Rodrigo Fernandes Ramalho

Possui título de Doutor em Ciências Biológicas concedido pelo Departamento de Genética e Biologia Evolutiva do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genômica Humana atuando principalmente em Bioinformática.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)

2008 - 2012

Universidade de São Paulo
Título: Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano
Diogo Meyer. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: bioinformatica; exonic splicing enhancer; evolução molecular.Grande área: Ciências Biológicas

Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)

2005 - 2007

Universidade de São Paulo
Título: Estudo dos efeitos da seleção natural na região controladora do gene CCR5 em populações ameríndias,Ano de Obtenção: 2008
Diogo Meyer.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: ccr5; amerindios; selecao natural; bioinformatica; genética de populações.Grande área: Ciências Biológicas

Graduação

1998 - 2003

Universidade de São Paulo
Título: Analise filogenetica de sequencias de retrovirus endogenos humanos atraves de bioinformatica
Orientador: Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

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Pós-doutorado

2014

Pós-Doutorado. , Fundação Antônio Prudente, FAP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

2013

Pós-Doutorado. , Indiana University, IU Bloomington, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

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Participação em eventos

61 Congresso Brasileiro de Genética. Genomic and Epigenomic Landscape of Triple-negative Breast Cancer Medated by BRCA1 Germline Mutations. 2015. (Congresso).

61 Congresso Brasileiro de Genética. Analysis of deregulated miRNAs and gene targets in Wilms tumor with the E1147K-DROSHA mutation. 2015. (Congresso).

61 Congresso Brasileiro de Genética. Urine as a potencial liquid biopsy for detecting tumor DNA in Wilms tumor patient: detection of somatic mutations in urine opens perspectives of monitoring chemoterapy response in WT patients. 2015. (Congresso).

Great Lakes Bioinformatics Conference (GLBIO). Proteomic evidence for in-frame and out-of-frame alternatively spliced isoforms in human and mouse. 2015. (Congresso).

Great Lakes Bioinformatics Conference (GLBIO). Improving SNV validation of Ion-based Sequence Data by using GATK metrics. 2015. (Congresso).

Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution. Alternative Splicing and Proteome Diversity: Looking for Evidence in Mass Spectrometry Data. 2013. (Congresso).

2º Biological Evolution Workshop. 2009. (Encontro).

X-Meeting - 5º International Conference of Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Bilogy. EVALUATING THE SIGNATURE OF RECENT NATURAL SELECTION IN COMBINED EXONIC SPLICING ENHANCERS USING SNP ALLELIC FREQUENCY FROM HAPMAP. 2009. (Congresso).

Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution. The frequency spectrum of polymorphisms of ESEs in constitutive and alternative exons of the human genome. 2008. (Congresso).

53º Congresso Brasileiro de Genética. Análise do polimorfismo da região contreoladora do CCR5 em populações ameríndias. 2007. (Congresso).

IX Congresso da Associação Latino Americana de Antropologia Biológica. 2006. (Congresso).

"X Meeting" 1ª Conferência Internacional da Associação Brasileirade Bioinformática e Biologia Computacional. 2005. (Congresso).

VI Reunião Científica Anual - VI Annual Scientific Meeting - Instituto Butantan.Detecting genomic instability of melanoma tissues using RAPD technique. 2005. (Encontro).

Conferências André Dreyfus. 2004. (Seminário).

11 Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo- SIICUSP.Identificação, Caracterização, Localização Cromossômica e Análise Filogenética de Retrovirus Endógenos Humanos da Famíla- K. 2003. (Simpósio).

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Comissão julgadora das bancas

Sérgio Russo Matioli

Meyer, D.; LINE, S. R. P.; OLIVEIRA, C. C.; SILVA JUNIOR, W. A.;MATIOLI, SÉRGIO R.. Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano.. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Regina Célia Mingroni Netto

MEYER, D.; Mendes-Júnior CT;MINGRONI-NETTO, R. C.. Análise do Polimorfismo da região cis-reguladora do gene CCR-5 em populações ameríndias. 2008. Dissertação (Mestrado em Biologia/Genética) - Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo.

Carla Columbano de Oliveira

OLIVEIRA, C. C.; MEYER, D.; MATIOLI, S. R.; LEITE, S. R. P.; A.S. JUNIOR, W.. Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

CELSO TEIXEIRA MENDES JUNIOR

MENDES-JUNIOR, C. T.; MINGRONI-NETTO, R. C.; MEYER, D.. Análise do polimorfismo da região cis-reguladora do gene CCR5 em populações ameríndias. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.

Diogo Meyer

Meyer, DMENDES-JUNIOR, C TMingroni-Netto, RC. Análise do polimorfismo da região cis-reguladora do gene CCR5 em populações ameríndias. 2008. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Diogo Meyer

Meyer, D; Line, Sergio Roberto Peres; Silva, Wilson Araújo; Matioli, S; Oliveira, Carla Columbano de. Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

PAULO ALBERTO OTTO

OTTO, P. A.. Seleção natural e reguladores de splicing exônicos do genoma humano. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Patricia Pereira Coltri

Coltri, Patricia P; Otto, Paulo Alberto; Zabonatto, Gabriel Henrique Marroig. Seleção natural e reguladores de splicing exônicos do genoma humano. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Depto. Genética e Biologia Evolutiva) - Universidade de São Paulo.

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Foi orientado por

Dirce Maria Carraro

2014; Fundação Antônio Prudente, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Dirce Maria Carraro;

Diogo Meyer

Estudo dos efeitos da seleção natural sobre a região controladora do gene CCR5 em populações indígenas brasileiras; 2008; 0 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Diogo Meyer;

Diogo Meyer

Estudo do efeito da seleção natural em ativadores de splicing exônico (ESEs) de populações humanas através de análise de frequência alélica; 2012; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Diogo Meyer;

Sandro José de Souza

Estudo do Efeito da Seleção Natural em Ativadores de Splicing Exônico (eses) de Populações Humanas Através de Análise de Frequência; 2012; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Sandro José de Souza;

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Produções bibliográficas

  • TORREZAN, GIOVANA T. ; DE ALMEIDA, FERNANDA G. DOS SANTOS R. ; FIGUEIREDO, MÁRCIA C. P. ; BARROS, BRUNA D. DE FIGUEIREDO ; DE PAULA, CLÁUDIA A. A. ; VALIERIS, RENAN ; DE SOUZA, JORGE E. S. ; RAMALHO, RODRIGO F. ; DA SILVA, FELIPE C. C. ; FERREIRA, ELISA N. ; DE NÓBREGA, AMANDA F. ; FELICIO, PAULA S. ; ACHATZ, MARIA I. ; DE SOUZA, SANDRO J. ; PALMERO, EDENIR I. ; CARRARO, DIRCE M. . Complex Landscape of Germline Variants in Brazilian Patients With Hereditary and Early Onset Breast Cancer. Frontiers in Genetics , v. 9, p. 161, 2018.

  • BRIANESE, RAFAEL CANFIELD ; NAKAMURA, KIVVI DUARTE DE MELLO ; ALMEIDA, FERNANDA GABRIELLA DOS SANTOS RAMOS ; RAMALHO, RODRIGO FERNANDES ; BARROS, BRUNA DURÃES DE FIGUEIREDO ; FERREIRA, ELISA NAPOLITANO E ; FORMIGA, MARIA NIRVANA DA CRUZ ; DE ANDRADE, VICTOR PIANA ; DE LIMA, VLADMIR CLAUDIO CORDEIRO ; Carraro, Dirce Maria . BRCA1 deficiency is a recurrent event in early-onset triple-negative breast cancer: a comprehensive analysis of germline mutations and somatic promoter methylation. BREAST CANCER RESEARCH AND TREATMENT , v. 167, p. 803-814, 2018.

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  • SOARES, CLEVERSON T. ; TROMBONE, ANA P. F. ; FACHIN, LUCIANA R. V. ; ROSA, PATRICIA S. ; GHIDELLA, CÁSSIO C. ; RAMALHO, RODRIGO F. ; PINILLA, MABEL G. ; CARVALHO, ALEX F. ; CARRARA, DIRCE N. ; SOARES, FERNANDO A. ; BELONE, ANDREA F. F. . Differential Expression of MicroRNAs in Leprosy Skin Lesions. Frontiers in Immunology , v. 8, p. 10.3389, 2017.

  • VILLELA, DARINE ; RAMALHO, RODRIGO F. ; SILVA, ADERBAL R. T. ; BRENTANI, HELENA ; SUEMOTO, CLAUDIA K. ; PASQUALUCCI, CARLOS AUGUSTO ; GRINBERG, LEA T. ; KREPISCHI, ANA C. V. ; ROSENBERG, CARLA . Differential DNA Methylation of MicroRNA Genes in Temporal Cortex from Alzheimer?s Disease Individuals. Neural Plasticity , v. 2016, p. 1-10, 2016.

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  • Ramalho, R. F. ; LI, S. ; HAHN, M. ; RADIVOJAC, P. . Proteomic evidence for in-frame and out-of-frame alternatively spliced isoforms in mammals. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • RAMALHO, RODRIGO F. . Sequenciamento NGS e aplicações na genômica. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Ramalho, Rodrigo F . Portais de dados genômicos e suas utilidades na pesquisa oncológica. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Ramalho, R. F. ; SOUZA, J. ; SOUZA, S. ; MEYER, D. . Padrão distinto de seleção natural entre os Exonic Splicing Enhancers sugere diferença funcional. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • RAMALHO, R. F. ; MEYER, D. . Efeitos da seleção natural no genoma humano. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • RAMALHO, R. F. . Efeito da seleção natural em ativadores de spicing exonico (ESEs) do genoma humano. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • RAMALHO, R. F. . Aplicações básicas da Bioinfomática na análise de sequencias de DNA. 2005. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Fleury Medicina e Saúde. , Avenida General Valdomiro de Lima, Jabaquara, 04344070 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 31790822, Ramal: 6923

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Experiência profissional

2016 - 2017

Fundação Antônio Prudente

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador Junior

2017 - Atual

Fleury Medicina e Saúde

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Pesquisador A2