Mario Tyago Murakami

Líder de grupo de pesquisa desde 2008 no CNPEM (2008-2016 LNBio e 2016-atual LNBR). Atuou entre 2008 e 2016 como Coordenador de instalações científicas de grande porte dedicadas à Cristalografia de Macromoléculas do LNLS e LNBio (linhas de luz MX1 e MX2, e instalação de cristalização de macromoléculas ROBOLAB). Entre 2016 e 2017, foi Coordenador da Divisão Molecular do LNBR e desde 2018 é Diretor Científico do Laboratório Nacional de Biorrenováveis (LNBR). Tem atuado nas áreas de Glicobiologia, Biotecnologia Molecular e Biologia Sintética tanto no campo da ciência fundamental como aplicada. Coordena um projeto temático FAPESP sobre novas estratégias para desconstrução da parede celular vegetal e é responsável por projetos de grande porte de P&D com empresas do setor de Biotecnologia, além de liderar programas multidisciplinares institucionais voltados a solucionar problemas estratégicos ao pais na área de bioenergia, como o desenvolvimento de uma rota de produção de etanol 2G a partir de resíduos da cana-de-açúcar. Recentemente publicou um estudo na Nature Chemical Biology sobre redes de similaridade para descoberta de enzimas que foi destaque de sua edição com uma resenha escrita pelo Prof. Paul Walton (York University, https://www.nature.com/articles/s41589-020-0585-y). Além disso, liderou uma pesquisa que desenvolveu uma plataforma fúngica para produção de celulases que pode chegar até 80 g/L usando resíduos industriais como meio de cultivo em planta piloto, gerando um coquetel enzimático brasileiro para etanol de segunda geração. Livre Docente pelo Instituto de Biologia da UNICAMP e membro afiliado da Academia Brasileira de Ciências (2020-2025). Já publicou mais de 150 artigos científicos em revistas de reconhecimento internacional (~3400 citações, indice H = 34 e i10 = 91, fonte: Google Scholar), resolveu mais de 180 estruturas cristalográficas depositadas no PDB e possui 8 depósitos de patente na área de Biotecnologia, das quais quatro foram licenciadas para empresas.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biofísica Molecular

2004 - 2006

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Estratégias de inibição, mecanismos moleculares e interações intermoleculares em complexos macromoleculares
Orientador: em Universität Hamburg ( Prof. Christian Betzel)
com Raghuvir Krishnaswamy Arni. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Graduação em Engenharia

1999 - 2003

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Estudos estruturais de uma lectina tipo C com potente atividade sobre a agregração plaquetária
Orientador: Prof. Dr, Raghuvir Krishnaswamy Arni
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

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Pós-doutorado

2013

Livre-docência. , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil. , Título: Estratégias moleculares para catálise, regulação e estabilidade de hidrolases glicosídicas com potenciais aplicações biotecnológicas, Ano de obtenção: 2013., Palavras-chave: Biologia Estrutural; Enzimas; Mecanismos de Ação; Engenharia de Proteínas; Biotecnologia., Setores de atividade: Educação.

2012 - 2012

Pós-Doutorado. , Rutgers University, RU, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

2006 - 2007

Pós-Doutorado. , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

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Formação complementar

2010 - 2010

Faseamento Experimental de Macromoleculas. (Carga horária: 48h). , Laboratório Nacional de Biociências, LNBIO, Brasil.

2009 - 2009

Curso de Cristalização de Macromoléculas. (Carga horária: 20h). , Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil.

2007 - 2007

RapiData. (Carga horária: 80h). , Brookhaven National Laboratory, BNL, Estados Unidos.

2006 - 2006

Automação em cristalização de proteínas. (Carga horária: 45h). , Universität Hamburg, UH, Alemanha.

2005 - 2005

expressao de proteinas. (Carga horária: 120h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2004 - 2004

Determinacao de estruturas. (Carga horária: 120h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2003 - 2003

Caracterização funcional de toxinas. (Carga horária: 240h). , Instituto Butantan, BUTANTAN, Brasil.

2002 - 2002

Espectrofotometria e Calorimetria. (Carga horária: 480h). , Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, LNLS, Brasil.

2002 - 2002

Expressao genica. (Carga horária: 360h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2001 - 2001

Sequenciamento de Edman. (Carga horária: 120h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular/Especialidade: Cristalografia de Macromoléculas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Química de Macromoléculas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Enzimologia de Carboidratos.

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Organização de eventos

Murakami, M. T. ; Ambrosio, A. . V Workshop de Cristalografia - Faseamento experimental. 2010. (Outro).

Barbosa, J. A. ; Murakami, M. T. . IV Worshop de Cristalografia - Cristalização de Proteínas. 2009. (Outro).

Murakami, M. T. . Curso de Verão em Biofísica Molecular 2008. 2007. (Outro).

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Participação em eventos

ABLC Global - The advanced bioeconomy leadership conference. 2018. (Congresso).

Ethanol Summit 2017. 2017. (Congresso).

Workshop - Macauba. 2017. (Congresso).

Workshop - Setor Sucroalcooleiro do Nordeste. 2017. (Congresso).

Workshop on Synthetic Biology and Robotics.Automação no LNBio/LNLS. 2011. (Oficina).

Encontro França-Brasil de Bioinformática.Bioinformática. 2010. (Encontro).

Global dialogues on emerging science and technology (GDEST): Conference on Bioinformatics.Bioinformática. 2006. (Simpósio).

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Participação em bancas

Aluno: Awana da Silva Lima

Segato, F.Murakami, M.T.; Alcalde, F.S.C.. Expressão heteróloga e caracterização bioquímica de uma xilooligossacarídeo oxidase de Thielavia terrestris pertencente à família AA7. 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Felipe Cardoso Ramos

Murakami, M.T.; SANTOS, CLELTON A.;Ruller, Roberto. Avaliação da termoestabilidade e aplicação biotecnológica de endo-xilanases GH11 obtidas por otimização in silico. 2017. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ana Elisa Tognoli Leite

Nascimento, A. S.;Murakami, M. T.; Trivella, D. B. B.. Bioprospecção, estudos bioquímicos de enzimas oxidativas e seu sinergismo com celulases na hidrólise de biopolímeros. 2017. Dissertação (Mestrado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Izabella Venturini Cagliari

Ramos, C.H.I; Murakami, Mário Sussulini, A.. Clonagem, expressão, purificação e caracterização da proteína SGT1 da cana-de-açúcar, uma co-chaperona do sistema Hsp90. 2016. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Angélica Rodriguez de Souza

Abrego, J. R. B.Ruller, R.Murakami, M. T.. Aspectos estruturais de duas enzimas relacionadas: liquenase e arabinofuranosidase termoestável. 2012. Dissertação (Mestrado em Biofisica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Aline Sampaio Pinto

Werneck, C. C.; Balan, A.;Murakami, M. T.. Investigações estruturas dos domínios funcionais das miosinas classes VIII e XI presentes em plantas. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Carla Cristina Polo

Leme, A. P.; Figueira, A.C.M.;Murakami, M. T.. Caracterização molecular dos dominios funcionais de miosinas de D. melanogaster. 2012. Dissertação (Mestrado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Plínio Salmazo Vieira

Murakami, M. T.Ward, R. J.de Oliveira, A.H.C.. Efeitos de mutações na estrutura em solução e na função da Nucleosídeo Difosfato Kinase de Leishmania major (LmNDK). 2012. Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Ciências) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernando Celestino Vacari

Murakami, M. T.; Canduri, F.; Fadel, V.. Cristalização e resolução da estrutura das proteínas Canavalia gladiata lectin (CGL) e Canavalia Maritma lectin (CML) complexada com açucares. 2010. Dissertação (Mestrado em Biofisica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ricardo Barros Mariutti

Gaspar, J. O.;Murakami, M. T.; Cornelio, M.L.. Expressão da provável proteína do movimento do Southern Bean Mosaic Virus em E. coli e produção de antissoro policlonal. 2009. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Lívia José Regatieri

Gaspar, J. O.;Souza, F. P.Murakami, M. T.. Expressão da possivel proteina do movimento do Pepper ringspot virus em E. coli e produção de anti-soro visando comprovação de função biologica. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Karine Fernanda dos Santos

Murakami, M. T.; CAETANO, R. C.;Arni, R. K.. Estudos estruturais da proteina precursora dos peptideos potenciadores de bradicinina. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ana Cecília Bergamim Pereira

Gaspar, J. O.; Belintani, P.;Murakami, M. T.. Proteína capsidial do Rupestris Stem pitting-associated virus: sequenciamento do gene, expressão em E. coli, purificação e produção de anti-soro policlonal.. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Flávia Barboza Carmargo

CAETANO, R. C.;Murakami, M. T.Arni, R. K.. Expressão, purificação e estudos estruturais da chaperona molecular Hsp65 kDa de Mycobacterium leprae. 2007. Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Fernanda Angélica Sala

Garratt, R.C.; Thiemann, H. O.; Borges, J.C.; Balan, A.;Murakami, M. T.. Interações proteína-proteína envolvidas na homeostase do cobre, envelhecimento oxidativo e doenças neurodegenerativas. 2020. Tese (Doutorado em Ciencias ( Química Analítica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Elise Marques Freire Cunha

de Oliveira, A.H.C.; Pedrosa, A.L.;Murakami, M. T.; Tosi, L.R.O.; Borges, J.C.; Dinamarco, T.M.. Estudos estruturais e funcionais do fator inibitório da migração dos macrófagos de Leishmania major (LmMIF2) e de mutantes da região carboxi-terminal. 2019. Tese (Doutorado em Quimica - Universidade de São Paulo/FFCLRP) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Josielle Abrahão

Bertolini, M. C.;Murakami, M. T.DAMÁSIO, ANDRÉ R. L.; Oliveira, J. F.; Ramos, C.H.I. Caracterização conformacional e funcional de proteínas com domínio AAA através da investigação da ANKCLP humana e as Rvbs de Leishmania major e Saccharomyces cerevisiae. 2018. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Luciano Graciani Dolce

Oliveira, J. F.; Santos, A. M.; Cameron, L. C.; Araujo, A. P. U.;Murakami, Mário T.. Estudo do interactoma das miosinas V humanas. 2018. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Isabelle Lobo de Mesquita Sampaio

Forte, M.B.S.; Mariano, A. P.;Murakami, M. T.. Mathematical modeling of a packed-bed reactor with immobilized enzymes for xylose isomerization aiming at 2G ethanol production. 2018. Tese (Doutorado em Doutorado) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Caio Vinicius do Reis

Polikarpov, I.Murakami, M.T.; SQUINA, F. M.; Nascimento, A. S.. Produção heterologa, caracterização biofísica e estrutural de xilose isomerases visando potenciais aplicações na fermentação de pentoses.. 2017. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: LUANA PARRAS MELEIRO

FURRIEL, ROSA DOS PRAZERES MELOBuckeridge, Marcos S.; Marana, S. R.; GUAZZARONI, M. E.;Murakami, M.T.. Relação estrutura-função de uma beta-glucosidase estimulada por glicose e xilose do fungo termófillo Humicola insolens: estudos de evolução dirigida. 2017. Tese (Doutorado em Ciencias ( Química Analítica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Zaira Bruna Hoffman

Segato, F.; SATO, HÉLIA HARUMI; Silva, R.; Pichhi, S. C.;Murakami, M.T.. Estudo de enzimas xilanolíticas do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Valquiria Pianheri Souza

Murakami, M.T.; Tersario, Ivarne L.S.; Farah, C. S.; Marana, S. R.. Papel das redes estruturais nas propriedades de uma beta-glicosidase. 2017. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Danilo Elton Evangelista

Polikarpov, I.Murakami, M.T.; Rezende, C.A.; Souza, D.H.F.; de Marco, R.. Estudos funcionais e estruturais de pectinases e xilanases com potencial para aplicações industriais. 2017. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carla Cristina Polo

Fontes, M. R. M.Kobarg, J.Benedetti, C. E.Cabral, H.Murakami, M. T.. Investigação dos determinantes estruturais do modo de ação de endo e exo-arabinanases provenientes da microflora do rúmen bovino. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Vanessa de Oliveira Arnoldi Pellegrini

Polikarpov, I.; Nagem, R. A. P.;Arni, Raghuvir K.Murakami, M. T.; Driemeier, C. E.. Clonagem molecular, expressão, purificação e caracterização estrutural da endoglucanase de Trichoderma harzianum visando o desenvolvimento de coquetéis enzimáticos para a produção de etanol celulósico. 2016. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Atílio Tomazini Junior

Polikarpov, I.Ruller, R.Murakami, M. T.Segato, F.; Levin, D. B.. Estudos de proteômica, estruturais e funcionais de proteínas envolvidas na degradação da biomassa lignocelulósica: expansinas microbianas e hidrolases de glicosídeos termofílicas. 2016. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carolina Bezerra Bussoli

Gomes, E.; Pessoa-Junior, A.;Murakami, M. T.; Malaman, A.M.G.;Bonilla-Rodriguez, G.O.. Expressão heteróloga de celulases de Myceliophthora heterothallica F214 em Pichia pastoris e Escherichia coli com a caracterização e purificação das enzimas produzidas. 2016. Tese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rui Milton Patrício da Silva Júnior

ESPREAFICO, E. M.;Larson, R. E.; Baqui, M. M. A. B.;Murakami, M.T.; Andrade, L. C. A.. Cadeia leve de dineína-2: localização subcelular, dinâmica e influência na ciliogênese, via de Hedgehog e crescimento tumoral. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Plínio Salmazo Vieira

Bressan, G.C.; Smetana, JulianaOliveira, M. A.; WARD, RICHARD JOHN;Murakami, M. T.. Estrutura, conformação e inibição de quinases de Leishmania. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Andre Schutzer de Godoy

Nascimento, A. S.;Arni, R. K.; Silva, F. H.; Mascarenhas, Y. P.;Murakami, M. T.. Estudos estruturais e funcionais das enzimas beta-galactosidases de bactérias. 2016. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leandro Henrique de Paula Assis

Murakami, M. T.; Halder, C. V. F.; Souza, D. M.; Guido, R. V. C.; Navarro, M. V. A. S.. A descoberta da interação entre miosina Va e RPGRIP1L: caracterização do complexo e localização no centrossomo. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Mariana Abrahão Bueno de Morais

Polikarpov, I.; Farah, C. S.;Kobarg, J.; DE SOUZA, ANETE PEREIRA;Murakami, M.T.. Calcio, magnésio e pH modulam o estado oligomérico da 2-Cys peroxiredoxina mitocondrial de Leishmania. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: William Borges fernandes

Garratt, R.C.; Ramos, C.H.I; Farah, C. S.;Murakami, M. T.; Montanari, C. A.. Determinação do modo de interação de inibidores reversíveis da cruzaína de Trypanosoma cruzi via cristalografia de raios X. 2015. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciências) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Thiago vargas Seraphim

BORGES, JÚLIO C.; Thiemann, H. O.;Murakami, M. T.; Garratt, R.C.; Carrilho, E.. Estudo estrutural da co-chaperona Aha1 (Activator of Hsp90 ATPase 1) de Leishmania braziliensis e da sua ação sobre o ciclo funcional da Hsp90. 2015. Tese (Doutorado em Doutorado em Química) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Andrey Fabricio Ziem Nascimento

Kobarg, J.Fontes, M. R. M.; Cordeiro, A. T.; Terenzi, H. F.;Murakami, M. T.. Aspectos estruturais dos eventos moleculares associados à regulação e seletividade do transporte de cargas celulares pelas miosinas de classe V humanas. 2014. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Anelisa Ramão

Murakami, M. T.; Oliver, C.; Santos, M. F.; ESPREAFICO, E. M.. Miosina Va promove a desmontagem das adesões focais e a migração celular. 2014 - Universidade de São Paulo.

Aluno: Juliana Conrado Ferreira

Monteiro, H.; Chagas, J.;Murakami, M. T.; Bachara, E.V.J.H.; Nantes, I.L.. Caracterização dos intermediários de alta valência de citoglobina, mioglobina e neuroglobina como oxidantes de resíduos de cisteína específicos da enzima proteolítica Timet-oligopeptidase. Implicações no estresse oxidativo celular. 2014. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciências) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Joice Helena Paiva

Pereira, G.A.;Leme, A. P.; Marana, S. R.; Dias, M. V. B.;Murakami, M. T.. Estrutura, função e estabilidade de hidrolases glicosídicas pertencentes à família GH5 com potencial aplicação na conversão de biomassa lignocelulósica em açúcares fermentescíveis. 2013. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Marcelo Augusto dos Reis

Itri, R.;Murakami, M. T.; Skaf, M.S.; Bassi, A.M.S.. Aplicação de técnicas de espalhamento de raios X na caracterização estrutural de proteínas e modelagem computacional utilizando vínculos experimentais obtidos por SAXS. 2013. Tese (Doutorado em Doutorado em Química) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Gilvan Pessoa Furtado

Ward, R.J.Murakami, M. T.; Silva, R.N.; Barbosa, J.E.; Tine, M.A.S.. Determinantes estruturais da especificidade pelo substrato de CBMs e suas contribuições na ação de glicosil-hidrolases. 2013. Tese (Doutorado em Química USP-Ribeirão Preto) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Márcia Yuri Kondo

Juliano L.; Tersario I.L.S.;Cabral, H.; Ferro, E.S.;Murakami, M. T.. Caracterização do mecanismo catalítico da SGP, enzima protótipo das glutâmico peptidases. 2012. Tese (Doutorado em Biociências Bioquímica) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Nádia Helena Martins

Canduri, F.; Nagem, R. A. P.;Zeri, A. C.; Balan, A.;Murakami, M. T.. Estudos estruturais e biofísicos da enzima purina nucleosideo fosforilase de Bacillus subtilis 168. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Juliana Fattori

Murakami, M. T.; Khater, L.; Almeida, W.P.; Marsaioli, A.J.. Resolução estrutural de proteínas hipotéticas, chaperonas de secreção da bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2011. Tese (Doutorado em Doutorado) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Tatiane Luciano Balliano

Oliva, G.; Reboredo, E.H.;Fontes, M. R. M.Murakami, M. T.; Nagem, R. A. P.. Estudos em biologia estrutural e química medicinal no planejamento de inibidores da gliceraldeido-3-fosfato desidrogenase de Trypanosoma cruzi. 2010. Tese (Doutorado em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carolina Santacruz Pérez

Barbosa, J. A.; Farah, C. S.;Murakami, M. T.; Ho, P. L.. Estudos estruturais da proteína ModA e do sistema de transporte de molibdato da bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citr. 2010. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Daniella Barreto Barbosa Trivella

Fontes, M. R. M.Murakami, M. T.; Nonato, M.C.; Reboredo, E.H.;Polikarpov, I.. Bases moleculares e estruturais do reconhecimento de ligantes pela proteína transtirretina humana. 2010. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciências) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Bruno Menezes de Oliveira

Novello, J.C.; Werneck, C. C.; Pinto, L.M.A.;Kobarg, J.Murakami, M. T.. Caracterização estrutural e funcional de proteínas através de espectrometria de massas MALDI-TOF. 2009. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Evandro José Mulinari

de Marco, R.; Buckeridge, M. S.;Murakami, Mario Tyago. Prospecção, clonagem, expressão e caracterização heteróloga de enzimas termofilicas do fungo Thielavia terrestris com aplicação biotecnológicas. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Física Aplicada à Medicina e Biologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Julio Cesar Nunes

Garratt, R.C.; Andrade, E.;Murakami, M. T.. Investigação sobre o splicing alternativo mutuamente exclusivo e análise funcional das isoformas. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Nádia Helena Martins

Pereira, H.;Murakami, M. T.Zeri, A. C.. Estudos estruturais e biofísicos da enzima PNP de Bacillus subtilis. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Juliana Ferreira de Oliveira

Kobarg, J.; Werneck, C. C.;Murakami, M. T.. haracterization of the Trypanosoma cruzi ortholog of the SBDS protein. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Aline Lima de Oliveira

Werneck, C. C.; Paula, E.;Murakami, M. T.. 1H, 15N AND 13C resonance assignments of cerato platanin, a phytotoxic proteins from Ceratocystis fimbriata. 2008 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Felipe Cardoso Ramos

Ruller, R.Murakami, M.T.Alvarez T. M.. Avaliação da termoestabilidade e aplicação biotecnológica de endo-xilanase da família GH11. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Ana Claudia Mancusi Valeije

Thiemann, H. O.; Delbem, A. C. B.;Murakami, M. T.. Utilização de informações termodinâmicas e estruturais na predição de sítios de ligação de receptores nucleares ao DNA: uma abordagem computacional. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Liliane Maria Fernandes Oliveira

Murakami, M. T.Abrego, J. R. B.Arni, R. K.. Expressão, Purificação e Cristalização de Mutantes da Proteína Humana NUDEL (Nuclear Distribution Element-LIke)-Oligopeptidase. 2010. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Joane Kathelen Rodrigues Rustiguel

Murakami, M. T.; Nery, J. G.; Fadel, V.. Estudos teóricos sobre difração de raios X e cristalografia de proteínas. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Patricia Kimi Akao

Murakami, M. T.. Purificação e Cristalização da lisozima tipo G de Struthio camelus. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Samantha Sayumi Okada

Murakami, M. T.. Expressão e purificação do domínio C-terminal da RdRp de SBMV. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Leandro da Rocha

Murakami, M. T.. Expressão e purificação da proteina do movimento do PeRSV. 2008. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Juliana Silva Kawata Passos

Gaspar, J. O.; Belintani, P.;Murakami, M. T.. Purificação e produção de anti-soro para a proteína capsidial do Southern bean mosaic virus. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Matheus Sacilotto de Moura

Abrego, J. R. B.; Feitosa E. S.;Murakami, M. T.. Estudo das Variações Conformacionais das Albuminas de Diferentes Espécies Utilizando a Técnica de Espalhamento de Raios X a Baixos Ângulos (SAXS). 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Lívia Maria Faim

Ruggiero Neto, J.;Murakami, M. T.; Nery, J. G.. Estudo Estrutural da Chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis em Complexo com Ligantes. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ferreira, R. S.; Guido, R. V. C.;Murakami, M. T.. Concurso para vaga de Pesquisador em Biologia Estrutural. 2014. Fundação Oswaldo Cruz.

Murakami, M. T.Zeri, A. C.Kobarg, J.. Tecnico Nivel Superior. 2010. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.

Murakami, M. T.Ambrosio, A.; Mattos, F.. Físico. 2010. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.

Murakami, M. T.Benedetti, C. E.Barbosa, J. A.. Tecnico nível superior. 2009. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais.

Cruz, A. K.; Ribeiro, B. M.; Segurado, A. A. C.;Murakami, M.T.; Filho, M. C. S.. Livre Docente junto ao Departamento de Biologia Celular e Molecular e Bioagentes Patogênicos. 2017. Universidade de São Paulo.

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Comissão julgadora das bancas

Roberto da Silva

Silva, R; ARNI, Raghuvir Krishnaswamy; CAMARGO, Antonio Carlos Martins; ZANCHIN, Nilson Ivo Tonin; GUIMARÃES, Beatriz Gomes. Estratégias de inibição, mecanismos de moleculares e interações intermoleculares em complexos macromoleculares. 2006. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Roberto da Silva

Silva, R; FOSSEY, Marcelo Andrés; ARNI, Raghuvir Krishnaswamy. Aspectos estruturais da multi-funcionalidade de toxinas: Mecanismos e inibição.. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Beatriz Gomes Guimarães

ARNI, R. K.; CAMARGO, A. C. M.;ZANCHIN, N. I. T.GUIMARÃES, B. G.; SILVA, R.. Estratégias de Inibição, Mecanismos Moleculares e Interações Intermoleculares em Complexos Macromoleculares. 2006. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Nilson Ivo Tonin Zanchin

Arni, R.; SILVA, R.; Camargo A. C. M.;GUIMARAES, B. G.ZANCHIN, N. I. T.. Estratégias de Inibição, Mecanismos Moleculares e Interações Intermoleculares em Complexos Macromoleculares. 2006. Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Marcelo Andrés Fossey

ARNI, Raghuvir Krishnaswamy; SILVA, Roberto da;FOSSEY, M. A.. Aspectos Estruturais da Multi-Funcionalidade de Toxina: Mecanismos e Inibição. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Raghuvir Krishnaswamy Arni

Arni, R. K.. Aspectos Estruturais da Multi-Funcionalidade de Toxinas: Mecanismos e Inibicao. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Biofisica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas IBILCE/UNESP.

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Orientou

Ellen Karen Barreto Román

Estudo de doadores de eletrons para LPMOs; Início: 2018; Dissertação (Mestrado profissional em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Jose Alberto Diogo

Estudo do Sistema Celulolítico do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv; citri; Início: 2018; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Lucas Miranda Fonseca

Estudos funcionais e estruturais de beta-galactosidases; Início: 2017; Tese (Doutorado em Doutorado) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

Isabela Mendes Bonfim

Estudos das bases moleculares do sistema de degradação e utilização de mananas do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Marcele Pandeló Martins

Estudos de PULs da microbiota de herbívoros monogástricos; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Mariana Chinaglia

Estrutura e função de novas hidrolases glicosídicas; Início: 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

Rosa Lorizolla Cordeiro

Bases mecanísticas da adaptação evolutiva à temperatura e especificidade de hidrolases glicosídicas pertencentes a novas subfamílias GH5; Início: 2016; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Pedro Avellar Cabral Rodrigues Costa

Estudos estruturais e funcionais de clusters isofuncionais da família GH128; Início: 2014; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Atílio Tomazini Junior

Início: 2018; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Plínio Salmazo Vieira

Início: 2017; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Thamy Lívia Ribeiro Corrêa

Início: 2017; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico;

Carla Cristina Polo

Caracterização Molecular de domínios funcionais de miosinas de D; melanogaster; 2012; Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular e Funcional) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Angélica Rodriguez de Souza

Aspectos estruturais de duas enzimas relacionadas: liquenase e arabinofuranosidase termoestável; 2012; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Aline Sampaio Pinto

Investigações estruturais dos domínios funcionais das miosinas classes VIII e XI presentes em plantas; 2012; Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular e Funcional) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Patricia Kimi Akao

Estudos estruturais e biofísicos de uma metaloproteinase isolada de Bothrops moojeni e da endo-glicanase de Bacillus subtilis; 2011; Dissertação (Mestrado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Karine Fernanda dos Santos

ESTUDOS ESTRUTURAIS DO PRECURSOR DOS PEPTÍDEOS POTENCIADORES DE BRADICININA E DA PROTEÍNA NUDEL ? NUCLEAR DISTRIBUTION ELEMENT-LIKE; 2007; Dissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Mário Tyago Murakami;

Daniella G

O; de Oliveira; Functional and Structural Analyses of Two Fibrinogen-Activating Enzymes Isolated from the Venoms of Crotalus durissus terrificus and Crotalus durissus collilineatus; 2006; Dissertação (Mestrado em Biofisica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Mário Tyago Murakami;

Luciano Dolce

Estudos do efeito da fosforilação na conformação e seletividade da miosina Va humana; 2018; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Zaira Bruna Hoffmam

Estudo de enzimas do sistema xilanolítico de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2017; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas,; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Leandro Henrique de Paula Assis

Human Myosin-5A and the Intracellular Transport of Cargoes: Studies of the Myosin-5A and Adapter Proteins Complexes; 2016; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Mariana Abrahão Bueno de Morais

Calcio, magnésio e pH modulam o estado oligomérico da 2-Cys peroxiredoxina mitocondrial de Leishmania; 2016; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Carla Cristina Polo

Investigação dos determinantes estruturais do modo de ação de endo e exo-arabinanases provenientes da microflora do rúmen bovino; 2016; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Plínio Salmazo Vieira

Estrutura, conformação e inibição de quinases de Leishmania; 2016; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Andrey Fabricio Ziem Nascimento

Aspectos estruturais dos eventos moleculares associados à regulação e seletividade do transporte de cargas celulares pelas miosinas de classe V humanas; 2014; Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Joice Helena Paiva

Estrutura, função e estabilidade de hidrolases glicosídicas pertencentes à família GH5 com potencial aplicação na conversão de biomassa lignocelulósica em açúcares fermentescíveis; 2013; Tese (Doutorado em Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Anwar Ullah

Purification and characterization of snake venom proteins; 2013; Tese (Doutorado em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Mário Tyago Murakami;

Nádia Helena Martins

Estudos estruturais e biofísicos da enzima purina nucleosídeo fosforilase hexamérica de Bacillus subtilis 168; 2011; Tese (Doutorado em Genética) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Magno Massolino Viçoti

Estudos estruturais em solução de toxinas por SAXS; ; 2009; Tese (Doutorado em Pós-Graduação em Biofísica Molecular) - Universidade Estadual Paulista, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Mário Tyago Murakami;

Mariana Morais

2020; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Mário Tyago Murakami;

Fernanda Mandelli

2020; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais,; Mário Tyago Murakami;

Lucélia Cabral

2019; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Mário Tyago Murakami;

Mariane Noronha Dominguez

2018; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais,; Mário Tyago Murakami;

Flávio Henrique Moreira Souza

2017; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Mário Tyago Murakami;

Diego Mario Ruiz

2016; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Mário Tyago Murakami;

Valeria Rosana Turowski

2016; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Mário Tyago Murakami;

Joice Helena Paiva

2014; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Mário Tyago Murakami;

Daniel Maragno Trindade

2012; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Mário Tyago Murakami;

Tatiana de Arruda Campos Brasil de Souza

2012; Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Mário Tyago Murakami;

Camila Ramos Santos

2010; Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Mário Tyago Murakami;

Priscila Oliveira de Giuseppe

2010; Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, ABTLUS; Mário Tyago Murakami;

Vanesa Peixoto de Matos Martins

Caracterização de duas novas xilanases isoladas de fitopatógenos; 2014; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Rosa L

Cordeiro; Estudos estruturais de xiloglicanases do rumen bovino; 2013; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, ABTLUS; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Mariana Abrahão Bueno de Morais

Caracterização estrutural de enzimas do secretoma de T; cruzi e L; braziliensis; 2012; Iniciação Científica - Laboratório Nacional de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Bruna Marcatto Belli

Clonagem, expressão, purificação e cristalização de quinases de tripanosomatídeos; 2012; Iniciação Científica - Laboratório Nacional de Biociências, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Leandro Assis

Interactoma da MVa em cérebro humano fetal; ; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Joice Helena Paiva

Expressão, purificação e cristalização de proteínas; ; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Carla Cristina Polo

Estudos estruturais de lisozimas tipo G do albume de Struthio camelus; 2009; Iniciação Científica - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Aline Sampaio Pinto

Expressão, purificação e cristalização de proteínas envolvidas na via de sinalização sensível a rapamicina; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Leandro da Rocha

Expressão, purificação e reenovelamento da proteína do movimento do Pepper ringspot virus; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Samantha Sayumi Okada

Expressão, purificação e análise espectroscópica do domínio C-terminal da RNA polimerase dependente de RNA do SBMV; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Patricia Kimi Akao

Purificação, caracterização e cristalização da lisozima tipo-G do albume de Struthio camelus; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Simone Michelan Duarte

Cristalização de esfingomielinases D; 2005; 10 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Fabio H C Brandt

Purificação e caracterização de enzimas envolvidas na coagulação sanguinea de venenos de serpente; 2004; 10 f; Iniciação Científica; (Graduando em Ciencias Biologicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Daniel Maragno Trindade

Structural genomics of human myosins; 2012; Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Maria da Conceição Mendes Ferreira da Costa

Estrutura cristalográfica da endo-arabinanase de uma biblioteca metagenomica; 2011; Orientação de outra natureza; (Biologia) - Universidade Federal de Pernambuco, ABTLUS; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Priscila Oliveira de Giuseppe

Estudos estruturais de quinases de tripanosomatídeos como alvo para desenho de fármacos; 2011; Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Camila Ramos Santos

Especificidade e estabilidade de enzimas extremofílicas aplicadas a degradação de biomassa lignocelulósica; 2011; Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Mariana Abrahão Bueno

Expressão, purificação e cristalização da NEK kinase de Leishmania braziliensis; 2011; Orientação de outra natureza; (Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, ABTLUS; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Daiane Patricia Oldiges

Determinação da estrutura cristalina da arabinofuranosidase de T; petrophila; 2010; Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Tonielli Cristina Souza de Lacerda

Expressão, purificação e cristalização da nucleosídeo difosfato quinase b (NDKb) de Trypanosoma cruzi para estudos comparativos com a sua ortóloga de Leishmania major; 2010; Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais; Orientador: Mário Tyago Murakami;

Andrey Nascimento

Clonagem e expressão da cauda globular da miosina Va humana; 2009; Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais; Orientador: Mário Tyago Murakami;

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Foi orientado por

Carlos Henrique Inácio Ramos

Uso de espectrofotometria e calorimetria no estudo de mioglobinas; ; 2002; 0 f; Orientação de outra natureza - Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carlos Henrique Inacio Ramos;

Raghuvir Krishnaswamy Arni

Estudos Estruturais de: Domino Globular da Miosina Va (Gallus domesticus), Lopap (Lonomia obliqua) e Xilanase (Bacillus subitillis); ; 2006; Tese (Doutorado em Biofisica Molecular) - Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Raghuvir Krishnaswamy Arni

2007; Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Raghuvir Krishnaswamy Arni;

Raghuvir Krishnaswamy Arni

Estrutura e função de proteínas isoladas do veneno de Bothrops jararacussu; 2003; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia de Alimentos) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Raghuvir Krishnaswamy Arni;

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Produções bibliográficas

  • MORAIS, MARIANA ABRAHÃO BUENO DE ; POLO, CARLA CRISTINA ; DOMINGUES, MARIANE NORONHA ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; PIROLLA, RENAN AUGUSTO SIQUEIRA ; DE SOUZA, FLÁVIO HENRIQUE MOREIRA ; CORREA, JESSICA BATISTA DE LIMA ; DOS SANTOS, CAMILA RAMOS ; MURAKAMI, MÁRIO TYAGO . Exploring the Molecular Basis for Substrate Affinity and Structural Stability in Bacterial GH39 -Xylosidases. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY , v. 8, p. 419, 2020.

  • FONSECA, LUCAS MIRANDA ; PARREIRAS, LUCAS SALERA ; Murakami, Mario Tyago . Rational engineering of the Trichoderma reesei RUT-C30 strain into an industrially relevant platform for cellulase production. Biotechnology for Biofuels , v. 13, p. 93, 2020.

  • SANTOS, CAMILA R. ; COSTA, PEDRO A. C. R. ; VIEIRA, PLÍNIO S. ; GONZALEZ, SINKLER E. T. ; CORREA, THAMY L. R. ; LIMA, EVANDRO A. ; MANDELLI, FERNANDA ; PIROLLA, RENAN A. S. ; DOMINGUES, MARIANE N. ; CABRAL, LUCELIA ; MARTINS, MARCELE P. ; CORDEIRO, ROSA L. ; JUNIOR, ATÍLIO T. ; SOUZA, BEATRIZ P. ; PRATES, ÉRICA T. ; GOZZO, FABIO C. ; PERSINOTI, GABRIELA F. ; SKAF, MUNIR S. ; MURAKAMI, MARIO T. . Structural insights into -1,3-glucan cleavage by a glycoside hydrolase family. Nature Chemical Biology , v. x, p. x, 2020.

  • RADE, LETÍCIA L. ; DA SILVA, MELQUE N. P. ; VIEIRA, PLÍNIO S. ; MILAN, NATALIA ; DE SOUZA, CLAUDIA M. ; DE MELO, RICARDO R. ; KLEIN, BRUNO C. ; BONOMI, ANTONIO ; DE CASTRO, HEIZIR F. ; Murakami, Mário T. ; ZANPHORLIN, LETICIA M. . A Novel Fungal Lipase With Methanol Tolerance and Preference for Macaw Palm Oil. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY , v. 8, p. 304, 2020.

  • MARIUTTI, RICARDO B. ; HERNÁNDEZ-GONZÁLEZ, JORGE E. ; NASCIMENTO, ANDREY F.Z. ; DE MORAIS, MARIANA A.B. ; MURAKAMI, MARIO T. ; CARARETO, CLAUDIA M.A. ; Arni, Raghuvir K. . A single P115Q mutation modulates specificity in the Corynebacterium pseudotuberculosis arginine repressor. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS , v. 1864, p. 129597, 2020.

  • MANDELLI, FERNANDA ; DE MORAIS, MARIANA ABRAHÃO BUENO ; DE LIMA, EVANDRO ANTONIO ; OLIVEIRA, LEANE ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; MURAKAMI, MÁRIO TYAGO . Spatially remote motifs cooperatively affect substrate preference of a ruminal GH26-type endo--1,4-mannanase. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY , v. 295, p. jbc.RA120.0125, 2020.

  • MIYAMOTO, RENAN YUJI ; DE SOUSA, AMANDA SILVA ; VIEIRA, PLÍNIO SALMAZO ; DE MELO, RICARDO RODRIGUES ; SCARPASSA, JOSIANE ANIELE ; RAMOS, CARLOS HENRIQUE INÁCIO ; Murakami, Mario Tyago ; Ruller, Roberto ; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA . Crystal structure of a novel xylose isomerase from Streptomyces sp. F-1 revealed the presence of unique features that differ from conventional classes. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS , v. 1864, p. 129549, 2020.

  • DOLCE, LUCIANO G. ; OHBAYASHI, NORIHIKO ; SILVA, DANIEL F.C. DA ; FERRARI, ALLAN J.R. ; PIROLLA, RENAN A.S. ; SCHWARZER, ANA C. DE A.P. ; ZANPHORLIN, LETICIA M. ; CABRAL, LUCELIA ; FIORAMONTE, MARIANA ; RAMOS, CARLOS H.I. ; GOZZO, FABIO CESAR ; FUKUDA, MITSUNORI ; GIUSEPPE, PRISCILA O. DE ; Murakami, Mário T. . Unveiling the interaction between the molecular motor Myosin Vc and the small GTPase Rab3A. Journal of Proteomics , v. 212, p. 103549, 2020.

  • CORRÊA, THAMY LÍVIA RIBEIRO ; JÚNIOR, ATÍLIO TOMAZINI ; WOLF, LÚCIA DANIELA ; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA ; DOS SANTOS, LEANDRO VIEIRA ; Murakami, Mario Tyago . An actinobacteria lytic polysaccharide monooxygenase acts on both cellulose and xylan to boost biomass saccharification. Biotechnology for Biofuels , v. 12, p. 117, 2019.

  • SANTOS, CLELTON A. ; MORAIS, MARIANA A. B. ; TERRETT, OLIVER M. ; LYCZAKOWSKI, JAN J. ; ZANPHORLIN, LETÍCIA M. ; FERREIRA-FILHO, JAIRE A. ; TONOLI, CELISA C. C. ; MURAKAMI, MARIO T. ; DUPREE, PAUL ; SOUZA, ANETE P. . An engineered GH1 -glucosidase displays enhanced glucose tolerance and increased sugar release from lignocellulosic materials. Scientific Reports , v. 9, p. 4903, 2019.

  • SOUZA MORINI, FLÁVIA ; DE CASTRO, EMANUELLA ; DE MORAIS, STEPHANIE BATH ; LANCHEROS CONTRERAS, CESAR ; PEREIRA WEILER, ANA VALÉRIA ; Murakami, Mario Tyago ; PINGE-FILHO, PHILENO ; YAMADA-OGATTA, SUELI FUMIE ; DE ARRUDA CAMPOS BRASIL DE SOUZA, TATIANA . In-solution behavior and protective potential of asparagine synthetase A from Trypanosoma cruzi. MOLECULAR AND BIOCHEMICAL PARASITOLOGY , v. 230, p. 1-7, 2019.

  • DOLCE, LUCIANOG. ; SILVA-JUNIOR, RUI M.P. ; ASSIS, LEANDRO H.P. ; NASCIMENTO, ANDREY F.Z. ; ARAUJO, JACKELINES. ; MESCHEDE, INGRIDP. ; ESPREAFICO, ENILZAM. ; DE GIUSEPPE, PRISCILAO. ; MURAKAMI, MÁRIOT. . Myosin Va interacts with the exosomal protein spermine synthase. BIOSCIENCE REPORTS , v. 39, p. BSR20182189, 2019.

  • CORDEIRO, ROSA LORIZOLLA ; PIROLLA, RENAN AUGUSTO SIQUEIRA ; PERSINOTI, GABRIELA FELIX ; GOZZO, FÁBIO CESAR ; de Giuseppe, Priscila Oliveira ; Murakami, Mario Tyago . N-glycan Utilization by Bifidobacterium Gut Symbionts Involves a Specialist -Mannosidase. JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY , v. 431, p. 732-747, 2019.

  • ZANPHORLIN, LETÍCIA MARIA ; MORAIS, MARIANA ABRAHÃO BUENO DE ; DIOGO, JOSÉ ALBERTO ; DOMINGUES, MARIANE NORONHA ; SOUZA, FLÁVIO HENRIQUE MOREIRA DE ; Ruller, Roberto ; Murakami, Mario Tyago . Structure-guided design combined with evolutionary diversity led to the discovery of the xylose-releasing exo-xylanase activity in the glycoside hydrolase family 43. BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING , v. 116, p. 734-744, 2019.

  • LOPES, PRISCILA HESS ; Murakami, Mário T. ; PORTARO, FERNANDA C. V. ; MESQUITA PASQUALOTO, KERLY FERNANDA ; VAN DEN BERG, CARMEN ; TAMBOURGI, DENISE V. . Targeting Loxosceles spider Sphingomyelinase D with small-molecule inhibitors as a potential therapeutic approach for loxoscelism. JOURNAL OF ENZYME INHIBITION AND MEDICINAL CHEMISTRY (ONLINE) , v. 34, p. 310-321, 2019.

  • TOYAMA, DANYELLE ; DE MORAIS, MARIANA ABRAHÃO BUENO ; RAMOS, FELIPE CARDOSO ; ZANPHORLIN, LETÍCIA MARIA ; TONOLI, CELISA CALDANA COSTA ; BALULA, AUGUSTO FURIO ; DE MIRANDA, FERNANDO PELLON ; ALMEIDA, VITOR MEDEIROS ; MARANA, SANDRO ROBERTO ; Ruller, Roberto ; Murakami, Mario Tyago ; HENRIQUE-SILVA, FLAVIO . A novel -glucosidase isolated from the microbial metagenome of Lake Poraquê (Amazon, Brazil). BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS , v. 1866, p. 569-579, 2018.

  • TRIBST, ALLINE ARTIGIANI LIMA ; DE MORAIS, MARIANA ABRAHÃO BUENO ; TOMINAGA, CAROLINA YUMI ; NASCIMENTO, ANDREY FABRICIO ZIEM ; MURAKAMI, MÁRIO TYAGO ; CRISTIANINI, MARCELO . How high pressure pre-treatments affect the function and structure of hen egg-white lysozyme. Innovative Food Science & Emerging Technologies , v. 47, p. 195-203, 2018.

  • DE OLIVEIRA, RENATA ROCHA ; MORALES-NETO, RAPHAEL ; ROCCO, SILVANA APARECIDA ; SFORÇA, MAURÍCIO LUIS ; POLO, CARLA CRISTINA ; TONOLI, CELISA CALDANA COSTA ; MERCALDI, GUSTAVO FERNANDO ; CORDEIRO, ARTUR TORRES ; MURAKAMI, MÁRIO TYAGO ; FRANCHINI, KLEBER GOMES . Adenosine Kinase couples sensing of cellular potassium depletion to purine metabolism. Scientific Reports , v. 8, p. 11988, 2018.

  • DOS SANTOS, CAMILA RAMOS ; de Giuseppe, Priscila Oliveira ; DE SOUZA, FLÁVIO HENRIQUE MOREIRA ; ZANPHORLIN, LETÍCIA MARIA ; DOMINGUES, MARIANE NORONHA ; PIROLLA, RENAN AUGUSTO SIQUEIRA ; HONORATO, RODRIGO VARGAS ; TONOLI, CELISA CALDANA COSTA ; DE MORAIS, MARIANA ABRAHÃO BUENO ; DE MATOS MARTINS, VANESA PEIXOTO ; FONSECA, LUCAS MIRANDA ; BÜCHLI, FERNANDA ; DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO LOPES ; GOZZO, FÁBIO CESAR ; MURAKAMI, MÁRIO TYAGO . The mechanism by which a distinguishing arabinofuranosidase can cope with internal di-substitutions in arabinoxylans. Biotechnology for Biofuels , v. 11, p. 223, 2018.

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  • Murakami, M. T. ; Gava, L. M. ; Zela, S. P. ; Arruda, E. Z. ; Melo, P. A. ; Gutierrez, J. M. ; Arni, R.K. . Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of suramin,a highly charged polysulfonated napthylurea, complexed with amyotoxic PLA2 from Bothrops asper venom. Biochimica et Biophysica Acta. Protein Structure and Molecular Enzymology (Cessou em 2002. Cont. ISSN 1570-9639 Biochimica et Biophysica Acta. Protein , v. 1703, p. 83-85, 2004.

  • Murakami, M. T. ; Magro, A. J. ; Marcussi, S. ; Soares, A. M. ; Arni, R.K. ; Fontes, M. R. M. . Crystal structure of an acidic platelet aggregation inhibitor and hypotensive phospholipase A2 in the monomeric and dimericstates: insights into its oligomeric state. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print) , v. 323, p. 24-31, 2004.

  • Murakami, M. T. ; Watanabe, L. ; Gava, L. M. ; Zela, S. P. ; Cintra, A. C. O. ; Arni, R. K. . Initial structural analysis of an a4b4 C-type lectin from the venom of Crotalus durissus terrificus. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography , v. D59, p. 1813-1815, 2003.

  • Murakami, M. T. ; Arni, R. K. . A structure based model for liposome disruption and the role. Toxicon (Oxford) , v. 42, p. 903-913, 2003.

  • Murakami, M. T. ; Zela, S. P. ; Gava, L. M. ; Michelan-Duarte, S. ; Cintra, A. C. O. ; Arni, R. K. . Crystal structure of the platelet activator convulxin,a disulfide-linked a4b4 cyclic tetramer from the venom of Crotalus durissus terrificus. Biochemical and Biophysical Research Communications (Print) , v. 310, p. 478-482, 2003.

  • Ketelhut, D. F. J. ; Homem de Mello, M. ; Veronese, E. L. G. ; Esmeraldino, L. E. ; Murakami, M. T. ; Arni, R. K. ; Giglio, J. R. ; Cintra, A. C. O. ; Sampaio, S. V. . Isolation, characterization and biological activity of acidic phospholipaseA2 isoforms from Bothrops jararacussu snake venom. Biochimie (Paris. Print) , v. 85, p. 983-991, 2003.

  • Bortoleto, R. K. ; Murakami, M. T. ; Watanabe, L. ; Soares, A. M. ; Arni, R. K. . Purification, characterization and crystallization of Jararacussin-I, a fibrinogen-clotting enzyme isolated from the venom of Bothrops jararacussu. Toxicon (Oxford) , v. 40, p. 1307-1312, 2002.

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Outras produções

Vidal, R.O. ; Carazzolle, M.A. ; Trindade, D. M. ; Pereira, G.A. ; Murakami, M. T. . Structural Biology Helper. 2011.

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Projetos de pesquisa

  • 2017 - Atual

    Linha de Pesquisa: CAZymes Projeto III - TEMÁTICO FAPESP: Explorando novas estratégias para a despolimerização de polissacarídeos da parede celular vegetal, Descrição: A parede celular vegetal constitui uma importante barreira física contra patógenos e estresse químico e físico para as plantas e é formada essencialmente por polissacarídeos de grande importância biológica e industrial. Entretanto, o desafio de desmontar a parede celular vegetal e posteriormente despolimerizar estes polissacarídeos em açucares simples ainda não é um processo totalmente consolidado e economicamente viável para diversas aplicações industriais como, por exemplo, na produção de biocombustíveis. Em muitos casos, como na indústria têxtil e do papel, processos químicos são amplamente empregados em face do baixo custo; porém, há um grande impacto ambiental. Assim, desenvolver e descobrir novas estratégias e processos bioquimicamente mais eficientes para degradação e modificação de polissacarídeos vegetais são de grande interesse econômico. Além disso, existe um forte apelo biológico em relação as hidrolases glicosídicas (GHs) devido a participação direta em vários eventos fisio-(pato)-lógicos como na interação planta-patógeno, no ciclo do carbono e na homeostase celular de plantas. Apesar dos grandes avanços na área de Enzimologia de Carboidratos, nosso conhecimento ainda é limitado diante do vasto universo das GHs. Apenas uma fração muito pequena do repertório da natureza é conhecida e isso é evidenciado pela pequena taxa de enzimas caracterizadas em relação ao total de sequências conhecidas. Das mais de 330.000 GHs classificadas no banco de dados CAZy, apenas 2% já foram estudadas do ponto de vista bioquímico e menos ainda do ponto de vista estrutural. Portanto, neste projeto visamos explorar e entender, ao nível mecanístico, a diversidade funcional das GHs de nichos ainda pouco explorados como o fitopatógeno Xac e subfamílias inéditas das famílias 5 e 128. Para tanto, utilizaremos uma abordagem multidisciplinar que integrará estudos evolutivos, bioquímicos e estruturais, visando fornecer resultados que potencialmente revelarão novas estratégias para a despolimerização da parede celular vegetal e gerarão dados instrumentais para o uso racional e aperfeiçoado de GHs para fins industriais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Roberto Ruller - Integrante / Celso Eduardo Benedetti - Integrante / Leticia Maria Zanphorlin - Integrante / Rodrigo Vargas Honorato - Integrante / DE OLIVEIRA, PAULO SERGIO LOPES - Integrante.

  • 2015 - 2017

    Linha de pesquisa: Miosinas não-convencionais - Projeto III - FAPESP auxílio regular, Descrição: Neste atual projeto, em andamento, continuaremos nossos estudos, como anteriormente, nas MioVs. A combinação de abordagens estruturais e funcionais será mantida e nosso objetivo consistirá em responder novas perguntas que surgiram ao longo desses dois últimos anos de trabalho, como o papel da fosforilação na regulação de MyoVa e a importância do splicing alternativo no reconhecimento e seletividade de parceiros moleculares para MyoVa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Priscila de Oliveira Giuseppe - Integrante.

  • 2014 - 2016

    Linha de pesquisa: CAZymes - Projeto IIa - FAPESP multi-usuário, Descrição: Este projeto está associado ao projeto II e visou incorporar em nossa infraestrutura um novo equipamento (eletroforese capilar) que permitiu avançar nos estudos mecanísticos de CAZymes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Celisa C. C. Tonoli - Integrante / Camila Ramos Santos - Integrante., Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

  • 2013 - 2016

    Linha de pesquisa: CAZymes - Projeto II - FAPESP auxílio regular, Descrição: Este projeto é uma continuidade do projeto I e buscou entender as bases mecanísticas de novas CAZymes isoladas de patógenos de plantas, particularmente da bactéria Xanthomonas axonopodis pv. citri. Um dos destaques deste projeto foi a descoberta de uma nova atividade para a família GH10 e também de novas potenciais funções para enzimas desta família como na supressão da resposta imune de plantas. Além disso, baseado nestes estudos pudemos desenhar uma nova enzima que teve sua patente solicitada junto ao INPI.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Roberto Ruller - Integrante / Camila Ramos Santos - Integrante / Leticia Maria Zanphorlin - Integrante., Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5 / Número de orientações: 3

  • 2013 - 2015

    Linha de pesquisa: Miosinas não-convencionais - Projeto II - CNPq Universal, Descrição: Este projeto é continuidade dos projetos I e Ia da linha de pesquisa sobre o tráfego intracelular em eucariotos mediado por miosinas não convencionais. Essencialmente nesta etapa, demos prosseguimento na busca e descoberta de novos parceiros moleculares da MyoVa, um dos objetivos do projeto I.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Priscila de Oliveira Giuseppe - Integrante., Financiador(es): (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

  • 2011 - 2012

    Linha de pesquisa: CAZymes - Projeto I - FAPESP SMOLBNET2, Descrição: Neste projeto foram estudadas enzimas hipertermofílicas de interesse biotecnológico e fatores de transcrição relacionados com a superexpressão de hidrolases glicosídicas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Camila Ramos Santos - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Integrante., Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 12 / Número de orientações: 3

  • 2010 - 2012

    Linha de pesquisa: Miosinas não-convencionais - Projeto I - FAPESP auxílio regular, Descrição: O primeiro projeto nesta linha pesquisa intitulou-se "Investigações funcionais e estruturais dos mecanismos moleculares envolvidos na sinalização, regulação e ativação das miosinas Classe V" e teve como objetivo principal a elucidação das estruturas tridimensionais dos domínios de ligação a cargas dos três genes parálogos, MyoVa, Vb e Vc, além de obter informações a respeito da redundância e diferenciação funcional entre esses genes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Priscila de Oliveira Giuseppe - Integrante., Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

  • 2010 - 2011

    Linha de pesquisa: Miosinas não-convencionais - Projeto Ia - CNPq Universal, Descrição: Este projeto está associado ao projeto I sobre a elucidação das estruturas tridimensionais dos domínios CBDs das miosinas de classe V e teve como objetivos complementares os estudos estruturais de proteínas homólogas as de classe V encontradas em plantas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador / Daniel Maragno Trindade - Integrante., Financiador(es): (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1

  • 2007 - 2008

    Linha de pesquisa: Enzimas com potencias aplicações biomédicas e biotecnológicas - Preludio - CNPq Universal, Descrição: Este projeto consistiu do primeiro fomento do grupo de pesquisa ainda associado UNESP e visava dar início ao estudo de enzimas de interesse biotecnológico bem como uma continuidade dos estudos sobre enzimas de relevância biomédica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Mário Tyago Murakami - Coordenador., Financiador(es): (CNPq) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5

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Prêmios

2020

News & Views - Enzymes knuckle down to the job (https://www.nature.com/articles/s41589-020-0585-y), Nature Chemical Biology.

2020

Voices in Chemical Biology (https://www.nature.com/articles/s41589-020-0543-8), Nature Chemical Biology.

2020

Eleito membro da Acadêmia Brasileira de Ciências, Acadêmia Brasileira de Ciências.

2018

Melhor Tese de Doutorado do Programa de Pós-Graduação Biologia Funcional e Molecular - Aluna Mariana A. B. Morais, IB-UNICAMP.

2018

Poster award: beta-mannosidase From Human Gut Microbiome Displays a Novel Molecular Architecture, ENZITEC 2018.

2018

Poster award: Bacterial LPMO boots biomass degradation acting on both cellulose and hemicellulose, LPMO Symposium 2018.

2011

Poster award: Unraveling the Molecular Basis of the Intriguing Structure-Function-Stability Relationships in Thermostable GH5 Cellulases (J-44)., SBBq - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.

2006

1 Colocado no X Prêmio Jovem Talento em Ciências da Vida, Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular e General Eletric Health Care.

2005

Six Top choices, American Crystallographic Association.

1997

Posição de destaque nas Olimpiadas regional de matematica, UNESP - Campus Bauru.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol. , Rua Giuseppe Máximo Scolfaro, 10000. LNBio - Sala 78, Pólo II de Alta Tecnologia de, 13083970 - Campinas, SP - Brasil - Caixa-postal: 6192, Telefone: (19) 35183198, URL da Homepage:

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Experiência profissional

2009 - Atual

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Orientação e Docência em Pós-graduaçao, Carga horária: 5

Atividades

  • 10/2013 - 11/2013

    Ensino, Doutorado em Quimica - UNICAMP, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Módulo - Cristalografia de Proteínas

  • 08/2011 - 12/2011

    Ensino, BIOCIÊNCIAS E TECNOLOGIA DE PRODUTOS BIOATIVOS, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Técnicas Experimentais e Computacionais Aplicadas ao Estudo de Proteínas

  • 03/2009 - 07/2009

    Ensino, Biologia Funcional e Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Cristalografia de Macromoléculas

  • 03/2009 - 07/2009

    Ensino, Genética e Biologia Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Cristalografia de Macromoléculas

2007 - 2008

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor - MS3, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 02/2000 - 08/2008

    Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Linhas de pesquisa

  • 08/2007 - 12/2007

    Ensino, Ciências Biológicas - Turma 1, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biofísica

  • 08/2007 - 12/2007

    Ensino, Ciências Biológicas - Turma 2, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biofísica

  • 07/2007 - 11/2007

    Ensino, Microbiologia, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Estrutura e função de proteínas

  • 03/2007 - 08/2007

    Ensino, Biofísica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Estrutura e função de proteínas

  • 02/2007 - 02/2007

    Ensino, Biofisica Molecular, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Curso Tópicos em Bioquímica e Biofísica

  • 03/2006 - 07/2006

    Ensino, Química Ambiental, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Estágio Docência em Laboratório de Física II

2017 - Atual

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Investigador Principal - CTBE, Carga horária: 40

Outras informações:
Junto ao Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol (CTBE)

2008 - 2016

Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Investigador Principal - LNBio, Carga horária: 40

Outras informações:
Junto ao Laboratório Nacional de Biociências e Laboratório Nacional de Luz Síncrotron.

Atividades

  • 01/2018

    Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .,Cargo ou função, Diretor Científico.

  • 01/2017

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol.,Atividade realizada, Projetos de Inovação junto à Industrias de Biotecnologia.

  • 09/2008

    Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .,Linhas de pesquisa

  • 01/2017 - 01/2018

    Direção e administração, Laboratório Nacional de Ciência e Tecnologia do Bioetanol, .,Cargo ou função, Coordenador da Divisão Molecular.

  • 09/2008 - 01/2017

    Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Nacional de Biociências, .,Linhas de pesquisa

  • 02/2014 - 12/2016

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.,Atividade realizada, Projeto de Inovação com indústria.

  • 02/2011 - 12/2016

    Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Nacional de Biociências, .,Linhas de pesquisa

  • 04/2009 - 12/2016

    Direção e administração, Laboratório Nacional de Biociências, .,Cargo ou função, Coordenador da Instalação Aberta de Cristalização de Macromoléculas (RoboLab).

  • 05/2010 - 08/2016

    Direção e administração, Laboratório Nacional Luz Síncrotron, .,Cargo ou função, Coordenador da linha de luz MX2.

  • 01/2016 - 03/2016

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.,Atividade realizada, Curso de Verão do CNPEM.

  • 07/2015 - 07/2015

    Treinamentos ministrados , Laboratório Nacional Luz Síncrotron, .,Treinamentos ministrados, uso da linha de luz MX2 aos participantes da São Paulo School of Advanced Sciences on Recent Developments in Synchrotron Radiation (SyncLight 2015)

  • 01/2014 - 02/2014

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.,Atividade realizada, Curso de Verão do CNPEM.

  • 01/2013 - 02/2013

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.,Atividade realizada, Curso de Verão do CNPEM.

  • 01/2012 - 02/2012

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.,Atividade realizada, Curso de Verão do CNPEM.

  • 01/2011 - 02/2011

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.,Atividade realizada, Curso de Verão do CNPEM.

  • 09/2010 - 09/2010

    Treinamentos ministrados , Laboratório Nacional de Biociências, .,Treinamentos ministrados, Workshop sobre Faseamento Experimental de Macromoléculas

  • 09/2008 - 04/2010

    Direção e administração, Laboratório Nacional Luz Síncrotron, .,Cargo ou função, Coordenador da linha de luz MX1.

  • 01/2010 - 02/2010

    Outras atividades técnico-científicas , Laboratório Nacional de Biociências, Laboratório Nacional de Biociências.,Atividade realizada, Curso de Verão do CNPEM.

  • 05/2009 - 05/2009

    Treinamentos ministrados , Laboratório Nacional de Biociências, .,Treinamentos ministrados, Workshop sobre Cristalização de Macromoléculas

Propriedade Intelectual

Patentes (1)