Sophia Lincoln Cardoso de Azevedo
Graduada em Biomedicina com habilitação em pesquisa científica e ênfase em fisiologia e farmacologia pela Universidade Federal Fluminense (UFF), é bolsista de aperfeiçoamento no Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e à Resistência Antimicrobiana (LaBSUR - Instituto Oswaldo Cruz (IOC)/Centro de Pesquisa, Inovação e Vigilância em Covid-19 e Emergências Sanitárias) atuando nos projetos "Papel dos sistemas de dois componentes phoPQ, envZ-ompR, ssrAB e qseCB na regulação das ilhas de patogenicidade 1 e 2 de Salmonella pelo Ácido 3,4-dimetilbenzoico" e "Investigação in silico do papel de substituições de aminoácido da enzima EthA de Micobacterium tuberculosis na resistência à etionamida". Foi bolsista de Iniciação Científica pelo PIBIC no Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática do IOC/Fiocruz, atuando no projeto "Diversidade de sequência da ribose-5-fosfato isomerase B de Trypanosoma cruzi: mapeamento e impacto no desenho de quimioterápicos" que foi premiado como um dos melhores trabalhos da vigésima nona Reunião Anual de Iniciação Científica (RAIC) do IOC e indicado ao prêmio "Destaque na Iniciação Científica e Tecnológica 2022" do CNPQ. Em 2021, foi selecionada para a segunda fase do Sanger Prize, competição internacional promovida anualmente pelo Instituto Sanger da Inglaterra que objetiva premiar alunos de graduação. Em 2022, foi selecionada para o programa de estágio de verão do Centre for Genomic Regulation (CRG) em Barcelona, Espanha. Foi monitora voluntária (2021) e bolsista (2022) da disciplina Políticas de Saúde no Brasil do Instituto de Saúde Coletiva da UFF e seu trabalho foi eleito como melhor trabalho entre os monitores voluntários do instituto em 2021. Foi membro do Diretório Acadêmico Jussara Pereira do Nascimento, entidade estudantil que representa os alunos do curso de Biomedicina da UFF Niterói, na gestão de 2019 a 2021. Atualmente, realiza trabalho voluntário no projeto de divulgação científica "Ciência Elas" que tem como objetivo estimular a participação de meninas nas áreas de ciência, tecnologia, engenharia e matemática. Tem grande interesse por projetos que estejam na interface entre genômica e saúde pública.
Informações coletadas do Lattes em 20/08/2023
Acadêmico
Formação acadêmica
Graduação em Biomedicina
2017 - 2021
Universidade Federal Fluminense
Título: Diversidade de sequência da ribose-5-fosfato isomerase B de Trypanosoma cruzi: mapeamento e impacto no desenho de quimioterápicos
Orientador: Teca Calcagno Galvão
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.
Formação complementar
2023 -
English for Work. (Carga horária: 80h). , British Council English Online, BC, Brasil.
2023 -
Minor in Global Challenges focused on inequalities. , Universidade Federal Fluminense, UFF, Brasil.
2021 - 2021
Extensão universitária em II Curso de Férias em Genética e Evolução. (Carga horária: 36h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.
2021 - 2021
Extensão universitária em A biotecnologia no desenvolvimento de fármacos. (Carga horária: 20h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
2021 - 2021
Competência Transversal - Lógica de Programação. (Carga horária: 14h). , SENAI - Departamento Regional de São Paulo, SENAI/DR/SP, Brasil.
2020 - 2020
Principles of Biochemistry. , Harvard edX, HARVARDX, Brasil.
2019 - 2019
Extensão universitária em Minicurso Princípios Básicos de Cultivo Celular. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
2019 - 2019
Extensão universitária em Técnicas biofísicas para o estudo de macromoléculas e partículas virais. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
2019 - 2019
Extensão universitária em Minicurso Sequenciamento de DNA para Identificação de Microrganismos. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
2019 - 2019
Extensão universitária em Minicurso Transcriptoma e Proteoma. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.
2019 - 2019
QBA/Online - Sensibilização em Gestão de Qualidade, Biossegurança e Ambient. (Carga horária: 4h). , Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.
2014 - 2016
Curso Técnico em Eletrônica. (Carga horária: 4347h). , Fundação de Apoio à Escola Técnica do Estado do Rio de Janeiro, FAETEC, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Bem.
Participação em eventos
VII Escola de Inverno do Programa de Pós-Graduação em Biociências e Biotecnologia da Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP. 2021. (Exposição).
49ª Reunião Anual da SBBq: Biossegurança e bioproteção no cotidiano dos laboratórios de bioquímica e biologia molecular. O que muda em situação da pandemia causada pelo SARS-CoV-2?. 2020. (Encontro).
49ª Reunião Anual da SBBq: Conformational space sample of proteins: Methods and Applications. 2020. (Encontro).
49ª Reunião Anual da SBBq: Enzymes in an arms-race. 2020. (Encontro).
BioIn4Girls. 2020. (Seminário).
Ciclo Carlos Chagas de Palestras - 8° edição. Identification of Trypanosoma cruzi ribose-5-phosphate isomerase inhibitors for Chagas disease chemotherapy: from an in vitro approach into the wilderness of exploring protein sequence-structure-function diversity. 2020. (Exposição).
I Workshop Online de Bioinformática (WOB). 2020. (Oficina).
Agenda Acadêmica da UFF 2019.Um exemplo de análise de isoenzimas por eletroforese: Simulação da separação de Creatina Cinase. 2019. (Outra).
I Workshop/V Curso de Férias: "Estratégias para Busca de Novos Protótipos com Atividades Farmacológicas e Potencial Biotecnológico" promovido pelo programa de Pós-graduação em Ciências e Biotecnologia da UFF.Minicurso "Exemplo da análise de isoenzimas por eletroforese: Simulação da Creatina Cinase". 2019. (Outra).
Produções bibliográficas
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AZEVEDO, S. L. C. ; SOUZA, M. P. C. ; GUIMARAES, A. C. R. ; GALVAO, T. C. . Genomic surveillance: a potential shortcut for effective Chagas disease management. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz , v. 117, p. 2, 2022.
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AZEVEDO, S. L. C. ; GALVAO, T. C. ; COSTA, M. A. ; GUIMARAES, A. C. R. ; SOUZA, M. P. C. ; SOARES, R. F. . Identification of Trypanosoma cruzi ribose-5-phosphate isomerase inhibitors for Chagas disease chemotherapy: from an in vitro approach into the wilderness of exploring protein sequence-structure-function diversity. In: Ciclo Carlos Chagas de Palestras - 9a edição, 2021, Rio de Janeiro. 100+12 ANOS DA DESCOBERTA DA DOENÇA DE CHAGAS: O TEMPO NÃO PARA., 2021.
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AZEVEDO, S. L. C. ; GALVAO, T. C. ; GUIMARAES, A. C. R. ; SOARES, R. F. ; COSTA, M. A. ; SOUZA, M. P. C. . Identification of Trypanosoma cruzi ribose-5-phosphate isomerase inhibitors for Chagas disease chemotherapy: from an in vitro approach into the wilderness of exploring protein sequence-structure-function diversity. In: Ciclo Carlos Chagas de Palestras - 8a edição, 2020, Rio de Janeiro. 100+11 ANOS DA DESCOBERTA DA DOENÇA DE CHAGAS: O TEMPO NÃO PARA, MESMO QUE SEJAMOS FREADOS PELA SINDEMIA DE COVID-19, 2020.
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Borges, C. D. ; AZEVEDO, S. L. C. ; SOARES, R. F. ; COSTA, M. A. ; SOUZA, M. P. C. ; GALVAO, T. C. ; GUIMARAES, A. C. R. . Sequence diversity of Trypanosoma cruzi ribose-5-phosphate isomerase B: mapping and potential impact on drug design. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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AZEVEDO, S. L. C. ; GALVAO, T. C. ; GUIMARAES, A. C. R. ; SOARES, R. F. ; COSTA, M. A. ; SOUZA, M. P. C. . Identification of Trypanosoma cruzi ribose-5-phosphate isomerase inhibitors for Chagas disease chemotherapy: from na in vitro approach into the wilderness of exploring protein sequence-structure-function diversity. 2020. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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AZEVEDO, S. L. C. ; GALVAO, T. C. ; GUIMARAES, A. C. R. ; SOUZA, M. P. C. ; SOARES, R. F. ; COSTA, M. A. . Identificação de compostos inibidores da ribose-5-fosfato isomerase de trypanosoma cruzi para quimioterapia da doença de chagas: de uma abordagem in vitro à exploração da diversidade de sequência, estrutura e função. 2020. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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AMORIM, L. M. F. ; JESUS, L. C. ; AZEVEDO, S. L. C. . Desenvolvimento de aula prática: simulação da separação de creatina cinase por eletroforese. 2019. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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AZEVEDO, S. L. C. ; GALVAO, T. C. ; GUIMARAES, A. C. R. . Identificação de compostos inibidores da ribose-5-fosfato isomerase de trypanosoma cruzi para quimioterapia da doença de chagas: uma abordagem in vitro. 2019. (Apresentação de Trabalho/Outra).
Projetos de pesquisa
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2023 - Atual
Papel dos sistemas de dois componentes phoPQ, envZ-ompR, ssrAB e qseCB na regulação das ilhas de patogenicidade 1 e 2 de Salmonella enterica pelo ácido 3,4-dimetilbenzoico, Descrição: Os sistemas de dois componentes são mecanismos adaptativos desenvolvidos pelas bactérias para modular sua expressão de acordo com alterações em fatores ambientais como pH, temperatura, osmolaridade, entre outros. Os sistemas de dois componentes phoPQ, envZ-ompR, ssrAB e qseCB, especificamente, modulam a expressão de operons em Salmonella enterica sorovar typhimurium conhecidos como ilhas de patogenicidade (SPI) I e II que codificam mecanismos de virulência bacterianos conhecidos como sistema de secreção do tipo 3 que são fundamentais para o processo de invasão tecidual estabelecido pela Salmonella. Moléculas presentes na microbiota de mamíferos produzidas por microrganismos comensais, como o ácido-3,4-dimetilbenzóido (DMB), são capazes de inibir a colonização de microrganismos patogênicos por mecanismos ainda pouco explorados. Por essa razão, o presente projeto de pesquisa tem como objetivo caracterizar o efeito da exposição ao ácido-3,4-dimetilbenzóico em cepas de Salmonella enterica sorovar typhimurium que sejam knock-out para os genes dos reguladores de resposta phoP, qseB, ssrB e ompR para investigar se o efeito de inibição da expressão de genes de SPI I e II em Salmonella induzida pela exposição ao DMB (demonstrado por um trabalho anterior de nosso grupo) é mediada pela atividade dos sistemas de dois componentes.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Sophia Lincoln Cardoso de Azevedo - Coordenador / Teca Calcagno Galvão - Integrante / Luis Caetano Martha Antunes - Integrante / Carlos Eduardo Gaspar - Integrante.
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2022 - Atual
Investigação in silico do papel de substituições de sequência na enzima EthA de Micobacterium tuberculosis na resistência à etionamida, Descrição: A resistência a antibióticos é uma preocupação crescente em todo o mundo e a tuberculose (TB) figura como uma das principais doenças nesse cenário. A etionamida é um pró-fármaco utilizado no tratamento de TB multidroga resistente e, mesmo não sendo um fármaco de primeira linha, os registros de isolados clínicos de M. tuberculosis resistentes a esse antibiótico vêm crescendo. A atividade da etionamida depende de sua ativação pela enzima EthA e substituições de sequência nessa enzima caracterizam o principal mecanismo de resistência à etionamida descrito até o momento. Em 2022, a Organização Mundial da Saúde publicou um conjunto de dados que relacionava informações de sequenciamento de genoma completo com teste de sensibilidade a antibióticos para isolados clínicos de M. tuberculosis de diversas localidades. A partir desses dados, o objetivo do presente projeto é produzir uma análise das substituições de aminoácidos mais frequentes na proteína EthA dos isolados resistêntes à etionamida. Além disso, serão construídos modelos virtuais tridimensionais dos mutantes de EthA para uma análise do potencial impacto que as mutações podem ter na na estrutura e na atividade da proteína.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Sophia Lincoln Cardoso de Azevedo - Integrante / Teca Calcagno Galvão - Coordenador / Rodrigo Fernandes Machado - Integrante.
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2019 - 2022
Diversidade de sequência da ribose-5-fosfato isomerase B de Trypanosoma cruzi: mapeamento e impacto no desenho de quimioterápicos, Descrição: O tratamento atualmente disponível para a doença de Chagas está associados a muitos problemas, como resistência, efeitos adversos e redução significativa de sua eficácia durante a fase crônica da infecção. Por esta razão, novas alternativas terapêuticas são buscadas e diferentes trabalhos sugerem a enzima ribose-5-fosfato isomerase B de Trypanosoma cruzi (TcRpiB) como um potencial novo alvo farmacológico. Um trabalho prévio do LAGFB identificou por meio de abordagens in silico moléculas que potencialmente se ligam seletivamente a TcRpiB e que podem inibir sua atividade catalítica. No entanto, durante os testes experimentais para avaliar o efeito dessas moléculas sobre a atividade enzimática, foram observadas diferentes sequências de aminoácidos para a enzima TcRpiB sugerindo a ocorrência de diversidade genética. Por essa razão, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a extensão da diversidade de sequência dessa proteína a partir de informações de bancos de dados virtuais e avaliar se as variações de sequência mais frequentes poderiam impactar a atividade enzimática ou o desenho de novos inibidores para a TcRpiB. Este trabalho foi premiado como um dos melhores trabalhos da vigésima nona Reunião Anual de Iniciação Científica (RAIC) do IOC e indicado ao prêmio "Destaque na Iniciação Científica e Tecnológica 2022" do CNPQ.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Sophia Lincoln Cardoso de Azevedo - Integrante / Teca Calcagno Galvão - Integrante / Ana Carolina Ramos Guimarães - Coordenador / Rafael Ferreira Soares - Integrante / Mayla Abrahim Costa - Integrante / Marcos Paulo Catanho de Souza - Integrante.
Prêmios
2023
Scholar of the Yale-Proxima Mentorship Program - Class of 2023, Iniciativa próxima.
2021
Melhores trabalhos na 29ª Reunião Anual de Iniciação Científica, Instituto Oswaldo Cruz.
Histórico profissional
Experiência profissional
2022 - 2022
Universidade Federal FluminenseVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Monitora, Carga horária: 12
Outras informações:
Monitora bolsista da disciplina Políticas de Saúde no Brasil (MPS000025) do departamento de Planejamento em Saúde do Instituto de Saúde Coletiva da Universidade Federal Fluminense, sob orientação das professoras Dr. Claudia March e Verônica Fernandez.
2021 - 2022
Universidade Federal FluminenseVínculo: Voluntário, Enquadramento Funcional: Monitora, Carga horária: 12
Outras informações:
Monitora voluntária vinculada à disciplina Políticas de Saúde no Brasil do departamento de Saúde Coletiva da UFF, sob orientação da Prof. Dr. Claudia March. Atuou no apoio ao desenvolvimento de materiais didáticos, no atendimento aos alunos, na correção de atividades e na apresentação de aulas expositivas e dialogadas. Desenvolveu trabalho teórico sobre a presença de componentes curriculares relacionados à Saúde Coletiva e à Saúde Pública nas grades dos cursos de graduação em biomedicina, o qual foi apresentado na XXIII Semana de Monitoria da UFF e selecionado como melhor trabalho de monitoria voluntária do Instituto de Saúde Coletiva.
2023 - Atual
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Bolsista FIOTEC, Carga horária: 40
Outras informações:
Bolsista da Fundação de Apoio Técnico à FIOCRUZ no projeto "Microbiome mediation of intestinal virulence through dietary aromatic compound metabolism" sob orientação do Dr. Caetano Antunes no Laboratório de Bacteriologia Aplicada à Saúde Única e à Resistência Antimicrobiana. Desempenhou construção de cepas de Salmonella enterica sorovar typhimurium knock out para os genes dos reguladores de resposta phoP, ompR, qseB e ssrB pelo método Lambda-Red. Para isso, utilizou técnicas como PCR convencional para padronização dos experimentos, eletroforese em gel de agarose, eletroporação e análise de dados de sequenciamenro de Sanger.Também faz parte do projeto "Exploring the structural impact of mutations in the prodrug activator EthA and its contribution to ethionamide resistance in Mycobacterium tuberculosis" sob orientação de Dra Teca Galvão (IOC) e Dra Priscila Caprilles (UFJF). Neste projeto, desempenha análises de biologia estrutural com o mapeamento de sítios de mutações na estrutura tridimensional da proteína EthA utilizando o software pymol, minimização de energia através do software open babel, avaliação da qualidade dos modelos estrutruturais e análise do impacto das substituições sobre a interação proteína-ligante através da geração de mapas de interação 2D, análise do perfil farmacofórico e do potencial eletrostático.
2019 - 2022
Fundação Oswaldo CruzVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: estagiária, Carga horária: 20
Outras informações:
Bolsista do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica no Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática (LAGFB) do Instituto Oswaldo Cruz/Fiocruz sob orientação de Drª. Teca Galvão e Drª. Ana Carolina Ramos Guimarães. Desenvolveu, na parte experimental, técnicas como PCR convencional, eletroforese, clonagem em E. coli eletrocompetente e western-blotting. Na parte computacional teve experiência com bancos de dados virtuais de sequências biológicas (GenBank, SRA, UniProt e TriTrypDB), análise da qualidade de dados de sequenciamento de genoma completo usando o software FASTQC e modelagem comparativa. Além disso, desenvolveu competências transversais de pesquisa e comunicação através da apresentação periódica de seminários; da participação em eventos científicos; da produção periódica de relatórios e resumos do projeto; e do convívio com pesquisadores e outros estudantes dentro do grupo de pesquisa.
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