Leandro José de Assis
Graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Lavras (2005) - Graduação em Biomedicina pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2008). Doutorado em Química Biológica (Bioquímica) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2009). Pós doutorado Maynooth University - Irlanda (2016), Pós doutorado Georg-August-University of Gottingen - Germany (2018), Pós doutorando na Universidade de São Paulo (2013-2019), Research Fellow University of Exeter - England. Linhas de pesquisa: Saccharomyces cerevisiae (Estudo do metabolismo fermentativo e sinalização de glicose); Aspergillus nidulans (Estudo do sistema de repressão catabólica do carbono e produção de enzimas hidrolíticas envolvendo as vias de sinalização PKA [protein kinase A], MAPK [mitogen-activated protein kinase] e vias de degradação reguladas por proteínas F-box); Aspergillus fumigatus (Estudo do envolvimento da subunidade catalítica proteína quinase dependente de cAMP na formação da parede celular em resposta ao estresse osmótico, regulação do metabolismo em processos de infecção, comunicação entre vias de sinalização MAPKs e PKA). Experiência em bioquímica, proteômica, genética e metabolismo de fungos.
Informações coletadas do Lattes em 04/07/2025
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Química Biológica
2009 - 2013
Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Caracterização Cinética da Ser/Thr fosfatase SIT4 e seu papel na Regulação da Piruvato Descarboxilase 1 por Fosforilação em Saccharomyces cerevisiae
, Ano de obtenção: 2013. Monica Motero Lomeli. Coorientador: José Daniel de Figueroa Villar. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Saccharomyces cerevisiae; Sit4; Fosfatase; TOR; descarboxilase.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.
Graduação em Ciências Biológicas Modalidade Médica
2005 - 2009
Universidade Federal do Rio de Janeiro
Título: Caracterização e Expressão de Sit4, um gene envolvido na via TOR
Orientador: Mònica Montero Lomelí
Bolsista do(a): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ, FAPERJ, Brasil.
Graduação interrompida em 2005 em Ciências Biológicas
2003 - Atual
Universidade Federal de Lavras
Ano de interrupção: 2005
Pós-doutorado
2018
Pós-Doutorado. , Georg-August-Universitat Gottingen, GAUG, Alemanha. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas
2016
Pós-Doutorado. , National University of Ireland Maynooth, NUI, Irlanda. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.
2015
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica de Microrganismos. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
2013 - 2014
Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Formação complementar
2011 - 2011
Curso Básico de Propriedade Intelectual. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.
2008 - 2008
Modelagem molecular. (Carga horária: 225h). , Instituto Militar de Engenharia, IME, Brasil.
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Metabolismo e Bioenergética.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Proteômica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos.
Participação em eventos
Fungal Threats Conference.Cooperation between PKA and HogAHOG1 pathway is affecting cell wall carbohydrate mobilization in Aspergillus fumigatus. 2019. (Simpósio).
International Symposium on Fungal Stress (ISFUS).Cooperation between protein kinase A (PKA) and high osmolarity glycerol response (HOG) pathways is affecting cell wall carbohydrate mobilization in Aspergillus fumigatus. 2019. (Simpósio).
ECFG14 European Conference on Fungal Genetics. SakA and MpkC interact with PkaAC1 to regulate the mobilization of carbon sources required for cell wall biosynthesis in Aspergillus fumigatus. 2018. (Congresso).
ECFG14 European Conference on Fungal Genetics. Regulation of Aspergillus nidulans CreA-mediated catabolite repression by the F-box proteins Fbx23 and Fbx47. 2018. (Congresso).
28th Fungal Genetics Conference. Multiple phosphatases regulate carbon source dependent germination and primary metabolism in Aspergillus nidulans. 2015. (Congresso).
22˚ Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP). 2014. (Simpósio).
BBEST Brazilian BioEnergy Science and Technology Conference.Functional Characterization of Aspergillus nidulans phosphatases involved in glucose metabolism. 2014. (Simpósio).
21˚ Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP (SIICUSP).Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP. 2013. (Simpósio).
Second Generation Bioethanol: Enzymatic Hydrolysis. 2013. (Simpósio).
Sociedade Brasileira de Biologia Celular. 2012. (Congresso).
Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Atividade de Pdc1 de Saccharomyces cerevisiae é induzida por fosforilação e regulada indiretamente pela Ser/Thr fosfatase Sit4. 2012. (Congresso).
VI Semana de Pós-Graduação Bioquímica Médica.Atividade de Pdc1 de Saccharomyces cerevisiae é induzida por fosforilação e regulada indiretamente pela Ser/Thr fosfatase Sit4. 2012. (Simpósio).
II Simpósio Sul-Americano de Terapia Gênica. 2011. (Simpósio).
Simpósio Sul-Americano de Terapia Gênica. 2011. (Simpósio).
V Semana de Pós-Graduação de Bioquímica Médica.Atividade de Pdc1 de Saccharomyces cerevisiae é induzida por fosforilação e regulada indiretamente pela Ser/Thr fosfatase Sit4. 2011. (Simpósio).
XVIII Simpósio Nacional de Bioprocessos.Atividade Pdc1p de Saccharomyces cerevisiae é Induzida por Fosforilação e Regulada pela Ser/Thr Fosfotase Sit4. 2011. (Simpósio).
IV Semana de Pós-Graduação da Bioquímica Médica.Atividade da Piruvato Descaboxilase de Saccharomyces cerevisiae é induzida por fosforilação. 2010. (Simpósio).
Sociedade Brasileira de Bioquimica e Biologia Molecular - SBBq. Piruvato Descarboxilase de Saccharomyces cerevisiae é induzida por fosforilação. 2010. (Congresso).
V Escola de Modelagem Computacional em Sistemas Bioléogicos. 2010. (Simpósio).
III Semana de Pós-Graduação de Bioquímica Médica. 2009. (Simpósio).
Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Moleuclar - SBBq. Activity in vitro and Identification ps Targets os phosphorylation Se/Thr Phosphatase Sit4 from Saccharomyces cerevisiae. 2009. (Congresso).
II Simpósio de Oncobiologia.Caracterização e Expressão de genes envolvidos na via TOR. 2008. (Simpósio).
Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Caracterization and Expression of Sit4, A Gene Involved in TOR Pathway. 2008. (Congresso).
Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Bipolar Disorder vs Galactosemia: Effect of Lithium in Galactose metabolism in Saccharomyces cerevisiae. 2008. (Congresso).
I Simposio de Oncobiologia.Caracterização de Sit4 e identificação de alvos de fosforilação envolvidos na via TOR. 2007. (Simpósio).
Sociedade Barsileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Cloning, expression and purification of SIT4, a Ser/Thr phosphatase from Saccharomyces cerevisiae. 2006. (Congresso).
Orientou
Identificação de Alvos de fosforilação da Ser / Thr Fosfatase Sit4; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Leandro José de Assis;
Identificação de Alvos de fosforilação da Ser/Thr Fosfatase Sit4; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Leandro José de Assis;
Identificação de Alvos de fosforilação da Ser/Thr Fosfatase Sit4; 2009; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio de Janeiro; Orientador: Leandro José de Assis;
Produções bibliográficas
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de Assis, Leandro José ; BAIN, JUDITH M. ; LIDDLE, CORIN ; LEAVES, IAN ; HACKER, CHRISTIAN ; PERES DA SILVA, ROBERTA ; YUECEL, RAIF ; BEBES, ATTILA ; STEAD, DAVID ; CHILDERS, DELMA S. ; PRADHAN, ARNAB ; MACKENZIE, KEVIN ; LAGREE, KATHERINE ; LARCOMBE, DANIEL E. ; MA, QINXI ; AVELAR, GABRIELA MOL ; NETEA, MIHAI G. ; ERWIG, LARS P. ; MITCHELL, AARON P. ; BROWN, GORDON D. ; GOW, NEIL A. R. ; BROWN, ALISTAIR J. P. . Nature of β-1,3-Glucan-Exposing Features on Candida albicans Cell Wall and Their Modulation. mBio , v. 6, p. e02605-22, 2022.
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SARIKAYA BAYRAM, ÖZLEM ; BAYRAM, ÖZGÜR ; KARAHODA, BETIM ; MEISTER, CINDY ; KÖHLER, ANNA M. ; THIEME, SABINE ; ELRAMLI, NADIA ; FRAWLEY, DEAN ; MCGOWAN, JAMIE ; FITZPATRICK, DAVID A. ; SCHMITT, KERSTIN ; DE ASSIS, LEANDRO JOSE ; VALERIUS, OLIVER ; GOLDMAN, GUSTAVO H. ; BRAUS, GERHARD H. . F-box receptor mediated control of substrate stability and subcellular location organizes cellular development of Aspergillus nidulans. PLoS Genetics , v. 18, p. e1010502, 2022.
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PRUSKY, DOV ; de Assis, Leandro José ; BARONCELLI, RICCARDO ; BENITO, ERNESTO P. ; DEL CASTILLO, VIRGINIA CASADO ; CHAYA, TIMOTHY ; COVO, SHAY ; DÍAZ-MÍNGUEZ, JOSÉ MARÍA ; DONOFRIO, NICOLE M. ; ESPESO, EDUARDO ; FERNANDES, TÂNIA RIBEIRO ; GOLDMAN, GUSTAVO H. ; JUDELSON, HOWARD ; NORDZIEKE, DANIELA ; DI PIETRO, ANTONIO ; SIONOV, EDWARD ; SUKNO, SERENELLA A. ; THON, MICHAEL R. ; TODD, RICHARD B. ; VOLL, LARS ; XU, JIN RONG ; HORWITZ, BENJAMIN A. ; WILSON, RICHARD A. . Nutritional factors modulating plant and fruit susceptibility to pathogens: BARD workshop, Haifa, Israel, February 25-26, 2018. PHYTOPARASITICA , v. 1, p. 1-17, 2020.
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PRADHAN, ARNAB ; MA, QINXI ; DE ASSIS, LEANDRO J. ; LEAVES, IAN ; LARCOMBE, DANIEL E. ; RODRIGUEZ RONDON, ALEJANDRA V. ; NEV, OLGA A. ; BROWN, ALISTAIR J.P. . Anticipatory Stress Responses and Immune Evasion in Fungal Pathogens. TRENDS IN MICROBIOLOGY , v. xx, p. 1-12, 2020.
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MANFIOLLI, ADRIANA OLIVEIRA ; SIQUEIRA, FILIPE SILVA ; DOS REIS, THAILA FERNANDA ; VAN DIJCK, PATRICK ; SCHREVENS, SANNE ; HOEFGEN, SANDRA ; FÖGE, MARTIN ; STRAßBURGER, MARIA ; de Assis, Leandro José ; HEINEKAMP, THORSTEN ; ROCHA, MARINA CAMPOS ; JANEVSKA, SLAVICA ; BRAKHAGE, AXEL A. ; MALAVAZI, IRAN ; GOLDMAN, GUSTAVO H. ; VALIANTE, VITO . Mitogen-Activated Protein Kinase Cross-Talk Interaction Modulates the Production of Melanins in. mBio , v. 10, p. e00215-19, 2019.
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HORTA, M. A. C. ; THIEME, N. ; GAO, Y. ; BURNUM-JOHNSON, K. E. ; NICORA, C. D. ; GRITSENKO, M. A. ; LIPTON, M. ; MOHANRAJ, K. ; ASSIS, LJ ; LIN, L. ; TIAN, C. ; BRAUS, G. H. ; BORKOVICH, K. A. ; SCHMOLL, M. ; LARRONDO, L. F. ; SAMAL, A. ; GOLDMAN, GUSTAVO H. ; BENZ, J. P. . Broad Substrate-Specific Phosphorylation Events Are Associated With the Initial Stage of Plant Cell Wall Recognition in Neurospora crassa. Frontiers in Microbiology , v. 10, p. 711085-711085, 2019.
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MANFIOLLI, ADRIANA OLIVEIRA ; DOS REIS, THAILA FERNANDA ; de Assis, Leandro José ; DE CASTRO, PATRÍCIA ALVES ; SILVA, LILIAN PEREIRA ; HORI, JULIANA I. ; WALKER, LOUISE A. ; MUNRO, CAROL A. ; RAJENDRAN, RANJITH ; RAMAGE, GORDON ; GOLDMAN, GUSTAVO H. . Mitogen activated protein kinases (MAPK) and protein phosphatases are involved in Aspergillus fumigatus adhesion and biofilm formation. The Cell Surface , v. 1, p. 43-56, 2018.
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de Assis, Leandro José ; MANFIOLLI, ADRIANA ; MATTOS, ELICIANE ; FABRI, JOÃO H. T. MARILHANO ; MALAVAZI, IRAN ; JACOBSEN, ILSE D. ; BROCK, MATTHIAS ; CRAMER, ROBERT A. ; THAMMAHONG, ARSA ; HAGIWARA, DAISUKE ; RIES, LAURE NICOLAS ANNICK ; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE . Protein Kinase A and High-Osmolarity Glycerol Response Pathways Cooperatively Control Cell Wall Carbohydrate Mobilization in. mBio , v. 9, p. e01952-18, 2018.
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DOS REIS, THAILA FERNANDA ; NITSCHE, BENJAMIN M. ; DE LIMA, POLLYNE BORBOREMA ALMEIDA ; DE ASSIS, LEANDRO JOSÉ ; MELLADO, LAURA ; HARRIS, STEVEN D. ; MEYER, VERA ; DOS SANTOS, RENATO A. CORRÊA ; RIAÑO-PACHÓN, DIEGO M. ; RIES, LAURE NICOLAS ANNICK ; GOLDMAN, GUSTAVO H. . The low affinity glucose transporter HxtB is also involved in glucose signalling and metabolism in Aspergillus nidulans. Scientific Reports , v. 7, p. 45073, 2017.
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RIES, LAURE NICOLAS ANNICK ; ROCHA, MARINA CAMPOS ; DE CASTRO, PATR?CIA ALVES ; SILVA-ROCHA, RAFAEL ; SILVA, ROBERTO NASCIMENTO ; FREITAS, FERNANDA ZANOLLI ; DE ASSIS, LEANDRO JOS? ; BERTOLINI, MARIA C?LIA ; MALAVAZI, IRAN ; GOLDMAN, GUSTAVO H. . The Aspergillus fumigatus CrzA Transcription Factor Activates Chitin Synthase Gene Expression during the Caspofungin Paradoxical Effect. mBio , v. 8, p. e00705-17, 2017.
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DE OLIVEIRA BRUDER NASCIMENTO, ARIANE CRISTINA MENDES ; DOS REIS, THAILA FERNANDA ; DE CASTRO, PATRÍCIA ALVES ; HORI, JULIANA I. ; BOM, VINÍCIUS LEITE PEDRO ; DE ASSIS, LEANDRO JOSÉ ; RAMALHO, LEANDRA NAIRA ZAMBELLI ; ROCHA, MARINA CAMPOS ; MALAVAZI, IRAN ; BROWN, NEIL ANDREW ; VALIANTE, VITO ; BRAKHAGE, AXEL A. ; HAGIWARA, DAISUKE ; GOLDMAN, GUSTAVO H. . Mitogen activated protein kinases SakA and MpkC collaborate for virulence. MOLECULAR MICROBIOLOGY , v. 100, p. 841-859, 2016.
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DE ASSIS, LEANDRO JOSÉ ; ZINGALI, RUSSOLINA BENEDETA ; MASUDA, CLAUDIO AKIO ; RODRIGUES, SILAS PESSINI ; MONTERO-LOMELÍ, MONICA . Pyruvate decarboxylase activity is regulated by the Ser/Thr protein phosphatase Sit4p in the yeast Saccharomyces cerevisiae. FEMS YEAST RESEARCH , v. 13, p. 518-528, 2013.
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Masuda, C. ; Previato, J. ; Miranda, M. ; ASSIS, Leandro José de ; Mendonça-Previato, L. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Overexpression of the aldose reductase GRE 3 suppresses lithium-induced galactose toxicity in Saccharomyces cerevisiae. FEMS Yeast Research , v. 8, p. 1245-1253, 2008.
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Tomizawa, M. M. ; DIAS, E. S. ; ASSIS, Leandro José de ; Gomide, P. H. O. ; Santos, J. B. . Variabilidade genética de isolados do cogumelo Agaricus blazei por meio de marcadores RAPD. Ciência e Agrotecnologia (UFLA) , v. 31, p. 1242-1249, 2007.
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DE ASSIS LJ ; Ulas M. ; RIES, L. A. N. ; RAMLI, N. A. M. E. ; SARIKAYA-BAYRAM, O. ; BRAUS, G. ; OZGUR, B. ; GOLDMAN, GUSTAVO H. . Regulation of Aspergillus nidulans CreA-mediated catabolite repression by the F-box proteins Fbx23 and Fbx47. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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ASSIS LJ ; MANFIOLI, A. ; RIES, L. A. N. ; MALAVAZI, IRAN ; JACOBSEN, I. D. ; BROCK, M. ; HEINEKAMP, T. ; GOLDMAN, G. H. . SakA and MpkC interact with PkaAC1 to regulate the mobilization of carbon sources required for cell wall biosynthesis in Aspergillus fumigatus. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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ASSIS LJ ; RIES, L. N. A. ; BROWN, N. A. ; SAVOLDI, M. ; GOLDMAN, G. H. ; DINAMARCO, T. M. . Functional Characterization of Aspergillus nidulans phosphatases involved in glucose metabolism. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
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ASSIS, Leandro José de ; Masuda, C. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Atividade de Pdc1 de Saccharomyces cerevisiae é induzida por fosforilação e regulada indiretamente pela Ser/Thr fosfatase Sit4. 2011. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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ASSIS, Leandro José de ; JABLONKA, W. ; ZINGALI, R. B. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Caracterização e expressão de Sit4, um gene envolvido na via TOR. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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ASSIS, Leandro José de ; JABLONKA, W. ; ZINGALI, R. B. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Characterization and expression of Sit4, a gene involved in the TOR pathway. 2008. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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ASSIS, Leandro José de ; JABLONKA, W. ; ZINGALI, R. B. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Caracterização e expressão de genes envolvidos na via TOR. 2008. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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ASSIS, Leandro José de ; JABLONKA, W. ; FIGUEROA, J. D. V. ; ZINGALI, R. B. ; LOMELÍ, Mònica Montero . O estudo de Sit4 para identificação de novos alvos terapêuticos de câncer. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).
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ASSIS, Leandro José de ; JABLONKA, W. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Caracterização do gene Sit4 e identificação de alvos de fosforilação envolvidos na via TOR. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).
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ASSIS, Leandro José de ; JABLONKA, W. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Caracterização do gene Sit4 e identificação de alvos de fosforilação envolvidos na via TOR. 2007. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
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ASSIS, Leandro José de ; JABLONKA, W. ; LOMELÍ, Mònica Montero . Cloning, expression and purification of Sit4, a Ser / Thr phosphatase from Saccharomyces cerevisiae. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).
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ASSIS, Leandro José de . Curso de Férias: Os mistérios da célula. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
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ASSIS, Leandro J. . Sábado da Ciência - A química da vida. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
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ASSIS, Leandro José de . Curso de Férias: Alimento, o combustível do organismo. Por que comer ?. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
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ASSIS, Leandro José de . Curso de Férias: Fermentação: de Pasteur aos dias de hoje. 2010. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
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ASSIS, Leandro José de . Universidade e Escola: trocando figurinhas "Dengue". 2008. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
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ASSIS, Leandro José de . Universidade e escola: trocando figurinhas " A Ciência do Campeões". 2007. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).
Projetos de pesquisa
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2020 - Atual
Nuclear Regulators of Fungal Enzymes, Descrição: The dependence of mankind on petroleum- and oil-based fuels as the main energy source is widely recognised as being accompanied by several problems that impact the global economy and environmental health. In recent years, the conversion of plant biomass to biofuels, in a process called 1st- (1G) and 2nd-generation (2G) biofuel-production, has gained significant interest as an environmentally friendly and naturally abundant alternative, renewable energy source. The EU (European Union) legislation implements that by 2020, 20% of energy must be derived from renewable sources, showing the importance that renewable energy source production will play in the future. Saprobic microorganisms, such as filamentous fungi of the genus Aspergillus, are of particular interest for this process as they secrete a vast array of plant biomass hydrolyzing enzymes. A major drawback in the production of renewable biofuels is built-up of glucose during enzymatic hydrolysis of plant biomass, resulting in the transcriptional repression of fungal enzyme-encoding genes and subsequent secretion. The here described fellowship is proposing to uncover novel proteins involved in the regulation of hydrolytic enzymes and secondary metabolites production in the filamentous fungus Aspergillus nidulans that can be explored for biotechnological processes. To implement this project, the candidate will be hosted at the National University of Ireland in Maynooth in the laboratory of Fungal Genetics and Secondary Metabolism.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Leandro José de Assis - Coordenador / BAYRAM, OZGUR - Integrante., Financiador(es): European Commission - Auxílio financeiro.
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2017 - Atual
Effects of CreA phosphorylation sites on carbon catabolite repression in Aspergillus nidulans, Descrição: Saprobic microorganisms, such as filamentous fungi of the genus Aspergillus are of particular interest for hydrolytic enzyme secretion as some species are already vastly used in industry where their natural capacity to secrete plant cell wall-degrading enzymes, that are known as carbohydrate-active enzymes (CAZy), is exploited. The genomes of Aspergillus spp. encode several hundred CAZy and the corresponding genes are under tight transcriptional control. The presence of easily metabolizable sugars such as glucose, whose concentrations increase during plant biomass hydrolysis, results in the repression of CAZy-encoding genes, in a process known as carbon catabolite repression (CCR). To date, the C2H2 transcription factor CreA has been described as the major CC-repressor in Aspergillus spp. In the presence of glucose, CreA translocates to the nucleus where it represses target genes; whereas, in the presence of plant biomass polysaccharides, it translocates to the cytoplasm, relieving gene repression. CCR is a highly conserved process in ascomycetous fungi, and its onset is dependent on the sensing and identification of extracellular nutrients. In terms of evolution, CCR allows the fungus to use the energetically most favorable carbon source required for niche colonization whereas it is undesired for the purpose of large-scale enzyme production. This work shows the effect of CreA point mutations, that mimic hypo-phosphorylation, through replacing serine (S) by alanine (A), on CCR. Using phospho-proteomics, a phosphorylation site on serine S262 was found when glucose was added to the cultures. Mass spectrometry data identified CkiA (casein kinase A) and GskA (glycogen synthase kinase A) as CreA interaction partners. Indeed, when mutating the predicted CkiA (S262A and S268A) and GskA (S308A) phosphorylation sites on CreA, cellular localization of the latter was aberrant. This project aims to describe the influence of CreA point mutations on CCR. Preliminary results suggest that phosphorylation-mediated regulation of CreA is essential for CCR and presents an interesting target for biotechnological strain manipulations without the need to delete essential genes which can result in undesired side effects.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Laure Nicolas Annick Ries - Integrante / GOLDMAN, GUSTAVO H. - Coordenador / BAYRAM, ÖZGÜR - Integrante / Paul Dowling - Integrante / Lilian Pereira Silva - Integrante.
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2016 - 2018
Regulação da repressão catabólica do carbono (CCR) por proteínas SCF (Fbox) em Aspergillus nidulans, Descrição: A família de proteínas Fbox possuem componentes de reconhecimento de substrato Skp1-Cul1-Fbox-protein (SCF) ubiquitina ligase. Elas regulam diversos processos celulares como replicação de DNA, transcrição, diferenciação celular e morte celular. Esta proteínas estão envolvidas na degradação de proteínas mediada por ubiquitinação, atuando sobre muitas proteínas regulatórias e fatores de transcrição. Ubiquitina ligases podem podem existir como complexos multi-subunidade ou como simples proteínas podendo realizar mono ou poliubiquitinação. Este projeto tem como objetivo analisar o envolvimentos de proteínas Fbox na regulação da repressão catabólica do carbono (CCR) e identificar os possíveis alvos destas proteínas por espectrometria de massas. Uma biblioteca contendo 74 cepas deletadas de genes que codificam proteínas Fbox em A. nidulans será usado para o estudos de repressão catabólica usando 2-deoxI-D-glicose (2DG) e álcool alílico. Para os candidatos que possuem sensibilidade ou resistência a estes compostos serão realizados testes de indução de CCR a nível transcricional e bioquímico, serão análisados o nível de secreção usando a construção GFP::synA e CCR usando a contrução CreA::GFP (Homólogo de MIG1 em Saccharomyces cerevisiae), também serão avaliadas as interações físicas das proteínas Fbox por imuno-precipitacão usando GFP/TAP tag e identificação por espectrometria de massas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador / Laure Annick Nicolas Ries - Integrante / Bayram Ozgur - Integrante.
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2015 - 2018
Interação entre SakA/MpkC com a proteina quinase A (pkaC1) durante a mobilização de carbono para a síntese de parede celular em Aspergillus fumigatus, Descrição: Aspergillus fumigatus é fungo mais comum causador de doenças invasivas humanas. A incidência em pacientes imuno-deprimidos tem aumentado dramaticamente, com isso, o interesse no desenvolvimento de novas drogas e estratégias terapêuticas tem aumentado. A parede celular deste fungo define a morfologia e confere proteção contra as adversidades ambientais, modulando a elasticidade e a resistência ao estresse osmótico, com isso, garantindo a sua sobrevivência. Para fungos patogênicos, a parede celular é um imuno-modulador chave para um alvo terapêutico. Este projeto tem como objetivo estudar o envolvimento da subunidade catalítica proteína quinase dependente de cAMP (pkaC1) de Aspergillus fumigatus, na síntese da parede celular e na resposta ao estresse osmótico usando sorbitol. A resposta ao estresse osmótico passa pela via das MAPKs que também serão abordadas neste projeto. A proteína pkaC1 esta regulando a resposta a diversos estresses na célula podendo estar envolvida no estresse osmótico e no mecanismo de resistência do fungo no modelo de infeção usando camundongos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
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2014 - 2015
O gene pkaA possui um importante papel na regulação da produção de celulases em Aspergillus nidulans, Descrição: Este projeto tem como objetivo estudar o envolvimento da subunidade catalítica proteína quinase dependente de cAMP, a serina/treonina quinase pkaA do fungo filamentoso Aspergillus nidulans na regulação da repressão catabólica do carbono (CCR - Carbon catabolite repression). Este sistema de repressão esta diretamente envolvido com a regulação de genes responsáveis pela produção de celulases, enzimas de grande interesse para a degradação de matéria orgânica para produção de etanol de segunda geração. O objetivo deste projeto é compreender os mecanismos de regulação da repressão catabólica do carbono usando técnicas de bioquímica e genética para verificar o possível envolvimento do gene pkaA na de-repressão do sistema CCR, aumentando assim a produção de celulases.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Neil Andrew Brown - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador / Marcela Savoldi - Integrante.
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2013 - 2015
Caracterização funcional de proteínas fosfatases de Aspergillus nidulans envolvidas no metabolismo de glicose, Descrição: Este projeto tem como objetivo estudar a utilização de diferentes fontes de carbono pelo fungo Aspergillus nidulans, em especial a sinalização celular para a utilização de glicose. Neste projeto foi utilizada uma biblioteca de cepas de Aspergillus nidulans com deleção em diferentes genes de fosfatases. As fosfatases são enzimas que hidrolisam grupamentos fosfato de diversos promotores e repressores gênicos, estando, portanto, diretamente ligadas à regulação de fatores responsáveis pela utilização de diversas fontes de carbono. O principal objetivo deste projeto é compreender os possíveis mecanismos de regulação de moduladores da repressão catabólica do carbono e estudar a regulação de possíveis enzimas envolvidas no metabolismo de carboidratos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (1) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Laure Nicolas Annick Ries - Integrante / Neil Andrew Brown - Integrante / Gustavo Henrique Goldman - Coordenador.
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2009 - 2013
Estudo do metabolismo fermentativo em Saccharomyces cerevisiae, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Monica Montero Lomeli em 03/11/2014., Descrição: Existe um grande interesse da indústria em aumentar a produtividade de etanol, para isso, a busca por possíveis reguladores da fermentação tem sido extensivamente estudados. A principal enzima responsável pelo direcionamento do piruvato para fermentação é a piruvato descarboxilase que possui sua expressão e atividade induzidas pela presença de glicose. O objetivo deste projeto foi estudar a regulação da atividade da piruvato descarboxilase pela serina/treonina fosfatase Sit4p. Foi utilizado como modelo a levedura S. cerevisiae que foi comparada a uma cepa deletada do gene SIT4. Observou-se que havia um mecanismo de regulação da atividade da piruvato descarboxilase por fosforilação em resíduos de serina dependente do nível de glicose presente no meio de cultura. Demonstramos que a fosforilação regulava a atividade da piruvato descarboxilase pois a deleção do gene SIT4 reprime o nível de fosforilação e atividade da piruvato descarboxilase, consequentemente reduzindo a produção de etanol. Esta fosforilação, regulada indiretamente por SIT4, modula a afinidade para tiamina pirofosfato que é um dos cofatores da piruvato descarboxilase, sendo a afinidade da piruvato descarboxilase pelo seu cofator reduzida no mutante Sit4 e possuindo um reduzido nível de fosforilação quando comparada a cepa controle. Este estudo possui grande importância para aplicação tecnológica pois o estudo da cinética da piruvato descarboxilase pode auxiliar no aumento da velocidade nos processos fermentativos deslocando o fluxo de carbono para a via fermentativa.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Mònica Montero Lomelí - Coordenador / Claudio Masuda - Integrante., Número de produções C, T & A: 1
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2009 - 2013
Caracterização funcional e estrutural da proteína ser/thr fosfatase Sit4 in Saccharomyces cerevisiae, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Monica Montero Lomeli em 07/11/2014., Descrição: O gene SIT4 da levedura Saccharomyces cerevisiae codifica uma serina/treonina fosfatase que regula processos importantes como controle do ciclo celular, metabolismo de glicogênio e integridade da parede celular. Sit4 participa de uma via conservada TOR (target of rapamycin) que esta ligada à disponibilidade de nutrientes para o crescimento celular estando ativada em células cancerígenas. Devido a seu envolvimento nesta via existe um grande interesse no estudo de Sit4 para a determinação de possíveis alvos que futuramente possam ser utilizados no estudo do desenvolvimento de novos fármacos para tratamento contra o câncer. Uma vez que Sit4 de S. cerevisiae é expressa em pequenas quantidades, não se tem nada descrito a respeito da sua purificação. Como objetivo inicial foi estabelecido um protocolo de purificação da proteína Sit4 a partir da expressão da ORF do gene SIT4 de S. cerevisiae no plasmídeo pQE30 contendo uma marcação de 6 histidinas na região n-terminal, sendo expressa em Escherichia coli M15. Após a purificação foram realizados ensaios para a caracterização cinética desta proteína. Devido a seu envolvimento na via TOR, a identificação de alvos fisiológicos é de grande interesse. Para identificarmos possíveis alvos de Sit4 será avaliado o estado de fosforilação diferencial de duas cepas, uma selvagem e outra deletada para o gene SIT4, as proteínas diferencias serão digeridas com tripsina e levadas para análise por MALDI-TOF-TOF ( Matrix-assisted Laser Desorption Ionization ? Time of Fly ). Os espectros de massa serão comparados ao banco de dados de proteínas tripsinizadas in silico para a identificação das mesmas. Para determinarmos possíveis inibidores para Sit4 será utilizado modelagem molecular analisando as interações das moléculas in silico com Sit4 e comparando com os resultados obtidos experimentalmente. Determinado um possível inibidor, Sit4 na presença deste será encaminhada para uma varredura de condições de cristalização com o objetivo de obtermos um cristal para determinação de sua estrutura tridimensional por cristalografia de raios-x.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Mònica Montero Lomelí - Coordenador / Willy Jablonka - Integrante / José Daniel Villar Figueroa - Integrante / Claudio Akio Masuda - Integrante.
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2003 - 2004
Estudo da variabilidade genética de isolados do cogumelo Agaricus blazei usando marcadores moleculares RAPD, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Eustáquio Souza Dias em 03/11/2014., Descrição: Agaricus blazei (Murrill) ss. Heinem. é um cogumelo nativo do Brasil que vem despertando a atenção de vários pesquisadores em todo o mundo, devido às suas propriedades farmacológicas e nutricionais. Este projeto teve por objetivo, analisar a variabilidade genética de alguns isolados utilizados comercialmente, por meio de marcadores RAPD. Foram analisados nove isolados de A. blazei, provenientes de diferentes regiões do Brasil e, como controle, dois isolados de A. bisporus. Todos eles fazem parte da coleção de fungos do Laboratório de Cogumelos Comestíveis e Medicinais do DBI/UFLA. Diferentes primers aleatórios foram utilizados, gerando um total de 139 bandas polimórficas. Procedeu-se a avaliação de similaridade genética entre os isolados pelo coeficiente de Dice e análise de agrupamento pelo método UPGMA. Os resultados revelaram que dos 9 isolados de A. blazei, 6 (CS1, CS3, CS4, CS6, CS8 e CS9) apresentaram uma alta similaridade genética, sendo considerados isolados de uma mesma origem ou clones. O isolado CS2 foi o que apresentou a maior divergência genética em relação aos demais, seguido dos isolados CS5 e CS7, os quais formaram cada um, um grupo a parte, com médias de 60,6%, 88,7% e 91,3% de similaridade genética, respectivamente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Leandro José de Assis - Integrante / Eustáquio Souza Dias - Coordenador / Márcia Mayumi Tomizawa - Integrante / João Bosco dos Santos - Integrante., Número de produções C, T & A: 1
Prêmios
2021
Special collection on resilience Trends in Microbiology, Trends in Microbiology, Cell Press.
2020
Cover Illustration Plos Genetics August Volume 16, N˚ 8, 2020, Plos.
2018
Cover Illustration mBio November/December Volume 9, N˚ 6 (de Assis et al., mBio 9:e01952-18, 2018), American Society of Microbiology (ASM).
Histórico profissional
Endereço profissional
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Universidade de São Paulo, Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto. , Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto - USP, Vila Monte Alegre, 14040903 - Ribeirão Preto, SP - Brasil, Telefone: (16) 33154311, URL da Homepage:
Experiência profissional
2021 - 2021
National University of Ireland MaynoothVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Independent Researcher, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
The dependence of mankind on petroleum- and oil-based fuels as the main energy source is widely recognised as being accompanied by several problems that impact the global economy and environmental health. In recent years, the conversion of plant biomass to biofuels, in a process called 1st- (1G) and 2nd-generation (2G) biofuel-production, has gained significant interest as an environmentally friendly and naturally abundant alternative, renewable energy source. The EU (European Union) legislation implements that by 2020, 20% of energy must be derived from renewable sources, showing the importance that renewable energy source production will play in the future. Saprobic microorganisms, such as filamentous fungi of the genus Aspergillus, are of particular interest for this process as they secrete a vast array of plant biomass hydrolyzing enzymes. A major drawback in the production of renewable biofuels is built-up of glucose during enzymatic hydrolysis of plant biomass, resulting in the transcriptional repression of fungal enzyme-encoding genes and subsequent secretion. The here described fellowship is proposing to uncover novel proteins involved in the regulation of hydrolytic enzymes and secondary metabolites production in the filamentous fungus Aspergillus nidulans that can be explored for biotechnological processes. To implement this project, the candidate will be hosted at the National University of Ireland in Maynooth in the laboratory of Fungal Genetics and Secondary Metabolism.
2016 - 2016
National University of Ireland MaynoothVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Post Doctoral Fellowship, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2013 - 2019
Universidade de São PauloVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2009 - 2013
Universidade Federal do Rio de JaneiroVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
2005 - 2009
Universidade Federal do Rio de JaneiroVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Graduação, Carga horária: 20
2003 - 2004
Universidade Federal de LavrasVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Graduação, Carga horária: 20
2018 - 2018
Georg-August-Universität GöttingenVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Post Doctoral Fellowship, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Outras informações:
Project: Mitogen-activated protein kinases (MAPK) interactome dynamics regulating carbon catabolite repression in Aspergillus nidulans
2008 - 2008
Instituto Militar de EngenhariaVínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estágio Supervisionado Avançado de Pesquisa, Carga horária: 225
Outras informações:
Laboratório de Síntese de compostos Bioativos (Modelagem Molecular), desenho de fármacos e simulação de docking in vitro usando AutoDoc software, criação de molécula para atuação como inibidor competitivo in vivo.
2020 - 2021
University Of ExeterVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Researcher Fellow, Carga horária: 35, Regime: Dedicação exclusiva.
2021 - Atual
Plymouth UniversityVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Research Fellow, Carga horária: 37, Regime: Dedicação exclusiva.
2021 - Atual
Plymouth UniversityVínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Research Fellow, Carga horária: 37, Regime: Dedicação exclusiva.
Criando um monitoramento
Nossos robôs irão buscar nos nossos bancos de dados todos os processos de Leandro José de Assis e sempre que o nome aparecer em publicações dos Diários Oficiais, avisaremos por e-mail e pelo painel do usuário
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