Shaker Chuck Farah

Possui graduação em Bioquímica e Química pela University of Toronto (1985), mestrado em Bioquímica também pela University of Toronto (1988) e doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (1994). Atualmente é professor Titular no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. O foco principal da sua pesquisa é entender a base estrutural de processos importantes para a comportamentos bacterianos complexos, utilizando como modelo o fitopatógeno Xanthomonas citri, causador do cancro cítrico. Os sistemas sob estudo incluem: i) Vias de sinalização que envolvem o importante segundo mensageiro bis(3´-5´)diGMP cíclico (c-diGMP) que controla comportamentos complexos em bactéria como produção de fatores patogênicos, pili de tipo IV, motilidade e formação de biofilmes, ii) O funcionamento e regulação do pilus do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para se translocar sobre superfícies sólidas (motilidade "twitching") e para se organizar em biofilmes, iii) O funcionamento do sistema de secreção do tipo IV, usado pelo Xanthomonas para transferir toxinas para outras bactérias, iv) O fenômeno de 'quorum sensing' pelo qual bactérias dentro de uma população coordenam suas atividades em uma maneira dependente de densidade celular. Suas pesquisas técnicas de biologia estrutural (cristalografia, microscopia eletrônica e RMN de proteínas), espectroscopia, microscopia de fluorescência, produção de nocautes gênicos e a análise de redes de interação proteína-proteína.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)

1991 - 1994

Universidade de São Paulo
Título: Funções Estruturais e Regulatórios das Regiões NH2- e COOH-terminal da Troponina I
Orientador: Fernando de Castro Reinach
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Mestrado em Biochemistry

1985 - 1988

University of Toronto
Título: Polypurine/Polypyrimidine DNA Structures: Unusual DNA Conformations Induced by Superhelical Torsion and Low pH,Ano de Obtenção: 1988
Orientador: DAVID E. PULLEYBLANK
Bolsista do(a): University of Toronto, UTORONTO, Canadá. Palavras-chave: Dna; Educacao Em Cienca Politica; Educacao Em Ciencas; Educacao Em Quimica; Reacoes Quimicas de Dna; Supercoiling. Grande área: Ciências Biológicas

Especialização em Education B Ed

1988 - 1989

University of Toronto

Graduação em Biochemsitry and Chemistry

1981 - 1985

University of Toronto
Bolsista do(a): University of Toronto, UTORONTO, Canadá.

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Pós-doutorado

2002

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: , Ano de obtenção: 2002.

1994 - 1996

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas/Especialidade: Proteínas.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

    Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Físico-Química/Especialidade: Espectroscopia.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Enzimologia.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica.

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Organização de eventos

Farah, C.S. ; SILVA, A. M. ; FERREIRA, H. ; J.C. Setubal ; SCHEFFERS, D.J. . XanthoMeeting 2018. 2018. (Congresso).

SILVA, A. M. ; FERREIRA, H. ; J.C. Setubal ; Farah, Chuck S. . Xantho Meeting 2015. 2015. (Congresso).

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Participação em eventos

2nd Annual Instruct-ULTRA Meeting.Structural Biology in Brazil and Prospects for collaboration with the European Community via INSTRUCT. 2018. (Simpósio).

50 Anos do Programa de Pós-graduação em Bioquímica e Imunologia da UFMG.Guerras Bacterianas: A transferência de toxinas pelo sistema de Secreção de Tipo IV. 2018. (Seminário).

6th Xanthomonas Genomics Conference. Bacterial Wars: Functional and Structural Studies on a Bacteria-Killing Type IV Secretion System. 2018. (Congresso).

Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Biofísica. Functional and Structural Studies on the Xanthomonadaceae Type IV Secretion System: a Bacteria-Killing Machine. 2018. (Congresso).

XanthoMeeting 2018.The Xanthomonas Type IV Secretion System. 2018. (Simpósio).

XLVII SBBq. Bacterial Wars: Functional and Structural Studies on a Bacteria-Killing Type IV Secretion System. 2018. (Congresso).

29o Congresso Brasileiro de Microbiologia.The interactions of Xanthomonas bacteria with their environment via Type 4 pili and the Type 4 secretion system. 2017. (Simpósio).

I Workshop in Microbial Molecular Biology. The Xanthomonadaceae Type IV secretion system is a bacterial killing machine. 2017. (Congresso).

XLVI Reunião de SBBq. Regulators of bacterial Type IV Pilus Biogenesis: Crystal Structure of the PilZ-PilBNt Complex and its interactions with FimX. 2017. (Congresso).

Integrative Methods in Structural Biology to enhance high impact research in health and disease.X ray, NMR and EM Studies of the Xanthomonas Type IV Secretion System. 2016. (Simpósio).

The 7th Brazil School for Single Particle Cryo-EM.Bacterial Warfare: The Type IV Secretion System Killing Machine from Xanthomonas. 2016. (Oficina).

The Protein Society 30th Anniversary Symposium. Bacterial Warfare: A New Role for Type IV Secretion Systems. 2016. (Congresso).

Type IV Secretion in Gram Negative and Gram Positive Bacteria. Bacterial Wars ? A new role for Type IV Secretion Systems. 2016. (Congresso).

V Latin American Protein Society Meeting (LAPSM). The Xanthomonadaceae Type IV Secretion System is a bacterial killing machine. 2016. (Congresso).

23rd IUBMB Congress and 44th Annual SBBq Meeting. Bacterial Wars: Toxin delivery by the Xanthomonas  Type IV Secretion System. 2015. (Congresso).

28o Congresso Brasileiro de Microbiologia. Bacterial Warfare: A new role for the   Type IV Secretion System. 2015. (Congresso).

NCMI Cryo-EM Workshop and 30th Anniversary Symposium. 2015. (Oficina).

XanthoMeeting 2015.Studies on the Type IV pilus of Xanthomonas citri. 2015. (Simpósio).

XXXVIII Reunion Anual Sociedad de Bioquimica y Biologia Molecular de Chile. Bacterial Warfare: A new role for the Type IV Secretion System. 2015. (Congresso).

1st Symposium on Current Topics in Molecular Biophysics.Structural studies of the Xanthomonas Type IV secretion system. 2014. (Simpósio).

Canada-Brazil Molecular Sciences Workshop.Structural studies of the Xanthomonas Type IV secretion system. 2014. (Seminário).

III Congresso Brasileiro de Recursos Geneticos.De Genoma para Função: métodos de clonagem e expressão de proteínas heterólogas para explorar a fisiologia e comportamento bacteriano.. 2014. (Simpósio).

International Year of Crystallography at UFMG.Cristalografia Biológica de Perutz a Kobilka. 2014. (Seminário).

UEA/NRP- BRAZIL WORKSHOP on PLANT SCIENCES.Using Xanthomonas citri as a model to study structure-function relationships in important bacterial processes. 2014. (Seminário).

Reunião Anual da Associação Brasileira de Cristalografia.Structural studies of the Xanthomonas Type IV secretion system. 2013. (Simpósio).

2012 International Conference on Cyclic di-GMP and Xanthomonads. Cyclic diGMP signalling and type IV pilus biogenesis: The PilZ-FimXEAL-cdiGMP complex. 2012. (Congresso).

III Latin American Protein Society Meeting.Structural Studies of the Xanthomonas citri Type IV Secretion System. 2010. (Simpósio).

18th INPEC Meeting.Ubiquitous cyclic diGMP signalling domains: Interactions between active and degenerate modules. 2009. (Simpósio).

X-Meeting 2008.Delimiting the problem of the relationship between Structure and Function. 2008. (Seminário).

800 MHz NMR facility Inauguration Symposium. The Results of a Structural Biology Project Initiated by a Rapid NMR Structural Screen of Conserved Hypothetical Proteins.. 2007. (Congresso).

Palestra apresentada dentro dos ?Seminários do Centro de Biologia Molecular Estrutural? no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron.Quorum Sensing em Xanthomonas. 2007. (Outra).

XVII Reunião Anual de Usuários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron.Nossa Experiência como Usuário da Linha MX1 do LNLS. 2007. (Encontro).

XXXVI Reunião Anual de SBBq e 10th IUBMB Conference. Protein-Protein Interaction Network of the Quorum Sensing Response in Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2007. (Congresso).

Palestra apresentada para o Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia, Escola Paulista de Medicina, Universidade Federal de São Paulo..Mecanismos Moleculares Importantes para Patogenicidade de Xanthomonas citri: Sistemas de secreção e. 2006. (Outra).

XVI Reunião Anual de Utilitários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron.Membro do Comitê Científico e Coordenador de Mesa Redonda sobre o Laboratório de Espectrometria de Massa e a Linha VUVF do LNLS.. 2006. (Encontro).

Federação das Sociedades de Biologia Experimental (XX FESBE). The Crystal Structures of two proteins from Xanthomonas axonopodis pv. citri: YaeQ (XAC2396) and SufE (XAC2355).. 2005. (Congresso).

Palestra apresentada na 8ª Semana Temática da Biologia, Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo.Interação Gene-Proteína Funcional. 2005. (Outra).

Sociedade Brasileira de Genética. Genoma funcional de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2005. (Congresso).

XXXIV Reunião Anual de SBBq. The Crystal Structure of YaeQ from Xanthomonas axonopodis pv. citri.. 2005. (Congresso).

1st Latin American Protein Society Meeting. Protein ? Protein Interactions Involving Components of the Type III and type IV Secretion and the Quorum Sensing Systems of Xanthomonas axonopodis pv. citri.. 2004. (Congresso).

Federação das Sociedades de Biologia Experimental (XIX FESBE). Using 5-hydroxytryptophan as a probe to follow protein protein interactions and protein folding transitions. 2004. (Congresso).

Oficina de Ressonância Magnética Nuclear em Biologia - evento paralelo à XIV Reunião Anual de Utilitários do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron.NMR 3D Structure Determination Of ApaG/CorD Protein of the Phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2004. (Encontro).

VII Congresso do Departamento de Bioquímica, Inst. de Química - USP. Identificação de Novas Interações Proteína-Proteína Envolvidas na Patogeniciade de Xanthomonas axonopodis pv citri.. 2004. (Congresso).

V IberoAmerican Congress of Biophysics. Thin-filament based regulation of the actomyosin interaction.. 2003. (Congresso).

VI Congresso do Departamento de Bioquímica, Inst. de Química - USP. Proteínas ?Conservadas Hipotéticas? Identificadas em Projetos Genomas: Triagem de Candidatos para Estudos Estruturais. 2003. (Congresso).

XXXII Reunião Anual de SBBq. Identification and Structure-Function Analysis of Protein-Protein Interactions in the plant pathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2003. (Congresso).

Palestra apresentada na Faculdade de Medicina de Riberão Preto da Universidade de São Paulo, Riberão Preto, SP.Estudos Estrutura-Função sobre Tropomiosina e seu Papel na Regulação da Contração Muscular. 2002. (Outra).

Palestra apresentada no Departamento de Bioquímica Médica - ICB, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, R.J..Evidência direita para rolamento (?rolling?) da tropomiosina em resposta ao Ca2+ no filamento fino regulado: Retorno à hipótese das bandas alfa/beta. 2002. (Outra).

XXIX Reunião Anual de SBBq. Coordenador da Mesa Redonda sobre ?Biologia Estrutural?. 2000. (Congresso).

Palestra apresentada ao Departamento de Bioquímica Médica - ICB, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, R.J..Regulação de Contração Muscular pela Troponina-Tropomiosina. 1998. (Outra).

XXIX Reunião Anual de SBBq. Studies on the Regulation of Muscle Contraction by Troponin-Tropomyosin. 1996. (Congresso).

Palestra apresentada no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química, USP, São Paulo.Mutantes de Troponina I. 1993. (Outra).

Palestra apresentada no Department of Biochemistry, Medical Research Council Group on Protein Structure and Function, University of Alberta.Deletion Mutants of Troponin I. 1992. (Outra).

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Orientou

Thiago Rodrigo dos Santos

Substratos do sistema de secreção do tipo IV de Xanthomonas citri; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Santiago Justo Arévalo

Engenharia estrutural do sítio ativo de diguanilato ciclases (domínios GGDEF) para a produção de novos segundos mensageiros; Início: 2015; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Edgar Llontop

Início: 2019; Instituto de Química, USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Gabriel Umaji Oka

Início: 2018; Instituto de Química, USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Bruno Yasui Matsuyama

Início: 2016; Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Sofia Quarello dos Ramos

Os R-bodies de Xanthomonas; Início: 2018; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Instituto de Química, USP; (Orientador);

Natalia Bueno

As toxinas X-TfeXAC0574 (fosfolipase) e X-TfeXAC1918 (PG-glicohidrolase) e suas proteínas de imunidade cognatas X-TfiXAC1917 e X-TfiXAC0573 de Xanthomonas citri; 2015; Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Maxuel de Oliveira Andrade

Caracterização bioquímica de interações proteína-proteína relacionadas com o mecanismo de quorum sensing do Xanthomonas axonopodis pv citri; 2006; Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Sandro Fernandes Ataide

Modificações no sítio ativo da triptofanil tRNA(Trp) sintetase de E; coli; 2001; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Edgar Llontop

Sinalização por c-di-GMP e pilus do tipo IV em Xanthomonas citri; ; 2019; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Gabriel Umaji Oka

Estudos sobre o sistema de secreção do tipo IV de Xanthomonas citri; 2017; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química,; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Maycon Campos Oliveira

Caracterização bioquímica e estrutural de diguanilato ciclases de Xanthomonas citri subsp; citri; 2015; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Raphael Dias Texeira

Estudo de proteínas GGDEF-EAL em vias de sinalização de c-di-GMP em Xanthomonas citri subsp; citri; 2015; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Maxuel Oliveira Andrade

Estudo da sinalização celular envolvendo a via do quorum-sensing e os segundos mensageiros c-diGMP e (p)ppGpp no fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri; ; 2011; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Maria Cláudia Pereda Rosa

Caracterização dos fatores sigma da RNA polimerase do fitopatógenos Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2010; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Diorge Paulo de Souza

Estudos Estruturais e de Interações Proteína-Proteína Envolvendo Componentes de um Sistema de Secreção do Tipo IV de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2010; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Paola Alejandra Cappelletti

Identificação e Análise Funcional de Interações Proteína-Proteína do Sistema de Secreção do Tipo III do Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2010; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Cristiane Rodrigues Guzzo

Estudo Estrutural e Funcional das Proteínas PilZ e YaeQ do Fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri; 2010; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Fernando Corrêa

Estudos Estrutura -Função do Complexo Cabeça-Cauda da Tropomiosina Muscular; 2008; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Leonor Magalhães Peres Galvão de Botton

Estudos Estruturais de Proteínas de Xanthomonas axonopodis pv citri por Ressonância Magnética Nuclear; 2007; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química, Fund; p; Ciência e Tec; do Min; de C, T e Ensino Superior; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Maxuel de Oliveira Andrade

Sinalização celular envolvendo os sistema de dois componentes RpfCG e a formação de c-di-GMP em Xanthomonas axonopodis pv citri; 2006; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Cassia Docena

Identificação das interações envolvendo proteínas relacionadas aos sistemas de dois-componentes e aos sistemas secretórios do tipo III e IV do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri; 2006; Tese (Doutorado em Bioquímica) - Instituto de Química da Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Eric Kors Vidsiunas

Mapeamento da Interface entre Actina e Tropomiosina; 2004; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Marcos Castanheira Alegria

Identificação e Interações Proteína-Proteína Envolvendo os Produtos dos Loci hrp, vir e hrp de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2004; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Adriana Aparecida Paulucci

Fragmentos de Tropomiosina - Estudos de estabilidade conformacional e da interação cabeça-cauda; 2003; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Luis Marcelo Fernandes Holthauzen

"Estudos de Estabilidade Conformaçional da Tropomiosina e de suas Interações com as Outras Proteinas do Filamento Fino; 2003; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Aurea Denise Sousa

Tropomiosinas contendo 5-hidroxiitriptofano: Sondas especificas para interações no filamento fino; 2002; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

William Cenens

2019; Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

German Sgro

2019; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

Diorge Paulo Souza

2017; Instituto de Química, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Shaker Chuck Farah;

Ethel Bayer Santos

2017; Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

Raphael Dias Teixeira

2016; Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

Cristina Elisa Alvarez Martinez

Caracterização dos Sistemas de Secreção do Tipo IV de Xanthomonas axonopodis pv citri; 2013; Instituto de Química, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Shaker Chuck Farah;

Pricila Hauk Teodoro

Caracterizações estruturais de proteínas reguladoras de níveis de c-diGMP em Xanthomonas e de antígenos da superfície de Leptospira interrogans; 2012; Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

German Dunger

2011; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

Cristiane Rodrigues Guzzo

Estrutura e Função do Complexo FimX-PilZ-PilZ do pilus tipo IV bacteriana; 2010; Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

Roberto Kopke Salinas

2008; Instituto de Química, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Shaker Chuck Farah;

Miryam Marroquin Quelopana

2006; Instituto de Química,; Shaker Chuck Farah;

Lucicleide Ribeiro

2003; Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Shaker Chuck Farah;

Lise Hobeika

Caracterização da proteína Xac2610 da Xanthomonas citri; 2011; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Química) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Ewa Ksiezopolska

Caracterização do Sistema de Secreçaõ do Tipo IV do Xanthomonas citri; 2011; Monografia; (Aperfeiçoamento/Especialização em Química) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Giancarlo Di Sessa

Substratos do sistema de secreção do tipo IV de Stenotrophomonas maltophilia; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Tiago Lubiana Alves

T4SS-dependent toxin/antitoxin mediated competition in Xanthomonas; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Tania Geraldine Churasacari Vinces

Papel funcional e estrutural dos domínios EAL e YkuI_C de LIC11921 na sinalização c-di-GMP do patógeno Leptospira interrogans serovar Copenhageni; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Química - ênfase em Bioquímica) - Instituto de Química, PIBIC-Pro-Reitoria de Pesquisa da USP; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Izabel Del Valle Mininel

Caracterização funcional e identificação de toxinas secretadas através do sistema de secreção do tipo IV de Stenotrophomonas maltophilia; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Química - ênfase em Bioquímica) - Instituto de Química; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Santiago Justo Arévalo

Structural study of the active site of the GGDEF domains and their possible production of new second messengers; ; 2015; Iniciação Científica - Instituto de Química; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Manchalu Srinivas

Biogênese do pilus tipo IV em bactérias; 2014; Iniciação Científica - Instituto de Química; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Clarissa Ribeiro Reily Rocha

Estudos estruturais e bioquímicos de XAC3230, um possível fator de virulência da família NAD:arginina ADP ribosiltransferase do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri; 2009; Iniciação Científica - Instituto de Química, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Lucas Yanaguissawa

Estudos Estrutura-Função da PilZ de Xanthomonas citri; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia-Bioquímica) - Instituto de Ciencias Farmaceuticas - Universidade de São paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Rafael Freitas dos Santos

Estudos Estrutura-Função da HrpB2 de Xanthomonas citri; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia-Bioquímica) - Instituto de Ciencias Farmaceuticas - Universidade de São paulo, PIBIC-Pro-Reitoria de Pesquisa da USP; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Erika Benedetti Rossi

Expressão e purificação de proteínas de Xanthomonas e Leptospira; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade de São Paulo, PIBIC-Pro-Reitoria de Pesquisa da USP; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Amanda Franco

Estudos do Funcionamento do Sistema de Secreção do Tipo IV de Xanthomonas citri; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia-Bioquímica) - Instituto de Ciencias Farmaceuticas - Universidade de São paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Giuliana Giuzio

Purificação e Cristalização de Proteínas de Xanthomonas; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Cristiane Rodrigues Guzzo

Biologia estrutural de proteínas de Xanthomonas axonopodis pv citri com possíveis papeis em patogenicidade e sem homologia com estruturas protéicas conhecidas; 2004; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Taís dos Santos Souza

Expressão e cristalização de proteínas dos dos sistemas de secreção de tipo IIII e de tipo IV do Xanthomonas axonopodis pv citri; 2003; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Pámela Jacqueline Zucker

Purificação e cristalização de tryptophanyl-tRNA sintetase de Xanthomonas axonopodis pv citri e desenho de mutantes para modificar sua especificidade; 2003; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Maria Cláudia Pereda Rosa

Analíse de interações proteína ? proteína envolvendo fatores sigma de RNA polimerase do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2003; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Ângela Mika Katsuyama

Estudos de interação cabeça-cauda da tropomiosina utilizando mutantes não-polimerizáveis e fluorescentes; 2003; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina Veterinária) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Aline de Jesus Barbosa

Regulação de contração muscular por troponina-tropomiosina; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Fernando Tadeu Bueno Martin

Regulação de contração muscular; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Flávio Almeida Curvelo dos Anjos

Expressão e purificação de cofilina recombinante em bactérias; 2000; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Fernando Itri

Produção de cofilina recombinante em bactérias; 2000; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Eduardo Dutra Pastor

Produção de mutantes de tropomiosina de músculo esquelético; 2000; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Bruno Brito Ctenas

Produçào de mutantes da tropomiosina; 1998; Iniciação Científica; (Graduando em Medicina) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Renato Golin

Produção de miosina recombinante; 1998; Iniciação Científica; (Graduando em Biologia) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Alessandra Scarlota

Expressão de miosina muscular em Dictyostelium discoidium; 1998; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

Victor Zilberstajn

Produção de mutantes da tropomiosina de músculo esquelético; 1997; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo; Orientador: Shaker Chuck Farah;

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Produções bibliográficas

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  • FARAH, S. C. . Protein ? Protein Interactions Involving Components of the Type III and type IV Secretion and the Quorum Sensing Systems of Xanthomonas axonopodis pv citri.. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. . NMR 3D Structure Determination Of ApaG/CorD Protein of the Phytopathogen Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. . Using 5-hydroxytryptophan as a probe to follow protein protein interactions and protein folding transitions.. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. . Identification and Structure-Function Analysis of Protein-Protein Interactions in the plant pathogen Xanthomonas axonopodis pv citri. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. . Evidência direita para rolamento (?rolling?) da tropomiosina em resposta ao Ca2+ no filamento fino regulado: Retorno à hipótese das bandas alfa/beta. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. . Estudos Estrutura-Função sobre Tropomiosina e seu Papel na Regulação da Contração Muscular. 2002. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. . Biologia Estrutural. 2002. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • FARAH, S. C. . Regulação de Contração Muscular pela Troponina-Tropomiosina. 1998. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. ; REINACH, F. C. . Studies on the Regulation of Muscle Contraction by Troponin-Tropomyosin. 1996. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. ; REINACH, F. C. . Mutantes de Troponina I. 1993. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FARAH, S. C. ; REINACH, F. C. . Deletion Mutants of Troponin I. 1992. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

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Outras produções

SILVA, A. C. R. ; FARAH, S. C. ; QUAGGIO, R. B. ; REINACH, F. C. ; FERRO, J. A. ; J.C.F. Oliveira ; M.L. Laia ; J.C. Setubal ; L.R. Furlan . Xanthomonas Genes Associated with Plant Pathogenicity?. 2003.

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Projetos de pesquisa

  • 2002 - Atual

    A Biologia de Xanthomonas citri, Descrição: O foco principal do nosso laboratório é entender a base estrutural de processos importantes para a patogenicidade bacteriana. Usamos como modelo o fitopatógeno Xanthomonas citri, causador do cancro cítrico. Os sistemas sob estudo incluem: - Vias de sinalização que envolvem o importante segundo mensageiro bis(3´-5´)diGMP cíclico (c-diGMP) que controla comportamentos complexos em bactéria como produção de fatores patogênicos, pili de tipo IV, motilidade e formação de biofilmes. - O fenômeno de ?quorum sensing? pelo qual bactérias dentro de uma população coordenam suas atividades em uma maneira dependente de densidade celular. - O funcionamento do sistema de secreção do tipo III e do tipo IV, necessários para a transferência de fatores de virulência para a célula hospedeira. Nossos trabalhos combinam técnicas de Biologia Estrutural (cristalografia, cryo-EM e RMN de proteínas), espectroscopia, produção de nocautes gênicos e a análise de redes de interação proteína-proteína.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Shaker Chuck Farah - Coordenador.

  • 1996 - 2006

    Mecanismo molecular de regulação da contração muscular, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Shaker Chuck Farah - Coordenador.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Instituto de Química, Departamento de Bioquímica. , AV. PROF. LINEU PRESTES 748, BLOCO 0, SALA 5, CID. UNIVERSITARIA, 05508000 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30913312, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2008 - Atual

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2003 - 2008

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    professor Associado a partir 21/01/2003 regime RDIDP

  • 1996 - 2003

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Efetivou-se no cargo de Prof. Doutor a partir de 18/12/2003 regime RDIDP

    Atividades

    • 01/2004

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Informática do IQ-USP.

    • 01/2003

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Central Analítica do Instituto de Química, USP.

    • 01/2002

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Pós-Graduação no Programa Interdisciplinar em Bioinformática da USP.

    • 01/1997

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro titular do Conselho do Departamento de Bioquímica, IQ-USP.

    • 08/1990

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Química, Departamento de Bioquímica.,Linhas de pesquisa

    • 01/2002 - 08/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Pós Graduação do IQ-USP.

    • 08/2005 - 12/2005

      Ensino, Biologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-219 Proteínas e Metabolismo para Biologia Noturno

    • 06/2005 - 07/2005

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-5737 A Gênese da descoberta

    • 02/2005 - 06/2005

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-5732 Bioquímica Avançada II: Mecanismos de reação e biocatálise

    • 01/2002

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Bolsas de Pós-Graduação do Departamento de Bioquímica.

    • 01/2000

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Escalação Didática de Graduação do Departamento de Bioquímica, IQ-USP.

    • 01/1998

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Banca Examinadora para Exame de Capacidade na Área de Bioquímica (Pós-graduação), IQ-USP.

    • 08/2004 - 12/2004

      Ensino, Farmácia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-215 Proteínas e Metabolismo para Farmácia Diurno

    • 06/2004 - 12/2004

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-5737 A Gênese da descoberta

    • 02/2004 - 06/2004

      Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-2454 Proteínas e Metabolismo para Química Diurno

    • 02/2004 - 06/2004

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, IBI-5021 Fundamentos Básicos em Bioquímica e Biologia Molecular I

    • 01/1996

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Presidente da Comissão Interna da Biossegurança do Instituto de Química - USP.

    • 08/2003 - 12/2003

      Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-2456 Biologia Molecular para Química

    • 08/2003 - 12/2003

      Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-2457 Tecnologia de DNA Recombinante para Química

    • 02/2003 - 06/2003

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-5732 Bioquímica Avançada II

    • 02/2003 - 06/2003

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, IBI-5021 Fundamentos Básicos em Bioquímica e Biologia Molecular I

    • 08/2002 - 12/2002

      Ensino, Farmácia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-215 Proteínas e Metabolismo para Farmácia Noturno

    • 08/2001 - 12/2001

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-5731 Bioquímica Avançada I

    • 02/2001 - 06/2001

      Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-211 Proteínas e Metabolismo para Medicina Diurno

    • 08/2000 - 12/2000

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-5730 Proteínas: Estrutura, Estabilidade e Interações

    • 02/2000 - 06/2000

      Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-211 Proteínas e Metabolismo para Medicina Diurno

    • 02/1999 - 06/1999

      Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-211 Proteínas e Metabolismo para Medicina Diurno

    • 02/1999 - 06/1999

      Ensino, Fisioterapia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-202 Proteínas e Metabolismo para Fisioterapia

    • 08/1998 - 12/1998

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-5730 Proteínas: Estrutura, Estabilidade e Interações

    • 02/1998 - 06/1998

      Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-212 Biologia Molecular para Medicina Diurno

    • 02/1996 - 06/1998

      Ensino, Ciências Biológicas (Bioquímica), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Proteínas: Conformações, Estabilidade, e Interações

    • 08/1997 - 12/1997

      Ensino, Biologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-219 Proteínas e Metabolismo para Biologia Noturno

    • 08/1996 - 12/1996

      Ensino, Farmácia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-215 Proteínas e Metabolismo para Farmácia Noturno

    • 08/1996 - 12/1996

      Ensino, Biologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, QBQ-219 Proteínas e Metabolismo para Biologia Noturno

    • 06/1990 - 08/1990

      Extensão universitária .,Atividade de extensão realizada, PROFESSOR DE QUIMICA EM NIVEL SUPERIOR.

    • 09/1989 - 06/1990

      Extensão universitária .,Atividade de extensão realizada, PROFESSOR DE QUIMICA NO NIVEL SUPERIOR.