Josmar Rodrigues da Rocha

Licenciado e Bacharel em Química pela Universidade Estadual do Centro Oeste (Unicentro, 2003) e Doutor em Ciências (Físico-Química) pelo Instituto de Química de São Carlos (USP, 2010). Tem experiência na área de planejamento computacional de inibidores enzimáticos empregando-se métodos de Químinformática e Modelagem Molecular; ensaios bioquímicos para determinação de potência e afinidade, bem como a expressão, purificação e cristalização de proteínas de interesse farmacológico. Fez pós-doutorado no Grupo de Química Medicinal do Instituto de Química de São Carlos onde desenvolveu projeto para o planejamento de inibidores seletivos das enzimas de Tripanosomatídeos, DHODH, GAPDH, cruzaína e catepsina B. Desenvolveu também um projeto de pós-doutorado no Departamento de Química Biomédica da Universidade de Tóquio, visando a obtenção da estrutura cristalográfica da enzima DHODH de Trypanosoma cruzi complexada com inibidores. Seu trabalho de pesquisa está focado na integração de métodos computacionais, síntese orgânica, ensaios bioquímicos e cristalografia de raios-X, no processo de descoberta e otimização de inibidores enzimáticos a compostos protótipos para o desenvolvimento de novos fármacos.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Química

2004 - 2010

Instituto de Quimica de Sao Carlos USP
Título: Planejamento de inibidores das enzimas Gliceraldeido-3-fosfato desidrogenase e Diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi
Albérico Borges Ferreira da Silva. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Doença de Chagas; Leishmaniose; Quiminformática.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal / Especialidade: Planejamento de Fármacos. Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal / Especialidade: Quimioinformática. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Química Bacharel e Licenciatura

2000 - 2003

Universidade Estadual do Centro Oeste
Título: Controle de Qualidade de Combustíveis Automotivos
Orientador: Paulo Rogério Pinto Rodrigues
Bolsista do(a): Fundação de Apoio à Universidade Estadual do Centro Oeste, FAU*, Brasil.

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Pós-doutorado

2015 - 2016

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Cristalografia de proteínas.

2013 - 2014

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal / Especialidade: Planejamento de Fármacos. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Cristalografia de proteínas.

2012 - 2013

Pós-Doutorado. , University of Tokyo, UT, Japão. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Cristalografia de proteínas. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Planejamento de Fármacos.

2011 - 2012

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal / Especialidade: Quimioinformática. , Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal / Especialidade: Planejamento de Fármacos.

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Formação complementar

2009 - 2009

Programa de Aperfeiçoamento de Ensino. (Carga horária: 6h). , Instituto de Química de São Carlos Usp, IQSC/USP, Brasil.

2008 - 2008

New Approaches in Drug Discovery. (Carga horária: 24h). , Instituto de Química da USP, IQ - USP, Brasil.

2006 - 2006

3D QSAR in Drug Design. (Carga horária: 3h). , 3th Brazilian Sympousium on Medicinal Chemistry, BRAZMEDCHEM, Brasil.

2006 - 2006

Programa de Aperfeiçoamento de Ensino. (Carga horária: 6h). , Instituto de Química de São Carlos Usp, IQSC/USP, Brasil.

2005 - 2005

Programa de Aperfeiçoamento de Ensino. (Carga horária: 6h). , Instituto de Química de São Carlos Usp, IQSC/USP, Brasil.

2004 - 2004

Programa de Aperfeiçoamento de Ensino. (Carga horária: 6h). , Instituto de Química de São Carlos Usp, IQSC/USP, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal/Especialidade: Planejamento de Fármacos.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Modelagem Molecular.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal/Especialidade: Quimioinformática.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Cristalografia de proteínas.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.

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Participação em eventos

Workshop de Calorimetria de Titulação Isotérmica. 2011. (Encontro).

The 5th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry - BrazMedChem 2010.Novel Insights for Potent Dihydroorotate dehydrogenase class 1A inhibitors discovery. 2010. (Simpósio).

Joint Workshop of the Medicinal Chemistry Divisions Brazilian Chemical Society and American Chemical Society. 2008. (Seminário).

The 4th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry - BrazMedChem 2008.Shape-matching Applied to Selective CB2 Receptor Antagonists Search. 2008. (Simpósio).

30a. Reunião da Sociedade Brasileira de Química. Relação Quantitativa Estrutura-Atividade Biológica de Derivados de Adenosina Inibidores da Enzima GAPDH de Leishmania mexicana. 2007. (Congresso).

6th International Congresss of Pharmaceutical Sciences.Evaluation of a New Molecular Shape-Based Similarity Method in the Identification of Selective 5-HT3 Receptor Antagonists. 2007. (Simpósio).

São Carlos Special Medicinal Chemistry Meeting. 2006. (Encontro).

The 3th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry.Structural Differences and Potential Implications for Human and Trypanosomatidae GAPDH Selectivity Examined by GRID/PCA Method. 2006. (Simpósio).

XIII Simpósio Brasileiro de Química Teórica.Estudo da Relação Estrutura-Atividade de Compostos Cumarínicos e Análogos com Atividade Acaricida. 2004. (Simpósio).

V Semana de Estudos de Química. 2002. (Seminário).

IX Encontro de Química da Região Sul. 2001. (Encontro).

VIII Semana de Iniciação Científica da UNICENTRO.VIII SEMANA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNICENTRO. 2001. (Seminário).

X Encontro de Química da Região Sul. 2001. (Encontro).

XIII Seminário de Pesquisa da UNICENTRO. 2001. (Seminário).

IV Semana de Estudos de Química. 2000. (Seminário).

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Participação em bancas

Aluno: Laise Pellegrini Alencar Chiari

SILVA, A. B. F.; LEITÃO, A.;ROCHA, J. R.. Estudos de relações quantitativas estrutura-atividade de antagonistas do receptor sigma-1. 2016. Dissertação (Mestrado em Química) - Instituto de Química de São Carlos Usp.

Aluno: Renato de Lima Bauab

MONTANARI, C. A.ROCHA, J. R.; SILVA, M.. Sobre os estudos metabólicos de fármacos empregando-se atividade enzimática de CYP450 visando-se estabelecer correlações entre estrutura e atividade. 2011. Dissertação (Mestrado em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos Usp.

Aluno: Danielle Karoline Silva do Vale Castro

CANDURI, F.; LEITÃO, A.;ROCHA, J. R.. Obtençao do domínio quinase da CDK8 humana por técnicas de biologia molecular. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Instituto de Química de São Carlos Usp.

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Comissão julgadora das bancas

Ricardo Celeste

CELESTE, R.; RODRIGUES, P. R. P.. Controle de qualidade de combustíveis automotivos.. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Bacharelado/Licenciatura em Química) - Universidade Estadual do Centro-Oeste - UNICENTRO.

Albérico Borges Ferreira da Silva

da Silva, A. B. F.MONTANARI, Carlos AlbertoGARRATT, Richard CharlesMOLFETTA, F. A.; NONATO, M. C.. Planejamento de inibidores das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi.. 2010. Exame de qualificação (Doutorando em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos.

Albérico Borges Ferreira da Silva

da Silva, A. B. F.; NONATO, M. C.;HAIDUKE, R. L. A.. Planejamento de inibidores das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase diidroorotato desidrogenase do Trypanosoma cruzi.. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Físico Química) - Instituto de Química de São Carlos Usp.

Paulo Rogerio Pinto Rodrigues

RODRIGUES, P. R. P.; CELESTE, Ricardo; CAETANO, Isis K. Controle da Qualidade de Combustiveis automotivos. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química) - Universidade Estadual do Centro-Oeste.

Maria Cristina Nonato

SILVA, A.B.F.;MONTANARI, Carlos AlbertoGARRATT, R. C.; MOLFETTA, F.A.;NONATO, M. C.. Planejamento de inibidores das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi. 2010. Tese (Doutorado em Ciências) - Instituto de Química de São Carlos.

Maria Cristina Nonato

SILVA, A.B.F.;NONATO, M. C.; HAIDUKE, R.L.A.. Planejamento de inibidores das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase diidroorotato desidrogenase do Trypanosoma cruzi. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Físico-Química) - Instituto de Química de São Carlos.

Fábio Alberto de Molfetta

DA SILVA, A. B. F.; MONTANARI, C. A.; GARRAT, R. C.; NONATO, M. C.;MOLFETTA, F. A.. Planejamento de inibidores das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi.. 2010 - Instituto de Química de São Carlos.

Isis Kaminski Caetano

CAETANO, I. K.; RODRIGUES, P. R. P.; CELESTE, R.. Controle de qualidade de combustíveis automotivos. 2003. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Química Bacharelado) - Universidade Estadual do Centro-Oeste.

Antonia Tavares do Amaral

AMARAL, Antonia Tavares-doMontanari, Carlos Alberto; Garratt, Richard; Fabio Alberto de Monfetta; Maria Cristina Nonato; SILVA, A. B. F.. Planejamento de Inibidores das Enzimas Gliceraldeido-3-fosfato desidrogenado e diidroorota desidrogenado de tripanosoma cruzi.. 2010. Tese (Doutorado em Química) - Universidade de São Paulo - São Carlos.

Carlos Alberto Montanari

SILVA, A. B. F.MONTANARI, C. A.; GARRATT, R. C.; Molfetta FA; NONATO, M. C.. Planejamento de inibidores das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi. 2010. Tese (Doutorado em Quimica) - Universidade de São Paulo.

Richard Charles Garratt

SILVA, A B F da; MONTANARI, C A;GARRATT, R CNONATO, M C. Planejamento de inibidores das enzimas gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi. 2010 - Instituto de Química de São Carlos.

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Foi orientado por

Ricardo Celeste

Monitoria da disciplina Química Geral; ; 2003; Orientação de outra natureza; (Bacharelado/Licenciatura em Química) - Universidade Estadual do Centro-Oeste - UNICENTRO; Orientador: Ricardo Celeste;

Paulo Rogerio Pinto Rodrigues

Controle de qualidade de combustíveis automotivos; 2003; 0 f; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Química) - Universidade Estadual do Centro Oeste; Orientador: Paulo Rogério Pinto Rodrigues;

Carlos Alberto Montanari

Planejamento Molecular de Inibidores das enzimas GAPDH e DHODH de Trypanosoma cruzi; 2007; Tese (Doutorado em Química (Físico-Química) - IQSC/USP) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Carlos Alberto Montanari;

Carlos Alberto Montanari

Otimização de Ligantes da Enzima diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi a compostos-matrizes; 2010; Instituto de Quimica de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carlos Alberto Montanari;

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Produções bibliográficas

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  • ROCHA, J. R. ; PAULUK, R.A. ; MONTANARI, C. A. ; DA SILVA, A.B.F. . Shape-matching Applied to Selective CB2 Receptor Antagonists Search. In: The 4th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2008, São Pedro. Livro de Resumos do 4th BRAZMEDCHEM, 2008.

  • PINHEIRO, M. P. ; ROCHA, J. R. ; MONTANARI, C. A. ; AMBRÓSIO, S. R. ; NONATO, M. C. . Search for inhibitors of dihydroorotate dehydrogenase from Trypanosoma cruzi. In: The 4th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2008, São Pedro. Livro de Resumos do 4th BRAZMEDCHEM, 2008.

  • WIGGERS, H. J. ; ROCHA, J. R. ; MONTANARI, C. A. . Quantitative Structure Thermodynamic Relationships for Thermodynamic Signature Profile Optimization. In: The 4th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2008, São Pedro. Livro de Resumos do 4th BRAZMEDCHEM, 2008.

  • ROCHA, J. R. ; FREITAS, R. F. ; MONTANARI, C. A. ; DA SILVA, A.B.F. . Relação Quantitativa Estrutura-Atividade Biológica de Derivados de Adenosina Inibidores da Enzima GAPDH de Leishmania mexicana. In: 30a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2007, Águas de Lindóia. Livro de Resumos 30a Reunião, 2007.

  • ROCHA, J. R. ; FREITAS, R. F. ; MOLFETTA, F. A. ; PROKOPCZYK, I. M. ; MONTANARI, C. A. . Evaluation of a New Molecular Shape-Based Similarity Method in the Identification of Selective 5-HT3 Receptor Antagonists. In: VI Congresso Internacional de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, 2007, Ribeirão Preto. Livro de Resumos do VI CIFARP, 2007.

  • FREITAS, R. F. ; ROCHA, J. R. ; MONTANARI, C. A. . Estudo Quimiométrico de Compostos Fosforilados Análogos ao Substrato da Enzima GAPDH de Trypanosoma cruzi. In: 30a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Química, 2007, Aguas de Lindóia. Livro de Resumos 30a Reunião SBQ, 2007.

  • ROCHA, J. R. ; SILVA, A. B. F. ; MONTANARI, C. A. . Structural Differences and Potential Implications for Human and Trypanosomatidae GAPDH Selectivity Examined by GRID/PCA Method. In: The 3th Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry, 2006, São Pedro - SP. 3th BrazMedChem. São Paulo: BrazMedChem, 2006. v. 3th. p. 14-14.

  • ROCHA, J. R. ; SILVA, A. B. F. ; HONORIO, K. M. . Estudo da Relação Estrutura-Atividade de Compostos Cumarínios e Análogos com Atividade Acaricida. In: XIII Simpósio Brasileiro de Químca Teórica, 2005, São Pedro - SP. Livro de resumos do XIII Simpósio Brasileiro de Químca Teórica. São Paulo: SBQT, 2005. v. XIII. p. 87-87.

  • LIMA, E. F. ; ROCHA, J. R. ; SILVA, A. B. F. . A structure-activity relationship study of cannabinoid compounds with analgesic activity. In: XIII Simpósio Brasileiro de Químca Teórica, 2005, São Pedro. Livro de resumos do XIII Simpósio Brasileiro de Químca Teórica, 2005. v. XIII.

  • ROCHA, J. R. . Seletividade em Processos de Poupação Organosolve em Sistemas Tamponados. In: VIII SEMINÁRIO DE PESQUISA DA UNICENTRO, 2001, GUARAPUAVA. SELETIVIDADE EM PROCESSOS DE POUPAÇÃO. GUARAPUAVA: UNICENTRO, 2001. v. VIII. p. 77-77.

  • ROCHA, J. R. . Planejamento Molecular de Inibidores com Atividades Tripanossomicida e Leishmanicida. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • ROCHA, J. R. ; CHELESKI, J. ; PINHEIRO, M. P. ; WIGGERS, H. J. ; NONATO, M. C. ; Montanari, C.A. . Novel Insights for Potent Dihydroorotate dehydrogenase class 1A inhibitors discovery. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • ROCHA, J. R. . Exploring Hidden Pockets through Induced Fit Docking. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • ROCHA, J. R. . Mini-curso: A Química Medicinal e o Planejamento de Fármacos. 2009. (Apresentação de Trabalho/Outra).

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Outras produções

ROCHA, J. R. . A química medicinal e o planejamento de fármacos. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

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Projetos de pesquisa

  • 2012 - 2013

    Caracterização do modo de interação de ligantes da enzima diidroorotato desidrogenase de Trypanosoma cruzi, Descrição: A proposta deste projeto consistiu da caracterização estrutural e o estudo do modo de interação de inibidores da enzima TcDHODH, como parte integrante de um projeto mais amplo visando a otimização molecular como agentes Tripanocidas. Através deste trabalho foi possível estabelecer um novo protocolo para expressão da enzima TcDHODH, que se mostrou bastante vantajoso em relação ao método utilizado previamente, sendo capaz propiciar a obtenção de proteína com alta atividade específica necessária para o crescimento de cristais de qualidade. Com isso, foi possível a obtenção de duas estruturas de alta resolução da TcDHODH em complexo com os ligantes de interesse. Estes dados serviram para a validação do estudos de modelagem molecular e ensaios bioquímicos, bem como trouxeram informações relevantes sobre o reconhecimento molecular e modo de ação dos inibidores.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Josmar Rodrigues da Rocha - Integrante / Carlos Alberto Montanari - Coordenador / INAOKA, DANIEL KEN - Integrante / KITA, KIYOSHI - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

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Prêmios

2009

Menção Honrosa por Atividade de Destaque no Programa de Aperfeiçoamento de Ensino, Instituto de Química de São Carlos (IQSC) - Universidade de São Paulo (USP).

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Instituto de Química de São Carlos Usp. , Av. Trabalhador São-carlense, 400, Centro, 13560570 - São Carlos, SP - Brasil - Caixa-postal: 780, Telefone: (16) 33738060, Fax: (16) 33739985, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2015 - 2016

    Instituto de Quimica de Sao Carlos USP

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2013 - 2014

    Instituto de Quimica de Sao Carlos USP

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2011 - 2012

    Instituto de Quimica de Sao Carlos USP

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2012 - 2013

    University Of Tokyo

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2002 - 2003

    Universidade Estadual do Centro Oeste

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20

    Outras informações:
    Atuei na função de Técnico no Laboratório de Análises Fisico-Químicas de Combustíveis do Departamento de Química da UNICENTRO.

  • 2001 - 2001

    Universidade Estadual do Centro Oeste

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 12

    Outras informações:
    Monitor da disciplina de Fisica Geral I para os alunos do curso de Química.