título: Caracterização Molecular e Epidemiológica do HIV em pacientes soropoitivos na República dos Camarões
Orientador: Esmeralda Augusta Jardim Machado Soares
Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ, Brasil.
Pós-doutorado
2017
Pós-Doutorado. , Instituto Nacional de Câncer, INCA, Brasil. , Bolsista do(a): Ministério da Saúde, MS, Brasil.
Formação complementar
2013 - 2013
18th International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular. (Carga horária: 45h). , University of Florida, UF, Estados Unidos.
2008 - 2008
Introdução à Bioinformática. (Carga horária: 60h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
2007 - 2007
Imunogenética nos Transplantes de Órgãos e Tecidos. (Carga horária: 30h). , Universidade do Estado do Rio de Janeiro, UERJ, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Razoavelmente, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Francês
Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos/Especialidade: Virologia.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada/Especialidade: Microbiologia Médica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Organização de eventos
SIQUEIRA, J. D. ; SANTOS, J. E. M. ; ASSIS, J. C. S. O. ; RODRIGUES, L. O. R. ; ABDO, L. M. ; AZEVEDO, P. L. ; BONECKER, S. ; PASTOR, T. P. ; FERNANDES, V. C. ; DANTAS, A. P. ; SOARES, M. A. . X Curso de Verão em Oncologia. 2018. (Outro).
SIQUEIRA, J. D. ; SEGGES, P. A. M. ; NORONHA, E. ; CASADO, L. ; SABBO, P. ; CAPELA, R. ; MONTINELLI, V. ; BARBOSA, S. D. S. ; PINTO, L. F. R. . V Curso de Verão de Pesquisa em Oncologia. 2013. (Congresso).
Cruz, A. L. S. ; Nestal, G. ; SIQUEIRA, J. D. . Ciclo de Seminários Ciência no Programa. 2012. (Outro).
Cruz, A. L. S. ; Nestal, G. ; Siqueira, Juliana D. . Ciclo de Seminários Ciência no Programa. 2011. (Outro).
Siqueira, Juliana D. ; Oliveira, CFAL ; Oliveira, EMAL ; Santos, RT ; Souza, ICC ; Correlo, MM . II Semana de Biomedicina. 2009. (Outro).
SIQUEIRA, J. D. ; Correlo, MM ; Oliveira, CFAL ; Oliveira, EMAL ; Santos, RT ; Souza, ICC . I Semana de Biomedicina da UNIRIO. 2008. (Outro).
Participação em eventos
33st International Papillomavirus Conference. Comparison of human papillomavirus detection and genotyping assays: clinical and epidemiological limitations. 2020. (Congresso).
AACR Virtual Annual Meeting I. 2020. (Congresso).
AACR Virtual Annual Meeting II. 2020. (Congresso).
Congresso Brasileiro de Virologia. VIROME CHARACTERIZATION IN DIFFERENT TYPES OF NON-HODGKIN LYMPHOMA. 2018. (Congresso).
II International Meeting in Oncology. Virome characterization in different types of non-Hodgkin lymphoma. 2018. (Congresso).
31st International Papillomavirus Conference. Identification of novel human papillomavirus lineages and sublineages in HIV/HPV-coinfected pregnant women by next-generation sequencing. 2017. (Congresso).
3rd ICGEB Workshop on Human Papillomavirus and associated malignancies: biology, prevention and therapy.Analysis of cervical virome from HIV/HPV co-infected women by next-generation sequencing. 2017. (Outra).
International Meeting in Oncology Research. Virome characterization in different types of non-Hodgkin lymphoma. 2017. (Congresso).
CHALLENGES AND SOLUTIONS IN CANCER RESEARCH AND TREATMENT. Next-Generation Sequencing analysis of the adaptability and diversity of HPV types over time in HIV+ pregnant women. 2014. (Congresso).
VI Jornada de Pós-graduação Stricto-sensu do INCA.Análise por NGS da adaptabilidade e diversidade dos tipos de HPV ao longo do tempo em gestantes HIV+. 2014. (Outra).
18th International Bioinformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Analysis of the adaptability and diversity of HPV types over time in HPV+ pregnant women. 2013. (Simpósio).
EACR Summer Conference: Cancer Genomics. 2013. (Congresso).
Oficina Pré Curso - Bases da Patogênese do HIV. 2013. (Oficina).
VIII Curso de Patogênese do HIV. 2013. (Outra).
V Jornada de Pós-graduação Stricto-sensu do INCA.Análise por NGS da adaptabilidade e diversidade dos tipos de HPV ao longo do tempo em gestantes HIV+. 2013. (Outra).
I Encontro de Geneticistas do Estado do Rio de Janeiro. 2012. (Encontro).
14 World Congress of Cervical Pathology and Colposcopy - IFCPC. Genetic diversity of human papillomavirus among HIV+ pregnant women in Rio de Janeiro, Brasil. 2011. (Congresso).
III Jornada de Pós-graduação Stricto-sensu do INCA.Caracterização molecular do papillomavirus humano e sua persistência entre mulheres gestantes HIV+ no Rio de Janeiro, Brasil. 2011. (Outra).
IX Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS (SIMPAIDS).Genetic Diversity of Human Papillomavirus Among HIV+ Pregnant Women in Rio de Janeiro, Brazil. 2011. (Simpósio).
VII Jornada de Iniciação Científica do INCA.Diversidade molecular e genótipos do gene polimerase do HIV-1 entre indivíduos Camaronenses virgens de tratamento com doença. 2010. (Outra).
VIII SIMPÓSIO DE PESQUISA EM AIDS - SIMPAIDS.HIV-1 primary drug resistance in protease and reverse transcriptase polymerase and rnase h domains from viruses infecting cameroonian subjects. 2009. (Simpósio).
Participação em bancas
Siqueira, Juliana D.. Caracterização de genomas provirais quase completos do HIV-1 e mutações de resistência aos antirretrovirais por sequenciamento de nova geração em pacientes HIV+ do Rio de Janeiro e Rio Grande do Sul. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro.
SIQUEIRA, J. D.. Prevalência de HPV e aspectos inflamatórios em pacientes portadores de carcinoma de células escamosas de canal anal recorrente. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal Fluminense.
Siqueira, Juliana D.; LEITE, T. H.; FERREIRA, T. B.. ANÁLISE DAS TÉCNICAS DE REPRODUÇÃO HUMANA ASSISTIDA. 2013. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro.
Siqueira, Juliana D.. Caracterização Molecular e Epidemiológica do HIV-1 em Pessoas Privadas de Liberdade de Presídio Central de Porto Alegre: Diversidade Viral e Cadeias de Transmissão. 2012. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro.
Siqueira, Juliana D.. XII Curso de verão. 2020. Instituto Nacional de Câncer.
Orientou
Caracterização de genomas provirais completos do HIV-1 e mutações de resistência aos antirretrovirais de pacientes HIV+ da cidade de Rio Grande - Rio Grande do Sul; Início: 2021; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Ministério da Saúde; (Orientador);
Caracterização do genoma completo do novo coronavírus em pacientes oncológicos e servidores do Instituto Nacional de Câncer (INCA) previamente vacinados, reinfectados e/ou com infecção longa pelo SARS-CoV-2; Início: 2021; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
Vigilância genômica do novo coronavírus (SARS-CoV-2) em pacientes oncológicos e servidores do Instituto Nacional de Câncer (INCA); Início: 2021; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, Ministério da Saúde; (Orientador);
Prevalência e diversidade do HPV no canal anal de homens HIV-positivos; Início: 2021; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Estácio de Sá, Ministério da Saúde; (Orientador);
Characterisation of viruses present in tumour samples of non-Hodgkin lymphoma; 2018; Dissertação (Mestrado em School of Medical Sciences) - Örebro University,; Orientador: Juliana Domett Siqueira;
Caracterização molecular do vírus papiloma humano persistente em gestantes HIV+ após o parto; Orientador: Esmeralda A; J; M; Soares, Co-orientador: Juliana Domett Siqueira; 2011; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em RESIDÊNCIA MULTIPROFISSIONAL EM ONCOLOGIA) - Instituto Nacional de Câncer, Ministério da Saúde; Orientador: Juliana Domett Siqueira;
Caracterização das variantes genéticas do HPV16 presentes em mulheres de Juiz de Fora (MG); 2020; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade do Grande Rio; Orientador: Juliana Domett Siqueira;
Caracterização das variantes genéticas do HPV16 presentes em mulheres de Juiz de Fora (MG); 2020; Iniciação Científica - Instituto Nacional de Câncer; Orientador: Juliana Domett Siqueira;
Produções bibliográficas
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Siqueira, Juliana D. ; GOES, LIVIA R. ; ALVES, BRUNNA M. ; DA SILVA, ANA CARLA P. ; DE CARVALHO, PEDRO S. ; CICALA, CLAUDIA ; ARTHOS, JAMES ; VIOLA, JOÃO P.B. ; Soares, Marcelo A. . Distinguishing SARS-CoV-2 bonafide re-infection from pre-existing minor variant reactivation. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 90, p. 104772, 2021.
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SIQUEIRA, JULIANA D ; GOES, LIVIA R ; ALVES, BRUNNA M ; DE CARVALHO, PEDRO S ; CICALA, CLAUDIA ; ARTHOS, JAMES ; VIOLA, JOÃO P B ; DE MELO, ANDRÉIA C ; SOARES, MARCELO A . SARS-CoV-2 genomic analyses in cancer patients reveal elevated intrahost genetic diversity. Virus Evolution , v. 7, p. veab013, 2021.
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ALVES, BRUNNA M. ; PRELLWITZ, ISABEL M. ; Siqueira, Juliana D. ; MEYRELLES, ÂNGELA R. ; BERGMANN, ANKE ; Seuánez, Héctor N. ; MACHADO, ELIZABETH S. ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. . The effect of human leukocyte antigen G alleles on human papillomavirus infection and persistence in a cohort of HIV-positive pregnant women from Brazil. Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 34, p. 339-343, 2015.
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MEYRELLES, ANGELA R.I. ; SIQUEIRA, J. D. ; HOFER, CRISTINA B. ; COSTA, TOMAZ P. ; AZEVEDO, ANDREA P. ; GUIMARÃES, BRUNA V. ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; ALMEIDA, GUTEMBERG ; SOARES, EAJM ; MACHADO, ELIZABETH S. . HIV/HPV co-infection during pregnancy in southeastern Brazil: Prevalence, HPV types, cytological abnormalities and risk factors. Gynecologic Oncology (Print) , v. 128, p. 107-112, 2013.
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Vieira, V. C. ; SIQUEIRA, J. D. ; Meyrelles, Angela R I ; ALMEIDA, G ; Seuánez, Héctor N. ; Machado, Elizabeth S ; SOARES, EAJM ; Soares, Marcelo A. . Detection of hypermutation in human papillomavirus DNA sequences from cervical samples. In: 22nd Biennial Congress of the European Association for Cancer Research, 2012, Barcelona. Europian Journal of Cancer. Oxford: Elsevier, 2012. v. 48. p. S7.
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Meyrelles, Angela R I ; Siqueira, Juliana D. ; ALMEIDA, G ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. ; Machado, Elizabeth S . Prevalence of HPV infection among HIV+ pregnant women and persistence after delivery. In: World Congress of Cervical Pathology and Colposcopy -IFCPC, 2011, Rio de Janeiro. 14 World Congress of Cervical Pathology and Colposcopy -IFCPC, 2011.
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Siqueira, Juliana D. ; Meyrelles, Angela R I ; ALMEIDA, G ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Machado, Elizabeth S ; Soares, Esmeralda A. . Genetic Diversity of Human Papillomavirus Among HIV+ Pregnant Women in Rio de Janeiro, Brazil. In: IX Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS (SIMPAIDS), 2011, Salvador. IX Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS (SIMPAIDS), 2011.
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Meyrelles, Angela R I ; SIQUEIRA, J. D. ; ALMEIDA, G ; Hoffer, C ; Azevedo, A ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. ; Machado, Elizabeth S . Clinical and Therapeutic factors affecting persistence of HPV infection among HIV+ pregnant women after delivery. In: 6th International AIDS Society Meeting on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention, 2011, Roma. Absctract Book - 6th Interbational AIDS Society Meeting on HIV Pathogenesis, Treatment and Prevention. Genebra: International AIDS Society, 2011. v. 1. p. 236-236.
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SIQUEIRA, J. D. ; ALVES, B. L. M. ; CASTELO-BRANCO, A. B. C. ; SOARES, E. A. J. M. ; MACHADO, M. L. S. M. ; DUQUE, K. C. D. ; TEIXEIRA, M. T. B. ; LEVI, J. E. ; SILVA, G. A. ; SOARES, M. A. . Comparison of human papillomavirus detection and genotyping assays: clinical and epidemiological limitations. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SIQUEIRA, J. D. ; SOARES, M. A. ; SOARES, E. A. J. M. . Virome characterization in different types of non-Hodgkin lymphoma. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Siqueira, Juliana D. ; DENG, X. ; Meyrelles, Angela R I ; Machado, Elizabeth S ; Soares, Marcelo A. ; SOARES, EAJM ; DELWART, E. . Analysis of cervical virome from HIV/HPV co-infected women. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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Siqueira, Juliana D. ; ALVES, B. L. M. ; PRELLWITZ, I. M. ; FURTADO, CAROLINA ; Meyrelles, Angela R I ; Machado, Elizabeth S ; SEUÁNEZ, HÉCTOR N ; SOARES, MARCELO A ; SOARES, EAJM . Identification of novel human papillomavirus lineages and sublineages in HIV/HPV-coinfected pregnant women by next-generation sequencing. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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SIQUEIRA, J. D. ; DENG, X. ; Meyrelles, Angela R I ; Machado, Elizabeth S ; SOARES, M. A. ; SOARES, E. A. J. M. ; DELWART, E. . Analysis of cervical virome from HIV/HPV co-infected women by next generation sequencing. 2017. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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SIQUEIRA, J. D. ; SOARES, M. A. ; SOARES, EAJM . Virome characterization in different types of non-Hodgkin lymphoma. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Siqueira, Juliana D. ; Meyrelles, Angela R I ; Machado, Elizabeth S ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. . Next-Generation Sequencing analysis of the adaptability and diversity of HPV types over time in HIV+ pregnant women - Apresentação Oral. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Siqueira, Juliana D. ; Meyrelles, Angela R I ; Machado, Elizabeth S ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. . Next-Generation Sequencing analysis of the adaptability and diversity of HPV types over time in HIV+ pregnant women. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SIQUEIRA, J. D. ; MEYRELLES, ANGELA R.I. ; MACHADO, ELIZABETH S. ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. . Análise por NGS da adaptabilidade e diversidade dos tipos de HPV ao longo do tempo em gestantes HIV+. 2014. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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Siqueira, Juliana D. ; Meyrelles, Angela R I ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Machado, Elizabeth S ; Soares, Esmeralda A. . Analysis of the adaptability and diversity of HPV types over time in HPV+ pregnant women. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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SIQUEIRA, J. D. ; MEYRELLES, ANGELA R.I. ; MACHADO, ELIZABETH S. ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. . Análise por NGS da adaptabilidade e diversidade dos tipos de HPV ao longo do tempo em gestantes HIV+. 2013. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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Siqueira, Juliana D. ; Meyrelles, Angela R I ; ALMEIDA, G ; Soares, Marcelo A. ; Machado, Elizabeth S ; Soares, Esmeralda A. . Genetic diversity of human papillomavirus among HIV+ pregnant women in Rio de Janeiro, Brasil. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Meyrelles, Angela R I ; Siqueira, Juliana D. ; ALMEIDA, G ; Soares, Marcelo A. ; Soares, Esmeralda A. ; Machado, Elizabeth S . Prevalence of HPV infection among HIV+ pregnant women and persistence after delivery. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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Siqueira, Juliana D. ; Meyrelles, Angela R I ; ALMEIDA, G ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Machado, Elizabeth S ; SOARES, EAJM . Caracterização molecular do papillomavirus humano e sua persistência entre mulheres gestantes HIV+ no Rio de Janeiro, Brasil. 2011. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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Soares, Esmeralda A. ; Makamche, Marie Florence ; Siqueira, Juliana D. ; Lumngwena, Evelyn ; Mbuagbaw, Josephine ; Kaptue, Lazare ; Asonganyi, Tazoacha ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Alemnji, George . Diversidade molecular e genótipos do gene polimerase do HIV-1 entre indivíduos Camaronenses virgens de tratamento com doença. 2010. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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Soares, Esmeralda A. ; Makamche, Marie Florence ; Siqueira, Juliana D. ; Lumngwena, Evelyn ; Mbuagbaw, Josephine ; Kaptue, Lazare ; Asonganyi, Tazoacha ; Seuánez, Héctor N. ; Soares, Marcelo A. ; Alemnji, George . HIV-1 primary drug resistance in protease and reverse transcriptase polymerase and rnase h domains from viruses infecting cameroonian subjects. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
Outras produções
SIQUEIRA, J. D. ; LOPES, R. ; ALVES, BRUNNA M. ; PRELLWITZ, I. M. ; REIS, L. ; CURTY, GISLAINE ; SOARES, E. A. J. M. ; SOARES, M. A. . Análise experimental e in silico de viromas: da descoberta de novos vírus à montagem de genomas virais. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
SIQUEIRA, J. D. ; ALVES, B. L. M. ; PRELLWITZ, I. M. ; Vieira, V. C. . Características moleculares da infecção pelo papilomavírus humano de alto risco no Brasil: da tipagem a hipermutação viral. 2013. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Siqueira, Juliana D. ; Vidal, J. P. ; Vieira, V. C. . Características moleculares da infecção pelo Papilomavírus Humano em gestantes HIV+: da tipagem à integração viral. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
SIQUEIRA, J. D. ; BAPTISTA, L. V. . Desvendando o DNA - Mini Curso para o Ensino Medio (4h). 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
Projetos de pesquisa
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2019 - Atual
Evolução molecular do novo coronavírus (SARS-CoV-2) em pacientes com câncer, Descrição: Em dezembro de 2019, um novo tipo de coronavírus, denominado SARS-CoV-2, foi detectado na China e se espalhou rapidamente pelo mundo. O SARS-CoV-2 é o agente etiológico da COVID-19 e possui genoma de RNA fita simples e positiva. Os vírus de RNA em geral estão mais susceptíveis ao surgimento de mutações durante sua replicação. O acúmulo de mutações pode compor assinaturas virais resultando no surgimento de novas variantes, conforme tem sido observado ao redor do mundo. Pacientes com câncer apresentam maior susceptibilidade à infecção por SARS-CoV-2 e pior prognóstico quando comparados com a população saudável. O SARS-CoV-2 apresenta uma taxa de mutação maior em pacientes oncológicos quando comparados a pacientes sem câncer. O acúmulo de mutações no genoma viral destes pacientes é uma importante fonte de diversidade genética podendo propiciar a formação de novas variantes do SARS-CoV-2. Diversos casos de infecção em indivíduos vacinados, reinfecção e de infecções longas tem sido identificados em pacientes e servidores do INCA. Com o avanço da vacinação e o aparecimento de novas variantes virais é essencial monitorar a distribuição das linhagens responsáveis por novos eventos de infecção nesta população. Com isso, o objetivo deste estudo é sequenciar o genoma completo do SARS-CoV-2 para caracterizar as variantes circulantes em pacientes e servidores do INCA. Amostras de pacientes matriculados e servidores do INCA positivos para SARS-CoV-2 serão selecionadas para o estudo e o genoma viral de cada paciente será sequenciado na plataforma Illumina Miseq. Com esses dados será possível avaliar características moleculares dos vírus circulantes nessa população, assim como a identificação de possíveis novas variantes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Domett Siqueira - Integrante / Brunna Luiza Misael Alves - Integrante / SOARES, MARCELO A - Coordenador / GOES, LIVIA R. - Integrante.
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2018 - Atual
Caracterização do viroma presente em diferentes tipos de linfoma não-Hodgkin, Descrição: O linfoma não-Hodgkin (LNH) é um grupo heterogêneo de neoplasias do tecido linfoide, com características clínicas, genéticas e morfológicas variadas. Este linfoma é a malignidade hematológica mais comum no mundo. Além dos fatores de risco, alguns agentes infecciosos causam ou estão relacionados com risco de desenvolvimento dos LNH. Dentre eles estão o vírus Epstein Barr, o Herpes Vírus Humano 8 (HHV8), o vírus linfotrópico de células T humano tipo 1, o vírus da imunodeficiência humana, o vírus da hepatite C e a bactéria Helicobacter pylori. Recentemente, outros agentes infecciosos têm sido associados ao LNH, como o pegivirus humano, o papilomavirus humano e o cutavirus. Apesar dos fatores relacionados à função imune alterada e aos agentes infecciosos descritos desempenharem um papel relevante na etiologia do LNH, estes fatores não explicam a maioria dos casos de LNH, sugerindo que outros fatores ou agentes infecciosos podem estar envolvidos no desenvolvimento do LNH. Identificar possíveis patógenos associados ao LNH e entender a relação câncer-agente infeccioso é essencial para o desenvolvimento de medidas de prevenção e de rastreamento para o diagnóstico precoce do câncer. Com isso, o objetivo deste estudo é caracterizar a composição viral do tecido tumoral de LNH e investigar a prevalência desses vírus nos diferentes tipos de LNH. Amostras de tecido tumoral de LNH armazenadas no Banco Nacional de Tumores (BNT) do Instituto Nacional de Câncer (INCA) serão processadas para extração do DNA e RNA viral. Em seguida, o material extraído será preparado com o kit Nextera XT DNA Sample Preparation e sequenciado na plataforma Illumina MiSeq. As análises para identificação dos vírus serão realizadas comparando as sequências obtidas com sequências virais depositadas no banco de dados GenBank através da ferramenta BLAST. Por fim, amostras de LNH fixadas e emblocadas em parafina armazenadas no Departamento de Patologia (DIPAT) do INCA serão submetidas à amplificação com iniciadores específicos para identificar a presença do cutavirus, pegivirus e demais vírus encontrados através da análise do viroma, determinando a prevalência desses vírus em diferentes subtipos de LNH.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Domett Siqueira - Coordenador / Esmeralda Augusta Jardim Machado Soares - Integrante / Marcelo Alves Soares - Integrante.
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2013 - 2019
Análise da adaptabilidade e da diversidade dos tipos de HPV ao longo do tempo por Sequenciamento de Nova Geração em gestantes HIV+, Descrição: A persistência do HPV é um fator importante para a progressão do câncer cervical. Entretanto, o papel da múltipla infecção e dos tipos e variantes virais e sua evolução ao longo do tempo na persistência, prognóstico, resposta ao tratamento e tempo para o desenvolvimento das lesões ainda é pouco estudado. Isto é particularmente importante em pacientes gestantes HIV-positivas, onde o número de trabalhos ainda é menor. É importante compreender a dinâmica da capacidade replicativa viral, ou a competição entre os múltiplos tipos e variantes virais presentes no paciente ao longo do tempo, e correlacionar estes dados com o desfecho, podendo ser a resolução da infecção, a permanência da infecção latente, ou progressão para lesões cervicais. Esta proposta é inédita tendo em vista que a dinâmica de circulação e competição, e por conseguinte da persistência, de diferentes variantes e tipos de HPV em um mesmo ambiente é pouco estudada. Nosso projeto avaliará tal dinâmica in vivo, ao longo da evolução de perfis citológicos das pacientes analisadas. Como resultado, poderemos inferir tipos e variantes de HPV mais persistentes e com maior fitness adaptativo, criando potencialmente uma nova variável de valor preditivo no desenvolvimento do câncer cervical associado ao HPV. A caracterização dos genomas completos dos HPVs que infectam mulheres com múltiplas infecções se torna importante no contexto da implementação das vacinas bivalente e quadrivalente contra o HPV no Brasil, visto que a informação gerada poderá apontar variantes virais não contemplados pelas vacinas, bem como a existência de variantes de escape imunológico, tópico este ainda não abordado na população brasileira. Todos os aspectos acima abordados são ainda mais relevantes quando aplicados à população de mulheres grávidas e HIV+, um grupo altamente vulnerável e usualmente negligenciado. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Juliana Domett Siqueira - Integrante / Soares, Esmeralda A. - Integrante / Seuánez, Héctor N. - Integrante / Soares, Marcelo A. - Coordenador / Angela Rosa Império Meyrelles - Integrante / Elizabeth Stankiewicz Machado - Integrante / Gutemberg Leão de Almeida Filho - Integrante.
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2010 - 2012
Caracterização Molecular do HPV em Gestantes HIV-Positivas e o Papel do Polimorfismo no Codon 72 da p53 para a Persistência da Infecção pelo HPV após o Parto, Descrição: A gestação é um período de alta prevalência de HPV devido à fatores hormonais e imunodepressão, que pode ser potencializada pela co-infecção pelo HIV. A prevalência do HPV durante a gestação é maior quando comparado à de mulheres não-grávidas, e também maior em mulheres HIV-positivas. Os objetivos do estudo são caracterizar molecularmente o HPV em uma coorte de gestantes HIV-positivas, e determinar os fatores de risco para a persistência da infecção após o parto. Métodos: Para a determinação dos possíveis fatores de risco para o desfecho final, serão avaliados fatores demográficos, história obstétrica, fumo, história sexual, contagem de células T CD4+ e carga viral de HIV no início do acompanhamento e ao final da gestação, uso de antirretrovirais durante a gestação e polimorfismos no codon 72 da p53.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Domett Siqueira - Integrante / Soares, Esmeralda A. - Coordenador / Soares, Marcelo A. - Integrante / Angela Rosa Império Meyrelles - Integrante / Elizabeth Stankiewicz Machado - Integrante / Gutemberg Leão de Almeida Filho - Integrante.
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2008 - 2011
Caracterização Molecular e Epidemiológica do HIV em pacientes soropositivos na República dos Camarões, Descrição: O vírus da imunodeficiência humana (HIV) é um patógeno com extrema variabilidade genética na população humana, e pode ser dividido em tipos (1 e 2), grupos (M, N e O) e subtipos (9 subtipos do grupo M). Além destes variantes, uma extensa geração de formas recombinantes circulantes (CRFs) e únicas (URFs), formadas a partir de dois ou mais subtipos, vem sendo descrita de forma crescente no mundo. A distribuição destes variantes genéticos no mundo é heterogênea. Ao passo que o subtipo B do HIV-1 prevalece em países desenvolvidos (EUA, Japão e países da Europa Ocidental), outros subtipos (?não-B?) predominam no mundo em desenvolvimento. Um número crescente de relatos na literatura vem demonstrando que diferentes subtipos do HIV possuem diferentes características biológicas, incluindo progressão para a Aids, eficiência de testes diagnósticos e de acompanhamento da infecção, e desenvolvimento da resistência viral aos anti-retrovirais (ARV). No que tange este último aspecto, todos os ARV atualmente disponíveis na clínica foram desenvolvidos para, e testados em indivíduos de países ricos, e pouco se sabe acerca da resposta ao tratamento, bem como do desenvolvimento da resistência viral, em países onde subtipos não-B prevalecem. A República dos Camarões é de fato o melhor local do mundo para avaliar tais implicações, visto que o país possui a maior diversidade de HIV já relatada no mundo, com todos os tipos, grupos e subtipos presentes, e é considerado o epicentro da pandemia de HIV/Aids que assola o mundo atual. O presente estudo almeja, desta forma, documentar alterações em parâmetros virológicos, hematológicos e bioquímicos em uma amostra populacional de pacientes com HIV/Aids em início de tratamento ARV no Hospital da Universidade de Yaoundé, Camarões, através de uma colaboração estabelecida entre pesquisadores daquela Universidade e o Instituto Nacional de Câncer.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Domett Siqueira - Integrante / Esmeralda Augusta Jardim Machado Soares - Coordenador / Makamche, Marie Florence - Integrante / Lumngwena, Evelyn - Integrante / Mbuagbaw, Josephine - Integrante / Kaptue, Lazare - Integrante / Asonganyi, Tazoacha - Integrante / Seuánez, Héctor N. - Integrante / Soares, Marcelo A. - Integrante / Alemnji, George - Integrante.
Prêmios
2017
Bolsa para participação e apresentação oral do trabalho "Identification of novel human papillomavirus lineages and sublineages in HIV/HPV-coinfected pregnant women by next-generation sequencing", no 31st International Papillomavirus Conference, International Papillomavirus Society.
2017
Bolsa para participação e apresentação oral do trabalho "Analysis of cervical virome from HIV/HPV co-infected women by next generation sequencing", no 3rd ICGEB Workshop on Human Papillomavirus, ICGEB.
2015
Bolsa de estudos para realização de doutorado sanduíche do Programa Ciência sem Fronteiras, CNPq.
2012
Proferred Paper Award - Presentation at the Symposium Virus and Cancer, Europian Association for Cancer Research.
2011
Menção Honrosa por excelência declarada na ata da defesa da monografia de conclusão de curso em Biomedicina, Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro.
Histórico profissional
Endereço profissional
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Instituto Nacional de Câncer, Coordenação de Pesquisa, Divisão de Genética. , Rua André Cavalcanti 37, 4o andar, Centro, 20231-050 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil
Experiência profissional
2017 - Atual
Instituto Nacional de CâncerVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2013 - 2017
Instituto Nacional de CâncerVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutoranda, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2012 - 2013
Instituto Nacional de CâncerVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aperfeiçoamento II, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2011 - 2012
Instituto Nacional de CâncerVínculo: Mestrado, Enquadramento Funcional: Mestrado, Carga horária: 40
2008 - 2011
Instituto Nacional de CâncerVínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica, Carga horária: 20
2015 - 2016
Blood Systems Research InstituteVínculo: Aluno de doutorado sanduíche, Enquadramento Funcional: aluno, Carga horária: 40
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