Júlia Pinheiro Chagas da Cunha

Possui graduação em Ciências Biológicas-Modalidade Médica pela Universidade Federal de São Paulo (2001), doutorado em Microbiologia e Imunologia pela Universidade Federal de São Paulo (2007) e pós-doutorado no Instituto Ludwig (2007-2010). Tem experiência na área de Bioquímica, Biologia Molecular de parasitas e células de mamíferos. Atualmente é pesquisadora científica V do Instituto Butantan onde estuda alterações proteômicas e epigenéticas em tripanossomas e células de mamíferos utilizando abordagens ômicas (proteômica e genômica).Obteve financiamento na categoria de Jovem Pesquisadores (FAPESP). Atualmente possui projetos financiados pela FAPESP incluindo Jovem Pesquisador -fase 2.

Informações coletadas do Lattes em 25/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Microbiologia e Imunologia

2002 - 2007

Universidade Federal de São Paulo
Título: Modificações pós-traducionais nas histonas H1 e H4 de Trypanosoma cruzi. Caracterizacao bioquimica e funcional ao longo do ciclo celular, ciclo de vida e no dano ao DNA.
Sergio Schenkman. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: fosforilacao; acetilacao; Trypanosoma cruzi; cromatina; histona; epigenetica.

Graduação em Ciências Biológicas-Modalidade Médica

1998 - 2001

Universidade Federal de São Paulo
Título: ESTUDO DE ACETILAÇÃO DE HISTONAS EM TRYPANOSOMA CRUZI
Orientador: SERGIO SCHENKMAN

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Pós-doutorado

2007 - 2010

Pós-Doutorado. , Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, ILPC, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

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Formação complementar

2018 - 2018

Proteomics Computational Biology. (Carga horária: 80h). , Northeastern University, NORTHEASTERN, Estados Unidos.

2013 - 2013

5th Maxquant Summer School 2013. (Carga horária: 40h). , Max Planck Institute of Biochemistry, MPIB, Alemanha.

2012 - 2012

Estagio em protômica quantitativa. (Carga horária: 160h). , Stowers Institute for Medical Research, SIMR, Estados Unidos.

2011 - 2011

Proteomics Informatics Course. (Carga horária: 40h). , Systems Biology Institute, ISB, Estados Unidos.

2008 - 2008

Quantitative real-time RT-PCR: Recent advances and. (Carga horária: 4h). , eppendorf, EPPENDORF, Brasil.

2008 - 2008

Estágio durante o pós doutorado. (Carga horária: 40h). , Fluidgim, FLUIDGIM, Estados Unidos.

2007 - 2007

Estágio durante o pos doutorado. (Carga horária: 220h). , Children's Hospital Boston, CHB, Estados Unidos.

2005 - 2005

Biology of Parasitism - Modern Approaches. (Carga horária: 520h). , Marine Biological Laborarory, MBL, Estados Unidos.

2004 - 2004

Espectrometria de massas. (Carga horária: 16h). , Laboratório de Luz Sincroton, LNLS, Brasil.

2004 - 2004

Parasite Glycobiology and Proteomics. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2003 - 2003

Seqüenciamento de Peptídeos por LC/MS/MS. (Carga horária: 40h). , Laboratório de Luz Sincroton, LNLS, Brasil.

2003 - 2003

Fundamentos de análise proteômica. (Carga horária: 40h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.

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Organização de eventos

da CUNHA, J. P. . 21 Reuniao Cientifica Anual do Instituto Butantan. 2019. (Congresso).

DA CUNHA, JÚLIA P.C ; ELIAS, M. C. . DNA metabolism and histone modifications in Trypanosomatids. 2017. (Congresso).

IWAI, L. ; SERRANO, S. M. T. ; DA CUNHA, JÚLIA P.C . "From Proteomics to Systems Biology". 2017. (Congresso).

DA CUNHA, JÚLIA P.C. ; ELIAS, M. C. . II Simposio Temático do CeTICS: DNA metabolism and epigenetics control. 2016. (Congresso).

da Cunha, J.P.C. ; SERRANO, S. M. T. ; IWAI, L. . 1 Simposio Cetics "From Proteomics to Systems Biology". 2015. (Congresso).

da CUNHA, J. P. ; SERRANO, S. M. T. ; ARMELIN, H. A. . ABORDAGENS PROTEÔMICAS PARA BIOLOGIA SISTÊMICA. 2011. (Outro).

da CUNHA, J. P. ; SERRANO, S. M. T. . XXX From Omics to Systems Biology. 2011. (Congresso).

SERRANO, S. M. T. ; ARMELIN, H. A. ; da CUNHA, J. P. . XXVIII Perspectives in Systems Biology. 2010. (Congresso).

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Participação em eventos

4th Mini Symposium: Implications of Survival and death mechanisms for the interactions of pathogenic protozoa with their hosts.Epigenomics and Chromatin Proteomics of T. cruzi. 2019. (Simpósio).

Kinetoplastid Molecular Cell Biology Meeting 2019. Epigenenomics and chromatin proteomics of Trypanosoma cruzi. 2019. (Congresso).

VI Curso Latino Americano de Biologia Molecular de Tripanosomatídeos. .. Histone PTMs in Trypanossoma cruzi. 2017. (Congresso).

DNA metabolism and epigenetics control.Chromatin alterations in trypanosomes and mammalian cells. 2016. (Simpósio).

4 BrMass. 2011. (Congresso).

High Throuput Technologies for alternative splicing. Tumor somatic mutations in exonic splicing enhancers and silencers. 2009. (Congresso).

II Simpósio da Rede Latino Americana de Células-Tronco. 2009. (Simpósio).

17 Reuniao Anual de Usuarios. Uso da espectrometria de massas para investigar modificacoes pos traducionais de histonas. 2007. (Congresso).

Seminário da Sociedade Brasileira de Biologia Celular.Modificações pós traducionais em histonas de Trypanosoma cruzi. 2004. (Seminário).

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Participação em bancas

Aluno: Bruno Souza Bonifácio

da CUNHA, J. P.. Papel das GTPases Cdc42,RhoA e Rac1 no citoesqueleto de actina durante a invasão celular pelas formas tripomastigotas metaciclicas e de cultura de tecido de Trypanosoma cruzi em celulas HeLa. 2019. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Juliana Quintanilha Martins

DA CUNHA, JULIA PCCAMARGO, A. A.. Estudo da resposta antioxidante em células tumorais com mutações nos oncogenes K-Ras e B-Raf através da análise do padrão de expressão de genes citoprotetores regulados por Nrf2. 2016 - Hospital Sírio-Libanês.

Aluno: Bruno Carvalho Resende

da CUNHA, J. P.. Influencia da recombinação nos processos de dormencia e hibridização em Trypanosoma cruzi. 2019. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais.

Aluno: João Paulo Ferreira Rodrigues

da CUNHA, J. P.; YOSHIDA, N.. Papel da proteína LAMP-2 associada à membrana lisossomal na invasão celular do Trypanosoma cruzi mediada pela molécula de superficie gp82. 2019. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Cristiane Regina Antonio

DA CUNHA, JÚLIA P.C. Estudo comparativo do genoma de Trypanosoma cruzi com enfase nas regioes telomericas e subtelomericas. 2018. Tese (Doutorado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Vivian Cristina de Oliveira

DA CUNHA, JÚLIA P.C. Papel de Ikaros na via de sinalização de BCR de células B1. 2018. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Flavia Silva Damasceno

SILBER, A. M.;DA CUNHA, JÚLIA P.C.. Papel da glutamina na biologia do Trypanosoma cruzi e Trypanosoma brucei. 2017. Tese (Doutorado em Biologia da Relação Patógeno Hospedeiro) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Tatiane Yumi Nakaura Kanno

DA CUNHA, JÚLIA P.C.. SCRATCH2 na diferenciação neural em embriôes e em células-tronco. 2016. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Tecidual) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Janete Chung

da CUNHA, J. P.. eiF5A de Trypanosoma cruzi: caracterizacao estrutural. 2011. Tese (Doutorado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Pilar Sampaio Tavares Veras

DA CUNHA, JÚLIA P.C.. Caracterização estrutural e funcional da glicoproteína Ssp-4 de formas amastigotas de Trypanosoma cruzi. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Carlo de Oliveira Martins

da CUNHA, J. P.. Análise Proteômica diferencial em doenças valvulares: degeneração mixomatosa e doença cardiaca. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Medicina (Ciências Médicas)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Larissa Valle Guilhen Longo

da CUNHA, J. P.. Caracterização de componentes da parede celular de Paracoccidioides brasiliensis. Análise diferencial em isolados fúngicos geneticamente distintos. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Bruno Russo

Cunha, Júlia P. C.. Análise in silico dos receptores homólogos de TNF-alfa em helmintos. 2018.

Aluno: Giovanna Ferreria Costa Leão Salustiano

da CUNHA, J. P.; LEMOS, A. P. S.; TAKAGI, M.. Comparação entre Neisseria meningitidis e Neisseria lactamica:cinetica do cultivo e resposta imune. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

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Comissão julgadora das bancas

Anamaria Aranha Camargo

CAMARGO, A. A.; MORTARA, Renato; SCHENKMAN, Sergio;CRUZ, Angela K; MACHADO, Carlos Renato. Modificações pós traducionais nas histonas H1 e H4 de Trypanosoma Cruzi:caracterização bioquímica e funcional no ciclo de vida, ciclo celular e dano ao DNA. 2007. Tese (Doutorado em Infectologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Carlos Renato Machado

MACHADO C R; Cruz, Angela; Mortara, RA; Camargo, AA;Schenkman, S. Modificações Pós traducionais nas histonas H1 e H4 de Trypanosoma cruzi: Caracterização Bioquímica e Funcional no ciclo de vida, ciclo celular e dano ao DNA. 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Miriam Galvonas Jasiulionis Leon

JASIULIONIS, M. G.. Modificações pós-traducionais nas histonas H1 e H4 de Trypanosoma cruzi: Caracterização bioquímica e funcional no ciclo de vida, ciclo celular e dano ao DNA. 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Renato Arruda Mortara

Schenkman, S.Cruz, A. K.Camargo, A. A.Machado, C. R.MORTARA, R.A.. Modificações pós-traducionais nas histonas H1 e H4 de Trypanosoma cruzi: caracterização bioquímica e funcional no ciclo de vida, ciclo celular e dano ao DNA. 2007. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

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Orientou

Juliana Nunes Roson

Estudo proteômico nos sítios de início e final de transcrição da RNA Polimerase II de Trypanosoma cruzi; Início: 2019; Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Francisca Nathália de Luna Vitorino

Caracterização do perfil de proteínas associadas à cromatina frente ao tratamento com FGF2; Início: 2016; Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Programa interunidades biotecnologia, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Orientador);

Héllida Marina Costa Silva

Início: 2020; Instituto Butantan, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo;

Thainá Rodrigues

Histona H2BV de Trypanosoma cruzi: análise dos parceiros de interação e seu papel na compactação da cromatina; ; Início: 2019; Iniciação científica (Graduando em Biomedicina) - Universidade de Mogi das Cruzes, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);

Juliana Nunes Roson

Análise Funcional da histona H2B variante em Trypanosoma cruzi; 2016; Dissertação (Mestrado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Mariana de Camargo Lopes

Análise de alterações induzidas por fator de crescimento no proteoma nuclear ao longo do ciclo celular de células tumorais de camundongo; 2019; Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Saloê Bispo Poubel

2018; Instituto Butantan, Instituto Serrapilheira; Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Teresa Cristina de Jesus

2013; Universidade de São Paulo,; Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Carolina Santacruz Pérez

Análises proteômicas quantitativas do núcleo de células tumorais de camundongo estimuladas com o fator de crescimento FGF-2; 2012; Instituto Butantan,; Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Letica de Sousa Lopes

CARACTERIZAÇÃO DE ASPECTOS EPIGENÉTICOS EM TRYPANOSOMA CRUZI: INTERAÇÃO ENTRE HISTONAS H2AZ E H2BV; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Mato Grosso; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Barbara Cordeiro

Expressão dos genes E2F em células tumorais estimuladas com fator de crescimento; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biologia) - FACIS, Fundacao Butantan; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Jaqueline Neves Moreno

Análise da expressão e dos parceiros de interação de fosB e junB após estímulo de células tumorais com FGF-2; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Universidade Metodista de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Fabio Montoni

Estudo do papel das proteínas fosB e junB após estímulo de células tumorais com FGF-2; 2015; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Centro Universitário das Faculdades Metropolitanas Unidas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Mariana de Camargo Lopes

Análise da dinâmica de modificações pós traducionais em histonas em células tumorais após tratamento com fator de crescimento; 2013; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Fundamentais Para A Saúde) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Daniella A

Franze; Incorporação de isótopos estáveis de aminoácidos em cultura celular (SILAC): padronização e quantificação de proteínas por espectrometria de massas de células de camundongos após tratamento com FGF2; ; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biomedicina) - Centro Universitário das Faculdades Metropolitanas Unidas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Tatiane Rodrigues

Analise de mutaçoes somáticas em reguladores de splicing; 2009; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em biologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Amanda Maria Cominatto

Identificação da localização genômica da Histona H2B variante de Trypanossoma cruzi; 2017; Iniciação Científica - Centro Universitário das Faculdades Metropolitanas Unidas, Fundação Butantan; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Daniel Ferreira Lima

Analise computacional de dados proteômicos quantitativos; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia Elétrica) - Escola Politécnica; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Natalie N

Takara; Enriquecimento de fosfopeptídeos e identificação de proteínas fosforiladas por espectrometria de massas de células adrenocorticais de camundongos após tratamento com FGF2; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Quimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

Luciana Mayumi Gutiyama

Localização e Quantificação da Fosforilação da Histona H1 ao longo do ciclo celular de Trypanosoma cruzi; 2005; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas-Modalidade Médica) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Julia Pinheiro Chagas da Cunha;

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Foi orientado por

Sergio Schenkman

Modificações pós-traducionais da histona H1 e histona H4 de Trypanosoma cruzi; 2007; Tese (Doutorado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Sergio Schenkman;

Sandro José de Souza

Estudo funcional de variantes de Splicing com expressão diferencial em tecidos tumorais baseados em mutações em sitios enhancers e silenciadores de Splicing encontrados em bancos de dados de tumores; ; 2007; Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Sandro José de Souza;

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Produções bibliográficas

  • SIDOLI, SIMONE ; KORI, YEKATERINA ; LOPES, MARIANA ; YUAN, ZUO-FEI ; KIM, HEE JONG ; KULEJ, KATARZYNA ; JANSSEN, KEVIN A. ; AGOSTO, LAURA M. ; da Cunha, Julia Pinheiro Chagas ; ANDREWS, ANDREW J. ; GARCIA, BENJAMIN A. . One minute analysis of 200 histone posttranslational modifications by direct injection mass spectrometry. GENOME RESEARCH , v. 23, p. 1800203, 2019.

  • PERES DA SILVA, ROBERTA ; LONGO, LARISSA G. V. ; CUNHA, JULIA P. C. DA ; SOBREIRA, TIAGO J. P. ; RODRIGUES, MARCIO L. ; FAORO, HELISSON ; GOLDENBERG, SAMUEL ; ALVES, LYSANGELA R. ; PUCCIA, ROSANA . Comparison of the RNA Content of Extracellular Vesicles Derived from Paracoccidioides brasiliensis and Paracoccidioides lutzii. Cells , v. 8, p. 765, 2019.

  • VITORINO, FRANCISCA NATHALIA DE LUNA ; MONTONI, FABIO ; MORENO, JAQUELINE NEVES ; DE SOUZA, BRUNO FERREIRA ; LOPES, MARIANA DE CAMARGO ; CORDEIRO, BARBARA ; FONSECA, CECILIA SELLA ; GILMORE, JOSHUA M ; SARDIU, MIHAELA I ; REIS, MARCELO SILVA ; FLORENS, LAURENCE A ; WASHBURN, MICHAEL P ; ARMELIN, HUGO AGUIRRE ; da Cunha, Julia Pinheiro Chagas . FGF-2 Antiproliferative Stimulation Induces Proteomic Dynamic Changes and High Expression of fosB and junB in K-Ras-Driven Mouse Tumor Cells. PROTEOMICS , v. 23, p. 1800203, 2018.

  • IKEDA, MARCELO AUGUSTO KAZUO ; DE ALMEIDA, JOSÉ ROBERTO FOGAÇA ; JANNUZZI, GRASIELLE PEREIRA ; CRONEMBERGER-ANDRADE, ANDRÉ ; TORRECILHAS, ANA CLÁUDIA TROCOLI ; MORETTI, NILMAR SILVIO ; da Cunha, Julia Pinheiro Chagas ; DE ALMEIDA, SANDRO ROGÉRIO ; FERREIRA, KAREN SPADARI . Extracellular Vesicles From Sporothrix brasiliensis Are an Important Virulence Factor That Induce an Increase in Fungal Burden in Experimental Sporotrichosis. Frontiers in Microbiology , v. 9, p. 2286-2289, 2018.

  • DE OLIVEIRA SANTOS, JEAN ; ZUMA, ALINE ARAUJO ; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA NATHALIA ; da Cunha, Julia Pinheiro Chagas ; DE SOUZA, WANDERLEY ; MOTTA, MARIA CRISTINA M. . Trichostatin A induces Trypanosoma cruzi histone and tubulin acetylation: effects on cell division and microtubule cytoskeleton remodelling. PARASITOLOGY , v. 13, p. 1-10, 2018.

  • GATTI DA SILVA, GUILHERME H. ; JURICA, MELISSA S. ; CHAGAS DA CUNHA, JULIA P. ; OLIVEIRA, CARLA C. ; COLTRI, PATRICIA P. . Human RNF113A participates of pre-mRNA splicing in vitro. JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY , v. 1, p. 1, 2018.

  • FLORENTINO, PILAR T. V. ; REAL, FERNANDO ; ORIKAZA, CRISTINA M. ; DA CUNHA, JULIA P. C. ; VITORINO, FRANCISCA N. L. ; CORDERO, ESTEBAN M. ; SOBREIRA, TIAGO J. P. ; MORTARA, RENATO A. . A Carbohydrate Moiety of Secreted Stage-Specific Glycoprotein 4 Participates in Host Cell Invasion by Trypanosoma cruzi Extracellular Amastigotes. Frontiers in Microbiology , v. 9, p. 1-7, 2018.

  • 2017 LEANDRO DE JESUS, TERESA CRISTINA ; Calderano, Simone Guedes ; VITORINO, FRANCISCA NATHALIA DE LUNA ; LLANOS, RICARDO PARIONA ; LOPES, MARIANA DE CAMARGO ; DE ARAÚJO, CHRISTIANE BEZERRA ; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE ; REIS, MARCELO DA SILVA ; Elias, Maria Carolina ; CHAGAS DA CUNHA, JULIA PINHEIRO . Quantitative Proteomic Analysis of Replicative and Nonreplicative Forms Reveals Important Insights into Chromatin Biology of Trypanosoma cruzi . MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS , v. 16, p. 23-38, 2017.

  • GONZALES-ZUBIATE, FERNANDO A ; OKUDA, ELLEN K ; DA CUNHA, JULIA PC ; OLIVEIRA, CARLA COLUMBANO . Identification of karyopherins involved in the nuclear import of RNA exosome subunit Rrp6 in Saccharomyces cerevisiae. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY , v. 24, p. jbc.M116.772376-10, 2017.

  • 2016 DE JESUS, TERESA CRISTINA LEANDRO ; NUNES, VINICIUS SANTANA ; LOPES, MARIANA DE CAMARGO ; MARTIL, DAIANA EVELIN ; IWAI, LEO KEI ; MORETTI, NILMAR SILVIO ; MACHADO, FABRICIO CASTRO ; DE LIMA-STEIN, MARIANA L ; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE ; Elias, Maria Carolina ; JANZEN, CHRISTIAN J. ; SCHENKMAN, SERGIO ; DA CUNHA, JULIA PC . Chromatin proteomics reveals variable histone modifications during the life cycle of Trypanosoma cruzi. Journal of Proteome Research (Print) , v. 15, p. 2039-2051, 2016.

  • 2016 DI GENOVA, BRUNO M. ; DA SILVA, RICHARD C. ; DA CUNHA, JÚLIA P. C. ; GARGANTINI, PABLO R. ; MORTARA, RENATO A. ; TONELLI, RENATA R. . Protein SUMOylation is Involved in Cell-cycle Progression and Cell Morphology in Giardia lamblia . The Journal of Eukaryotic Microbiology , v. -, p. 1-13, 2016.

  • 2014 LONGO, LARISSA V.G. ; DA CUNHA, JÚLIA P.C. ; SOBREIRA, TIAGO J.P. ; PUCCIA, ROSANA . Proteome of cell wall-extracts from pathogenic Paracoccidioides brasiliensis: Comparison among morphological phases, isolates, and reported fungal extracellular vesicle proteins. EuPA Open Proteomics , v. 3, p. 216-228, 2014.

  • 2013 da Cunha, J. P. C. ; Galante, Pedro A. F. ; de SOUZA, J. E. ; PIEPRZYK, M. ; CARRARO, D. ; OLD, L. J. ; CAMARGO, A. A. ; de SOUZA, S. J. ; da CUNHA, J. P. . The Human Cell Surfaceome of Breast Tumors. BioMed Research International , v. 2013, p. 1-11, 2013.

  • 2012 de SOUZA, J. E. S. ; GALANTE, P. A. F. ; RVB, A. ; da CUNHA, J. P. ; Ohara, D. T. ; ohno-machado, L. ; OLD, L. J. ; SOUZA, S. J. . SurfaceomeDB: a cancer-orientated database for genes encoding cell surface proteins. Cancer Immunity , v. 1, p. 12-15, 2012.

  • 2011 Calderano, Simone Guedes ; Godoy, Patricia Diogo de Melo ; da Cunha, Julia Pinheiro Chagas ; Elias, Maria Carolina . Trypanosome Prereplication Machinery: A Potential New Target for an Old Problem. Enzyme Research , v. 2011, p. 1-8, 2011.

  • 2009 NARDELLI, S. C. ; da CUNHA, J. P. ; MOTTA, M. C. ; SCHENKMAN, S. . Distinct acetylation of Trypanosoma cruzi histone H4 during cell cycle, parasite differentiation, and after DNA damage. Chromosoma (Berlin. Print) , v. 118, p. 487-499, 2009.

  • 2009 da Cunha, J. P. C. ; GALANTE, P. A. F. ; de SOUZA, J. E. ; de SOUZA, R. F. ; CARVALHO, P. M. ; Ohara, D. T. ; MOURA, R. P. ; Oba-Shinja, S. M. ; Marie, S. K. N. ; Silva, W. A. ; PEREZ, R. O. ; STRANSKY, B. ; PIEPRZYK, M. ; MOORE, J. ; CABALLERO, O. ; GAMA-RODRIGUES, J. ; HABR-GAMA, A. ; KUO, W. P. ; SIMPSON, A. J. ; CAMARGO, A. A. ; OLD, L. J. ; de Souza, S. J. ; da CUNHA, J. P. . Bioinformatics construction of the human cell surfaceome. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , v. 106, p. 16752-16757, 2009.

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Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    A Network for an Integrative Biology in Neglected Diseases: Bridging Epigenetics, Metabolism and Cell Cycle in Pathogenic Trypanosomatids., Descrição: The goal of this proposal is to understand the interaction among three essential core processes: metabolism, cell cycle and epigenetic gene expression regulation, with the goal of establishing a broader comprehension of how the metabolic environment affects parasite proliferation and determines inheritable adaptations. The information to be obtained will be fundamental to elucidate the basic biology of these pathogens as well as to discover new druggable points, greatly contributing for the development of novel therapies.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Coordenador / THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE - Integrante / Ariel Mariano Silber - Integrante / ELIAS, M - Integrante / Luiz Tosi - Integrante.

  • 2019 - Atual

    Indo a fundo na regulação da cromatina de Trypanosoma cruzi: identificação de novas moléculas e questionando seu possível impacto no controle da transcrição., Descrição: Regiões clássicas de eu e heterocromatina estão presentes nos núcleos de T.cruzi que mudam dramaticamente durante a diferenciação de epimastigotas para metacíclicos (E --> M). Tradicionalmente, essas regiões de cromatina (e algumas histonas MPTs) estão associadas à regulação da transcrição. No entanto, em tripanossomas, é geralmente aceito que mecanismos pós-transcricionais governam a expressão gênica, já que não foram encontradas regiões promotoras clássicas de RNA Pol II, e a transcrição é principalmente policistrônica. Assim, nosso principal objetivo é entender essa aparente controvérsia, investigando o papel da regulação da cromatina em um potencial controle de transcrição.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Coordenador.

  • 2018 - 2019

    Unravelling the epigenome of a simpler organism through differentiation: a shortcut to understand key epigenetics questions, Descrição: Muitas questões ainda não foram respondidas em epigenética, incluindo o papel da modulação da estrutura da cromatina (e suas marcas epigenéticas) em relação a regulação transcricional. Nós investigaremos esta questão usando um modelo celular eucariótico simples, o Trypanosoma cruzi. Além de ter um importante apelo médico na América Latina, nestes organismos não há regulação transcricional gene-específica para a maioria dos transcritos, o que nos permite visualizar os efeitos da dinâmica do epigenoma sem a interferência da regulação transcricional. Marcas epigenéticas e alterações globais na estrutura da cromatina já foram descritas em tripanossomas, e, há evidências de serem moduladas na diferenciação celular. Nós investigaremos o epigenoma ao longo da diferenciação celular das formas epimastigotas para tripomastigotas metacíclicos utilizando Gro-seq, Faire-seq e proteômica quantitativa. A integração destes resultados permitirá elucidar questões importantes no campo da epigenética. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Coordenador / Saloe Bispo Poubel - Integrante., Financiador(es): Instituto Serrapilheira - Auxílio financeiro.

  • 2017 - 2019

    Análise funcional da Histona H2B variante de Trypanosoma cruzi, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Coordenador.

  • 2013 - Atual

    CeTICS - Centro de Toxinas, Imuno-resposta e sinalização Celular., Descrição: No Instituto Butantan toxinologia e regulação da resposta imune são, tradicionalmente, áreas conexas de pesquisa científica e desenvolvimento biotecnológico, através das quais o Instituto, historicamente, construiu sua reputação internacional de excelência. Na cultura do Instituto, venenos são misturas complexas de toxinas, selecionadas ao longo da evolução para sinergicamente exercerem efeitos biológicos sistêmicos, através de mecanismos bioquímicas, moleculares e celulares altamente específicos. Portanto, a análise química de venenos tem boas chances de levar à descoberta de novas moléculas de toxinas com potencial terapêutico. Essas premissas foram seguidas com sucesso por pesquisadores do Centro de Toxinologia Aplicada (CATcepid-FAPESP), projeto iniciado há 10 anos, que isolaram, caracterizaram quimicamente e patentearam diversas toxinas de natureza proteica, que se tornaram pontos de partida para desenvolvimento de inovação farmacêutica em parceria com indústrias locais. A ênfase em proteínas e peptídeos levou o CATcepid a instalar laboratórios no estado da arte para transcriptômica, proteômica, biologia molecular do DNA recombinante e síntese de peptídeos. Mais recentemente, estudos dos mecanismos de ação, bioquímicas, moleculares e celulares, dessas promissoras moléculas foram iniciados com o objetivo de estabelecer provas de conceito. Assim, o CAT estabeleceu, no Instituto Butantan, as condições iniciais para a criação de um centro de toxinas e resposta imune fundamentado nas abordagens atuais da biologia sistêmica. Por conseguinte, 10 pesquisadores, entre os mais competitivos do Instituto Butantan, propõem a criação do novo Centro de Toxinas, Resposta-imune e Sinalização Celular, com aspirações a centro de excelência de classe mundial, aproveitando a histórica reputação internacional do Butantan e o sucesso recente do CATcepid. O Plano de pesquisa do Centro Integra subprojetos voltados para a pesquisa científica com subprojetos de vocação para a inovação tecnológica. Um Grande grupo de cientistas seniores do Instituto Butantan, de outras instituições brasileiras e de renomadas instituições estrangeiras serão colaboradores do Centro proposto.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Integrante / Maria Carolina Elias - Integrante / Solange M T Serrano - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador / Ana Marisa Chudzinski-Tavassi - Integrante / Denise Vilarinho Tambourgi - Integrante / Osvaldo Augusto Brazil Esteves Sant'Anna - Integrante / Wilmar Dias da Silva - Integrante / Inácio de Loiola Meirelles Junqueira de Azevedo - Integrante / Yara Cury - Integrante / Junior Barrera - Integrante.

  • 2011 - 2017

    Alterações nucleares e na cromatina ao longo do ciclo celular e senescência de células de mamíferos, Descrição: O núcleo celular é uma organela complexa formada por ácidos nucléicos e proteínas intimamente relacionadas. O proteoma nuclear, em especial a cromatina, desempenha funções envolvidas com a regulação e gerenciamento de ações no genoma que culminam com o controle da expressão gênica e do fenótipo celular. Diversas evidências apontam para um papel importante do núcleo e da cromatina no controle do ciclo celular de eucariotos. O fator de crescimento de fibroblastos 2 bloqueia transitoriamente células tumorais de camundongos nas transições G1S do ciclo celular e em seguida bloqueia irreversivelmente em G2M levando ao aparecimento de células com fenótipo senescente. Assim, o objetivo central desse projeto é estudar o papel das proteínas nucleares e da cromatina no ciclo celular e na senescência induzida por FGF2 estudando quantitativamente as alterações no proteoma e fosfoproteoma nuclear. Para tal, pretendemos estabelecer uma plataforma de análise proteômica quantitativa com principal enfoque no estudo do núcleo celular e da cromatina utilizando uma perspectiva de Biologia Sistêmica para análise e interpretação dos dados. Pretendemos ainda analisar em maiores detalhes o padrão de modificações pós traducionais em histonas ao longo do ciclo e senescência celular a fim de investigar se as mesmas podem desempenhar um papel importante no ciclo/senescência. A dinâmica da ligação de proteínas ao DNA ao longo do ciclo celular também será investigada e integrada com a dinâmica das alterações proteômicas a fim de obter uma visão mais completa e sistêmica dos efeitos causados por FGF2 no núcleo.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) . , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3

  • 2007 - 2010

    Splicing alternativo: Integração de estratégias computacionais para a caracterização funcional de variantes identificados por mutações em sítios reguladores de splicing em tumores de cólon, mama e glioblastomas., Descrição: O splicing alternativo é uma das maiores causas da grande diversidade de transcritos encontradas nas células humanas sendo que alguns variantes de splicing estão associados com a dispersão e a progressão de diversos tumores humanos, e dessa maneira, podem ser alvos importantes no diagnóstico e na terapia contra o câncer. Este projeto de pesquisa pretende explorar os dados de estratégias computacionais desenvolvidas no laboratório de Bioinformática do Instituto Ludwig - São Paulo, as quais identificaram possíveis novas seqüências reguladoras de splicing e variantes de splicing diferencialmente expressos em tumores. Pretendemos integrar essas estratégias para caracterizar funcionalmente variantes gerados por mutações somáticas existentes em elementos regulatórios de splicing (ESEs, ESSs, ISEs, ISSs).. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Integrante / Pedro Alexandre Favoretto Galante - Integrante / sandro jose de Souza - Coordenador / Jorge E de Souza - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.

  • 2007 - 2010

    Projeto Surfaceoma, Descrição: Neste projeto pretende-se identificar todas as proteínas transmembrânicas presentes na superfíce das células humanas e comparar a expressão desses genes em diversos tumores humanos afim de indetificar marcadores tumorais.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Julia Pinheiro Chagas da Cunha - Integrante / Pedro Alexandre Favoretto Galante - Integrante / sandro jose de Souza - Coordenador / Jorge E de Souza - Integrante / Anamaria Aranha Camargo - Integrante., Financiador(es): Ludwig Institute for Cancer Research - Auxílio financeiro.

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Prêmios

2007

Announcement of the Nature Reviews Cancer Award for Young Investigators, Nature Reviews Cancer & São Paulo Research Conference.

2006

PRÊMIO ZIGMAN BRENNER 2006 - MENÇÃO HONROSA, XXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology XXXIII annual meeting on Basic Research.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Instituto Butantan, CAT. , Rua Vital Brasil,1500., Butantã, 05503900 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 37267222, Ramal: 1024

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Experiência profissional

2010 - Atual

Instituto Butantan

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador Científico, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2007 - 2010

Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer

Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: pos doc student, Regime: Dedicação exclusiva.