Michel Francisco Abanto Marín

Possui graduação em Microbiologia y Parasitologia pela Universidad Nacional de Trujillo (2003), mestrado em Biologia Molecular pela Universidad Nacional Mayor de San Marcos (2007) e doutorado pelo Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz/FIOCRUZ. Tem experiência na área de genética molecular de microrganismos, genômica comparativa e bioinformática.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas

2009 - 2013

Fundação Oswaldo Cruz
Título: Epidemiologia Genômica de Vibrio cholerae da América Latina
Dra. Ana Carolina Paulo Vicente. Coorientador: Dr. Jeronimo Ruiz. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Mestrado em Biologia Molecular

2004 - 2007

Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Título: Diversidad molecular de bacterias oxidadoras de hierro aisladas de drenajes ácidos de minas del Perú,Ano de Obtenção: 2008
Orientador: Dr. Pablo Sergio Ramírez Roca
Bolsista do(a): Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, CONCYTEC, Peru. Palavras-chave: rRNA 16S; filogenia molecular; Acidithiobacillus ferrooxidans; Leptospirillum ferrooxidans; biolixiviação; biominería. Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Indústrias Extrativas; Extração de Minerais Metálicos.

Graduação em Microbiología y Parasitología

1998 - 2003

Universidad Nacional de Trujillo
Título: Frecuencia de cultivos bacterianos productores de betalactamasas clásicas y de espectro ampliado aislados de ambientes del Hospital II Es Salud Cajamarca, entre agosto y noviembre del 2003
Orientador: Dr. Pedro Mercado Martínez

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Pós-doutorado

2014

Pós-Doutorado. , Instituto Oswaldo Cruz, IOC, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

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Formação complementar

2014 - 2014

Análise, Montagem e Anotação de Genomas. (Carga horária: 40h). , Instituto Oswaldo Cruz, IOC, Brasil.

2014 - 2014

Hands-on course on High-Throughput Sequencing data. (Carga horária: 80h). , Instituto Pasteur de Montevideo, PASTEUR, Uruguai.

2012 - 2012

Montagem, Anotação, Meta-Anotação de transcriptoma. (Carga horária: 45h). , Centro de Pesquisas René Rachou, CPQRR, Brasil.

2010 - 2010

Aplicações e Fundamentos da real time PCR. (Carga horária: 32h). , Applied Biosystems do Brasil, A&B, Brasil.

2010 - 2010

Análise Metagenômica com o Uso das Plataformas de. (Carga horária: 80h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2010 - 2010

Métodos estatísticos em evolução e filogenética. (Carga horária: 60h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2010 - 2010

Comparative Metagenomics and Taxonomy. (Carga horária: 45h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2010 - 2010

Análise filogenética bayesiana. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2010 - 2010

Plataforma de Seqüenciamento de Nova Geração "NGS-. (Carga horária: 90h). , Universidade Federal do Pará, UFPA, Brasil.

2007 - 2008

Curso Intensivo de Lengua Portuguesa. (Carga horária: 144h). , Centro de Estudos Brasileiros de Lima, CCBP, Peru.

2006 - 2006

Programação em Bioinformatica. , Universidad Peruana Cayetano Heredia, UPCH, Peru.

2006 - 2006

Evolución Molecular. , Universidad Mayor de San Marco, UMSM, Peru.

2005 - 2005

I Curso de Bioinformática. , Universidad Mayor de San Marco, UMSM, Peru.

2005 - 2005

Visión Científica Tecnológica de la Diversidad Gen. , Instituto Especializado de Enfermedades Neoplásicas, INEN, Peru.

2005 - 2005

Técnicas de Microscopía Electrónica Aplicada. , Universidad Mayor de San Marco, UMSM, Peru.

2004 - 2004

Curso Avanzado de Químico Biofísica. , Instituto Internacional de Investigaciones del Perú, IIIPERU, Peru.

2004 - 2004

Microbiología y Parasitología Molecular. , Universidad Mayor de San Marco, UMSM, Peru.

2003 - 2003

Extensão universitária em Bioingeniería y Bioética. , Sociedad Peruana de Biotecnología, SPB, Peru.

2003 - 2003

I Curso de Inmunología. , Universidad Catolica de Santa Maria, U.SANTA MARIA, Peru.

2003 - 2003

Infecciones Intrahospitalarias y Resistencia Ba. , Universidad Nacional de Trujillo, U.TRUJILLO, Peru.

2002 - 2002

Caracterización y Potencial Uso de Suelos. , Universidad Nacional de Trujillo, U.TRUJILLO, Peru.

2000 - 2000

Avances en el diagnóstico de las Infecciones Paras. , Sociedad Peruana de Parasitología, SPP, Peru.

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Idiomas

Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: BIOINFORMATICA.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biología Molecular.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia Aplicada.

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Organização de eventos

Mercado, P. ; MARÍN, M. F. A. . Infecciones Intra - hospitalarias y Resistencia Bacteriana. 2003. (Outro).

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Participação em eventos

27° Congresso Brasileiro de Microbiologia. High-throughput genomic analysis of Vibrio cholerae from Latin America cholera epidemic. 2013. (Congresso).

IV SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURA. 2013. (Simpósio).

X-Meeting & BSB 2013. Complete genome of Bordetella pertussis from Brazil: a phylogenomic study. 2013. (Congresso).

X-MEETING 2011. 2011. (Encontro).

X-MEETING 2011.Repetitive sequences in the pathogenic bacteria Vibrio cholerae. 2011. (Encontro).

56 Congresso Brasileiro de Genética. Abordagem genômica através de MLSA, no estudo da Epidemiologia de Vibrio cholerae na América Latina. 2010. (Congresso).

56 Congresso Brasileiro de Genética. 2010. (Congresso).

Descobertas recentes e perspectivas em Bioinformática e Genômica. 2010. (Outra).

I Fórum de Integração de Alunos de Pós-graduação do IOC. 2009. (Encontro).

I Fórum de Integração de Alunos de Pós-graduação do IOC.Evolutionary analysis of Vibrio cholerae in Latin America on the basis of the recA and pyrH genes. 2009. (Encontro).

The Fourth Workshop Comparative Microbial Genomics and Taxonomy. 2009. (Encontro).

Vibrio2009-The Third Conference on the Biology of Vibrios.Genomic Taxonomy of Vibrios. Evolutionary analysis of Vibrio cholerae in Latin America on the basis of the sequences recA and pyrH genes. 2009. (Congresso).

Vibrio2009-The Third Conference on the Biology of Vibrios.Genomic Taxonomy of Vibrios. 2009. (Outra).

Workshop de Biologia Computacional e Sistemas. 2009. (Encontro).

Evaluación de los Aprendizajes. 2008. (Seminário).

Biotecnología Aplicada a la Salud.Técnicas en Biología Molecular. 2007. (Outra).

XVI Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). 2007. (Encontro).

Epidemiología Molecular, Principios y Aplicaciones. 2006. (Outra).

Evolución Molecular. 2006. (Outra).

III Congreso Peruano de Biotecnología y Bioingeniería. Filogenia de Genes involucrados en la producción de Betalactamasas de Espectro Ampliado. 2006. (Congresso).

XV Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). 2006. (Encontro).

XII Encuentro Científico Internacional - ECI 2005v. 2005. (Encontro).

XIV Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). 2005. (Encontro).

IIIi Encuentro Científico Internacional de Invierno ECI 2004i. 2004. (Encontro).

XI Encuentro Científico Internacional de Verano, ECI 2004v. 2004. (Encontro).

X Encuentro Científico Internacional - ECI 2003. 2003. (Encontro).

I Forum Internacional de Medicina Biológica. 2002. (Outra).

II Seminario Nacional de Procesos Químicos, Industriales y Biotecnológicos. 2002. (Seminário).

IV Congreso Peruano de Parasitología. 2000. (Congresso).

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Participação em bancas

Aluno: Diego Duque Cambuy

CATANHO, M.; MIRANDA, A. B.; THOMPSON, C. C.; Passeti, F.;MARIN, MICHEL A. Epidemiologia genômica de Bordetella pertussis no Brasil. 2014. Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Nilcéia de Veiga Ramos

VIEIRA, V. V; Picao, R. C; THOMPSON, C. C.; FERREIRA, R. B. R;Marin, M. A.. Caracterização da resistência aos Beta-lactâmicos e taxonomia de isolados do gênero Klebsiella. 2014. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitaria) - Instituto Oswaldo Cruz.

Aluno: Caio Filipe Alves Lourenço Landim

MARIN, MICHEL A; Figueiró, Rolando; ANDRADE, B. G.. Caracterização da diversidade de espécies de Vibrio na ressurgência de Arraial do Cabo. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Centro Universitário da Zona Oeste.

Aluno: Mayla Abrahim Costa

Jardim, Rodrigo; Figueiró, Rolando;MARIN, MICHEL A. Exploração da diversidade de lipases encontradas em ambientes aquáticos através da abordagem metagenômica. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Centro Universitário da Zona Oeste.

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Comissão julgadora das bancas

David Eduardo Barroso

Miranda AB; Codeço CT; Antunes LCM; Davila AMR;Barroso DE. Epidemiologia Genômica de Vibrio cholerae na América Latina. 2013. Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz.

Luis Caetano Martha Antunes

ANTUNES, L. C. M.. Epidemiologia genômica de Vibrio cholerae na América Latina. 2013. Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.

Cláudia Torres Codeço

MIRANDA, A. B.;Codeço, Claudia Torres; ANTUNES, L. C. M.. Epidemiologia genômica de Vibrio cholerae na América Latina. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.

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Orientou

Caio Filipe Alves Lourenço Landim

Caracterização da diversidade de espécies de Vibrio na ressurgência de Arraial do Cabo; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Centro Universitário da Zona Oeste; Orientador: Michel Francisco Abanto Marín;

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Foi orientado por

Jerônimo Conceição Ruiz

Epidemiologia Genômica de Vibrio cholerae; 2009; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação de Assistência ao Trabalhador da Fiocruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Jeronimo Conceição Ruiz;

Cristiane Carneiro Thompson

Epidemiologia Genômica de V; cholerae na América Latina; ; 2013; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Instituto Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Cristiane Carneiro Thompson;

Ana Carolina Paulo Vicente

Epidemiologia Genômica de Vibrio cholerae da América Latina; 2013; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Ana Carolina Paulo Vicente;

Ana Carolina Paulo Vicente

2014; Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Ana Carolina Paulo Vicente;

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Produções bibliográficas

  • CRAINEY, JAMES L ; SILVA, TÚLLIO RR DA ; ENCINAS, FERNANDO ; MARÍN, MICHEL A ; VICENTE, ANA CAROLINA P ; LUZ, SÉRGIO LB . The mitogenome of Onchocerca volvulus from the Brazilian Amazonia focus. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Online) , v. 111, p. 79-81, 2016.

  • FONSECA, E. L. ; Marin, M. A. ; ENCINAS, F. ; VICENTE, A. C. P. . Full characterization of the integrative and conjugative element carrying the metallo- -lactamase blaSPM-1 and bicyclomycin bcr1 resistance genes found in the pandemic Pseudomonas aeruginosa clone SP/ST277. Journal of Antimicrobial Chemotherapy (Online) , v. 00, p. 00, 2015.

  • GOMES, LIA LIMA ; Marin, Michel Abanto ; LASUNSKAIA, ELENA ; VASCONCELLOS, SIDRA EZIDIO GONÇALVES ; ARAUJO, MARCELO EMANUEL IVENS DE ; DE MIRANDA, ANTONIO BASÍLIO ; SUFFYS, PHILIP NOEL . Genome Comparison of an Ancestral Isolate and a Modern Isolate of Mycobacterium tuberculosis of the Beijing Lineage from São Paulo, Brazil. Genome Announcements , v. 3, p. e01129-15, 2015.

  • ENCINAS, FERNANDO ; MARIN, MICHEL A ; RAMOS, JULIANA N ; VIEIRA, VERÔNICA V ; MATTOS-GUARALDI, ANA LUIZA ; VICENTE, ANA CAROLINA P . Genomic analysis of a nontoxigenic, invasive Corynebacterium diphtheriae strain from Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Online) , v. 110, p. 817-819, 2015.

  • CONTEVILLE, LILIANE COSTA ; ZANELLA, LOUISE ; MARÍN, MICHEL ABANTO ; FILIPPIS, ANA MARIA BISPO DE ; NOGUEIRA, RITA MARIA RIBEIRO ; VICENTE, ANA CAROLINA PAULO ; MENDONÇA, MARCOS CÉSAR LIMA DE . Parvovirus B19 1A complete genome from a fatal case in Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Online) , v. 110, p. 820-821, 2015.

  • DUTILH, BAS E ; THOMPSON, CRISTIANE C ; VICENTE, ANA CP ; MARIN, MICHEL A ; LEE, CLARENCE ; SILVA, GENIVALDO GZ ; SCHMIEDER, ROBERT ; ANDRADE, BRUNO GN ; CHIMETTO, LUCIANE ; CUEVAS, DANIEL ; GARZA, DANIEL R ; OKEKE, IRUKA N ; ABODERIN, AARON OLADIPO ; SPANGLER, JESSICA ; ROSS, TRISTEN ; DINSDALE, ELIZABETH A ; THOMPSON, FABIANO L ; HARKINS, TIMOTHY T ; EDWARDS, ROBERT A . Comparative genomics of 274 Vibrio cholerae genomes reveals mobile functions structuring three niche dimensions. BMC Genomics , v. 15, p. 654, 2014.

  • ANDRADE, BRUNO GABRIEL N. ; DE VEIGA RAMOS, NILCEIA ; ABANTO MARIN, MICHEL F. ; Fonseca, Erica L. ; Vicente, Ana Carolina P. . The genome of a clinical K. variicola strain reveals virulence associated traits and a pl9-like plasmid. FEMS Microbiology Letters , v. 00, p. n/a-n/a, 2014.

  • Marin, Michel A. ; Fonseca, Erica L. ; ANDRADE, BRUNO N. ; CABRAL, ADRIANA C. ; Vicente, Ana Carolina P. . Worldwide Occurrence of Integrative Conjugative Element Encoding Multidrug Resistance Determinants in Epidemic Vibrio cholerae O1. Plos One , v. 9, p. e108728, 2014.

  • ANDRADE, BRUNO GABRIEL N ; MARIN, MICHEL F ABANTO ; CAMBUY, DIEGO DUQUE ; FONSECA, ERICA LOURENÇO ; SOUZA, NADJLA FERREIRA ; VICENTE, ANA CAROLINA P . Complete genome sequence of a clinical Bordetella pertussis isolate from Brazil. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz (Impresso) , v. 109, p. 972-974, 2014.

  • Marin, Michel A. ; Thompson, Cristiane C. ; Freitas, Fernanda S. ; Fonseca, Erica L. ; ABODERIN, A. OLADIPO ; ZAILANI, SAMBO B. ; QUARTEY, NAA KWARLEY E. ; Okeke, Iruka N. ; Vicente, Ana Carolina P. . Cholera Outbreaks in Nigeria Are Associated with Multidrug Resistant Atypical El Tor and Non-O1/Non-O139 Vibrio cholerae. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online) , v. 7, p. e2049, 2013.

  • MARIN, MICHEL A ; VICENTE, ANA CAROLINA P . Architecture of the superintegron in Vibrio cholerae: identification of core and unique genes. F1000Research , v. 2, p. 63, 2013.

  • Abanto, Michel ; PARIONA, NICOLAZA ; CALDERON, JULIO ; GUERRA, GREGORY ; RAMIREZ, RINA ; DELACRUZ-CALVO, FERNANDO ; RAMIREZ, PABLO . Molecular Identification of Iron Oxidizing Bacteria Isolated from Acid Mine Drainages in Peru. Advanced Materials Research (Online) , v. 825, p. 84-87, 2013.

  • THOMPSON, CRISTIANE C ; EMMEL, VANESSA E ; FONSECA, ERICA L ; MARIN, MICHEL A ; VICENTE, ANA CAROLINA P . Streptococcal taxonomy based on genome sequence analyses. F1000Research , v. 2, p. 67, 2013.

  • Jaramillo, Michael L ; Abanto, Michel ; Quispe, Ruth L ; Calderón, Julio ; Valle, Luís J del ; Talledo, Miguel ; Ramírez, Pablo . Cloning, expression and bioinformatics analysis of ATP sulfurylase from Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 in Escherichia coli. Bioinformation (Online) (Chennai) , v. 8, p. 695-704, 2012.

  • ZANELLA, L. ; OTSUKI, K. ; Marin, M. A. ; BENDET, I. ; VICENTE, A. C. . Complete Genome Sequence of Central Africa Human T-Cell Lymphotropic Virus Subtype 1b. Journal of Virology (Print) , v. 86, p. 12451-12451, 2012.

  • THOMPSON, C. C. ; MARÍN, M. F. A. ; Dias, G. M. ; Dutilh, B. E. ; Edwards, R. A. ; Iida, T. ; Thompson, F. L. ; VICENTE, A. C. P. . Genome Sequence of the Human Pathogen Vibrio cholerae Amazonia. Journal of Bacteriology (Print) , v. 193, p. 5877-5878, 2011.

  • Marin, M. A. ; VICENTE, A. C. P. . Variants of Vibrio cholerae O1 El Tor from Zambia showed new genotypes of ctxB. Epidemiology and Infection (Print) , v. --, p. 1-2, 2011.

  • Thompson, Cristiane C. ; Freitas, Fernanda S. ; Marin, Michel A. ; Fonseca, Erica L. ; Okeke, Iruka N. ; Vicente, Ana Carolina P. . Vibrio cholerae O1 lineages driving cholera outbreaks during seventh cholera pandemic in Ghana. Infection, Genetics and Evolution (Print) , v. 11, p. 1951-1956, 2011.

  • ORBEGOZO, J. ; MARÍN, M. F. A. ; GARCÍA, R. ; Ramírez, P . Molecular identification of Pichia guillermondii isolated from mine water acidic of Peru and its resistance to heavy metals. Revista Peruana de Biología (Impresa) , v. 15, p. 91-96, 2008.

  • ABANTO MARIN, MICHEL F. ; Sá, Lena ; VICENTE, A. C. P. . Vibrio cholerae e Outros Vibrios de Importância Médica. Microbiologia. 6ed.São Paulo: Atheneu, 2015, v. , p. 375-382.

  • Marin, Michel A. ; Dutilh, B. E. ; THOMPSON, C. C. ; Edwards, R. A. ; VICENTE, A. C. P. . Analysis of genomic regions with abundant repetitive sequences using highthroughput genomic data: Vibrio cholerae superintegron. In: ISCB Latin America 2012 - Conference on Bioinformatics, 2012, Santiago de Chile. ISCB Latin America 2012 - Selected Posters. La Jolla, CA 92093-0505: International Society of Computational Biology, 2012. v. 0. p. 0-0.

  • THOMPSON, C. C. ; EMMEL, V. E. ; Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . Genomic and computational analysis used for bacterial taxonomy: Streptococci species as a test case. In: ISCB Latin America 2012 - Conference on Bioinformatics, 2012, Santiago de Chile. ISCB Latin America 2012 - Selected Posters. La Jolla, CA 92093-0505: International Society of Computational Biology, 2012.

  • ANDRADE, B. G. ; Fonseca, Erica L. ; Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . The marine metagenomic databases and computational analysis for the environmental resistome exploration. In: ISCB Latin America 2012 - Conference on Bioinformatics, 2012, Santiago de Chile. ISCB Latin America 2012 - Selected Posters. La Jolla, CA 92093-0505: International Society of Computational Biology, 2012.

  • Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . High-throughput genomic analysis of Vibrio cholerae from Latin America cholera epidemic. In: 27º CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA 2013, 2013, Natal. Livro de Resumo, 2013.

  • Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . Architecture of the Superintegron in Vibrio cholerae: identification of core and unique genes. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-meeting, 2012, Campinas - Sao Paulo. X-meeting 2012 - Selected Posters, 2012.

  • Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . Accuracy of the NGS sequencing and assembling on the gene prediction and annotation. In: RECOMB Comparative Genomics 2012 - Tenth Annual RECOMB Satellite Workshop on Comparative Genomics, 2012, Niteroi - Rio de Janeiro. RECOMB Comparative Genomics 2012. Rio de Janeiro: Universidade Federal Fluminense, 2012.

  • MARÍN, M. F. A. ; THOMPSON, C. C. ; VICENTE, A. C. P. . Evolutionary analysis of Vibrio cholerae en Latin America on the basis of the sequences recA and pyrH genes. In: The Fourth Workshop Comparative Microbial Genomics and Taxonomy, 2009, Rio de Janeiro. The Book of abstracs of Fourth Workshop Comparative Microbial Genomics and Taxonomy, 2009. p. 85.

  • Guzmán, F. ; Jaramillo, M. ; Sumi, A. ; MARÍN, M. F. A. ; Ramírez, P . Abundancia, distribución y composición de secuencias microsatélites en el genoma de Acidithiobacillus ferrooxidans. In: Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR), 2007, Lima. XVI Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). Lima: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2007. p. 127.

  • Pariona, N. ; MARÍN, M. F. A. ; ORBEGOZO, J. ; Calderón, J. ; GARCÍA, R. ; Ramírez, R. ; Del Valle, L. ; Ramírez, P . Filogenia molecular de Leptospirillum ferrooxidans aisladas de muestras de aguas ácidas provenientes Minera Yanacocha, Cajamarca, Perú. In: Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR), 2007, Lima. XVI Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). Lima: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2007. p. 186.

  • Guzmán, F. ; Jaramillo, M. ; Sumi, A. ; MARÍN, M. F. A. ; Flores, B. ; Ramírez, P . Abundancia, distribución y composición de microsatélites en el genoma de Salmonella enterica serovar Typhi. In: Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR), 2006, Lima. XV Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). Lima: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2006. p. 43.

  • MARÍN, M. F. A. ; Jaramillo, M. ; Flores, B. ; Siccha, R. ; ORBEGOZO, J. ; Guzmán, F. ; GARCÍA, R. ; Cabrera, W. ; Ramírez, P . Amplificación por touchdown-PCR del gen 16S rRNA de cepas de Acidithiobacillus ferrooxidans aisladas de muestras de aguas de minas del Perú. In: Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR), 2006, Lima. XV Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). Lima: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2006.

  • Jaramillo, M. ; Siccha, R. ; Sumi, A. ; MARÍN, M. F. A. ; Flores, B. ; GARCÍA, R. ; Alvarado, D. ; Manya, W. ; Ramírez, P . Clonación y expresión en Escherichia coli de una proteína similar a ATP sulfurilasa de Acidiothiobacillus ferrooxidans ATCC 23270. In: Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR), 2006, Lima. XV Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). Lima: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2006. p. 45.

  • MARÍN, M. F. A. ; Jaramillo, M. ; Flores, B. ; Siccha, R. ; ORBEGOZO, J. ; Pariona, N. ; GARCÍA, R. ; Alvarado, D. ; Coha, J. ; Ramírez, P . Caracterización de Acidithiobacillus ferrooxidans aislados de muestras de aguas ácidas de minas del Perú. In: Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR), 2006, Lima. XV Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). Lima: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2006. p. 49.

  • MARÍN, M. F. A. ; Morales, M. ; Ramírez, P . Aislamiento de Bacterias acidófilas oxidadoras de ión ferroso a partir de muestras de aguas de minera Yanacocha. In: Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR), 2005, Lima. XIV Reunión Científica del Instituto de Investigación de Ciencias Biológicas Antonio Raimondi (ICBAR). Lima: Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2005. p. 93.

  • Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . High-throughput genomic analysis of Vibrio cholerae from Latin America cholera epidemic. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • THOMPSON, C. C. ; EMMEL, V. ; Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . Genomic and computational analysis used for bacterial taxonomy: streptococci species as a test case. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • ANDRADE, B. G. ; Fonseca, Erica L. ; Marin, Michel A. ; VICENTE, A. C. P. . The marine metagenomic databases and computational analysis for the environmental resistome exploration. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Marin, Michel A. ; Vicente, Ana Carolina P. . Architecture of the Superintegron in Vibrio cholerae: identification of core and unique genes. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Marin, Michel A. ; Vicente, Ana Carolina P. . Accuracy of the NGS sequencing and assembling on the gene prediction and annotation. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Marin, Michel A. ; Dutilh, B. E. ; THOMPSON, C. C. ; Edwards, R. A. ; VICENTE, A. C. P. . Analysis of genomic regions with abundant repetitive sequences using high-throughput genomic data: Vibrio cholerae superintegron. 2012. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • THOMPSON, C. C. ; Marin, M. A. ; Dias, G. M. ; Dutilh, B. E. ; Edwards, R. A. ; Iida, T. ; VICENTE, A. C. P. ; Thompson, F. L. . Genome Sequence of the Human Pathogen Vibrio cholerae Amazonia. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • THOMPSON, C. C. ; Marin, M. A. ; Freitas, Fernanda S. ; Fonseca, Erica L. ; ABODERIN, O. A. ; Okeke, Iruka N. ; VICENTE, A. C. P. . Vibrio cholerae driving cholera outbreaks in West Africa. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

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Outras produções

ABANTO, Michel ; MARÍN, M. F. A. . Biotecnología aplicada a la Salud. 2007. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

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Prêmios

2012

Fellowship award for Latin America 2012 conference in Santiago, Chile, International Society for Computational Biology.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratorio de Genética Molecular de Microorganismos. , Av. Brasil 4365, Manguinhos, 21040360 - Rio de Janeiro, RJ - Brasil, Telefone: (21) 38658168

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Experiência profissional

  • 2014 - Atual

    Fundação Oswaldo Cruz

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista Pós Doutorado - PNPD, Carga horária: 40

  • 2013 - 2013

    Fundação Oswaldo Cruz

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós Doutorado - PNPD, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 11/2013 - 11/2013

      Ensino, Vigilância Sanitária, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Taxonomia Microbiana [Taxonomia Genômica e Filogênomica]

  • 2007 - 2009

    Universidad Peruana de Integración Global

    Vínculo: Celetista formal, Enquadramento Funcional: Professor, Carga horária: 40

    Atividades

    • 01/2007 - 04/2009

      Ensino, Engenharia agroindustrial, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Geral

    • 01/2007 - 04/2009

      Ensino, enfermagem, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Geral

  • 2005 - 2009

    Universidad Mayor de San Marco

    Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor

    Outras informações:
    Assistente de docência

  • 2005 - 2006

    Universidad Mayor de San Marco

    Vínculo: Assitente de docência, Enquadramento Funcional: Assistente de laboratorio

  • 2004 - 2006

    Universidad Mayor de San Marco

    Vínculo: Aluno de pós gradauação, Enquadramento Funcional: Estudante

    Atividades

    • 01/2006

      Ensino, Biologia Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Microbiologia Molecular, Biologia Molecular

    • 01/2005

      Ensino, Microbiologia y Parasitologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Genética Microbiana

  • 2007 - 2009

    Bioperformance/Revista de divulgação científica BIOS

    Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Diretor

    Outras informações:
    www.revistabios.com

  • 2003 - 2004

    Universidad Nacional de Trujillo

    Vínculo: Estagio, Enquadramento Funcional: Ajudante estagiário