Manuela Leal da Silva

Possui graduação em Química Industrial pela Universidade Federal de Santa Maria (2004), Mestrado em Química - Química Medicinal pelo Instituto Militar de Engenharia (2007) e Doutorado em Ciências Biológicas - Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2011). Tem experiência nas áreas de Biologia e Química Computacional, Genômica Estrutural, Bioinformática, Modelagem Molecular, Bioquímica e Química Medicinal. Realizou estágio de pós-doutoramento na École Normale Supérièure de Cachan junto ao Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée (LBPA) (França) e estágios de pós-doutoramento junto ao Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ e ao Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia. Atuou como pesquisadora do Inmetro, desenvolvendo aplicativos de bioinformática para análise e anotação de proteínas em larga escala e utilizando métodos de Bioinformática e Modelagem Molecular em pesquisas nas áreas de Química Medicinal e Biotecnologia. Atuou como Professora Visitante do Programa de Pós-Graduação em Modelagem Computacional da Universidade Federal de Juiz de Fora. Atualmente é Professora Adjunta do Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade (NUPEM/UFRJ) da Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ, Docente Permanente do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia do Inmetro (PPGBiotec), Docente do Programa Multicêntrico de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas da UFRJ (PMPGCF) e Docente do Programa de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz (PGBCS/IOC/Fiocruz).

Informações coletadas do Lattes em 23/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biofísica

2007 - 2011

Pós-graduação Latino Americana de Biofísica
Título: Modelagem molecular de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: Análise em larga escala e de proteínas potencialmente envolvidas na associação planta-bactéria
Paulo Mascarello Bisch.

Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)

2007 - 2011

Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Modelagem molecular de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: Análise em larga escala e de proteínas potencialmente envolvidas na associação planta-bactéria
Paulo Mascarello Bisch. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Mestrado em Química

2005 - 2007

Instituto Militar de Engenharia
Título: Planejamento de Inibidores Seletivos da Serina Hidroximetiltransferase de Plasmodium falciparum por Modelagem Molecular,Ano de Obtenção: 2007
Jose Daniel Figueroa Villar.Coorientador: Tanos Celmar Costa França. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Graduação em Química Industrial

2001 - 2004

Universidade Federal de Santa Maria

Curso técnico/profissionalizante em Técnico Agrícola - Habilitação em Agropecuária

1996 - 1998

Colégio Agricola de Santa Maria

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Pós-doutorado

2015 - 2017

Pós-Doutorado. , Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, INMETRO, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia.

2012 - 2012

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Físico-Química / Especialidade: Modelagem Molecular. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas.

2011 - 2012

Pós-Doutorado. , École Normale Supérieure de Cachan, ENS/Cachan, França. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

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Formação complementar

2020 - 2020

Extensão universitária em Ensino Remoto Emergencial: Formação para Professores do Ensino Superior. (Carga horária: 5h). , Universidade Federal de São Paulo, UNIFESP, Brasil.

2016 - 2016

Orientação sobre a ABNT ISO NBR 17025:2005. (Carga horária: 16h). , Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, INMETRO, Brasil.

2014 - 2014

F Bioinfo Ap às Análises de Seq Transcriptômicas. (Carga horária: 80h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2013 - 2013

Advanced School in Functional Genomics. (Carga horária: 90h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2010 - 2010

Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. (Carga horária: 40h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2010 - 2010

Escola de Nanoestrutura em Interfaces Biológicas. (Carga horária: 60h). , Centro Brasileiro-Argentino de Nanotecnologia, CBAN, Brasil.

2009 - 2009

Latin American Pos Program of Biophysics Course. (Carga horária: 50h). , Latin American Posgraduate Program of Biophysics, POSLATAM, Brasil.

2008 - 2008

Efeito Solvente a Metodologia AGOA. , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Predição de Est de Proteinas via Mod. Comparativa. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Predição de Est.de Proteínas pPrimeiros Princípios. (Carga horária: 4h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Método LIE para cálculo de Energia Livre. , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Método Monte Carlo para Simulação de Líquidos. (Carga horária: 4h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2008 - 2008

Genômica Comparativa. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.

2008 - 2008

A próxima geração em soluções para Bioinformática. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.

2008 - 2008

Avanços em Eng. de Proteínas e Síntese de Peptídeo. (Carga horária: 70h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

2006 - 2008

Dinâmica Molecular. (Carga horária: 16h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2008

Cálculos Quânticos semi-empíricos. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2008

MM prop Eletrostáticas de Proteínas e Complexos. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2008

Cálculos Quânticos ab initio. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Princípios de Estereoquímica de Fármacos. (Carga horária: 9h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2006 - 2006

Introdução à Química Farmacêutica Medicinal (IQFM). (Carga horária: 15h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2006 - 2006

Modelagem Comparativa. (Carga horária: 8h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

Simulando Líquidos utilizando Monte Carlo. (Carga horária: 4h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2006 - 2006

3D QSAR Strategies in Drug Design. (Carga horária: 3h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2006 - 2006

Temas avançados de Bioquimica e Biologia Molecular. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2003 - 2003

Estrutura e Funcionamento do Ens. de 1º e 2º Graus. (Carga horária: 40h). , Instituto Padre Reus, IPR, Brasil.

2003 - 2003

Didática Geral. (Carga horária: 40h). , Instituto Padre Reus, IPR, Brasil.

2003 - 2003

Português. (Carga horária: 40h). , Instituto Padre Reus, IPR, Brasil.

2002 - 2003

Extensão universitária em Laboratório de Apoio a Clinicas de Hemodiálise. , Universidade Federal de Santa Maria, UFSM, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: BIOINFORMÁTICA.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Modelagem Molecular.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Química / Subárea: Química Medicinal.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia.

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Organização de eventos

da Silva, Manuela Leal ; PASTOR JUNIOR, A. A. ; BARROS, C. M. . Evento comemorativo dos 25 anos do NUPEM. 2019. (Outro).

da Silva, Manuela Leal ; LEITE, P. E. C. ; BARRIAS, E. ; CARVALHO, R. ; LIMA, R. S. ; SBANO, A. . I Jornada Integrada das Pós-graduações do Inmetro & II Jornada de Iniciação Científica e Tecnológica em Metrologia, Qualidade e Tecnologia do Inmetro. 2019. (Congresso).

DA SILVA, MANUELA L. ; PASCUTTI, P. G. ; GOMES, D. E. B. ; LIMA, R. S. ; CHEOHEN, C. F. A. R. . I Workshop em Biologia Computacional. 2019. (Congresso).

da Silva, Manuela Leal ; LEITE, P. E. C. . 1ª. Jornada de Iniciação Científica e Tecnológica em Metrologia, Qualidade e Tecnologia do Inmetro. 2018. (Congresso).

da Silva, Manuela Leal ; GOMES, D. E. B. ; SANTOS, E. O. ; GRIECO, M. A. . Introdução a Metagenômica. 2013. (Outro).

BISCH, P. M. ; WEISSMULLER, G. ; DA SILVA, M. L. ; ROCHA, G. M. . Escola de Nanoestrutura em Interfaces Biológicas: métodos e aplicações. 2010. (Congresso).

LOPES, F. J. P. ; DA SILVA, M. L. ; WEISSMULLER, G. ; PINTO, N. M. A. C. ; PASSOS, M. D. M. ; LERY, L. M. S. . Simposio Comemorativo dos 15 anos do Laboratorio de Fisica Biologica. 2009. (Outro).

DA SILVA, M. L. ; DEPOI, F. S. . 5º Semana Acadêmica Integrada do CCNE ? Curso de Química Industrial e Química Licenciatura. 2004. (Congresso).

DA SILVA, M. L. ; DEPOI, F. S. . 1st Internacional Symposium on Residue Management in Universities. 2002. (Congresso).

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Participação em eventos

Educação no Mundo 4.0. 2020. (Seminário).

I Workshop de Atualização em Modelagem Computacional da Fiocruz Ceará. Docking reverso e a busca pelo alvo macromolecular. 2019. (Congresso).

8ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. Predição de Estruturas de Proteínas: Modelagem Comparativa. 2016. (Congresso).

8ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. Predição Funcional Utilizando Informações Estruturais de Proteínas. 2016. (Congresso).

8ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. Avaliador de pôster. 2016. (Congresso).

Programa de Pós-graduação em Bioinformática.A Biologia Computacional no Inmetro: Biocombustíveis, Química Medicinal e Desenvolvimento de Softwares. 2016. (Seminário).

X-Meeting 2016 - 12th international Conference of the AB3C. Avaliador de pôster. 2016. (Congresso).

X-Meeting 2016 - 12th International Conference of the Brazilian Association of Bioinformatics and Computational Biology. Novel Computational Methods For Protein Characterization. 2016. (Congresso).

2 Curso de Verão da Pós-Graduação do Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho.Modelagem de Estruturas 3D por Bioinformática. 2015. (Outra).

III Workshop Internacional de Bioinformática em Biologia/Epidemiologia Molecular e Evolução Viral. Fundamentos de Modelagem Comparativa. 2015. (Congresso).

III Workshop Internacional de Bioinformática em Biologia/Epidemiologia Molecular e Evolução Viral. Avaliador de pôster. 2015. (Congresso).

Programa Aristides Pacheco Leão de Iniciação Científica.Bioinformática básica. 2015. (Outra).

XL Annual Meeting of the Sociedade Brasileira de Biofísica (SBBf). Automatic Structural Annotation of Proteins in Large Scale Projects.. 2015. (Congresso).

Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo - ERAD-SP 2014.Aplicações de HPC em Bioinformática e Modelagem Molecular. 2014. (Encontro).

Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo - ERAD-SP 2014.Avaliador das Apresentações Orais - Iniciação Científica. 2014. (Encontro).

V Encontro do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Biologia Estrutural e Bioimagem (INBEB)EB).Avaliador de pôster da sessão de alunos de Mestrado e Doutorado. 2014. (Encontro).

VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos - EMMSB.Avaliador de pôster. 2014. (Encontro).

VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos - EMMSB.Protein-Protein Docking & Protein Structural Alignment and Classification. 2014. (Encontro).

I Semana de Biotecnologia do Estado do Rio de Janeiro. Avaliador de pôster da sessão de Biotecnologia Geral e Industrial. 2013. (Congresso).

1er Séminaire Scientifique Pluridisciplinaire - Collège Universitaire Franco-Brésilien Santos Dumont. 2012. (Seminário).

Journées Modélisation de Paris. 2011. (Outra).

Modeling and Beyond - 2nd French ENSC- Schrödinger Meeting & Workshop at ENSC. 2011. (Outra).

Escola de Nanoestrutura em Interfaces Biológicas: métodos e aplicações. 2010. (Outra).

III Latin American Postgraduate program of Biophysics Course / I Colloquium Brazil-Africa of Biophysics. Structural analysis of sequences from the endophytic bacterium Gluconacetobacter diazotrophicus genome using MHOLline. 2010. (Congresso).

IV Fórum de Proteômica do Rio de Janeiro.Anotação estrutural do genoma da bactéria endofitica Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando MHOLline. 2010. (Simpósio).

V escola de Modelagem Computacional em Sistemas Biológicos.Anotação estrutural do genoma da bactéria endofitica Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando MHOLline. 2010. (Outra).

Latin American postgraduate Program of Biophysics Course.Structural analysis of outer membrane efflux proteins from Gluconacetobacter diazotrophicus. 2009. (Outra).

VII Iberoamerican Congress of Biophysics. Structural analysis of outer membrane efflux proteins from Gluconacetobacter diazotrophicus. 2009. (Congresso).

Avanços em engenharia de proteínas e Síntese de Peptídeos. 2008. (Outra).

I Escola Brasileira de Bioinformática (EBB 2008).Analysis of outer and cytoplasmic membranes proteins from Gluconacetobacter diazotrophicus using MHOLline. 2008. (Outra).

III Brazilian Simposium on Bioinformatics (BSB 2008). 2008. (Simpósio).

III Fórum em Proteômica da Rede-Rio. 2008. (Encontro).

IV Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.Analysis of outer and cytoplasmic membranes proteins from Gluconacetobacter diazotrophicus using MHOLline. 2008. (Outra).

XXXVII Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq) and XI Congress of the Pan American Association for Biochemistry and Molecular Biology (PABMB). Bioinformatcs studies of Gluconacetobacter diazotrophycus genome: predictions of transmembrane helices and topology of proteins. 2008. (Congresso).

10th IUBMB Conference/XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology. Docking and Molecular Dynamics Studies in the Design of Selective Inhibitors for Plasmodium falciparum Serine Hydroxymethyl Transferase. 2007. (Congresso).

III Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2006. (Outra).

The 3rd Brazilian Symposium on Medicinal Chemistry. Design of 5-Formyl-6-hydrofolic Acid Analogues as New Potential Antimalarials Targeting P.falciparum Serine Hydroxymethyltransferase. 2006. (Congresso).

VI Escola do CBPF. 2006. (Outra).

XII Escola de Verão em Química Farmacêutica & Medicinal. 2006. (Outra).

Evento Comemorativo dos Dez Anos do Seminário Laveran & Deane sobre Malária. 2005. (Seminário).

X Seminário Laveran & Deane sobre Malária.Planejamento de inibidores seletivos da SHMT do P.falciparum por Modelagem Molecular. 2005. (Seminário).

1 Fórum de Profissionais da Área de Química (FPAQ ). 2003. (Encontro).

Semana Acadêmica do CCNE ? Curso de Química Industrial. 2003. (Encontro).

V Encontro sobre Produção de Leite e Derivados. 2003. (Encontro).

Mercado de Trabalho do Químico. 2002. (Seminário).

Segurança e Gerenciamento de Resíduos Químicos. 2001. (Seminário).

Semana Acadêmica do Curso de Química. 2000. (Congresso).

VIII Encontro de Química da Região Sul. 2000. (Encontro).

VII Encontro Internacional ? A Educação e o Mercosul / Conesul ? Desafio Político e Pedagógico.?. 1998. (Encontro).

II Seminário de Educação Ambiental ? Produção Consciente de Alimentos. 1996. (Seminário).

V Encontro Internacional de Educação e o Mercosul. 1996. (Encontro).

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Participação em bancas

Aluno: Raíssa Santos de Lima

DA SILVA, MANUELA L.BISCH, PAULO MASCARELLO; CAFFARENA, E. R.; BARRIAS, E.. Reposicionamento de Fármacos e Triagem Virtual de Substâncias Bioativas para o tratamento de Tuberculose e Malária. 2020. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Daniela Maria dos Santos Lucena

PAULA NETO, H. A.; TRAMBAIOLI, L. M. T. R. E.;DA SILVA, MANUELA L.; TODESCHINI, A. R.. Estratégias de inibição da Glutamina:Frutose-6-fosfato amidotransferase humana (hGFAT). 2019. Dissertação (Mestrado em IMUNOLOGIA E INFLAMAÇAO) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Emanuel Victor Nogueira Gotardo

DA SILVA, M. L.; CAMPOS, E.; BARTH, T.; SILVA, J. R.. Proteína quinase Mps1 de Arabidopsis thaliana. Análise computacional e genética química como estratégias para caracterização de seu domínio quinase.. 2019. Dissertação (Mestrado em Produtos Bioativos e Biociências) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Felipe Cerqueira Demidoff

DAHER NETTO, C.; RENNO, M. N.; COSTA, P. R. R.; CARVALHO, L. L.;DA SILVA, M. L.. Planejamento, síntese e avaliação in silico de híbridos estilbeno-quinona: substâncias com potencial atividade antimicobacteriana. 2019. Dissertação (Mestrado em Produtos Bioativos e Biociências) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Thiciana Santos da Fonseca

PASCUTTI, P. G.;DA SILVA, M. L.; FERNANDES, T. V. A.. Análise Computacional da Estabilidade Térmica de Celulases em Líquido iônico. 2018. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Kendy Anny de Azevedo Werneck

da Silva, Manuela Leal; VISBAL, G.; SILVA, J. H. M.;PASCUTTI, PEDRO G.. Planejamento De Inibidores Seletivos Contra Esterol-Metiltransferase De Tripanossomatídeos Por Modelagem Computacional. 2017. Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Maria Emilia Pinto Barrão

SOUZA, R. O. L.; SEIXAS FILHO, J. T.;DA SILVA, MANUELA L.. Inovação Metodológica no Ensino da Matemática Financeira para Alunos do Programa de Educação para Jovens e Adultos (PROEJA) como Instrumento para o Desenvolvimento Local. 2017. Dissertação (Mestrado em Mestrado Profissional em Desenvolvimento Local) - Centro Universitário Augusto Motta.

Aluno: Rafael Nicolay Baptista da Silva

DA SILVA, MANUELA L.; PASCUTTI, P. G.; SHERER, N.. Desenvolvimento de Metodologias Computacionais para Análises de Bibliotecas Ômicas: Aplicação em Metagenômica. 2017. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Ricardo Valle Ladewig Zappala

LAGE, C. A. S.; PACHECO, A. B. F.; VERMELHO, A.B; FERREIRA, R.S;DA SILVA, M. L.PASCUTTI, PEDRO G.. Predição Funcional de Proteínas Moduladas por Estresse em Deinococcus radiodurans. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Patricia Pereira Farias

BRITO, M.;DA SILVA, MANUELA L.; LIMA, C.. Modelagem Comparativa, Docagem Molecular e relação Estrutura-Atividade de derivados nitromidazólicos como potenciais inibidores da enzima nitroredutase de Trypanosoma cruzi. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências Aplicadas a Produtos Para Saúde) - Universidade Federal Fluminense.

Aluno: Alessandra Sbano

MEDEIROS, M.; CAVALCANTE, J. J. V.; CARDOSO, A. M.;DA SILVA, M. L.. Caracterização da Microbiota Presente em Mídias Filtrantes no Controle da Qualidade da Água em Sistema de Recirculação para Aquicultura. 2016. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Caio Bulgarelli

DA SILVA, M. L.Bisch, Paulo M.; PASCUTTI, P. G.; VISBAL, G.. Desenvolvimento de Software para Screening de Compostos de Interesse em Alvos Moleculares: Aplicação em Doenças Negligenciadas. 2016. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Tahila Andrighetti

da Silva, Manuela Leal; dos Santos, Laurita; RYBARCZYK FILHO, J. L.. Ferramenta computacional para identificação de micro-organismos com base em assinaturas genômicas. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciência Biológica AC.: Genética) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Andressa Sbano da Silva

LEMOS, J. L. S.;DA SILVA, M. L.; CARDOSO, A. M.. Desenvolvimento de processo biológico para tratamento de embalagens com resíduos de 2,4-D. 2015. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: João Victor Rego Ferreira

CARDOSO, A. M.; CAVALCANTE, J. J. V.;DA SILVA, M. L.. Triagem e Caracterização de Bactérias Isoladas de Rizoplanos de Gramíneas Utilizadas como Cobertura Vegetal no Aterro Sanitário de Gramacho. 2015. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Rafael Ferreira Soares

GOMES, M. F. C.;DA SILVA, M. L.; COSTABEL, M. D.. Estudo computacional dos estados de protonação das histidinas catalíticas da enzima ribose-5-fosfato isomerase de Trypanosoma cruzi. 2019. Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Rafael Ferreira Soares

GOMES, M. F. C.;DA SILVA, MANUELA L.; COSTABEL, M. D.. Estudo dos estados de protonação das Histidinas catalíticas da enzima Ribose-5-Fosfato Isomerase de Trypanosoma cruzi. 2019. Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz.

Aluno: Maria Fernanda Ribeiro Dias

DA SILVA, MANUELA L.; GRANJEIRO, J. M.; AUGUSTO, D. A.; GUIMARAES, A. C. R.; MAGALHAES, C. S.. Desenvolvimento de Métodos para Screening de Compostos de Interesse no Combate de Doenças Virais utilizando Métodos de Aprendizagem de Máquina e Informações Estruturais de Proteínas. 2018. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Reuel Lopes de Paula

LEITE, P. E. C.; ALVARENGA, A. V.; ALBUQUERQUE, M. G.; SILVA, G. R.; CABRAL, P. A. M.;DA SILVA, M. L.. Avaliação por métodos in silico e in vitro de reativador neutro da enzima acetilcolinesterase inibida por organofosforado: nova abordagem para avaliação do ancoramento molecular. 2018. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Carina Azevedo Oliveira Silva

DA SILVA, MANUELA L.; ABREU, L. A.; WANDERLEY, J. L. M.. Estudo das alfa-glucosidases e seu papel no processo de síntese de hemozoína em Rhodnius prolixus. 2020. Exame de qualificação (Doutorando em Produtos Bioativos e Biociências) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Caio Bulgarelli

DA SILVA, M. L.; SANTANNA FILHO, C. B.; CAPRILES, P. V. S. Z.; FERNANDES, T. V. A.. Desenvolvimento e Aplicação de Métodos Computacionais para o Desenho Racional de Fármacos. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Renato Granado Padilha

SANTANNA FILHO, C. B.;DA SILVA, M. L.; CAVALCANTI, D.. Efeito de análogos de fosfolipídeos no crescimento de Trypanosoma cruzi: uma proposta quimioterápica. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Andressa Sbano da Silva

DA SILVA, M. L.; SANTANNA FILHO, C. B.; DIREITO, I. C.. Determinação do herbicida ácido 2,4-diclorofenóxiacético residual em embalagens após tríplice lavagem e utilização de bactérias do solo para sua remediação. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Maria Fernanda Ribeiro Dias

DA SILVA, M. L.; PASCUTTI, P. G.; AUGUSTO, D. A.; SILVA, J. H. M.. DESENVOLVIMENTO DE MÉTODOS PARA SCREENING DE COMPOSTOS DE INTERESSE NO COMBATE A DOENÇAS VIRAIS UTILIZANDO MÉTODOS DE APRENDIZAGEM DE MÁQUINA E INFORMAÇÕES ESTRUTURAIS DE PROTEÍNAS. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: João Victor Rego Ferreira

CARDOSO, A. M.;DA SILVA, MANUELA L.; CAVALCANTE, J. J. V.. Identificação e metabolismo de microrganismos envolvidos na produção e degradação de metano de diversas profundidades no Aterro de Adrianopolis-RJ. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Rafael Mesquita Stoque

SANTANNA FILHO, C. B.; BORGES, P. P.;DA SILVA, MANUELA L.. Efeito dos líquidos iônicos na dinâmica e estrutura de complexos lignocelulósicos monitorados por métodos computacionais e experimentais. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Pedro Henrique Monteiro Torres

DA SILVA, M. L.; WEISSMULLER, G.; NASCIUTTI, L. E.. Análise estrutural do fragmento N-terminal da endostatina e a interação putativa com a integrina V3. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Priscila da Silva Figueiredo Celestino Gomes

LAGE, C. A. S.;DA SILVA, M. L.; LOPES, U. G.. Estudo in silico do mecanismo de ativação e do impacto de mutações oncogênicas na estrutura e dinâmica do receptor tirosino-quinase CSF1R (Colony Stimulating Factor-1 Receptor). 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Raynná Bittencourt Pena

ROMEIRO, N. C.; CARVALHO, L. L.;DA SILVA, M. L.; DAHER NETTO, C.. Síntese de novos análogos triazólicos da Lavendustina-A, via Click Chemistry: estudos in silico e avaliação da atividade biológica contra Trypanosoma cruzi. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Produtos Bioativos e Biociências) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Emanuela Heiderick Gouvêa

ABREU, P. A.; MUZITANO, M. F.;DA SILVA, M. L.. TRIAGEM VIRTUAL NA BUSCA POR NOVOS ANTIFÚNGICOS QUE ATUEM NA ENZIMA CYP51. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Produtos Bioativos e Biociências) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: GISELLE DA SILVA BOTELHO DE SOUZA

SOUZA, R. O. L.; MIRANDA, M. G.;DA SILVA, M. L.. Turismo cervejeiro como alternativa de aumento de demanda turística para a cidade de Petrópolis. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado Profissional em Desenvolvimento Local) - Centro Universitário Augusto Motta.

Aluno: Thiciana Santos da Fonseca

PASCUTTI, PEDRO G.DA SILVA, MANUELA L.; FERNANDES, T. V. A.. PLANEJAMENTO DE GLICOSIL HIDROLASES RESISTENTES AO PRÉ-TRATAMENTO DA BIOMASSA COM LÍQUIDOS IÔNICOS. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Lucas Jorge Marianno Costa

MEDEIROS, M.;DA SILVA, M. L.; BELTRAO, P. J.. Estudo do efeito da desglicosilação controlada nas propriedades cinéticas da celobiose desidrogenase 1 de Neurospora crassa. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Bernardo Fernandes Fogel

COSTA, L. T.;DA SILVA, M. L.; CAVALCANTE, J. J. V.. Avaliação dos efeitos da utilização de agrotóxicos na incidência de doenças inflamatórias intestinais na comunidade do Caxambu ? Petrópolis/RJ. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

Aluno: Maria Emilia Pinto Barrão

DA SILVA, MANUELA L.; SOUZA, R. O. L.; SEIXAS FILHO, J. T.. Letramento matemático a partir de APP de gestão: Ferramenta de desenvolvimento matemático para estudantes do PROEJA. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Mestrado Profissional em Desenvolvimento Local) - Centro Universitário Augusto Motta.

Aluno: Carolina De oliveira de paiva Gil

SANTOS, M. P.;DA SILVA, M. L.; TSCHOEKE, D. A.. Genômica Comparativa de bactérias Degradadoras de Gás Sulfídrico e Fixadoras de Carbono. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Stephany da Costa Torres

ROMEIRO, N. C.;DA SILVA, MANUELA L.; SCHULTZ, M. S.. Identificação de produtos da biodiversidade brasileira e fármacos aprovados como potenciais agentes anti-inflamatórios, inibidores de IRAK-1 e IRAK-4. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Maria Eduarda Alves Esteves

DA SILVA, MANUELA L.; FERNANDES, T. V. A.; AFONSO, A. O.. Triagem virtual de potenciais ligantes para a proteína NS3 genótipo 1 subtipo b do hepacivirus C. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis.

Aluno: Raíssa Santos de Lima

DA SILVA, M. L.; FERNANDES, T. V. A.; BOLDRINI, L C P; AFONSO, A. O.. Planejamento In Silico De Candidatos A Fármacos Para O Tratamento Da Tuberculose. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis.

Aluno: Carla Nathália Rodrigues Teixeira

DA SILVA, M. L.; NEPOMUCENO, J.; von Kruger, W. M. A.. Análise do Envolvimento do gene phoB na fisiologia de cepas de Vibrio parahaemolyticus isoladas no Brasil. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas: Modalidade Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Paula Jofily de Lima Rangel

DA SILVA, M. L.; SOARES, R. O.; FERNANDES, T. V. A.. Análise Conformacional e Busca por Inibidores de Proteínas não-estrutural 3 do Vírus da Zika. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas: Modalidade Médica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Ana Larissa Gama Martins Alves

DA SILVA, M. L.; LOPES, F. J. P.; BLEICHER, L.; TORRES, PEDRO H.M.. Predição funcional de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: método sequencial versus método estrutural.. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Marcela Guimarães

DA SILVA, MANUELA L.; LOPES, F. J. P.; SCAPIN, S. M. N.; TORRES, PEDRO H.M.. Caracterização in silico de glicosil hidrolases do metagenoma de Achatina fulica para produção de etanol de segunda geração. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Aluno: Rafael Nicolay Baptista da Silva

da Silva, Manuela LealGOMES, D. E. B.; AFONSO, A. O.. Identificação de enzimas atuantes na degradação de celulose utilizando ferramentas de bioinformática em larga escala. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis.

da Silva, Manuela Leal. Comitê de Seleção do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica e Tecnológica - BICT/FUNCAP da Fiocruz-Ceará. 2019. Fundação Oswaldo Cruz.

CAMPOS, E.;DA SILVA, M. L.; MENDONCA, H. R.. Comissão de Seleção de Doutorado no Programa Multicêntrico de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas. 2019. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

BARROS, C. M.;da Silva, Manuela Leal; MENDONCA, H. R.. Comissão de Seleção de Mestrado no Programa Multicêntrico de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas. 2019. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

GADELHA, A. P. R.; BAPTISTA, L. S.;DA SILVA, M. L.. Comissão de Seleção do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia - Doutorado. 2018. Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia.

da Silva, Manuela Leal; PIERUCCI, A. P. T. R.. Comissão de Seleção do Programa de Pós-Graduação em Nutrição ? Candidatura do Programa de Doutorado-sanduíche no Exterior (PDSE). 2018. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

da Silva, Manuela Leal. Comissão de avaliação do XXIV Seminário de Iniciação Científica da UFJF. 2018. Universidade Federal de Juiz de Fora.

da Silva, Manuela Leal; CAPRILES, P. V. S. Z.;GOMES, D. E. B.. Comitê de Avaliação de Pôster da 9ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos - EMMSB. 2018. Laboratório Nacional de Computação Científica.

DA SILVA, M. L.. Comitê Avaliador do Edital 011/2015 da Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação. 2016. Universidade Estadual do Rio Grande do Sul.

da Silva, Manuela LealGOMES, D. E. B.Pascutti, Pedro Geraldo. Comitê Avaliador de Pôsters da 8ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2016. Laboratório Nacional de Computação Científica.

SHERER, N.;da Silva, Manuela Leal. Comitê Avaliador de Pôster do X-Meeting 2016 - 12th international Conference of the AB3C. 2016. Universidade Federal de Minas Gerais.

da Silva, Manuela Leal. Comitê Avaliador de Pôster do III Workshop Internacional de Bioinformática em Biologia/Epidemiologia Molecular e Evolução Viral. 2015. Fundação Oswaldo Cruz.

da Silva, Manuela Leal. Comitê Avaliador das Apresentações Orais na Escola Regional de Alto Desempenho de São Paulo - ERAD-SP 2014. 2014. Universidade Federal do ABC.

da Silva, Manuela Leal. Comitê Avaliador de Pôster do V Encontro do Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Biologia Estrutural e Bioimagem (INBEB). 2014. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

da Silva, Manuela LealGOMES, D. E. B.Pascutti, Pedro Geraldo. Comitê Avaliador de Pôster da VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos - EMMSB. 2014. Laboratório Nacional de Computação Científica.

GOMES, D. E. B.da Silva, Manuela Leal. Comitê Avaliador de Pôster da I Semana de Biotecnologia do Estado do Rio de Janeiro. 2013. Universidade do Estado do Rio de Janeiro.

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Comissão julgadora das bancas

Gloria Regina Cardoso Braz

BRAZ, G. R. C.. Modelagem molecular de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: análise em larga escala e de proteínas potencialmente envolvidas na associação planta-bactéria.. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Teodorico de Castro Ramalho

Figueroa-Villar, J. D.França TCCPascutti PRAMALHO, T. C.. Planejamento de inibidores seletivos da serina hidroximetil transferase de Plasmodium falciparum por modelagem molecular. 2007. Dissertação (Mestrado em Química) - Instituto Militar de Engenharia.

Teodorico de Castro Ramalho

Aguiar APRAMALHO, T. C.França TCCFigueroa-Villar, J. D.. Planejamento de inibidores seletivos da Serina Hidroximetil Transferase de Plasmodium falciparum por modelagem molecular. 2005. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em Exame de proposta de mestrado) - Instituto Militar de Engenharia.

Ronaldo da Silva Mohana Borges

MOHANA-BORGES, R.. Tópicos Avançados de Biologia Molecular e Estrutural. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Wanda Maria Almeida von Kruger

Silva, ML;BISCH, Paulo MascarelloKRUGER, W. M. A. V.. Modelagem molecular de proteínas da bactéria endofítica G. diazotrophicus: análise em larga escala e de proteínas potencialmente envolvidas na associação planta-bactéria. 2011. Tese (Doutorado em Pós-graduação (Doutorado)) - Instituto de Biofisica Carlos Chagas Filho (UFRJ).

Laurent Emmanuel Dardenne

BISCH, Paulo Mascarelo;DARDENNE, L. E.; VonKruger, W.M.A; Braz, G.R.C.;PASCUTTI, Pedro Geraldo. Modelagem molecular de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: Análise em larga escala e de proteínas potencialmente envolvidas na associação planta-bactéria. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Alcino Palermo de Aguiar

Aguiar, A. P.VILLAR, Jose Daniel Figueroa; FRANÇA, Tanos Celmar Costa. Planejamento de Inibidores Seletivos da Serina -Hidroximetil Transferase de Plasmodium falciparum por Modelagem Molecular. 2005. Outra participação, Instituto Militar de Engenharia.

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Orientou

Maria Eduarda Alves Esteves

Reposicionamento de fármacos e busca por substâncias bioativas voltados à terapêutica da COVID-19; Início: 2020; Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Ana Carolina Silva Bulla

Reposicionamento de fármacos e busca por substâncias bioativas para o tratamento da Doença de Chagas; Início: 2020; Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Caio Felipe de Araujo Ribas Cheohen

Desenvolvimento de Alternativas ao Tratamento de Infecções Bacterianas Multirresistentes através de Análises in silico; Início: 2019; Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia; (Orientador);

Nathalia dos Santos Faria

Estudo do Perfil de Interação entre Peptídeos Antimicrobianos e Membranas Biológicas Através de Ferramentas Computacionais; Início: 2019; Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia; (Orientador);

Raíssa Santos de Lima

Reposicionamento de substâncias bioativas para tratar doenças causadas por Tripanossomatídeos; Início: 2020; Tese (Doutorado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Rafael Nicolay Baptista da Silva

Métodos Computacionais para a Busca de Novos Alvos Terapêuticos em Doenças Infecciosas: Análise de Rotas Metabólicas Diferenciadas entre Organismos Patogênicos e o Hospedeiro Humano; Início: 2019; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Alessandra Sbano da Silva

Tecnologias in sílico direcionadas para o controle e diagnóstico de arboviroses: Uma abordagem regulatória; Início: 2018; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Programa Apoio ao Desenvolvimento da Metrologia, Qualidade e Tecnologia; (Orientador);

Ricardo Valle Ladewig Zappala

Estudo dos mecanismos de resistência a estresses extremos em Deinococcus radiodurans; Início: 2017; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Coorientador);

Caio Bulgarelli

Desenvolvimento e Aplicação de Métodos Computacionais para o Desenho Racional de Fármacos; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Programa Apoio ao Desenvolvimento da Metrologia, Qualidade e Tecnologia; (Orientador);

Maria Fernanda Ribeiro Dias

Início: 2018; Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;

Ana Paula Manhães Balbino

Predição funcional de proteínas de Trypanosoma cruzi; Início: 2020; Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas - Licenciatura Ou Bacharelado) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; (Orientador);

Areza Zozimo Caputo Silva

Predição funcional de proteínas de Leishmania brasiliensis: foco na busca de novos alvos terapêuticos para o tratamento de leishmaniose; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis; (Orientador);

Aline Maia Alves

Predição estrutural de proteínas relacionadas à lesões focais no córtex cerebral; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Camila Rosa da Silva

Predição funcional de proteínas da Treponema pallidum: foco na busca de novos alvos terapêuticos para o tratamento de Sífilis; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis; (Orientador);

Lorrana Faria Fonseca

Predição funcional de proteínas de Trypanosoma cruzi: foco na busca de alvos terapêuticos; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas - Licenciatura Ou Bacharelado) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Rebeca Riscado Bernardo

Utilização de modelos 3D para a representação de interações químicas entre biomoléculas; ; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Química) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Raíssa Santos de Lima

Reposicionamento de Fármacos e Triagem Virtual de Substâncias Bioativas para o Tratamento de Tuberculose e Malária; 2018; Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Programa Apoio ao Desenvolvimento da Metrologia, Qualidade e Tecnologia; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Rafael Nicolay Baptista da Silva

Desenvolvimento de Metodologias Computacionais para Análises de Bibliotecas Ômicas: Aplicação em Metagenômica; 2017; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Ricardo Valle Ladewig Zappala

Modelagem Molecular de proteínas relacionadas à extremofilia em Deinococcus radiodurans; 2017; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Coorientador: Manuela Leal da Silva;

Kendy Anny de Azevedo Werneck

Planejamento De Inibidores Seletivos Contra Esterol-Metiltransferase De Tripanossomatídeos Por Modelagem Computacional; 2017; Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Caio Bulgarelli

Desenvolvimento de Software para Screening de Compostos de Interesse em Alvos Moleculares: Aplicação em Doenças Negligenciadas; 2016; Dissertação (Mestrado em Mestrado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Maria Fernanda Ribeiro Dias

Desenvolvimento de Métodos para Screening de Compostos de Interesse no Combate a Doenças Virais utilizando Métodos de Aprendizagem de Máquina e Informações estruturais de Proteínas; 2018; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Maria Eduarda Alves Esteves

Triagem Virtual de potenciais ligantes para a proteína NS3 genótipo 1 subtipo b do Hepacivirus C; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Fernando Limoeiro Lara de Oliveira

AGNINetwork: Aplicação de algoritmos de aprendizagem profunda como métodos alternativos para a triagem em larga escala de moléculas com potencial farmacêutico; Estudo de caso do reconhecimento de substratos pela protease do HIV-1; ; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas: Biofísica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Raíssa Santos de Lima

Planejamento in silico de candidatos à protótipos de fármacos para o tratamento da tuberculose; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Marcos Vinícius Geraldes

Análise in silico de Genes Relacionados a Resistência aos Fármacos Antituberculose; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Ana Larissa Gama Martins Alves

Predição funcional de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: método sequencial versus método estrutural; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Marcela Guimarães

Caracterização in silico de glicosil hidrolases do metagenoma de Achatina fulica para produção de etanol de segunda geração; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Rafael Nicolay Baptista da Silva

Identificação de enzimas atuantes na degradação de celulose utilizando ferramentas de bioinformática em larga escala; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Lucas Eduardo Mello Barboza

Utilização de ferramentas in silico para a descoberta de sítios catalíticos e secundários em proteínas; ; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Enfermagem e Obstetrícia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Yago Frossard Carvalho Célem

Estudo in silico de potenciais inibidores da Diidrofolato Redutase como potencial alvo para o desenvolvimento de fármacos; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Matheus Moebus Farias

Utilização de ferramentas in silico para a descoberta de sítios catalíticos e secundários em proteínas; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Física) - Centro Federal de Educação Tecnológica Celso Suckow da Fonseca, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Ricardo Cardozo de Barros

Desenvolvimento do portal ASAProt; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Tecnologia da Informação e da Comunicação) - Faculdade de Educação Tecnológica do Estado Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Maria Eduarda Alves Esteves

Metanálise de proteínas relacionadas ao Hepacivirus C; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Pedro Henrique do Nascimento Esteves

Predição Funcional de Proteínas e Busca de Novos Alvos Moleculares Relacionados com Produção de Biogás; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências biológicas) - Fundação Centro de Ciências e Educação Superior à Distância do Estado do RJ; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Caio Felipe de Araujo Ribas Cheohen

Predição funcional: anotação sequencial versus anotação estrutural; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Ana Larissa Gama Martins Alves

ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins): Validação Da Eficácia Dos Metódos Automatizados Para Anotação Estrutural Em Larga Escala; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Beatriz Cândido Barbosa

Identificação de enzimas atuantes na degradação de celulose oriundas do metagenoma do suco gástrico de Achatina fulica; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Fernando Limoeiro Lara de Oliveira

Estudos de Bioinformática e Modelagem Comparativa de enzimas envolvidas no desenvolvimento de biocombustíveis de segunda geração; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas: Biofísica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Raysla Alves Pires

Estudos de Bioinformática e Modelagem Comparativa de enzimas do caramujo Achatina fulica potencialmente envolvidas na degradação de celulose; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Kendy Anny de Azevedo Werneck

Análise Estrutural de Cadeias de Celulose e seus Complexos com Celulases por Métodos Computacionais de Modelagem Molecular; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Católica de Petrópolis, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Henrique Lisboa Mendes Borges Soares

Análises de bioinformática e estruturais da glutamina sintetase de cana-de-açúcar; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciências Biológicas - Biofísica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Maira Arruda Cardoso

Estudos de Bioinformática do gene SHR5 de Saccharum spp; diferencialmente expresso em interações com bactérias endofíticas fixadoras de Nitrogênio; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Enfermagem) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Ana Beatriz de Sousa Vieira

Estudo das características estruturais da enzima 24-smt do organismo Leishmania braziliensis; 2018; Orientação de outra natureza; (Técnico em Biotecnologia) - Colégio Estadual Círculo Operário, Programa Apoio ao Desenvolvimento da Metrologia, Qualidade e Tecnologia; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Vinícius Santos de Pontes

Automatização de estratégias computacionais aplicadas à análise de dados biológicos por ferramentas de bioinformática; 2018; Orientação de outra natureza; (Técnico em Biotecnologia) - Colégio Estadual Círculo Operário, Programa Apoio ao Desenvolvimento da Metrologia, Qualidade e Tecnologia; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Joanna Clementino Passos

Caracterização e normalização de dados biológicos destinados a análise de workflows científicos; 2016; Orientação de outra natureza; (Técnico em Biotecnologia) - Colégio Estadual Círculo Operário; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Alice Martins de Carvalho

Estudo das características estruturais da enzima 24-SMT do organismo Trypanosoma cruzi; 2016; Orientação de outra natureza; (Técnico em Biotecnologia) - Colégio Estadual Círculo Operário; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Maria Helena Costa Passos

Estudos de Bioinformática e Modelagem Molecular de enzimas oriundas do metagenoma do suco gástrico do caramujo Achatina fulica; 2015; Orientação de outra natureza; (Técnico em Biotecnologia) - Colégio Estadual Círculo Operário, Programa Petrobras de Desenvolvimento de Recursos Humanos; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Caio Bulgareli

Bolsista de Desenvolvimento Tecnologico F; 2015; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Márcia da Silva Chagas

Inteligência Artificial Aplicada a Banco de Dados de Inibidores Enzimáticos de Compostos Químicos; 2015; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas: Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Priscila da Silva Figueiredo Celestino Gomes

Bolsista de Desenvolvimento Tecnologico A - MAT-A; 2015; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Pedro Henrique Monteiro Torres

Bolsista de Desenvolvimento Tecnologico A - MAT-A; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Suzenne Antunes

Análise de sequências de DNA da microbiota de caramujo africano utilizando ferramentas de bioinformática; 2014; Orientação de outra natureza; (Técnico em Biotecnologia) - Colégio Estadual Círculo Operário; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Reinaldo Souza de Oliveira Júnior

Bolsista de Desenvolvimento Tecnologico A - MAT-A; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Maria Fernanda Ribeiro Dias

Bolsista de Desenvolvimento Tecnologico A - MAT-A; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Paula Carvalho de Almeida Daros

Bolsista de Desenvolvimento Tecnologico F - MDT-F; 2013; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Rosemberg de Oliveira Soares

Bolsista de Desenvolvimento Tecnologico A - MAT-A; 2013; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Manuela Leal da Silva;

Henrique Lisboa Mendes Borges Soares

Estudos de Bioinformática e Modelagem Comparativa de Possíveis Receptores da Interação entre Cana-de-açúcar e Bactérias Endofíticas; 2009; Orientação de outra natureza; (Bacharelado em Ciências Biológicas - Biofísica) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Manuela Leal da Silva;

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Foi orientado por

Jose Daniel Figueroa-Villar

Planejamento de Inibidores Seletivos da Serina Hidroximetil Transferase de Plasmodium falciparum por Modelagem Molecular; 2007; Dissertação (Mestrado em Química) - Instituto Militar de Engenharia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Jose Daniel Figueroa-Villar;

Tanos Celmar Costa França

Planejamento de Inibidores Seletivos da Serina Hidroximetil Transferase de Plasmodium falciparum por Modelagem Molecular; 2007; Dissertação (Mestrado em Química) - Instituto Militar de Engenharia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Tanos Celmar Costa Franca;

Paulo Mascarello Bisch

Modelagem molecular de proteínas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus: Análise em larga escala e de proteínas potencialmente envolvidas na associação planta-bactéria; 2011; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica)) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Paulo Mascarello Bisch;

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Produções bibliográficas

  • FREITAS, CYNTIA SILVA ; VERICIMO, MAURICIO AFONSO ; da Silva, Manuela Leal ; DA COSTA, GIOVANI CARLO VERÍSSIMO ; PEREIRA, PATRICIA RIBEIRO ; PASCHOALIN, VANIA MARGARET FLOSI ; DEL AGUILA, EDUARDO MERE . Encrypted antimicrobial and antitumoral peptides recovered from a protein-rich soybean (Glycine max) by-product. Journal of Functional Foods , v. 54, p. 187-198, 2019.

  • SILVA, E. ; CONDE, J. ; ALLONSO, D. ; VENTURA, G. ; COELHO, D. ; CARNEIRO, P. H. ; DA SILVA, MANUELA L. ; PAES, M. V. ; RABELO, K. ; WEISSMULLER, G. ; BISCH, P. M. ; MOHANA-BORGES, R. S. . Dengue virus nonstructural 3 protein interacts directly with human glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) and reduces its glycolytic activity. Scientific Reports , v. 9, p. 1-19, 2019.

  • ZAPPALA, R. V. L. ; PASCUTTI, P. G. ; DA SILVA, MANUELA L. ; LAGE, C. A. S. . The ?Black Box? Genome of the extremophilic bacterium Deinococcus radiodurans turning grayish. MEMORIE DELLA SOCIETA ASTRONOMICA ITALIANA (ONLINE) , v. 9, p. 282-288, 2019.

  • TORRES, P. H. M. ; Pascutti, Pedro Geraldo ; BISCH, PAULO MASCARELLO ; da Silva, Manuela Leal . Alternative Model for RND-Type Efflux Pump. Journal of the Brazilian Chemical Society (Online) , v. 00, p. 1-5, 2016.

  • SOARES, ROSEMBERG O. ; TORRES, PEDRO H.M. ; DA SILVA, MANUELA L. ; PASCUTTI, PEDRO G. . Unraveling HIV Protease Flaps Dynamics by Constant pH Molecular Dynamics Simulations. Journal of Structural Biology (Print) , v. 195, p. 216-226, 2016.

  • SOARES, ROSEMBERG O. ; TORRES, PEDRO H.M. ; DA SILVA, MANUELA L. ; PASCUTTI, PEDRO G. . Dataset showing the Impact of the Protonation States on Molecular Dynamics of HIV protease. Data in Brief , v. 8, p. 1144-1150, 2016.

  • DIAS, M. F. R. ; PASCUTTI, P. G. ; DA SILVA, M. L. . Machine Learning and Applications in Bioinformatics.. SEMIOSES (RIO DE JANEIRO) , v. 10, p. 23-31, 2016.

  • ALLONSO, D. ; ANDRADE, I. ; CONDE, J. ; COELHO, D. ; ROCHA, D. ; da Silva, Manuela Leal ; VENTURA, G. ; SILVA, E. ; MOHANA-BORGES, R. . Dengue Virus NS1 Protein Modulates Cellular Energy Metabolism by Increasing Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase Activity. Journal of Virology (Print) , v. 89, p. 11871-11883, 2015.

  • RIBEIRO, J. M. C. GENTA, F. A. SORGINE, M. H. LOGULLO, R. MESQUITA, R. D. PAIVA-SILVA, G. O. MAJEROWICZ, D. MEDEIROS, M. KOERICH, L. TERRA, W. R. FERREIRA, C. PIMENTEL, A. C. BISCH, P. M. LEITE, D. M. C. DINIZ, M. M. P. VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. DA SILVA, M. L. ARAUJO, R. N. GANDARA, A. C. P. BROSSON, S. SALMON, D. BOUSBATA, S. GONZALEZ-CABALLERO, N. SILBER, A. M. ALVES-BEZERRA, M. , et al. GONDIM, K. C. SILVA NETO, M. A. C. ATELLA, G. C. ARAUJO, H. DIAS, F. A. POLYCARPO, C. VIONETTE-AMARAL, R. J. FAMPA, P. MELO, A. C. A. TANAKA, A. S. BALCZUN, C. OLIVEIRA, J. H. M. GONCALVES, R. L. LAZOSKI, C. RIVERA-POMAR, R. DIAMBRA, L. SCHAUB, G. A. GARCIA, E. S. AZAMBUJA, P. BRAZ, G. R. C. OLIVEIRA, P. L. ; An Insight into the Transcriptome of the Digestive Tract of the Bloodsucking Bug, Rhodnius prolixus. PLoS Neglected Tropical Diseases (Online) , v. 8, p. e2594, 2014.

  • VERISSIMO DA COSTA, GIOVANI CARLO ; LERY, LETICIA MIRANDA SANTOS ; da Silva, Manuela Leal ; MOURA, HÉRCULES ; PERALTA, REGINA HELENA SARAMAGO ; VON KRÜGER, WANDA MARIA ALMEIDA ; BISCH, PAULO MASCARELLO ; BARR, JOHN R. ; PERALTA, JOSÉ MAURO . The identification and characterization of epitopes in the 30 34kDa Trypanosoma cruzi proteins recognized by antibodies in the serum samples of chagasic patients. Journal of Proteomics (Print) , v. 80, p. 34-42, 2013.

  • Campos, R.A ; DA SILVA, M. L. ; da Costa, G. V. ; BISCH, P. M. ; PERALTA, J. M. ; Silva, R ; RONDINELLI, E. ; Urmenyi, T.P . Gene expression and molecular modeling of the HSP104 chaperone of Trypanosoma cruzi. Genetics and Molecular Research , v. 11, p. 2122-2129, 2012.

  • Parente, Thiago E.M. ; Rebelo, Mauro F. ; da-Silva, Manuela L. ; Woodin, Bruce R. ; Goldstone, Jared V. ; Bisch, Paulo M. ; Paumgartten, Francisco J.R. ; Stegeman, John J. . Structural features of cytochrome P450 1A associated with the absence of EROD activity in liver of the loricariid catfish Pterygoplichthys sp.. Gene (Amsterdam) , v. 489, p. 111-118, 2011.

  • DA SILVA, M. L. ; da Silva Goncalves, Arlan ; Ricardo Batista, Paulo ; Figueroa-Villar, Jose Daniel ; Pascutti, Pedro Geraldo ; Franca, Tanos Celmar Costa . Design, docking studies and molecular dynamics of new potential selective inhibitors of Plasmodium falciparum serine hydroxymethyltransferase. Molecular Simulation , v. 36, p. 5-14, 2010.

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Outras produções

DA SILVA, MANUELA L. . Como os bancos de dados biológicos podem ajudar a sua pesquisa?. 2019. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

DA SILVA, MANUELA L. . Predição de Estruturas de Proteínas: Modelagem Comparativa. 2018. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

DA SILVA, MANUELA L. . Predição de Estruturas de Proteínas: Modelagem Comparativa e Ab initio. 2018. .

CAPRILES, P. V. S. Z. ; DA SILVA, M. L. . Predição de Estruturas de Proteínas: Modelagem Comparativa. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

da Silva, Manuela Leal . Visualização e Análise de Estruturas Proteícas. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

da Silva, Manuela Leal . Construção e Validação de Modelos Por Modelagem Comparativa Usando o Modeller. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

RITCHIE, Dave ; da Silva, Manuela Leal ; GOMES, D. E. B. . Protein-Protein Docking & Protein Structural Alignment and Classification. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

da Silva, Manuela Leal ; GOMES, D. E. B. ; SANTOS, E. O. ; GRIECO, M. A. ; SARAIVA, A. M. ; MEDEIROS, M. . Introdução a Metagenômica. 2013. .

DA SILVA, M. L. . Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

DA SILVA, M. L. ; ROCHA, G. M. ; MARTINS, J. . Introdução teórico-prática de Bioinformática, Modelagem Comparativa & Microscopia de Força Atômica. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Figueroa-Villar, Jose Daniel ; TINOCO, L. ; da Silva, Manuela Leal ; da Silva Gonçalves, Arlan ; CUNHA, S. . Interações Intermoleculares por RMN - RMN e Modelagem Molecular. 2009. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

DA SILVA, M. L. ; BARROS, P. M. ; LEITE, D. M. C. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. ; BITAR, M. . Descobrindo a Biofísica - Introdução teórico-prática de Bioinformática e Modelagem Molecular. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

CAPRILES, P. V. S. Z. ; DA SILVA, M. L. ; VIANEZ JUNIOR, J. L. S. G. . Predição de Estruturas de Proteínas via Modelagem Comparativa. 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para concurso da ESA ? Escola de Sargentos das Armas (Química). 2004. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para concurso do EPCAR ? Escola Preparatória de Cadetes da Aeronáutica (Química e Biologia). 2004. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para concurso do EsPCEx ? Escola Preparatória de Cadetes do Exército (Química e Biologia). 2004. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

DA SILVA, M. L. . Manual de Segurança e Primeiros Socorros Quimilac. 2004. (Manual).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para concurso da ESA ? Escola de Sargentos das Armas (Química). 2003. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para concurso do EsPCEx ? Escola Preparatória de Cadetes do Exército (Química e Biologia). 2003. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para concurso do EPCAR ? Escola Preparatória de Cadetes da Aeronáutica (Química e Biologia). 2003. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para o Concurso Público para Servidores de Escolas Públicas do Estado do Rio Grande do Sul ? Agente Educacional I. 2002. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

DA SILVA, M. L. . Apostila Preparatória para o Concurso Público para Servidores de Escolas Públicas do Estado do Rio Grande do Sul ? Agente Educacional II. 2002. (Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Apostila).

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Projetos de pesquisa

  • 2020 - Atual

    Estudos de Biologia Computacional Aplicadas na Identificação de Alvos Terapêuticos e no Planejamento de Fármacos, Descrição: A crescente produção de informações biológicas demonstrou que, o uso da computação destinada a pesquisas e ao gerenciamento de dados é essencial para a interpretação dos possíveis resultados a serem obtidos. Assim, nos últimos anos desenvolvemos metodologias e protocolos de predição funcional de proteínas e ferramentas para direcionar buscas em diferentes bancos de dados e amostras oriundas das ciências ômicas (genômica, transcriptômica, proteômica, metagenômica, etc). Objetivo: Buscar por novos alvos terapêuticos oriundos das ciências ômicas e implementar novos métodos de biologia computacional para entender a interação desses alvos com diferentes moléculas afim de planejar novos protótipos a fármacos. Abordagem experimental: Empregar diferentes metodologias e ferramentas de bioinformática desenvolvidas pela proponente e seu grupo, na busca de alvos terapêuticos em diferentes bibliotecas de dados e no planejamento racional de fármacos. Os métodos serão utilizados em particular nas seguintes pesquisas: (i) busca por possíveis alvos terapêuticos em genomas/transcriptomas/proteomas de organismos relacionados a doenças negligenciadas, (ii) a busca por possíveis alvos moleculares em genomas virais e bacterianos e (iii) triagem virtual em banco de dados de substâncias e predições de absorção, distribuição, metabolismo, excreção e toxicidade para os compostos selecionados visando diminuir custo e o tempo para a descoberta de novos protótipos a fármacos. Resultados esperados: Espera-se publicar pelo menos cinco artigos científicos nos próximos três anos como autora correspondente. Além disso, este projeto permitirá a formação continuada de recursos humanos no interior do Rio de Janeiro e fixação do grupo de pesquisa em biologia computacional na UFRJ-Macaé.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Coordenador., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

  • 2020 - Atual

    Proteínas recombinantes no combate à COVID-19: tocilizumabe biossimilar para terapia e proteínas virais para triagem de fármacos sintéticos e naturais, Descrição: A pandemia de COVID-19, doença causada pelo coronavírus SARS-CoV-2, impõe um grande desafio devido à alta transmissibilidade do vírus e à gravidade dos casos. A necessidade de terapia intensiva para uma grande parcela dos pacientes e o longo tempo de internação desafiam os sistemas de saúde. Visando a contribuir para o desenvolvimento de ferramentas que possam auxiliar no combate à COVID-19, esta proposta reúne um grupo de pesquisadores com reconhecida experiência em biotecnologia e ciências farmacêuticas, com o objetivo de propor alvos e terapias inovadoras. O presente projeto aborda esse desafio em duas estratégias complementares: por um lado, modular a resposta do paciente à infecção e, por outro, interferir na propagação do virus. Para a primeira, pretende-se usar ferramentas biotecnológicas para produzir um anticorpo monoclonal inibidor de interleucina 6 (IL-6), biossimilar ao tocilizumabe (TCZ), o qual já é indicado pelas autoridades chinesas para tratamento de pacientes graves com COVID19 e está atualmente sendo testado em ensaios clínicos nos EUA e outros países. Dado que a patente do TCZ já expirou, pretende-se desenvolver uma tecnologia de produção eficiente que permita ao sistema de saúde brasileiro o acesso ao medicamento por custos menores e de forma menos dependente de importação. A segunda estratégia envolve a busca por moléculas com potencial atividade antiviral. Como ponto de partida, fármacos sintéticos já disponíveis no mercado e também compostos derivados da enorme biodiversidade brasileira serão estudados por ferramentas computacionais capazes de predizer a interação de centenas de milhares destas moléculas com proteínas não estruturais do vírus, fundamentais para sua replicação. As moléculas mais promissoras serão avaliadas experimentalmente, utilizando proteínas virais que serão expressas na forma recombinante. Desta forma, pretende-se propor alternativas terapêuticas que inibam a multiplicação do vírus e acelerem a recuperação dos pacientes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / diego allonso - Integrante / heitor affonso de paula neto - Integrante / Leda Dos Reis Castilho - Coordenador / Gilda Guimarães Leitão - Integrante / Renato Sampaio Carvalho - Integrante / Suzana Guimarães Leitão - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

  • 2017 - Atual

    Biometrologia Aplicada às Ciências Ômicas: Foco em Anotação Funcional e Busca de Alvos Moleculares, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Coordenador.

  • 2016 - Atual

    Genômica e Saúde: Mecanismos de Interação entre Agentes Infecciosos e seus Hospedeiros, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / BISCH, PAULO MASCARELLO - Coordenador., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

  • 2015 - Atual

    Métodos Pós-Genômicos no estudo da Regulação Gênica em Biomedicina, Biotecnologia e Meio Ambiente, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / BISCH, PAULO MASCARELLO - Coordenador., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

  • 2015 - Atual

    Modelagem e Dinâmica de Estruturas Moleculares de Interesse Biológico, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Pedro Geraldo Pascutti em 12/06/2017., Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / PASCUTTI, PEDRO G. - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2014 - Atual

    Estudos de biologia computacional aplicadas a genômica/metagenômica/transcriptômica/proteômica de microorganismos de interesse em biocombustíveis e no desenvolvimento de fármacos para doenças negligenciadas, Descrição: Este projeto tem como objetivo geral o desenvolvimento e aplicação de métodos computacionais e matemáticos para modelagem molecular e simulação de estruturas de proteínas, além do desenvolvimento de algoritmos para análise funcional de sistemas biológicos e análise e interpretação de dados gerados nas áreas de genômica, transcriptômica, proteômica e metagênomica. Serão realizados a modelagem e simulação de sistemas biológicos (interações proteína-proteína, proteína-ligante e proteína-superficies biológicas) e a análise e interpretação de dados gerados por cristalografia e ressonância magnética nuclear. Serão investigas celulases para produção de etanol de segunda geração e a inibição de enzimas importantes como alvos moleculares no tratamento de doenças negligenciadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / Pascutti - Integrante / wanderlei de souza - Coordenador / Diego Enry Barreto Gomes - Integrante / Celso Barbosa de Sant'Anna Filho - Integrante / Eidy de Oliveira Santos - Integrante / Glória Regina Franco - Integrante / Rafaela Salgado Ferreira - Integrante / Lucas Bleicher - Integrante / Liza Figueiredo Felicori Vilela - Integrante / Youssef Bacila Sade - Integrante / Antonio Marcos Saraiva - Integrante / Jose Mauro Granjeiro - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

  • 2014 - Atual

    Estudos de Biologia Computacional aplicados na identificação de enzimas atuantes na degradação de biomassa lignocelulósica, Descrição: Este projeto utilizará aplicativos de bioinformática desenvolvidos no Laboratório de Biologia Computacional da DIMAV/INMETRO e atualmente em processo de implementação para análise e anotação estrutural em larga escala. Dessa forma, o objetivo do projeto é aplicar essa ferramenta denominada ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins) em estudos já em desenvolvimento no INMETRO como em análises de diferentes amostras de DNA metagenômicos, transcriptoma do cupim e metagenoma da microbiota do caramujo gigante africano, entre outros. O foco é a busca de novos alvos moleculares a serem estudados pelos grupos experimentais na área de biocombustíveis, realizando uma busca em larga escala de novas enzimas que possuam a capacidade de degradação da biomassa lignocelulósica, já que grande parte da biomassa proveniente da produção de etanol de cana-de-açúcar não é aproveitada. Construindo-se modelos tridimensionais de qualidade para essas enzimas podem-se realizar estudos computacionais detalhados do sítio catalítico das mesmas, além de entender as interações que ocorrem entre enzima e substrato. Com essas informações, podem-se analisar características especificas para cada enzima, como complementaridade de cargas e hidrofobicidade de cada grupo químico, que poderiam ser utilizadas para propor mutações dirigidas visando sua maior eficiência a nível industrial.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Coordenador / Daniel Leite - Integrante / Pascutti - Integrante / rafael bernardi - Integrante / wanderlei de souza - Integrante / marcelo melo - Integrante / Diego Enry Barreto Gomes - Integrante / Antonio Marcos Saraiva - Integrante / caio bulgarelli - Integrante / Tácio Vinicio Amorim Fernandes - Integrante / Janaina Japiassu de Vasconcelos Cavalcante - Integrante / Sandra Mara Naressi Scapin - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2013 - 2016

    Modelagem e Dinâmica Molecular em Sistemas Biomoleculares: Desenho de Fármacos, Estrutura e Dinâmica de Complexos Protéicos, nanomateriais, Polissacarídeos e Biomembranas, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Pedro Geraldo Pascutti em 12/06/2017., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / PASCUTTI, PEDRO G. - Coordenador., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2016

    PENSA-RIO 2012 - FAPERJ, Descrição: Ação Integrada de Estratégias Estruturais e Moleculares na Investigação de Agentes e Alvos Terapêuticos Importantes no Controle e Prevenção de Doenças Virais Relevantes ao Estado do Rio de Janeiro. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / Diego Enry Barreto Gomes - Integrante / PASCUTTI, PEDRO G. - Coordenador., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2016

    Ação Integrada de Estratégias Estruturais e Moleculares na Investigação de Agentes e Alvos Terapêuticos Importantes no Controle e Prevenção de Doenças Virais Relevantes ao Estado do Rio de Janeiro, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Pedro Geraldo Pascutti em 12/06/2017., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / PASCUTTI, PEDRO G. - Coordenador., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

  • 2012 - 2015

    Apoio ao Projeto Métodos Pós-Genômicos no Estudo da Regulação da Expressão Gênica em Sistemas de Interesse na Biomedicina, Biotecnologia e Meio Ambiente, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / BISCH, PAULO MASCARELLO - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2012 - Atual

    Desenvolvimento de aplicativos de bioinformática para anotação estrutural de sequências genômicas, metagenômicas, proteômicas e transcriptômicas em larga escala, Descrição: Ainda que a função de uma proteína deva ser determinada experimentalmente, ela pode ser predita usando técnicas de bioinformática. A estratégia tradicional é procurar em bancos de dados, sequências protéicas com funções conhecidas que tenham similaridade com a sequência em estudo. Neste caso para se inferir uma função a nova sequência, o alinhamento entre as sequências primárias deve ser de alta qualidade, podendo mesmo assim levar a anotações com baixa confiabilidade. Como alternativa, pode-se usar a técnica de modelagem comparativa para inferir função para uma proteína. Esta opção baseia-se na construção de modelos 3D e na identificação de motivos estruturais que possam auxiliar na determinação da função protéica. Este projeto tem como principal objetivo desenvolver aplicativos de bioinformática que integrem programas e banco de dados disponíveis na internet, para análise e anotação estrutural em larga escala. Várias aplicações serão possíveis com estas novas ferramentas, especialmente em temas já em estudo no INMETRO como as análises de diferentes amostras de DNA metagenômicos, transcriptoma do cupim e metagenoma da microbiota do caramujo gigante africano, entre outros. O desenvolvimento desta ferramenta também contribuirá em projetos de estudo na área de biocombustíveis, auxiliando na busca em larga escala de novas enzimas que possuam a capacidade de degradação da biomassa lignocelulósica, já que grande parte da biomassa proveniente da produção de etanol de cana-de-açúcar não é aproveitada.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Coordenador / Paulo Bisch - Integrante / Daniel Leite - Integrante / Pascutti - Integrante / rafael bernardi - Integrante / wanderlei de souza - Integrante / marcelo melo - Integrante / caio bulgarelli - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2011 - 2013

    Métodos Pós-Genômicos no Estudo da Regulação da Expressão Gênica em Sistemas de Interesse na Biomedicina, Biotecnologia e Meio Ambiente, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / BISCH, PAULO MASCARELLO - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2011 - 2012

    Interações entre cinases e ligantes e Investigação dos Mecanismos Moleculares de Resistência a Fármacos, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Coordenador / Paulo Bisch - Integrante / Luba Tchertanov - Integrante., Financiador(es): COFECUB - Cooperação / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

  • 2011 - Atual

    AMEP (Antiangiogenic MEtargidin Peptide) Project: Análises estruturais de peptídeos e suas interações com integrases, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Coordenador / Paulo Bisch - Integrante / Christian Auclair - Integrante / Luba Tchertanov - Integrante.

  • 2009 - Atual

    Estudos moleculares e estruturais de proteínas do vírus da dengue: identificação de alvos terapêuticos e diagnóstico da doença, Descrição: Dengue é uma doença endêmica nas regiões tropicais e subtropicais e representa um grave problema econômico, ambiental e de saúde pública, causando a morte de milhares de adultos e crianças em todo o mundo. As manifestações clínicas da doença variam de uma febre auto-limitada à febre hemorrágica, podendo evoluir para choque e morte. Os quadros graves resultam de um repentino aumento da permeabilidade vascular, cuja patogênese ainda não foi esclarecida, levando a uma diminuição do volume do fluido intravascular, e conseqüente hemoconcentração e hipotensão. Além dos danos vasculares, existem fortes evidências de que a disfunção hepática é característica dos casos mais graves da doença hemorrágica e da síndrome do choque da dengue. A introdução do sorotipo 3 e a sua rápida disseminação desencadearam uma grande epidemia em 2002 afetando principalmente o Estado do Rio de Janeiro. Neste ano, os cariocas vivenciaram uma nova epidemia de dengue do sorotipo 2 mais virulenta com mais de 200.000 casos, sendo cerca de 2.000 de dengue hemorrágico, dos quais 5 % evoluíram para o óbito. Desta forma, o objetivo geral deste projeto é estudar os aspectos moleculares e estruturais das proteínas C, E, NS1, e NS3 do vírus da dengue e de suas interações com outras proteínas virais e com moléculas da célula hospedeira a fim de que possamos planejar futuramente inibidores de moléculas-chave no processo de infecção deste vírus.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / Paulo Bisch - Coordenador / Ronaldo da Silva Mohana Borges - Integrante / diego allonso - Integrante / Emiliana Mandarano da Silva - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2007 - 2009

    Desenvolvimento e Aplicações de Métodos Físicos em Biologia Estrutural, Genômica e Proteômica, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Manuela Leal da Silva - Integrante / BISCH, PAULO MASCARELLO - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

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Prêmios

2019

Menção honrosa pelo trabalho Utilização de ferramentas in silico para descoberta de novos sítios catalíticos e secundários em proteínas: aplicação na falcipaína-2 de Plasmodium falciparum, I Jornada Integrada das Pós-graduações do Inmetro & II Jornada de Iniciação Científica e Tecnológica.

2019

Menção honrosa pelo trabalho Avaliação e comparação das mutações entre as proteases do HIV-1 subtipo B e F e suas influências nos inibidores de protease, I Jornada Integrada das Pós-graduações do Inmetro & II Jornada de Iniciação Científica e Tecnológica.

2019

Menção honrosa pelo trabalho Reposicionamento In Silico de Substâncias Aprovadas pelo FDA para Tratamento de Malária e Tuberculose, I Jornada Integrada das Pós-graduações do Inmetro & II Jornada de Iniciação Científica e Tecnológica.

2019

Menção honrosa pelo trabalho Caracterização in silico da Toposiomerase I de Mycobacterium tuberculosis: alvo promissor para tratamento de tuberculose, I Workshop em Biologia Computacional.

2019

Menção honrosa pelo trabalho Desenvolvimento de Metodologias Computacionais para Análises de Bibliotecas Ômicas: Aplicação em Metagenômica, I Workshop em Biologia Computacional.

2016

Menção Honrosa pelo trabalho "Inteligência Artificial aliada ao Docking Molecular na Predição de Substratos Naturais de Proteínas"., 8ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.

2016

Menção Honrosa pelo trabalho Análise da aplicação de métodos automatizados embasada em anotação estrutural de sequências proteicas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus, 8ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.

2016

Menção Honrosa pelo trabalho Identification and evaluation of new molecular targets: from metagenome analysis to 3D structure, 8ª Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.

2015

Menção Honrosa pelo trabalho ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins): Automação do Sistema Computacional para Anotação de Proteínas em Larga Escala, 1 Congresso Regional da Sociedade Brasileira de Biofisica, Natal - RN - Brasil.

2015

Menção Honrosa pelo trabalho Avaliação de métodos de classificação de substratos naturais de proteínas utilizando métodos de aprendizagem de máquina., XXXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural - UFRJ.

2015

Menção Honrosa pelo trabalho: Interações molecularesde uma 6-fosfo-beta-glicosidase de citrobacter sp, oriunda do metagenomagástrico do molusco Achatina fulica, com seu substrato e co-fator: um estudo, XXXVII Jornada Giulio Massarani de Iniciação Científica, Tecnológica, Artística e Cultural - UFRJ.

2014

Melhor Pôster na Categoria Graduação pelo Trabalho Anotação e Modelagem Estrutural da Endo1,4-D-Glucanase de Stenotrophomonas sp., Proveniente do Metagenoma do Caramujo Achatina fulica, V Encontro Anual do INBEB - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Biologia Estrutural e Bio.

2011

Menção Honrosa pelo trabalho Análise in silico do envolvimento da PTO-like tirosina cinase na interação entre Gluconacetobacter diazotrophicus e cana-de-açúcar, II Semana da Graduação em Biofísica da Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ - Campus Macaé, Núcleo em Ecologia e Desenvolvimento Socioambiental de Macaé - NUPEM. , Avenida São José do Barreto, 764, Centro, 27910970 - Macaé, RJ - Brasil, Telefone: (22) 21413900

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Experiência profissional

2019 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Substituto de Coordenador de Graduação

Outras informações:
Substituto Eventual da Função de Coordenador de Graduação do Curso de Licenciatura em Biologia - Macaé

2019 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Docente de Pós-Graduação

Outras informações:
Docente do Programa Multicêntrico de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas vinculada a instituição associada UFRJ-Macaé.

2018 - Atual

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2012 - 2018

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador colaborador

2012 - 2012

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Projeto: Estudos moleculares e estruturais de proteínas do vírus da dengue: identificação de alvos terapêuticos e diagnóstico da doença

2007 - 2011

Universidade Federal do Rio de Janeiro

Vínculo: Bolsista de Doutorado da CAPES, Enquadramento Funcional: Doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 08/2018

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Proteômica e Transcriptoma, Bioinformática e Genômica Funcional, Modelagem 3D de Biomacromoléculas

  • 05/2019 - 07/2019

    Ensino, CIÊNCIAS AMBIENTAIS E CONSERVAÇÃO, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular e Genômica Funcional

  • 05/2019 - 07/2019

    Ensino, Ciencias Biologicas - Fisiologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular e Genômica Funcional

  • 08/2013 - 12/2013

    Ensino, Ciências Biológicas: Modalidade Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BMW 128 - Fundamentos de Biofísica II

  • 03/2010 - 08/2010

    Ensino, Ciências Biológicas (Biofísica), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Modelagem e Dinâmica de Biomoléculas

  • 03/2010 - 07/2010

    Ensino, Bacharelado em Ciências Biológicas - Biofísica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BMB413 - Bioinformática e Modelagem Molecular, BMB 222 - Bioinformática

  • 04/2010 - 04/2010

    Ensino, Bacharelado em Ciências Biológicas - Biofísica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Conceitos Fundamentais da Física e da Biologia

  • 08/2009 - 11/2009

    Ensino, Ciências Biológicas: Modalidade Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Dinâmica Molecular

  • 10/2009 - 10/2009

    Extensão universitária , Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, .,Atividade de extensão realizada, Introdução teórico-prática de Bioinformática, Modelagem Comparativa & Microscopia de Força Atômica.

  • 04/2009 - 07/2009

    Ensino, Bacharelado em Ciências Biológicas - Biofísica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BMB 222 - Bioinformática

  • 03/2009 - 07/2009

    Ensino, Ciências Biológicas (Biofísica), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Modelagem e Dinâmica de Biomoléculas

  • 03/2009 - 06/2009

    Ensino, Bacharelado em Ciências Biológicas - Biofísica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BMB413-Bioinformática e Modelagem Molecular

  • 08/2008 - 11/2008

    Ensino, Ciências Biológicas: Modalidade Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Introdução à Dinâmica Molecular

  • 10/2008 - 10/2008

    Extensão universitária , Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho, .,Atividade de extensão realizada, Descobrindo a Biofísica - Introdução teórico-prática de Bioinformática e Modelagem Molecular.

  • 03/2008 - 07/2008

    Ensino, Bacharelado em Ciências Biológicas - Biofísica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BMB 222 - Bioinformática, Bioinformática e Modelagem Molecular

  • 07/2007 - 12/2007

    Ensino, Ciências Biológicas Modalidade Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, BMW 128 - Fundamentos de Biofísica II

2020 - Atual

Fundação Oswaldo Cruz

Vínculo: Docente de Pós-graduação, Enquadramento Funcional: Docente de Pós-Graduação

Outras informações:
Docente do Programa de Pós-graduação Stricto sensu em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz (PGBCS/IOC/Fiocruz)

2018 - Atual

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Pesquisador colaborador

2014 - Atual

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Docente, Enquadramento Funcional: Docente da Pós-Graduação em Biotecnologia

2017 - 2018

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40

Outras informações:
Bolsista Pronametro Modalidade DCT-3B 100%. Publicado no DOU de 29 de maio de 2017.

2015 - 2017

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Pós-doutorando, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando

2012 - 2015

Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40

Outras informações:
Bolsista CNPq/Prometro Modalidade Desenvolvimento Cientifico da Metrologia Nacional - MDC Nível: 4D . Publicado no DOU de 9 de outubro de 2012.

Atividades

  • 12/2018

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Programa de Pós-graduação em Biotecnologia, .,Cargo ou função, Presidente da Comissão Curricular e de Acompanhamento Discente ? CCD.

  • 07/2014

    Ensino, Mestrado em Biotecnologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática, Modelagem e Dinâmica Molecular, TBB: Análise Computacional de Famílias de Proteínas, Tópicos Especiais: Montagem de Genomas, Predição de Estrutura de Proteínas

  • 11/2012 - 06/2018

    Pesquisa e desenvolvimento , Inmetro em Xerém, Diretoria de Metrologia Aplicada às Ciências da Vida - DIMAV.,Linhas de pesquisa

2018 - 2018

Universidade Federal de Juiz de Fora

Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Visitante, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Professor Visitante do Programa de Pós-graduação em Modelagem Computacional

Atividades

  • 07/2018

    Ensino, Modelagem Computacional, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática e Biologia Computacional

2015 - Atual

Universidade Federal de Minas Gerais

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: colaborador

Atividades

  • 11/2016 - 11/2016

    Ensino, Bioinformática, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Predição funcional utilizando informações estruturais de proteínas

2011 - 2012

École Normale Supérieure de Cachan, ENS/Cachan

Vínculo: Bolsista de Pós doutorado, Enquadramento Funcional: pós-doutoranda, Regime: Dedicação exclusiva.

2005 - 2007

Instituto Militar de Engenharia

Vínculo: Bolsista de Mestrado da CAPES, Enquadramento Funcional: Mestrando, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 02/2006 - 11/2006

    Ensino, Engenharia Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Química II, Química I

2003 - 2004

Universidade Federal de Santa Maria

Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Membro do Colegiado

Outras informações:
Membro discente do Colegiado do curso de Química Industrial

2003 - 2004

Universidade Federal de Santa Maria

Vínculo: Aluno, Enquadramento Funcional: Presidente do Diretório Acadêmico

Outras informações:
Presidente do Diretório Acadêmico da Química Industrial

2002 - 2003

Universidade Federal de Santa Maria

Vínculo: Iniciação Científica, Enquadramento Funcional: Iniciação Científica Voluntária, Carga horária: 20

Outras informações:
Iniciação Científica no LACHEM - Laborátorio de Apoio à Clínicas de Hemodiálise

2000 - 2000

Farmácia Bioativa

Vínculo: CIEE, Enquadramento Funcional: estagiária, Carga horária: 44

Outras informações:
Auxiliar no Controle Químico e Físico-químico de Qualidade, Auxiliar na Rotulagem, Pesagem e Expedição de Produtos Químicos

Atividades

  • 06/2000 - 12/2000

    Estágios , Farmácia Bioativa, .,Estágio realizado, Auxiliar no laboratório.

2003 - 2003

Farmacologe Farmácia & Manipulação

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: estagiária, Carga horária: 20

Outras informações:
Auxiliar no Laboratório de Manipulação de Medicamentos, no Laboratório de Controle de Qualidade de Cápsulas, Sólidos, Semi-sólidos e Líquidos

Atividades

  • 05/2003 - 06/2003

    Estágios , Farmacologe Farmácia & Manipulação, .,Estágio realizado, Auxiliar no laboratório.

2004 - 2004

Quimilac Química Ltda

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: estagiária, Carga horária: 44

Outras informações:
Estágio junto ao Departamento de Controle de Qualidade: Elaboração do Manual de Segurança e Primeiros Socorros da Empresa. Elaboração do Mapa de Risco da Empresa. Editoração da Ficha de Treinamento Padrão da Empresa

Atividades

  • 07/2004 - 11/2004

    Estágios , Quimilac Química Ltda, .,Estágio realizado, Controle de Qualidade.

2000 - 2004

Instituto Padre Reus

Vínculo: Terceirizado, Enquadramento Funcional: química

Atividades

  • 03/2000 - 10/2004

    Ensino,,Disciplinas ministradas, Ciências Físicas e Biológicas

  • 03/2000 - 10/2004

    Ensino, Pré Vestibular, Nível: Aperfeiçoamento,Disciplinas ministradas, Biologia para o Pré Vestibular, Química para o Pré-Vestibular

  • 03/2000 - 10/2004

    Ensino,,Disciplinas ministradas, Biologia, Química