Nathalia de Setta Costa

Possui graduação em Licenciatura Em Ciências Biológicas pela UNESP Campus de São José do Rio Preto (2002) e, Mestrado (2005) e Doutorado (2009) em Genética pela mesma universidade. Pós-doutorado no Depto de Botânica da USP. Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Genética Evolutiva, atuando principalmente nos seguintes temas: elementos de transposição eucarióticos, com ênfase em evolução molecular e impacto no genoma hospedeiro. Atualmente é Professora Adjunta na UFABC, Brasil.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Biociências

2005 - 2009

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Identificação, caracterização e estudo da evolução de Elementos Transponíveis do gênero Zaprionus
Orientador: em Centre National de la Recherche Scientifique ( Profa Dra Françoise Lemeunier e Prof Dr Pierre Capy)
com Profa Dra Claudia Marcia Aparecida Carareto. Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Drosophila; Resistência a inseticidas; Elementos transponíveis; Número de cópias; Zaprionus.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.

Mestrado em Biociências

2003 - 2005

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Avaliação da ocorrência e da atividade de elementos transponíveis P tipo-O e da família P em espécies do grupo saltans de Drosophila,Ano de Obtenção: 2005
Profa. Dra. Cláudia Márcia Ap. Carareto.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: elemento P tipo-O; grupo saltans; número de inserções; relações filogenéticas; transferência horizontal; Transposon Display. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia Molecular.

Graduação em Licenciatura Em Ciências Biológicas

1999 - 2002

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil.

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Pós-doutorado

2009 - 2012

Pós-Doutorado. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia Molecular. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.

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Formação complementar

2014 - 2014

Extensão universitária em Online DNA sequence analysis at Galaxy plataform. (Carga horária: 40h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2009 - 2009

Epigenética Comparativa. (Carga horária: 30h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2009 - 2009

Elementos de transposição e genomas eucarióticos. (Carga horária: 6h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2007 - 2007

Extensão universitária em Proteção Radiológica. (Carga horária: 50h). , Universidade de São Paulo, USP, Brasil.

2007 - 2007

Aspectos básicos e aplicados da Nutrigenômica. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2002 - 2002

Noções de Evolução e Paleobiologia de Vertebrados. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2002 - 2002

Genética da Longevidade e Doenças Ligadas à Idade. (Carga horária: 3h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2002 - 2002

Consultoria e Perícia Ambiental. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2002 - 2002

Biodiversidade em crise? Lições de Paleontologia. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2001 - 2001

Filogenia e Comportamento. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2001 - 2001

Matriz Extracelular: Uma Análise Multidisciplinar. (Carga horária: 9h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2001 - 2001

Genética e Citogenética de Peixes. (Carga horária: 16h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2001 - 2001

Genética da Conservação. (Carga horária: 12h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2001 - 2001

Carcinogênese Química e Sistema Imunológico. (Carga horária: 10h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2001 - 2001

Especiação. (Carga horária: 6h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2000 - 2000

Legislação Ambiental e Preservação da Natureza. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2000 - 2000

Preservação de Tartarugas Marinhas. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Genética Evolutiva.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Vegetal.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal.

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Organização de eventos

SETTA, N. . UFABC PARA TODOS 2019. 2019. (Outro).

SETTA, N. . UFABC PARA TODOS 2018. 2018. (Outro).

SETTA, N. ; CENTENO, D. C. ; BARCELOS, L. A. . 1º Workshop de Genômica Comparada. 2017. (Outro).

Setta, Nathalia . VII Simpósio de Iniciação Científica da UFABC. 2014. (Outro).

CARARETO, C. M. A. ; BABETO, E. ; SETTA, N. ; BITTAR, C. ; LOPES, Fabrício Ramon ; SOUZA, H. V. ; RICCI, J. ; PIRES, L. C. ; VALSECHI, M. C. ; CASTANHOLE, M. M. U. ; BEGUELINI, M. R. . X Simpósio de Genética. 2007. (Outro).

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Participação em eventos

1 Workshop de Genômica Comparada.Práticas em genômica comparada: análises de ortologia e sintenia. 2017. (Outra).

VI Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas. 2017. (Simpósio).

3° Workshop em Evolução e Diversidade. 2016. (Outra).

Brazilian-International Congress of Genetics. Structure and evolution of Setaria italica LTR retrotransposons. 2016. (Congresso).

11th International Congress of Plant Molecular Biology. Transposable elements impact on Setaria italica genome and gene structure. 2015. (Congresso).

61° Congresso Brasileiro de Genética. Elementos de transposição, marcadores moleculares e aplicabilidade biotecnológica. 2015. (Congresso).

Arena de Inovação: Biotecnologia e Nanotecnologia. 2015. (Encontro).

Environmental and metabolic control of plant growth and development.Dissecting genetics and epigenetics mechanisms underlying drought tolerance in C4 plants: do transposable elements play a role on the scene?. 2015. (Outra).

58° Congresso Brasileiro de genética. Minicurso: Aplicações genéticas e biotecnológicas dos elementos de transposição. 2012. (Congresso).

57° Congresso Brasileiro de Genética. Diversity and evolution of Helitrons transposons in "Saccharum complex" species. 2011. (Congresso).

III Simpósio Brasileiro de Genética Molecular de Plantas.Helitron transposon prediction in sugarcane using the HelitronFinder program. 2011. (Simpósio).

Plant and Animal Genome XIX Conference.Sugarcane Genome Sequencing Initiative. 2011. (Outra).

Workshop: O pós-doutorado e a pesquisa no Departamento de Botânica.Evolução dos elementos de transposição em eucariotos. 2011. (Outra).

Workshop on Syntetic Biology and Robotics. 2011. (Outra).

2nd ASM Conference on Mobile DNA.First record of Helitrons transposons in sugarcane (Saccharum spp.). 2010. (Outra).

12ª Semana Temática da Biologia.Biologia Molecular de Plantas - Genômica como objeto e ferramenta em estudos de Biologia Molecular. 2009. (Outra).

55° Congresso Brasileiro de Genética. Horizontal transfer of transposable elements between Zaprionus genus and melanogaster subgroup of Drosophila genus (Drosophilidae). 2009. (Congresso).

Journnée Régionale GenoToul Bioinformatique. 2009. (Outra).

Workshop "Os elementos de transposição como agentes de diversidade". 2009. (Outra).

Workshop BIOEN on Sugarcane Improvement. 2009. (Outra).

ICTE2008: Internacional Congress on the Transposable Elements. Diversity of copia retrotransposon regulatory sequences in the Zaprionus genus of Drosophilidae. 2008. (Congresso).

XI impósio de Genética e I Simpósio IMC-IBILCE Células-Tronco. 2008. (Simpósio).

1° Simpósio de Inovação Tecnológica da UNESP. 2007. (Simpósio).

53° Congresso Brasileiro de Genética. High variability and complex evolution of copia retrotransposon in Drosophilidae. 2007. (Congresso).

Colloque à hommage à la memoire de Daniel Lachaise. 2007. (Outra).

II Encontro de Pós-Graduação do IBILCE - IIEPGI. 2007. (Encontro).

V Simpósio de Biologia Animal. 2007. (Simpósio).

V Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila.Structural variability and evolution of copia regulatory sequences in the Zaprionus genus. 2007. (Simpósio).

X Simpósio de Genética. 2007. (Simpósio).

LEGS Seriales. 2006. (Encontro).

Réunion GDR 2175: ?Evolution des Elements Transposables: du Génome aux Populations?. 2006. (Outra).

51° Congresso Nacional de Genética. Diversidade de sequências da subfamília O de transposons P em espécies do grupo saltans de Drosophila. 2005. (Congresso).

IV Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila.Avaliação da atividade transposicional de duas subfamílias do elemento P em Drosophila sturtevanti e D. saltans por meio de Transposon Display. 2005. (Simpósio).

VIII Simpósio de Genética.Localização genômica de inserções polimórficas de elementos transponíveis em drosofilídeos colonizadores expostos a estresse ambiental. 2005. (Simpósio).

50° Congresso Brasileiro de Genética. Análise da distribuição e número de inserções do retrotransposon gypsy no grupo repleta de Drosophila. 2004. (Congresso).

VII Simpósio de Genética. 2004. (Simpósio).

III Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila.Identificação do elemento P tipo-O no subgrupo sturtevanti do grupo saltans de Drosophila. 2003. (Simpósio).

II Simpósio GEZ: Manejo e Conservação da Fauna Silvestre. 2003. (Simpósio).

VI Simpósio de Genética. 2003. (Simpósio).

29 Colóquio de Incentivo à Pesquisa.Caracterização dos componentes do valor adaptativo de uma população brasileira de Zaprionus indianus. 2002. (Outra).

V Simpósio de Genética. 2002. (Simpósio).

XIV Congresso de Iniciação Científica.Caracterização dos componentes do valor adaptativo de uma população brasileira de Zaprionus indianus. 2002. (Oficina).

XVIII Semana da Biologia. 2002. (Outra).

2 Seminário de Ética em Pesquisa. 2001. (Seminário).

2 Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila. 2001. (Simpósio).

Ciclo de Seminários: Sociedade Moderna e seus Impactos Ambientais. 2001. (Seminário).

Simpósio de Neurogenética. 2001. (Simpósio).

V Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia. 2001. (Congresso).

XVII Semana da Biologia. 2001. (Outra).

IV Simpósio de Genética. 2000. (Simpósio).

XVI Semana da Biologia. 2000. (Outra).

XV Semana da Biologia. 1999. (Outra).

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Participação em bancas

Aluno: Tatiane Cristina Nicomedio dos Santos

SETTA, N.; CENTENO, D. C.; MORAES, A. P.. Análise do fitness de Setaria italica cultivada em diferentes níveis de estresse hídrico. 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Larissa Batista Seixas

SETTA, N.; TEODOROV, E.; SIMOES, A. C. Q.. Diversidade da família gênica LEA nas espécies irmãs Setaria italica e Setaria viridis. 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Vania Gabriela Sedano Partida

SLUYS, Marie Anne Van; HOTTA, C.; CESARINO, I.;SETTA, N.. Caracterização genômica dos genes S6PP de Saccharum spp. associados ao metabolismo da sacarose. 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Jae Diana Paredes Rodriguez

SETTA, N.; LIRA, BRUNO SILVESTRE; CARDOSO, P. R.. Caracterização das alterações morfo-fisiologicas e metabólicas associadas ao estresse hídrico na monocotiledônea Setaria italica. 2018. Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Renata Neves Biancalana

SETTA, N.; BIONDO, C.; SANCHES, A.. Mitogenoma e prospecção e caracterização de microssatélites de Cypseloides fumigatus (Aves: Apodidae). 2017. Dissertação (Mestrado em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Alessandra Koltun

SETTA, N.; LIMA, J. E.; PERES, L. E. P.. Identificação e caracterização funcional de genes da subfamília Ammonium Transporter 2 (AMT2) de cana-de açúcar (Saccharum spp.). 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências (Energia Nuclear na Agricultura)) - Universidade de São Paulo.

Aluno: Valeska Daliane Souto de Souza

SETTA, N.; LIMA, JPMS; Scortecci KC. Análise de cDNAs identificados em bibliotecas de cDNA subtrativas para floração de variedades de cana-de-açúcar cultivadas no RN: NAC, Calmodulina e Fosfotidiltransferase - SEC14. 2011. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: LÍVIA DE MORAES BOMEDIANO CAMILLO

SASAKI, S. D.; MELLO, P. H.; MARTINS JUNIOR, D. C.;SETTA, N.; TANAKA, A. S.. Estudo dos inibidores de serino proteases RbmTI-A e RbmTI-6 no contexto do processo inflamatório do enfisema pulmonar. 2020. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Fernanda de Oliveira Barreto Costa

CENTENO, D. C.; MASUDA, H. P.;SETTA, N.; SOUZA, W. R.; RIBEIRO, C. A. J.. Papel de adjuvantes na eficácia do herbicida glifosato para controle de Setaria italica. 2020. Tese (Doutorado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Vanessa Fuentes Suguiyama

SETTA, N.; NUNES, L. R.; SLUYS, M. A. V.; FRESCHI, L.; Domingues DS. Entendendo as respostas plásticas ao estresse hídrico em Setaria italica e a influência dos elementos de transposição. 2019. Tese (Doutorado em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Renan Cardoso Soares

PAULINO, L. C.; SATO, M. I. Z.; MASUDA, H. P.;SETTA, N.; SASAKI, S. D.. Caracterização da microbiota cutânea fúngica e análise da resposta imunológica em pacientes com dermatite seborreica e seus familiares. 2018. Tese (Doutorado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Kellya Francisca Mendonça Barreto

SCORTECCI, KATIA CASTANHO; MACEDO, C. E. C.; MENESES, C. H. S. G.; GOLDBERT, D. C. F.;SETTA, N.. Prospecção do gene da calmodulina em plantas. 2018. Tese (Doutorado em Bioquímica) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte.

Aluno: Fernanda de Góes Maciel

BIONDO, C.; SANCHES, A.; PRESTI, F. T.; MIOTTO, R. A.;SETTA, N.. Diversidade e estrutura genética populacional de queixadas (Tayassu pecari) no Pantanal, Cerrado e Mata Atlântica. 2018. Tese (Doutorado em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Helena Sanches Marcon

MARINO, C. L.; SLUYS, M. A. V.; VIEIRA, M. L. C.; MAIA, I. G.;SETTA, N.. Caracterização de retrotransposons com LTR do gênero Eucalyptus. 2014. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Márcia Maria Urbanin Castanhole

ITOYAMA, M. M.; MORALES, M. A. M.;SETTA, N.; LANGEANI NETO, F.; CASTIGLIONI, L.. Relacionamento filogenético das espécies pertencentes às famílias Belostomatidae, Gelastocoridae, Gerridae, Notonectidae, Veiidae (Hemiptera: Heteroptera) e Cercopidae (Hemiptera: Auchenorrhyncha). 2013. Tese (Doutorado em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Lívia de Moraes Bomediano

SETTA, N.; SILVA, M. C. C.; MARTINS JUNIOR, D. C.. Estudo da interação da terapia a laser de baixa intensidade com o foto aceptor citocromo c oxidase e estudo evolutivo e estrutural da subunidade COX5B. 2018. Exame de qualificação (Doutorando em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Vanessa Fuentes Suguiyama

SETTA, N.; TURRINI, P. C. G.; SILVA, E. A.. Entendendo as respostas plásticas ao déficit hídrico em Setaria italica e a influência dos elementos de transposição. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Aline Forgatti Hell

SETTA, N.; CARDOSO, P. R.; SILVA, J. P. N.. Alterações no perfil metabólico e nos sistemas de defesa de microalgas liquenizadas com tolerância à dessecação distintas. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Fernanda de Góes Maciel

SETTA, N.; DIAS, G.; MIYAKI, C. Y.. Diversidade genética e estrutura populacional de um mamífero de grande porte em paisagens heterogêneas. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Renan Cardoso Soares

SETTA, N.; NUNES, L. R.; SASAKI, S. D.. Caracterização da microbiota cutânea fúngica e análise da resposta imunológica em pacientes com dermatite seborreica e seus familiares. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Elias Alberto Gutierrez Carnelossi

CARARETO, C. M. A.; Fablet, M.;SETTA, N.. Investigação de elementos de transposição em populações de Drosophila mojavensis e Drosophila arizonae e seus hibrídos. 2012. Exame de qualificação (Doutorando em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Aline de Almeida Ferreira

RODAS, A. C. D.; MARTINS JUNIOR, D. C.;SETTA, N.. Reconstrução e modelagem computacional de redes de inflamação em conjuntos de dados de RNA-seq de dieta cetogênica. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Engenharia Biomédica) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Wanessa Bastos dos Santos Mascarenhas

Setta, Nathalia; ELOY, N. B.; SOUSA-BAENA, M. S.. Análise funcional do gene AtMO25-1 na morfogênese celular de plantas. 2019. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Ana Clara de Oliveira Cruz

SETTA, N.; HOTTA, C.; GASPAR, M.. Metabolismo de cana-de-açúcar sob estresse hídrico: análise de olgossacarídeos da série da rafinose. 2017. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Renata Neves Biancalana

SETTA, N.; MIYAKI, C. Y.; COELHO, M. M.. Fidelidade ao ninho e incidência de fertilização extra-par em Cypseloides fumigatus e Streptocne zonairis (Aves: Apodidae). 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Fernanda Sant'Ana Cabral

SETTA, N.; MASUDA, H. P.; GASPAR, M.. Avaliação da dinâmica do carbono e sua contribuição para o acúmulo de açúcares em diferentes variedades de cana. 2014. Exame de qualificação (Mestrando em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Elaine Silva Dias

SETTA, N.; AMARAL, MEJ; CARARETO, Cláudia Márcia Ap. Proposição dos modelos de expansão intragenômica dos elementos transponíveis 412 e Bari nas espécies do grupo melanogaster. 2010. Exame de qualificação (Mestrando em Biociências) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Aluno: Rafael de Oliveira

SETTA, N.; CENTENO, D. C.; LOMBELLO, R. A.. Efeitos fitotóxicos do fluoreto no substrato em diferentes estágios de desenvolvimento de Setaria italica. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Anna Carolina Russo Curbelo Martin

SETTA, N.; BIONDO, C.; CARRIJO, T. F.. Identificação individual de amostras não invasivas de queixadas (Tayassu pecari) usando marcadores moleculares microssatélites.. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Nathalia Moreschi Brandt

SETTA, N.; BIONDO, C.; DIAS, G.. Caracterização da diversidade genética de queixadas (Tayassu pecari) de uma região de cerrado do Mato Grosso do Sul. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do ABC.

Aluno: Ana Clara de Oliveira Cruz

SETTA, N.; COSTA, R. M. A.; SILVA, J. B.. Decifrando o regulon SOS de Leptospira biflexa. 2015. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do ABC.

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Orientou

Thais Massanet

Análise genômica evolutiva e funcional associada ao estresse hídrico das metacaspases de monocotiledôneas, com ênfase em Setaria italica e Setaria viridis; ; Início: 2018; Tese (Doutorado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC; (Orientador);

Jae Diana Paredes Rodriguez

Identificação de rotas metabólicas associadas ao estresse hídrico na monocotiledônea C4 Setaria italica; ; 2018; Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Tatiane Cristina Nicomedio dos Santos

Análise do fitness de Setaria italica cultivada em diferentes níveis de estresse hídrico; 2018; Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC,; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Larissa Batista Seixas

Diversidade da família gênica LEA nas espécies irmãs Setaria italica e Setaria viridis; 2018; Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC,; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Pedro Teixeira Pimont

Caracterização dos genes rafinose sintase e estaquiose sintase em gramíneas; 2018; Dissertação (Mestrado em Biotecnociência) - Universidade Federal do ABC,; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Vanessa Fuentes Suguiyama

Entendendo as respostas plásticas ao estresse hídrico em Setaria italica e a influência dos elementos de transposição; 2019; Tese (Doutorado em Evolução e Diversidade) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Joice Caroline dos Santos Silva

Avaliação do perfil de regulação gênica em Setaria italica sob diferentes intensidades de estresse hídrico; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Metodista de São Paulo; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Luiz Augusto Baciega Vasconcelos

Os transposons de DNA hAT em Setaria: caracterização, diversidade e impacto no genoma das espécies irmãs Setaria italica e Setaria viridis; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Beatriz Tonhazolo Gimenez

Evolução e contribuição dos elementos de transposição aos genes de síntese de sacarose e amido em gramíneas, com ênfase em cana-de-açúcar (Saccharum spp; ) e milheto (Setaria italica); 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Marcos Vinícius Gonçalves da Silva

Caracterização estrutural e evolutiva dos genes fumarase e malato desidrogenase em cana-de-açúcar; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Vitor Audibert

Caracterização de genes da rota de biossíntese da vitamina E em variedades de pimenta Capsicum chinense; 2012; Iniciação Científica; (Graduando em Bacharelado em Ciencia e Tecnologia) - Universidade Federal do ABC; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

Ana Cristina FAzza

Identificação de alterações genéticas em câncer de mama por meio do método Alu-PCR; 2006; Iniciação Científica; (Graduando em Licenciatura Em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Nathalia de Setta Costa;

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Foi orientado por

Marie-Anne Van Sluys

2011; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Marie-Anne Van Sluys;

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Produções bibliográficas

  • MASUDA, H. P. ; NAKABASHI, M. ; MORGANTE, P. ; KAJIHARA, D. ; SETTA, N. ; MENCK, C. F. M. ; SLUYS, M. A. V. . Evidence for sub-functionalization of tandemly duplicated XPB nucleotide excision repair genes in Arabidopsis thaliana. GENE , p. 144818, 2020.

  • SIMÕES, MARCELLA SIQUEIRA ; CARVALHO, GABRIEL GARON ; FERREIRA, SÁVIO SIQUEIRA ; HERNANDES-LOPES, JOSÉ ; DE SETTA, NATHALIA ; CESARINO, IGOR . Genome-wide characterization of the laccase gene family in Setaria viridis reveals members potentially involved in lignification. PLANTA , v. 251, p. 46, 2020.

  • TAVARES, EVELINE Q P ; DE SOUZA, AMANDA P ; ROMIM, GRAYCE H ; GRANDIS, ADRIANA ; PLASENCIA, ANNA ; GAIARSA, JONAS W ; GRIMA-PETTENATI, JACQUELINE ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; BUCKERIDGE, MARCOS S . The control of endopolygalacturonase expression by the sugarcane RAV transcription factor during aerenchyma formation. JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY , v. 70, p. 497-506, 2019.

  • SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES ; VASCONCELOS, LUIZ AUGUSTO BACIEGA ; ROSSI, MARIA MAGDALENA ; BIONDO, CIBELE ; DE SETTA, NATHALIA . The population genetic structure approach adds new insights into the evolution of plant LTR retrotransposon lineages. PLoS One , v. 14, p. e0214542, 2019.

  • DE OLIVEIRA SILVA, FRANKLIN MAGNUM ; LICHTENSTEIN, GABRIEL ; ALSEEKH, SALEH ; ROSADO-SOUZA, LAISE ; CONTE, MARIANA ; SUGUIYAMA, VANESSA FUENTES ; LIRA, BRUNO SILVESTRE ; FANOURAKIS, DIMITRIOS ; USADEL, BJÖRN ; BHERING, LEONARDO LOPES ; DAMATTA, FÁBIO M. ; SULPICE, RONAN ; ARAÚJO, WAGNER L. ; ROSSI, MAGDALENA ; DE SETTA, NATHALIA ; FERNIE, ALISDAIR R. ; CARRARI, FERNANDO ; NUNES-NESI, ADRIANO . The genetic architecture of photosynthesis and plant growth-related traits in tomato. PLANT CELL AND ENVIRONMENT , v. 41, p. 327-341, 2018.

  • SIMÃO, M C ; HAUDRY, A ; GRANZOTTO, A ; SETTA, N ; CARARETO, C M A . Helena and BS: two travellers between the genera Drosophila and Zaprionus. Genome Biology and Evolution , v. 10, p. 2671-2685, 2018.

  • VILELA, MARIANE DE MENDONÇA ; DEL-BEM, LUIZ-EDUARDO ; Van Sluys, Marie-Anne ; DE SETTA, NATHALIA ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; CRUZ, GUILHERME MARCELO QUEIROGA ; SFORÇA, DANILO AUGUSTO ; DE SOUZA, ANETE PEREIRA ; FERREIRA, PAULO CAVALCANTI GOMES ; GRATIVOL, CLÍCIA ; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO ; VICENTINI, RENATO ; VINCENTZ, MICHEL . Analysis of three sugarcane homo/homeologous regions suggests independent polyploidization events of Saccharum officinarum and Saccharum spontaneum . Genome Biology and Evolution , v. 9, p. evw293, 2017.

  • MEDEIROS, AMANDA L. ; FURTADO, CRISTIANE M. ; LEITE, FRANCINALDO S. ; SOUTO, VALESKA S. ; DE SETTA, NATHALIA ; Van Sluys, Marie-Anne ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; COSTA, ANA PAULA P. ; BENEDITO, VAGNER A. ; SCORTECCI, KATIA C. . Molecular Genetic Dissection of Sugarcane Flowering under Equatorial Field Conditions. Tropical Plant Biology , v. 1, p. 1-15, 2016.

  • ROSADO, DANIELE ; GRAMEGNA, GIOVANNA ; CRUZ, ALINE ; LIRA, BRUNO SILVESTRE ; FRESCHI, LUCIANO ; DE SETTA, NATHALIA ; ROSSI, MAGDALENA . Phytochrome Interacting Factors (PIFs) in Solanum lycopersicum: Diversity, Evolutionary History and Expression Profiling during Different Developmental Processes. Plos One , v. 11, p. e0165929, 2016.

  • Cruz, Guilherme M. Q. ; Metcalfe, Cushla J. ; DE SETTA, NATHALIA ; CRUZ, EDGAR A. O. ; VIEIRA, ANDRÉIA PRATA ; MEDINA, ROSARIO ; Van Sluys, Marie-Anne . Virus-Like Attachment Sites and Plastic CpG Islands: Landmarks of Diversity in Plant Del Retrotransposons. Plos One , v. 9, p. e97099, 2014.

  • LIRA, BRUNO SILVESTRE ; DE SETTA, NATHALIA ; ROSADO, DANIELE ; ALMEIDA, JULIANA ; FRESCHI, LUCIANO ; ROSSI, MAGDALENA . Plant degreening: evolution and expression of tomato (Solanum lycopersicum) dephytylation enzymes. Gene (Amsterdam) , v. 546, p. 359-366, 2014.

  • DE SETTA, NATHALIA ; DE SETTA, NATHALIA MONTEIRO-VITORELLO, CLÁUDIA BARROS METCALFE, CUSHLA JANE CRUZ, GUILHERME MARCELO DEL BEM, LUIZ EDUARDO VICENTINI, RENATO NOGUEIRA, FÁBIO TEBALDI CAMPOS, ROBERTA ALVARES NUNES, SIDENY LIMA TURRINI, PAULA CRISTINA VIEIRA, ANDREIA PRATA OCHOA CRUZ, EDGAR ANDRÉS CORRÊA, TATIANA CAROLINE HOTTA, CARLOS TAKESHI DE MELLO VARANI, ALESSANDRO VAUTRIN, SONIA DA TRINDADE, ADILSON SILVA DE MENDONÇA VILELA, MARIANE LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI SATO, PALOMA MIEKO DE ANDRADE, RODRIGO FANDINO NISHIYAMA, MILTON YUTAKA CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO SCORTECCI, KATIA CASTANHO GARCIA, ANTÔNIO AUGUSTO , et al. CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO KIM, CHANGSOO PATERSON, ANDREW H BERGÈS, HÉLÈNE D'HONT, ANGÉLIQUE DE SOUZA, ANETE PEREIRA SOUZA, GLAUCIA MENDES VINCENTZ, MICHEL KITAJIMA, JOÃO PAULO Van Sluys, Marie-Anne ; Building the sugarcane genome for biotechnology and identifying evolutionary trends. BMC Genomics , v. 15, p. 540, 2014.

  • ALMEIDA, J. ; QUADRANA, L. ; Asis, R. ; SETTA, N. ; de GODOY, F. ; BERMUDEZ, L. ; Otaiza, S. N. ; Correa da Silva, J. V. ; FERNIE, A. R. ; CARRARI, F. ; ROSSI, M. . Genetic dissection of vitamin E biosynthesis in tomato. Journal of Experimental Botany , v. 62, p. 3781-3798, 2011.

  • Setta, Nathalia ; Sluys, Marie-Anne ; CAPY, Pierre ; Carareto, Claudia Marcia Aparecida . Copia Retrotransposon in the Zaprionus Genus: Another Case of Transposable Element Sharing with the Drosophila melanogaster Subgroup. Journal of Molecular Evolution , v. 72, p. 326-338, 2011.

  • FAZZA, A. C. ; SABINO, F. C. ; SETTA, N. ; BORDIN, N. U. R. ; SILVA, E. H. T. ; CARARETO, C. M. A. . Estimating genomic instability mediated by Alu retroelements in breast cancer. Genetics and Molecular Biology , v. 32, p. 25-31, 2009.

  • SETTA, N. ; Van Sluys, Marie-Anne ; CAPY, Pierre ; Carareto, Claudia MA . Multiple invasions of Gypsy and Micropia retroelements in genus Zaprionus and melanogaster subgroup of the genus Drosophila. BMC Evolutionary Biology (Online) , v. 9, p. 279, 2009.

  • SETTA, N. ; GALEGO, L. G. ; CHAMINADE, N. ; AULARD, S. ; LEMEUNIER, F. ; CARARETO, C. M. A. . Insights about the phylogenetic relationship between Zaprionus and Drosophila from molecular and cytogenetic data of -esterase7 gene of Zaprionus indianus.. Drosophila Information Service , v. 91, p. 60-68, 2008.

  • SETTA, N. ; COSTA, A. P. P. ; LOPES, Fabrício Ramon ; SLUYS, Marie Anne Van ; CARARETO, C. M. A. . Transposon display supports transpositional activity of P elements in species of the saltans group of Drosophila. Journal of Genetics , v. 86, p. 37-43, 2007.

  • SETTA, N. ; LORETO, E. L. S. ; CARARETO, C. M. A. . Is the Evolutionary History of the O-Type P Element in the saltans and willistoni Groups of Drosophila Similar to That of the Canonical P Element?. Journal of Molecular Evolution , v. 65, p. 715-724, 2007.

  • SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Screening for transposable elements in South America invasive species Zaprionus. Drosophila Information Service , v. 90, p. 96-99, 2007.

  • CASTRO, J. P. ; SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Distribution and insertion numbers of transposable elements in species of the Drosophila saltans group. Genetics and Molecular Biology , Ribeirão Preto, SP, Brasil, v. 29, n.2, p. 384-390, 2006.

  • SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Fitness components of a recently-established population of Zaprionus indianus (Diptera, Drosophilidae) in Brazil. Iheringia. Série Zoologia , Porto Alegre - RS, v. 95, n.1, p. 47-51, 2005.

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Outras produções

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico BMC Genomics. 2020.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de iniciação científica FAPESP. 2020.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Genetics and Molecular Biology. 2019.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa para o Edital 'Pesquisando desde o Primeiro Dia' UFABC. 2019.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de iniciação científica FAPESP. 2019.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Mobile DNA. 2018.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de iniciação científica PIBIC UFBAC. 2018.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de iniciação científica PIBIC UFBAC. 2018.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Brazilian Journal of Botany. 2017.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de pós-doutorado FAPESP. 2017.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de iniciação científica PIBIC UFBAC. 2017.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Genetics and Molecular Biology. 2016.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Genetics and Molecular Biology. 2016.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Molecular Genetics and Genomics. 2016.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Molecular Genetics and Genomics. 2016.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de iniciação científica PIBIC UFBAC. 2016.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Brazilian Journal of Botany. 2015.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Brazilian Journal of Botany. 2015.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Molecular Genetics and Genomics. 2015.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de mestrado FAPESP. 2015.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Brazilian Journal of Botany. 2015.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa para o Edital 'Pesquisando desde o Primeiro Dia' UFABC. 2014.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa para o Edital 'Pesquisando desde o Primeiro Dia' UFABC. 2014.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de mestrado FAPESP. 2014.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de iniciação científica PIBIC UFBAC. 2014.

SETTA, N. . Parecer de Plano de Pesquisa de Docente Ingressante no Departamento de Botânica do IB da USP. 2014.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Gene. 2013.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa para o Edital 'Pesquisando desde o Primeiro Dia' UFABC. 2013.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa de bolsa de mestrado FAPESP. 2013.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Genetics and Molecular Biology. 2012.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Genetics and Molecular Biology. 2012.

SETTA, N. . Parecer em manuscrito para o periódico Plos One. 2012.

SETTA, N. . Parecer em projeto de pesquisa para o Edital 'Pesquisando desde o Primeiro Dia' UFABC. 2012.

SETTA, N. . Peer-review para a Mobile DNA. 2018.

SETTA, N. . Peer-review para a Brazilian Jounal of Botany. 2017.

SETTA, N. . Peer-review para Molecular Genetics and Genomics. 2016.

SETTA, N. . Peer-review para Genetics and Molecular Biology. 2016.

SETTA, N. . Peer-review para a Genetics and Molecular Biology. 2016.

SETTA, N. . Peer-review para Brazilian Journal of Botany. 2015.

SETTA, N. . Peer-review para Brazilian Jounal of Botany. 2015.

SETTA, N. . Peer-review para Molecular Genetics and Genomics. 2015.

SETTA, N. . Parecer ad-hoc FAPESP. 2013.

SETTA, N. . Peer-review para Gene. 2013.

SETTA, N. . Peer-review para Plos One. 2012.

SETTA, N. . Peer-review para Genetics and Molecular Biology. 2012.

SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van . Análises estruturais, funcionais e evolutivas de Helitrons em cana-de-açúcar. 2011.

SETTA, N. . Elementos de transposição no gênero Zaprionus (Diptera, Drosophilidae): estudos genômicos e evolutivos com ênfase nos retrotransposons copia, gypsy e micropia. 2009.

SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van . Análises estruturais, funcionais e evolutivas de Helitrons em cana-de-açúcar. 2009.

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Parte A ? Análises dos retrotransposons gypsy, copia e micropia em espécies do gênero Zaprionus. Parte B ? Caracterização citogenética e molecular do gene a-Esterase 7 de Zaprionus indianus com ênfase nas suas relações filogenéticas com espécies do gênero Drosophila.. 2007.

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Identificação, caracterização e estudo da evolução de Elementos Transponíveis do gênero Zaprionus. 2007.

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Avaliação da ocorrência e da atividade de elementos transponíveis P tipo-O e da família P em espécies do grupo saltans de Drosophila. 2005.

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Localização genômica e cromossômica de sítios de inserção polimórficos de elementos transponíveis em espécies invasoras de drosofilídeos expostas a estresse ambiental. 2005.

CARARETO, C. M. A. ; CASTRO, J. P. ; SETTA, N. . Avaliação da ocorrência, diversidade de sequências e atividade transcricional de elementos transponíveis P não-canônicos em espécies do grupo saltans de Drosophila. 2003.

SETTA, N. . Aplicações genéticas e biotecnológicas dos elementos de transposição.. 2012. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SETTA, N. . Sequenciamento de nova-geração: conceitos e aplicações. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van ; CARARETO, C. M. A. . Zaprionus retrotransposon gypsy env gene, partial sequence (FJ710405-FJ710422). 2010. (Sequencias de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van ; CARARETO, C. M. A. . Zaprionus retrotransposon micropia RNAse H domain, partial sequence (FJ710423-FJ710440). 2010. (Sequencias de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. . Filogenia Molecular. 2010. (Colaboração na Disciplina BIB538 ?Biologia e Evolução em Procariotos?).

SETTA, N. ; SLUYS, Marie Anne Van ; CARARETO, C. M. A. . Zaprionus glycerol-3-phosphate dehydrogenase gene, exon 2 and partial cds (FJ705445-FJ705450). 2009. (Sequencias de DNA depositada no GenBank).

GALEGO, L. G. ; SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Zaprionus indianus strain Mirassol alpha-esterase 7 (aE7) gene, partial cds (EU583135). 2009. (Sequencia de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Influência da vegetação vizinha no controle de pragas do feijoeiro (Phaseolus vulgaris, L.) em São José do Rio Preto, SP.. 2007. (Análise de Projeto de Pesquisa).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Estresse infantil em São José do Rio Preto, SP: identificação dos fatores mais frequentes. 2007. (Análise de Projeto de Pesquisa).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila willistoni strain 17A transposon O-type P element, partial sequence (DQ679769). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila nebulosa transposon O-type P element, partial sequence (DQ679768). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila milleri strain MEY transposon O-type P element, partial sequence (DQ679767). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila prosaltans strain PMS transposon O-type P element, partial sequence (DQ679766). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila sturtevanti strain SMX transposon O-type P element, partial sequence (DQ679765). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila austrosaltans strain ARP transposon O-type P element, partial sequence (DQ679764). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila milleri strain MEY transposon O-type P element, partial sequence (DQ679763). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila sturtevanti strain SMX transposon O-type P element, partial sequence (DQ679762). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila austrosaltans strain ARP transposon O-type P element, partial sequence (DQ679761). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila prosaltans strain PMS transposon O-type P element, partial sequence (DQ679760). 2007. (Sequência de DNA depositada no GenBank).

SETTA, N. ; CARARETO, C. M. A. . Drosophila saltans strain SAM transposon O-type P element, complete sequence. 2007. (Sequência de DNA depositada de GenBank).

SETTA, N. . Análises Filogenéticas de Elementos Transponíveis. 2007. (Colaboração na Disciplina de Genômica Comparativa à Luz dos Elementos Transponíveis).

SETTA, N. . Teoria e Prática em Reconstruções Filogenéticas. 2006. (Colaboração na Disciplina de Evolução Molecular).

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Projetos de pesquisa

  • 2009 - Atual

    Análises estruturais, funcionais e evolutivas de Helitrons em cana-de-açúcar, Descrição: A cana-de-açúcar é uma cultura de extrema importância no cenário econômico brasileiro, devido à produção do bioetanol e do açúcar. Dessa forma, o estudo da genética dessa planta tem se tornado atrativo, pois visa contribuir no esclarecimento dos mecanismos que geram variabilidade genética. Estes permitem a seleção de genótipos que resultem em aumento da produtividade e melhoramento de características agronomicamente importantes. Dos fatores que geram variabilidade em plantas, pode-se destacar os elementos de transposição, que geram rearranjos, duplicações e variabilidade na produção de proteínas. Neste contexto, este projeto de pesquisa integra um Projeto Temático, e tem como objetivo central o estudo de um grupo específico de elementos que ainda não foram estudados em cana, os Helitrons, já relacionados à geração de variabilidade em outras gramíneas, como o arroz e o milho. As análises consistirão da caracterização de Helitrons e de regiões genômicas que os contenham, da produção de seus perfis de expressão em diferentes variedades de cana, com fenótipos de interesse no melhoramento e, da sua identificação em espécies relacionadas, por meio de uma abordagem evolutiva. Assim, espera-se que os resultados produzidos contribuam com o entendimento do papel dos Helitrons na dinâmica do genoma da cana-de-açúcar, como também forneçam ferramentas de estudo e experimentação de cultivares.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Marie Anne Van Sluys - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2007 - 2010

    Análise de respostas adaptativas associadas a inserções preferenciais de elementos transponíveis em espécies invasoras de drosofilídeos expostas a estresse ambiental, Descrição: A temática deste projeto de pesquisa foca tal questão, com ênfase no estudo da ação de elementos transponíveis no processo de adaptação de espécies colonizadoras a habitats perturbados pela ação antrópica. Dentre as possíveis abordagens para o estudo da origem de adaptações devidas à ação de TEs em insetos hospedeiros pode-se citar: (i) a análise da importância dessas seqüências no fenômeno de resistência a inseticidas e; (ii) o estudo da dinâmica de inserção/excisão em populações colonizadoras. Dentre as numerosas espécies de drosofilídeos introduzidas no Brasil em diferentes períodos destacamos D. melanogaster, D. simulans e D. malerkotliana, espécies do subgênero Sophophora, do gênero Drosophila e Zaprionus indianus. Desse modo, será feita uma busca pelos sítios de inserção de elementos transponíveis e análise da variação de seu número nos genomas de espécies invasoras de modo a propiciar o conhecimento do amplo espectro de alternativas que os insetos possuem e que os habilita a se adaptarem rapidamente a mudanças ambientais. Focalizaremos também nosso estudo nos genes das famílias P450, COE e GST de Drosophila que já foram associados à resistência a inseticidas. A disponibilidade atual das seqüências completas de uma variedade de genomas propicia uma oportunidade sem precedente para acessar mais objetivamente a contribuição de seqüências de elementos de transposição para a função gênica. Em vista disso será realizada também a comparação das regiões flanqueadoras dos genes das famílias CYP, GST e EST em D. melanogaster e D. simulans para avaliar a inserção diferencial de TEs nessas regiões, entre as duas espécies. As seqüências com inserções diferenciais serão estudadas em linhagens resistentes e susceptíveis a inseticidas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Cláudia Márcia A. Carareto - Coordenador / Fabrício Ramon Lopes - Integrante / Adriana Granzotto - Integrante / Lilian Madi-Ravazzi - Integrante / Julcimary Ricci - Integrante / Elaine Silva Dias - Integrante / Cristina Vieira - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

  • 2005 - 2009

    Estudo Comparativo de Duas Invasões Biológicas no Brasil, Descrição: Pouco se conhece sobre os mecanismos genéticos que permitem a uma espécie ser invasora e se adaptar a ambientes diferentes. Os drosofilideos são um modelo ideal para abordar estas questões, em função da diversidade das distribuições geográficas dessas espécies e dos conhecimentos acumulados sobre ecologia e genética que dispomos desse grupo. Esse projeto visa a comparar duas espécies originárias do continente africano que invadiram a América do Sul. Uma é invasora recente, Zaprionus indianus, e a outras colonizadoras mais antigas, Drosophila melanogaster e Drosophila simulans, para as quais já existe uma literatura abundante, tanto no plano ecológico quanto no genético. Um dos objetivos do projeto é ampliar estudos de dispersão de Z. indianus no Brasil e, sobretudo sua eventual diferenciação em raças geográficas e climáticas. Pretendemos também, analisar a variabilidade genética de populações de Z. indianus estabelecidas ao longo do território brasileiro, visando responder a três questões iniciais: Qual a origem provável da população brasileira? Qual a perda de biodiversidade sofrida pela população fundadora do Brasil? Qual a variabilidade genética suficiente para que a espécie se estabeleça em diferentes ambientes? Um segundo objetivo é a avaliação da variabilidade genética já existente na espécie D. simulans que já invadiu o continente Sul Americano há um tempo maior, estando presente em todo a América do Sul. Pretende-se neste estudo contribuir para o entendimento dos mecanismos genéticos e ecológicos associados ao processo de invasão e adaptação a diferentes ambientes. E como um terceiro objetivo, pretendemos verificar se há uma associação entre mudança na dinâmica dos elementos de transposição (número de cópias, localização de cópias e/ou atividade dos elementos de transposição) e alteração no status das espécies (de endêmica para invasora e de invasora para cosmopolita). Será realizado um estudo fundamentado na hipótese de que os elementos transponíveis acarre. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Cláudia Márcia Ap Carareto - Integrante / Pierre Capy - Integrante / Elgion Lucio da Silva Loreto - Coordenador / Lilian Madi-Ravazzi - Integrante / Julcimary Ricci - Integrante / Vera Lúcia Silva Valente Gayeski - Integrante / Louis Bernard Klazcko - Integrante / Elaine Silva Dias - Integrante / Blanche Christine Pires de Bitner-Mathé - Integrante / Jean David - Integrante / Claude Maisonhaute - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / COFECUB - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 8

  • 2005 - 2007

    Localização genômica de sítios de inserção de elementos transponíveis em espécies invasoras de drosofilídeos expostas a estresse ambiental, Descrição: Este projeto fundamenta-se em dois modelos teóricos. O primeiro refere-se à hipótese de que os elementos transponíveis acarretam adaptações ao estresse ambiental a que seus hospedeiros são submetidos. A busca pela localização de TEs que conferem resistência pode propiciar o conhecimento do amplo espectro de alternativas que os insetos possuem para tornarem-se adaptados rapidamente a mudanças ambientais. O segundo fundamenta-se na hipótese que uma mudança de status das espécies (de endêmica para invasora e cosmopolita) pode acarretar o "wake-up" de TEs. Esse projeto visa comparar a dinâmica dos elementos transponíveis nos genomas de três espécies originárias do continente africano (Drosophila melanogaster, D. simulans e Zaprionus indianus) e uma asiática (D. malerkotliana) que invadiram a América do Sul em épocas diferentes e as respostas adaptativas destas espécies associadas aos elementos transponíveis que abrigam.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Cláudia Márcia A. Carareto - Coordenador / Pierre Capy - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação / Centre National de la Recherche Scientifique - Cooperação.

  • 2004 - 2006

    Avaliação da ocorrência, diversidade de seqüências e atividade de elementos transponíveis P canônicos e não-canônicos em espécies do subgênero Sophophora., Descrição: Seqüências homólogas ao elemento P têm sido detectadas em quase todas as espécies do grupo saltans, mas pouco se sabe sobre a estrutura molecular das famílias não-canônicas e sobre o estado de atividade da família P como um todo. Alguns trabalhos mostraram que as seqüências P isoladas de espécies do grupo saltans são muito assemelhadas ao elemento P de D. melanogaster e, por isso sugeriu-se que os elementos P canônicos também estivessem ativos neste grupo e as demais subfamílias estivessem inativas. Nossos estudos têm mostrado que as seqüências P canônicas estão transcricionalmente ativas em apenas três espécies do grupo saltans, mas os transcritos são muito divergentes dos de D. melanogaster, de modo que a transposase, se traduzida, deve ser inativa. Pouco também se conhece sobre os elementos não-canônicos, tanto quanto sua ocorrência no grupo saltans, como quanto ao seu grau de atividade transcricional. Em face do exposto, com este projeto pretendemos: (1) verificar a ocorrência e caracterizar as seqüências dos elementos P tipo-O em espécies dos diferentes subgrupos do grupo saltans e em diferentes linhagens; (2) avaliar o grau de divergência da subfamília O entre as espécies dos diferentes sub-grupos do grupo saltans por meio do seqüenciamento do exon 2 do elemento, o mais conservado; (3) averiguar se as seqüências P tipo-O são transcricionalmente ativas nas linhagens e espécies do grupo saltans.; (4) detectar a ocorrência dos efeitos fenotípicos da mobilização dos elementos P em cruzamentos entre linhagens de espécies possuidoras de elementos transcricionalmente ativos e (5) avaliar a capacidade de transposição da família P nas espécies do grupo saltans caracterizadas como possuidoras de elementos transcricionalmente ativos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Cláudia Márcia A. Carareto - Coordenador / Fabrício Ramon Lopes - Integrante / Élen Arroyo Peres - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 3

  • 2002 - 2004

    Variabilidade genética e interações competitivas em Zaprionus indianus., Descrição: Z. indianus é um um drosofilídeo que invadiu o Brasil recentemente (1999) e tem sido considerado uma importante paraga de cultura de figos. Tendo em vista que para se estabelecerem formas de controle adequadas é de imprescindível importância ter-se um conhecimento detalhado da Biologia da espécie invasora, do grau de variabilidade genética e da estrutura genética de suas populações, bem como as inter-relações da espécie invasora com espécies nativas, este projeto tem os seguintes tem por objetivos quantificar a variabilidade genética de populações meio da análise de variantes eletroforéticas, bem como a evolução destas populações no tempo; caracterizar seus componentes do valor adaptativo e conhecer as interações competitivas desta espécie com as espécies nativas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Cláudia Márcia A. Carareto - Coordenador / Luis Gustavo Galego - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

  • 2000 - 2003

    Reavaliação da distribuição, diversidade de seqüências, número de cópias, e atividade transcricional de elementos transponíveis no grupo saltans de Drosophila, com ênfase no elemento P, Descrição: No presente estudo investigou-se a distribuição; diversidade de seqüências; número de cópias; e atividade transcricional de elementos transponíveis no grupo saltans de Drosophila. Para isto, foram empregadas as técnicas de Southern blot, PCR, RT-PCR de tecidos germinativo e somático, e seqüenciamento. Os resultados mostraram que ao contrário do que se pensava, existem seqüências homólogas ao elemento P em todos os subgrupos do grupo saltans, entretanto, apenas as espécies dos subgrupos sturtevanti e saltans parecem possuir cópias potencialmente completas. Elementos P completos foram seqüenciados em D. sturtevanti e em D. prosaltans e a análise filogenética realizada mostrou que estas seqüências pertencem a uma mesma subfamília, para a qual se acreditava existirem poucas seqüências. D. saltans parece ser a única espécie do grupo que ainda apresenta uma seqüência P que pode ser considerada transcricionalmente ativa, e provavelmente transposicionalmente ativa, por possuir transcritos que codificam para a transposase e para a proteína repressora da transposição. A comparação do número de substituições ocorridas ao longo do tempo nas seqüências P transcritas, e em seqüências de Adh, sugere que as seqüências P transcritas em D. saltans e D. prosaltans provavelmente estavam presentes no ancestral do subgrupo saltans; sugere também que a seqüência P transcrita em D. sturtevanti pode ter sido transmitida horizontalmente a partir de D. saltans. Além do estudo do elemento P, outros elementos transponíveis foram avaliados quanto a sua distribuição e o seu número de cópias em espécies do grupo saltans. O elemento mariner não parece ser amplamente distribuído nas espécies do grupo, enquanto que os elementos copia, gypsy, micropia, I, hobo, Minos e Bari-1 estão presentes nas espécies dos cinco subgrupos deste grupo de Drosophila.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Nathalia de Setta Costa - Integrante / Juliana Polachini de Castro - Integrante / Cláudia Márcia Ap Carareto - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 1

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Prêmios

2018

Menção honrosa - Orientação de trabalho no XVI Simpósio de BECN, UFABC.

2017

Melhor Pôster de Pós-graduação no VI Simpósio Brasileiro de Biologia Molecular de Plantas (Orientadora), Sociedade Brasileira de Genética.

2008

Grant for young scientists from under-represented countries, Société Française de Génétique.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Federal do ABC, Centro de Ciências Naturais e Humanas. , Rua Arcturus, 03, Bloco Delta, Sala 283, Jardim Antares, 09606070 - São Bernardo do Campo, SP - Brasil, Telefone: (11) 23206306, URL da Homepage:

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Experiência profissional

2009 - 2012

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista recém-doutor, Enquadramento Funcional: Pós-doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2006 - 2009

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Aluno de Pós-graduação, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2005 - 2006

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Aluno de Pós-graduação, Enquadramento Funcional: Doutorando, Carga horária: 20

2003 - 2005

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Aluno de Pós-graduação, Enquadramento Funcional: Mestrando, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2001 - 2002

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Iniciação Científica realizada no Departamento de Biologia UNESP - Ibilce.

2000 - 2001

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Estágio, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 20, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Estágio básico realizado no Departamento de Biologia, UNESP - Ibilce.

Atividades

  • 03/2003

    Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Linhas de pesquisa

  • 01/2005 - 12/2005

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Cargo ou função, Membro do Conselho PPG-Genética SJRP.

  • 08/2001 - 08/2002

    Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Linhas de pesquisa

  • 08/2001 - 08/2002

    Estágios , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Estágio realizado, Inicição Científica: Estudo dos componentes do valor adaptativo da mosca-do-figo Zaprionus indianus.

  • 09/2000 - 03/2001

    Estágios , Instituto de Biociências Letras e Ciências Exatas de São José do Rio Preto, .,Estágio realizado, Estágio Basico: Técnicas e Conhecimentos Básicos em Drosophila.

2009 - 2009

Institut National de la Recherche Agronomique

Vínculo: Pós-doutorando, Enquadramento Funcional: Pesquisador Visitante, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 11/2009 - 12/2009

    Treinamentos ministrados , Centre National de Ressouces Genomiques Vegetales, .,Treinamentos ministrados, Desenvolvimento de um pool 3D da biblioteca de cana-de-açucar SCHRBa para seleção de clones de BACs

2006 - 2007

Centre National de la Recherche Scientifique

Vínculo: Estágio de Doutoramento, Enquadramento Funcional: Estudante de pós-graduação, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Doutorado sanduíche no Laboratoire de Evolution, Genomes et Speciation sob orientação Prof Pierre Capy e Profa Dra Françoise Lemeunier

Atividades

  • 10/2006 - 03/2007

    Estágios , Gyf-sur-Yvette UPR 9034, .,Estágio realizado, Estágio de Doutoramento entitulado: Análise dos sítios de inserção dos retrotransposons copia, micropia e gypsy em populações de Zaprionus indianus resistentes e susceptíveis a inseticidas.

2005 - 2006

Centro Educacional Rio Preto

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor titular, Carga horária: 20

Atividades

  • 02/2005 - 02/2006

    Ensino,,Disciplinas ministradas, Ciências

  • 08/2005 - 11/2005

    Treinamentos ministrados , Centro Educacional Rio Preto, .,Treinamentos ministrados, Orientação de estágio curricular para o curso de Licenciatura em Ciências Biológicas da UNESP-IBILCE

2018 - Atual

Universidade Federal do ABC

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto IV, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2016 - 2018

Universidade Federal do ABC

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto III, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2014 - 2016

Universidade Federal do ABC

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto II, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2012 - 2014

Universidade Federal do ABC

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto I, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 05/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro de Ciências Naturais e Humanas, .,Cargo ou função, Coordenação do Programa de Pós-graduação em Evolução e Diversidade - Representante Docente Titular.

  • 03/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro de Ciências Naturais e Humanas, .,Cargo ou função, Membro Titular da Coordenação do PPG Biotecnociência da UFABC Período: Março/2017-Fevereiro/2020..

  • 07/2015

    Ensino, Biotecnociência, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular e Biotecnologia

  • 06/2013

    Ensino, Evolução e Diversidade, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Genética de Populações e Microevolução / Genômica Comparada

  • 01/2013

    Ensino, Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Celular / TCC em Biologia / Genética I

  • 02/2012

    Pesquisa e desenvolvimento , Centro de Ciências Naturais e Humanas, .,Linhas de pesquisa

  • 02/2012

    Ensino, Bacharelado em Ciencia e Tecnologia, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bases Experimentais das Ciências Naturais / Iniciação à Pesquisa Científica II / Projeto Dirigido / Transformações Bioquímicas

  • 06/2016 - 08/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Fundação Universidade Federal do ABC, .,Cargo ou função, Coordenador da disciplina de Base Experimental das Ciências Naturais - BCT.

  • 09/2014 - 05/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Fundação Universidade Federal do ABC, .,Cargo ou função, Comitê do Programa de Iniciação Científica - Representante do CCNH..

  • 05/2015 - 04/2017

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Centro de Ciências Naturais e Humanas, .,Cargo ou função, Coordenação do Programa de Pós-graduação em Evolução e Diversidade - Representante Docente Suplente..

  • 11/2012 - 05/2016

    Extensão universitária , Fundação Universidade Federal do ABC, .,Atividade de extensão realizada, Tutoria PEAT (Projeto de Ensino-Aprendizagem Tutorial)..

  • 09/2015 - 11/2015

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Fundação Universidade Federal do ABC, .,Cargo ou função, Comissão de seleção do PPG em Evolução e Diversidade - Presidente..

  • 04/2013 - 05/2013

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Fundação Universidade Federal do ABC, .,Cargo ou função, Comissão Eleitoral da Coordenação do PPG em Evolução e Diversidade - Presidente..