Katlin Brauer Massirer

É pesquisadora do CBMEG-Unicamp, estuda biologia da regulação de RNA. Coordena o INCT Centro de Química Medicinal e hub brasileiro do Structural Genomics Consortium (SGC-Unicamp, PITE-FAPESP) em conjunto com Professor Paulo Arruda. Em 2017 o CQMED-Unicamp foi aprovado como Unidade de Inovação Tecnológica Embrapii (CQMED - Centro de Química Medicinal), sendo a primeira unidade Embrapii no Brasil focada em fármacos/biofármacos por parcerias entre Universidade e a Indústria Farmacêutica Nacional. Desenvolve projetos na área de proteínas de ligação a RNA e de processos que permitam estudar inibidores de quinases que regulam splicing. Formação: graduação e mestrado em Farmácia (UFSM-1996, USP-2000) e doutorado integral no exterior com dupla ênfase em Genética, Biologia Molecular e Celular e Bioinformática (Universidade da Califórnia San Diego, UCSD-2009). Realizou pós-doutorado duplo com Prof Dr Gene Yeo e Prof Dr Alysson Muotri (UCSD-2009-2011), estudando processos mecanísticos de proteínas de ligação a RNAs relacionados a células tronco e doenças neuronais. Tem 15 anos de experiência em planejamento e execução de projetos e publicações internacionais em Biologia Molecular, Genética, Bioinformática e Biologia Estrutural. Membro suplente da Câmara Interna do Desenvolvimento de Pesquisadores - CIDP (Unicamp).

Informações coletadas do Lattes em 23/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biologia Molecular, celular e genética em doutorado duplo com Bioinformátic

2003 - 2009

Universidade da Califórnia San Diego
Título: The embryonic mir-35 microRNA cluster regulates development and RNAi efficiency in C. elegans
Orientador: Amy E. Pasquinelli
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: microRNA; C. elegans; genética; embriogenese.Grande área: Ciências da SaúdeGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioinformatica. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Mestrado em Ciências Farmacêuticas

1997 - 2000

Universidade de São Paulo
Título: Expressão Gênica do Receptor do IFNalfa/beta em Pacientes com Infecção Crônica por HCV, tratados com IFNalfa-2b recombinante,Ano de Obtenção: 2000
Rosario Dominguez Crespo Hirata.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: IFNAR; expressão gênica; hepatite C; tratamento.Grande área: Ciências da SaúdeGrande Área: Ciências da Saúde / Área: Farmácia / Subárea: Análises Clínicas / Especialidade: Diagnóstico. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Farmácia Análises Clínicas

1992 - 1996

Universidade Federal de Santa Maria
Orientador: Carlos Alberto Mallman
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

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Pós-doutorado

2010 - 2011

Pós-Doutorado. , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos. , Bolsista do(a): California Institute of Regenerative Medicine, CIRM, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Células-tronco humanas. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Proteínas de ligação ao RNA.

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Formação complementar

2018 - 2018

Hake Make Explore-NuVu The Innovation School- Cambridge USA. (Carga horária: 10h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2016 - 2016

SIMPTEC (Simpósio de Profissionais da UNICAMP). (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2016 - 2016

Pharmaceutical Industry Leadership 2030. (Carga horária: 4h). , National Science Foundation, NSF, Estados Unidos.

2014 - 2014

Curso de Biossegurança FCM/Unicamp. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2014 - 2014

Exploring variation in animal genomes. (Carga horária: 40h). , European Molecular Biology Laboratories, EMBL, Brasil.

2012 - 2012

Webinar - Biotech Leaders 2020. (Carga horária: 12h). , National Science Foundation, NSF, Estados Unidos.

2011 - 2011

Nat and Internat Shipping of Biological Samples. (Carga horária: 4h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2010 - 2010

Orientation to Animal Research at UCSD. (Carga horária: 8h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2010 - 2010

Anesthesia & Surgery in Small Animals. (Carga horária: 2h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2009 - 2009

Patenting: From PhD Thesis to the market. (Carga horária: 4h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2009 - 2009

San Diego Professional Lab Management Course. (Carga horária: 14h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2009 - 2009

Viral Vectors. (Carga horária: 4h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2003 - 2009

Especialização em Bioinformática. (Carga horária: 400h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2008 - 2008

Extensão universitária em Perl for Bioinfomatics. (Carga horária: 60h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2007 - 2008

Stem Cell Ethics. (Carga horária: 12h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

2003 - 2003

Biosafety: Blood Born Pathogens. (Carga horária: 4h). , Universidade da California San Diego, UCSD, Estados Unidos.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Alemão

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Proteínas de ligação ao RNA.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Farmácia / Subárea: Química medicinal.

Grande área: Ciências da Saúde / Área: Farmácia / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.

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Organização de eventos

Massirer, K.B. ; UNICAMP, U. . Unicamp Portas Abertas - SGC UNICAMP. 2019. (Exposição).

MASSIRER, K. B. ; EDWARDS, A. ; COUNAGO, R. . Inovação público-privada CQMED (Unicamp) - Ache Farmacêutica. 2018. (Outro).

Massirer, K.B. ; UNICAMP, U. . Unicamp Portas Abertas - SGC, UNICAMP. 2018. (Exposição).

MASSIRER, K. B. . New Horizons of Innovation in Medicinal Chemistry of Protein Kinases. 2016. (Outro).

MASSIRER, K. B. . Scientific Advisory Committee on Kinase Inhibitors. 2016. (Congresso).

MASSIRER, K. B. ; BENGTSON, M. H. ; ARRUDA, P. ; COUNAGO, R. ; GILEADI, O. . Curso teórico prático Universidade-Empresa: dos genes as drogas. 2016. (Outro).

MASSIRER, K. B. ; ZOCAL, N. . Encontro SGC Sites on Quinase Proteins. 2016. (Congresso).

MARQUES-SOUZA, H. ; MASSIRER, K. B. ; PAPES, F. ; BENGTSON, M. H. ; MARTINS-DE-SOUZA, D. . II Network - Encontro de Jovens Pesquisadores em Regulação Gênica na Diferenciação Celular e no Desenvolvimento. 2015. (Congresso).

MASSIRER, K. B. ; MENOSSI, M. . II Recepção Ingressantes da Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular. 2015. (Outro).

MASSIRER, K. B. ; BENGTSON, M. H. ; ARRUDA, P. . Curso teórico prático Universidade-Empresa: dos genes as drogas. 2015. (Outro).

MARQUES-SOUZA, H. ; MASSIRER, K. B. ; PAPES, F. ; BENGTSON, M. H. . I Network - Encontro de Jovens Pesquisadores em Regulação Gênica na Diferenciação Celular e no Desenvolvimento. 2014. (Congresso).

MASSIRER, K. B. ; MENOSSI, M. . I Recepção Ingressantes da Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular. 2014. (Outro).

MASSIRER, K. B. ; SARTORATO, E. L. ; JUNQUEIRA, A. C. ; MELLO, M. B. ; ARRUDA, P. . II Workshop Advanced Topics on Genomics and Cell Biology - ATGC 2014. 2014. (Congresso).

ARRUDA, P. ; SARTORATO, E. L. ; MASSIRER, K. B. ; JUNQUEIRA, A. C. . I Workshop Advanced Topics on Genomics and Cell Biology - ATGC 2013. 2013. (Congresso).

Pasquinelli AE ; SLACK, F. J. ; MASSIRER, K. B. . MicroRNA and Cancer Keystone meeting. 2009. (Congresso).

MASSIRER, K. B. ; et. al. . The Greater San Diego Science & Engineering Fair. 2008. (Festival).

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Participação em eventos

1. Encontro Anual Research Hub Merck.Os desafios da parceria entre o segmento acadêmico e a indústria farmacêutica. 2019. (Seminário).

9. Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry.Cases of Success between Academia and Industry. 2019. (Simpósio).

IV Workshop de Interação ICTs & Empresas, no âmbito da Rede BIONORTE.Estratégias Modernas de Bioprospecção. 2019. (Simpósio).

Workshop Current Research and Training Opportunities in Drug Discovery for Neglected Tropical Diseases. 2019. (Simpósio).

46. SBBQ.Modulation od Protein Kinase Function in Human Health and Plant Biotechnology. 2017. (Simpósio).

Embrapii.Evento de Assinatura de Novas Unidades - CQMED. 2017. (Simpósio).

Inovação: Prêmio Nacional de Inovação na Indústria. 2017. (Exposição).

Inovação em Fármacos e Medicamentos no Brasil: A Necessidade de Interação entre Universidades e Empresas. 2017. (Encontro).

23o Congress of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology 2015. 44a. Annual Meeting of SBBq. 2015. (Congresso).

ASCB - American Society of Cell Biology. 2015. (Congresso).

1 Encontro dos Pesquisadores Unicamp CAI/CONSU. 2014. (Simpósio).

2nd Advanced Topics in Genomics and Cell Biology - ATGC 2014. 2014. (Simpósio).

II Encontro de Jovens Pesquisadores em Regulação Gênica na Diferenciação Celular e no Desenvolvimentoro de Jovens Pesquisadores em Regulação Gênica na Diferenciação Celular e no Desenvolvimento. 2014. (Encontro).

II Simposio Interdisciplinar de Reabilitação: Reabilitar para Incluir.Biomarcadores no estudo do Câncer: microRNAs. 2014. (Simpósio).

Inovação: Premio Nacional De Inovação da Indústria. 2014. (Simpósio).

TEDX Unicamp.TEDX Unciamp. 2014. (Simpósio).

1st Advanced Topics in Genomics and Cell Biology - ATGC 2013. 2013. (Simpósio).

I Encontro de Jovens Pesquisadores em Regulação Gênica na Diferenciação Celular e no Desenvolvimentoro de Jovens Pesquisadores em Regulação Gênica na Diferenciação Celular e no Desenvolvimento. 2013. (Encontro).

Workshop Science Communication. 2012. (Oficina).

15th Annual Meeting of the RNA Society. FOX2 RNA binding protein regulates 3?UTR of genes in addition to splicing regulation. 2010. (Congresso).

5th Annual Stem Cell Meeting on the Mesa.FOX RNA binding proteins and stem cells. 2010. (Simpósio).

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Participação em bancas

Aluno: Illy Enne Gomes Pereira

ARCHANGELO, L. F.;MASSIRER, K. B.; Goldman, M.H.S.; BAQUI, M. M. A.. Consequência funcional da inibição e superexpressão do fator de splicing SF1 em células de linhagem hematopoiética. 2019. Dissertação (Mestrado em Biologia Celualr e Molecular) - Faculdade de Medicina da USP Ribeirão Preto.

Aluno: Aline Mika Matsuguma

SOUZA, H. M. B.;MASSIRER, K. B.. Estudo da expressão polarizada da via Wnt/-catenina e Coup-tf2 em corpos embrioides formados a partir de células-tronco embrionárias. 2019. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Cauã Antunes Westmann

ROCHA, R. S.;MASSIRER, K. B.; KOHLSDORF, T.; NAKAYA, H. T. I.. A multiscale approach for exploring bacterial transcriptional systems. 2018. Dissertação (Mestrado em Biologia Celualr e Molecular) - Faculdade de Medicina da USP Ribeirão Preto.

Aluno: Felipe Eduardo Ciamponi

OLIVEIRA, P. S. L.; MORI, M. A. S.;MASSIRER, K. B.. Análise computacional de alterações transcriptômicas induzidas por grânulos de stress em células humanas. 2018. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Natacha Azussa Migita

MASSIRER, K. B.; ZANELLI, C. F.; KOBARG, J.. Perfil de RNAs ligados a proteina Caprin-1. 2016. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Mateus Augusto de Andrade Souza

PAPES, F.;MASSIRER, K. B.; GLESER, I.. Investigação molecular e funcional de proteínas do grupo polycomb e seu envolvimento com a neurogênese olfatória. 2015. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Rafael Ferraz Conceição

MORI, M.;MASSIRER, K. B.; WINTER, C. E.; CUNHA, F. M.. Estudo da participação da proteína IMPACT nos efeitos da restrição calórica em C. elegans. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Laura Alonso

MASSIRER, K. B.; MARTINS-SOUZA, D.; MORELLI, C. V. M.. Caracterização do complexo proteico da RBP Caprin-1. 2015. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Andresa Forte

BYDLOWISKY, S. P.;MASSIRER, K. B.; LIMA, T. M.; ISSAC, C.. Expansão ex vivo das células-tronco hematopoiéticas do sangue do cordão umbilical: análise comparativa da proliferação celular em cocultura de células-tronco mesenquimais provenientes do endotélio vascular do cordão umbilical e do tecido adiposo. 2014. Dissertação (Mestrado em Ciências Médicas e Biológicas) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Daniel Fernando Paulo

De Azeredo-Espin AM;MASSIRER, K. B.; SIMOES, Z. L.; Valente G.T.. Identificação e caracterização de microRNAs das espécies Cochliomyia hominivorax e Cochliomyia macellaria (Diptera:Calliphoridae). 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Felipe Tolentino

PAPES, F.;MASSIRER, K. B.; MARQUES-SOUZA, H.; BELTRAO-BRAGA, P.. Produção e avaliação de vetores retrovirais visando a diferenciação de neurônios olfativos in vitro pela superexpressão de fatores de transcrição definidos. 2014. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fábio Tadeu Arrojo Martins

SARTORATO, E. L.;MASSIRER, K. B.; OTTOBONI, L. M. M.; MELLO, M. B.; CASTILHO, A. M.. Otimização de rastreamento simultaneo das principais mutações envolvidas na surdez neurossensorial sindromica e não-sindromica utilizando a plataforma TaqMan OpenArray Genotyping. 2013. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fulvia Di Pillo

MASSIRER, K. B.; BRESSAN, GUSTAVO COSTA; COLTRI, P.; MORELLI, C.; GUARAGNA, M. S.. Regulação de splicing alternativo por quinase em células de glioblastoma. 2019. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fabrício Castro Machado

SCHENKMAN, S.; YOSHIDA, N.; CAMPOS, D. R.; TROSSINI, G. H. G.;MASSIRER, K. B.. Participação de eIF2 e sua fosforilação durante o ciclo de vida e sobrevivência de Trypanosoma. 2018. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: THIAGO SEIKE PICORETI NAKAHARA

PAPES, F.;MASSIRER, K. B.; KOBARG, J.; MALNIC, B.. Caracterização funcional de uma nova população de neurônios sensoriais olfativos em mamíferos (Mus musculus). 2018. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Gloria Alexandra Gallo Enamorado

MORI, M. A. S.;Massirer, K.B.; KOBARG, J.; PESQUEIRO, J. B.; ALFONSO, M. R. A. W.. Caracterização estrutural da proteína, uma proteína do sistema CRISPr-CAS. 2018. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Marianna Teixeira de Pinho Favaro

AZZONI, A. R.;MASSIRER, K. B.; BROCCHI, M.; MAGALHAES, G. S.; CARDOSO, M. B.. Avaliação de proteínas modulares para a entrega de genes e drogas. 2017. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Gabriel Sarti Lopes

LARSON, M. L. P.;MASSIRER, K. B.; SABOLELLA, A. S.; ROCHA, R. S.. Caracterização estrutural, bioquímica e funcional de uma proteína do tipo hnRNPA/B identificada em neurônios de lula. 2017. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernanda Machado de Carvalho

STOTT, S.;MASSIRER, K. B.; NUNES, D. N.; ANDRADE, M. B.. Estudo de células tumorais circulantes (CTCs) em câncer de mama e melanoma. 2016. Tese (Doutorado em Ciências) - A.C. Camargo Cancer Center.

Aluno: Diogo Galdeano

MACHADO, M. A.;MASSIRER, K. B.; HARAKAVA, R.; SOUZA, H. M. B.. Avaliação da expressão de genes candidatos em sistema de RNA interferente (RNAi) em Diaphorina citri. 2016. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Melissa Quintero Escobar

DIAS, S. M. G.;MASSIRER, K. B.; SMETANA, J. H. C.; DIAS, M. M.. Transcriptômica e metabolômica como ferramentas para o entendimento do processo de adaptação metabólica tumoral dos tumores de mama triplo-negativo. 2016. Tese (Doutorado em BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Paulo Mauricio do Amor divino Miranda

SARTORATO, E. L.;MASSIRER, K. B.; OLIVEIRA, C. A.; FERRAZ, L. F. C.; CASTILHO, A. M.. Alteracoes mitocondriais e nucleares associadas a neuropatia óptica. 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Luiz Eduardo Vieira Del Bem

MASSIRER, K. B.; VINCENTZ, M. G. A.; REIS, S. F.; CALDANA, C.; DOMINGUES, D.; COLOMBO, C. A.; LABORDA, P. R.. Evolução de familias multigenicas e redes de regulação em plantas. 2013. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Clelton Aparecido dos Santos

SOUZA, A. P.;MASSIRER, K. B.; OLIVEIRA, J. C. F.; VILAS BOAS, L. A.; TASIC, L.. Estudos estruturais e funcionais de proteinas relacionadas a patogenicidade de Xylella fastidiosa. 2013. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Marcelo Augusto Szymanski

AZZONI, A. R.;MASSIRER, K. B.; Cororato-SANTOS, S. A.; de la TORRE, L. G.. Tráfego intracelular de vetores não virais: desenvolvimento de proteínas de fusão para transporte de DNA plasmidial através da interação com proteínas motoras. 2013. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Cleverson C

VINCENTZ, M. G. A.;MASSIRER, K. B.; HEMERLY, A. S.; MOURA, D. S.; SALGADO, I.. Matiolli. O fator de transcrição AtbZIP63 como integrador de sinais energéticos e estresses biótico/abiótico. 2012. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Ludimila Dias Almeida

BILSLAND, E.;MASSIRER, K. B.; SANTOS, L. V.; ZANELLI, C. F.. Determinação da especificidade ao substrato de transportadores de membrana plasmática de Saccaromyces cerevisiae e Homo sapiens. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Rodrigo de Vecchi

REHEN, S.;MASSIRER, K. B.BENGTSON, MARIO H.; SOUZA, H. M. B.. Geração de neurônios sensoriais periféricos humanos derivados de células tronco pluripotentes induzidas. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Krishina Rtna Sousa de Oliveira

DIAS, S. M. G.;MASSIRER, K. B.; MELLO, M. L. S.; SMETANA, J. H. C.. Estudo epigenético das enzimas desmetilases de histonas dependentes de FE(II) e -cetoglutarato da família jumonji no contexto do metabolismo tumoral e atividade glutaminase. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Carolline Ascenção

MASSIRER, K. B.; QUEIROZ, K. C. S.; CONSONNI, S. R.. Estudos do mecanismo de ação das vias de sinalização celular PI3K/Akt/mTOR sobre a atividade da enzima glutaminase. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fernanda Machado de Carvalho

MALAGOLI-ROCHA, R.;MASSIRER, K. B.. Avaliação da transição epitélio-mesênquima e do papel do coativador transcricional PGC-1 em carcinoma mamário: Um estudo envolvendo células tumorais circulantes (CTCs).. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado) - Fundação Antônio Prudente.

Aluno: Marianna Teixeira de Pinho Favaro

AZZONI, A. R.;MASSIRER, K. B.; PERONI, L. A.; VINCENTZ, M. G. A.. Desenvolvimento e avaliação in vitro e in vivo de vetores de entrega gênica baseados na cadeia leve de dineína Rp3 e peptídeos sintéticos. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Izabella Agostinho Pena Neshich

ARRUDA, P.;MASSIRER, K. B.; PAPES, F.; CARVALHO, H. F.. Catabolismo de Lisina: da adaptação a estresse osmótico a um novo alvo contra Epilepsia Dependente de Piridoxina. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Maria Carolina Costa Melo Svidnicki

SARTORATO, E. L.;MASSIRER, K. B.; MELO, M. B.; ALEXANDRINO, F.; OLIVEIRA, C. A.. Diagnostico de surdez de origem genetica: Desenvolvimento de painel diagnostico para rastreamento simultaneo das principais mutações envolvidas na perda auditiva usando espectrometria de massa.. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Sweta Sarmah

MORI, M. A. S.;MASSIRER, KATLIN BRAUER; LIMA, T.; BOZI, L.. Uncovering the new Regulators of DAF-16/FOXO expression. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Luis Fernando Nagano

MARQUES-SOUZA, H.;MASSIRER, K. B.; SANTOS, A. M.; YUNES, A.. Análise da rede de regulação gênica de Coup-TFII em cardiomiócitos atriais humanos diferenciados a partir de células-tronco embrionárias humanas. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Guilherme Henrique Gatti da Silva

COLTRI, P.;MASSIRER, K. B.. Estudo funcional da proteína RNF113A (ZNF183) no spliceossomo em células de mamíferos.. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Silas Pinto da Silva

MORI, M.;MASSIRER, K. B.. Estudo em nematoides C. elegans sobre um novo mecanismo responsável pelos efeitos da restrição calórica. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Paulo.

MASSIRER, K. B.; ESPREAFICO, E. M.; BEVILACQUA, E. M. F.; SILVEIRA, M. S.; HAYASHI, M. A. F.; JUNQUEIRA, V. B. C.. Banca Examinadora Concurso de Professor Adjunto da Area de Biologia do Campus de São Jose dos Campos. 2013. Universidade Federal de São Paulo.

Massirer, K.B.; TAKEUTI, D.. Julgadora Science Fair Escola Americana. 2019. Escola Americana de Campinas.

MASSIRER, K. B.; GOZZI, M.. Julgadora Science Fair Escola Americana. 2017. Escola Americana de Campinas.

MASSIRER, K. B.. X-meeting Bioinformática. 2017. Universidade Estadual de Campinas.

MASSIRER, K. B.; POHLMANN, A. R.. Escolha de melhor trabalho no II Encontro do Programa de Pós-graduação em Ciências Farmacêuticas. 2017. Universidade Federal de Santa Maria.

MASSIRER, K. B.; GOZZI, M.. Julgadora Science Fair Escola Americana. 2016. Escola Americana de Campinas.

MASSIRER, K. B.; PAPES, F.. Network: Encontro de Jovens Pesquisadores em regulação gênica em diferenciação celular e no desenvolvimento. 2014. Universidade Estadual de Campinas.

MASSIRER, K. B.. Julgadora do Concurso de Melhor Poster de Doutorado - AAAS meeting. 2010.

MASSIRER, K. B.. Julgadora Greater San Diego Science and Engineering Fair. 2008. non-profit.

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Comissão julgadora das bancas

Antonio Eduardo Benedito Silva

Silva, A.E.B.. Expressão gênica do receptor do IFN alfa/beta em pacientes com infecção crônica por HCV, tratados com IFN alfa-2b recombinante. 2000. Dissertação (Mestrado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo.

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Orientou

Gabriela Maria Gomes

Proteina quinase reguladora de splicing PRPF4B, caracterização e definição de inibidores; Início: 2016; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Natacha Azussa Migita

Fusões gênicas em Leucemias Philadelphia like; Início: 2016; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Coorientador);

Laura Alonso

Função da proteína CAPRIN1 em grânulos celulares de stress; Início: 2015; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Fulvia Di Pillo

Início: 2019; Universidade Estadual de Campinas;

Stanley Nunes Vasconcelos

Início: 2018; Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Angela Fala

Início: 2017; Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;

Caio Reis

Início: 2017; Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;

Ricardo Serafim

Início: 2016; Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Gabriel Vielira Valderrama

Investigação celular de proteínas quinases envolvidas com splicing, por sistema de minigene, FAPESP; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Universidade Paulista, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Fernando Henrique Bosso

Otimização de condições de cristalização da proteína quinase PRPF4 e definição de interações proteicas em células triplo negativo de tumor de mama; Início: 2018; Iniciação científica (Graduando em Farmácia) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Felipe Ciamponi

Identificação de características biológicas associadas a sitios alvo de proteínas de ligação ao RNA (RBPs); 2017; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Natacha Azussa Migita

Perfil de RNAs ligados a proteina Caprin-1; 2016; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Laura Alonso

Caracterização do complexo proteico da RBP Caprin-1; 2015; Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundo de Apoio a Pesquisa, ao Ensino e a Extensão; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Fulvia Di Pillo

Regulação de splicing alternativo por quinase em células glioblastoma; 2019; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Pedro Rodrigues Sousa da Cruz

2017; Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Katlin Brauer Massirer;

André Santiago

2017; Universidade Estadual de Campinas, SGC-FAPESP-Funcamp; Katlin Brauer Massirer;

Natassia Oliveira

2016; Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Katlin Brauer Massirer;

André Santiago

2016; Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Katlin Brauer Massirer;

Michael Lovci

2015; Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Katlin Brauer Massirer;

Arie Johan Hoogendijk

2015; Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Katlin Brauer Massirer;

Roberto Takata

2014; Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Katlin Brauer Massirer;

Laura Fiorini Alves

Expressão heteróloga e função do proteína quinase CAMKK1; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Pablo Nathan Barros da Silva

Enzima DYRK1B: clonagem, expressão e purificação; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Química) - Instituto Federal de São Paulo, SGC-FAPESP-Funcamp; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Felipe Ciamponi

Análise computacional de alterações transcriptômicas induzidas por grânulos de stress em células humanas; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Gabriela Figueiredo

Entendimento dos níveis da proteína e das condições de cristalografia para a kinase PRPF4, envolvida em regulação de splicing; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Luidy Issaiama

Sistema de localização celular para a proteína reguladora de splicing RBFOX; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Felipe Ciamponi

Proteinas de ligação a RNA - TDP43; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Felipe Ciamponi

Falha no sistema de nonsense mediated decay em células neuronais como base para toxicidade de mutações em TDP-43; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Gabriel Vieira Valderrama

Ensaios de splicing alternativo para avaliação de proteínas quinases - Estágio; 2019; Orientação de outra natureza; (Farmácia) - Universidade Estadual de Campinas, Empresa Brasileira de Inovação Industrial; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Fong Koh- Honors Thesis

miR-35 Sensor System for Target Evaluation; 2007; Orientação de outra natureza - University of California San Diego; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Gabriela Carolina Monsalve

Is the Dosage Compensation Pathway in C; elegans regulated by microRNAs?; 2006; Orientação de outra natureza - University of California San Diego; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Brad Heli

The role of argonaut protein ALG-2 during embryogenesis in C; elegans; 2004; Orientação de outra natureza; (PhD in Biological Sciences) - University of California San Diego; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

Fabio de Araujo Feio Nobre

Desenvolvimento de proteina recombinante para gerar anticorpo anti-interferon; 1997; Orientação de outra natureza; (Farmácia e Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Katlin Brauer Massirer;

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Foi orientado por

Rosario Dominguez Crespo Hirata

Expressão do receptor do Inferferon alfa em indivíduos portadores de infecção crônica por HCV, tratados com inferferon alfa; 2000; 0 f; Dissertação (Mestrado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Rosario Dominguez Crespo Hirata;

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Produções bibliográficas

  • SCOTT, FIONA ; FALA, ANGELA M. ; PENNICOTT, LEWIS E. ; REUILLON, TRISTAN D. ; Massirer, Katlin B. ; ELKINS, JONATHAN M. ; WARD, SIMON E. . Development of 2-(4-pyridyl)-benzimidazoles as PKN2 chemical tools to probe cancer. BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS , v. 1, p. 127040, 2020.

  • DE-SOUZA, EVANDRO A ; CAMARA, HENRIQUE ; SALGUEIRO, WILLIAN G ; MORO, RAÍSSA P ; KNITTEL, THIAGO L ; TONON, GUILHERME ; PINTO, SILAS ; PINCA, ANAPAULAF ; ANTEBI, ADAM ; Pasquinelli, Amy E ; Massirer, Katlin B ; MORI, MARCELO A . RNA interference may result in unexpected phenotypes in Caenorhabditis elegans . NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 1, p. 1, 2019.

  • BARBOSA, ÉVERTON DE ALMEIDA ALVES ; SERAPHIM, THIAGO VARGAS ; GANDIN, CÉSAR AUGUSTO ; TEIXEIRA, LEILANE FERREIRA ; DA SILVA, RONNI ANDERSON GONÇALVES ; RIGHETTO, GERMANNA L. ; GONCALVES, KALIANDRA DE ALMEIDA ; VASCONCELLOS, RAPHAEL DE SOUZA ; ALMEIDA, MÁRCIA ROGÉRIA ; SILVA JÚNIOR, ABELARDO ; FIETTO, JULIANA LOPES RANGEL ; KOBARG, JÖRG ; GILEADI, CARINA ; Massirer, Katlin B. ; BORGES, JULIO CÉSAR ; DE OLIVEIRA NETO, MARIO ; BRESSAN, GUSTAVO COSTA . Insights into the full-length SRPK2 structure and its hydrodynamic behavior. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES , v. 137, p. 205-214, 2019.

  • SERAFIM, RICARDO A. M. ; DE SOUZA GAMA, FERNANDO H. ; DUTRA, LUIZ A. ; DOS REIS, CAIO V. ; VASCONCELOS, STANLEY N. S. ; DA SILVA SANTIAGO, ANDRÉ ; TAKARADA, JÉSSICA E. ; DI PILLO, FÚLVIA ; AZEVEDO, HATYLAS ; MASCARELLO, ALESSANDRA ; ELKINS, JONATHAN M. ; Massirer, Katlin B. ; GILEADI, OPHER ; GUIMARÃES, CRISTIANO R. W. ; COUAGO, RAFAEL M. . Development of Pyridine-based Inhibitors for the Human Vaccinia-related Kinases 1 and 2. ACS Medicinal Chemistry Letters , v. 1, p. 1, 2019.

  • PROFETA, GERSON S. ; DOS REIS, CAIO V. ; SANTIAGO, ANDRÉ DA S. ; GODOI, PAULO H. C. ; FALA, ANGELA M. ; WELLS, CARROW I. ; SARTORI, ROGER ; SALMAZO, ANITA P. T. ; RAMOS, PRISCILA Z. ; Massirer, Katlin B. ; ELKINS, JONATHAN M. ; DREWRY, DAVID H. ; GILEADI, OPHER ; COUAGO, RAFAEL M. . Binding and structural analyses of potent inhibitors of the human Ca2+/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) identified from a collection of commercially-available kinase inhibitors. Scientific Reports , v. 9, p. 1, 2019.

  • RIGHETTO, GERMANNA LIMA ; SRIRANGANADANE, DEV ; HALABELIAN, LEVON ; CHIODI, CARLA G. ; ELKINS, JONATHAN M. ; Massirer, Katlin B. ; GILEADI, OPHER ; MENOSSI, MARCELO ; COUAGO, RAFAEL M. . The C-Terminal Domains SnRK2 Box and ABA Box Have a Role in Sugarcane SnRK2s Auto-Activation and Activity. Frontiers in Plant Science , v. 10, p. 1, 2019.

  • TOSARINI, THALITA RAVAZO ; RAMOS, PRISCILA ZONZINI ; DE SOUZA, GERSON PROFETA ; BARONI, RENATA MORO ; Massirer, Katlin B. ; COUAGO, RAFAEL M. ; MONDEGO, JORGE M.C. . Cloning, expression and purification of kinase domains of cacao PR-1 receptor-like kinases. PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION , v. 1, p. 1, 2018.

  • PINTO, SILAS ; SATO, VITOR N. ; DE-SOUZA, EVANDRO A. ; FERRAZ, RAFAEL C. ; CAMARA, HENRIQUE ; PINCA, ANA PAULA F. ; MAZZOTTI, DIEGO R. ; Lovci, Michael T. ; TONON, GUILHERME ; LOPES-RAMOS, CAMILA M. ; PARMIGIANI, RAPHAEL B. ; WURTELE, MARTIN ; Massirer, Katlin B. ; MORI, MARCELO A. . Enoxacin extends lifespan of C. elegans by inhibiting miR-34-5p and promoting mitohormesis. Redox Biology , v. 18, p. 84-92, 2018.

  • SANTIAGO, ANDRÉ DA SILVA ; COUAGO, RAFAEL M. ; RAMOS, PRISCILA ZONZINI ; GODOI, PAULO H. C. ; Massirer, Katlin B. ; GILEADI, OPHER ; ELKINS, JONATHAN M. . Structural Analysis of Inhibitor Binding to CAMKK1 Identifies Features Necessary for Design of Specific Inhibitors. Scientific Reports , v. 8, p. 1, 2018.

  • AQUINO, BRUNO ; COUAGO, RAFAEL M. ; VERZA, NATALIA ; FERREIRA, LUCAS M. ; Massirer, Katlin B. ; GILEADI, OPHER ; ARRUDA, PAULO . Structural Characterization of Maize SIRK1 Kinase Domain Reveals an Unusual Architecture of the Activation Segment. Frontiers in Plant Science , v. 8, p. 852-857, 2017.

  • COUAGO, RAFAEL M. ; ALLERSTON, CHARLES K. ; SAVITSKY, PAVEL ; AZEVEDO, HATYLAS ; GODOI, PAULO H. ; WELLS, CARROW I. ; MASCARELLO, ALESSANDRA ; DE SOUZA GAMA, FERNANDO H. ; Massirer, Katlin B. ; ZUERCHER, WILLIAM J. ; GUIMARÃES, CRISTIANO R. W. ; GILEADI, OPHER . Structural characterization of human Vaccinia-Related Kinases (VRK) bound to small-molecule inhibitors identifies different P-loop conformations. Scientific Reports , v. 7, p. 7501, 2017.

  • EDWARDS, ALED M. ARROWSMITH, CHERYL H. BOUNTRA, CHAS BUNNAGE, MARK E. FELDMANN, MARC KNIGHT, JULIAN C. PATEL, DHAVALKUMAR D. PRINOS, PANAGIOTIS TAYLOR, MICHAEL D. SUNDSTRÖM, MICHAEL BARKER, PHIL BARSYTE, DALIA BENGTSON, MARIO H. BELL, CINDY BOWNESS, PAUL BOYCOTT, KYM M. BUSER-DOEPNER, CAROLYN CARPENTER, CHRISTOPHER L. CARR, ANDREW J. CLARK, KIRK DAS, ANUK M. DHANAK, DASHYANT DIRKS, PETER ELLIS, JAMES FANTIN, VALERIA R. , et al. FLORES, CHRISTOPHER FON, EDWARD A. FRAIL, DONALD E. GILEADI, OPHER O'HAGAN, RONAN C. HOWE, TREVOR ISAAC, JOHN T. R. JABADO, NADA JAKOBSSON, PER-JOHAN KLARESKOG, LARS KNAPP, STEFAN LEE, WEN HWA LIMA-FERNANDES, EVELYNE LUNDBERG, INGRID E. MARSHALL, JOHN Massirer, Katlin B. MACKENZIE, ALEX E. MARUYAMA, TETSUYUKI MUELLER-FAHRNOW, ANKE MUTHUSWAMY, SENTHIL NANCHAHAL, JAGDEEP O'BRIEN, CATHERINE OPPERMANN, UDO OSTERMANN, NILS PETRECCA, KEVIN POLLOCK, BRUCE G. POUPON, VIVIANE PRINJHA, RAB K. ROSENBERG, SAUL H. ROULEAU, GUY SKINGLE, MALCOLM SLUTSKY, ARTHUR S. SMITH, GARTH A. M. VERHELLE, DOMINIQUE WIDMER, HANS YOUNG, L. TREVOR ; Preclinical target validation using patient-derived cells. NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY , v. 14, p. 149-150, 2015.

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  • Bagga, Shveta ; Bracht, John ; Hunter, Shaun ; MASSIRER, KATLIN ; Holtz, Janette ; Eachus, Rachel ; Pasquinelli, Amy E. . Regulation by let-7 and lin-4 miRNAs Results in Target mRNA Degradation. CELL , v. 122, p. 553-563, 2005.

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  • BRENTANI, H. ; ... ; MASSIRER, K. B. . The generation and utilization of a cancer-oriented representation of the human transcriptome by using expressed sequence tags. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , v. 100, p. 13418-13423, 2003.

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Outras produções

MASSIRER, KATLIN BRAUER . FAEPEX UNICAMP. 2018.

MASSIRER, KATLIN BRAUER . PIPE-FAPESP. 2018.

MASSIRER, K. B. ; BENGTSON, M. H. ; ARRUDA, P. . Plataforma dos Genes as Drogas. 2017.

Massirer, KatlinB. ; BENGTSON, MARIO H. ; ARRUDA, P. . Plataforma dos Genes as Drogas. 2015.

ASTOLFI, S. ; Massirer, K.B. . Estratégias modernas de bioprospecção. 2019. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

Massirer, K.B. ; DREWES, K. ; BARROS, F. A. P. ; LACATIVA, P. . Cases of sucess between Academia and Industry. 2019. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

Massirer, K.B. ; DIAS, L. C. ; DREWES, K. . Os desafios da parceria entre o segmento acadêmico e a indústria farmacêutica. 2019. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

Massirer, KatlinB. ; AZEVEDO, H. . Inovação em Fármacos no Brasil. 2017. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

Massirer, Katlin B . youtube - Linha de Pesquisa do laboratório de Regulação de RNA e microRNAs em Doenças. 2014. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

Massirer, KatlinB. . Trajetórias de Carreira. 2014. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

Massirer, Katlin B. ; Brennand, K . Busca de empregos no ambiente acadêmico. 2011. (Programa de rádio ou TV/Mesa redonda).

Massirer, KatlinB. . Structural Genomics Consortium - Unicamp. 2017; Tema: Projetos de ciência aberta em química medicinal. (Site).

TAKATA, R. ; Massirer, K.B. . Versão humana de gene ligado à fala facilita aprendizado em camundongos. 2014; Tema: divulgação, gene aprendizado. (Site).

TAKATA, R. ; Massirer, K.B. . Desenvolvimento de invertebrado marinho dá pistas para a origem da notocorda. 2014; Tema: divulgação de ciência. (Site).

TAKATA, R. ; Massirer, K.B. . Nobel de Fisiologia ou Medicina 2014: Como o cérebro mapeia o ambiente. 2014; Tema: Nobel de Medicina 2014. (Site).

TAKATA, R. ; Massirer, K.B. . Nobel de Química 2014: Microscopia óptica em nanoescala. 2014; Tema: Nobel de Química 2014. (Site).

Massirer, K.B. . Linha de pesquisa do Grupo - Conceitos de Expressao genica. 2014; Tema: Divulgação da linha de pesquisa - Porque o fígado é diferente do olho se tem o mesmo DNA. (Site).

Massirer, K.B. . Desenvolvimento ocorrendo constantemente diante de nossos olhos (ovos de borboleta e mão de bebê). 2014. Fotografia.

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Projetos de pesquisa

  • 2017 - Atual

    Coordenadora, Unidade Embrapii CQMED Fármacos (Centro de Química Medicinal de Inovação Aberta), Descrição: Projeto concedido pela Empresa Brasileira de Inovação Industrial. Nossa laboratório SGC foi cadastrado como Unidade Embrapii em julho de 2017 e se denomina CQMED (Centro de Química Medicinal de Acesso Aberto). O Objetivo do projeto é gerar inovação realizando projetos de química medicinal (desenvolvimento de sondas químicas) por parcerias entre centros de excelência das Universidade e empresas farmacêuticas nacionais. Este projeto é desenvolvido por pós-doutorandos. Coordenado por ambos Katlin Massirer e Paulo Arruda. http://embrapii.org.br/cqmed/. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Coordenador / Paulo Arruda - Integrante., Financiador(es): Empresa Brasileira de Inovação Industrial - Auxílio financeiro.

  • 2017 - Atual

    Pesquisadora Principal, INCT Centro de Química Medicinal de Ciência aberta, Descrição: Muitas das descobertas da área em rápida expansão da genômica não são efetivamente utilizadas na medicina, agricultura e indústria. Isto acontece em parte por causa da falta de cooperação entre cientistas de disciplinas diferentes e também pelo fato de muito da pesquisa translacional feita na indústria e academia ser protegida por patentes e, portanto, não publicada no tempo oportuno. Nossa proposta INCT procura atacar estes problemas de duas formas. A primeira através da criação de uma rede altamente integrada de pesquisadores de diferentes disciplinas (genética, bioquímica, química medicinal, biologia celular e do desenvolvimento) e a segunda através do comprometimento com a pesquisa de livre acesso: todos os dados e reagentes gerados serão de livre acesso a qualquer pesquisador, dentro ou fora de nossa proposta, sem nenhuma restrição. Iremos explorar o potencial de genes relevantes medicamente focando nas proteínas codificadas por estes genes e desenvolvendo um pacote de ferramentas que permitirão a pesquisa nessas proteínas. Esse pacote de ferramentas incluirá clones de expressão gênica, protocolos de purificação de proteínas, anticorpos, estruturas cristalográficas e inibidores químicos. Esses conjuntos de reagentes (ou pacotes) irão permitir com que a comunidade cientifica expanda muito sua capacidade. A fim de garantir que os cientistas locais se beneficiem dessas ferramentas, nosso INCT apresenta o compromisso de disponibilizá-las livremente a todos cientistas interessados. Nosso projeto está focado na facilitação da pesquisa em proteínas pois proteínas específicas frequentemente representam o ?elo perdido? entre a genética e estudos funcionais/médicos. O estudo detalhado das proteínas codificadas por um gene selvagem e o correspondente mutado em doenças ou proteínas-alvo em doenças parasitárias, são frequentemente pouco estudadas. Nosso INCT será formado em torno de um laboratório central na UNICAMP, em colaboração com o Consorcio de Genômica Estrutural (Structural Genomics Consortium ? SGC; www.thesgc.org) e seus laboratórios nas universidades de Oxford e Toronto. Os grupos colaboradores componentes da rede do INCT irão escolher uma lista de genes alvo relacionados a sua pesquisa, conjuntamente com indicações de grupos colaboradores da parte de genética médica. Nosso laboratório central irá clonar, purificar, cristalizar e determinar as estruturas atômicas das proteínas codificadas. Nossos grupos componentes irão colaborar no desenvolvimento de ensaios funcionais para cada uma das proteínas de interesse (por exemplo: ensaios de atividade enzimática, interação com ligantes e/ou outras proteínas), buscando o entendimento da função destas proteínas alvo. Além disto, nosso laboratório central irá otimizar e realizar ensaios de rastreamento de pequenas moléculas para encontrar moléculas de ponto de partida para desenvolvimento de inibidores. Os laboratórios colaboradores irão usar o conhecimento e reagentes gerados pelos estudos proteicos para formular e testar hipóteses no contexto celular e fisiológico relevante. Projeto coordenado por Paulo Arruda e Mario Bengtson. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Mario Henrique Bengtson - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Edi L Sartorato - Integrante / Opher Gileadi - Integrante / Jon Elkins - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / CAPES - Centro Anhanguera de Promoção e Educação Social - Bolsa.

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Jovem Pesquisador: Impacto da regulação traducional na diferenciação neuronal (2014/21704-9), Descrição: Durante a diferenciação celular, vários mecanismos bioquímicos são empregados pela célula para garantir que genes sejam expressos no momento e quantidade adequados, modulando corretamente as diversas vias envolvidas neste complexo processo. Um destes mecanismos controla quais mRNAs especificamente e em que taxa serão traduzidos pelos ribossomos e é conhecido como controle traducional da expressão gênica. Desde algum tempo se sabe que este mecanismo deve ser fundamental para o funcionamento celular, visto que a expressão proteica apresenta má correlação com a expressão de mRNA. Apesar disto, os diversos fatores que participam deste mecanismo, como ele opera e quais vias regula ainda são pouco compreendidos. Neste projeto pretendemos entender como a regulação traducional da expressão gênica contribui para a diferenciação neuronal de células tronco. Quais genes e vias são reguladas traducionalmente no processo de diferenciação e quais proteínas/miRNA participam desta regulação.Para chegar a estes objetivos, iremos comparar o níveis globais de expressão genica de cada mRNA celular (biblioteca de RNAseq) com o nível dos mRNAs correspondentes ligados aos ribossomos (biblioteca de Riboseq), em diferentes pontos da diferenciação neural. Buscaremos encontrar genes cuja expressão de mRNA não mude, mas que a fração ligada ao ribossomo seja alterada durante a diferenciação, por exemplo. A expressão de miRNAs e de proteínas ligantes de RNA serão comparadas entre os mesmos pontos de tempo para sugerir possíveis responsáveis pela regulação. Usaremos ensaios biológicos e bioinformática para determinar o impacto da regulação no processo de diferenciação. (AU). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Andre Fujita - Integrante / Mario Henrique Bengtson - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2014 - 2017

    Coordenadora, Universal CNPQ: Inibidores de Proteínas quinases para as vias celulares de processamento de RNA em doenças neurológicas (456809/2014-7), Descrição: Projeto Universal em Colaboração com SGC-Campinas (Structural Genomics Consortium) Proteínas de ligação a RNA (ou RNA binding proteins - RBPs) controlam uma série de eventos celulares pós-transcricionais como splicing alternativo, transporte de pré-mRNAs para fora do núcleo celular, estabilização de mRNAs e a via de microRNAs. Mutações ou alterações na expressão de RBPs vêm sendo associadas a estados patológicos como Alzheimer, Esclerose Lateral Amiotrófica (ELA), distrofia muscular miotônica, autismo e Parkinson. Além disso, várias RBPs regulam a manutenção da pluripotência de células tronco e processos envolvidos na diferenciação celular. No entanto, ainda se sabe pouco sobre como as RBPs são ativadas e sobre a regulação de seus mRNAs-alvo. Recentemente foi demostrado que RBPs também podem ser ativadas por fosforilação. A atuação de proteínas quinase sobre as RBPs influencia assim o processamento de mRNAs-alvo das RBPs. Neste projeto temos o objetivo de estudar a regulação de proteínas RPBs por proteínas quinases, em colaboração com o grupo Internacional SGC-Toronto (Structural Genomic Consortium). Estas proteínas quinases terão sua estrutura determinada no projeto conjunto e também serão geradas pequenas moléculas químicas capazes de atuarem nestas quinases. Iremos focar o projeto na influência destas quinases e das moléculas candidatas no controle e processamento de RNAs. Propomos validar eventos regulatórios pós-transcricionais em células humanas em cultura, utilizando moléculas regulatória sintetizadas pelo SGC. Esperamos encontrar moléculas que resultem na regulação destes mecanismos de RNA.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

  • 2014 - 2017

    Coordenadora, Professor Visitante Especial CNPQ: Caracterização da fosforilação de Proteínas de Ligação a RNA: Investigação de quinases responsáveis e geração de inibidores de quinases (400906/2014-7), Descrição: A RBFOX é uma dessas proteína de ligação a RNA que controla splicing alternativo de RNA. Falha na sua função e consequente perda de regulação do splicing alternativo de vários mRNAs-alvo está relacionada a doenças musculares e neurológicas como distrofias musculares, Alzheimer e autismo. Recentemente foi demostrado que algumas RBPs também podem ser alvos de proteínas quinases, sendo fosforiladas para serem ativadas e controlando assim o processamento de seus mRNAs-alvo. Em relação a Rbfox mencionada, foi sugerido que a quinase WNK3 (with no lysine-3) interfere no splicing de mRNAs-alvo de RBFOX. Por isso, nossa proposta é estudar a regulação de RBPs por proteínas quinases num projeto colaborativo com especialistas em kinome. Na colaboração com o SGC-Toronto (Structural Genomic Consortium, University of Toronto) pretendemos elucidar a importância da fosforilação da RBFOX por WNK3, gerar e testar moléculas inibitórias da quinase WNK3. O SGC irá auxiliar na determinação da estrutura de WNK3 e irá gerar moléculas inibidoras da quinase WNK3, utilizando sua expertise do projeto human kinome e suas plataformas de geração de moléculas. Os materiais gerados pelo SGC são parte de open Science que não geram patentes. Ao mesmo tempo, estaremos estabelecendo os ensaios de quinase e validando eventos regulatórios pós-transcricionais (eventos de splicing alternativo) em células humanas em cultura, como uma plataforma para testar os inibidores de quinases. Comprovações de eventos de splicing alternativos dependentes de quinases serão então transpostos para modelo de células neuronais derivados de células tronco embrionárias humanas. Com esse projeto pretendemos gerar bases para inibidores de quinases de importância clínica. Temos como Professor Visitante especial o Dr Aled Edwards, professor da Universidade de Toronto e CEO do SGC-Global.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Coordenador / Aled Edwards - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2 / Número de orientações: 3

  • 2014 - 2016

    Colaboradora, Regular FAPESP: Desenvolvimento de técnicas estatístico-computacionais para construir, modelar e analisar redes biológicas envolvidas em doenças (2014/09576-5), Descrição: O entendimento dos mecanismos geradores das diversas doenças que acometem a humanidade é um dos grandes objetivos das ciências biológicas. Apesar de todos os esforços, o enorme número de fatores heterogêneos que influenciam na gênese de uma doença torna essa tarefa muito árdua. Um dos desafios para o entendimento das doenças está no desenvolvimento de metodologias computacionais para a análise estatística e manipulação de dados gerados em larga escala. Isso se deve principalmente a grande quantidade, heterogeneidade, multidimensionalidade e presença de ruído intrínseco nos dados biológicos. Neste contexto, este projeto de pesquisa tem como objetivo principal o desenvolvimento de técnicas estatístico-computacionais para inferência dos fenômenos que emergem das interações entre os diferentes componentes biológicos envolvidos numa doença. Em outras palavras, desenvolveremos métodos estatísticos formais para grafos (teste de hipóteses, seleção de modelos, estimador de parâmetros) a fim de comparar redes neurais obtidas da modelagem de dados de ressonância magnética funcional, e estrutural e integrar dados de genômica, transcriptoma e fenótipo em câncer. Isso permitirá modelar, integrar e analisar dados biológicos obtidos em diversas colaborações entre nosso grupo e laboratórios de biologia/medicina (Lab. de Regulação de RNAs e micro RNAs em Doenças (Profa. Massirer) e Lab. de Biologia Molecular (Prof. Bengtson), ambos da UNICAMP; dados de ressonância magnética dos grupos do Prof. Sato da UFABC e Dr. Takahashi da Universidade de Princeton) além também de implantar uma linha de pesquisa inédita (análise estatística formal em grafos) tanto no mundo como também no Dept. de Ciência da Computação do IME-USP. Com isso, esperamos auxiliar biomédicos a elucidar os mecanismos biológicos envolvidos em diversas doenças estudadas neste projeto (câncer, doenças cardiovasculares, diabetes e distúrbios do cérebro).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / FUJITA, ANDRÉ - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2017

    Coordenadora, Jovem Pesquisadora FAPESP: Redes de regulação pós-transcricional por proteínas de ligação a RNA em células tronco embrionárias humanas (Projeto Jovem Pesquisador), Descrição: Proteínas de ligação a RNA (ou RNA binding proteins ? RBPs) controlam uma série de eventos celulares pós-transcricionais como splicing alternativo, transporte de pré-mRNAs para fora do núcleo celular, estabilização de mRNAs e a via de microRNAs. Mutações ou alterações na expressão de RBPs vêm sendo associadas a estados patológicos como Alzheimer, Esclerose Lateral Amiotrófica (ELA), distrofia muscular miotônica, autismo e Parkinson. Além disso, várias RBPs regulam a manutenção da pluripotência de células tronco e processos envolvidos na diferenciação celular. No entanto, ainda se sabe pouco sobre a função das RBPs na escolha e na regulação de mRNAs-alvo. Neste projeto propomos identificar os complexos nos quais RPBs estão envolvidas, caracterizar seus mRNAs-alvo e definir mecanismo que relaciona estes dois achados. Iremos combinar técnicas moleculares e bioinformática. Propomos estudar 5 RBPs relacionadas `a manutenção do estado pluripotente e a diferenciação neuronal a partir de células tronco humanas, contribuíndo para o entendimento do mecanismo regulatório ao nível de RNA em doenças neurológicas. Iremos caracterizar complexos protéicos formados por RBPs através de imunoprecipitação combinada com espectrometria de massa, utilizando-se superexpressão de RBPs em células HEK293. Ao mesmo tempo, propomos estudar o estado pluripotente de células tronco embrionárias humanas empregando a técnica de CLIP-seq (crosslinking de células seguida de imunoprecipitação da RBP e seleção de mRNAs ligados a proteína) para identificar os mRNAs-alvo de RBPs. Os dados de CLIP-seq também serão utilizados para identificar sítios de ligação da proteína aos mRNAs, combinando ferramentas computacionais. Pretendemos validar eventos regulatórios pós-transcricionais em células tronco embrionárias humanas comparativamente com células neuronais derivadas das primeiras.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Coordenador.

  • 2009 - 2011

    Post-doutorado, Principal: Neural and general splicing factors control self-renewal, neural survival and differentiation, Descrição: Mecanismdo de regulação de splicing por proteínas de ligação a RNA em células tronco humanas e neuronais. Proteínas Lin-28, Fox2, Fox3(Neun). - Universidade da California San Diego (UCSD). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / GENE W YEO - Coordenador., Financiador(es): University of California San Diego - Bolsa.

  • 2003 - 2009

    Doutorado bolsa Concedida: The embryonic mir-35 microRNA cluster regulates development and RNAi efficiency in C. elegans -Universidade da Califórnia San Diego (UCSD), Descrição: O objetivo deste projeto foi estudar a funcao do cluster de microRNAs mir-35-41, o qual e expresso especificamente durante embriogenese. Este projeto foi minha tese de doutorado, no qual demostrei pela primeira vez que o cluster mir-35-41 e responsavel por regular o mecanismo intracelular de RNAi por meio da proteina . Delecao deste cluster de microRNAs cause hipersensibilidade ao RNAi e este efeito pode ser epigenetico.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Coordenador / Fong Koh - Integrante / Gabriela Monsalve - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

  • 1998 - 2000

    Expressão gênica do receptor do IFNalfa/beta em pacientes com infecção crônica por HCV, tratados com IFNalfa-2b recombinante, Descrição: Pacientes participando de um estudo clinico de tratamento para hepatite C tiveram sangue coletado e avaliado bioquimica e molecularmente. Durante minha tese de doutorado avaliei a expressao genica do recepetor de interferon alfa destes pacientes. Os dados indicaram que a expresao de receptor antes do tratamento auxiliavam na predicao da resposta as tratamento. Projeto desenvolvido com bolsa de mestrado fapesp dentro de projeto tematico no laboratorio da Professora Dra Rosario Domingues Crespo Hirata.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Rosario D C Hirata - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

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Projetos de desenvolvimento

  • 2015 - Atual

    Structural genomics Consortium - Quimica Medicinal em modelo de ciencia aberta, Descrição: Desenvolvimento de inibidores de kinases, do gene aos medicamentos. Consorcio Internacional de Ciência aberta. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador.

  • 2015 - Atual

    Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto, Descrição: Desenvolvimento de inibidores de kinases, do gene aos medicamentos. Consórcio Internacional de Ciência aberta. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador.

  • 2015 - Atual

    PITE-FAPESP, Colaborador: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto, Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

  • 2014 - Atual

    PVE-CNPQ, Principal: Regulação do Processamento de RNA por quinase, Descrição: Recentemente foi demostrado que algumas Proteínas de Ligação a RNA (RBP ou RNA binding Proteins) também podem ser alvos de proteínas quinases, sendo fosforiladas para serem ativadas e controlando assim o processamento de seus mRNAs-alvo. Nesta proposta iremos estudar a regulação de RBPs por proteínas quinases num projeto colaborativo com especialistas em ?kinome?. Na colaboração com o SGC-Toronto (Structural Genomic Consortium, University of Toronto) pretendemos elucidar a importância da fosforilação da Proteína de Ligação a RNA Rbfox pela quinase WNK3 e gerar e testar moléculas inibitórias da quinase WNK3. O SGC com Aled Edwards como Professor Visitante, irá auxiliar na determinação da estrutura de WNK3 e irá gerar moléculas inibidoras da quinase WNK3, utilizando sua expertise do projeto ?human kinome? e suas plataformas únicas de geração de moléculas. Os materiais gerados pelo SGC são parte de OpenScience que não geram patentes, uma cultura científica bastante importante para o Brasil. Ao mesmo tempo, estaremos estabelecendo os ensaios de quinase e validando eventos regulatórios pós-transcricionais (eventos de splicing alternativo) em células humanas em cultura, como uma plataforma para testar os inibidores de quinases. Comprovações de eventos de splicing alternativos dependentes de quinases serão então transpostos para modelo de células neuronais derivados de células tronco embrionárias humanas. Com esse projeto pretendemos gerar bases para inibidores de quinases de importância clínica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Coordenador / Fulvia di Pillo - Integrante / Aled Edwards - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    PITE-FAPESP, Colaborador: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto, Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

  • 2014 - Atual

    PVE-CNPQ, Principal: Regulação do Processamento de RNA por quinase, Projeto certificado pela empresa Fundação de Desenvolvimento da UNICAMP em 14/11/2017., Descrição: Recentemente foi demostrado que algumas Proteínas de Ligação a RNA (RBP ou RNA binding Proteins) também podem ser alvos de proteínas quinases, sendo fosforiladas para serem ativadas e controlando assim o processamento de seus mRNAs-alvo. Nesta proposta iremos estudar a regulação de RBPs por proteínas quinases num projeto colaborativo com especialistas em ?kinome?. Na colaboração com o SGC-Toronto (Structural Genomic Consortium, University of Toronto) pretendemos elucidar a importância da fosforilação da Proteína de Ligação a RNA Rbfox pela quinase WNK3 e gerar e testar moléculas inibitórias da quinase WNK3. O SGC com Aled Edwards como Professor Visitante, irá auxiliar na determinação da estrutura de WNK3 e irá gerar moléculas inibidoras da quinase WNK3, utilizando sua expertise do projeto ?human kinome? e suas plataformas únicas de geração de moléculas. Os materiais gerados pelo SGC são parte de OpenScience que não geram patentes, uma cultura científica bastante importante para o Brasil. Ao mesmo tempo, estaremos estabelecendo os ensaios de quinase e validando eventos regulatórios pós-transcricionais (eventos de splicing alternativo) em células humanas em cultura, como uma plataforma para testar os inibidores de quinases. Comprovações de eventos de splicing alternativos dependentes de quinases serão então transpostos para modelo de células neuronais derivados de células tronco embrionárias humanas. Com esse projeto pretendemos gerar bases para inibidores de quinases de importância clínica.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Coordenador / Fulvia di Pillo - Integrante / Aled Edwards - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Pesquisadora Principal, PITE-FAPESP: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto (2013/507245), Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases. Exerço o papel de COO (Chief Operational Officer) e Investigadora Principal, coordenando o centro junto com o Dr Paulo Arruda. http://www.sgc.unicamp.br. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Aled Edwards - Integrante / Opher Gileadi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Pesquisadora Principal, PITE-FAPESP: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto (2013/507245), Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases. Exerço o papel de COO (Chief Operational Officer) e Investigadora Principal, coordenando o centro junto com o Dr Paulo Arruda. http://www.sgc.unicamp.br. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Aled Edwards - Integrante / Opher Gileadi - Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Pesquisadora Principal, PITE-FAPESP: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto (2013/507245), Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases. Exerço o papel de COO (Chief Operational Officer) e Investigadora Principal, coordenando o centro junto com o Dr Paulo Arruda. http://www.sgc.unicamp.br. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Aled Edwards - Integrante / Opher Gileadi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Pesquisadora Principal, PITE-FAPESP: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto (2013/507245), Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases. Exerço o papel de COO (Chief Operational Officer) e Investigadora Principal, coordenando o centro junto com o Dr Paulo Arruda. http://www.sgc.unicamp.br. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Aled Edwards - Integrante / Opher Gileadi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Pesquisadora Principal, PITE-FAPESP: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto (2013/507245), Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases. Exerço o papel de COO (Chief Operational Officer) e Investigadora Principal, coordenando o centro junto com o Dr Paulo Arruda. http://www.sgc.unicamp.br. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Aled Edwards - Integrante / Opher Gileadi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Pesquisadora Principal, PITE-FAPESP: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto (2013/507245), Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases. Exerço o papel de COO (Chief Operational Officer) e Investigadora Principal, coordenando o centro junto com o Dr Paulo Arruda. http://www.sgc.unicamp.br. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Aled Edwards - Integrante / Opher Gileadi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1

  • 2015 - Atual

    Colaboradora, Pesquisadora Principal, PITE-FAPESP: Centro de Biologia Química de Proteínas Quinases: alavancando desenvolvimento de fármacos através de pesquisa de acesso aberto (2013/507245), Descrição: Projeto de criação do SGC-UNICAMP (The Structural Genomics Consortium), "hub" brasileiro do Consórcio Internacional de Ciência aberta para acelerar a descoberta de novos fármacos. Neste projeto foi desenvolvida a plataforma de processos: dos gene as drogas e no qual visamos o desenvolvimento de inibidores de proteinas quinases. Exerço o papel de COO (Chief Operational Officer) e Investigadora Principal, coordenando o centro junto com o Dr Paulo Arruda. http://www.sgc.unicamp.br. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Técnico de nível médio: (2) Doutorado: (2) . , Integrantes: Katlin Brauer Massirer - Integrante / Paulo Arruda - Coordenador / Aled Edwards - Integrante / Opher Gileadi - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Outra., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 1

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Prêmios

2017

Best Poster Award, Software: BioFeatureFinder (BFF): Flexible, unbiased analysis of biological characteristics, X-meeting 2017, 13th International Conference of the AB3C.

2016

Best Poster Award, Drug Design: Development of tool compounds to investigate the cellular function of human protein kinase VRK1, Braz Medicinal Chemistry Society.

2016

Prêmio Paulo Sodero Martins de melhor trabalho na área de Genômica e Bioinformática: Profiling RNA interactions of Caprin-1 in Stress Granules, Sociedade Brasileira de Genética.

2016

Best Poster Award, Genomics: Caprin1 binding profile to target RNAs via enhanced CLIPseq, X-meeting 12th International Conference of the AB3C.

2015

Conference Travel award: RNA society for masters student, RNA Society.

2015

Best Poster Award, Genomics: Defining RNA-related Regulatory events: Implementation of a Platform to integrate high-throughput RNA data, IUBM/SBBQ.

2012

Jovem Geneticista - Honra ao Mérito, GE e Sociedade Brasileira de Genética.

2008

Prêmio Laboratório Destaque em Biosegurança - integrante do Lab de Amy Pasquinelli, UCSD.

2005

Second-best Poster Award: Dosage Compensation of X-chromosome relulated by microRNA, C. elegans International Meeting.

1998

Conference Travel Award: International Society for Interferon and Cytokine Research, Biosintetica Farmaceutica Brasil.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Estadual de Campinas, Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética. , AV Candido Rondon 400, Barão Geraldo - UNICAMP, 13083875 - Campinas, SP - Brasil - Caixa-postal: 6010, Telefone: (019) 35211094, URL da Homepage:

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Experiência profissional

2012 - Atual

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador C, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Chefe do Laboratório de Regulação de RNAs e microRNAs em doenças localizado no CBMEG-Unicamp. Também é uma das coordenadoras do laboratório internacional SGC (The Structural Genomics Consortium), um centro de inovação em química medicinal de ciência aberta. Em 2017 nosso laboratório foi credenciado como Unidade Nacional EMBRAPII de Inovação em fármacos. Carreira Pesquisador Unicamp (PQ). Orientadora pelo programa de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecular - IB -Unicamp. Área atual de pesquisa: Controle de proteinas de ligação a RNA na regulação de splicing alternativo em processo neuronais, biologia estrutural e química medicinal de proteínas quinases que atuam sobre processos splicing em doenças neuronais e outras proteínas de interesse.

2001 - 2003

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista DTI-7D, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Atuação no Laboratório de Biologia Celular e Molecular da Profa. Dra. Mari Cleide Sogayar. Implantação e coordenação do setor de bioinformática no grupo, atuando nas áreas de transcriptoma, anotação de genes e análises de domínios proteicos relacionados com câncer. Colaboradora no Projeto Produção de Fatores Recombinantes de Coagulação Sanguínea: Fator VIII e Von Willebrand.

2000 - 2001

Universidade de São Paulo

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Técnico de nível Superior, Carga horária: 40

Outras informações:
Atuação como técnica de nível superior no Projeto Genoma Humano de Câncer no laboratório do Prof. Dr. Sergio Verjovski-Almeida. Técnica responsável pelo planejamento, preparo de reações de sequenciamento, operação de equipamentos automáticos de sequenciamento capilar e formatação de dados gerados para submissão à banco de dados externo. Atuação como técnica responsável em organizar, estabelecer e manter os procedimentos de biossegurança laboratorial. Desenvolvimento de projeto envolvendo a expressão e purificação de proteínas tóxicas da bactéria Xylella fastidiosa. (Funcionária do Instituto Ludwig de Pesquisa para o Câncer)

Atividades

  • 06/2002 - 06/2002

    Outras atividades técnico-científicas , Instituto de Química, Instituto de Química.,Atividade realizada, Monitora no Curso: Biologia Molec da Transformação Maligna.

  • 07/1998 - 12/1998

    Outras atividades técnico-científicas , Faculdade de Ciências Farmacêuticas, Faculdade de Ciências Farmacêuticas.,Atividade realizada, Programa de Aperfeiçoamento ao Ensino (PAE).