Bruno Cesar Feltes

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade de Caxias do Sul (2011), mestrado em Biologia Celular e Molecular pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2013) e doutorado em Biologia Celular e Molecular pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (2017). Tem experiência na área de Bioinformática, atuando principalmente nos seguintes temas: Biologia de Sistemas, Dinâmica Molecular, Análises Transcritômicas de Microarranjo e RNAseq, Neurodesenvolvimento, Biologia do Desenvolvimento, Toxicologia, Reparo de DNA e Mecanismos de Envelhecimento.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biologia Celular e Molecular

2013 - 2017

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Estudo conformacional do complexo proteico DDB2-DDB1 e diferentes variantes mutantes na doença Xeroderma Pigmentosum
Diego Bonatto. Coorientador: Hugo Verli. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Biologia de Sistemas; Biologia Estrutural; Xeroderma Pigmentosa; Dinâmica Molecular; Reparo de DNA.

Mestrado em Biologia Celular e Molecular

2012 - 2013

Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Estudo da atuação de substâncias de abuso no desenvolvimento embrionário por meio da quimio-biologia de sistemas,Ano de Obtenção: 2013
Diego Bonatto.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Biologia de Sistemas; Farmacologia de Sistemas; Nicotina; Etanol; Neurodesenvolvimento; Síndrome Alcoólica Fetal.

Graduação em Ciências Biológicas

2007 - 2011

Universidade de Caxias do Sul
Título: Influência da nicotina na diferenciação celular durante o desenvolvimento embrionário
Orientador: Daniel Luis Notari
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

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Pós-doutorado

2017

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biologia de Sistemas. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Análises Transcriptômicas.

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Formação complementar

2014 - 2014

Introduction to Transcriptional Network Analysis. (Carga horária: 15h). , Universidade Federal do Rio Grande do Sul, UFRGS, Brasil.

2011 - 2011

Controle da expressão gênica por micro RNA. (Carga horária: 2h). , Mutagen - Brasil, MUTAGEN, Brasil.

2009 - 2009

Extensão universitária em Ornitologia no RS. (Carga horária: 8h). , Universidade de Caxias do Sul, UCS, Brasil.

2009 - 2009

Epigenética e Mutagênese. (Carga horária: 4h). , Mutagen - Brasil, MUTAGEN, Brasil.

2009 - 2009

Epigenetics and cancer. (Carga horária: 3h). , 55º Congresso Brasileiro de Genética, SBG, Brasil.

2009 - 2009

Reparo de DNA: Mecanismos e formas de estudo. (Carga horária: 4h). , Mutagen - Brasil, MUTAGEN, Brasil.

2008 - 2008

Extensão universitária em Biomonitoramento da Poluição do Ar. (Carga horária: 10h). , Universidade de Caxias do Sul, UCS, Brasil.

2008 - 2008

Extensão universitária em Aves de rapina Diurnas. (Carga horária: 72h). , Universidade de Caxias do Sul, UCS, Brasil.

2008 - 2008

Col. Científicas e Prática em Taxidermia de Aves. (Carga horária: 20h). , Universidade de Caxias do Sul, UCS, Brasil.

2008 - 2008

Observação de Baleias Francas. (Carga horária: 4h). , Instituto Baleia Franca, IBF, Brasil.

2008 - 2008

Biologia Molecular na Microbiologia Clínica. (Carga horária: 4h). , 1º Simpósio Internacional de Microbiologia Clínica, SBM, Brasil.

2008 - 2008

Usando Pocessando materiais clínicos sem erros. (Carga horária: 4h). , 1º Simpósio Internacional de Microbiologia Clínica, SBM, Brasil.

2007 - 2007

Extensão universitária em A Vida Marinha em Nossas Praias. (Carga horária: 20h). , Universidade de Caxias do Sul, UCS, Brasil.

2007 - 2007

Extensão universitária em A Atuação do Biólogo no Licenciamento Ambiental. , Universidade de Caxias do Sul, UCS, Brasil.

2007 - 2007

Tecnologia do DNA Recombinante e suas Aplicações. (Carga horária: 6h). , XVI Simpósio Nacional de Bioprocessos, SINAFERM, Brasil.

2002 - 2002

IPD - Windows - Word - Exel - Internet. (Carga horária: 50h). , Graphics - Assessoria e Treinamento em Informática, GRAPHICS, Brasil.

2002 - 2002

CorelDraw - PageMaker - PhotoShop. (Carga horária: 65h). , Graphics - Assessoria e Treinamento em Informática, GRAPHICS, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Alemão

Compreende Pouco, Fala Pouco, Lê Pouco, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia do Desenvolvimento.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia do Câncer.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Toxicologia.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Estrutural.

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Organização de eventos

FELTES, B. C. . 8º Edição do Curso de Férias "ALIMENTOS, O que você gostaria de saber a ciência pode explicar". 2012. (Outro).

FELTES, B. C. . Semana Acadêmica de Biologia - A Evolução da Consciência a Favor do Meio Ambiente. 2010. (Outro).

FELTES, B. C. . Semana Acadêmica de Biologia - "Uma Mente que se Abre a uma Nova Idéia Nunca Volta ao Seu tamanho Original". 2010. (Outro).

FELTES, B. C. . Curso prático e teórico Introdução à Primatologia. 2009. (Outro).

FELTES, B. C. . IV Simpósio Internacional sobre Cogumelos no Brasil (SICOG) e III Simpósio Nacional sobre Cogumelos Comestíveis. 2008. (Congresso).

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Participação em eventos

4th International Conference of Integrative Biology. Conformational strudy of a mutated protein complex in Xeroderma Pigmentosum disease using molecular dynamics and residue interaction networks. 2016. (Congresso).

Saúde em Debate: Métodos Atuais de Biologia Molecular.Saúde em Debate: Métodos Atuais de Biologia Molecular. 2014. (Seminário).

X Congresso Brasileiro da Sociedade Brasileira de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental. Inhibitory Effect of Nicotine in the Retinoic Acid Signalization and Bone Development During Embryogenesis. 2011. (Congresso).

International Society for Computational Biology Latin America Conference. Developmental aging in mammals: a systems biology analysis of epigenetic, developmet and senescence mechanisms. 2010. (Congresso).

XVIII Encontro de Jovens Pesquisadores da UCS.Atuação da Proteína p53 em Resposta a Danos de DNA Induzidos por Espécies Reativas de Oxigênio no Desenvolvimento Embrionário. 2010. (Encontro).

XXII Salão de Iniciação Científica.Efeito modulatório da nicotina na diferenciação celular durante o desenvolvimento embrionário. 2010. (Encontro).

55º Congresso Brasileiro de Genética. Epigenetic modulation of embryonic development in Homo sapiens, Mus musculus and Gallus gallus as observed by the systems biology. 2009. (Congresso).

IX Congresso da Sociedade Brasileira de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental. Epigenetic Modulation of Embryonic Development and Senescence in Homo sapiens, Mus musculus and Gallus gallus as observed by the Systems Biology. 2009. (Congresso).

XVII Encontro de Jovens Pesquisadores da UCS..Modulação epigenética do desenvolvimento embrionário em Homo sapiens, Mus musculus e Gallus gallus como observado pela biologia de sistemas.. 2009. (Encontro).

XXI Salão de Iniciação Científica.Modulação Epigenética do Desenvolvimento Embrionário em Homo sapiens, Mus musculus e Gallus gallus Como Observado Pela Biologia de Sistemas. 2009. (Encontro).

1º Simpósio Internacional de Microbiologia Clínica. 2008. (Simpósio).

IV Simpósio Internacional sobre Cogumelos no Brasil e III Simpósio Nacional sobre Cogumelos Comestíveis. 2008. (Simpósio).

Semana Acadêmica de Biologia - O meio ambiente começa no meio da gente. 2008. (Encontro).

XVI encontro de Jovens Pesquisadores da UCS.Obtenção de recombinantes entre mutantes de penicillium echinulatum para produção de celulase por fusão de protoplastos. 2008. (Encontro).

XVI Simpósio Nacional de Bioprocessos (SINAFERM). 2007. (Simpósio).

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Participação em bancas

Aluno: Maiara Kolbe Musskopf

FELTES, B. C.; ANDREIS, F. C.. Filogenia de proteínas da subfamília DNAJ/HSP40 e estudo da organização dos membros das subclasses A, B e C. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia - Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Aluno: Alana Eduarda de Castro Panzenhagen

FELTES, B. C.BONATTO, D.. Metilmercúrio e neurodesenvolvimento: uma abordagem de biologia de sistemas. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

FELTES, B. C.. XXX Salão de Iniciação Científica da UFRGS. 2018. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

FELTES, B. C.. XXIX Salão de Iniciação Científica. 2017. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

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Comissão julgadora das bancas

Gunther Johannes Lewczuk Gerhardt

GERHARDT, G. J. L.; Bonatto, D.; Notari, D.L.. Influencia da Nicotina na Diferenciação Celular Durante o Desenvolvimento Embrionário. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biologia) - Universidade de Caxias do Sul.

Rodrigo Ligabue Braun

MENCK, C. F. M.; CHIES, J. A. B.;Ligabue-Braun, Rodrigo; FERREIRA, H. B.. Estudo conformacional do complexo proteico DDB2-DDB1 e suas diferentes variantes mutantes na doença Xeroderma Pigmentosum. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

JOSE CLAUDIO FONSECA MOREIRA

Moreira, José Cláudio Fonseca; Zaha, A.; Verli, H.. Estudo da atuação de pequenas moléculas durante o desenvolvimento embrionário por meio da quimio-biologia de sistemas.. 2013. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Charley Christian Staats

Staats, Charley C.; PASQUALI, G.; BONATTO, D.. Comparação transcripômica entre estágios da lactação de vacas Holstein produtivamente jovens e velhas. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

ARNALDO ZAHA

Moreira JC; Verli H;ZAHA, A.. Estudo da atuação de pequenas moléculas durante o desenvolvimento embrionário por meio da químio-biologia de sistemas. 2013. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Hugo Verli

VERLI, H.. Estudo da atuação de pequenas moléculas durante o desenvolvimento embrionário por meio da químio-biologia de sistemas. 2013. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

Daniel Luis Notari

NOTARI, D. L.BONATTO, D.; Gerhardt, G. J.. Influência da nicotina na diferenciação celular durante o desenvolvimento embrionário. 2011. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade de Caxias do Sul.

Rodrigo Juliani Siqueira Dalmolin

DALMOLIN RJS. Comparação transcriptomica entre duas raças de gado leiteiro para o estudo de biomarcadores de qualidade do leite. 2015.

José Artur Bogo Chies

CHIES, J. A. B.. Estudo conformacional do complexo proteico DDB2-DDB1 e suas diferentes variantes mutantes na doença Xeroderma pigmentosum. 2017. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

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Orientou

Itamar José Guimarães Nunes

A Definir; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Éderson Sales Moreira Pinto

A Definir; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; (Coorientador);

Thiago Corrêa

A Definir; Início: 2018; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Coorientador);

Itamar José Guimarães Nunes

GEAP: Uma Plataforma Flexivel e Intuitiva para Análise de Transcriptoma; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Biotecnologia - Bioinformática) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Bruno César Feltes;

Itamar José Guimarães Nunes

Accessing the impact of xpa-1 mutation in Caenorhabditis elegans through systems biology and transcriptomic approaches; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Biotecnologia) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Orientador: Bruno César Feltes;

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Foi orientado por

Diego Bonatto

Uso de centralidades para descoberta de novos fármacos para reprogramação celular; 2012; Dissertação (Mestrado em Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Diego Bonatto;

Diego Bonatto

Estudo conformacional do complexo proteico DDB2-DDB1 e suas diferentes variantes mutantes na doença Xeroderma Pigmentosum; 2017; Tese (Doutorado em Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Diego Bonatto;

Diego Bonatto

Influência da nicotina na diferenciação celular durante o desenvolvimento embrionário; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Faculdade de Ciências Biológicas) - Universidade de Caxias do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Diego Bonatto;

Hugo Verli

Caracterização de regiões de interação das proteínas da família Xeroderma Pigmentosa; 2017; Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Hugo Verli;

Marcio Dorn

Início: 2018; Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul;

Marcio Dorn

2018; Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul; Márcio Dorn;

Daniel Luis Notari

Influência da nicotina na diferenciação celular durante o desenvolvimento embrionário; 2011; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade de Caxias do Sul; Orientador: Daniel Luís Notari;

Mariana Roesch Ely

Caracterização dos mecanismos genéticos e fisiológicos da longevidade celular em Saccharomyces cerevisiae e Caenorhabditis elegans; 2011; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Caxias do Sul, UCS; Orientador: Mariana Roesch Ely;

Marli Camassola

Avaliação da termoestabilidade de xilanases de Penicillium echinulatum produzidas em cultivos em estado sólido e submerso; 2007; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade de Caxias do Sul; Orientador: Marli Camassola;

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Produções bibliográficas

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  • PAQUOLA, A. C. M. ; ASIF, H. ; PEREIRA, C. A. B. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. ; LIMA, W. C. ; MENCK, C. F. M. . Horizontal gene transfer building prokaryote genomes: genes related to exchange between cell and environment are frequently transferred. Journal of Molecular Evolution , v. 86, p. 1-14, 2018.

  • FELTES, B. C. ; PEDEBOS, C. ; BONATTO, D. ; VERLI, H. . Dynamics of DDB2-DDB1 complex under different naturally-occurring mutants in Xeroderma Pigmentosum disease. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS , v. 1862, p. 2579-2589, 2018.

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  • FELTES, B. C. ; POLONI, J. F. ; BONATTO, D. . Modulação Epigenética do Desenvolvimento Embrionário em Homo sapiens, Mus musculus e Gallus gallus como Observado pela Biologia de Sistemas. In: XVII Encontro de Jovens Pesquisadores, 2009, Caxias do Sul. XVII Encontro de Jovens Pesquisadores, 2009.

  • POLONI, J. F. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. . A Influência da Melatonina Materna no Ritmo Circadiano Fetal Durante o Desenvolvimento Embrionário de Diferentes Modelos de Vertebrados Por Meio de Análise de Biologia de Sistemas. In: XXI Salão de Iniciação Científica, 2009, Porto Alegre. XXI Salão de Iniciação Científica, 2009.

  • POLONI, J. F. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. . A Influência do Ritmo Circadiano no desenvolvimento Embrionário de Diferentes Modelos de Vertebrados por Meio de Análise de Biologia de Sistemas. In: XVII Encontro de Jovens Pesquisadores, 2009, Caxias do Sul. XVII Encontro de Jovens Pesquisadores, 2009.

  • POLONI, J. F. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. . A systems biology analysis of the major proteins associated to vasculogenesis and enzymatic antioxidant mechanisms during the embryonic development of H. sapiens and M. Musculus. In: IX Congresso da Sociedade Brasileira de Mutagênse, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental, 2009, Ouro Petro. Anais do IX Congresso da Sociedade Brasileira de Mutagênse, Carcinogênese e Teratogênese Ambienta, 2009.

  • CAMASSOLA, Marli ; FELTES, B. C. ; DILLON, A. . Avaliação de termoestabilidade de xilanases de Penicillium echinulatum em diferentes processos.. In: 5º Congresso Brasileiro de Micologia, 2007, Recife. 5º Congresso Brasileiro de Micologia. Recife: Editora Universitária da UFPE, 2007. v. 1. p. 231-231.

  • FELTES, B. C. . Bioinformática e suas diversas aplicações. 2018. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FELTES, B. C. . Conformational strudy of a mutated protein complex in Xeroderma Pigmentosum disease using molecular dynamiics and residue interaction networks. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • FELTES, B. C. . Efeitos Toxicológicos do Tabaco no Desenvolvimento Embrionário Humano. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • POLONI, J. F. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. . A influência da melatonina no desenvolvimento neural e na sinalização de cálcio durante a embriogênese. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • FELTES, B. C. ; POLONI, J. F. ; BONATTO, D. . Efeito modulatório da nicotina na diferenciação celular durante o desenvolvimento embrionário. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • FELTES, B. C. ; POLONI, J. F. ; BONATTO, D. . Atuação da Proteína p53 em Resposta a Danos de DNA Induzidos por Espécies Reativas de Oxigênio no Desenvolvimento Embrionário. 2010. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • FELTES, B. C. ; POLONI, J. F. ; BONATTO, D. . Modulação epigenética do desenvolvimento embrionário em Homo sapiens, Mus musculus e gallus gallus como observado pela biologia de sistemas.. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • POLONI, J. F. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. . A Influência do Ritmo Circadiano no desenvolvimento Embrionário de Diferentes Modelos de Vertebrados por Meio de Análise de Biologia de Sistemas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • FELTES, B. C. ; POLONI, J. F. ; BONATTO, D. . Modulação Epigenética do Desenvolvimento Embrionário em Homo sapiens, Mus musculus e Gallus gallus como Observado pela Biologia de Sistemas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • POLONI, J. F. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. . A Influência da Melatonina Materna no Ritmo Circadiano Fetal Durante o Desenvolvimento Embrionário de Diferentes Modelos de Vertebrados Por Meio de Análise de Biologia de Sistemas. 2009. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

  • FELTES, B. C. ; POLONI, J. F. ; BONATTO, D. . Epigenetic Modulation of Embryonic Development and Senescence in Homo sapiens, Mus musculus and Gallus gallus as observed by the Systems Biology. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • POLONI, J. F. ; FELTES, B. C. ; BONATTO, D. . A systems biology analysis of the major proteins associated to vasculogenesis and enzymatic antioxidant mechanisms during the embryonic development of H. sapiens and M. Musculus. 2009. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • FELTES, B. C. ; DILLON, A. ; POLONI, J. F. . Obtenção de recombinantes entre mutantes de penicillium echinulatum para a produção de celulases por fusão de protoplastos. 2008. (Apresentação de Trabalho/Comunicação).

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Outras produções

FELTES, B. C. . (Peer Review) PeerJ ISSN: 2376-5992. 2019.

FELTES, B. C. . (Peer Review) Briefings in Bioinformatics ISSN: 1467-5463/1477-4054. 2019.

FELTES, B. C. . (Peer Review) Briefings in Bioinformatics ISSN: 1467-5463/1477-4054. 2018.

FELTES, B. C. . (Peer Review) Briefings in Bioinformatics ISSN: 1467-5463/1477-4054. 2018.

FELTES, B. C. . (Peer Review) Frontiers in Microbiology ISSN: 1664-302X. 2018.

FELTES, B. C. . (Peer Review) Revista de Informática Teórica e Aplicada (RITA) ISSN: 21752745. 2018.

FELTES, B. C. . (Peer Review) Revista de Informática Teórica e Aplicada (RITA) ISSN: 21752745. 2017.

FELTES, B. C. ; CHAPOLA, H. . Introdução a Biologia de Sistemas e Análise de Redes. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

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Projetos de pesquisa

  • 2019 - Atual

    Atual Mesoscopic Molecular Dynamics Simulations: Development of Models and Computational Strategies for Complex Structural Bioinformatics Problems, Descrição: There is a wide range of unanswered scientific questions which cannot be answered neither by experiments nor by classical modeling and simulation approaches. One question is how to consider microscopic and macroscopic effects in one model. On the one hand, available microscopic approaches (Molecular Dynamics (MD) type) are precise but computational too complex for large or multi-scale problems. On the other hand, several macroscopic methods (Computational Fluid Dynamics (CFD) type) cannot show crucial microscopic effects. Therefore, a mesoscopic scale model is required that closes this gap. For such a Mesoscopic Molecular Dynamics (MMD) model, we propose to take advantage of the Lattice Boltzmann Method (LBM), a modern CFD method, and state-of-the-art MD methods in order to combine both. This MMD model resolves certain microscopic effects important for the considered macroscopic application. In this project, two complementary academic expert groups from Brazil and Germany join together in order to provide an interdisciplinary research and academic education in the fields of mathematics, computer science, biology, chemistry and engineering to PhD students as well as to researchers.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Integrante / Hugo Verli - Integrante / Márcio Dorn - Coordenador / Rodrigo Ligabue-Braun - Integrante / Pedro Henrique Narloch - Integrante / Leonardo de Lima Corrêa - Integrante / Marcelo Depólo Polêto - Integrante / Ana Lúcia Cetertich Bazzan - Integrante / Luciana S Buriol - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação.

  • 2018 - Atual

    Meta-heuristics and Machine Learning for Cancer Research: What Bioinformatics Can tell us about Ourselves?, Descrição: The increasing availability of genomic data, resulting from significant advances in sequencing techniques and large-scale expression analysis and the reduction of associated cost, have revolutionized medicine in the 21st Century. By enabling a better understanding of the genetic components of many diseases that represent significant public health problems, the perspective of integrating genomic data into clinical practice has propelled the area of Personalized Medicine. In this research proposal, we are interested in developing and applying meta-heuristics, machine learning methods and computational strategies to integrate, explore and analyze the omic data, in order to identify new biomarkers with diagnostic or prognostic value, and potential therapeutic targets. Through bioinformatics approaches and the union of the efforts of researchers with experience in Computer Science, Biological Sciences, Mathematics and Health Sciences, we intend to address research questions in this line related to cancer, focusing on the translational potential of the in silico findings. That is, it is intended through the execution of this project to generate scientific knowledge with potential clinical use, which can bring important benefits to healthcare actions and preventive activities in the Unified Health System (SUS) from Brazil, by improving the diagnostic process, prognosis and therapeutic planning for the patients affected by these pathologies. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (4) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Integrante / Joice de Faria Poloni - Integrante / Bruno Iochins Grisci - Integrante / Márcio Dorn - Coordenador / Rodrigo Ligabue-Braun - Integrante / Pedro Henrique Narloch - Integrante / Pablo Felipe Leonhart - Integrante / Leonardo de Lima Corrêa - Integrante.

  • 2017 - Atual

    Bioinformática aplicada à medicina personalizada: do diagnóstico ao tratamento de doenças, Descrição: Neste projeto de pesquisa estamos interessados em desenvolver e aplicar estratégias para integrar, explorar e analisar dados genômicos com o objetivo de identificar novos biomarcadores com valor diagnóstico ou prognóstico, e potenciais alvos terapêuticos. Através de abordagens de Bioinformática e da união de esforços de pesquisadores com formação e experiência em Ciências da Computação, Biológicas e da Saúde, pretendemos abordar questões de pesquisa nesta linha relacionadas a doenças cardiovasculares e câncer, com foco no potencial translacional dos achados in silico. Isto é, pretende-se através da realização deste projeto gerar conhecimento científico com potencial uso clínico, que possam trazer importantes benefícios às ações assistenciais e atividades preventivas no Sistema Único de Saúde (SUS) ao aprimorar o processo de diagnóstico, elaboração do prognóstico e planejamento terapêutico dos pacientes acometidos com estas patologias. Dentro desta temática, este projeto irá abordar, especificamente, as seguintes questões de pesquisa: i) detecção de diferenças moleculares entre hipertrofia cardíaca fisiológica e patológica com potencial aplicação terapêutica no tratamento da insuficiência cardíaca, ii) identificação de biomarcadores de doença aterosclerótica instável, iii) caracterização de alterações moleculares em tumores sólidos de mama, ovário e cólon em pacientes portadores de mutações germinativas em genes de predisposição ao câncer para investigação de biomarcadores de câncer hereditário, iv) avaliação da patogenicidade de variantes de significado incerto em genes de predisposição ao câncer. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Integrante / Guido Lenz - Integrante / Hugo Verli - Integrante / Bruno Iochins Grisci - Integrante / Márcio Dorn - Coordenador / Rodrigo Ligabue-Braun - Integrante / Pablo Felipe Leonhart - Integrante / Bruno Ferreira de Faria Alixandre - Integrante / Mathias J. Krause - Integrante.

  • 2013 - 2017

    Estudo conformacional do complexo proteico DDB2-DDB1 e diferentes variantes mutantes na doença Xeroderma Pigmentosum, Descrição: Xeroderma Pigmentosa (XP) é uma doença autossômica recessiva que atinge uma a cada 250.000 pessoas, onde menos de 40% dessas chegam aos 20 anos de idade. Essa doença é caracterizada por uma hipermelanização da pele, perda de audição e cegueira somadas à alta incidência de cânceres de pele. Neste sentido a XP é causada por uma mutação nos genes Xeroderma pigmentosum, complementation group (XPs), cujos produtos possuem função reduzida ou ausente. São conhecidas sete variantes do gene XP (XPA a XPG), cujos produtos são responsáveis pela via de reparo por excisão de nucleotídeos (nucleotide excision repair - NER). Desta forma, essas proteínas atuam na remoção de dímeros de pirimidinas e 6,4-fotoprodutos no DNA originados pela exposição do DNA à luz ultravioleta (UV), sendo também essenciais para corrigir erros oriundos do processo replicativo. Atualmente a Xeroderma Pigmentosa não possui cura. Uma ampla gama de mutações foram descobertas por serem responsáveis pelo desenvolvimento da doença, contudo, como elas afetam as proteínas XP ainda é desconhecido. Neste sentido, uma das proteínas XP, a proteína DDB2, é responsável pelo reconhecimento do dano ao DNA, em um dos primeiros passos da via de NER. Da mesma forma, a proteína DDB2 não consegue reconhecer o dano sem estar complexada com a a proteína DDB1, a qual é necessária no ancoramento de DDB2 ao DNA. Tendo em vista que não há, atualmente, trabalhos que mostrem o comportamento molecular a nível de estrutura de nenhuma XP, incluindo DDB2, o objetivo deste projeto e estudar, através de dinâmica molecular e redes dinâmicas de interação entre resíduos, como três das quatro variantes mutantes que causam Xeroderma Pigmentosum tipo E, aferam tanto DDB2 quanto o complexo DDB2-DDB1. Este é o primeiro trabalho que pretende estudar o comportamento deste complexo a nível estrutural, assim como caracterizar as conformações de DDB2 e suas variantes mutantes.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Coordenador / Diego Bonatto - Integrante / Conrado Pedebos - Integrante / Hugo Verli - Integrante.

  • 2012 - 2013

    Estudo da atuação de substâncias de abuso no desenvolvimento embrionário por meio da quimio-biologia de sistemas, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Diego Bonatto em 04/11/2012., Descrição: Muitos caminhos bioquímicos e interações moleculares ainda são pouco conhecidos para as ciências biomédicas, dentre elas a ação de pequenos compostos tóxicos no desenvolvimento embrionário de diferentes modelos biológicos. Neste sentido, dois cenários críticos, de amplo interesse clínico e de impacto social, se destacam: o abuso de tabaco e de bebidas alcoólicas. Sabe-se que os derivados químicos do tabaco e do etanol são capazes de alterar o funcionamento de diferentes vias bioquímicas, levando a modificações. Por exemplo, crianças nascidas de mulheres fumantes expostas ou usuárias de tabaco mostram inúmeras alterações morfológicas e funcionais em diferentes tecidos do seu organismo. Da mesma forma, o abuso de álcool durante a gravidez é responsável por danos ao tecido neural do feto que, ao nascer, apresenta problemas cognitivos, motores e de aprendizado que se agravam ao longo da vida. Esse quadro patológico é chamado de Síndrome Alcoólica Fetal (SAF). Infelizmente, devido à complexidade inerente dos sistemas bioquímicos, os mecanismos moleculares subjacentes a ambos cenários são escassos. Assim, essa dissertação de mestrado visa aplicar diversas ferramentas de químio-biologia de sistemas para elucidar os possíveis alvos e caminhos moleculares relacionados às anomalias geradas pelo abuso de tabaco e à SAF. Para tanto, análises topológicas globais e locais de redes de interação foram empregadas juntamente com informações transcritômicas para ambas as condições de uso de tabaco e de etanol em modelo humano e murino (Mus musculus), visando estudar como as substâncias de abuso afetam o desenvolvimento embrionário.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Coordenador / Joice de Faria Poloni - Integrante / Diego Bonatto - Integrante / Itamar José Guimarães Nunes - Integrante.

  • 2009 - 2011

    Modulação Epigenética do Desenvolvimento Embrionário em Homo sapiens, Mus musculus e Gallus gallus como Observado pela Biologia de Sistemas, Descrição: Os efeitos epigenéticos são parte dos mecanismos relacionados com o desenvolvimento embrionário e a senescência em diferentes tipos celulares. Estes efeitos incluem a metilação do DNA, a metilação de histonas, a reposição de nucleossomas, a remodelagem dos níveis de organização superiores da cromatina, o silenciamento de porções gênicas, além de estar associado à estabilidade genômica. Dentre as principais proteínas da metilação de DNA podemos citar DNMT1, DNMT3A e DNMT3B. Estudos recentes sugerem que a regulação epigenética em células-tronco embrionárias é um dos fatores essenciais para a diferenciação tecidual e formação de padrões corporais. Neste sentido, os genes HOX compreendem uma família multigênica que controla o desenvolvimento embrionário em metazoários. A propriedade mais fascinante dos genes HOX é a conservação evolutiva entre a ordem dos genes nos clusters e a forma como os genes são expressos de acordo com o tempo e o espaço ao longo da formação do eixo embriônico antero-posterior. Para avaliar as relações entre as proteínas do mecanismo epigenético e HOX será desenvolvido um estudo usando ferramentas de biologia de sistemas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Coordenador / Joice de Faria Poloni - Integrante / Diego Bonatto - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

  • 2007 - 2009

    Obtenção de recombinantes entre mutantes de Penicillium echinulatum para produção de celulases por fusão de protoplastos, Descrição: Atualmente vários milhões de dólares estão sendo investidos no desenvolvimento de sistemas enzimáticos capazes de hidrolisar a celulose visando a obtenção do etanol de segunda geração. Entre os microrganismos que secretam celulases com capacidade de hidrolisar eficientemente a celulose encontra-se a linhagem mutante de Penicillium echinulatum 9A02S1. Esta linhagem é alvo de um programa de melhoramento por mutagênese e seleção visando aumentar ainda a produção de celulases. A fusão de protoplastos ao permitir o desenvolvimento do ciclo parassexual, pode constituir-se também em uma alternativa de melhoramento genético em fungos deuteromicetos. Nesta técnica é possível recombinar genes pertencentes a linhagens dentro de uma mesma espécie, de espécies distintas em um mesmo gênero ou mesmo de gêneros diferentes. Aumentos de produção ainda maiores de produtos em linhagens obtidas por fusão de protoplastos podem ser ainda ampliados pelo uso de fusão recursiva de protoplastos. Nesta estratégia, numa única etapa, fusiona-se mais de um clone e os novos clones obtidos com características desejáveis podem ser utilizados em novas fusões de protoplastos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Coordenador / Marli Camassola - Integrante / Aldo Dillon - Integrante / Joice de Faria Poloni - Integrante., Financiador(es): Universidade de Caxias do Sul - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

  • 2007 - 2007

    Projeto Bioetanol: produção de etanol por hidrólise enzimática da biomassa da cana-de-açúcar, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Integrante / Marli Camassola - Coordenador / Aldo Dillon - Integrante / Tiago Romio - Integrante / Bárbara Lizandra Perini de Souza - Integrante.

  • 2007 - 2007

    Obtenção de fenol-oxidases em cultivos sólidos e líquidos de Pleurotus sajor-caju PS-2001 visando à degradação de compostos polifenólicos e de corantes têxteis, Descrição: O projeto tem o objetivo geral de produzir enzimas ligninolíticas de interesse industrial em cultivos sólidos e líquidos utilizando a linhagem PS-2001 de Pleurotus sajor-caju, com vistas a futuras aplicações em estratégias de biotratamento de efluentes têxteis e da indústria de papel e celulose.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Bruno César Feltes - Integrante / Marli Camassola - Coordenador / Aldo Dillon - Integrante / Fernada Bettin - Integrante / Letícia Osório da Rosa - Integrante.

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Prêmios

2018

Capa do Volume 86, Issue 3-4, Abril 2018 da Journal of Molecular Evolution, Journal of Molecular Evolution - Springer.

2018

Destaque na VIII Feira de Inovação Tecnológica da UFRGS (FINOVA). Desenvolvimento de Uma Plataforma Visual, Flexível e Intuitiva Para Análises de Expressão Gênica Por Microarranjo (Orientação), Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

2014

Destaque XXVI Salão de Iniciação Científica - Orientação de trabalho - Itamar José Guimarães Nunes, Universidade Federal do Rio Grande do Sul.

2009

Melhor trabalho apresentado no IX Congresso da SBMCTA (Epigenetic Modulation of Embryonic Development and Senescence in Homo sapiens, Mus musculus and Gallus gallus as observed by the Systems Biology), Sociedade Brasileira de Mutagênese, Carcinogênese e Teratogênese Ambiental (SBMCTA).

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Instituto de Informática. , Avenida Bento Gonçalves 9500, Viamão, 91501970 - Porto Alegre, RS - Brasil - Caixa-postal: 15005, Telefone: (051) 33086824, Ramal: 6824, URL da Homepage:

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Experiência profissional