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Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Londrina (1985), mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (1990), doutorado em Biologia Molecular - Gesellshaft Fur Biotechnologische Forshung, Braunschweig, Alemanha (1994), pós-doutorado em Biologia Molecular pela Universidade de Rochester, NY, EUA (1997), e livre-docência pelo Departamento de Bioquímica, USP (2004). Atualmente é professora associada III da Universidade de São Paulo. Tem experiência nas áreas de Bioquímica, Biologia Molecular e Genética, com ênfase em Controle Pós-Transcricional de Expressão Gênica, atuando principalmente nos seguintes temas: Síntese de Ribossomos, Processamento de RNA, Interação Proteína-Proteína, Interação Proteína-RNA, Splicing de Pré-mRNAs e Estrutura de Proteínas. É membro da SBBq (Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular), da SBG (Sociedade Brasileira de Genética), da ASBMB (American Society for Biochemistry and Molecular Biology), e da RNA Society. Mais informações: http://www2.iq.usp.br/docente/ccoliv/
Informações coletadas do Lattes em 23/06/2020
Acadêmico
Formação acadêmica
Doutorado em Biologia Molecular
1990 - 1994
Gesellshaft Fur Biotechnologische Forshung
Título: Translational Control in Yeast: The Roles of mRNA Leader Sequence and Structure
Orientador: John E G. McCarthy
Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: Controle de tradução; Estrutura de RNA; Expressão Gênica; Eucariiotos.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
Mestrado em Genética e Biologia Molecular
1986 - 1990
Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Título: Clonagem e Caracterização do Gene da Enterotoxina Termo-Estável (STIa) de Escherichia coli de Origem Suína,Ano de Obtenção: 1990
Orientador: Diógenes Santiago Santos
Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: E coli enterotoxigenica; toxina termo-estável.Grande área: Ciências BiológicasSetores de atividade: Produtos e Processos Biotecnológicos.
Pós-doutorado
2004
Livre-docência. , Universidade de São Paulo, USP, Brasil. , Título: Caracterização de Proteínas envolvidas em Processamento de RNA em Saccharomyces cerevisiae, Ano de obtenção: 2004., Palavras-chave: Expressão Gênica; Interação Proteína-RNA; Interação proteína-proteína; Processamento de RNA; Saccharomyces cerevisiae; Estrutura de proteínas. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
1995 - 1996
Pós-Doutorado. , University of Rochester, UR, Estados Unidos. , Bolsista do(a): National Institutes Of Health, NIH, Estados Unidos. , Grande área: Ciências Biológicas
Idiomas
Inglês
Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.
Espanhol
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Alemão
Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.
Áreas de atuação
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular/Especialidade: Controle de Expressão Gênica.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Biologia Molecular.
Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.
Participação em eventos
19th International Conference on Biological Inorganic Chemistry. Imine-, thiosemicarbazone- and pyridine-based ligands for copper(II): consequences on DNA binding and nuclease activity. 2019. (Congresso).
RiboClub 20th Anniersary & Canada Gairdner International Symposium. Insights into the role of Nop53 during nuclear pre-60S maturation stages. 2019. (Congresso).
RNA 2019. Ribosome maturation factor Nop53 controls association of the RNA exosome with pre-60S particles. 2019. (Congresso).
SBBq 2019. Chromatin quantitative proteomics analysis of tumor cells stimulated with FGF2 detects alterations in ribosome profile and nucleolus structure. 2019. (Congresso).
2018 International Ribosome Synthesis Conference. Analysis of the interactions between Nop53 and other processing factors within eukaryotic pre-60S ribosomal subunit. 2018. (Congresso).
35 Semana da Química, IQ-USP.65 Anos da Estrutura do DNA. 2018. (Simpósio).
47th Annual Meeting of the SBBq. STUDY OF THE CELLULAR TRANSPORT MECHANISM OF THE EXOSOME SUBUNITS IN Saccharomyces cerevisiae. 2018. (Congresso).
RNA 2018. Insights into the interaction of Nop53 with the RNA exosome. 2018. (Congresso).
46th Annual Meeting of Brazilian society for Biochemistry and Molecular Biology. Identification of the Karyopherins Responsible for the Nuclear Transport of the Exosome Subunit Rrp44 in Saccharomyces cerevisiae.. 2017. (Congresso).
I Workshop in Microbial Molecular Biology.Nop53 Regulates ribosomal maturation by interacting with the Nuclear Exosome Subunit Rrp6. 2017. (Simpósio).
RNA 2017. Identification of Karyopherins involved in the nuclear import of RNA exosome subunit Rrp6 in Saccharomyces cerevisiae. 2017. (Congresso).
RNA 2016. Nop53 Regulates Processing of pre-rRNA Processing by interacting with the Nuclear Exosome Subunit Rrp6. 2016. (Congresso).
Splicing 2016. The role of posttranslational modification of Cwc24 in its interactions with other splicing factors. 2016. (Congresso).
10th EMBO Conference on Ribosome Synthesis. Proteomic Analysis of Yeast RNA Exosome Complexes Purified with Rrp43 or Rrp6. 2015. (Congresso).
Biomod. Protomatos - DNA Cage. 2015. (Olimpíada).
RNA 2015. Nop17 is a key R2TP factor for the assembly and maturation of box C/D snoRNP complex. 2015. (Congresso).
RNA 2014. RRP43 temperature sensitive mutants affect exosome assembly and the interaction between the complex and other cellular proteins. 2014. (Congresso).
RNA 2013. Identification of proteins co-purifying with the yeast RNA exosome and their effect on the complex stabilization. 2013. (Congresso).
10th International Congress on Cell Biology and 16th Congress of the Brazilian Society for Cell Biology. Identification of proteins regulating the RNA exosome. 2012. (Congresso).
28 Reunião de Genética de Microorganismos. Regulation of gene expression. 2012. (Congresso).
58 Congresso Brasileiro de Genética. 2012. (Congresso).
Ribosome Synthesis. Cwc24p stabilizes U2 snRNP binding to pre-U3 snoRNA during maturation. 2012. (Congresso).
RNA 2012. Cwc24p is a Saccharomyces cerevisiae general splicing factor required for the stable U2 snRNP binding to pre-RNAs. 2012. (Congresso).
Eukaryotic mRNA Processing. The essential nucleolar yeast protein Nop8p controls the exosome function during 60S ribosomal subunit maturation. 2011. (Congresso).
XL Annual Meeting of SBBq. 2011. (Congresso).
Ribosomes 2010. Utp25p, a novel nucleolar Saccharomyces cerevisae protein interacts with SSU processome ubunits anda affects processing of the 35S pre-rRNA. 2010. (Congresso).
RNA 2010. Study of the exosome activity regulation in yeast. 2010. (Congresso).
Ribosome Synthesis. Identification of archaeal proteins that affect the exosome function in vitro. 2009. (Congresso).
RNA 2009. Sdo1p, the yeast ortholog of Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein binds RNA and interacts with nuclear rRNA processing factors. 2009. (Congresso).
RNA 2009. Identification of archaeal proteins that affect the exosome function in vitro. 2009. (Congresso).
Experimental Biology 2008. Cwc24p, a novel Saccharomyces cerevisiae RING-finger protein, affects U3 snoRNA splicing and rRNA processing. 2008. (Congresso).
RNA 2008 - Thirteenth Annual Meeting of the RNA Society. Sdo1p, the yeast ortholog of Shwachman-Bodian-Diamond Syndrome protein binds RNA and interacts with nuclear rRNA processing factors. 2008. (Congresso).
RNA 2008 - Thirteenth Annual Meeting of the RNA Society. Nop53p interacts co-transcriptionally with the 5.8S rRNA and regulates processingof pre-rRNA by the exosome. 2008. (Congresso).
XXXVII Annual Meeting of SBBq and XI congress of the PABMB. Functional characterization of the S. cerevisiae nucleolar protein Nop8. 2008. (Congresso).
Ribosomes 2007. RNA interaction, structure analysis and complex formation by the ribosome biogenesis protein Nip7p. 2007. (Congresso).
RNA 2007, 12th Annual Meeting of the RNA Society. Cwc24p, a novel S. cerevisiae RING-finger protein, connects pre-rRNA processing with splicing. 2007. (Congresso).
RNA 2007, 12th Annual Meeting of the RNA Society. Nop53p interacts co-transcriptionally with the pre-rRNA, binding to the 5.8S rRNA. 2007. (Congresso).
XXXVIa Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Characterization of a novel RING-finger protein involved in ribosomal RNA processing in Saccharomyces cerevisiae. 2007. (Congresso).
XXXVIa Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Functional Analysis of Nip7p, a Conserved Protein Involved in pre-RNA Processing in S. cerevisiae. 2007. (Congresso).
XXXVIa Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Nop53p interacts co-transcriptionally with the pre-rRNA, binding directly to the 5.8S rRNA. 2007. (Congresso).
XXXVIa Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Analysis of the Saccharomyces cerevisiae exosome architecture and of the RNA binding activity of Rrp40p. 2007. (Congresso).
Ribosome Synthesis 2006. The Pyrococcus Exosome Complex: Functional and Structural Characterization. 2006. (Congresso).
XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Funcitonal Analysis of Nip7p, a Conserved Protein Involved in pre-RNA Processing in Saccharomyces cerevisiae. 2006. (Congresso).
XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Translational control of PPARb. 2006. (Congresso).
XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. 2006. (Congresso).
Participação em bancas
Oliveira, Carla Columbano; FORTI, F. L.;COLTRI, P. P.; CANO, M. I. N.. Estudos funcionais e biológicos associados à interação de DUSP3 com a proteína HNRNPC1/C2. 2019. Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; STRAUS, A. H.; PADILLA, G.; HERNANDEZ, A.. Estudo dos mecanismos de perturbação da manutenção das paredes celulares fúngicas mediados por esteróis anormais. 2019. Dissertação (Mestrado em Ciências (Biologia da Relação Patógeno-Hospedeiro)pgbmp@icb.usp.br) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C; MARQUES, M. V.; MARTINEZ, C. E. A.. Estudo da RNA helicase da família DEAD-box codificada pelo gene CC0835 em Caulobacter crescentus. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; ZANELLI, C. F.; BENGTSON, M. H.. Análise da relação funcional entre elF5A e o fator de transcrição Hac1 na levedura Saccharomyces cerevisiae. 2017. Dissertação (Mestrado em BIOCIÊNCIAS E BIOTECNOLOGIA APLICADAS À FARMÁCIA,) - Universidade Estadual Paulista.
Oliveira, Carla Columbano; ALMEIDA, S. V.; Nakaya, HTI; NAKAYA, M. G. I.. Estudo da regulação por microRNAs do RNA longo não codificador de proteínas TUG1 envolvido em processos tumorigênicos. 2016.
Haddad, LA; Gorab, E;OLIVEIRA, C. C.. Levantamento de proteínas candidatas a ativadoras do spling do exon 12 do gene FMR1. 2014. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C.; Aline Maria da Silva; Bertolini, MC. Análise de interações da subunidade catalítica da fosfatase do tipo 1 de Dictyostelium discoideum identificadas através do sistema de duplo-hpibrido em leveduras. 2010. Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Maragno, ALGC; GOMES, M. D.; LODI, W. R. N.;OLIVEIRA, C. C.. Caractericação de FBX025, uma nova E3 ligase análoga a Atrogin-1. 2007. Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Clonagem e caracterização do gene Pumilio de Arabidopsis thaliana. 2002. Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.; Claudio M. Costa Neto; João B. Pesquero. Efeitos da inativação do fator 4E de início de síntese proteíca (eIF4E) em Saccharomyces cerevisiae. 2002. Dissertação (Mestrado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.Sandro R. ValentiniBeatriz A. Castilho. clonagem do gene YPT1 como sinteticamente letal com TIF51A, gene codificador de eIF5A em Saccahromyces cerevisiae. 2002. Dissertação (Mestrado em Química) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
OLIVEIRA, C. C.. Caracterização do gene SIF5A de Saccharomyces cerevisiae e análise da sua interação com o gene codificador de eIF5A. 2001. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista.
Oliveira, Carla Columbano; COSTA, E. T.; OSORIO, C. A. B. T.; BEGNAMI, M. D. F. S.; HAJJ, G. N. M.. ANÁLISE DE FATORES DO CONTROLE TRADUCIONAL NO CARCINOMA INVASIVO DA MAMA E ESTRUTURAÇÃO DE METODOLOGIA DE TRANSLATÔMICA PARA AMOSTRAS TUMORAIS HUMANAS. 2019. Tese (Doutorado em Oncologia) - Fundação Antônio Prudente.
Oliveira, Carla Columbano; ZANELLI, C. F.; HAJJ, G. N. M.; Jörg Kobarg; BENGTSON, M. H.. ESTUDO DO IMPACTO DA FUNÇÃO DO FATOR DE INÍCIO DE TRADUÇÃO DE EUCARIOTOS (elF5A) NO PERFIL PROTEÔMICO CELULAR UTILIZANDO O MODELO DE SACCHAROMYCES CEREVISIAE. 2019. Tese (Doutorado em Biociências e Biotecnologia Aplicadas à Farmácia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Oliveira, Carla ColumbanoColtri, Patricia P; CELLA, N.; JAEGER, R. G.; TONELLI, R. R.. Mecanismo molecular do tráfego núcleo-citoplasmático de maspina. 2018. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; ALMEIDA, S. V.; MALNIC, B.; PEREIRA, L. V.; YAN, C. Y. I.. Caracterização do HIPSTR destaca o padrão de expressão heterogênea de lncRNAs em embriões humanos e linhagens estáveis de células. 2016. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C; ALMEIDA, S. V.; BASSERES, D. S.; VIOLA, J. P. B.; TERSARIOL, I. L. S.. INXS, um longo RNA não codificador de proteínas mediador de apoptose. 2015. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla ColumbanoBeatriz A. Castilho; Schenkman, S;Sandro R. Valentini; SABBAGA, M. C. B. E.. Proteínas ligantes de Yih1/IMPACT: Relevãncia biológica dessas interações. 2014. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; Schenkman, S; SCHECHTMAN, D.; MIGUEL, D. C.. Caracterização de uma proteína quinase do fator de início de tradução, eIF2alfa, regulada por heme e envolvida no controle do crescimento e diferenciação de Trypanonsoma cruzi. 2014. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
Terra, WR;Oliveira, Carla Columbano; TANAKA, A. S.; SALINAS, R. K.; SIVIERO, F.. Fiisiologia molecular intestinal de Tenebrio molitor. 2013. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C; MACK, M.; CARMONA, E. C.. Riboflavin analogs from Streptomyces davawensis as antiinfectives: mode of action, mehanism of resistance of the producer and metabolization by humans. 2012. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Microbiologia Aplicada)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
OLIVEIRA, C. C.; MEYER, D.; MATIOLI, S. R.; LEITE, S. R. P.; A.S. JUNIOR, W.. Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano. 2012. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biologia Genética)) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; ALMEIDA, S. V.; BASSERES, D. S.; CARRARO, D. M.; BRENTANI, H. P.. Recrutamento do complexo repressivo polycomb2 pelo RNA não codificador longo antissenso ANRASSF1 modula a expressão do gene RASSF1A e a proliferação celular. 2012. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
SOUZA, S. J.;Oliveira, Carla Columbano; DIAS NETO, E.; LIMA, A. M.; DURHAM, A. M.. Estudo da poliadenilação alternativa: efeito dos polimorfismos nos elementos em cis no RNA e de transcritos em antisenso. 2012. Tese (Doutorado em Bioinformática) - Universidade de São Paulo.
TERRA, C. F.;Oliveira, Carla Columbano; WINTER, C. E.; MACHADO, E. A.. Proteínas envolvidas na secreção microapócrina na lagarta de Spodoptera frugiperda (Lepidoptera). 2012. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; MARTINEZ-ROSSI, N. M.; Gomes SL; SIMOES, Z. L. P.; SILVA JUNIOR, W. A.. Análise do perfil transcricional do dermatófito Trichophyton rubrum durante a interação com o agente inibidor acriflavina. 2012. Tese (Doutorado em Genética USP-RP) - Universidade de São Paulo.
CRUZ, A. K.;Oliveira, Carla C.; SILVA, C. V.; KRIEGER, M. A.; GOMES, M. D.. Investigação do papel da proteína ribossômica L19 no controle da expressão de genes em Leishmania. 2011. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C.; Valentini SR. Análise da interação funcional de eIF5A com a tradução, repressão da tradução e degradação de mRNA em Saccharomyces cerevisiae. 2011. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Mazzon, R.R.; MARQUES, M. V.;Oliveira, Carla C.; BALDINI, R. L.; GALHARDO, R. S.. Estudo de genes de Caulobacter crescentus importantes para a sobrevivência em baixas temperaturas. 2011. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.
Beatriz A. CastilhoOliveira, Carla C; Jörg Kobarg; MALNIC, B.. Controle da síntese de proteínas em neurônios: papel da proteína IMPACT. 2011. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
Oliveira, Carla C.; BARROS, M. H.; NOBREGA, F. G.; Maia, I.G.; NETTO, L. E. S.. Caracterização funcional da proteína Coq10p de Saccharomyces cerevisiae na atividade respiratória da coenzima Q. 2010. Tese (Doutorado em Pós-graduação em Microbiologia) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C.ZANCHIN, N. I. T.; Valentini SR; BARROS, M. H.; Barros, F.H.. Estudo do papel de eIF5A na síntese protéica. 2010. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
KOWALTOWSKY, A. J.; PINTO, N. C.; BONATTO, D.; KASUDA, C. A.;Oliveira, Carla C.. Restrição calórica e mitocôndrias: papel no envelhecimento de Saccharomyces cerevisiae. 2010. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Identificação e caracterização de RNA mensageiros candidatos a alvo de proteínas pumilio de Arabdopsis através do sistema do triplo-híbrido de levedura. 2009. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C.; TERRRA, W. R.; CUCCOVIA, I. M.; Oliveira, P.L.; CAPURRO, M. L.. Fisiologia molecular digestiva de Musca domestica (Diptera). 2009. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Terra, WR;OLIVEIRA, C. C.; L HO, P.; Schenkman, S; TANAKA, A. S.. Estrutura e função das cisteína proteínases intestinais de Tenebrio molitor. 2009. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
PADOVAN, A. C. B.;OLIVEIRA, C. C.; BRIONES, M. R. S.; PUCCIA, R.; REIS, S. F.; CISALPINO, P. S.. Estudo da evolução molecular de seqüências de rDNA 18S aplicado à investigação de fatores de patogenicidade do filo Ascomycota. 2008. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Análise da região promotora e do fator protéico ZFAR1 de regulação da expressão transcricional do gene APUM-2 de Arabdopsis thaliana. 2008. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
MALNIC, B.;OLIVEIRA, C. C.. RIC-8B, uma GEF putativa do sistema olfatório, interage com Galfa-olf, Gbeta-1 e G gama-13. 2008. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Nakaya, HTI; ALMEIDA, S. V.;OLIVEIRA, C. C.. Identificação e análise de expressão de RNAs intrônicos não codificadores humanos. 2007. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Favaro, E.C.; QUAGGIO, R. B.;OLIVEIRA, C. C.; COLEPICOLO, P.; van Sluys, M.A.; PINNA, G. F. A. M.. Estudo da função dos genes pumilio de Arabidopsis durante o desenvolvimento vegetal. 2007. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Análise da interação funcional entre as proteínas eIF5a e Ypt1 em S. cerevisiae. 2007 - Universidade Estadual Paulista.
OLIVEIRA, C. C.. Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas. 2007 - Instituto de Matemática e Estatística.
OLIVEIRA, C. C.. Análise funcional e estrutural da proteína Pub1 em Saccharomyces cerevisiae. 2007. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
OLIVEIRA, A. D.; ARMELIN, H. A.;OLIVEIRA, C. C.. FGF-2: estudo de estrutura e função. 2007. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
PINHEIRO, M. M.; MENCK, C. F.;OLIVEIRA, C. C.. Busca por genes relacionados a fenótipos mutadores em Caulobacter crescentus. 2007. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.
MORAES, M. C. S.;Beatriz A. CastilhoOLIVEIRA, C. C.. TbeIF2K2, uma nova quinase de eIF2alfa associada à membrana da bolsa flagelar de Trypanosoma brucei. 2007. Tese (Doutorado em Micro-Imuno-Parasitologia) - Universidade Federal de São Paulo.
ASPRINO, P. F.; ARMELIN, H. A.;OLIVEIRA, C. C.. Análise de expressão gênica por microarrays de cDNA em linhagens de células adrenais tumorigênicas tratadas com FGF2 e ACTH. 2006. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
ZANELLI, C. F.;Sandro R. ValentiniOLIVEIRA, C. C.. Caracterização funcional de eIF5A: análise genética e molecular utilizando o modelo de Saccharomyces cerevisiae. 2006. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
ITALIANI, V. C. S.; MARQUES, M. V.; BALDINI, R. L.; GUEIROS FILHO, F. J.;OLIVEIRA, C. C.; MENCK, C. F.. Caracterização do fator de terminação de transcrição Rho de Caulobacter crescentus. 2006. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.; FARAH, S. C.; Ferreira, H.; FERREIRA, R. C. C.; Aline Maria da Silva. Identificação das interações envolvendo proteínas relacionadas aos sistemas de dois-componentes e aos sistemas secretórios do tipo III e IV do fitopatógeno Xanthomonas axopodis pv citri. 2006. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; Gomes SL. Análise da expressão gênica global durante a germinação do fungo aquático Blastocladiella emersonii. 2006. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; Gomes SL. Análise da expressão gênica em resposta ao choque térmico e cádmio no fungo aquático Blastocladiella emersonii. 2006. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Aline Maria da Silva;Beatriz A. CastilhoOLIVEIRA, C. C.; FERRO, E. S.; MARANA, S. R.. Caracterização molecular da proteína DdI-2 e mapeamento de seus domínios de interação com a proteína fosfatase do tipo I de Dictyostelium discoideum. 2005. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.; TERRA, C. F.. Caracterização da Trealase Intestinal da Larva de Tenebrio molitor e Clonagem do cDNA que a Codifica.. 2005. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.; MARQUES, M. V.. Caracterização dos Genes que Codificam Proteínas com Domínio de Choque Frio em Caulobacter crescentus. 2005. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.; GUEIROS FILHO, F. J.; FARAH, S. C.; BALDINI, R. L.; SLUYS, M. A. V.. Identificação de interações proteína-proteína envolvendo os produtos dos loci hrp, vir e rpf de Xanthomonas axonopodis pv. citri. 2004. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
Beatriz A. CastilhoOLIVEIRA, C. C.Sandro R. Valentini. Caracterização biofísica e funcional de Gir2, uma proteína altamente acídica de Saccharomyces cerevisiae. 2004. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.; Jörg Kobarg; Marcelo Menossi Teixeira; Christine Hackel; Kleber Gomes Franchini. Estudo funcional e estrutural da proteína humana AUF1. 2003. Tese (Doutorado em Biologia Funcional e Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.
OLIVEIRA, C. C.. Interações protéicas no fator de início de tradução eIF2. 2003. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Aspectos evolutivos e funcionais do gene thi1 de Arabdopsis thaliana. 2003. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Microbiologia)) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Estrutura, expressão e análise funcional do gene codificando Calmodulina no fungo aquático Blastocladiella emersonii. 2000. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Expressão do operon de choque térmico groESL durante o ciclo celular de Caulobacter crescentus. 1999. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Clonagem e caracterização da serina/treonina fosfatase do tipo 1 (PP1) de Dictyostelium discoideum. 1999. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Estudo da possível função do gene essencial ARH1 de Saccharomyces cerevisiae. 1999. Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Caracterização de uma nova função mitocondrial. Clonagem e estudo de dois genes essenciais de Saccharomyces cerevisae. 1999. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Análise mutacional da região amino-terminal da subunidade beta do fator 2 de início de tradução (eIF2). 1998. Tese (Doutorado em Microbiologia e Imunologia) - Universidade Federal de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; SCHRANK, I. S.; FRANCO, G. R.. Concurso Público para Contratação de Docentes. 2013. Universidade Federal do Rio Grande do Sul.
Oliveira, Carla C.; FERREIRA, A. M. C.; SILBER, A. M.; CAMARGO, A.; UHLRICH, A. H.. Concurso público para contratação de docentes. 2010. Instituto de Química, Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; YAN, C. Y. I.; MARIA-ENGLER, S. S.; PORCIONATTO, M.; HAMASSAKI, D. E.. Livre-Docência em Biologia Celular e do Desenvolvimento. 2019. Universidade de São Paulo.
MACHINI, M. T.;Oliveira, Carla C; Jörg Kobarg; TERENZI, H. F.; GARRAT, R. C.. Concurso de Livre-Docência. 2014. Universidade de São Paulo.
BARROS, M. H.;OLIVEIRA, C. C.. Saccharomyces cerevisiae como modelo para estudo da biogênese mitocondrial. 2012. Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo.
Reis, E;Oliveira, Carla C.. Concurso de Livre-Docência. 2011. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C; BARROS, M. H.; VALENTE, V.. Exame de Qualificação - Doutorado. 2019. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.
Oliveira, Carla Columbano; CAMARGO, A.; GUEIROS FILHO, F. J.. Banca de Qualificação - Mestrado. 2019. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; MALNIC, B.; Salinas RK. Exame de Qualificação - Mestrado. 2019. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C; BASSERES, D. S.; CUCCOVIA, I. M.. Exame de qualificação - doutorado. 2018. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; JAEGER, R. G.; FIORE, A. P. Z. P.. Banca de qualificação Doutorado. 2017. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; SALINAS, R. K.; CARDOSO, A. B.. Banca de qualificação Mestrado. 2016. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; Reis, E; STEVANI, C. V.. Banca de Qualificação Doutorado. 2016. Instituto de Química, Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; ALVES, M. J. M.; MEOTTI, F. C.. Banca de qualificação mestrado. 2015. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; FERREIRA-JUNIOR, J. R. S.; PASCON, R. C.. Banca de qualificação mestrado. 2015. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; BARROS, M. H.; ARAUJO, W. L.. Banda de qualificação Mestrado. 2015. Instituto de Ciências Biomédicas, Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano. Banca de qualificação doutorado. 2014.
Oliveira, Carla Columbano; SALINAS, R. K.; SETUBAL, J. C.. Banca de qualificação doutorado. 2013. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; Gomes SL; UHLRICH, A. H.. Banca de qualificação doutorado. 2013. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; PINTO, N. C.; RIBEIRO, A. M. C.. Banca de qualificação doutorado. 2013. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla Columbano; UHLRICH, A. H.; CUCCOVIA, I. M.. Banca de qualificação mestrado. 2013. Universidade de São Paulo.
Chaves, GAT;Oliveira, Carla C.. Banca de qualificação mestrado. 2012. Universidade de São Paulo.
MORELLO, L. G.;ZANCHIN, N. I. T.Oliveira, Carla C; Jörg Kobarg. Banca examinadora de análise prévia de trabalho de doutorado. 2012. Universidade Estadual de Campinas.
Durvalle MC;Oliveira, Carla C.; Gomes SL; Salinas RK. Banca de qualificação mestrado. 2012. Universidade de São Paulo.
Moreira NR;Oliveira, Carla C.. Banca de Qualificação Doutorado. 2011. Universidade de São Paulo.
Belchior, GG;Oliveira, Carla C; Reis, E; Giordano, R.. Banca de Qualificação - Produção de Fatores de Crescimento Endotelial Vascular Humano Recombinantes visando a geração de Biofármacos. 2010. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Estudo da expressão e localização subcelular de RNAs intrônicos não coidificadores em linhagens celulares tumorais utilizando hibridização in situ. 2009. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C.. Caracterização bioquímica e funcional de proteínas que interagem com a subunidade catalítica da fostatase do tipo 1 em D. discoideum. 2009. Universidade de São Paulo.
Oliveira, Carla C.. Determinação do papel das proteínas HsNip7, FtsJ3 e CXorf34 na síntese de ribossomos em células humanas. 2009. Universidade Estadual de Campinas.
MANTILLA, B. A. S.;OLIVEIRA, C. C.; Drafre, S.; Katzin, A.M.. Caracterização funcional e papel fisiológico da P5C-Dh de Trypanosoma cruzi. 2008. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Serina proteinases digestivas de insetos-modelo. 2008. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.; TERRA, C. F.; LEE HO, P.. Identificação de ligantes específicos aos receptores purinérgicos P2X2 e P2X4 através da técnica SELEX para estudo da diferenciação neuronal. 2005. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Estudo computacional de splicing alternativo e de seus elementos (reguladores) em cis. 2005. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Caracterização da Trealase Intestinal da Larva de Tenebrio molitor e Clonagem do cDNA que a Codifica. 2005. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Caracterização do fator de terminação de transcrição Rho de Caulobacter crescentus. 2005. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.Sandro R. Valentini; Jörg Kobarg. Caracterização estrutural e funcional de Pub1 quanto ao controle da estabilidade do mRNA de TIF51A. 2005. Universidade Estadual Paulista.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2004. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2004. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2004. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Análise funcinal das protéinas HrcA, DnaK/J e GroES/EL em Caulobacter crescentus. 2004. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Ligantes de miócitos cardíacos para a glicoproteína de 85 kDa (Tc-85) de Trypanosoma cruzi. 2004. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2004. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Variabilidade intratípica de HPV16 em relação à origem étnica e HLA de uma população de alto risco para o câncer do colo do útero. 2004. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2003. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2003. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2003. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2003. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2002. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2002. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2002. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2002. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2002. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2002. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2001. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2001. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2001. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2001. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2001. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2001. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 2000. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 1999.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 1999. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 1999. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 1998. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 1998. Universidade de São Paulo.
OLIVEIRA, C. C.. Banca de Qualificação. 1998. Universidade de São Paulo.
Comissão julgadora das bancas
ZAHA, Arnaldo. Clonagem e caracterização do gene da enterotoxina termo?estável de E. coli de origem suína. 1990. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul.
Orientou
Estudo dos mecanismos de transporte celular de subunidades do complexo exossomo em Saccharomyces cerevisiae; Início: 2017; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
Caracterização do papel de Nop17, membro do complexo R2TP, no sistema de montagem de proteínas Fe-S citosólicas (CIA) em Saccharomyces cerevisiae; Início: 2019; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
CARACTERIZAÇÃO DAS PROTEÍNAS NEURONAIS QUE INTERAGEM COM A SUBUNIDADE EXOSC8 (Rrp43) DO EXOSSOMO E REGULAM SUA ATIVIDADE; Início: 2018; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Estudo das Interações entre Nop53 e outros cofatores com o exossomo de S; cerevisiae; Início: 2017; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo; (Orientador);
Papel de Nop53 no controle da atividade do exossomo; Início: 2015; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; (Orientador);
O papel da fosforilação nas interações proteína-proteína na regulação do splicing em Saccharomyces cerevisiae; 2017; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo,; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo do papel da interação Dre2-Nop17 em Saccharomyces cerevisiae; 2015; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Caracterização da função molecular de Nop53p e de seu papel no controle do exossomo em Saccharomyces cerevisiae; 2014; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo das interações de Utp25 com outros componentes do complexo SSU processomo; 2013; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo do Exossomo de Archaea e de Sua Interação Com a Proteína Reguladora PaNip7; 2013; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo da montagem do complexo do exossomo de Saccharomyces cerevisiae; 2012; Dissertação (Mestrado em Bioquímica) - Instituto de Química, Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo das Interações entre as Subunidades do Complexo Exossomo em Saccharomyces cerevisiae; 2004; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo de Interações entre Subunidades do Exossomo e com outras Proteínas Celulares em Saccharomyces cerevisiae; 2001; Dissertação (Mestrado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Caracterização do papel de Nop17p na montagem de snoRNPs de box C/D; 2014; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo do papelo de modificações pós-traducionais de Cwc24 na regulação de splicing em Saccharomyces cerevisiae; 2013; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Caracterização funcional da proteína Nop8p de Saccharomyces cerevisiae; 2011; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Caracterização funcional da proteína Cwc24p de Saccharomyces cerevisiae; 2008; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Caracterização da função da proteína Nop53p de Saccharomyces cerevisiae; 2007; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Análise estrutural e funcional de cofatores do exossomo de Saccharomyces cerevisiae e Pyrococcus; 2006; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Caracterização da função da proteína Nop17p de Saccharomyces cerevisiae; 2005; Tese (Doutorado em Bioquímica Sp) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
2013; Instituto de Química, Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carla Columbano de Oliveira;
2012; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carla Columbano de Oliveira;
2010; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carla Columbano de Oliveira;
Caracteriação do Papel de Cwc24p em Splicing de pré-snoRNAs de box C/D em Leveduras e Mamíferoa; 2009; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carla Columbano de Oliveira;
2009; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carla Columbano de Oliveira;
2009; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carla Columbano de Oliveira;
Estrutura da proteína Rrp43p, um Componente do Exossomo de Saccharomyces cerevisiae; 2006; Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Carla Columbano de Oliveira;
Estudo dos mecanismos de transporte da subunidade Rrp44 do complexo exossomo em Saccharomyces cerevisiae; 2016; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciências Biomédicas) - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Análise do papel de cofatores do exossomo na expressão e estabilidade da exoribonuclease Rrp6 em Saccharomyces cerevisiae; 2014; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Farmácia e Bioquímica) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Mecanismos Biomoleculares da Memória; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Abi - Farmácia) - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Noncoding RNA: uma nova era no estudo da biologia molecular; 2012; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Abi - Farmácia) - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
ANÁLISE DA INFLUÊNCIA DE Prp19 NA UBIQUITINAÇÃO DE Cwc24 NO SPLICEOSSOMO EM SACCHAROMYCES CEREVISIAE; 2018; Iniciação Científica; (Graduando em Química Com Ênfase em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo das interações entre fatores de processamento de rRNA; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Identificação dos domínios de interação de Nop53 e Rrp6; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Química Com Ênfase em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo dos mecanismos de transporte celular da Subunidade Rrp44 do complexo exossomo em Saccharomyces cerevisiae; ; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo dos efeitos da depleção de Prp19 em componentes do spliceossomo de Saccharomyces Cerevisiae; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Química) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo da interação Nop53-Rrp6 em Saccharomyces cerevisiae; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Química Com Ênfase em Bioquímica e Biologia Molecular) - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Análise do papel de cofatores do exossomo na expressão e na estabilidade da exoribonuclease Rrp6 em Saccharomyces cerevisiae; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Abi - Farmácia) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
ANÁLISE DA INTERAÇÃO DA GTPASE SNU114 COM COMPONENTES DO SPLICEOSSOMO DE Saccharomyces cerevisae; 2014; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo funcional de Cwc24; 2013; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo de interações entre subunidades do exossomo; 2012; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Caracterização de novas proteínas de levedura com domínio G-patch; 2009; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo das proteínas de levedura codificadas pelos genes YLR271W e YNL224C, que contêm G-patch; 2009; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudos de interação de Cwc24 com outras proteínas celularres; 2009; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Identificação de fatores interagindo com Sdo1p, uma proteína essencial de Saccharomyces cerevisiae, potencialmente envolvida em processamento de rRNA; 2008; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Estudo de possíveis interações de Nop8p, uma proteína envolvida no processamento de rRNA em Saccharomyces cerevisiae, através do sistema do duplo-híbrido; 2008; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Expressão e Puirificação de Subunidades do Exossomo de S; crevisiae; 2006; Iniciação Científica - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
ESTUDO DA FUNCAO DA PROTEINA RRP43 NA DEGRADACAO DE mRNA; 2000; Iniciação Científica; (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Clonagem e caracterização de genes de proteínas envolvidos em processamento de mRNA em Saccharomyces cerevisae; 1999; Iniciação Científica; (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Carla Columbano de Oliveira;
Foi orientado por
Carla Columbano de Oliveira; 1989; 0 f; Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Diogenes Santiago Santos;
Identificação de mutantes da subunidade do exossomo Rrp43; 2015; Iniciação Científica; (Graduando em Ciências Biomédicas) - Universidade de São Paulo, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Bruna Ferreira Rech;
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OLIVEIRA, C. C. ; HEUVEL, J. J. V. D. ; MCCARTHY, J. E. G. . Inhibition of translational initiation in Saccharomyces cerevisiae by secondary structure: the roles of the stability and position of stem-loops in the mRNA leader. Molecular Microbiology (Print) , v. 9, n.3, p. 521-532, 1993.
OLIVEIRA, C. C. ; GOOSSEN, B. ; ZANCHIN, N. I. T. ; MCCARTHY, J. E. G. ; HENTZE, M. W. ; STRIPECKE, R. . Translational repression by the human iron-regulatory factor (IRF) in Saccharomyces cerevisiae. Nucleic Acids Research , v. 21, n.23, p. 5316-5322, 1993.
Outras produções
Oliveira, Carla Columbano . Estudo mostra como é regulado o complexo responsável pelo controle de qualidade dos RNAs nas células. 2019. (Programa de rádio ou TV/Comentário).
Oliveira, Carla Columbano . Pesquisa básica em genética ajuda a entender doenças hereditárias. 2013. (Programa de rádio ou TV/Entrevista).
Oliveira, Carla Columbano . Estágio Avançado em Bioquímica e Biologia Molecular. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Outra).
2016 - Atual
Estudo Funcional de Componentes do Exossomo e do Spliceossomo de Saccharomyces cerevisiae e de seu papel no Controle Pós-Transcricional de Expressão Gênica, Descrição: Projeto Temático - FAPESP A regulação dos processos pós-transcricionais tem seu papel no controle de expressão gênica cada vez mais evidente. A identificação dos fatores envolvidos nessas vias e o estudo de interações RNA-proteínas tornam-se, assim, essenciais para a elucidação dos processos de síntese, maturação e degradação de RNA. A vantagem de se utilizar levedura nesse estudo advém principalmente da possibilidade de manipulação genética de Saccharomyces cerevisiae, associada à possibilidade de se trabalhar com um organismo eucarioto que tem seu genoma completamente seqüenciado, o que torna a clonagem e a identificação de genes isolados muito mais eficientes. S. cerevisiae também apresenta vantagens para a análise bioquímica dos mecanismos de regulação, através de ensaios in vitro. As semelhanças já identificadas desses processos pós-transcricionais em levedura e mamíferos podem levar a um melhor entendimento dos mecanismos de controle de expressão gênica em eucariotos em geral.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): (FAPESP) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2011 - 2015
Estudo da Estrutura de Proteínas Componentes e Reguladoras do Exossomo de Archaea e de Levedura, Descrição: Projeto Temático dentro da chamada SMOLBNet2.0. Exossomo está presente em todos organismos desde archaea a eucariotos e participa do processamento e degradação de todos os tipos de RNA em eucariotos, desempenhando um importante papel no controle de expressão gênica. A estrutura do complexo de archaea já foi determinada, assim como de subcomplexos de humanos. Entretanto, a regulação da atividade do exossomo ainda não é bem conhecida. Em nosso laboratório, identificamos proteínas ativadoras (Nop53p) e inibidoras (aNip7), que ligam RNA, interagem com o exossomo e controlam sua atividade. A determinação das mudanças conformacionais causadas por proteínas que interagem com o exossomo será de extrema importância para o entendimento da regulação do complexo. Como o exossomo participa da maturação de rRNA no núcleo, degradando parcialmente pre-rRNAs e liberando rRNAs maduros, e atua na degradação completa de mRNAs citoplasmáticos, a caracterização de fatores que controlam sua atividade terá um importante papel no estudo de controle pós-transcricional de expressão gênica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador / Nilson I T Zanchin - Integrante / Beatriz G. Guimarães - Integrante / Melissa Jurica - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 3
2011 - 2012
Expressão e análise de proteinas relacionadas a doenças genéticas, Descrição: Edital Universal CNPq (479779/2010-4). , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Integrante / Nilson I T Zanchin - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
2009 - 2011
Caracterização Funcional das Proteínas de Saccharomyces cerevisiae, NOP17p e CWC24p, que estão Envolvidas em Processamento de RNA, Descrição: Auxílio à Pesquisa Através de estudos anteriores em nosso laboratório, identificamos e caracterizamos as funções de várias novas proteínas de Saccharomyces cerevisiae envolvidas em diferentes etapas de processamento de RNA, dentre elas, Nop17 e Cwc24, que conectam splicing e processamento de pré-rRNAs . Nop17 participa da montagem de um grupo específico de complexos de ribonucleoproteínas, os snoRNPs de box C/D (responsáveis por metilações de ribose nos rRNAs) . Através de sua interação com Nop17, Cwc24 deve ser recrutada co-transcricionalmente para os pré-snoRNAs de box C/D que contêm introns, e participa do splicing desses RNAs. Neste projeto, pretendemos continuar os estudos de caracterização funcional de Nop17 e de Cwc24 e determinar seus papéis em splicing de snoRNAs e de montagem de complexos de snoRNPs. Essas duas proteínas são conservadas entre levedura e humanos, e pretendemos também estender esses estudos para as ortólogas humanas, hNop17 e ZNF183.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 6
2008 - 2010
Caracterização Funcional de Proteínas de Saccharomyces cerevisiae Envolvidas em Processamento de RNA ? Papel de Nop8p e Kr071p na maturação do pré-60S, Descrição: Em eucariotos, todos os tipos de RNA são processados durante sua maturação e a eficiência dessas etapas tem um efeito direto no controle de expressão gênica. Os mRNAs sofrem a adição do cap na extremidade 5?, splicing e poliadenilação antes de seu transporte para o citoplasma, onde poderão ser traduzidos e finalmente degradados. Os snRNAs (que atuam em splicing), os tRNAs (tradução) e snoRNAs (processamento de rRNA) também passam por várias etapas de processamento. Estudos recentes têm demonstrado a importância de RNAs não codificantes no controle de meia-vida de mRNAs, como nas vias de RNAi (RNA de interferência), com efeito direto na regulação da expressão gênica. Os rRNAs (RNA ribossomais) também passam por várias etapas de maturação em eucariotos. Três dos rRNAs são transcritos como um precursor único, de 35S/45S (leveduras/mamíferos), que depois de processamento origina os rRNAs de 18S, 5,8S e 25S/28S, que, junto com o rRNA 5S, formarão as subunidades ribossomais maduras de 40S e 60S. Todas essas etapas envolvem interações específicas proteína-proteína e RNA-proteínas que vão determinar a eficiência e o tempo de tradução dos mRNAs, e portanto, são essenciais para o controle de expressão gênica. Da biogênese de ribossomos participam os rRNAs, proteínas ribossomais, snoRNPs e vários outros fatores (em um número estimado em 180 fatores em levedura). Em nosso laboratório, realizamos vários estudos de interação entre proteínas com o objetivo de identificar novos fatores envolvidos em processamento de rRNA. Esses estudos nos levaram à identificação de novas proteínas de Saccharomyces cerevisiae e à caracterização de suas funções: Nop17p interage com a subunidade do exossomo Rrp43p (Oliveira et al., 2002) e participa das etapas iniciais de processamento de rRNA de metilação de riboses em sítios específicos nos rRNAs (Gonzales et al., 2005). Nop53p interage com Nop17p e está envolvida nas etapas mais tardias de processamento de rRNA, possivelm. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.Número de orientações: 1
2006 - 2008
Caracterização Funcional de uma Nova Proteína de Saccharomyces cerevisiae pontencialmente Envolvida em Processamento de RNA, Descrição: Em eucariotos, todos os tipos de RNA passam por várias etapas de processamento para sua maturação e a eficiência com a qual essas etapas são cumpridas tem um efeito direto no controle de expressão gênica. Os mRNAs sofrem a adição do cap na extremidade 5?, splicing, poliadenilação antes de seu transporte para o citoplasma, onde poderá ser traduzido e finalmente degradado. Os snRNAs (que atuam em splicing), os tRNAs (tradução) e snoRNAs (participam do processamento de rRNA) também passam por várias etapas de processamento. Estudos recentes têm demonstrado a importância de RNAs não codificantes no controle de meia-vida de mRNAs, como nas vias de iRNA (RNA de interferência), com efeito direto na regulação da expressão gênica. Os rRNAs (RNA ribossomais) também passam por várias etapas de maturação em eucariotos. Três dos rRNAs são transcritos como um precursor único, de 35S/45S (leveduras/mamíferos), que depois de processamento origina os rRNAs de 18S, 5,8S e 25S/28S, que, junto com o rRNA 5S, formarão as subunidades ribossomais maduras de 40S e 60S. Todas essas etapas envolvem interações específicas proteína-proteína e RNA-proteínas que vão determinar a eficiência e o tempo de tradução dos mRNAs, e portanto, são essenciais para o controle de expressão gênica. Da biogênese de ribossomos participam os rRNAs, proteínas ribossomais, snoRNAs e vários outros fatores (em um número estimado em 150 proteínas em levedura). Em nosso laboratório, realizamos várias seleções com o sistema do duplo-híbrido para identificar proteínas envolvidas em diferentes etapas do processamento de rRNA. Esses estudos nos levaram à identificação de novas proteínas de Saccharomyces cerevisiae e à caracterização de suas funções. Nop17p interage com a subunidade do exossomo Rrp43p (Oliveira et al., 2002) e participa das etapas iniciais de processamento de rRNA de metilação de riboses em sítios específicos nos rRNAs (Gonzales et al., 2005). Nop53p interage com Nop17p e está envolvida nas etapas mais. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador / Daniela Campos Granato - Integrante / Mauricio Barbugiani Goldfeder - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
2003 - 2005
Caracterização de Novas Proteínas Envolvidas em Processamento de RNA em Saccharomyces cerevisiae, Descrição: Em eucariotos, três dos rRNAs são transcritos pela RNApol I no nucléolo como um precursor único, de 35S/45S (leveduras/mamíferos), que é processado, originando os rRNAs de 18S, 5,8S e 25S/28S, que formarão as subunidades ribossomais maduras. Todas essas etapas envolvem interações RNA-RNA e RNA-proteínas específicas que vão determinar a eficiência e o tempo de tradução dos mRNAs, e portanto, são determinantes para o controle de expressão gênica. Alguns dos fatores protéicos envolvidos nesses processos já foram identificados na levedura Saccharomyces cerevisiae e em outros eucariotos. Neste projeto, iniciamos a caracterização funcional das novas proteínas que interagem com Nop17p em S. cerevisiae e de seu papel no metabolismo de RNA. Os resultados obtiddos neste trabalho levaram a caracterização funcional da proteína codificada pelo gene YPL146C, agora denominada Nop53p. Nop53p participa da via de processamento dos rRNAs 5.8S e 25S, liga-se especificamente ao rRNA 5.8S e regula a função do exossomo. Iniciamos também experimentos para a caracterização funcional de outras proteínas que interagem com Nop17p e obtivemos dados que indicam que a proteína codificada pelo gene YLR323C também esteja envolvida em processamento de rRNA.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (4) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador / Fernando Alexis Gonzales Zubiate - Integrante / Juliana Silva da Luz - Integrante / Daniela Campos Granato - Integrante / Mauricio Barbugiani Goldfeder - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 10
2001 - 2007
SMOLB-Net - Estudo da Estrutura de Proteínas componentes do Exossomo de Saccharomyces cerevisiae, Descrição: Projeto Temático - FAPESP A principal linha de pesquisa em nosso laboratório visa o estudo do controle pós-transcricional de expressão gênica, concentrando-se na caracterização da função de algumas proteínas envolvidas em processamento e degradação de RNAs. Este trabalho tem como objetivo principal o estudo da estrutura de algumas dessas proteínas. Foram escolhidas como alvos proteínas de Archea homólogas às subunidades do exossomo e outras proteínas possivelmente associadas a processamento de RNA. Neste projeto visamos a definição de um modelo do complexo do exossomo em Archea a partir de dados de SAXS. Visamos também a caracterização funcional dessas proteínas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador / Juliana Silva da Luz - Integrante / Celso Raul Romero Ramos - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 5
2001 - 2004
Caracterização do Papel de Proteínas que Interagem com o Exossomo no Processamento de RNA em Saccharomyces cerevisiae, Descrição: Auxílio à Pesquisa. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador / Fernando Alexis Gonzales Zubiate - Integrante / Juliana Silva da Luz - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3
1998 - 2001
Controle Pós-Transcricional de Expressão Gênica: o Papel do mRNA, Descrição: Auxílio à Pesquisa. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Carla Columbano de Oliveira - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3
Prêmios
2017
Menção Honrosa do Prêmio Tese Destaque - Doutorado de Hans Eugene Waldenmaier, Universidade de São Paulo.
2016
Professora homenageada como madrinha da turma de formandos em Química em 2016, Instituto de Química - Universidade de São Paulo.
2015
Professora homenageada na colação de grau do curso de Farmácia e Bioquímica - Formandos 2014, Faculdade de Ciências Farmacêuticas - Universidade de São Paulo.
2014
Paraninfa dos formandos em Farmácia e Bioquímica turma 08N, Faculdade de Ciências Farmacêuticas - Universidade de São Paulo.
2013
Professora homenageada na colação de grau das turmas diurno e noturno do curso de Farmácia e Bioquímica, Faculdade de Ciências Farmacêuticas - Universidade de São Paulo.
1985
Medalha de honra ao mérito - melhor média na conclusão da graduação, Universidade Estadual de Londrina.
Histórico profissional
Endereço profissional
Universidade de São Paulo, Instituto de Química, Departamento de Bioquímica. , Av. Prof. Lineu Prestes, 748, Bloco 0 sup., Sala 28, Cidade Universitaria, 05508000 - São Paulo, SP - Brasil, Telefone: (11) 30919197, Fax: (11) 38155579, URL da Homepage:
Experiência profissional
1998 - Atual
Universidade de São PauloVínculo: Professor Doutor, Enquadramento Funcional: Professor associado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.
Atividades
Ensino, Bioquímica Sp, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular do Gene
Ensino,,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular, Bioquímica
Pesquisa e desenvolvimento , Instituto de Química, Departamento de Bioquímica.,Linhas de pesquisa
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