Patrick da Silva

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Participação em eventos

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Comissão julgadora das bancas

Orientou

Foi orientado por

Produções bibliográficas

• SERIBELLI, AMANDA AP. ; DA SILVA, PATRICK ; DA CRUZ, MARCELO FERREIRA ; DE ALMEIDA, FERNANDA ; FRAZÃO, MILIANE R. ; MEDEIROS, MARTA I. C. ; RODRIGUES, DÁLIA DOS P. ; KICH, JALUSA D. ; DE JESUS BENEVIDES, LEANDRO ; SOARES, SIOMAR DE C. ; ALLARD, MARC W. ; FALCÃO, JULIANA PFRIMER. . Insights about the epidemiology of Salmonella Typhimurium isolates from different sources in Brazil using comparative genomics. Gut Pathogens , v. 13, p. 27, 2021.

• SERAFIM, RODOLFO BORTOLOZO ; DA SILVA, PATRICK ; CARDOSO, CIBELE ; DI CRISTOFARO, LUIS FERNANDO MACEDO ; NETTO, RENATO PETITTO ; DE ALMEIDA, RODRIGO ; NAVEGANTE, GEOVANA ; STORTI, CAMILA BALDIN ; DE SOUSA, JULIANA FERREIRA ; DE SOUZA, FELIPE CANTO ; PANEPUCCI, RODRIGO ; MOREIRA, CRISTIANO GALLINA ; PENNA, LARISSA SIQUEIRA ; SILVA, WILSON ARAUJO ; VALENTE, VALERIA . Expression Profiling of Glioblastoma Cell Lines Reveals Novel Extracellular Matrix-Receptor Genes Correlated With the Responsiveness of Glioma Patients to Ionizing Radiation. FRONTIERS IN ONCOLOGY , v. 11, p. 668090, 2021.

• DA SILVA, PATRICK ; LUSTRI, BRUNA C. ; CASTILHO, IVANA GIOVANNETTI ; FERREIRA, ADRIANO MARTISON ; HERNANDES, RODRIGO T. ; SCHEMBRI, MARK A. ; MOREIRA, CRISTIANO G. . Genome profiling of fluoroquinolone-resistant uropathogenic Escherichia coli isolates from Brazil. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 53, p. 1, 2021.

• SERIBELLI, AMANDA APARECIDA ; RIBEIRO, TAMARA R. MACHADO ; DA SILVA, PATRICK ; MARTINS, ISABELA MANCINI ; VILELA, FELIPE PINHEIRO ; MEDEIROS, MARTA I. CAZENTINI ; PERONNI, KAMILA CHAGAS ; DA SILVA JUNIOR, WILSON ARAÚJO ; MOREIRA, CRISTIANO GALLINA ; FALCÃO, JULIANA PFRIMER . Salmonella Typhimurium ST313 isolated in Brazil revealed to be more invasive and inflammatory in murine colon compared to ST19 strains. JOURNAL OF MICROBIOLOGY , v. 59, p. 861-870, 2021.

• SERIBELLI, AMANDA APARECIDA ; DA SILVA, PATRICK ; FRAZÃO, MILIANE RODRIGUES ; KICH, JALUSA DEON ; ALLARD, MARC W. ; FALCÃO, JULIANA PFRIMER . Phylogenetic relationship and genomic characterization of Salmonella Typhimurium strains isolated from swine in Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 93, p. 104977, 2021.

• DE SOUSA, JULIANA FERREIRA ; DA SILVA, PATRICK ; SERAFIM, RODOLFO BORTOLOZO ; NOCITI, RICARDO PERECIN ; MOREIRA, CRISTIANO GALLINA ; SILVA, WILSON ARAUJO ; VALENTE, VALERIA . RNA sequencing data of different grade astrocytoma cell lines. DATA IN BRIEF , v. 34, p. 106643, 2020.

• DA SILVA, PATRICK ; MANIERI, FERNANDA Z. ; HERRERA, CARMEN M. ; TRENT, M. STEPHEN ; MOREIRA, CRISTIANO G. . Novel Role of VisP and the Wzz System during O-Antigen Assembly in Salmonella enterica Serovar Typhimurium Pathogenesis. INFECTION AND IMMUNITY , v. 86, p. IAI.00319-18, 2018.

• ALMEIDA, FERNANDA ; SERIBELLI, AMANDA APARECIDA ; DA SILVA, PATRICK ; MEDEIROS, MARTA INÊS CAZENTINI ; DOS PRAZERES RODRIGUES, DÁLIA ; MOREIRA, CRISTIANO GALLINA ; ALLARD, MARC W. ; FALCÃO, JULIANA PFRIMER . Multilocus sequence typing of Salmonella Typhimurium reveals the presence of the highly invasive ST313 in Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION , v. 51, p. 41-44, 2017.

• ALMEIDA, FERNANDA ; SERIBELLI, AMANDA APARECIDA ; SILVA, P. ; MEDEIROS, MARTA INÊS CAZENTINI ; DOS PRAZERES RODRIGUES, DÁLIA ; MOREIRA, C. G. ; ALLARD, MARC W. ; FALCÃO, JULIANA PFRIMER . Importante ST invasivo de Salmonella Typhimurium é relatado no Brasil. Microbiologia in foco, p. 18 - 19, 01 jul. 2017.

• SILVA, P. ; MOREIRA, C. G. . Pesquisa aponta presença de salmonela mais invasiva e mais resistente no Brasil. G1 Globo, São Carlos, 22 mar. 2017.

• SILVA, P. ; MANIERI, F. Z. ; TRENT, S. M. ; SPERANDIO, V. ; MOREIRA, C. G. . The O-Antigen Shield as a Proper Way to Trick the Host During Bacterial Pathogenesis. In: Microbial Adhesion and Signal Transduction Gordon Research Conferences, 2017, Newport, RI. Microbial Adhesion & Signal Transduction Gordon Research Conferences, 2017.

• SILVA, P. ; LUSTRI, B. C. ; MANIERI, F. Z. ; TRENT, S. M. ; SPERANDIO, V. ; MOREIRA, C. G. . Bacterial chemical signaling role on O-antigen assembly and Salmonella enterica serovar Typhimurium pathogenesis.. In: Gordon Research Conference 'Sensory Transduction in Microorganisms', 2016, Ventura-California. Gordon Research Conference, 2016.

• SILVA, P. ; TRENT, S. M. ; SPERANDIO, V. ; MOREIRA, C. G. . Role of VisP and LpxO proteins on O-antigen assembly and Salmonella enterica serovar typhimurium pathogenesis.. In: 28° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianópolis-SC. APRESENTAÇÃO ANAIS DO 28 CBM 2015, 2015.

• SILVA, P. ; SOUZA, C. W. O. ; BERNARDI, A. C. A. ; TRAPP, M. A. ; RODRIGUES-FILHO, E. . IDENTIFICAÇÃO DE CEPAS BACTERIANAS EM AMOSTRAS CLÍNICAS POR ESPECTROMETRIA DE MASSAS DE DESSORÇÃO/IONIZAÇÃO POR LASER ASSISTIDA POR MATRIZ. In: XXI Congresso de Iniciação Científica da UFSCar, 2013, São Carlos. Anais de Eventos da UFSCar, 2013. v. 9.

• SILVA, P. ; MOREIRA, C. G. . Role of VisP and LpxO proteins on O-antigen assembly and Salmonella enterica serovar typhimurium pathogenesis.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• SILVA, P. ; TRENT, S. M. ; SPERANDIO, V. ; MOREIRA, C. G. . Role of VisP and LpxO proteins on O-antigen assembly and Salmonella enterica serovar typhimurium pathogenesis.. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, P. ; SOUZA, C. W. O. ; BERNARDI, A. C. A. ; TRAPP, M. A. ; RODRIGUES-FILHO, E. . Identificação de cepas bacterianas em amostras clínicas por espectrometria de massas de dessorção/ionização por laser assistida por matriz.. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2021 - Atual

  Resistência e Susceptibilidade na Síndrome Congênita do Zika Vírus, Descrição: O projeto visa buscar e compreender genes que conferem resistência ou susceptibilidade à síndrome congênita do ZIKV, utilizando tanto amostras de mulheres que tiveram bebês afetados como em modelos experimentais. Serão realizados screenings por sequenciamento, além de experimentos de validação in vivo em modelo murino.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patrick da Silva - Coordenador / Jean Pierre Schatzmann Peron - Integrante.

• 2019 - 2020

  Characterization and strength prediction of promoters regulated by YgiV transcriptional factor of Salmonella enterica serovar Typhimurium, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Patrick da Silva - Coordenador / Cristiano Gallina Moreira - Integrante / Carol A Gross - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de SP - Bolsa.

• 2016 - 2020

  Estudo da regulação transcricional por YgiV e da interação proteica de VisP na sinalização química e montagem do LPS na patogênese de Salmonella enterica sorovar Typhimurium, Descrição: Sinalização química em bactérias patogênicas é um mecanismo empregado para interagir com o hospedeiro e sua respectiva microbiota. Através desta interação ocorre a regulação dos mecanismos de virulência. Estudando o mecanismo de sinalização química de 2-componentes QseBC em Salmonella enterica serovar Typhimurium, uma nova proteína VisP (Virulence and stress-related Periplasmic protein) foi reportada. Seu papel inicial na resposta a estresse foi demonstrado anteriormente, e foi observado em análises posteriores sua importância na patogenicidade mediada por fatores codificados nas ilhas de patogenicidade SPI-1 e 2 (Salmonella Patogenicity Island 1 and 2). Esta proteína é codificada por um gene de em um operon, o qual apresenta também o gene ygiV, que codifica um regulador transcricional da família AraC. O antígeno-O do LPS fornece proteção contra as defesas do hospedeiro, e particularmente, o comprimento de sua cadeia exerce um papel essencial. A montagem do antígeno-O é orquestrado por uma maquinaria proteica periplasmática, cujos mecanismos de ação são pouco elucidados. Dados preliminares evidenciaram que há um aumento nas cadeias longas (L-OAg) e muito longas (VL-OAg) no mutante visP. O presente estudo busca elucidar o papel de VisP na regulação das cadeias de antígeno-O, assim como definir a regulação transcricional realizada por YgiV, e correlacionar estas interações com os processos patogênicos. A compreensão destes mecanismos de homeostase de membrana bacteriana e a relação complexa entre bactéria patogênica, microbiota, e hospedeiro é um tópico essencial na patogênese microbiana. A completa elucidação destes sinais será essencial para o entendimento desta relação, assim como o desenvolvimento de novas tecnologias e terapias.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Patrick da Silva - Coordenador / Cristiano Gallina Moreira - Integrante.

• 2016 - 2018

  Sinalização química via QseC e QseE em Citrobacter rodentium, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Patrick da Silva - Integrante / Cristiano Gallina Moreira - Integrante / Karine Melchior - Coordenador.

• 2014 - 2019

  Investigação do papel da sinalização química e de mecanismos auxiliares na virulência de Salmonella enterica sorovar Typhimurium e outros enteropatógenos, Descrição: Sinalização química em bactérias é um mecanismo que as mesmas utilizam para interagir com o hospedeiro e sua respectiva microbiota. Através desta interação patógeno-hospedeiro ocorre a regulação dos mecanismos de virulência em bactérias. Estudando o mecanismo de sinalização química de 2-componentes QseBC do autoindutor-3 (AI-3), epinefrina (Epi) e noraepinefrina (NE) em Salmonella enterica serovar Typhimurium foi aberta uma nova perspectiva para desvendar os mecanismos de patogenicidade. Dentre estes, uma nova proteína VisP (Virulence and stress-related Periplasmic protein) foi reportada (29). Seu papel inicial na interação com a enzima LpxO (Dioxigenase Fe2+/ -ketoglutarato-dependente) e a cadeia de peptidoglicano em S. Typhimurium foi anteriormente demostrada (29). Porém, novos estudos são necessários para a completa elucidação deste mecanismo em relação à patogenicidade dos sistemas de secreção do tipo III, codificados pelas ilhas de patogenicidade SPI-1 e SPI-2, bem como a participação do antígeno-O do LPS de S. Typhimurium. Novos mecanismos precisam ainda a serem elucidados a partir da análise transcriptômica recentemente realizada do sensor quinase QseC. O estudo detalhado de todos estes novos mecanismos faz parte do presente projeto, com o intuito de caracterizá-los, analisar sua importância em processos de bactérias patogênicas para humanos, desvendar novos mecanismos, assim como, a longo prazo, avaliar a presença dos mesmos em outros enteropatógenos similares da família Enterobacteriaceae. Cabe salientar a importância deste tipo de estudo para compreender melhor os mecanismos com os quais as bactérias se relacionam em comunidades complexas e com o próprio hospedeiro. O intestino humano alberga uma vasta variedade de espécies bacterianas, incluindo bactérias comensais que por vezes enfrentam o ?ataque? de bactérias patogênicas. A sinalização química entre microrganismos e o hospedeiro é o aspecto central deste relacionamento, e a compreensão desta sinalização será essencial para o entendimento e desenvolvimento de novas tecnologias e terapias para o benefício da vida humana.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Patrick da Silva - Integrante / Cristiano Gallina Moreira - Coordenador / Bruna C Lustri - Integrante / Fernanda Z Manieri - Integrante / Karine Melchior - Integrante / Tamara Renata Machado - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2014 - 2016

  Estudo do papel das proteínas VisP e LpxO na sinalização química e a participação destes na formação de antígeno-O e a patogênese de Salmonella enterica sorovar Typhimurium, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patrick da Silva - Coordenador / Cristiano Gallina Moreira - Integrante.

• 2012 - 2013

  Identificação de cepas bacterianas em amostras clínicas por Espectrometria de Massas de Dessorção/Ionização por Laser Assistida por Matriz, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Patrick da Silva - Coordenador / Clovis Wesley Oliveira de Souza - Integrante.

Prêmios