Taisa Magnani Dinamarco

Possui graduação em Farmácia bioquímica pela Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (2003) e Doutorado em Biociências Aplicadas à Farmácia pela Universidade de São Paulo (2008). É docente do Departamento de Química da Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto-USP.Tem experiência na área de Bioquímica e Genética de Microrganismos, com ênfase em Biologia Molecular. O objetivo do nosso grupo de pesquisa atualmente está concentrado nos estudos visando o aproveitamento de diversos resíduos industriais como Bagaço e palha de cana-de-açúcar, bagaço de uva, cascas de frutas, resíduos de indústrias de sucos e etc.

Informações coletadas do Lattes em 03/05/2022

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Farmacêuticas

2004 - 2008

Universidade de São Paulo
Título: Clonagem, expressão e caracterização do gene da oxidase alternativa mitocondrial de Aspergillus fumigatus.
Sérgio Akira Uyemura. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Graduação em Farmácia biquímica

1999 - 2003

Universidade de São Paulo
Título: Estudos moleculares da oxidase alternativa de Aspergillus fumigatus
Orientador: Sérgio Akira Uyemura
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

Pós-doutorado

2009 - 2012

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

Formação complementar

2007 - 2007

1 Encontro de citometria da Faculdade de Ciências. (Carga horária: 16h). , Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, FCFRP, Brasil.

2006 - 2006

Introdução ao uso da Interferência por RNA (RNAi). (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, SBBQ, Brasil.

2004 - 2004

Expressão diferencial de genes em fungos. (Carga horária: 34h). , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP, Brasil.

2004 - 2004

Radioproteção. (Carga horária: 40h). , Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, FMRP, Brasil.

Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.

Organização de eventos

WARD, R. J. ; SPILLER, V. R. ; BLACIDO, D. R. T. ; OLIVEIRA, A. C. ; Magnani, T. . III Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial. 2019. (Congresso).

WARD, R. J. ; SPILLER, V. R. ; OLIVEIRA, A. C. ; Magnani, T. ; BLACIDO, D. R. T. . II Encontro Nacional de Qumica Biotecnológica e Agroindustrial. 2017. (Congresso).

Magnani, T. . I Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial. 2015. (Congresso).

Magnani, T. . III Encontro Farmacêutico de Ribeirão Preto. 2002. (Congresso).

Participação em eventos

40th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals. 40th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals. 2018. (Congresso).

BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE 2017. LPMOS FROM ASPERGILLUS FUMIGATUS CAN INCREASE THE EFFICIENCY OF LIGNOCELLULOSIC BIOMASS BREAKDOWN. 2017. (Congresso).

Workshop on Second Generation Bioethanol 2016. Identification of LPMOs in Apergillus fumigatus secretome when grown in sugarcane bagasse. 2016. (Congresso).

XLII Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology. Ataxia-Telangiectasia Mutated Kinase (ATM) Regulates Mitochondrial Homeostasis In Aspergillus nidulans. 2013. (Congresso).

XL Annual Meeting of Sbbq. Identification of new Aspergillus fumigatus calcineurin. 2011. (Congresso).

XXXVIII Annual Meeting of The Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq). 2010. (Congresso).

33rd FEBS Congress - Biochemistry of Cell Regulation. 2008. (Congresso).

XXXVII Annual Meeting of SBBq and XI Congress of the PABMB. 2008. (Congresso).

XXXVI Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology. 2007. (Congresso).

XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2006. (Congresso).

5th International Congress of Pharmaceutical Science. 2005. (Congresso).

XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2005. (Congresso).

1 Simpósio Internacional de Pós-graduação de Pesquisa da FCFRP/USP. 2004. (Seminário).

XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2004. (Congresso).

4th Congress of Pharmaceutical Sciences. 2003. (Congresso).

II ENFARP - Encontro Farmacêutico de Ribeirão Preto. 2000. (Congresso).

I Simpósio de Biologia Molecular Aplicada à Análises Clínicas. 1999. (Simpósio).

Participação em bancas

Aluno: Luísa Czamanski Nora

ROCHA, R. S.;Magnani, T.; TOSI, L. R. O.; FILL, T.. Development of synthetic biology tools applied to fungi of medical and industrial importance. 2019. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Aluno: Amanda Beatriz Candelaria da Silva

MENDES JUNIOR, C. T.; FERREIRA, D. M.; SILVA, R. H. A.; Dinamarco, T. M.. Caracterização da diversidade genética das regiões regulatórias e codifcantes do gene SLC24A5 e associações com fenótipos de pigmentação humana em amostra da população brasileira. 2019. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Mariana Dias Ferreira

Magnani, T.; OLIVEIRA, A. C.; CABRAL, H.; RULLER, R.. Identificação, clonagem e expressão de proteínas secretadas de Rhodosporidium fluviale cultivada em lignina. 2018. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Luis Eduardo Gerolamo

Magnani, T.; OLIVEIRA, A. C.; DAMASIO, A. R. L.;Ferreira, Márcia ES. Clonagem, purificação e caracterização de duas proteínas acessórias de Aspergillus fumigatus envolvidas na desconstrução do bagaço de cana de açúcar. 2018. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Aline Vianna Bernardi

WARD, R. J.; ROCHA, R. S.;MALAVAZI, I.Magnani, T.. identificação das principais enzimas hidrolíticas de Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-acucar. 2017. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Lais Faria de Sousa

OLIVEIRA, A. C.;Magnani, T.; PEDROSA, A. L.. Analise proteomica de parasitas superexpressores da LmNDK e superexpressão da enzima inativa. 2017. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: André Luís Condeles

TOLEDO, J. C.; LEOPOLDINO, A. M.;Magnani, T.. Atividade peroximitrito redutase de tiol peroxidases em células. 2017. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Lucas Diniz Giraldeli

SPILLER, V. R.;Magnani, T.; TOMMASO, G.; MAINTINGUER, S. I.. Efeito de derivados de hidrólise de biomassa de algas sobre a produção biológica de H2 por diferentes espécies de Clostridium sp. 2017. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Bruna Constante Fonseca

SILVA, M. B. V.; SPILLER, V. R.;Magnani, T.. Produção de Hidrogênio por fermentação por um novo isolado de Clostridium beijerinckii. 2016. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Bruno Bonamichi Bueno

NATSUI, A. P.; SOARES, R. M.;Magnani, T.. Em busca de proteínas solúveis de Neospora caninum. 2016. Dissertação (Mestrado em Biociências Aplicadas à Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Raíssa Ferrari

Magnani, T.; DORTA, D. J.. Quantificação de PBDEs em amostras de sedimentos em Ribeirão Preto e avaliação da toxicidade do BDE-209 em células HepG2 sob influência de indução autofágica. 2016. Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Eliza Vieira Davi

Russo, EMS; CUNHA, A. F.;Magnani, T.. Clonagem de fragmentos dos genes gag e env do HIV-1 e HTLV-1, expressão em E. coli das proteínas gp21, p24 e gp46 do HTLV-1 e imunodetecção.. 2015. Dissertação (Mestrado em Biociências Aplicadas à Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Fillipe Luiz Rosa do Carmo

Russo, EMS; CABRAL, H.;Magnani, T.. Clonagem, expressão e caracterizacao do fator estimulador de colônia de granulóciitos humano recombinante (rhg-CSF) em Escherichia coli.. 2014. Dissertação (Mestrado em Biociências Aplicadas à Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Heliara Maria Spina Canela

BALIEIRO, M. H. S. F.; ALMEIDA, M. T. G.;Magnani, T.. Análise Molecular da anidrase carbônica no fungo patogêncio humano Aspergillus fumigatus. 2013. Dissertação (Mestrado em Biociências Aplicadas à Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Elise Marques Freire Cunha

OLIVEIRA, A. C.; PEDROSA, A. L.; MURAKAMI, M. T.; TOSI, L. R. O.; BORGES, J. C.;Dinamarco T. M.. Estudos estruturais e funcionais do fator inibitório da migração dos macrófagos de leishmania major (LmMIF2) e de mutantes da região Carboxi-terminal. 2019. Tese (Doutorado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Maryanne Trafani de Melo

TEDESCO, A. C.; FREITAS, L. A. P.; SILVA JUNIOR, R. M. P.; CAVALCANTE, A. H.;Dinamarco T. M.; QUAGLIO, L. M.. Preparo, caraterização e aplicação em engeharia de tecidos de suportes de alginato/quitosana, associados a processos fotodinâmicos para fotobioestimulação. 2019. Tese (Doutorado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Evandro Ares de Araújo

POLIKARPOV, I.; OLIVEIRA NETO, M.; CRAIEVICH, A. F.;Magnani, T.; BARBOSA, L. R. S.. Explorando as relações entre estrutura e função das hidrolases de glicosídeos das famílias 9, 48 e 74. 2018. Tese (Doutorado em Física Aplicada) - Instituto de Física de São Carlos/USP.

Aluno: Thiago Augusto Gonçalves

Squina, F. M.; LABATE, C. A.; OLIVEIRA, J. V. C.; TERRASAN, C. R. F.;Magnani, T.. Caracterização da expressão genica de fungos filamentosos na desconstrução do bagaço de cana de açucar. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Renata Nishida Goto

LEOPOLDINO, A. M.; ANTUNES, L. M. G.; TONE, L. G.; SILVA, L. L. P.;Magnani, T.. Estudo in vitro e in vivo de novos compostos: com alvo-específico (hnRNP K e SET) ou com ação na mitocôndria para uso como antitumoral em carcinoma oral ou como citoprotetor em célula não-tumoral.. 2017. Tese (Doutorado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Marcos Alexandre Bezerra

NATSUI, A. P.; CABRAL, H.; Russo, EMS;Magnani, T.; ANDRE, M. R.. Identificação e caracterização d eproteinas de superficie da familia SRS do Apicomplexa Neospora caninum. 2017. Tese (Doutorado em Biociências Aplicadas à Framácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Ana Cristina Colabardini

Goldman, G. H.; ROSSI, N. M. M.; Uyemura, Sérgio Akira;Magnani, T.; SILVA, A. M.. Análise funcional dos genes que codificam as proteínas quinases pkcA e ypkA em Aspergillus nidulans.. 2014. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Aluno: CRISTIANA BERNADELLI GARCIA

LEOPOLDINO, A. M.; MARQUI, A. B. T.; CABRAL, H.; SCAPULATEMPO NETO, C.;Magnani, T.. Acúmulo da ribonucleoproteína nuclear K em câncer de cabeça e pescoço: estudos mitocondriais.. 2014. Tese (Doutorado em Biociências Aplicadas à Framácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Paula Fagundes de Gouvêa

Goldman, Gustavo H; Gomes, M D; Uyemura, S.A.; Squina, F. M.;Magnani, T.. Estudos genéticos e moleculares da produção de celulases e hemicelulases em Aspergillus nidulans e Aspergillus niger. 2013 - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto.

Aluno: Aline Vianna Bernardi

Magnani, T.; SPILLER, V. R.; OLIVEIRA, A. C.. Enzimas. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Bruna Constante Fonseca

CIANCAGLINI, P.; SPILLER, V. R.;Magnani, T.. Produção de energia na célula. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Maria Julia Tasso

DORTA, D. J.; OLIVEIRA, A. C.;Magnani, T.. Fosforilação Oxidativa. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Mauricio Cristiano Rocha Júnior

QUINTANA, V. H. A.; BALIEIRO, M. H. S. F.;Magnani, T.. Developmente and validation of a Multiplex Real-time PCR for HTLV-1/2 confirmatory diagnosis. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biociências Aplicadas à Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP.

Aluno: Dhara Cavalcante de Oliveira

Russo, EMS; CASTILHO, R. F.; Dinamarco, T. M.. Expressão heteróloga em S. cerevisiae da translocase de membrana mitocondrial interna Tom20 de A. fumigatus. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Biociências e Biotecnologia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Beatriz da Cruz Mermejo

SPILLER, V. R.; WARD, R. J.; Dinamarco, T. M.. Conversão eletroquímica do Glicerol: comparação entre as vias fermentativa e eletroquímica.. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Maiko Luis Carlos

Magnani, T.; CAIUT, J. M. A.; TEDESCO, A. C.. Uso de fármaco fotossensibilizante para o tratamento da doença de Alzheimer por destruição seletiva das placas amiloides via fotobiomodulação.. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Raul Ghiraldelli Miranda

Magnani, T.; LEOPOLDINO, A. M.; DORTA, D. J.. Uso de cultura de células HepaRG em ambiente tridimensional como ferramenta alternativa na avaliação da autofagia induzida por retardantes de chamas bramados. 2018. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Thalita Marques da Silva

SPILLER, V. R.; OLIVEIRA, A. R. M.;Magnani, T.. Estudo da fase solventogenica do Clostridium beijerinckii Br21 utilizando xilose como substrato. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Mariana Antão Cavalcanti

Russo, EMS; ANTONIETTO, K. S.;Magnani, T.. Estudos de meios alternativos para produção de peptidase heteróloga expressa em Pichia pastoris. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Luis Eduardo Gerolamo

Magnani, T.; OLIVEIRA, A. C.; CABRAL, H.. Clonagem, purificação e caracterização de duas proetínas acessórias de Aspergillus fumigatus envolvidas na desconstrução do bagaço de caba de açúcar. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Aline Viana Bernardi

OLIVEIRA, A. C.; ROCHA, R. S.;Magnani, T.. Identificação das principais enzimas hidrolíticas de A. fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: André Luís Condeles

TOLEDO, J. C.; MENDES JUNIOR, C. T.;Magnani, T.. Investigação da atividade detoxificadora de peroxinitrito por Peroxirredoxinas em celulas. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Letícia Marcorin

CASTELLI, E. C.; MENDES JUNIOR, C. T.;Magnani, T.. Implicação da diversidade genética de regiões regulatórias e exônicas do gene MITF na diferenciação de populações globais. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Mario Henrique Panziani

Ferreira, Márcia ES; SALTORATTO, A. L. F.;Magnani, T.. Caracterização funcional dos genes codificadores de proteínas ADP-Ribosilation Factor no fungo filamentoso patogenico Aspergillus fumigatus. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Biociências Aplicadas à Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Mariana Dias Ferreira

OLIVEIRA, A. C.; GUIMARAES, L. H. S.;Magnani, T.. Analise do secretoma da levedura Rhodoporidium fluviale cultivada em lignina para identificação de enzimas de interesse biotecnológico.. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Bárbara de Oliveira

SPADARO, A. C. C.;Magnani, T.; RODRIGUES, F. P.. Avaliação da toxicidade dos herbicidas trifluralina e terbutirium utilizando ensaios mitocondriais. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Biociências Aplicadas à Farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto.

Aluno: Bruna Constante Fonseca

WARD, R. J.; SPILLER, V. R.;Magnani, T.. Produção de Hidrogênio por fermentação a partir de galactose por uma nova cepa de Clostridium beijerinckii Br21 isolada de um sistema de tratamento de vinhaça.. 2015. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Maria Julia Tasso

DORTA, D. J.; VALIM, Y. M. L.;Magnani, T.. Structural diffrence between flavonoids Kaempferol and Morin is capable to cause distinct affects in HepG2 cells.. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Tatiana Belini Andre

DORTA, D. J.; CIANCAGLINI, P.;Magnani, T.. Baicaleína interfere com a bioenergética mitocondrial, apesar de sua ação antioxidante.. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Aluno: Deborah Kimie Yonamine

Dinamarco T. M.GOLDMAN, M. H. S.; LUBINI, G.. Caracterização funcional de uma endoglucanase GH7 e uma celobiohidrolase de Aspergillus fumigatus. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Magnani, T.. Banca de Arguição para Ingresso no Doutorado do Programa de Pós Graduação em Química. 2016. Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP.

Comissão julgadora das bancas

Mario Henrique de Barros

BARROS, M. H.. Clonagem, expressão e caracterização do gene da oxidase alternativa mitocondrial de Aspergillus fumigatus. 2008. Tese (Doutorado em Biociências e Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Ana Patricia Yatsuda Natsui

Uyemura, S.A.; BARROS, M. H.; Boreck, J; GOLDMAN, G.;YATSUDA, A. P.. Clonagem, expressão e caracterização do gene da oxidase alternativa mitocondrial de Aspergillus fumigatus. 2008. Tese (Doutorado em Biociências aplicadas à farmácia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto-USP.

Orientou

Lucas Matheus Soares Pereira

Avaliação do potencial biotecnológico de uma nova -glicosidase do fungo termófilo Aspergillus fumigatus; Início: 2020; Dissertação (Mestrado profissional em Biociências e Biotecnologia) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Deborah Kimie Yonamine

Efeitos da ORF Nsp4 de Sars-Cov-2 sobre a função mitocondrial em hepatócitos; ; Início: 2020; Tese (Doutorado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Luis Eduardo Gerolamo

Avaliação do efeito das LPMOs (Afu1g12560 e Afu4g07850) de Aspergillus fumigatus, nos processos de hidrólise de material lignocelulósico; Início: 2018; Tese (Doutorado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; (Orientador);

Paula Fagundes Gouvea

Início: 2018; Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Luis Eduardo Gerolamo

Clonagem, purificação e caracterização de duas proteínas acessórias de Aspergillus fumigatus envolvidas na desconstrução da biomassa de cana-de-açúcar; ; 2016; Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Aline Vianna Bernardi

Análise transcricional do fungo Aspergillus fumigatus, quando crescido em bagaço de cana de açúcar; 2015; Dissertação (Mestrado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Aline Vianna Bernardi

Caracterização e melhoramento genético de quatro enzimas hidrolíticas de Aspergillus fumigatus envolvidas na desconstrução do bagaço de cana-de-açúcar; 2017; Tese (Doutorado em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Paula Fagundes Gouvea

2015; Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Taisa Magnani Dinamarco;

Deborah Kimie Yonamine

Caracterização funcinal de uma endoglucanase GH7 e uma celobiohidrolase GH6 de Aspergillus fumigatus; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biologia) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

BRENDA KETSIRE CHAUCA ASTETE

Avaliação da expressão de LPMO em ulturas com lignina; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Escuela Académico Profesional) - Universidad del Santa; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Aline Vianna Bernardi

Análise do secretoma do fungo Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Luiz Augusto dos Santos Koike

Avaliação das propriedades bioquímicas e do potencial hidrolítico de uma monoxigenase lítica de polissacarídeo de A; fumigatus (AfAA9_B); ; 2019; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica-CNPq; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Deborah Kimie Yonamine

Caracterização funcional da endoglucanase GH7 de Aspergillus fumigatus; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Lucas Matheus Soares Pereira

Investigando as propriedades da LPMO (AfuLPMO9C) de Aspergillus fumigatus durante a hidrólise enzimática; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica-CNPq; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Ana Lívia Vezzoso

Caracterização funcional de novas enzimas hidrolíticas de Aspergillus fumigatus; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Programa Unificado de Bolsas de Estudos - USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Ana Laura Totti Benatti

Clonagem, expressão e caracterização funcional de uma enzima hidrolítica do tipo LPMOs (AA9) do fungo Aspergillus fumigatus; ; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Jean Junior Moraes Resende

Clonagem, expressão e caracterização funcional de uma enzima hidrolítica do tipo LPMOs (AA9) do fungo Aspergillus fumigatus; ; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

VALÉRIA SANTANA DOS SANTOS

Clonagem, expressão e caracterização funcional de uma enzima hidrolíticdo fungo Aspergillus fumigatus; ; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Deborah Kimie Yonamine

Caracterização funcional de uma xilanase GH10; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Lucas Matheus Soares Pereira

Avaliação da atividade de diferentes LPMO na aticidade auxiliar de hidrólise de biomassa lignocelulósica; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Luis Eduardo Gerolamo

Análise do secretoma de Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP, Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica-CNPq; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Gisele Daiani Pegorin

Expressão heteróloga dos genes da xilose redutase e da xilitol desidrogenase em cepas de S; cerevisiae; ; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirao Preto- USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Ana Carolina Alvarenga

Estudos bioquímicos e moleculares dos componentes clássicos e alternativos mitocondriais em Aspergillusfumigatus: Transportador de NAD+/NADH; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia Bioquímica) - Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP, Programa Institucional de Bolsas de Iniciação Científica-CNPq; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Raíssa Ferrari

Programa de Aperfeiçoamento ao ensino (PAE); 2014; Orientação de outra natureza; (Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Maria Julia Tasso

Programa de Aperfeiçoamento ao ensino (PAE); 2014; Orientação de outra natureza; (Química) - Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirão Preto- USP; Orientador: Taisa Magnani Dinamarco;

Foi orientado por

Gustavo Henrique Goldman

2010; Faculdade de Ciencias Farmaceuticas de Ribeirao Preto, USP,; Gustavo Henrique Goldman;

Produções bibliográficas

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  • Magnani, T. ; MARTINS, V. P. ; SORIANI, F. M. ; TUDELLA, V. G. ; CURTI, C. ; UYEMURA, S. A. . Cloning and sequence of an alternative oxidase from Aspergillus fumigatus. In: 1 Simpósio Internacional de Pós-graduação de Pesquisa da FCFRP/USP, 2004, Ribeirão Preto. 1 Sinpospq, 2004.

  • SORIANI, F. M. ; Magnani, T. ; MARTINS, V. P. ; TUDELLA, V. G. ; SANTOS, A. C. ; UYEMURA, S. A. . Cloning and sequencing of Ca+2 ATPase from Aspergillus fumigatus. In: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2003, Caxambu. XXXII Reunião Anual Programa e Resumos, 2003. p. 92.

  • MARTINS, V. P. ; Magnani, T. ; SORIANI, F. M. ; GOLDMAN., G. ; UYEMURA, S. A. . Cloning of genes encoding the mitochondrial alternative oxidase in P. brasiliensis and A. fumigatus. In: 4th Congress of Pharmaceutical Sciences, 2003, Ribeirão Preto. Brazilian Journal of Pharmaceutical Sciences (RBCF), 2003. v. 39. p. 81.

  • Magnani, T. ; UYEMURA, S. A. ; MARTINS, V. P. ; SORIANI, F. M. ; TUDELLA, V. G. . Clonagem do gene da oxidase alternativa mitocondrial em Aspergillus fumigatus. In: XI Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2003, Ribeirão Preto. SIICUSP 2003, 2003.

  • Magnani, T. ; SORIANI, F. M. ; TUDELLA, V. G. ; MARTINS, V. P. ; UYEMURA, S. A. . Estudos Moleculares da Oxidase Alternativa de Aspergillus fumigatus. In: 10 Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2002, Ribeirão Preto. SIICUSP 2002, 2002.

  • MARTINS, V. P. ; Magnani, T. ; SORIANI, F. M. ; TUDELLA, V. G. ; UYEMURA, S. A. . Estudos moleculares da Oxidase Alternativa no fungo sistêmico Paracoccidioides brasiliensis. In: X Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo, 2002, Ribeirão Preto. SIICUSP 2002, 2002.

  • Dinamarco T. M. . IDENTIFICATION OF DIFFERENT LYTIC POLYSACCHARIDE MONOOXYGENASES IN ASPERGILLUS FUMIGATUS SECRETOME WHEN GROWN IN SUGARCANE BAGASSE. 2016. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Dinamarco T. M. . Análise transcricional do fungo Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Dinamarco, T. M. ; SAVOLDI, M. ; Goldman, G. H. . Identification of new Aspergillus fumigatus calcineurin targets. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

  • 2022 - Atual

    Desenvolvimento de estratégias para aproveitamento de celulases através do bioprocessamento consolidado(CBP)., Descrição: Resíduos lignocelulósicos são uma fonte promissora de polissacarídeos que podem ser convertidos em uma variedade de compostos, que vão desde biocombustíveis até bioplásticos. A maior parte desses resíduos podem substituir produtos originados do petróleo, representando uma importante vantagem ambiental. Os materiais lignocelulósicos são teoricamente ilimitados, mais baratos e não competem com as culturas alimentares. No entanto, a principal limitação do seu uso é que a conversão desses materiais em açúcares mais simples geralmente requer enzimas celulolíticas, que ainda estão associadas a um alto custo de produção, o que é considerado um dos principais entraves na valorização econômica desse processo. O conceito de bioprocessamento consolidado (CBP) é uma abordagem promissora para a conversão econômica de biomassa vegetal em combustíveis e produtos químicos e é descrito como uma alternativa para a redução no consumo e custos de celulases. Esse conceito se baseia na utilização de microrganismos que podem hidrolisar as frações celulósica e hemicelulósica da biomassa pré-tratada e, simultaneamente, converter os açúcares monoméricos liberados em produtos úteis. As leveduras são os microrganismos de escolha no CBP, pois podem produzir altos rendimentos de biocombustíveis ou seus precursores moleculares. No entanto, as leveduras utilizadas não são capazes de produzir enzimas que degradam as biomassas de forma eficiente e nesse cenário a engenharia de leveduras, juntamente com a biologia sintética se destacam por permitirem a expressão de enzimas celulolíticas e hemicelulolíticas em leveduras fermentativas. Resultados das contínuas e recentes pesquisas no nosso Laboratório de Biotecnologia de Proteínas da FFCLRP (FAPESP: Processos 2014/10466-0, 2016/19095-0 e 2018/10296-8) apontam para a viabilidade do uso concomitante na hidrólise de biomassas de novas enzimas identificadas pelo nosso grupo de pesquisa. Com isso, a nossa proposta visa à expressão de enzimas celulolíticas em cepas de S. cerevisiae de interesse industrial, que poderão ser empregadas no Bioprocessamento consolidado. A edição genômica será realizada pelo sistema enzimático quimérico CRISPR/Cas, uma ferramenta muito poderosa que está revolucionando as abordagens de engenharia genética e ampliando o repertório de organismos geneticamente modificados (OGM), e por isso desperta o interesse não apenas da pesquisa básica, mas também da indústria biotecnológica. As cepas construídas serão aplicadas no Bioprocessamento consolidado, utilizando diferentes biomassas. Esta etapa do projeto será realizada em cooperação com a Dra. Lucília Domingues do "B. Factory group- Molecular Biotechnology, Bioreactors, Biofuels and Food research group" da Universidade do Minho (Braga, Portugal). Espera-se que os resultados permitam a implantação de tecnologias de segunda geração para a produção sustentável de bioetanol e derivados químicos, a partir de biomassas a um custo muito menor do que a tecnologia atual.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2017 - 2020

    CNPq 42546520160: Identificação, caracterização e expressão funcional de enzimas auxiliares hidrolíticas do tipo LPMOs do fungo Aspergillus fumigatus., Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador / Luis Eduardo Gerolamo - Integrante / Aline Vianna Bernardi - Integrante / Paula Fagundes Gouvea - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2017 - 2019

    FAPESP 2016/19095-0: Identificação, caracterização e expressão funcional de enzimas auxiliares hidrolíticas do tipo LPMOs do fungo Aspergillus fumigatus., Descrição: Nos últimos 4 anos a agroindústria canavieira brasileira foi um dos setores que mais se desenvolveu no pais. Dentre os principais países produtores, o Brasil está na liderança com uma área superior a 9 milhões de hectares utilizados pelo setor sucroalcooleiro e é responsável por uma produção anual de 632 milhões de toneladas de cana-de-açúcar. De todo o açúcar redutor recuperável a partir de biomassa lignocelulósica, 56% é destinado à produção de etanol e 44% para o processamento de açúcar comercial O processo tradicional de produção de etanol de primeira geração envolve o esmagamento dos colmos para obtenção de caldo, um material rico em sacarose, o qual é, subsequentemente, fermentado pela levedura S. cerevisiae em condições anaeróbias. No entanto, cerca de 30% da massa da cana-de-açúcar é perdida na forma de palha e bagaço. O resíduo lignocelulósico apresenta composição de 32-48% de celulose, 23-27% de hemicelulose e 19-32% de lignina. A conversão eficiente da biomassa lignocelulósica em açúcares solúveis é um grande desafio tecnológico, o qual limita a produção eficiente desse material em produtos químicos e biocombustíveis. Na natureza, o processo é conseguido pela ação de uma grande variedade de celulases, xilanases e enzimas auxiliares. Neste contexto, os fungos filamentosos conhecidos pela sua capacidade em produzir enzimas hidrolíticas capazes de clivar a biomassa lignocelulósica ganhou relevância nos últimos anos, dentre eles o A. fumigatus. Apesar de sua patogenicidade, o A. fumigatus apresenta um destacado potencial biotecnológico relacionado com a desconstrução de resíduos vegetais como o bagaço, fazendo frente até mesmo ao produtor padrão T. reesei, uma vez que é considerado um importante produtor de celulases, hemicelulases, amilases, lignases, lipases, proteases, quitinases e fosfatases, que juntas apresentam alto grau de sinergia. Resultados obtidos pelo nosso grupo de pesquisa em que caracterizou o secretoma e o transcriptoma de A. fumigatus, quando cultivado em bagaço de cana-de-açúcar, revelaram a secreção de 54 enzimas hidrolíticas caracterizadas como Carbohydrate-Active enzymes (CAZy enzymes) e a super-expressão de 145 genes codificadores desse mesmo grupo de enzimas, dentre eles diferentes mono-oxigenases líticas de polissacarídeos (LPMOs). As LPMOs são classificadas como enzimas com Atividades Auxiliares (AA) descritas em diferentes bactérias e fungos e apresentam um importante papel na desconstrução da biomassa lignocelulósica, pois apresentam mecanismos de ação oxidativo capaz de impulsionar a atividade de enzimas canônicas como celulases e hemicelulases. São classificadas em 4 classes principais, sendo as classes de AA9, AA10 e AA11 as de maior interesse atualmente. Estudos recentes, nos quais coquetéis enzimáticos comerciais foram suplementados com LPMOs purificadas, mostrou um aumento na eficiência de degradação da biomassa lignocelulósica, destacando a importância dessas enzimas na hidrólise da biomassa. Nesse contexto, o principal objetivo deste trabalho é a caracterização do perfil de expressão das diferentes LPMOs de A. fumigatus em uma variedade de substratos e a expressão heteróloga de quatro LPMOs identificadas como super-expressas nesses substratos em que o fungo foi cultivado. A purificação e caracterização dessas enzimas permitirá uma maior compreensão do papel desempenhado por elas na hidrólise da biomassa, o que poderá ajudar a aumentar a eficiência dos coquetéis enzimáticos disponíveis no mercado atualmente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador / Luis Eduardo Gerolamo - Integrante / Aline Vianna Bernardi - Integrante / Paula Fagundes Gouvea - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2014 - 2016

    Processo Fapesp: 2014/10466-0. Análise transcricional do fungo Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar., Descrição: Atualmente, o Brasil produz mais de 25 bilhões de litros de etanol por ano a partir da cana-de-açúcar, o que representa aproximadamente 33% de toda produção mundial, destacando-o em um importante papel na futura demanda deste combustível. Para manter estes índices, são necessários investimentos compatíveis para geração de novas tecnologias na conversão da cana-de-açúcar para etanol. Atualmente, a produção de etanol ocorre a partir de tecnologias de primeira geração que utilizam a sacarose da cana-de-açúcar como fonte energética. Cerca de um terço da energia da planta é usada para a produção de etanol e açúcar, enquanto que o restante permanece no campo na forma de bagaço e palha, produzindo o maior resíduo da agroindústria brasileira. A grande quantidade de bagaço gerado, a fácil disponibilidade e o baixo custo estimulam os estudos para a produção de etanol, podendo o Brasil se tornar uma grande potência no desenvolvimento de etanol de segunda geração. Biocombustíveis de segunda geração podem ser produzidos a partir dos açúcares liberados da parede celular dos resíduos de origem vegetal, como o bagaço de cana-de-açúcar. A biomassa da cana-de-açúcar é constituída de material lignocelulósico, principalmente celulose, hemicelulose, que são polissacarídeos de açúcares de alta energia e que podem ser convertidos a etanol. No entanto, a associação entre a celulose, hemicelulose e pectina impõem grandes dificuldades para recuperar os açúcares constituintes sob a forma de monômeros com elevado grau de pureza. Devido à essa característica recalcitrante do bagaço, um grande desafio na produção de combustíveis de segunda geração é a conversão de substratos lignocelulósicos em açúcares fermentáveis. Com isso se tornam necessários pré-tratamentos mecânico ou químico eficazes, que visam destruir a estrutura celular do bagaço, para posterior hidrólise enzimática. Na natureza, os fungos e bactérias desempenham uma importante função na degradação da biomassa de plantas, pois secretam diferentes enzimas específicas para os polissacarídeos constituintes. Muitas destas enzimas são estudadas, caracterizadas e catalogadas no banco de dados CAZy, sendo as mais abundantes da classe das glicosil hidrolases (GH) e carboidrato esterases (CE). No entanto, pouco ainda é conhecido sobre a resposta dos fungos aos diferentes materiais lignocelulósicos e sobre a produção de enzimas e proteínas acessórias necessárias à quebra da biomassa vegetal. Atualmente estas as enzimas são mais estudadas em fungos como Aspergillus niger e Trichoderma reesei. Porém, outros membros do gênero Aspergillus são capazes de secretar enzimas hidrolíticas de extrema importância, dentre eles o A. fumigatus. Apesar do A. fumigatus ser um fungo patogênico, é considerado um importante produtor de enzimas como celulases, lipases e xilanases, cujo efeito sinérgico aumenta a eficiência hidrolítica das enzimas secretadas, mas ainda pouco se sabe sobre essas enzimas, fato que ressalta a importância do melhor entendimento deste mecanismo em A. fumigatus. Nesse sentido, os principais objetivos deste trabalho são: (i) a análise do perfil transcricional de A. fumigatus quando crescido na presença de bagaço de cana-de-açúcar, através de técnicas de RNA-seq; (ii) identificação das enzimas secretadas no meio através de LC-MS/MS (Secretoma); (iii) caracterização em S. cerevisiae PE-2 das 5 enzimas hidrolíticas mais expressas no RNA-seq. A análise dos dados de RNA-seq, bem como a determinação do secretoma desta espécie, poderá trazer novos conhecimentos das enzimas hidrolíticas que favoreçam sua aplicabilidade industrial, com ênfase no etanol de segunda geração.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

  • 2013 - 2017

    Projeto Temático FAPESP 2012/23942-9:A função de genes que codificam fosfatases na virulência e na patogenicidade de Aspergillus fumigatus, Descrição: A. fumigatus é um fungo patógeno primário e oportunista, alergênico, que também causa asma severa e sinusites em pacientes imunocompetentes. Devido ao fato de que A. fumigatus produz quantidades prodigiosas de conídios, o trato respiratório humano está continuamente exposto ao fungo. Os conídios alcançam as vias aéreas por inalação e chegam ao pulmão devido ao seu pequeno tamanho; nos alvéolos tornam -se ativos e germinam. O sensoriamento e a obtenção de nutrientes essenciais do ambiente são características fenotípicas que estão associados ao crescimento do saprófita A. fumigatus em ambientes inóspitos. Apesar da importância médica e ecológica, a biologia básica deste organismo é mal compreendida. Dentre os aspectos da fisiologia celular de A. fumigatus, o funcionamento do ajuste fino do balanço entre fosforilação e defosforilação de alvos proteicos ainda é pouco conhecido. Uma vez que as modificações pós-traducionais envolvendo transferência e remoção de grupamentos fosforil de proteínas é um dos mais importantes eventos que têm consequência na sinalização celular em células eucarióticas, os principais objetivos deste projeto são: (i) a caracterização molecular de genes modulados ao nível transcripcional por CrzA, um fator de transcrição chave na via de sinalização de cálcio/calcineurina o qual está posicionado downstream à fosfatase calcineurina. Os genes em questão foram previamente identificados por Chromatin Immunoprecipitation seguida por sequenciamento de DNA (Chip-Seq); (ii ) a caracterização molecular de todos os genes que codificam proteínas fosfatases em A. fumigatus e o seu envolvimento em virulência e patogenicidade; (iii) a verificação da participação das diferentes fosfatases de A. fumigatus nas via de sinalização de integridade da parede celular (CWIP cell wall integrity pathway e osmoresistência (HOG High Osmolarity Glycerol ); e (iv) a identificação global de alvos regulados ao nível transcripcional e proteico por fosfatases de A. fumigatus. Para o cumprimento desses objetivos propostos esses genes serão deletados e os fenótipos das linhagens mutantes bem como a sua virulência e patogenicidade investigadas, tanto no modelo alternativo Galleria mellonella, assim como no modelo de imunossupressão em camundongos. As abordagens propostas neste trabalho poderão ser capazes de descrever novos genes reguladores (e não somente os efetores) nesses processos. Além disso, os resultados obtidos a partir do estudo desses genes irão proporcionar novos conceitos a respeito da biologia e dos mecanismos de sinalização e adaptação ao ambiente do hospedeiro em A. fumigatus... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Integrante / Iran Malavazi - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.

  • 2009 - 2012

    Caracterizacao molecular de genes que participam da via calcineurina-crza em Aspergillus fumigatus (Fapesp 2009/50506-2), Descrição: O Aspergillus fumigatus é um fungo filamentoso que apresenta pouca incidência em indivíduos imunocompetentes. Entretanto, nas últimas décadas, esta incidência tem aumentado em pacientes com neutropenia, na doença granulomatosa crônica e na AIDS. Muito pouco é conhecido sobre a regulação dos níveis de cálcio neste fungo e tem sido descrito que os íons cálcio têm importância crucial no controle de vários processos biológicos. A sinalização celular promovida pela fosfatase calcineurina, mediada por cálcio, altera o nível de expressão de diversos genes. A modulação da transcrição gênica pela calcineurina está relacionada à ativação de proteínas ou fatores de transcrição específicos que possuem motivos de ligação (?docking site?) à calcineurina, semelhantes à PxIxIT encontrados no NFAT e CrzA. Para a elucidação desta via de sinalização, foram realizadas análises computacionais que revelaram a presença de ?docking sites? para calcineurina em diferentes proteínas e fatores de transcrição. Neste contexto, o presente projeto visa a caracterização molecular dos fatores de transcrição Rpn4 e Seb1 e do trocador Ca2+/H+ vacuolar VcxA em A. fumigatus, que apresentaram o motivo semelhante ao PxIxIT. Esta abordagem tem como objetivo avaliar as alterações fenotípicas destes mutantes como a virulência, crescimento e sensibilidade destas cepas na presença de agentes produtores de radicais livres e antibióticos, bem como o entendimento da transdução de sinal mediada por cálcio neste fungo. Além disto, serão determinadas e caracterizadas as proteínas que interagem com a calcineurina durante a sinalização celular. Para tanto, a abordagem adotada será a inserção de uma cauda S-tag na calcineurina, a qual permitirá sua posterior purificação, bem como das proteínas que interagem com ela, permitindo assim a sua identificação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

  • 2007 - 2010

    Vias alternativas mitocondriais: Estudos da NADH desidrogenase alternativa e oxidase alternativa em fungos (processo FAPESP 06/04909-0), Descrição: : O Aspergillus fumigatus é um fungo saprofítico, amplamente distribuído no mundo. A principal forma de infecção ocorre através da inalação de conídios do fungo, com predominância de infecções no trato respiratório, principalmente em pacientes imunocomprometidos. Muito pouco é conhecido sobre a nestes microrganismos. Estudos da respiração mitocondrial de A. fumigatus realizados em nosso laboratório, sugerem a presença de vias alternativas como a oxidase alternativa e a NADH desidrogenase alternativa (TUDELLA et al., 2004). Estas vias alternativas podem estar envolvidas na adaptação destes organismos em ambientes instáveis como estresse ao frio, estresse oxidativo e condições anaeróbias, os quais influenciam na expressão ou atividade destes componentes alternativos (AMORA et al., 2000; CALEGARIO et al., 2003). A NADH desidrogenase alternativa de A. fumigatus, é semelhante àquelas descritas em plantas, fungos, eubactérias e arqueobactérias. Sabe-se que sua atividade encontra-se estimulada durante a fase de crescimento da célula, porém seu papel fisiológico ainda é pouco conhecido (WACKWITZ et al., 1999). A possível resistência de inúmeros fungos a drogas que atuam sobre as mitocôndrias, tem sido atribuída à presença de uma oxidase alternativa que previne a autoxidação da ubiquinona reduzida e a subseqüente formação de espécies reativas de oxigênio. O gene que codifica uma oxidase alternativa mitocondrial foi clonada e seqüenciada no projeto n 02/01452-5. No projeto 05/51677-4, a seqüência de cDNA do gene foi clonada em plasmídeos pET28a(+) e pYES2 e expressa em dois sistemas heterólogos, um procarioto, E. coli RosettaTM (DE3)pLysS e um eucarioto, S. cerevisiae INVSc1. Em ambos os sistemas a oxidase alternativa expressa conferiu uma respiração resistente a cianeto. Esta característica herdada provocou uma discreta diminuição na taxa de crescimento, mas uma capacidade de sobrevivência na presença de KCN. Desta forma, a fim de se caracterizar molecularme. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

  • 2006 - 2011

    Identification of the mitochondrial genes involved in tolerance to oxidative stress of conidia of Aspergillus fumigatus (Processo NIAID-NIH GENRQ-256), Descrição: The conidia are responsible for the reproduction, dispersal and environmental persistence of different fungal species. In pathogenic species, conidia also are the structures predominantly responsible for host infection. Following inhalation of conidia by the immunocompetent host, the innate cellular immune system (comprised of alveolar macrophages and neutrophils) is responsible for the killing of the conidia, exposing them to reactive oxygen and nitrogen species. In addition to oxidative stress, others environmental changes in the mammalian host relative to saprotrophic nice takes place such as temperature, nutrient availability, pH and osmolarity. The objective of the present study is to use DNA microarrays to identify genes differentially expressed during exposition to oxidative stresses. The inactivation of some of these genes will be used to confirm the importance of the genes in question for tolerance to oxidative stresses. In this sense, gene expression analysis, using microarray to examine the expression of the multiple genes encoding alternative pathway components in response to such stresses in Aspergillus fumigatus cultures will be useful to identify novel gene responses and roles proposed for the alternative pathways, and signalling mechanisms which may play a role in mitochondrial regulation.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

  • 2005 - 2007

    Interferência de RNA do gene de uma Ca2+-ATPase e expressão de uma oxidase alternativa mitocondrial de Aspergillus fumigatus (Processo FAPESP 05/51677-4), Descrição: Nas duas últimas décadas, infecções oportunistas causadas por fungos têm sido freqüentemente diagnosticadas em pacientes imunocomprometidos, sendo uma importante causa de morbidade e mortalidade entre os pacientes hospitalizados em todo o mundo. Com o rápido aumento dos casos de AIDS, algumas micoses aumentaram dramaticamente, sendo a candidíase a principal infecção oportunista. Entretanto, novas espécies de fungos são regularmente identificadas como causa de doenças nesses pacientes, dentre esses patógenos emergentes são importantes causadores de micoses sistêmicas o fungo Aspergillus fumigatus, como a segunda espécie mais notificada em pacientes imunossuprimidos. Muito pouco é conhecido sobre a bioenergética e regulação dos níveis de cálcio nestes microrganismos. A possível resistência de inúmeros fungos a drogas que atuam sobre as mitocôndrias, têm sido atribuidas a presença de uma oxidase alternativa que previne a autoxidação da ubiquinona reduzida e a subseqüente formação de espécies reativas de oxigênio. O gene que codifica uma oxidase alternativa mitocondrial foi clonada e seqüenciada no projeto anterior (processo n 02/01452-5). Desta forma, o cDNA do gene da aox foi funcionalmente expresso em S. cerevisae. Recentemente, o nosso laboratório clonou, seqüênciou e expressou em organismos heterólogos o gene de uma Ca2+-ATPase da subclasse PMR1 de A. fumigatus (SORIANI et al., 2005). A PMR1 parece contribuir de forma decisiva na manutenção das concentrações citoplasmáticas de íons cálcio e manganês em fungos. Estes íons estão envolvidos na distribuição (Ca2+) e glicosilação de proteínas (Mn2+). Nesse sentido, tem sido sugerido que o mesmo possa ser um alvo útil para o desenvolvimento de novos agentes terapêuticos. Assim, foi construído um plasmídeo para indução da RNAi através da inserção de seqüência homóloga ao gene de pmr1, em direções invertidas, com um espaçador de GFP e marcador o gene alb1. A cepa CEA 17 pyr G+ foi transformada com o plasmídeo pGlapmr.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

  • 2005 - 2007

    Expressão e caracterização bioquímica do gene da oxidase alternativa mitocondrial de Aspergillus fumigatus (Processo CNPq 471155/2004-7), Descrição: O Aspergillus fumigatus é um fungo filamentoso e saprofítico, encontrado em todas as regiões do mundo. A principal forma de infecção ocorre através da inalação de conídios do fungo com predominância de infecções no trato respiratório, principalmente em pacientes imunocomprometidos. Muito pouco é conhecido sobre a bioenergética mitocondrial do A. fumigatus. Entretanto, estudos preliminares de respiração mitocondrial realizados em nosso laboratório, sugerem a presença de uma oxidase alternativa semelhante àquelas descritas em plantas, tripanosomas, amebas e outros organismos. A função dessa oxidase no metabolismo desses organismos não está totalmente elucidada, mas tem sido sugerido que as principais funções da via alternativa estejam ligadas à diferenciação celular, termogênese e manutenção da concentração de ubiquinona suficientemente oxidada prevenindo a auto-oxidação da ubiquinona reduzida e a subseqüente formação de espécies reativas de oxigênio. No projeto anterior, nosso laboratório clonou e seqüênciou o gene da oxidase alternativa mitocondrial de Aspergillus fumigatus. A tradução da maior fase aberta de leitura resulta em um polipeptídeo deduzido de 353 aminoácidos, com pI calculado de 9,47 e peso molecular 40,8 Kda e seis regiões propostas como ligantes de metal (Fé). Além disso, a análise de hidropaticidade indicou a presença de dois domínios transmembrana, do aminoácido 147 ao 169 e do 209 ao 231. Estas características são compatíveis com a alternativa oxidase de outros fungos, sendo que a comparação da seqüência deduzida de aminoácidos apresentou homologia de 78% e 51% com A.niger e P. anserina, respectivamente. Assim, uma vez seqüenciado o gene da oxidase alternativa, o objetivo do presente projeto é a expressão em dois sistemas heterólogos (1) Em bactérias (2) Em Saccharomyces cerevisiae... , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

  • 2003 - 2005

    Estudos bioquímicos e moleculares do transporte de cálcio e clonagem da Oxidase alternativa de Aspergilus fumigatus (Processo FAPESP 02/04152-5), Descrição: Nas duas últimas décadas, infecções oportunistas causadas por fungos têm sido freqüentemente diagnosticadas em pacientes imunocomprometidos, sendo uma importante causa de morbidade e mortalidade entre os pacientes hospitalizados em todo o mundo. Com o rápido aumento dos casos de AIDS, algumas micoses aumentaram dramaticamente, sendo a candidíase a principal infecção oportunista. Entretanto, novas espécies de fungos são regularmente identificadas como causa de doenças nesses pacientes, dentre esses patógenos emergentes são importantes causadores de micoses sistêmicas o fungo Aspergillus fumigatus, como a segunda espécie mais notificada em pacientes imunossuprimidos. Muito pouco é conhecido sobre a bioenergética e regulação dos níveis de cálcio nestes microrganismos. Entretanto, a presença de um grande número de mitocôndrias e vacúolos ácidos elétron-densos sugere os seus envolvimentos na regulação dos níveis de cálcio intracelular. Assim, serão realizados estudos envolvendo o movimento de cálcio e parâmetros cinéticos da Ca2+-ATPase, H+-ATPase e de outros possíveis transportadores nos vacúolos ácidos de Aspergillus fumigatus. Estudos moleculares envolvendo o compartimento ácido serão realizados através da caracterização do gene da Ca2+-ATPase vacuolar. Além disso, os estudos da função da oxidase alternativa mitocondrial em Aspergillus fumigatus serão abordados através de técnicas moleculares.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

Prêmios

2017

Premio - 2 Lugar - Melhor apresentação oral do trabalho: Clonagem, expressão e purificação de uma xilanase GH10 de Aspergillus fumigatus envolvida na hidrólise de biomassas lignocelulósicas, 2 Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial.

2017

Premio - Melhor apresentação oral : Clonagem, purificação e análise bioinformática de duas LPMOs de Aspergillus fumigatus envolvidas na desconstrução do bagaço de cana-de-açúcar, 2 Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial.

2015

Premio de melhor painel: Identificação de enzimas hidrolíticas secretadas por Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar, por técnicas de RNA-seq, 1 Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial.

2005

Menção Honrosa no 5th International Congress of Pharmaceutical Science, .

Histórico profissional

Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirao Preto- Dept de Química. , Avenida dos Bandeirantes, 3900, Monte Alegre, 14040901 - Ribeirão Preto, SP - Brasil, Telefone: (15) 33159121, Ramal: 9121, Fax: (15) 36024838

Experiência profissional

2012 - Atual

Faculdade de Filosofia Ciências e Letras de Ribeirão Preto- USP

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 05/2019

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciêcias e Letras de Ribeirão Preto.,Cargo ou função, Membro suplente do Conselho de Departamento.

  • 01/2019

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular, Bioquímica Experimental, Química Biológica, Bioquímica I

  • 01/2018

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular, Química Biológica, Estágio I Bioquímica e Biologia Molecular, Bioquímica Experimental, Bioquímica Teórica I

  • 08/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Filosofia Ciêcias e Letras de Ribeirão Preto.,Cargo ou função, Membro titular da Comissão interna de biossegurança.

  • 05/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Departamento de Química, Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirao Preto.,Cargo ou função, Membro Titular da Comissão Interna de Biossegurança da FFCLRP-USP.

  • 03/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Departamento de Química.,Cargo ou função, Membro titular da Comissão Coordenadora do Programa de Pos graduação em Química (CCP).

  • 01/2017

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estágio I Bioquímica e Biologia Molecular, Biologia Molecular, Química Biológica

  • 08/2016

    Ensino, Química, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Avançada, Fundamentos de Bioquímica e Biologia Molecular, Aspectos Moleculares da Biologia do Gene

  • 01/2016

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular, Bioquímica II

  • 03/2015

    Ensino, Química, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos de Bioquímica e Biologia Molecular

  • 01/2015

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular, Estágio IV Bioquímica e Biologia Molecular, Estágio I Química Tecnológica, Biotecnológica e Agroindustrial, Seminários em Bioquímica

  • 01/2014

    Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Filosofia Ciêcias e Letras de Ribeirão Preto.,Linhas de pesquisa

  • 01/2014

    Pesquisa e desenvolvimento, Faculdade de Filosofia Ciêcias e Letras de Ribeirão Preto.,Linhas de pesquisa

  • 01/2014

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Experimental, Química Biológica, Estágio IV Bioquímica e Biologia Molecular

  • 03/2013

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, 5930151 - Biologia Molecular, 5930157 - Estágio em Bioquimica e Biologia Molecular

  • 03/2013

    Ensino, Física Médica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, 5930230-Químimica Geral III

  • 08/2012

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, 5930236 - Química Biológica, 5930252 - Bioquímica II

  • 08/2012

    Ensino, Química, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, 5930153 - Biologia Molecular Experimental

  • 09/2017 - 04/2019

    Extensão universitária , Faculdade de Filosofia Ciêcias e Letras de Ribeirão Preto.,Atividade de extensão realizada, Comissão Organizadora do III Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial (EnqBiotec).

  • 06/2014 - 07/2018

    Extensão universitária , Departamento de Química.,Atividade de extensão realizada, Supervisora da Empresa Junior - Soluções Químicas.

  • 09/2015 - 09/2017

    Extensão universitária , Faculdade de Filosofia Ciêcias e Letras de Ribeirão Preto.,Atividade de extensão realizada, Comissão Organizadora do II Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial (EnqBiotec).

  • 08/2015 - 07/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Departamento de Química, Faculdade de Filosofia Ciencias e Letras de Ribeirao Preto.,Cargo ou função, Membro suplente da comissão Biossegurança.

  • 04/2015 - 03/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Departamento de Química.,Cargo ou função, Membro Suplente do Conselho de Departamento.

  • 09/2015 - 09/2015

    Extensão universitária , Faculdade de Filosofia Ciêcias e Letras de Ribeirão Preto.,Atividade de extensão realizada, Comissão Organizadora do I Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial (EnqBiotec).

2012 - Atual

Universidade de São Paulo

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2009 - 2012

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.

2004 - 2008

Universidade de São Paulo

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2009 - 2012

Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP

Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Bosista Pós-doutorado Fapesp, Regime: Dedicação exclusiva.

2004 - 2008

Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP

Vínculo: Livre, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.