bruno Francelino de Melo

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Comissão julgadora das bancas

Orientou

Foi orientado por

Produções bibliográficas

• FAIRCLOTH, B. C. ; ALDA, F. ; HOEKZEMA, K. ; BURNS, M. D. ; OLIVEIRA, C. ; ALBERT, J. S. ; MELO, B. F. ; OCHOA, L. E. ; ROXO, F. F. ; CHAKRABARTY, P. ; SIDLAUSKAS, B. L. ; ALFARO, M. E. . A Target Enrichment Bait Set for Studying Relationships among Ostariophysan Fishes. COPEIA , v. 108, p. 47-60, 2020.

• GAVAZZONI, M. ; PAVANELLI, C. S. ; GRACA, W. J. ; MELO, B. F. ; MARGARIDO, V. P. . Detection of natural hybridization and delimitation of two closely related operational taxonomic units of the Astyanax fasciatus (Teleostei: Characidae) complex through integrative approaches. BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY , v. XX, p. 1-14, 2020.

• DORINI, BEATRIZ F. ; RIBEIRO'SILVA, LUÍS R. ; Foresti, Fausto ; Oliveira, Claudio ; MELO, BRUNO F. . Molecular phylogenetics provides a novel hypothesis of chromosome evolution in Neotropical fishes of the genus (Teleostei, Curimatidae). JOURNAL OF ZOOLOGICAL SYSTEMATICS AND EVOLUTIONARY RESEARCH (ONLINE) , v. 00, p. jzs.12358, 2020.

• OCHOA, LUZ E. ; DATOVO, ALÉSSIO ; DONASCIMIENTO, CARLOS ; ROXO, FABIO F. ; SABAJ, MARK H. ; CHANG, JONATHAN ; MELO, BRUNO F. ; SILVA, GABRIEL S. C. ; FORESTI, Fausto ; ALFARO, MICHAEL ; Oliveira, Claudio . Phylogenomic analysis of trichomycterid catfishes (Teleostei: Siluriformes) inferred from ultraconserved elements. Scientific Reports , v. 10, p. 2697, 2020.

• MELO, B. F. . New species of Curimatopsis from the río Caroni, Orinoco basin, Venezuela, with comments on C. macrolepis (Characiformes: Curimatidae). Neotropical Ichthyology , v. 18, p. 000, 2020.

• SERRANO, ÉRICA A. ; MELO, BRUNO F. ; FREITAS-SOUZA, DIOGO ; OLIVEIRA, MARIA L. M. ; UTSUNOMIA, RICARDO ; Oliveira, Claudio ; FORESTI, Fausto . Species delimitation in Neotropical fishes of the genus Characidium (Teleostei, Characiformes). ZOOLOGICA SCRIPTA , v. 48, p. 69-80, 2019.

• BRITSKI, H. A. ; MELO, B. F. ; VARI, R. P. ; OLIVEIRA, C. . Revalidation and redescription of Steindachnerina nigrotaenia and redescription of S. insculpta (Characiformes: Curimatidae). Neotropical Ichthyology , v. 17, p. e180076, 2019.

• MATEUSSI, NADAYCA T.B. ; MELO, BRUNO F. ; FORESTI, Fausto ; Oliveira, Claudio . Molecular Data Reveal Multiple Lineages in Piranhas of the Genus Pygocentrus (Teleostei, Characiformes). Genes , v. 10, p. 371, 2019.

• ROXO, F. F. ; OCHOA, L. E. ; SABAJ, M. H. ; LUJAN, N. K. ; COVAIN, R. ; SILVA, GSC ; MELO, B. F. ; ALBERT, J. S. ; CHANG, J. ; FORESTI, F. ; ALFARO, M. E. ; OLIVEIRA, C. . Phylogenomic reappraisal of the Neotropical catfish family Loricariidae (Teleostei: Siluriformes) using ultraconserved elements. MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 135, p. 148-165, 2019.

• DUTRA, G. M. ; MELO, B. F. ; NETTO-FERREIRA, A. L. . A new species of Curimatopsis Steindachner (Characiformes: Curimatidae) from the Rio Nhamundá, Amazon basin. JOURNAL OF FISH BIOLOGY , v. 92, p. 515-522, 2018.

• MELO, B. F. ; DORINI, B. F. ; FORESTI, F. ; OLIVEIRA, C. . Little divergence among mitochondrial lineages of Prochilodus (Teleostei, Characiformes). Frontiers in Genetics , v. 9, p. 107, 2018.

• URBANSKI, B. Q. ; MELO, B. F. ; SILVA, G. S. C. ; BENINE, R. C. . A new species of Tetragonopterus (Characiformes: Characidae) from Central Amazon lowlands, Brazil. Neotropical Ichthyology , v. 16, p. e170158, 2018.

• ROXO, F. F. ; SILVA, G. S. C. ; MELO, B. F. . Hisonotus devidei , a new species from the São Francisco basin, Brazil (Siluriformes: Loricariidae). JOURNAL OF FISH BIOLOGY , v. 92, p. 1687-1701, 2018.

• BORTOLO, GUSTAVO C. ; LIMA, FLÁVIO C. T. ; MELO, BRUNO F. . A New Cyphocharax from the Lower Rio Tapajós, Amazon Basin, Brazil (Characiformes: Curimatidae). COPEIA , v. 106, p. 346-352, 2018.

• MELO, BRUNO F. ; SIDLAUSKAS, BRIAN L. ; HOEKZEMA, KENDRA ; VARI, RICHARD P. ; DILLMAN, CASEY B. ; Oliveira, Claudio . Molecular phylogenetics of Neotropical detritivorous fishes of the family Curimatidae (Teleostei: Characiformes). MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 127, p. 800-812, 2018.

• MELO, BRUNO F. . Cyphocharax boiadeiro, a new species from the upper rio Araguaia, Amazon basin, Brazil (Characiformes: Curimatidae). ZOOTAXA , v. 4247, p. 114-120, 2017.

• ROXO, F?BIO F. ; MELO, BRUNO F. ; SILVA, GABRIEL S. C. ; Oliveira, Claudio . New species of Parotocinclus (Siluriformes: Loricariidae) from coastal drainages of Rio de Janeiro, southeastern Brazil. ZOOTAXA , v. 4232, p. 260-270, 2017.

• NOBILE, A. B. ; FREITAS-SOUZA, D. ; LIMA, F. P. ; VIEIRA, L. B. ; MELO, B. F. ; OLIVEIRA, C. . Length-weight and length-length relationships of 16 fish species from Amapá, Brazilian Amazon. JOURNAL OF APPLIED ICHTHYOLOGY , v. 33, p. 1058-1061, 2017.

• MELO, B. F. ; OLIVEIRA, C. . Three new species of Curimatopsis (Characiformes: Curimatidae) from the Amazon basin. JOURNAL OF FISH BIOLOGY , v. 91, p. 528-544, 2017.

• MELO, B. F. ; VARI, RICHARD P. ; Oliveira, Claudio . Curimatopsis maculosa, a new species from the Rio Tapajós, Amazon basin, Brazil (Teleostei: Curimatidae). Ichthyological Exploration of Freshwaters , v. 27, p. 303-308, 2016.

• MELO, BRUNO F. ; BENINE, RICARDO C. ; SILVA, GABRIEL S.C. ; AVELINO, GLEISY S. ; Oliveira, Claudio . Molecular phylogeny of the Neotropical fish genus Tetragonopterus (Teleostei: Characiformes: Characidae). MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION , v. 94, p. 709-717, 2016.

• MELO, BRUNO F. ; SIDLAUSKAS, BRIAN L. ; HOEKZEMA, KENDRA ; FRABLE, BENJAMIN W. ; VARI, RICHARD P. ; Oliveira, Claudio . Molecular phylogenetics of the Neotropical fish family Prochilodontidae (Teleostei: Characiformes). Molecular Phylogenetics and Evolution (Print) , v. 102, p. 189-201, 2016.

• MELO, BRUNO F. ; BENINE, RICARDO C. ; BRITZKE, RICARDO ; GAMA, C. S. ; OLIVEIRA, C. . An inventory of coastal freshwater fishes from Amapá highlighting the occurrence of eight new records for Brazil. ZooKeys (Print) , v. 606, p. 127-140, 2016.

• FRABLE, BENJAMIN W. ; MELO, BRUNO F. ; SIDLAUSKAS, BRIAN L. ; HOEKZEMA, KENDRA ; VARI, RICHARD P. ; Oliveira, Claudio . Data on the multilocus molecular phylogenies of the Neotropical fish family Prochilodontidae (Teleostei: Characiformes). DATA IN BRIEF , v. 9, p. 128-142, 2016.

• SILVA, GABRIEL S. C. ; Roxo, Fábio F. ; MELO, BRUNO F. ; Oliveira, Claudio . New species of Curculionichthys (Siluriformes: Loricariidae) from the eastern Guiana Shield. ZOOTAXA , v. 4175, p. 281-291, 2016.

• VARI, R. P. ; MELO, B. F. ; OLIVEIRA, C. . Protocheirodon, a new genus of Characidae (Teleostei: Characiformes) with the redescription of the poorly known Protocheirodon pi. Neotropical Ichthyology , v. 14, p. 315-322, 2016.

• SILVA, GABRIEL S. C. ; MELO, BRUNO F. ; Oliveira, Claudio ; BENINE, RICARDO C. . Revision of the South American genus Tetragonopterus Cuvier, 1816 (Teleostei: Characidae) with description of four new species. ZOOTAXA , v. 4200, p. 1-46, 2016.

• MELO, BRUNO F. ; OCHOA, LUZ E. ; VARI, RICHARD P. ; Oliveira, Claudio . Cryptic species in the Neotropical fish genus Curimatopsis (Teleostei, Characiformes). ZOOLOGICA SCRIPTA , v. 45, p. n/a-n/a, 2016.

• BENINE, RICARDO C. ; MELO, BRUNO F. ; CASTRO, RICARDO M. C. ; Oliveira, Claudio . Taxonomic revision and molecular phylogeny of Gymnocorymbus Eigenmann, 1908 (Teleostei, Characiformes, Characidae) . ZOOTAXA , v. 3956, p. 1-28, 2015.

• MELO, BRUNO F. ; SIDLAUSKAS, BRIAN L. ; HOEKZEMA, KENDRA ; VARI, RICHARD P. ; Oliveira, Claudio . The first molecular phylogeny of Chilodontidae (Teleostei: Ostariophysi: Characiformes) reveals cryptic biodiversity and taxonomic uncertainty. Molecular Phylogenetics and Evolution (Print) , v. 70, p. 286-295, 2014.

• MELO, B. F. ; VARI, R. P. . New species of Cyphocharax (Characiformes: Curimatidae) from the upper rio Negro, Amazon basin. Neotropical Ichthyology (Impresso) , v. 12, p. 327-332, 2014.

• POLAZ, CARLA NATACHA MARCOLINO ; MELO, BRUNO F. ; BRITZKE, RICARDO ; RESENDE, EMIKO KAWAKAMI DE ; MACHADO, FRANCISCO DE ARRUDA ; LIMA, JOSÉ AUGUSTO FERRAZ DE ; PETRERE JR., MIGUEL . Fishes from the Parque Nacional do PantanalMatogrossense, upper Paraguai River basin, Brazil . Check List (São Paulo. Online) , v. 10, p. 122-130, 2014.

• SILVA, G. S. C. ; MELO, B. F. ; OLIVEIRA, C. ; BENINE, R. C. . Morphological and molecular evidence for two new species of Tetragonopterus (Characiformes: Characidae) from central Brazil. Journal of Fish Biology , v. 82, p. 1613-1631, 2013.

• MELO, BRUNO F. ; SATO, YOSHIMI ; FORESTI, Fausto ; Oliveira, Claudio . The roles of marginal lagoons in the maintenance of genetic diversity in the Brazilian migratory fishes Prochilodus argenteus and P. costatus. Neotropical Ichthyology (Impresso) , v. 11, p. 625-636, 2013.

• Melo, Bruno F ; Benine, Ricardo C ; Mariguela, Tatiane C ; Oliveira, Claudio . A new species of Tetragonopterus Cuvier, 1816 (Characiformes: Characidae: Tetragonopterinae) from the rio Jari, Amapá, northern Brazil. Neotropical Ichthyology (Impresso) , v. 9, p. 49-56, 2011.

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2019 - Atual

  Biodiversidade, Taxonomia e DNA Barcoding da família Curimatidae (Teleostei: Characiformes), Descrição: A ordem Characiformes constitui um dos maiores e mais diversificados grupos de peixes de água doce contendo atualmente cerca de 2.200 espécies, alocadas em cerca de 290 gêneros e 24 famílias. Curimatidae, a quarta maior família de Characiformes, possui, atualmente, 114 espécies válidas distribuídas em oito gêneros, e diversas espécies novas têm sido constantemente descritas. Análises recentes em diferentes coleções científicas têm mostrado evidência de ocorrência de novas espécies em, ao menos três gêneros de Curimatidae. O objetivo deste projeto envolve a geração de novos dados morfológicos que, em combinação com análises moleculares de delimitação de espécies, poderão revelar resultados interessantes sobre a biodiversidade de Curimatidae, incluindo a detecção de espécies crípticas e espécies não descritas. Também pretendemos obter espécies não amostradas na filogenia mais recente e estabelecer o posicionamento filogenético delas. Além disso, o projeto visa fortalecer uma rede de colaboração ligada à biodiversidade de Curimatidae, e também dará oportunidades para a formação de jovens pesquisadores nas áreas de sistemática, genética e evolução de peixes neotropicais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Brian L. Sidlauskas - Integrante / Claudio de Oliveira - Integrante / BENINE, R. C. - Integrante / Flávio C T Lima - Integrante / Beatriz F. Dorini - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2019 - Atual

  Phylogenomics of the African characiform families Alestidae, Citharinidae, Distichodontidae and Hepsetidae, Descrição: FAPESP 18/24040-5. Characiformes is one of the largest teleost assemblages with over 2000 valid species of characins, piranhas, tigerfish, tetras and relatives. They occupy a wide variety of freshwater ecosystems across immense regions in both tropical African and American continents. Four families and roughly 230 species inhabit Africa, from Nile valley to tropical sub-Saharan basins, whereas 20 families and over 1,800 species live in the Neotropical region from southern United States to Argentina and Chile, most of them widespread throughout the Amazon and adjacent basins. African characiforms are represented by four families: Alestidae (19 genera, 116 species), Citharinidae (three genera, eight species), Distichodontidae (17 genera, 104 species), and Hepsetidae (one genus, six species). Previous morphological and molecular studies disagree in the phylogenetic position of each of those families. While morphological phylogenies and an exon-based phylogeny place the suborder Citharinoidei (Citharinidae+Distichodontidae) as the first lineage to diverge within the Characiformes, multilocus and genomic studies have repeatedly found Citharinoidei as sister to remaining characiforms (Characoidei) and Siluriformes. These incongruences reinforce the need to further investigate the early-branch portion of Characiformes. Intrafamilial multilocus studies have demonstrated several instances of non-monophyly of several genera within the Alestidae (e.g., Alestopetersius, Brycinus) and Distichodontidae (e.g., Neolebias, Phago) and the placement of Arnoldichthys and Lepidarchus outside Alestidae. All these studies used a limited species coverage within the three analyzed families: ~45% in Alestidae, ~38% in Citharinidae, ~54% in Distichodontidae; and a molecular interspecific phylogeny is not available for Hepsetidae. Herein, we propose the construction of new phylogenies using a phylogenomic approach of sequence capture of ultraconserved elements (UCEs) through next-gen sequencing. The present study will be fundamental for a better understanding of evolutionary relationships in the early branching of the Characiformes and to test the hypotheses of interfamilial, intergeneric and interspecific relationships and macroevolutionary processes shaping this large teleost lineage.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Claudio de Oliveira - Integrante / Jairo Arroyave - Integrante / Melanie L. J. Stiassny - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

• 2017 - Atual

  Characinae (Actinopterygii: Characiformes: Characidae): identificação molecular e estudo das relações filogenéticas entre espécies, Descrição: Characinae é uma das subfamílias mais especiosas de Characidae, amplamente distribuída pela América do Sul e Central. A subfamília é representada por espécies de pequeno a médio porte que adotam diferentes estratégias alimentares, tais como carnivoria, onivoria e lepidofagia. As relações filogenéticas dentro de Characinae e desta com outras subfamílias de Characidae têm sido objeto de alguns estudos morfológicos, porém, não há, até o momento, hipóteses de relacionamento incluindo uma significativa representatividade de espécies de Characinae usando caracteres morfológicos ou moleculares. Além disso, os estudos publicados ainda apresentam incongruências nas relações intergenéricas e interespecíficas. O presente projeto esta inserido em um amplo estudo filogenético e evolutivo na ordem Characiformes e tem como objetivos testar as hipóteses de relações filogenéticas entre espécies e entre gêneros de Characinae, desta com as demais subfamílias de Characidae e criar um banco de dados genético para identificação molecular de todas as espécies da subfamília. Para os estudos filogenéticos usaremos cerca de 2000 loci de elementos ultraconservados (UCEs), marcadores nucleares ortólogos e altamente eficientes para a elaboração de filogenias moleculares, através de técnicas de sequenciamento de nova geração. Para a identificação molecular construiremos um banco de dados genéticos de DNA barcode com sequências do gene mitocondrial Citocromo Oxidase c subunidade I (COI). Os resultados deverão contribuir para ampliação do conhecimento sobre diversidade, filogenia e os processos evolutivos envolvidos na diversificação das espécies de Characinae, um dos maiores subclados de Characidae.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Claudio de Oliveira - Integrante / Camila S. Souza - Integrante.

• 2017 - Atual

  Revisão taxonômica e filogenia das espécies do grupo Leporinus obtusidens (Characiformes, Anostomidae), Descrição: O conhecimento sobre sistemática é essencial para os estudos das demais áreas da biologia. Os dois maiores grupos de peixes de água doce da América do Sul, os Siluriformes e os Characiformes estão sendo foco de grandes projetos de pesquisa do Brasil e no mundo. Leporinus (Anostomidae) é um dos gêneros de Characiformes mais diversos, com quase uma centena de espécies válidas. Apesar da taxonomia de Leporinus ter sido melhorada substancialmente nos últimos anos, há ainda muitas dúvidas sobre a validade e os limites de suas espécies. Leporinus obtusidens pertence a um grupo monofilético que abrange outras 10 espécies válidas, algumas com problemas taxonômicos a serem resolvidos. O grupo ainda possui pelo menos duas espécies que precisam ser descritas. O presente projeto se propõe a estudar a taxonomia e filogenia das espécies do grupo Leporinus obtusidens, com o exame de exemplares depositados em coleções científicas e também da coleta de novos exemplares. O projeto está associado a outros projetos de pesquisa e terá colaboração de outros pesquisadores e instituições nacionais e do exterior. Espera-se, ainda, a formação de recursos humanos na área de sistemática de peixes com a participação de estudantes de graduação e de pós-graduação.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Brian L. Sidlauskas - Integrante / Oscar Akio Shibatta - Integrante / Fernando Camargo Jerep - Integrante / José L O Birindelli - Integrante / Heraldo A Britski - Integrante / Naércio A Menezes - Integrante / Pedro M Galetti Jr - Integrante / Jorge L Ramirez - Integrante / Fernando M Assega - Integrante / Edson S Silva - Integrante.

• 2016 - 2018

  Identificação molecular de espécies de Curimata e Potamorhina (Characiformes, Curimatidae), Descrição: A ordem Characiformes constitui um dos maiores e mais diversificados grupos de peixes de água-doce contendo atualmente cerca de 2.400 espécies válidas, alocadas em cerca de 270 gêneros e 23 famílias. Curimatidae, a quarta maior família de Characiformes, possui, atualmente, 105 espécies válidas distribuídas em oito gêneros, e diversas espécies novas têm sido constantemente descritas. Análises genéticas recentes tem revelado a presença de diversas espécies não descritas e também crípticas. Todos os gêneros possuem revisão taxonômica, incluindo Curimata e Potamorhina, embora seja possível e provável a existência de novos táxons. O objetivo do presente projeto é estudar a biodiversidade através da identificação molecular (DNA barcoding) entre as diferentes espécies de Curimata e Potamorhina cobrindo toda a distribuição das espécies. Para isso, iremos gerar dados moleculares utilizando o marcador universal citocromo oxidase c subunidade I para o maior número de espécies possíveis para ambos os gêneros. Análises de delimitação de espécies, distância genética, Bayesiana e de verossimilhança serão realizadas em combinação com o exame de caracteres morfológicos. Nossos resultados irão permitir uma melhor delimitação das espécies, além de testar a hipótese de presença de táxons ainda não descritos e de também de espécies crípticas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Claudio de Oliveira - Integrante / Beatriz Ferreira Dorini - Integrante., Número de orientações: 1

• 2015 - 2019

  Filogenômica de Serrasalmidae e estudos morfológicos e moleculares em Catoprion e Pygocentrus (Teleostei: Characiformes), Descrição: A família Serrasalmidae é endêmica da região Neotropical e possui 16 gêneros, dos quais seis pertencem ao grupo chamado de "piranhas". Muitos estudos tem sido realizados ao longo dos anos a fim de se elucidar as composições dos gêneros e as relações entre eles e, embora a origem monofilética de Serrasalmidae seja bem estabelecida, vários aspectos das relações entre os subgrupos são conflitantes entre os estudos. Em todos eles, a presença do clado "piranha" (contendo Serrasalmus, Pristobrycon, Pygocentrus, Pygopristis, Catoprion e Metynnis) é um resultado unânime, porém são encontradas politomias e restam dúvidas sobre o monofiletismo e atribuições genéricas e específicas dos mesmos. Ainda, a inconsistência da descrição das espécies e seus atuais status taxonômicos dificultam o entendimento e o estudo para diversas áreas. Os elementos ultra conservados (ultraconserved elements - UCEs) são regiões extremamente conservadas do genoma e sua utilização para a sistemática filogenética tem se mostrado muito promissora. Sendo assim, o presente projeto pretende utilizar marcadores moleculares do tipo UCEs, além de análises morfológicas, para elucidar as relações existentes dentro do grupo das chamadas "piranhas", além do possível reconhecimento de novos taxa e o aperfeiçoamento da taxonomia do gênero com maior número de espécies, Serrasalmus.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Integrante / Claudio de Oliveira - Integrante / Nadayca Thayane Bonani Mateussi - Coordenador.

• 2015 - Atual

  Filogenômica da ordem Characiformes (Teleostei: Ostariophysi) utilizando elementos ultraconservados, Descrição: A ordem Characiformes, um dos principais componentes da fauna de peixes de água doce do mundo, com mais de 2000 espécies conhecidas, é um dos grupos menos estudado sob o ponto de vista sistemático. Dentro desta ordem está a família Characidae, uma das maiores famílias de peixes, com mais de 1000 espécies. Representantes dessa ordem sempre têm grande importância ecológica e econômica nas regiões onde ocorrem, sendo utilizados diretamente para o consumo humano ou na aquariofilia. Na região Neotropical, os Characiformes representam cerca de um terço de todas as espécies de peixes de água-doce. Um estudo recente, conduzido por nosso grupo de pesquisa, envolvendo dados moleculares, apresentou uma nova hipótese de relações entre Characiformes, propondo o reconhecimento de cinco famílias, não utilizadas anteriormente, e uma nova definição de Characidae. Embora este estudo tenha proporcionado um grande avanço no conhecimento sobre a sistemática de Characiformes, ainda há a necessidade de mais estudos, especialmente em relação a muitos grupos altamente diversos de Characidae e para várias famílias de Characiformes. Uma revisão geral da literatura disponível revela que também é nítido a necessidade de utilização de novos e mais resolutivos marcadores moleculares, uma vez que muitas das relações entre as famílias ainda são pouco resolvidas. Neste sentido, estamos propondo a reconstrução filogenômica de Characiformes, empregando as técnicas mais modernas de sequenciamento de segunda geração de elementos ultraconservados (UCEs), cuja utilização na sistemática filogenética tem se mostrada promissora. Assim, o presente projeto deverá ser fundamental para uma melhor compreensão dos grupos monofiléticos que constituem Characiformes e para testar as hipóteses sobre as relações entre as famílias, as relações entre os gêneros e espécies dentro das famílias e da biogeografia histórica do grupo, que hoje é amplamente distribuído em muitas bacias das regiões Etiópica e Neotropical.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Michael Alfaro - Integrante / VARI, RICHARD P. - Integrante / Claudio de Oliveira - Integrante.

• 2015 - Atual

  Filogenia da hiperdiversa Ordem Characiformes (Teleostei: Ostariophysi) utilizando elementos ultraconservados, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Claudio de Oliveira em 20/11/2015., Descrição: A ordem Characiformes, um dos principais componentes da fauna de peixes de água doce do mundo, com mais de 2000 espécies conhecidas, é um dos grupos menos estudado sob o ponto de vista sistemático. Dentro desta ordem esta a família Characidae, uma das maiores famílias de peixe, com mais de 1000 espécies. As espécies dessa ordem sempre têm grande importância ecológica e econômica nas regiões onde ocorrem, sendo utilizados diretamente para o consumo humano ou na aquariofilia. Na região Neotropical, Characiformes representam cerca de um terço de todas as espécies de peixes de água doce. Um estudo recente, conduzido por nosso grupo de pesquisa, envolvendo dados moleculares, apresentou uma nova hipótese de relações entre Characiformes, propondo o reconhecimento de cinco famílias, não utilizadas anteriormente, e uma nova definição de Characidae. Embora este estudo tenha proporcionado um grande avanço no conhecimento sobre a sistemática de Characiformes, ainda há a necessidade de mais estudos, especialmente em relação a muitos grupos altamente diversos de Characidae e para várias famílias de Characiformes. Uma revisão geral da literatura disponível revela que também é nítido que há uma necessidade de utilização de marcadores moleculares novos e mais resolutivos, uma vez que muitas das relações entre as famílias ainda são pouco resolvidas. Neste sentido, estamos propondo a construção de uma nova filogenia, empregando as técnicas mais modernas de sequenciamento de segunda geração (filogenômica) de elementos ultraconservados (UCEs), cuja utilização na sistemática filogenética tem dados mostrando promissores. Neste projeto também estamos propondo o enriquecimento de bancos de dados moleculares, como o bando de dados BOLD, para permitir a identificação molecular de todas as espécies a serem analisadas no presente estudo. Assim, o presente projeto deverá ser fundamental para uma melhor compreensão do que grupos constituem a ordem Characiformes e para testar as hipóteses sobre as relações entre as famílias, as relações entre os gêneros e espécies dentro das famílias e da biogeografia histórica do grupo, que hoje é amplamente distribuído em muitas bacias das regiões Neotropical e Etiópica. Temático FAPESP 14/26508-3.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Integrante / Ricardo Cardoso Benine - Integrante / Richard P Vari - Integrante / Brian L. Sidlauskas - Integrante / Michael Alfaro - Integrante / Claudio de Oliveira - Coordenador / Brant Faircloth - Integrante.

• 2013 - 2017

  HARNESSING MODERN PHYLOGENETIC COMPARATIVE METHODS TO UNDERSTAND THE DIVERSIFICATION OF ANOSTOMOID FISHES, Descrição: This project investigates how the biodiversity of one of the world's most important groups of freshwater fishes evolved. Containing tetras, piranhas and many other popular aquarium fishes, order Characiformes represents one of the most diverse groups of fishes on the planet, but some of its families include species of many varying shapes, sizes and diets, while others include numerous species with similar habitats, food sources and anatomies. Why are some groups more diverse than others? How do its many species fit together on their family tree? How do a dozen or more ecologically similar species coexist in a single river? This project will tackle such questions by assembling a comprehensive tree-of-life for the very diverse characiform superfamily Anostomoidea (headstanders and relatives) using traditional DNA analysis, study of skeletal anatomy, and a new genomic approach. Then, that tree-of-life will serve as a framework with which to investigate the evolution of anatomical and ecological biodiversity. Overall, this project synthesizes the expertise and genetic resources of two countries to forge an enduring international collaboration and reconstruct the evolutionary history of some of the most intriguing South American fishes with precision and detail that would be impossible if the labs were to work alone. It draws on diverse human capital in the US and in Brazil, including the author of previous evolutionary studies on these fishes, one of Brazil's leading fish geneticists, an expert on taxonomy, a leader in genomics and macroevolution, and students in both countries. Other broader impacts include the involvement of undergraduate students in research and outreach, development of a DNA-barcode library and interactive online identification key, sponsorship of graduate students at a training workshop and active participation in the Smithsonian's "The Scientist is In" program, which brings the public into direct contact with museum-affiliated researchers and specimens. Financial support: National Science Foundation. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Integrante / Claudio Oliveira - Integrante / Richard P Vari - Integrante / Brian L. Sidlauskas - Coordenador / Kendra Hoekzema - Integrante / Michael Alfaro - Integrante.

• 2013 - 2016

  Sistemática das Subfamílias Tetragonopterinae e Stethaprioninae (Characiformes: Characidae), Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Ricardo Cardoso Benine em 31/07/2015., Descrição: Um dos maiores componentes da fauna de peixes de água doce do mundo é a ordem Characiformes, que também é um dos grupos menos estudados do ponto de vista sistemático. A família Characidae, com 58% (cerca de 1.100 espécies) das espécies hoje reconhecidas de Characiformes, é a maior em número de espécies em Characiformes e é também a área mais ativa em termos de descrição de espécies na ordem (mais de 250 espécies novas descritas nos últimos 10 anos ou cerca de 80% de todos os Characiformes). Um componente importante da família Characidae, a subfamília Tetragonopterinae ainda permanece em um estado confuso quanto às suas relações filogenéticas em Characidae, considerando que hipóteses com base em caracteres morfológicos e moleculares apontam para topologias conflitantes que resultam em situações taxonômicas distintas, envolvendo diretamente a subfamília Stethaprioninae. Dessa forma, o presente projeto visa envidar esforços para um melhor entendimento das relações filogenéticas e composição taxonômica e caracterização das subfamílias Tetragonopterinae e Stethaperioninae, com base tanto em caracteres morfológicos quanto moleculares.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Integrante / Claudio Oliveira - Integrante / Benine, Ricardo C - Coordenador / Gabriel S Costa e Silva - Integrante / Marina Gimenez Petrolli - Integrante / James Raul Garcia Ayala - Integrante / Paloma Lima - Integrante / Valter Monteiro Azevedo Santos - Integrante / Barbara Martins - Integrante.

• 2013 - 2014

  Relações filogenéticas na superfamília Anostomoidea (Ostariophysi: Characiformes) usando abordagem Multilocus e Filogenômica, Descrição: Este projeto visa investigar como a biodiversidade de uma dos grupos mais especiosos de peixes evoluiu. Characiformes representa uma das mais diversas ordens de peixes do planeta, mas algumas de suas famílias incluem espécies de variadas formas, tamanhos e dietas, enquanto outras incluem numerosas espécies com habitats, alimentação e anatomias similares. Por que alguns grupos são mais diversos que outros? Como suas espécies são arranjadas em suas árvores filogenéticas? Como pode uma dúzia ou mais de espécies ecologicamente similares coexistirem em um único rio? Este projeto vai abordar tais questões através de uma compreensiva árvore-da-vida com a diversa superfamília Anostomoidea (Anostomidae, Chilodontidae, Curimatidae e Prochilodontidae) usando sequenciamento tradicional de DNA de Sanger e de sequencimento de Nova-geração usando Elementos Ultraconservados (UCEs, sigla em inglês). Assim, essa árvore-da-vida servirá como base para a investigação da evolução da biodiversidade anatômica e ecológica. Finalmente, este projeto sintetiza o conhecimento e os recursos genéticos de dois países para criar uma grande colaboração internacional e reconstruir a história evolutiva de alguns dos mais intrigantes peixes sul-americanos. Processo FAPESP 2013/16436-2.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Claudio Oliveira - Integrante / Richard P Vari - Integrante / Brian L. Sidlauskas - Integrante / Michael Alfaro - Integrante.

• 2012 - 2016

  Gui-BOL Barcoding Guianese fishes, Descrição: Barcoding of all fishes from the Guiana Shield (South America).. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Integrante / Claudio Oliveira - Integrante / Richard P Vari - Integrante / Brian L. Sidlauskas - Integrante / Raphael Covain - Coordenador / Sonia Fisch Muller - Integrante / Pierre Yves Le Bail - Integrante / Jan H. Mol - Integrante.

• 2011 - 2015

  Relações filogenéticas na superfamília Anostomoidea (Ostariophysi: Characiformes), Descrição: A superfamília Anostomoidea representa um extenso grupo de peixes da ordem Characiformes, amplamente distribuído pelas drenagens neotropicais e habitam uma variedade de ecossistemas de água-doce, representando uma proporção significante da biomassa em algumas regiões. A superfamília Anostomoidea é reconhecidamente monofilética e formada por quatro famílias: Anostomidae, Chilodontidae, Curimatidae e Prochilodontidae. As relações deste grupo com outras famílias têm sido estudadas por diversos autores, mas as hipóteses já apresentadas são ainda discordantes. Internamente, as hipóteses filogenéticas de relação entre as famílias Anostomidae e Chilodontidae e entre Curimatidae e Prochilodontidae são suportadas por diversas sinapomorfias baseadas em caracteres morfológicos, porém não corroboradas por estudos moleculares. A incongruência entre os resultados propostos, associada a uma pequena representatividade da diversidade de espécies nestes estudos evidencia a importância de um estudo aprofundado acerca das relações em Anostomoidea, utilizando de uma amostragem ampla. Neste contexto, o principal objetivo do presente projeto é estudar as relações filogenéticas entre as famílias de Anostomoidea e entre os gêneros de suas famílias com base em sequências de três genes nucleares e três mitocondriais. Pretende-se também realizar análises de evidência total somando os dados morfológicos com dados moleculares. Para tanto serão também analisados os caracteres morfológicos já descritos e, para os grupos nos quais esses dados não estão disponíveis, esses dados deverão ser levantados durante o presente projeto. Outro ponto importante é testar as hipóteses de relação entre as famílias, principalmente a posição de Chilodontidae, já que existem discordâncias sugeridas por estudos prévios. Os resultados que serão obtidos deverão contribuir para o entendimento dos processos evolutivos que proporcionaram a diferenciação genética e a origem de grandes subgrupos de Characiformes. Processo FAPESP 2011/08374-1. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Claudio Oliveira - Integrante / Richard P Vari - Integrante / Brian L. Sidlauskas - Integrante.

• 2010 - 2014

  Conservação de Peixes Continentais nas Bacias Brasileiras: impactos, espécies e indicadores, Descrição: O Centro Nacional de Pesquisa e Conservação de Peixes Continentais - CEPTA / ICMBio - tem por missão a pesquisa e o manejo para a conservação das espécies, sobretudo ameaçadas, de peixes continentais em todo território nacional. É também o centro especializado do Instituto Chico Mendes responsável pela avaliação do estado de conservação da ictiofauna de água doce, processo este que fundamenta: 1) a elaboração e atualização das listas de espécies ameaçadas do grupo taxonômico em questão, e 2) a elaboração e implementação de Planos de Ação para as espécies em situação de ameaça. Para isto, o CEPTA tem conduzido, ao longo de sua história institucional, diversos projetos de pesquisa em diferentes bacias hidrográficas: Amazônica, Paraná-Paraguai, Araguaia-Tocantins e Bacias do Leste, principalmente a do Rio Paraíba do Sul. O presente grupo tem por objetivo, além da realização de pesquisas voltadas à conservação das espécies de peixes continentais nestas bacias, a síntese de resultados já obtidos no decorrer desses anos de pesquisa e atuação. Espera-se, com estes resultados, contribuir para a implementação de instrumentos efetivos de conservação, com ênfase na construção de indicadores de qualidade ambiental.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Integrante / Claudio Oliveira - Integrante / Carla Natacha Marcolino Polaz - Coordenador / José Augusto Senhorini - Integrante / José Oswaldo Junqueira Mendonça - Integrante / Paulo Sérgio Ceccarelli - Integrante / Leonardo Milano - Integrante / Ricardo Britzke - Integrante / Luís Alberto Gaspar - Integrante.

• 2009 - 2011

  Genética de Populações de Prochilodus argenteus e P. costatus do médio São Francisco, Descrição: A bacia hidrográfica do rio São Francisco conta com uma rica fauna de peixes, muitos de elevada importância para a pesca de subsistência, artesanal, industrial e para aquicultura. Dentre os peixes de maior interesse econômico, os curimbatás (Prochilodus) são os mais capturados nos últimos anos, representado cerca de 12% da pesca no Brasil. O curimbatá-pacu (P. argenteus) é a espécie de maior porte alcançando até 15 kg e responsável por até 50% do pescado no Rio São Francisco. O curimbatá-pioa (P. costatus) tem um importante papel ecológico devido a seus hábitos alimentares e também representa uma relevante parcela na pesca artesanal na região. O principal objetivo do presente projeto será testar a hipótese de que os peixes que vivem no rio São Francisco são oriundos não apenas das lagoas marginais encontradas ao longo de seu leito, mas também das lagoas marginas dos seus principais tributários. Para tanto, serão analisados, através de análises de sequências do DNA mitocondrial e de microssatélites em pelo menos 30 exemplares de cada espécie coletados em lagoas marginais dos cinco principais tributários do médio São Francisco, lagoas marginais do próprio rio São Francisco, no leito do rio em um ponto próximo a barragem de Três Marias e em um ponto a jusante da desembocadura do rio Abaeté. Os resultados deverão ser bastante úteis para uma melhor compreensão da estrutura genética destas espécies, da importância das lagoas marginais na manutenção da ictiofauna do rio São Francisco e também sobre a importância dos tributários na manutenção da fauna da calha principal do rio.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Bruno Francelino de Melo - Coordenador / Claudio Oliveira - Integrante / Fausto Foresti - Integrante / Yoshimi Sato - Integrante.

Prêmios