Aline Maria da Silva

Graduada em Farmácia pela Universidade de São Paulo (1983), obteve título de Doutora em Bioquímica na Universidade de São Paulo (1987) sob orientação da Profa. Maria Helena Juliani. Realizou estágio de Pós-Doutorado na Saint Louis University, EUA (1989) sob supervisão da Dra. Claudette Klein, onde investigou mecanismos de adesão da ameba social Dictyostelium discoideum. Desde 1991 é docente no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. Em 1999 obteve o título de Livre-Docência em Bioquímica e desde 2008 é Professora Titular. É membro da Academia de Ciências do Estado de São Paulo desde 2017. A principal linha de pesquisa que desenvolve tem como objetivo compreender como a bactéria Xylella fastidiosa coloniza e causa doenças em plantas hospedeiras suscetíveis, como laranjeiras e videiras. Em outra linha de pesquisa desenvolvida em seu laboratório, investiga a diversidade e a dinâmica de comunidades microbianas envolvidas na degradação de biomassa durante o processo de compostagem. Mais recentemente o escopo dessa linha de pesquisa foi ampliado para a descoberta de novos bacteriófagos da compostagem com potencial de aplicação em fagoterapia. Em sua pesquisa utiliza abordagens bioquímicas, de biologia molecular e genômicas.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)

1983 - 1987

Universidade de São Paulo
Título: Expressão gênica diferencial durante o desenvolvimento e na resposta ao choque térmico em Blastocladiella emersonii
Orientador: Maria Helena Juliani
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Blastocladiella emersonii; Choque térmico; Expressão gênica diferencial; fungo aquático; Regulação pós-transcricional.Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Farmácia

1978 - 1983

Universidade de São Paulo

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Pós-doutorado

1999

Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: Aspectos regulatórios e funcionais da fosforilação reversível de proteínas em microorganismos, Ano de obtenção: 1999., Palavras-chave: Fosforilação de Proteínas; Inibidor de fosfatases; Proteina Fosfatase; Expressão Gênica; Proteina recombinante., Grande área: Ciências Biológicas

1987 - 1989

Pós-Doutorado. , Saint Louis University School Of Medicine, SLUSM, Estados Unidos. , Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Genômica.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímica dos Microorganismos/Especialidade: Bactérias Fitopatogênicas.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Regulação da Expressão Gênica.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Genômica/Especialidade: Metagenômica.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Sinalização celular.

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Organização de eventos

da Silva, Aline M ; Farah, C.S. ; Ferreira, H. ; SETUBAL, J. C. . XanthoMeeting. 2015. (Outro).

ALMEIDA, Maria Lucia Cardoso de ; PREVIATO, Lucia Mendonça ; PINTO, Francisco Juarez Ramalho ; DA SILVA, A. M. ; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho . GPI Membrane Anchors Structure and Function 1994 Meeting. 1994. (Congresso).

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Participação em eventos

23rd Biennial Evergreen International Phage Meeting. Genomic Analysis of Pseudomonas aeruginosa Phages Isolated from Composting Pinpoints Proteins Involved in Host Specificity. 2019. (Congresso).

48a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2019. (Congresso).

47a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2018. (Congresso).

EMBO VIRUSES OF MICROBES V Biodiversity and future applications s. Thermophilic composting virome assessed by metagenomics and by isolation of phages targeting Pseudomonas aeruginosa. 2018. (Congresso).

Microbes 2018 - American Society for Microbiology. 2018. (Congresso).

SPCell - São Paulo School For Advanced Science In Cell Biology.Outer membrane vesicles: biogenesis and functions in bacteria-host interactions. 2018. (Encontro).

46a Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2017. (Congresso).

Functional Metagenomics 2016. Composting as a source of new bacteria and thermostable enzymes viewed through metagenomics and metatranscriptomics. 2016. (Congresso).

XLV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). Mini-curso: Abordagens transcritômicas para o estudo da expressão de genomas e metagenomas. 2016. (Congresso).

XXXV ENEQUI.Minicurso: Microbiologia do Processo de Compostagem. Minicurso. 2016. (Encontro).

115th General Meeting, American Society for Microbiology. A Semi-Static Composting Process Viewed Through Metagenomics and Metatranscriptomics Temporal Series Samples. 2015. (Congresso).

23rd Congress of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) and 44th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology ? SBBq. Adhesion strategies of the phytopathogen Xylella fastidiosa. 2015. (Congresso).

Evolution 2015. Insights into Xylella fastidiosa host-plant specialization through phylogenomics. 2015. (Congresso).

XLIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq). 2014. (Congresso).

2013 Pierce?s Disease Research Symposium.Trimeric autotransporter adhesins of Xylella fastidiosa: role in virulence and insect transmission. 2013. (Simpósio).

XLII Reunião Anual da SBBq. Microbial communities succession, gene and functional diversity in a composting operation at the São Paulo Zoo Park. 2013. (Congresso).

XLII Reunião Anual da SBBq. Plant-Pathogen Interactions: Molecular Events and Signaling. 2013. (Congresso).

15a. Semana Temática da Biologia USP.Sinalização Celular. 2012. (Oficina).

4th ASM Conference on Beneficial Microbes, American Society for Microbiology. Microbial communities succession in a composting operation at the São Paulo Zoo Park, Brazil. 2012. (Congresso).

Congresso Latino Americano de Microbiologia. Genética de Micro-organismos e Bioinformática. 2012. (Congresso).

Second Generation Bioethanol 2012: Enzymatic Hydrolysis.Microbial community composition dynamics and gene diversity from São Paulo Zoo composting operation assessed by shotgun pyrosequencing. 2012. (Simpósio).

XLI Reunião Anual da SBBq. Prediction of bacteriocin-encoding genes in Xylella fastidiosa and analysis of their transcript levels. 2012. (Congresso).

Microbial Genomics & Metagenomics Workshop, Joint Genome Institute, Walnut Creek, California. 2011. (Oficina).

56o. Congresso Brasileiro de Genética. Pirossequenciamento, genômica comparativa e filogenia de cepas de Xylella fastidiosa. 2010. (Congresso).

56o. Congresso Brasileiro de Genética. Sequenciamento e comparação do genoma de uma cepa não-virulenta de Xylella fastidiosa. 2010. (Congresso).

Pierce´s Disease Research Symposium.Comparative Genomics of Xylella fastidiosa south american strains. 2010. (Simpósio).

XVIII Conference of the International Organization of Citrus Virologists. Microfluidic technology to study citrus pathogens. 2010. (Congresso).

XXXIX Reunião Anual da SBBq. Characterization of a Novel Protein that Interacts with Type 1 Serine/Threonine Phosphatase Catalytic Subunit of Dictyostelium discoideum. 2010. (Congresso).

Annual International Dictyostelium Conference. Serine/threonine phosphatases in Dictyostelium discoideum: expression profile during development and heat, osmotic and oxidative stresses.. 2009. (Congresso).

The Fourth Workshop Comparative Microbial Genomics and Taxonomy. 2009. (Oficina).

XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. Gomesin, a β-hairpin antimicrobial peptide, induces Xylella fastidiosa biofilm formation at a sublethal concentration. 2009. (Congresso).

XXXVIII Reunião Anual da SBBq. Characterization of Proteins that Interact with the Catalytic Subunit of Serine/Threonine Phosphatase of Type 1 (PP1) of Dictyostelium discoideum. 2009. (Congresso).

10th Biennial FASEB Summer Research Conference on Protein Phosphatases. Gene Expression Analyses of Dictyostelium discoideum Serine/Threonine Phosphatases. 2008. (Congresso).

XXXVIII Reunião Anual da SBBq. Serine/Threonine Phosphatases in the social amoebae Dictyostelium discoideum: expression analysis of catalytic and regulatory subunits. 2008. (Congresso).

Internacional Workshop on Xylella fastidiosa.The iron stimulon of Xylella fastidiosa. Internacional Workshop on Xylella fastidiosa.. 2007. (Simpósio).

XIII International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. The iron regulon of Xylella fastidiosa includes genes for type-IV pilus and colicin V-like bacteriocins. 2007. (Congresso).

XXXVI Reunião Anual da SBBq. Effect of sublethal concentration of streptomycin in Xylella fastidiosa. 2007. (Congresso).

XXXVI Reunião Anual da SBBq. Serine/threonine phosphatases in the social amoebae Dictyostelium discoideum: annotation and expression analysis of catalytic and regulatory subunits.. 2007. (Congresso).

Annual International Dictyostelium Conference. The P450 oxidoreductase, RedA, controls development beyond the mound stage in Dictyostelium discoideum. 2006. (Congresso).

Summer Research Conference on Protein Phosphatases. Identification and characterization of Dictyostelium discoideum serine/threonine phosphatases. 2006. (Congresso).

XII Congreso Venezolano de Bioanálisis. Intronic noncoding RNA as a molecular makers in prostate tumor. 2006. (Congresso).

XII Congreso Venezolano de Bioanálisis. Genomic Techonologies applied to cancer studies. 2006. (Congresso).

XXXV Reunião Anual da SBBq. RNA PolI-independent transcription of noncoding RNAs in human cells. 2006. (Congresso).

XXXV Reunião da SBBq. Prospecting the iron regulon of Xylella fastidiosa. 2006. (Congresso).

XII International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. Genome-wide analysis of the iron starvation stimulon and the Fur regulon of Xylella fastidiosa. 2005. (Congresso).

XXXIV Reunião Anual da SBBq. Molecular characterization of inhibitor-2 like proteins from Dictyostelium discoideum and Neurospora crassa: analysis of interaction domains with protein phosphatase 1 catalytic subunit. 2005. (Congresso).

First Latin American Protein Society Meeting. Molecular characterization of inhibitor-2 like proteins from Dictyostelium discoideum and Neurospora crassa: analysis of interaction domains with protein phosphatase 1 catalytic subunit. 2004. (Congresso).

XXXII Reuniao Anual da SBBq. Proteínas: Expressão, Estrutura, Interações e Função na Escala do Genoma.. 2003. (Congresso).

XXXII Reuniao Anual da SBBq. Identification and characterization of a putative inhibitor-2(DdI-2): A protein that interacts with Dictyostelium discoideum type-1 protein phosphatase (PP1). 2003. (Congresso).

XXXII Reunião Anual da SBBq. Characterization of redA: a Dictyostelium discoideum developmental mutant.. 2003. (Congresso).

XXXII Reunião Anual da SBBq. Cloning and characterization of an specific inhibitor for type-1 serine/threonine phosphatase of Neurospora crassa. 2003. (Congresso).

XXXII Reunião Anual da SBBq. Molecular Classification of Prostate Cancer using cDNA microarrays. 2003. (Congresso).

XXXI Reunião Anual da SBBq. Differential Gene Expression In Prostate Cancer Using cDNA Microarrays.. 2002. (Congresso).

XXXI Reunião Anual da SBBq. Identification and characterization of sugarcane transcription factors. 2002. (Congresso).

XXXI Reunião Anual da SBBq. Recombinant expression purification and characterization of Neurospora crassa neutral trehalase. 2002. (Congresso).

XXXI Reunião Anual da SBBq. Using DNA microarrays to prospect heat shock response in Xylella fastidiosa and to investigate genomic variations in distinct strains. 2002. (Congresso).

47o Congresso Nacional de Genética/SBG. Gene expression patterns of Xylella fastidiosa: a DNA microarray analysis. 2001. (Congresso).

XLIV Reunion Anual de La Sociedad de Biologia Chile. Gene expression patterns of Xylella fastidiosa: a DNA microarray analysis. 2001. (Congresso).

XXX Reunião Anual da SBBq. Characterization of redA: a Dictyostelium discoideum developmental mutant. 2001. (Congresso).

XXIX Reunião Anual da SBBq. Molecular characterization of Dictyostelium discoideum type-1 protein phosphatase (PP1). 2000. (Congresso).

XXIX Reunião Anual da SBBq. Expression and Partial Characterization of recombinant neutral trehalase. 2000. (Congresso).

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Participação em bancas

Aluno: Ana Maria Martins Marques da Cruz

da Silva, Aline M.; Oliveira, C.C.;Marques MV. Estudo das interações de Utp25 com outros componentes do complexo SSU processomo. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciencias Biológicas (Bioquímica)) - Instituto de Química/USP.

Aluno: Larissa de Oliveira Magalhães

Baldini, R.L.; SILVA NETO, J. F.;da Silva, Aline M. Caracterização de fatores sigma ECF de Pseudomonas aeruginosa PA14. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jennifer Katherine Salgueiro Londoño

da Silva, Aline M. Análises da expressão de genes do sistema de secreção na interação Methylobacterium mesophilicum sr 1.6/6 com a planta hospedeira. 2015. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: [Nome removido após solicitação do usuário]

da Silva, Aline M; Araujo, W.L.; Baldini, R.L.. Predição in silico e caracterização parcial das bacteriocinas de Xylella fastidiosa. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Nadia Abdrabo Abd El Khalik

da Silva, Aline M; MOHAMED, M. E.; MOUSSA, T. A. A.. Enviromental clean-up of oil residue using microbial surfactants. 2013. Dissertação (Mestrado em Biochemistry) - Cairo University.

Aluno: Danielle do Carmo Ferreira da Silva

da Silva, Aline M; Zingales, B.S.; Yoshida, N.. Similaridades entre as sequências de proteínas de invasão celular de Trypanosoma cruzi e bactérias intracelulares: transferência horizontal de genes ou convergência evolutiva?. 2013. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Carlos Henrique Rodrigues Gomes

Giordano, R.J.; CAMARA, N. O. S.;da Silva, Aline M.. Construção de uma biblioteca de anticorpos ScFv dirigidos contra o fator de crescimento vascular (VEGF). 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luiz Gustavo de Almeida

Spira, B.; Baldini, R.L.;da Silva, Aline M.. Acúmulo de polifosfato e o papel do gene phoU em Pseudomonas aeruginosa. 2013. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Miriam Molnar

Marques MVMARTINS, Elizabeth A. L.da Silva, Aline M.. papel de duas ferritinas no metabolismo de ferro de Caulobacter crescentus e sua regulação. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Juliana da Silva Santos

Marques MVda Silva, Aline M.MARTINS, Elizabeth A. L.. de fatores de transcrição e sinais celulares que regulam a expressão do gene cspC em Caulobacter crescentus. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gustavo Antônio Teixeira Chaves

da Silva, Aline M; Farah, C.S.; Spira, B.. Captação de ferro e efeito desse metal para crescimento e morfologia de Xylella fastidiosa. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Marques Pierry

da Silva, Aline MMarques MV; Hotta, C.T.. Pirossequenciamento e análise comparativa de genomas do fitopatógeno Xylella fastidiosa. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Valquiria Tiago dos Santos

Gueiros Filho, F.J.;da Silva, Aline M.Marques MV. Caracterização de novos componentes da maquinária de divisão em Bacillus subtilis. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ramira Yuri Ribeiro

GARCIA, C.R.S.da Silva, Aline M; SCHECHTMAN, D.. Papel das quinases PfPK7, PfNEK2, PfNEK3, PfMAP1 e PfelK1 na transdução de sinal de melatonina no desenvolvimento do ciclo celular intraeritrocítico de Plasmodium falciparum. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Renato Astolfi Raposo

da Silva, Aline M; BERTOLINI, M. C.; Oliveira, C.C.. Análise de interações da subunidade catalítica da fosfatase do tipo 1 (PP1c) de Dictyostelium discoideum identificadas através do sistema de duplo-híbrido em leveduras. 2010. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Tung Ching Ching

AZEVEDO, I. L. M. J.; LEE HO, P.;da Silva, Aline M. Identificação de toxinas da família Colubridae por meio da caracterização transcriptômicas das glândulas de Duvernoy das serpentes Philodryas olfersii e Waglerophis merremii. 2007. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Barbara Pereira de Mello

REIS, L. F. L.;da Silva, Aline M. Identificação de novos transcritos humanos através da exploração racional do banco de dados do Projeto Genoma do Câncer Humano (HCGP). 2007. Dissertação (Mestrado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente.

Aluno: Paulo de Paiva Rosa Amaral

da Silva, Aline M; ARMELIN, Hugo Aguirre; NOBREGA, Francisco G.. Estudo da biossíntese e regulação de RNAs não-codificadores intrônicos em células humanas. 2006. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Mariana Maschietto

CAMARGO, B.;da Silva, Aline M. Caracterização molecular dos componentes dos tumores de Wilms. 2005. Dissertação (Mestrado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente.

Aluno: Daniela Beton

da Silva, Aline M; BERTOLINI, M. C.; Marana, S.R.. Caracterização molecular de INc-1, um inibidor da proteína fosfatase do tipo 1 de Neurospora crassa. 2004. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Daniela Carvalho Gonzalez Kristeller

da Silva, Aline M; Colepicolo Neto, P.; Netto, L.E.S.. Caracterização do Mutante de Desenvolvimento redA de Dictyostelium discoideum. 2002. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernando Alexis Gonzales Zubiate

Oliveira, C.C.; Van Sluys, M.A.;da Silva, Aline M.. Estudo de interações entre subunidades do exossomo e com outras proteínas celulares em Saccharomyces cerevisiae. 2001. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ari José Scattone Ferreira

EL-DORRY, H. F.;da Silva, Aline M.MARTINS, Elizabeth A. L.. Sequenciamento de parte do genoma de Xylella fastidiosa e análise do metabolismo de carboidratos no genoma anotado. 2000. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Cleonice da Silva

Araujo, P.S.;Jorge, J.A.da Silva, Aline M.. Isolamento do transportador de trealose de Saccharomyces cerevisae. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ligia Miranda Menezes

Marques MVda Silva, Aline MGOMES, Suely Lopes. Análise da expressão do fator TacA e investigação dos promotores dependentes de TacA em Caulobacter crescentus. 1999. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga

Brentani, R.R.;da Silva, Aline M; Sampaio, L.O.. Celula-matriz extracelular. Outros proteoglicanos mediando novas interações. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carla Luciana Galli

Alves, M.J.M.;da Silva, Aline M.; Silveira-Filho, J.F.. Purificação de uma glicoproteína de Tripanosoma cruzi: Estudos de Condições e obtenção de peptídeos. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alcely Strutz Barroso

da Silva, Aline M; de Bianchi, A.G.; MARINOTTI, O.. Purificação e Caracterização de Subunidade Catálica da Proteína Fosfatase do Tipo 2A de Dictyostelium discoideum. 1996. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Claudia Kerley Frigeri

ARMELIN, Hugo Aguirre; NOBREGA, Francisco G.;da Silva, Aline M.. Revendo o mecanismo de ação de ACTH-PKC: A outra via. 1995. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Laila Alves Nahum

Zingales, B.S.;da Silva, Aline M; Silveira-Filho, J.F.. Isolamento e caracterização de sequencias que codificam antigenos de 80-90 KA de Trypanosoma cruzi. 1993. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Denise Braz Golgher

Zingales, B.S.;da Silva, Aline M.; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho. Antigenicidade de LLPG e galactofuranose e distribuição em cepas e estágios do Trypanosoma cruzi. 1992. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Claudio Antonio Pinho Joazeiro

SOGAYAR, Mari Cda Silva, Aline M.; Reinach FC. Oncogene Fos: Transformação celular e modulação da resposta de células BALB-3T3 a reguladores de crescimento. 1990. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Marcos Abrão de Souza Fonseca

VENCIO, Ricardo Z. N.da Silva, Aline M.; Cruz, AK. Identificação in silico de ncRNAs no organismo modelo Halobacterium salinarum. 2016. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paloma Bonato

Chubatsu, L.S.;da Silva, Aline M. Regulação dos genes relacionados ao metabolismo de nitrato em Herbaspirilum seropedicae. 2016. Tese (Doutorado em Ciências (Bioquímica)) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Leticia Anderson Bassi

VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergioda Silva, Aline M.. Regulação epigenética da expressão gênica de Schistosoma mansoni induzida por inibidor de histona deacetilase. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Thais Fernanda Bartelli

Briones MR; Gorab E;da Silva, Aline M.; Alves JMP; Janini LM. Dinâmica mutacional e epigenética do genoma de Candida albicans durante evolução in vitro sob hipóxia e choque térmico. 2016. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: André Coppe Pimentel

Terra, W.R.; ALMEIDA, S. V.;da Silva, Aline M; de Oliveira PL; Tanaka, A.S.. Estudos funcionais e moleculares relativo às membranas apicais intestinais de Dysdercus peruvianus. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Emy Tiyo Mano

Araujo, W.L.;da-Silva, A.M.. Prospecção de genes de Burkholderia seminalis TC3.4.2R3 com potencial para o biocontrole. 2015. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Cristina Colabardini

Goldman, G.H.;da Silva, Aline M.. Análise funcional dos genes que codificam as proteínas quinases pkcA e ypkA de Aspergillus nidulans. 2014. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Universidade de Sao Paulo-RP.

Aluno: Ana Paula Barroso do Nascimento

Baldini, R.L.;GOMES, Suely Lopesda Silva, Aline M.; Spira, B.; GALHARDO, R. S.. Um novo gene de Pseudomonas aeruginosa envolvido em percepção de quórum. 2014. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: TatIana Rodrigues Fraga

ISAAC, L.; LOPES-FERREIRA, M.;da Silva, Aline M. Identificação de proteases de Leptospira envolvidas com mecanismos de escape do sistema complemento humano. 2014. Tese (Doutorado em Imunologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Marcela Bach Prieto

Oliveira, C.C.;da Silva, Aline M.; Farah, C.S.. Caracterização do papel de Nop17p na montagem de snoRNPs de box C/D. 2014. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gabriela Mol Avelar

GOMES, Suely Lopesda-Silva, A.M.. Estudo da Sinalização por GMP cíclico em Blastocladiella emersonii. 2014. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Wesley Oliveira Santana

da Silva, Aline MSetubal, J.C.Ferro, J.A.; Briones, M.R.S.; Hotta, C.T.. Genômica comparativa de Xylella fastidiosa: diversidade do pangenoma e análise de genes de patogenicidade. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gianlucca Gonçalves Nicastro

Baldini, R.L.;de Souza, A. A.; Spira, B.; Farah, C.S.;da Silva, Aline M.. Busca por alvos de regulação pelo segundo mensageiro c-diGMP em Pseudomonas aeruginosa. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Liziane Cristina Campos Brusamarello dos Santos

de Souza, E.M.; Hemerly, A.S.; de Souza, F.A.; STEFFENS, M. B. R.;da Silva, Aline M.. Análise do transcritoma total de raízes de plântulas de arroz (Oryza sativa L.) colonizadas por Herbaspirilum seropedicae SmR1. 2013. Tese (Doutorado em Ciências (Bioquímica)) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Ana Laura Boechat Borges

Baldini, R.L.; SILVA NETO, J. F.; Gueiros Filho, F.J.; BROCCHI, M.;da Silva, Aline M.. Caracterização da superexpressão do fator sigma ECF sigma x em Pseudomonas aeruginosa PA14. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Alexandre Budu

GARCIA, C.R.S.; SCHECHTMAN, D.;da Silva, Aline M.; Marinho, C.R.F.; Lima, M.R.I.. Screening de ligantes para candidatos a receptores de sete domínios transmembrânicos no parasita Plasmodium falciparum. 2013. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Aline Helena da Silva Cruz

Rossi Filho, A.;da Silva, Aline M; UYEMURA, S. A.; BRAGA, G. U. L.; SILVA, R. N.. Mecanismos moleculares envolvidos no sensoriamento de nutrientes e a possível relevância destes na patogenicidade de Trichophyton rubrum. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de Sao Paulo-RP.

Aluno: Sávio de Siqueira Ferreira

SOUZA, Glaucia Mendesda Silva, Aline M.; Figueira, A.V.O.;Setubal, J.C.MENOSSI, Marcelo. Estudo do transcriptoma de genótipos ancestrais de cana-de-açúcar com enfoque em genes do metabolismo de parede celular. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paloma Mieko Sato

SOUZA, Glaucia Mendes; SCHECHTMAN, D.;SILVA, A.M.; PEREIRA, Gonçalo G; Figueira, A.V.O.. Regulação do acúmulo de sacarose em Cana-de-açúcar e análise funcional de uma proteína quinase relacionada com o conteúdo de sacarose. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Lauren Camargo

REIS, Eduardo Moraes R.da Silva, Aline M.; Brentani, H.P.; Rainho, C.A.; Giordano, R.J.. Expressão de RNAs não codificadores intrônicos longos em linhagens celulares humanas e o seu controle epigenético por metilação do DNA. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Carolina Ayupe de Oliveira Beckedorff

REIS, Eduardo Moraes R.da Silva, Aline M.; Briones, M.R.S.; Giordano, R.J.;DIAS-NETO, Emmanuel. Biogênese, estabilidade e localização sub-celular de RNAs não-codificadores longos expressos em regiões intrônicas do genoma humano. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernanda Christtanini Koyama

GARCIA, C.R.S.da Silva, Aline M.; Malnic, B.; Uliana, S.R.B.; Wunderlich, G.. Caracterização de putativo receptor serpentino e estudos sobre a implicação do sistema de ubiquitina/proteossomo na modulação do ciclo celular de Plasmodium falciparum. 2012. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Rodrigo Duarte Gonçalves

BERTOLINI, M. C.;da Silva, Aline M; Goldman, G.H.; THIEMANN, O. H.. Análise funcional e estrutural de fatores de transcrição envolvidos no controle do metabolismo do glicogênio em Neurospora crassa. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Giulliana Tessarin e Almeida

VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio; Zingales, B.S.;da Silva, Aline M.; Oliveira, G.C.; Oliveira, M.F.. Efeitos do pareamento no perfil da expressão gênica do parasita Schistosoma mansoni. 2010. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paola Alejandra Cappeletti

Farah, C.S.; Machini, M.T.;da Silva, Aline M.; Benedetti, C.E.; FERREIRA, R. C. C.. Identificação e análise funcional de interações proteína-proteína do sistema de secreção do tipo III de Xanthomonas axonopodis pv citri. 2010. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Guilherme Louzada Silva Meira

Gueiros Filho, F.J.;da Silva, Aline M.; Forti, F.L.; FERREIRA, R. C. C.; Lins, U.G.C.. Estudo do processo de divisão em Bacillus subtilis por microscopia de fluorescencia vital. 2010. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Laura Nogueira da Cruz

GARCIA, C.R.S.da Silva, Aline M.; BARCINSKI, M. A.; Teixeira, MMG; Ulrich, A.H.. Estudos de fisiologia comparativa de modelos de malária em roedor. 2010. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Layla Farage Martins

da Silva, Aline M; Goldman, G.H.; Forti, F.L.; Terenzi, H.F.; SCHECHTMAN, D.. Análise do perfil de expressão de serina/treonina fosfatases e prospecção da função biológica para algumas dessas enzimas em Dictyostelium discoideum. 2010. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Patricia Isabela Pessoa da Silva

da Silva, Aline Mde Souza, A. A.; de Oliveira, J.C.F.; Baldini, R.L.;GOMES, Suely Lopes. Identificação de genes com expressão modulada por estreptomicina e de genes associados à virulencia e patogenicidade em Xylella fastidiosa. 2010. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: César Moisés Camilo

GOMES, Suely Lopes; Rossi Filho, A.; Puccia, R.;da Silva, Aline M.VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Regulação da expressão gênica por oxigênio no fungo aquático Blastocladiella emersonii. 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: José Roberto Tavares

Gueiros Filho, F.J.; Ferreira, L.C.S.;da Silva, Aline M.Marques MV; Baldini, R.L.. Identificação e caracterização de novos moduladores da divisão em Bacillus subtilis. 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jacqueline Salotti

ARMELIN, Hugo Aguirre;da Silva, Aline M.; Curi, R.; Ulrich, A.H.; Viola, J.P.B.. Mecanismos moleculares e celulares de citotoxicidade de FGF2 parácrino em células tumorais dependentes de Ras. 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Angela Pedroso Tonon

Colepicolo Neto, P.; Yokoya, N.S.; Pinto, N.C.S.;da Silva, Aline M.; Gomes, L.F.. Adaptação celular e molecular de Gracilaria tenuistipitata exposta ao cádmio e cobre. 2009. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Juliana Helena Costa Smetana

Zanchin, N.I.T.; KOBARG, J.; SCHENKMAN, S.; Franchini, K.G.;da Silva, Aline M. Caracterização das proteinas TIPRL e alpha4, reguladores de fosfatases 2A. 2009. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Marina von Atzingen dos Reis

Nascimento, A.L.T.O.;da Silva, Aline M; Martinez, M.B.; Piazza, R.M.F.; CHUDZINSKI-TAVASSI, A. M.. Expressão, purificação e caracterização de proteínas de superfície de Leptospira interrogans. 2009. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ana Carolina Quirino Simões

da Silva, Aline MSOGAYAR, Mari C; Hirata Junior, R.;BRENTANI, H.; da Silva Junior, W.A.. Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarrays de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico em cânceres humanos. 2009. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Thais Duarte Bifano

Terra, W.R.;da Silva, Aline M.GOMES, Suely Lopes; Tanaka, A.S.; Oliveira, P.L.. Fisiologia molecular intestinal de Dysdercus peruvianus (Hemiptera). 2008. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernando Henrique Lojudice da Silva

Sogayar, M.C.; Zingales, B.S.;da Silva, Aline M.; Carramaschi, L.V.; Krieger, J.E.. Identificação de genes diferencialmente expressos durante diferenciação de células-tronco e caracterização de células progenitoras mesenquimais. 2008. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Pedro Alexandre Favoretto Galante

Malnic, B.;da Silva, Aline M; Brentani, H.P.; Farah, C.S.; Briones, M.R.S.. Uso de técnicas computacionais no estudo da transcrição e regulação gênica em Homo sapiens e Mus musculus. 2008. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Tatiana Rabachini

Villa, L.L.; Chammas, R.; ARMELIN, Hugo Aguirre;da Silva, Aline M.; Valentini, S.R.. Efeito da rapamicina em culturas organotípicas de queratinócitos que expressam oncoproteínas de papiloma vírus humano tipo 16. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Glauber da Costa de Brito

REIS, Eduardo Moraes R.DURHAM, Alan Mitchellda Silva, Aline M.SOGAYAR, Mari C; Silva, I.D.C.. Análise da expressão de RNAs intrônicos não-codificadores em carcinomas de célula renal. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leonardo de Oliveira Rodrigues

SOGAYAR, Mari Cda Silva, Aline M.; Ferreira, C.E.;REIS, Eduardo Moraes R.; Galler, R.. Busca e identificação de genes regulados pelo antígeno MT do vírus polioma na transformação maligna de células Balb-3T3. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Elza Helena Andrade Barbosa Durham

SOUZA, S. J.; POLIKARPOV, I.; CARRARO, D. M.;da Silva, Aline M.; BISCH, P. M.. Bioinformática estrutural de proteínas modificadas por eventos de splicing alternativo. 2007. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Adriano Zaini

da Silva, Aline Mde Souza, A. A.; Farah, C.S.; Vitorello, C.B.M.; Baldini, R.L.. O stimulon de ferro em Xylella fastidiosa. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Daniela Carvalho Gonzalez Kristeller

da Silva, Aline M; Baldini, R.L.; NOBREGA, Francisco G.; Malnic, B.; Lomeli, M.M.. Identificação e caracterização de subunidades catalíticas e reguladoras de proteínas fosfatases de Dictyostelium discoideum. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Sandra Mara Naressi Scapin

Zanchin, N.I.T.;da Silva, Aline M; KOBARG, J.; YUNES, J. A.; ARMELIN, Hugo Aguirre. Analises estruturais de GTPases da familia RAB e mecanismo de regulção de MAFB pela proteina TIPRL. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Ana Claudia Bonatto

BENELLI, E. M.;TERENZI, H. F.da Silva, Aline M. Caracterização in vitro da modificação pós-traducional das proteínas GlnB e GlnK de Herbaspirillum seropedicae. 2007. Tese (Doutorado em Ciências (Bioquímica)) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Cassia Docena

Farah, C.S.;da Silva, Aline M.; FERREIRA, R. C. C.; Oliveira, C.C.; Ferreira, H.. Identificação das interações envolvendo proteínas relacionadas aos sistemas de dois componentes e aos sistema de secreção do tipo III e IV do fitopatógeno Xanthomonas axonopodis pv citri. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ari José Scattone Ferreira

GOMES, Suely Lopes; Colepicolo Neto, P.;da Silva, Aline M.; Goldman, G.H.;MENOSSI, Marcelo. Regulação da resposta transcricional a estresses ambientais em fungos: Análise de microarrays de cDNAs de Trichoderma reesei. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jacqueline Salotti

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leandro Marcio Moreira

da Silva, Aline M; Farah, C.S.; Vitorello, C.B.M.; Baldini, R.L.; Kitajima, J.P.F.W.. Análise estrutural e funcional do genoma de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Natalia Pasternak Taschner

Spira, B.;da Silva, Aline M; Baldini, R.L.;Marques MV; Menck, C.F.. A regulação da Fosfatase Alcalina pelo fator sigma S da RNA polimerase de Escherichia coli. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Miryam Paola Alvarez Flores

CHUDZINSKI-TAVASSI, A. M.;da Silva, Aline M. Caracterização Funcional do ativador de fator X purificado do extrato bruto das cerdas de Lonomia obliqua: Ação sobre células endoteliais (HUVECs) e clonagem. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Michelle Fernanda Susin

GOMES, Suely Lopesda Silva, Aline M.; Chubatsu, L.S.; Spira, B.; Marval, M.G.. Análise funcional das proteínas HrcA, GroEs/GroEL e DnaK/DnaJ em Caulobacter crecentus. 2005. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Juliana Silva da Luz

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2005. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Juliana Moreira de Sousa Canavez

da Silva, Aline M; Ferro, E.S.; Castilho, B.A.; Marana, S.R.; Oliveira, C.C.. Caracterização molecular da proteína Ddl-2 e mapeamento de seus domínios de interação com a proteína fosfatase do tipo-1 de Dictyostelium discoideum. 2005. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paula Bertoloto Varaldo

Leite, L.C.C.;da Silva, Aline M. Expressão em BCG Recombinante do antígemo Sm14 de Schistosoma mansoni a partir dos Genes Nativo e Sintético. 2005. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Diva do Carmo Teixeira

COSTA, P. I.;da Silva, Aline M. Caracterização molecular e detecção por PCR de uma nova espécie de Liberibacter associada ao Huanglongbing (greening) no Estado de São Paulo, Brasil: Candidatus Liberibacter americanus. 2005. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luiz Fernando Goda Zuleta

Marques MVda Silva, Aline MGOMES, Suely Lopes; Menck, C.F.; GOMEZ, J. G. C.. Estudo dos genes envolvidos na resposta ao estresse osmótico em Caulobacter crescentus. 2005. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Cássio da Silva Baptista

Zingales, B.S.; Cano, M.I.N.; Colli, W.;da Silva, Aline M.; Silveira-Filho, J.F.. Expressão diferencial de genes em cepas de Trypanosoma cruzi pela técnica de microarranjos de DNA. 2004. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Larissa de Souza Carnevalli

Castilho, B.A.; Zanchin, N.I.T.;da Silva, Aline M; Castilho, R.F.. Fosforilação de elF2alfa e a resposta integrada de estresse no status epilepticus induzido por pilocarpina. 2004. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Flávia Regina Carreño

Ferro, E.S.;da Silva, Aline M. Análise molecular e ultraestrutural da via de secreção não convencional das endooligopeptidases neurolisina (ec3.4.24.16) e "thimet oligopeptidase" (EC3.4.24.15). 2004. Tese (Doutorado em Ciências (Biologia Celular e Tecidual)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Paulo Bandiera Paiva

BRIONES, M. R.; SOUZA, S. J.;da Silva, Aline M. Filogenias moleculares de sequências genômicas: aplicação na análise de receptores acoplados à proteína-G. 2004. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Molecular)) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Renato Magalhães de Paula

BERTOLINI, M. C.;da Silva, Aline M; Goldman, G.H.. Metabolismo do glicogênio em Neurospora crassa. Um estudo molecular e bioquímica e análise de interação proteína-proteína. 2004. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Luciana Pugliese da Silva

GOMES, Suely Lopes; Santelli, R.V.;da Silva, Aline M.; Ramos, C.H.I.; Netto, L.E.S.. Estudo da expressão dos genes de choque térmico hsp90, hsp60 e hsp10 do fungo aquático Blastocladiella emersonii. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Leonardo Costa Fiorini

da Silva, Aline M; Winter, C.E.; Quaggio, R.B.; Colepicolo Neto, P.;Marques MV. Identificação de genes codificadores de serina/treonina fosfatases em Dictyostelium discoideum e caracterização funcional da proteína fosfatase do tipo 4 (PP4). 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Nilce Naomi Hashimoto

Castilho, B.A.; Zanchin, N.I.T.;da Silva, Aline M. INTERAÇÕES PROTÉICAS NO FATOR DE INÍCIO DE TRADUÇÃO E lF2. 2003. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: FABIANA MARIA DE ALMEIDA

TERENZI, H. F.da Silva, Aline M. Expressão e caracterizão da trealase neutra recombinante de Neurospora crassa. 2003. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Felipe Santiago Chambergo Alcalde

El Dorry, H.F.A.; VENTURA, A. M.; NOBREGA, Francisco G.; Zingales, B.S.;da Silva, Aline M.. Elucidação do destino metabólico de glicose no fungo filamentoso Tricoderma reesei por análise EST (expressed sequence tags) e microarrays de cDNA. 2002. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Pedro Jorge Chimoy Effio

Pueyo, M.T.; Terra, W.R.;da Silva, Aline M.; Winter, L.M.F.; Silveira-Filho, J.F.. Estudos sobre a expressão dos genes de alfa amilase de B. stearothermophilus e de A. merus em células de bactéria, levedura e inseto. 2001. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Pio Donizete Alduino Zapella

da Silva, Aline M; ARMELIN, Hugo Aguirre; Daffre, S.; Leone, F.A.;Jorge, J.A.. Caracterização de alguns componentes envolvidos na desfosforilação de proteínas fosforiladas em resíduos de serina e treonina em Neurospora crassa. 2001. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Rose Adele Monteiro

Chubatsu, L.S.;da Silva, Aline M. Análise funcional dos domínios modulares da proteína NifA de Herbaspirillum seropedicae. 2001. Tese (Doutorado em Ciências (Bioquímica)) - Universidade Federal do Paraná.

Aluno: Rafael Marques Porto

SCHENKMAN, S.;da Silva, Aline M. Estrutura da cromatina e a fosforilaçäo da histona H1 durante o ciclo de vida e a diferenciaçäo do Trypanosoma cruzi. 2001. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Cleber Giovane Vedoy

SOGAYAR, Mari Cda Silva, Aline M.; EL-DORRY, H. F.; Zaha, A.;DIAS-NETO, Emmanuel. Isolamento, identificação e caracterização de sequencias expressas de DNA (ESTs) de genes regulados por glicocorticoides na reversão fenotípica tumoral-normal de células ST1 de glioma de rato. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: EUCLIDES MATHEUCCI JUNIOR

EL-DORRY, H. F.;da Silva, Aline M.; Farah, C.S.;Marques MV; Terenzi, H.F.. Isolamento e análise funcional do gene que codifica para uma proteína serina-treonina quinase que modula a expressão de genes regulados por carboidratos em Tricchoderma reesei. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Sandra Sueli Chan

Junqueira, V.B.C.; Campa, A.;da Silva, Aline M.; Curi, R.; Di Mascio, P.. Efeitos do alfa-tocoferol nas vias de sinalização associadas ao burst oxidativo de neutrófilos humano. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Daniela Mara de Oliveira

Reinach FC; Larson, R.E.;da Silva, Aline M.VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio; Nakaie, C.R.. Mapeamento e caracterização do dominio ativatório da troponina T. 2000. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luiz Paulo Moura Andrioli

da Silva, Aline M; Alves, M.J.M.; PEREIRA, Gonçalo G; SOUZA, S. J.; Oliveira, C.C.. Clonagem e Caracterização da Serina/treonina Fosfatase Tipo 1 (PP1) de Dictyostelium discoideum. 1999. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jose Antonio Novaes da Silva

da Silva, Aline M; EL-DORRY, H. F.; NOBREGA, Francisco G.;GOMES, Suely LopesFerro, J.A.. Clonagem e Seqüenciamento do Gene da L-glutamina:D-frutose-6-fosfato Amidotransferase de Blastocladiella emersonii. 1999. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Beatriz Monge Bonini

TERENZI, H. F.da Silva, Aline M. Especializaçãoo funcional das enzimas do metabolismo de trealose em fungos: modelos Saccharomyces cerevisiae e Neurospora crassa. 1999. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Angélica Alves Lima

Lodi, W.R.N.;da Silva, Aline M. Organização dos Microfilamentos e Microtúbulos Durante o Desenvolvimento da Blastocladiella emersonii. 1999. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Joaquim Cabrera Crespo

RAW, I.; Greene, L.J.;da Silva, Aline M.; Pessoa-Junior, A.; Tanaka, K.. Produção de albumina a partir de placentas humanas. 1998. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Mara Lucia Zucheran Silvestri

da Silva, Aline M; Colli, W.; NOBREGA, Francisco G.;Marques MV; Quaggio, R.B.. Mapeamento da Seqüência Sinal Responsável pela Adição da Âncora Glicolipídica na Molécula de Adesão Celular gp80 em Dictyostelium discoideum. 1998. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jomar Pereira Laurino

Castilho, B.A.;da Silva, Aline M. ANÁLISE MUTACIONAL DA REGIÃO AMINO-TERMINAL DA SUBUNIDADE BETA DO FATOR 2 DE INÍCIO DE TRADUÇÃO (eIF2). 1998. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Maira da Penha Marques da Silva

TERENZI, H. F.da Silva, Aline M. Caracterização bioquímica de mutantes osmossensíveis de Neurospora crassa. 1998. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Rosangela Ballego Campanha

da Silva, Aline M; Lodi, W.R.N.; Alves, M.J.M.;Jorge, J.A.; Reinach FC. Purificação da Proteína Fosfatase Dependente de Mg2+ e Estudo de seu Envolvimento na Regulação da Biossíntese da Parede de Quintina de Blastocladiella emersonii. 1997. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Flavio Henrique da Silva

EL-DORRY, H. F.;da Silva, Aline M.; Oliva, G.; Winter, L.M.F.;ARRUDA, Paulo. Região cis-atuante reguladora da transcrição do gene que codifica celobiohidrolase I em Trichoderma reesei- expressão basal e induzida. 1996. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maria Antonia Noventa Jordão

TERENZI, H. F.; Marin, J.M.; Goldman, G.H.; Rossi Filho, A.;da Silva, Aline M. Isolamento e caracterização de mutantes de Neurospora crassa deficiente no acumulo de glicogênio. 1996. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Julio Cezar Franco de Oliveira

GOMES, Suely Lopes; Santelli, R.V.; NOBREGA, Francisco G.; Larson, M.L.P.;da Silva, Aline M. Clonagem do gene da subunidade catalítica e caracterização dos promotores dos genes R e C da proteína quinase dependente de cAMP em Blastocladiella emersonii. 1995. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ricardo José Giordano

Alves, M.J.M.; Brentani, R.R.;da Silva, Aline M.; Winter, L.M.F.; Yoshida, N.. Estudos envolvendo uma família de glicoproteínas (TC-85) da superfície do protozoário flagelado Tripanosoma cruzi. 1995. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Norton Heise

ALMEIDA, Maria Lucia Cardoso de;da Silva, Aline M. Âncoras glicosilfosfatidilinositol em Trypanosoma cruzi e sua biossíntese. 1995. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Arthur Gruber

Zingales, B.S.; El Dorry, H.F.A.;da Silva, Aline M.; Winter, L.M.F.; Degrave, W.. Caracterização de dois genes contíguos de Tripanosoma cruzi que codificam antigenos com repetições de epitopos imunodominantes. 1994. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: MARCELO RIBEIRO DA SILVA BRIONES

SCHENKMAN, S.;da Silva, Aline M. Caracterizacao, expressao genica e evolucao da trans-sialidase de formas epimastigotas de Trypanosoma cruzi. 1994. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.

Aluno: Milton Vieira Coelho

Larson, R.E.;da Silva, Aline M; Farah, C.S.. Miosina-V é Alvo de Duas Enzimas Mediadoraa de Íons Cálciio: Calpaína e Cam Quinase I. 1994. Tese (Doutorado em Bioquimica) - Universidade de Sao Paulo-RP.

Aluno: Sandro Roberto Valentini

SOGAYAR, Mari Cda Silva, Aline M.GOMES, Suely Lopes; Bianco, A.C.; Winter, L.M.F.. Bases moleculares da reversão fenotípica induzida por hormonios glicocorticoides nas células C6 de glioma de rato. 1993. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Glaucia Mendes Souza

da Silva, Aline M; Castilho, B.A.; Van Sluys, M.A.; KOVARY, K.; Winter, L.M.F.. Estudo dos mecanismos envolvidos no controle por cAMP da expressão do gene para uma molécula de adesão em Dictyostelium discoideum. 1993. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Hans Waldenmaier

da Silva, Aline M.; Colepicolo Neto, P.; MIYAMOTO, S.. Exame de Qualificação. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Valquiria Pianheri Souza

da Silva, Aline M.; TERRA, C. F.; Machini, M.T.. Exame de Qualificação. 2013. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Eliciane C

da Silva, Aline M.. Mattos. Exame de Qualificação. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Camila Pinto Arantes

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2008. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Diorge Paulo de Souza

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2007. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Lívea Fujita Barbosa

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Rogério Ferreira Lourenço

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Fernando Alexis Gonzales Zubiate

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Debora Rose de Oliveira

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Marcos Castanheira Alegria

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2003. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Carlos Alberto Mayora Aita

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2002. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Nidia Alice Pinheiro

da Silva, Aline M.VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio. Exame de Qualificação. 2001. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Nicolás Federico Villamil Munévar

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Edmílson Ozório

da Silva, Aline M.SOUZA, Glaucia Mendes; KOWALTOWSKI, A. J.. Exame de Qualificação. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Luiz Gustavo Almeida

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2013. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gilberto Hideo Kaihami

da Silva, Aline M.; Pinto, N.C.S.. Exame de Qualificação. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Mariana Lombardi Peres

da Silva, Aline M.; Forti, F.L.; SCHECHTMAN, D.. Exame de Qualificação. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Gabriela Hase Siqueira

Marques MVda Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Maíra Harume Nagai

da Silva, Aline M.; Carmona, A.M.. Exame de Qualificação. 2011. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Raquel Santamaria

da Silva, Aline M.; Oliveira, M.L.S.; Borges, M.M.. Exame de Qualificação. 2010. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Ligia Segatto

Takita, M.A.;da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2009. Exame de qualificação (Mestrando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fabio Passeti

da Silva, Aline M.. Exame de Qualificação. 2002. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo.

da Silva, Aline M.; OLIVEIRA, H. C. F.; CIPOLLA NETO, J.; CAMARGO, A. C. M.. Comissão Especial de Avaliação para promoção à classe de professor titular. 2015. Universidade Federal de São Paulo.

da Silva, Aline M; PEREIRA, Gonçalo G; Di Mascio, P.; Gombert, AK; Kato, M.J.. Concurso para 01 cargo de Professor Doutor junto ao Departamento de Bioquímica do IQ-USP. 2015. Universidade de São Paulo.

da Silva, Aline M.; SCHENKMAN, S.. Concurso para 01 Cargo de Professor Doutor junto ao Instituto de Biofisica Carlos Chagas Filho. 2015. Universidade Federal do Rio de Janeiro.

Winter, C.E.;da Silva, Aline M; Barros, M.H.; Dini-Andreote, F.; Jorge, S.A.C.. Concurso para 02 cargos de Professor Doutor junto ao Departamento de Microbiologia/ICB-USP. 2014. Universidade de São Paulo.

MAZZACORATTI, M. G. N.; BECHARA, E. J. H.; CAMARGO-MATHIAS, M. I.;da Silva, Aline M; MERCURI, L. P.. Concurso para 01 cargo de Professor Adjunto no Departamento de Biofisica/UNIFESP. 2013. Universidade Federal de São Paulo.

DA SILVA, A. M.; FERREIRA, S. T.; Marana, S.R.; MENDES, J. G. P. A.; BLOCH JUNIOR, C.. Concurso para 02 cargos de Professor Doutor no Departamento de Bioquímica/IQUSP. 2013. Universidade de São Paulo.

da Silva, Aline M; MALAVAZI, I.; GUEIROS-FILHO, F.; KOBARG, J.; FUENTES, A. S. C.. Concurso para Professor Adjunto no Departamento de Genética e Evolução/UFSCAR. 2012. Universidade Federal de São Carlos.

da Silva, Aline M; VENTURA, A. M.; SILVA, L. B.; POLANCZYK, G. V.; OLIVEIRA, A. C.. Concurso para Provimento de 1 cargo de Prof. Doutor do Departamento de Farmacologia/Farmacologia com Enfoque em Genômica. 2012. Universidade de São Paulo.

da Silva, Aline M; MAIA, I. G.; ZERBINI-JR, F. M.; BARROS, M. H.; BRAGA, G. U. L.. Concurso para Provimento de 1 cargo de Pesquisador II no Departamento de Genética/Unesp-Botucatu. 2012. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

DA SILVA, A. M.. Concurso para Professor Doutor no Departamento de Bioquímica do IQUSP. 2011. Universidade de São Paulo.

SILVA, A.M.; BERTOLLO, L. A. C.; BERTOLINI, M. C.; BACCI, M.; MORAES, G.. Concurso para Professor Adjunto no Departamento de Genética e Evolução/UFSCAR. 2011. Universidade Federal de São Carlos.

DA SILVA, A. M.. Concurso para Professor Doutor no Departamento de Bioquímica e Imunologia da FMUSP-RP. 2010. Universidade de Sao Paulo-RP.

DA SILVA, A. M.. Concurso para Professor Doutor no Departamento de Quimica da FFCLRP. 2010. Universidade de Sao Paulo-RP.

SILVA, A.M.. Concurso para Professor Adjunto no Departamento de Genética e Evolução/UFSCAR. 2008. Universidade Federal de São Carlos.

SILVA, A.M.. Concurso para Professor Doutor no Departamento de Bioquímica do IQUSP. 2008. Instituto de Química/USP.

DA SILVA, A. M.. Processo seletivo para contratação de professor-doutor em regime de tempo parcial no Departamento de Bioquímica do IQUSP. 2002. Universidade de São Paulo.

DA SILVA, A. M.. Processo Seletivo para Contratação de Professor Doutor (MS3) Depto Farmacologia/ICB-USP. 2000. Universidade de São Paulo.

DA SILVA, A. M.. Processo Seletivo para contratação de Professor Doutor (MS3)/Depto Farmacologia ICB-USP. 1995. Universidade de São Paulo.

DA SILVA, A. M.. Provimento de Cargos de Pesquisador Científico I. 1992. Instituto Butantan.

da Silva, Aline M; COSTA NETO, C. M.; Ribeiro, BM; KETTELHUT, I. C.. Concurso de Titulos e Provas de Livre-Docencia da FMRP-USP. 2015. Universidade de São Paulo.

da Silva, Aline M.. Concurso de Provas e Titulos de Livre-Docencia do IQSC-USP. 2015. Universidade de São Paulo.

KETTELHUT, I. C.; COSTA NETO, C. M.; THIEMANN, O. H.;da Silva, Aline M; SILVA, F.H.. Concurso de Títulos e Provas de Livre-Docente junto ao Departamento de Bioquímica e Imunologia/FMRP-USP. 2013. Universidade de Sao Paulo-RP.

SILVA, A.M.; AUGUSTO, O.. Concurso para obtenção do Título de Livre-Docente no Departamento de Bioquímica do IQ-USP. 2006. Instituto de Química/USP.

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Orientou

Ariosvaldo Pereira dos santos junior

Caracterização molecular de novos bacteriófagos com potencial de uso na fagoterapia; ; Início: 2018; Dissertação (Mestrado profissional em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Fernando Pacheco Nobre Rossi

Busca de determinantes de especificidade de bacteriófagos de Pseudomonas aeruginosa; Início: 2017; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Guillermo Uceda Campos

Filogenômica de Xylella fastidiosa; Início: 2017; Dissertação (Mestrado em Bioinformatica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

Suzana Eiko Sato Guima

Estudo genômico das bactérias da compostagem em amostras de inóculo e composto maduro; Início: 2017; Dissertação (Mestrado profissional em Bioinformatica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Remigio Cenepo Escobar Rodrigues

Dinâmica e co-ocorrência de genes de resistência a antibióticos e elementos genéticos móveis no microbioma da compostagem; Início: 2019; Tese (Doutorado em Bioinformatica) - Universidade de São Paulo; (Orientador);

Deyvid Emanuel Amgarten

Predição de atributos biológicos em bacteriófagos ambientais através de aprendizado de máquina visando aplicação em fagoterapia; Início: 2017; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Raquel Riyuzo de Almeida Franco

Análise de dados genômicos e metagenômicos da microbiota de fezes de macacos bugio de vida livre e de cativeiro; Início: 2016; Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Orientador);

MAIKE ROSSMANN

Início: 2018; Instituto de Química/USP;

Oséias Feitosa Júnior

Início: 2017; Instituto de Química/USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior;

Deyvid Amgarten

Análise da diversidade de bacteriófagos associada à comunidade microbiana durante o processo de compostagem; 2016; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Aline Maria da Silva;

Fernando Domingues Kummel Tria

Análise in silico de regiões promotoras de genes de Xylella fastidiosa; 2013; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

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Predição in silico e caracterização parcial das bacteriocinas de Xylella fastidiosa; 2013; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Gustavo Antônio Teixeira Chaves

Captação de ferro e efeito desse metal para crescimento e morfologia de Xylella fastidiosa; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Paulo Marques Pierry

Pirossequenciamento e análise comparativa de genomas do fitopatógeno Xylella fastidiosa; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Renato Astolfi Raposo

Análise de interações da subunidade catalítica da fosfatase do tipo 1 (PP1c) de Dictyostelium discoideum identificadas através do sistema de duplo-híbrido em leveduras; 2010; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Paulo de Paiva Rosa Amaral

Estudo da biossíntese e regulação de RNA não-codificadores intrônicos em células humanas; 2006; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Daniela Beton

Caracterização molecular de INc-1, um inibidor da proteína serina/treonina fosfatase do tipo 1 de Neurospora crassa; ; 2004; 98 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Daniela Carvalho Gonzalez

Caracterização do mutante de desenvolvimento redA de Dictyostelium discoideum; ; 2002; 110 f; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Alcely S Barroso

Purificação e caracterização da subunidade catalítica da proteína fosfatase do tipo 2A de Dictyostelium discoideum; ; 1996; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Ana Paula Silva de Souza

Caracterização bioquímica e funcional da adesina XadA3 de Xylella fastidiosa; ; 2018; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Paulo Marques Pierry

Transcritômica comparativa de cepas de Xylella fastidiosa; 2017; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Oséias Rodrigues Feitosa Junior

Caracterização do secretoma de cepas Xylella fastidiosa; 2017; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Aline Maria da Silva;

Luciana Principal Antunes

Metagenômica e Metatranscritômica da Microbiota da Compostagem do Parque Zoológico de São Paulo; 2016; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Deibs Barbosa

Análise computacional da variação do potencial metabólico microbiano em metagenomas; 2015; Tese (Doutorado em Bioinformatica) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Aline Maria da Silva;

Wesley Oliveira Santana

Genômica comparativa de Xylella fastidiosa: diversidade do pangenoma e análise de genes de patogenicidade; 2013; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Aline Maria da Silva;

Patricia Isabela Pessoa da Silva

Identificação de genes com expressão modulada por estreptomicina e de genes associados à virulência e patogenicidade em Xylella fastidiosa; 2010; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Layla Farage Martins

Análise do perfil de expressão de serina/treonina fosfatases e prospecção da função biológica para algumas dessas enzimas em Dictyostelium discoideum; 2010; 0 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Ana Carolina Quirino Simões

Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos; 2009; Tese (Doutorado em Bioinformatica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Paulo Adriano Zaini

O stimulon de ferro em Xylella fastidiosa; 2007; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Daniela Carvalho Gonzalez

Identificação e caracterização de subunidades catalíticas e reguladoras de proteínas fosfatases de Dictyostelium discoideum; 2007; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Leandro Marcio Moreira

Análise estrutural e funcional do genoma de Xanthomonas axonopodis pv; citri; 2006; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Juliana Moreira Sousa

Caracterização molecular da proteína DdI-2 e mapeamento de seus domínios de interação com a proteína fosfatase 1 de Dictyostelium discoideum; ; 2005; 154 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Leonardo Costa Fiorini

Identificação de gene codificadores de serina/treonina fosfatases em Dictyostelium discoideum e caracterização funcional da proteína fosfatase do tipo 4 (PP4); ; 2003; 112 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Pio Donizete Alduino Zapella

Caracterização de alguns componentes envolvidos na desfosforilção de proteínas fosforiladas em resíduos de serina e treonina em Neurospora crassa; 2001; 175 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Jose Antonio Novaes da Silva

Clonagem e sequenciamento do gene da L-glutamina:D-frutose-6-fosfato amidotransferase de Blastocladiella emersonii; ; 1999; 93 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Aline Maria da Silva;

Luiz Paulo Moura Andrioli

Clonagem e Caracterização da Serina/treonina Fosfatase Tipo 1 (PP1) de Dictyostelium discoideum; 1999; 124 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Mara Lucia Zucheran Silvestri

Mapeamento da sequência sinal responsável pela adição da âncora glicolípidica na molécula de adesão celular gp80 de Dictyostelium discoideum; ; 1998; 126 f; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Rosangela Ballego Campanha

Purificação da proteína fosfatase dependente de Mg2+ e estudo de seu envolvimento na regulação da biossíntese da parede de quitina de Blastocladiella emersonii; ; 1997; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Glaucia Mendes Souza

Estudo dos mecanismos envolvidos no controle por cAMP da expressão do gene para uma molécula de adesão celular em Dictyostelium discoideum; ; 1993; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica)) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Rafael Nascimeno

2018; Instituto de Química/USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Aline Maria da Silva;

Paulo Marques Pierry

2017; Instituto de Química/USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Aline Maria da Silva;

Paulo Adriano Zaini

2015; Instituto de Química/USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Aline Maria da Silva;

Deibs Barbosa

2015; Instituto de Química/USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Aline Maria da Silva;

Roberta Verciano Pereira

2015; Instituto de Química/USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Aline Maria da Silva;

Joaquim Martins Junior

2014; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Aline Maria da Silva;

Andréa Cristina Fogaça

Efeitos de peptídeos antimicrobianos em concentrações subinibitórias sobre o perfil de expressão gênica de Xylella fastidiosa; 2003; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Aline Maria da Silva;

Rosangela Ballego Campanha

1998; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Aline Maria da Silva;

Glaucia Mendes Souza

1998; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Aline Maria da Silva;

Lilian C

Etchebehere; 1997; Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Aline Maria da Silva;

Joice Cassimiro da Silva

Caracterização de bacteriófagos de Pseudomonas aeruginosa; 2017; Iniciação Científica - Instituto de Química/USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Mariane Leichsenring Schulz

Caracterização Química e Microbiologica de Inóculos de Compostagem; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Química) - Instituto de Química/USP; Orientador: Aline Maria da Silva;

Laís Uchôa Rabelo Mendes

Análise Computacional da Diversidade Microbiana em Inóculos de Compostagem Termofílica; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Química) - Instituto de Química/USP, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Karen Cristina Lombardi

Estudos de metagenômica da comunidade microbiana da compostagem do Zoológico de São Paulo; 2013; Iniciação Científica; (Graduando em Farmácia e Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Oséias Rodrigues Feitosa Junior

Análise da expressão da poligalacturonase em diferentes cepas de Xylella fastidiosa; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Farmacia e Bioquimica) - Universidade Católica de Santos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Carolina Dagli Hernandez

Clonagem e expressão recombinante de pilQ de Xylella fastidiosa; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Farmacia e Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Ana Paula Fefin

Análise de proteínas relacionadas a adesão em Xylella fastidiosa; 2010; Iniciação Científica; (Graduando em Farmacia) - Universidade Santa Cecília, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Maurício Barlera

Caracterização de componentes responsáveis pela patogenicidade em Xylella fastidiosa; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Quimica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Fernanda N

G; Lupo; Purificação e caracterização funcional da proteína recombinante Fur de Xylella fastidiosa; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Farmacia e Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Renato Astolfi Raposo

Caracterização funcional de proteínas que interagem com a subunidade catalítica da serina/treonina fosfatase do tipo 1 (PP1) de Dictyostelium discoideum; 2006; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Quimica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Isabel Irino

Caracterização bioquímica de proteínas que interagem com a subunidade catalítica da serina/treonina fosfatase do tipo 1 (PP1) de Dictyostelium discoideum; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Farmacia e Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Evelyn Pucci Schevciw

Expressão recombinante e caracterização de uma bacteriocina de Xylella fastidiosa; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Quimica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Ana Carolina Quirino Simões

Data mining nos projetos Genoma do Câncer e da Cana de Açúcar; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Farmacia e Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Camila M

Egidio; Implantação de microarrays de DNA para análise da expressão gênica no câncer de próstata; 2002; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Paulo Adriano Zaini

Mutagênese sítio-dirigida no sítio catalítico da PP1 de Dictyostelium discoideum; Análise de seus efeitos na atividade da enzima recombinante; 2001; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Daniela Beton

Obtenção e purificação da trealase neutra de N; crassa recombinante; 2001; Iniciação Científica; (Graduando em Quimica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Daniela Carvalho Gonzalez

Clonagem do gene da NADPH citocromo P450 redutase de Dictyostelium discoideum; 2000; Iniciação Científica; (Graduando em Quimica) - Universidade de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Ayumi Hasemi Carvalho

Purificação da proteína gp80 para análise de seus oligossacarídeos O-ligados; 1998; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Andrea C Regatão

Clonagem de genes de fosfatases em Blastocladiella emersonii; 1993; Iniciação Científica; (Graduando em Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Aline Maria da Silva;

Adriana Pivi

Obtenção de linhagens de D; discoideum que expressam a proteína gp80 constitutivamente; 1993; Iniciação Científica; (Graduando em Farmacia e Bioquimica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Roberta Verciano Pereira

Descoberta de genes e bactérias para degradação de biomassa lignocelulósica; 2014; Orientação de outra natureza; (Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

Gabriela Sola

Estudos de parametros químicos da compostagem do Zoológico de São Paulo através de pirossequenciamento; 2013; Orientação de outra natureza; (Química Ambiental) - Universidade de São Paulo, Pro-Reitoria de Graduacao USP; Orientador: Aline Maria da Silva;

Vanessa Goulart

Análise de genomas bacterianos; 2013; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Pro-Reitoria de Graduacao USP; Orientador: Aline Maria da Silva;

FABIANA MARIA DE ALMEIDA

Expressão e caracterização bioquímica da trealase neutra recombinante de Neurospora crassa; ; 2003; 110 f; Orientação de outra natureza - Universidade de Sao Paulo-RP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Aline Maria da Silva;

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Produções bibliográficas

  • TANG, FENNY H. F. ; STAQUICINI, FERNANDA I. ; TEIXEIRA, ANDRÉ A. R. ; MICHALOSKI, JUSSARA S. ; NAMIYAMA, GISLENE M. ; TANIWAKI, NOEMI N. ; SETUBAL, JOÃO C. ; da Silva, Aline M. ; SIDMAN, RICHARD L. ; PASQUALINI, RENATA ; ARAP, WADIH ; GIORDANO, RICARDO J. . A ligand motif enables differential vascular targeting of endothelial junctions between brain and retina. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA (ONLINE) , v. 116, p. 201809483, 2019.

  • SILVA, NATALIA MARIA ; DE OLIVEIRA, ALINE MÁRCIA SILVA ARAÚJO ; PEGORIN, STEFANIA ; GIUSTI, CAMILA ESCANDURA ; FERRARI, VITOR BATISTA ; BARBOSA, DEIBS ; MARTINS, Layla Farage ; MORAIS, CARLOS ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; VASCONCELLOS, SUZAN PANTAROTO ; DA SILVA, ALINE MARIA ; DE OLIVEIRA, JULIO CEZAR FRANCO ; PASCON, RENATA CASTIGLIONI ; VIANA-NIERO, CRISTINA . Characterization of novel hydrocarbon-degrading Gordonia paraffinivorans and Gordonia sihwensis strains isolated from composting. PLoS One , v. 14, p. e0215396, 2019.

  • FEITOSA-JUNIOR, OSÉIAS R. ; STEFANELLO, ELIEZER ; ZAINI, Paulo ; NASCIMENTO, RAFAEL ; PIERRY, PAULO M. ; DANDEKAR, ABHAYA ; LINDOW, STEVEN ; DA SILVA, ALINE MARIA . Proteomic and metabolomic analyses of Xylella fastidiosa OMV-enriched fractions reveal association with virulence factors and signaling molecules of the DSF family. PHYTOPATHOLOGY , v. 109, p. PHYTO-03-19-008, 2019.

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  • Maltez Thomas, Andrew ; Prata Lima, Felipe ; Maria Silva Moura, Livia ; Maria da Silva, Aline ; DIAS-NETO, Emmanuel ; SETUBAL, JOÃO C. . Comparative Metagenomics. In: Joao C Setubal; Jens Stoye; Peter F. Stadler. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York: Springer New York, 2018, v. , p. 243-260.

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  • da Silva, Aline M ; Gonzalez-Kristeller, D.C. ; KOBARG, J. ; Oliveira, C.C. . Sistema duplo-híbrido em levedura: Conceitos e Aplicações. In: Resende, Rodrigo Ribeiro; Soccol, Carlos Ricardo. (Org.). Biotecnologia aplicada à saúde : fundamentos e aplicações. 1a.ed.São Paulo: Blucher, 2015, v. 2, p. 933-965.

  • Marques MV ; DA SILVA, A. M. . Transcriptoma. In: Luiz Mir. (Org.). Genômica. 1ed.São Paulo: Atheneu, 2004, v. 01, p. 1-1114.

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  • VENANCIO, Thiago M ; DEMARCO, Ricardo ; OLIVEIRA, Katia Cristina P ; SIMÕES, Ana Carolina Quirino ; DA SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio . Genomics and gene expression management tools for the Schistosoma mansoni cDNA microarray project. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2005, São Leopoldo. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer-Verlag, 2005. v. 3594. p. 198-201.

  • SIMÕES, Ana Carolina Quirino ; DA SILVA, A. M. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; REIS, Eduardo Moraes R. . SAM method as an approach to select candidates for human prostate cancer markers. In: Brazilian Symposium on Bioinformatics, 2005, São Leopoldo. Lecture Notes in Computer Science. Berlin: Springer-Verlag, 2005. v. 3594. p. 202-205.

  • SILVESTRI, Mara Lucia Zucheran ; PIVI, Adriana Maria ; KLEIN, Claudette ; PAULY, P C ; DA SILVA, A. M. . Constitutive overexpression of a GPI-anchored cell adhesion molecule in Dictyostelium discoideum cells.. In: GPI Membrane Anchors Structure and Function Meeting, 1994, Angra dos Reis. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (Impresso), 1994. v. 27. p. 427-430.

  • PAULY, P C ; DA SILVA, A. M. ; KLEIN, Claudette . Biogenesis of the gp80, the GPI-anchored protein in Dictyostelium discoideum.. In: GPI Membrane Anchors Structure and Function Meeting, 1994, Angra dos Reis. Brazilian Journal of Medical and Biological Research (Impresso), 1994. v. 27. p. 421-426.

  • da Silva, Aline M. . Xylella fastidiosa comparative genome analyses provide insights into pathogen-plant interaction. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M. . Mecanismos moleculares de patogenicidade em Xylella fastidiosa. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Santana, W.O. ; Pierry, P.M. ; Coletta-Filho H.D. ; ZAINI, Paulo A. ; Kitajima, J.P. ; MARTINS-JUNIOR, J. ; Almeida, L.G. ; de Souza, A. A. ; VASCONCELOS, A. T. R. ; ALMEIDA, R. R. ; Machado, M.A. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; da Silva, Aline M . Whole genome comparison reveals significant diversity among different Xylella fastidiosa strains and highlights host specificity determinants. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • MARTINS, Layla Farage ; Principal, L.A. ; SETUBAL, J. C. ; da Silva, Aline M . Microbial community composition dynamics and gene diversity from São Paulo Zoo composting operation assessed by shotgun pyrosequencing. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M ; ZAINI, Paulo A. ; FOGAÇA, A.C. . The iron stimulon of Xylella fastidiosa. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M ; REIS, Eduardo Moraes R. ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; AMARAL, P.R.A. ; T.I.NAKAYA, H. . Intronic non-coding RNA as molecular markers in prostate tumor. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; REIS, Eduardo Moraes R. . Genomic approach to cancer. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M . Advanced technology of genomic analysis.. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • ZAINI, Paulo A. ; KOIDE, Tie ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; GOMES, Suely Lopes ; da Silva, Aline M . Delineation of pathogenesis mechanisms in Xylella fastidiosa through DNA microarrays. 2003. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • ZAINI, Paulo A. ; KOIDE, Tie ; VERJOVSKI-ALMEIDA, Sergio ; GOMES, Suely Lopes ; da Silva, Aline M . Gene expression patterns of Xylella fastidiosa: a DNA microarray analysis. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M . Transcriptional profiling through DNA microarray analysis: technological aspects and applications. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M . Gene expression patterns of Xylella fastidiosa: a DNA microarray analysis. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M . In silico mining and annotation of assembled ESTs from sugarcane. 2001. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M . Genome sequence of Xylella fastidiosa. 2000. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • da Silva, Aline M . Searching for the role of serine/threonine phosphatases in Dictyostelium. 1999. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • ARRUDA, Paulo ; GOLDMAN, Maria Helena de Souza ; LEITE, Adilson ; MENCK, Carlos F. ; NOBREGA, Francisco G. ; DA SILVA, A. M. . Sugarcane Transcriptome. A landmark in Plant Genomics in the tropics - Editores associados. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2001 (Genetics and Molecular Biology volume especial 24 (1-4)).

  • ALMEIDA, Maria Lucia Cardoso de ; PREVIATO, Lucia Mendonça ; PINTO, Francisco Juarez Ramalho ; DA SILVA, A. M. ; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho . Proceedings of the GPI Membrane Anchors Structure Function 1994 Meeting- Guest Editorial Board. Ribeirão Preto: Assoc Bras Divulg Cientifica, 1994 (Brazilian Journal of Medical and Biological Research/volume 27 (2):115-562).

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Outras produções

Guimarães, M. ; da Silva, Aline M . Aliados improváveis - Entrevista e Podcast. 2017. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).

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Projetos de pesquisa

  • 2016 - Atual

    Isolamento e caracterização molecular de bacteriófagos visando aplicação em fagoterapia., Descrição: Bacteriófagos ou fagos são vírus que infectam bactérias e vastamente abundantes na natureza. Desde sua descoberta, no início do século XX, os fagos têm sido ferramentas valiosas no desenvolvimento da biologia molecular e da biotecnologia, além de agentes antimicrobianos, na chamada fagoterapia. Nos últimos anos o interesse no uso de fagos como agentes terapêuticos ressurgiu como uma alternativa para o tratamento de infecções por bactérias multirresistentes a antibióticos. Temos como objetivo nesse projeto o isolamento e caracterização de fagos utilizando-se Pseudomonas aeruginosa como hospedeira. Os fagos isolados serão caracterizados quanto a sua morfologia e abrangência de hospedeiros em nível de espécie e cepas. Os genomas dos fagos serão sequenciados e anotados. Os mecanismos moleculares envolvidos na interação fago-bactéria serão investigados. Os fagos e suas despolimerases serão avaliados quanto a eficácia na dissolução do biofilme bacteriano. O potencial de utilização dos fagos no tratamento de infecções por P. aeruginosa será avaliado em larvas de Galleria mellonella como modelo experimental.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Layla Farage Martins - Integrante / João C. Setubal - Integrante / Deyvid Amgarten - Integrante / Lucas Palma Braga - Integrante / Ariosvaldo Pereira dos Santos Junior - Integrante / Fernando Pacheco Nobre Rossi - Integrante., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 5

  • 2012 - Atual

    Aspectos moleculares da interação de Xylella fastidiosa com seu hospedeiro vegetal, Descrição: Este projeto tem como objetivo investigar aspectos moleculares da interação de Xylella fastidiosa com seu hospedeiro vegetal através da análise comparativa do genoma e do transcritoma completo de diferentes linhagens deste fitopatógeno. As diferenças detectadas serão associadas aos distintos fenótipos das linhagens, em particular aqueles potencialmente associados à adaptação ao hospedeiro vegetal e a virulência desta bactéria. Esta investigação envolverá: sequenciamento completo do genoma de novas linhagens de X. fastidiosa, anotação e comparação de genomas completos já conhecidos, reconstrução da filogenia das linhagens de X. fastidiosa através de uma abordagem de filogenômica, sequenciamento do transcritoma de linhagens selecionadas crescidas em meio de cultivo que mimetiza o xilema, mapeamento dos transcritos no genoma, identificação de regiões regulatórias, identificação e caracterização funcional pequenos RNAs não-codificantes. Paralelamente, pretendemos investigar variações no perfil de expressão gênica de um hospedeiro vegetal (ex: plântula de laranja) ao longo da infecção com distintas linhagens isoladas de citros. Análises proteomicas e metabolomicas também serão realizadas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Paulo Adriano Zaini - Integrante / Andrea Cristina Fogaça - Integrante / Paulo Marques Pierry - Integrante / João C. Setubal - Integrante / Steve E Lindow - Integrante / Michael Ionescu - Integrante / Joaquim Martins-Junior - Integrante / Oseias Feitosa Junior - Integrante / Ana Paula Silva de Souza - Integrante / Guillermo Uceda Campos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Universidade de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 6

  • 2011 - Atual

    Estudos de metagenômica da comunidade microbiana da compostagem do Zoológico de São Paulo, Descrição: Este projeto visa o estudo da diversidade microbiana envolvida na degradação de biomassa durante o processo de compostagem. Através de um projeto colaborativo com a Fundação Parque Zoológico de São Paulo e a UNIFESP, estamos gerando dados metagenômicos de amostras coletadas da unidade de compostagem instalada no Parque Zoológico de São Paulo. Nossos objetivos são investigar bactérias cultiváveis e não-cultiváveis nestas comunidades microbianas complexas e buscar, nestes metagenomas, por novas enzimas com potencial para aplicação industrial.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Layla Farage Martins - Integrante / Julio C. F. de Oliveira - Integrante / João C. Setubal - Coordenador / Luciana Antunes Principal - Integrante / Luiz Juliano Neto - Integrante / João Batista da Cruz - Integrante / Luciano A. Digiampietri - Integrante / Cristina Viana-Niero - Integrante / Renata C. Pascon - Integrante / Deibs Barbosa - Integrante / Karen Cristina Lombardi - Integrante / QUAGGIO, RONALDO B. - Integrante / Roberta Verciano Pereira - Integrante / Italo Sudré Pereira - Integrante / Suzana Eiko Sato Guima - Integrante / Remigio Cenepo Escobar Rodrigues - Integrante / Raquel Riyuzo de Almeida Franco - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 7 / Número de orientações: 7

  • 2009 - 2012

    Estabelecimento de um laboratório de Microbiologia Aplicada no Zoológico de São Paulo: Identificação e isolamento de microrganismos que produzam enzimas e seus inibidores de aplicação nas áreas médica, veterinária e industrial, Descrição: A Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP) possui uma unidade de produção de composto orgânico (UPCO) que aproveita a matéria orgânica de várias origens como: excremento de aproximadamente 3.500 animais, oriundos de varias partes do mundo, carcaças, sedimentos e coluna de água do lago, restos de cama de animais, resíduos de poda dos jardins do Parque, restos vegetais da Mata Atlântica e resíduos alimentares. O composto final, cerca de 600 toneladas/ano é utilizado como fertilizante orgânico na fazenda do Zoológico, para produção de cerca de 70% dos alimentos consumidos pelos animais do Parque, fechando assim um ciclo virtuoso de sustentabilidade. Além disso, a compostagem evita que a matéria orgânica seja depositada em aterros sanitários, aumentando o volume de lixo. A riqueza microbiológica deste material é incalculável, visto que ali poderão ser encontradas inúmeras espécies que ainda não foram descritas e/ou cultivadas. Baseado nisso, foi estabelecida uma parceria entre a UNIFESP e FPZSP para nuclear um programa de microbiologia aplicada com o objetivo de prospectar esta diversidade microbiana e aplicá-la em processos biotecnológicos. O objetivo geral deste projeto é isolar conhecer, preservar e caracterizar microrganismos da compostagem e das águas do parque. Nossos dados preliminares demonstram que os métodos tradicionais de isolamento e preservação podem ser utilizados na prospecção dos microrganismos cultiváveis da compostagem, no entanto, estima-se que a maior parte dos microrganismos que habitam este material não seja passível de cultivo. Os microrganismos isolados serão identificados por espectrometria de massa (MALDI/TOF-MS), uma metodologia que está sendo implementada no laboratório de Biofísica do INFAR/UNIFESP. As identificações serão validadas pelo sequenciamento da subunidade menor do ribossomo (SSU rDNA). Os microrganismos isolados da compostagem serão testados para produção de enzimas de grande interesse industrial, como as celulases, xilanas. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Integrante / Layla Farage Martins - Integrante / Julio C. F. de Oliveira - Integrante / João C. Setubal - Integrante / Luciana Antunes Principal - Integrante / Luiz Juliano Neto - Coordenador / João Batista da Cruz - Integrante / Marcelo Vallim - Integrante / Cristina Viana-Niero - Integrante / Renata C. Pascon - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 1

  • 2008 - Atual

    Identificação e análise funcional de genes associados à adaptação, evolução e virulência de Xylella fastidiosa, Descrição: Xylella fastidiosa é uma bactéria que coloniza o xilema de uma diversidade de plantas cultivadas e silvestres em várias partes do mundo, sendo o agente causador de uma série de doenças em plantas economicamente importantes como citros, videiras e café. Diferentes cepas ou patovares de X. fastidiosa foram identificados, sendo que destes, quatro já tiveram seus genomas completa ou parcialmente elucidados: (i) X. fastidiosa cepa 9a5c, isolada de citros e agente etiológico da Clorose Variegada dos Citros; (ii) X. fastidiosa cepa Temecula-1, isolada de videiras e agente etiológico da doença de Pierce; (iii) X. fastidiosa pv. almond cepa Dixon, agente causal da escaldadura da amendoeira e (iv) X. fastidiosa pv. oleander cepa Ann-1 agente causal escaldadura da espirradeira. Desde o seqüenciamento completo destes genomas, muito se avançou na compreensão de processos envolvidos na colonização dos hospedeiros de X. fastidiosa, seja ele planta ou inseto vetor, e alguns dos mecanismos de virulência foram elucidados. Entretanto, presume-se a existência de mecanismos e fatores adicionais importantes para colonização de plantas e insetos por este fitopatógeno. É importante ressaltar que hoje se verifica a ausência da estirpe 9a5c nos pomares citrícolas com CVC em São Paulo em detrimento de outras estirpes virulentas, mesmo que em condições experimentais a cepa 9a5c ainda se mantenha virulenta. Aparentemente esta cepa está geneticamente mais relacionada a estirpes de café e a um isolado de citros da Argentina do que a outros isolados hoje encontrados nos pomares de citros de São Paulo. Portanto, a origem da X. fastidiosa da CVC ainda é controversa. Assim, neste projeto temos como objetivo a identificação de novos genes potencialmente associados aos aspectos evolutivos e de adaptação e virulência de X. fastidiosa. Para tal será realizado o seqüenciamento completo do genoma de quatro cepas de X. fastidiosa (3 de citros e 1 de cafeeiro), suas anotações e comparação com genomas já conh. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Sergio Verjovski-Almeida - Integrante / Paulo Marques Pierry - Integrante / Wesley Oliveira Santana - Integrante / Alessandra Alves de Souza - Integrante / Helvécio Della Coletta Filho - Integrante / Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos - Integrante / Marcos Antonio Machado - Integrante / João Paulo Kitajima - Integrante / Paulo Adriano Zaini - Integrante / Joaquim Martins-Junior - Integrante / Luiz Gonzaga - Integrante / Rodrigo R.P. de Almeida - Integrante / Gustavo Antonio Teixeira Chaves - Integrante / Rodrigo Roberto Rafagnin Duarte - Integrante / Fernando Domingues Kümmel Tria - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 6 / Número de orientações: 5

  • 2004 - 2013

    Análise do transcritoma e caracterização molecular dos componentes responsáveis pela patogenicidade de Xylella fastidiosa, Descrição: O objetivo principal deste projeto é a identificação e caracterização funcional de genes de Xylella fastidiosa com expressão regulada por ferro ou por concentrações subinibitórias de agentes antimicrobianos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Paulo Adriano Zaini - Integrante / Andrea Cristina Fogaça - Integrante / Patrícia Isabela Pessoa da Silva - Integrante / Gustavo Antonio Teixeira Chaves - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 9 / Número de orientações: 7

  • 2003 - 2013

    Estrutura e função de serina/treonina fosfatases na ameba social Dictyostelium discoideum, Descrição: As serina/treonina fosfatases (PPs) são enzimas que catalisam a desfosforilação específica de resíduos de fosfoserina e fosfotreonina. Considerando-se especialmente a identidade entre as sequências de aminoácidos de suas subunidades ou domínios catalíticos, as PPs foram agrupadas em duas famílias: PPP (PhosPhoprotein Phosphatase) e PPM (Phosphoprotein Phosphatase Magnesium-dependent). A família PPP compreende enzimas classificadas em cinco subfamílias denominadas PP1, PP2A, PP2B, PP5 e PP7 enquanto a família PPM engloba enzimas denominadas PP2C. Algumas subfamílias das PPPs compreendem holoenzimas onde uma subunidade catalítica interage com uma ou mais subunidades reguladoras variáveis, o que confere uma extraordinária diversidade funcional às serina/treonina fosfatases. Nos últimos anos nosso grupo tem investigado os papéis desempenhados pelas serina/treonina fosfatases nas vias de sinalização envolvidas no crescimento e desenvolvimento de D. discoideum, um microorganismo eucariótico que tem sido utilizado há mais de 50 anos como sistema experimental em estudos de diversos processos celulares. Estudos recentes que realizamos resultaram na identificação de algumas proteínas que interagem e possivelmente modulam a atividade da PP1 de D. discoideum (DdPP1c). Para estes estudos foram utilizadas tanto buscas por similaridades na sequência genômica deste microorganismo como ensaios utilizando o sistema de duplo-híbrido em leveduras, utilizando-se a DdPP1c como isca. Com essa abordagem, foram selecionados clones de cDNA que codificam proteínas (presas) que interagiram com a DdPP1c. Dando continuidade a estes estudos, propomos, nesse projeto, aprofundar a caracterização funcional de duas novas proteínas que potencialmente interagem com a DdPP1c as quais foram selecionadas após os ensaios confirmatórios de sua interação com a DdPP1c.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (3) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Leonardo Costa Fiorini - Integrante / Luiz Paulo M. Andrioli - Integrante / Daniela Beton - Integrante / Juliana Moreira Sousa - Integrante / Renato Astolfi Raposo - Integrante / Daniela Carvalho Gonzalez-Kristeller - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 10 / Número de orientações: 7

  • 2003 - 2008

    Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA, Descrição: Projeto Temático - FAPESP- (02/13283-6). 06/2004-06/2008. Sergio Verjovski-Almeida (Coordenador), Aline M. da Silva, Eduardo Moraes Reis, L.H. Câmara Lopes, Fernando Ferreira Costa. Projeto: Identificação de marcadores moleculares para diagnóstico e prognóstico em câncer utilizando microarrays de DNA.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Coordenador / Ana Carolina Quirino Simões - Integrante / Katia R Leite - Integrante / Luiz H Camara Lopes - Integrante / Eduardo Moraes Reis - Integrante / Fernando Costa - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 8 / Número de orientações: 2

  • 2001 - 2005

    Cooperação para análise de expressão gênica (CAGE), Descrição: Projeto Temático - FAPESP (99/07390-0) - 2001-2005. Hugo A. Armelin (Coordenador), Suely L. Gomes, Sergio Verjovski-Almeida, Aline M. da Silva, Glaucia M. Souza, Mari C. Sogayar, Hamza El-Dorry, Ana Claudia R. da Silva, Bianca Zingales, Eduardo J. Neves e Junior Barreira. Projeto: Cooperação para análise de expressão gênica (CAGE)/Implantação da tecnologia de microarrays de DN no IQ-USP.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (5) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Suely Lopes Gomes - Integrante / Sergio Verjovski-Almeida - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Integrante / Ana Claudia Rasera da Silva - Integrante / Hamza F. El-Dorry - Integrante / Mari C Sogayar - Integrante / Hugo Aguirre Armelin - Coordenador / Bianca Zingales - Integrante / Eduardo Jordão Neves - Integrante / Junior Barreira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

  • 2001 - 2004

    Data mining no Projeto Genoma Cana-de-açúcar, Descrição: Auxílio à Pesquisa - FAPESP (00/07425-7) - 2000-2004. Gláucia M. Souza (Coordenadora) e Aline M. da Silva. Projeto: Data mining no Projeto Genoma Cana-de-açúcar.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Leonardo Costa Fiorini - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Coordenador / Ana Carolina Quirino Simões - Integrante / Milton Yutaka Nishiyama-Junior - Integrante / Flavia Papini-Terzi - Integrante / Flavia R. Rocha - Integrante / Katia Cristina P Oliveira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

  • 2000 - 2002

    Laboratório Associado de Bioinformática - Projeto Genoma Humano do Câncer, Descrição: Auxílio à Pesquisa FAPESP (99/03653-6). 2000-2002. Laboratório Associado de Bioinformática - Projeto Genoma Humano do Câncer. Responsáveis: Aline M. da Silva e Sergio Verjovski-Almeida.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Sergio Verjovski-Almeida - Integrante / Eduardo Moraes Reis - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

  • 1999 - 2002

    Laboratórios de Sequenciamento - Projeto Genoma cana-de-açúcar, Descrição: Auxílio à Pesquisa FAPESP (99/02878-4). 1999-2002. Laboratórios de Sequenciamento - Projeto Genoma cana-de-açúcar. Responsáveis: Suely L. Gomes e Aline M. da Silva.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Suely Lopes Gomes - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 1

  • 1997 - 2001

    Laboratórios de Sequenciamento - Projeto Genoma Xylella fastidiosa, Descrição: Auxílio à Pesquisa FAPESP (97/13479-8). 1997-2001. Laboratórios de Sequenciamento - Projeto Genoma Xylella fastidiosa. Responsáveis: Suely L. Gomes, Aline M. da Silva e Marilis V. Marques.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Suely Lopes Gomes - Coordenador / Marilis do Valle Marques - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 2

  • 1996 - 1999

    Proteínas Fosfatases de Dictyostelium discoideum e Neurospora crassa: Caracterização Bioquímica, Funcional e Clonagem de seus Genes, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Hector F. Terenzi - Integrante / Lilian C. Etchebehere - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 2

  • 1995 - 1998

    Fosforilação reversível em eucariotos unicelulares: aspectos regulatórios e funcionais, Descrição: Projeto PADCT II/ SBIO/CNPq. Fosforilação reversível em eucariotos unicelulares: aspectos regulatórios e funcionais. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Hector F. Terenzi - Integrante / Lilian C. Etchebehere - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 4 / Número de orientações: 3

  • 1993 - 1995

    Biologia do desenvolvimento de microrganismos: aspectos celulares e moleculares, Descrição: Auxílio Integrado de Pesquisa CNPq Biologia do desenvolvimento de microrganismos: aspectos celulares e moleculares. Responsáveis: José Carlos da Costa Maia (coordenador) e Aline Maria da Silva.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / José Carlos da Costa Maia - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 1991 - 1998

    Estudos dos mecanismos de adesão celular e do sinal para adição de âncoras glicolipídicas em Dictyostelium discoideum, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Claudette klein - Integrante / Mara Lucia Z Silvestri - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3 / Número de orientações: 3

  • 1991 - 1995

    Biologia do desenvolvimento de microrganismos: aspectos celulares e moleculares, Descrição: Projeto temático de equipe FAPESP (90/3875-4). Biologia do desenvolvimento de microrganismos: aspectos celulares e moleculares. Responsáveis: José Carlos C. Maia (Coordenador), Héctor F. Terenzi, Suely L. Gomes e Aline Maria da Silva.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / Suely Lopes Gomes - Integrante / Hector F. Terenzi - Integrante / José Carlos da Costa Maia - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 2

  • 1990 - 1991

    Aproveitamento biotecnológico de placentas humanas. Purificação de Fosfatase alcalina placentária, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Coordenador / Joaquim Cabrera-Crespo - Integrante / Isaias Raw - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

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Projetos de desenvolvimento

  • 2018 - Atual

    Caracterização do microbioma de solos, rizosfera e plantas de soja e milho em regiões de plantio dessas culturas, Projeto certificado pela empresa INDIGO BRAZIL AGRICULTURA LTDA. em 30/01/2019., Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / João C. Setubal - Coordenador / Maike Rossmann - Integrante.

  • 2018 - Atual

    Caracterização do microbioma de solos, rizosfera e plantas de soja e milho em regiões de plantio dessas culturas, Projeto certificado pela empresa INDIGO BRAZIL AGRICULTURA LTDA. em 30/01/2019., Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / João C. Setubal - Coordenador / Maike Rossmann - Integrante.

  • 2018 - Atual

    Caracterização do microbioma de solos, rizosfera e plantas de soja e milho em regiões de plantio dessas culturas, Projeto certificado pela empresa INDIGO BRAZIL AGRICULTURA LTDA. em 30/01/2019., Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Aline Maria da Silva - Integrante / João C. Setubal - Coordenador / Maike Rossmann - Integrante.

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Prêmios

2000

Medalha do Mérito Científico, Governo do Estado de São Paulo.

2000

Medalha pela participação no Projeto de Sequenciamento do Genoma da bactéria Xylella fastidiosa., Reitoria da Universidade de São Paulo.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade de São Paulo, Instituto de Química, Departamento de Bioquímica. , Av. Prof.Lineu Prestes 748, Butantan, 05508000 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30912182, Fax: (11) 30912186, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2008 - Atual

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: PROFESSOR TITULAR MS-6, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2000 - 2008

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: PROFESSOR ASSOCIADO MS-5, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 1991 - 2000

    Universidade de São Paulo

    Vínculo: , Enquadramento Funcional: PROFESSOR DOUTOR MS-3, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 02/2018

      Conselhos, Comissões e Consultoria, USP, .,Cargo ou função, Membro titular da Comissão de Pós-Graduação do Programa Interunidades de Bioinformática da USP.

    • 02/2018

      Conselhos, Comissões e Consultoria, USP, .,Cargo ou função, Representante (Suplente) da Congregação do IQ-USP no Conselho Universitário da USP.

    • 01/2013

      Ensino, Química Com Ênfase em Bioquímica e Biologia Molecular, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica Experimental Avançada

    • 01/2010

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Química, Departamento de Bioquímica.,Linhas de pesquisa

    • 03/2000

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro titular do Conselho do Departamento de Bioquimica.

    • 01/1997

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Química, Departamento de Bioquímica.,Linhas de pesquisa

    • 01/1991

      Ensino, Farmacia e Bioquimica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular do Gene

    • 01/1991

      Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Química, .,Linhas de pesquisa

    • 05/2016 - 04/2018

      Direção e administração, Instituto de Química, Departamento de Bioquímica.,Cargo ou função, Vice-chefe do Departamento de Bioquimica.

    • 08/2012 - 12/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Conselho Deliberativo do Núcleo de Apoio à Pesquisa em Biologia Computacional e Genômica (NUBIC).

    • 05/2015 - 04/2017

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Ética e Direitos Humanos do IQ-USP.

    • 05/2014 - 04/2016

      Direção e administração, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Chefe Suplente do Departamento de Bioquímica.

    • 05/2009 - 05/2015

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro (Suplente) da Comissão Coordenadora do Programa de Ciências Biológicas (Bioquímica).

    • 01/2013

      Ensino, Ciências Biológicas (Bioquímica), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Metodologias em Bioquímica e Biologia Molecular - Conceitos e Aplicações

    • 02/2009 - 07/2012

      Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular do Gene

    • 10/2010 - 04/2011

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro titular da Comissão de Pesquisa do IQUSP.

    • 05/2007 - 04/2010

      Direção e administração, Pró-Reitoria de Pós-Graduação - USP, .,Cargo ou função, Assessora da Pró-Reitoria de Pós-Graduação.

    • 04/2006 - 04/2010

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Pró-Reitoria de Pós-Graduação - USP, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Avaliação da Pós-Graduação da USP.

    • 01/2003

      Ensino, Bioinformatica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Fundamentos Básicos em Bioquímica e Biologia Molecular

    • 01/1991

      Ensino, Bioquímica, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, A gênese da Descoberta, Biologia Molecular do Gene, Significado Biológico das Modificações Co-Tradução e Pós-Tradução de Proteínas

    • 05/2006 - 07/2007

      Direção e administração, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Vice-Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Bioquímica.

    • 05/2005 - 05/2007

      Direção e administração, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Presidente da Comissão de Pós-Graduação do IQUSP.

    • 05/2005 - 05/2007

      Direção e administração, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Coordenadora da Comissão do Programa de Aperfeiçoamento de Ensino (PAE).

    • 09/2003 - 05/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Universidade de São Paulo, .,Cargo ou função, Membro titular da Congregação do IQUSP.

    • 03/2002 - 05/2007

      Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Membro titular da Comissão de Pós-Graduação.

    • 01/2004

      Ensino, Medicina Veterinária, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica: Estrutura de Biomoléculas e Metabolismo

    • 03/2002 - 05/2006

      Direção e administração, Instituto de Química, .,Cargo ou função, Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Bioquimica.

    • 01/2001

      Ensino, Ciências Biológicas (Bioquímica), Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Bioinformática

    • 01/1994

      Ensino, Medicina Veterinária, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular do Gene

  • 2011 - 2011

    University of California at Berkeley, Berkeley

    Vínculo: Pesquisador visitante, Enquadramento Funcional: Bolsista pesquisador senior/ FAPESP, Carga horária: 40

    Outras informações:
    Pesquisador visitante no laboratório do Prof. Steve E. Lindow com bolsa da FAPESP.

    Atividades

    • 04/2011 - 10/2011

      Estágios , Department of Plant and Microbial Biology, .,Estágio realizado, Aspectos moleculares da interação de Xylella fastidiosa com seus hospedeiros vegetais.

  • 1987 - 1990

    Instituto Butantan

    Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Pesquisador Científico, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2015 - Atual

    Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular

    Vínculo: Primeira Tesoureira, Enquadramento Funcional: Membro da Diretoria da SBBq, Carga horária: 1

    Outras informações:
    Primeira Tesoureira