Marcelo Santos da Silva

Possui graduação em Ciências Biológicas (UNESP, Botucatu - 2009, bolsa FAPESP IC) e Doutorado em Genética e Biologia Molecular (UNICAMP - 2014, bolsa FAPESP DD) realizado sob supervisão da Dr. Maria Isabel N. Cano. Em 2013, realizou parte de seu doutorado (PhD sandwich) pelo Institut de Biologie Physico-Chimique no Centre National de la Recherche Scientifique (IBPC-CNRS), Paris, França (bolsa CAPES PDSE) sob a orientação da Dr. Maria Teresa Teixeira. De 2015 a 2019 realizou o pós-doutorado (bolsa FAPESP PD) no Instituto Butantan sob a supervisão da Dr. Maria Carolina Elias. De 2018 a 2019 realizou pós-doutorado pela Universidade de Glasgow, Glasgow, UK (bolsa BEPE-FAPESP), sob a supervisão do Dr. Richard McCulloch. Atualmente está aguardando julgamento da aplicação Jovem Pesquisador (JP) - FAPESP para desenvolver o projeto proposto. Tem grande experiência nas áreas de bioquímica, genética, biologia molecular, evolução, genética molecular de parasitos tripanosomatídeos, parasitologia e protozoologia, atuando principalmente em temas relacionado ao metabolismo de DNA como reparo, replicação, ciclo celular, homeostase telomérica, estresse replicativo e evolução de parasitos tripanosomatídeos.

Informações coletadas do Lattes em 23/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Genética e Biologia Molecular

2010 - 2014

Universidade Estadual de Campinas
Título: Estresse oxidativo em Leishmania amazonensis: Do encurtamento dos telômeros ao deslocamento de LaRPA-1 do complexo telomérico
Maria Isabel Nogueira Cano. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Leishmania; Estresse Oxidativo; Proteínas Teloméricas; LaRPA-1; Reparo de DNA.Grande área: Ciências Biológicas

Doutorado em PhD Sandwich

2013 - 2013

Centre National de la Recherche Scientifique
Título: Interaction dynamics of telomeric protein RPA-1 of Leishmania amazonensis (LARPA-1) face to different levels of oxidative stress
Orientador: em Centre National de La Recherche Scientifique - IBPC ( Dr. Maria Teresa Teixeira)
com Maria Isabel Nogueira Cano. Coorientador: Maria Teresa Teixeira. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: telomeres; telomeric measurement; single telomere extension; leading and lagging telomeres.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica.

Graduação em Ciências Biológicas

2005 - 2009

Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP
Título: Identificação do gene, clonagem e expressão da proteína TRF2 de Leishmania (L.) amazonensis (LaTRF2)
Orientador: Profa. Dra. Maria Isabel Nogueira Cano
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

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Pós-doutorado

2018 - 2019

Pós-Doutorado. , University of Glasgow, GLASGOW, Escócia. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Replicação de DNA.

2014 - 2019

Pós-Doutorado. , Instituto Butantan, IBU, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Replicação de DNA. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Tripanossomatídeos.

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Formação complementar

2019 - 2019

Extensão universitária em Metodologia da Pesquisa Científica. (Carga horária: 30h). , Fundação Oswaldo Cruz - Fiocruz Paraná, FIOCRUZ - PR, Brasil.

2019 - 2019

Introduction to the Concepts and Practice of Metrology. (Carga horária: 8h). , Instituto de Química - USP, IQ - USP, Brasil.

2016 - 2016

GENOMICS AND FUNCTIONAL GENOMICS OF PROTOZOAN PARASITES. (Carga horária: 8h). , Sociedade Brasileira de Protozoologia, SBPz, Brasil.

2016 - 2016

Treinamento Operacional na Plataforma Attune Acoustic Focusing Cytometer. (Carga horária: 18h). , Instituto Butantan, IBU, Brasil.

2015 - 2015

São Paulo School of Advanced Science (SPSAS-ND3). (Carga horária: 100h). , Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais, CNPEM, Brasil.

2009 - 2009

Extensão universitária em Curso de Inverno de Genética. (Carga horária: 40h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.

2009 - 2009

Extensão universitária em Ciclo de Palestras do IB. (Carga horária: 13h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2009 - 2009

Técnicas Moleculares Aplicadas a Pesquisa. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.

2009 - 2009

Curso de Campo no Bioma Pantanal. (Carga horária: 32h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2009 - 2009

Oncologia Molecular. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal do Paraná, UFPR, Brasil.

2009 - 2009

Professores Brilhantes - Aulas Interessantes. (Carga horária: 6h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2008 - 2008

Extensão universitária em Bioinformática: Genômica e Transcriptômica. (Carga horária: 40h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2008 - 2008

Fisiologia do Sono. (Carga horária: 8h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2007 - 2007

Desconstruindo Darwin: A Teoria da Evolução de Ari. (Carga horária: 8h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2007 - 2007

Vertebrados Fósseis do Brasil. (Carga horária: 12h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2006 - 2006

Extensão universitária em Radioproteção para Licenciamento de Laboratórios. (Carga horária: 45h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2006 - 2006

Extensão universitária em Célula: O Caminho da Decoberta. (Carga horária: 72h). , Universidade Federal do Rio de Janeiro, UFRJ, Brasil.

2005 - 2005

Auto Desenvolvimento: Como se Tornar um Líder. (Carga horária: 20h). , Serviço de Apoio às Micro e Pequenas Empresas de São Paulo, SEBRAE/SP, Brasil.

2005 - 2005

De como e Porque Viemos a Ser o Que Somos. (Carga horária: 12h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2005 - 2005

Fundamentos dos Sistemas e Processos de Memória. (Carga horária: 8h). , Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP, IBB - UNESP, Brasil.

2005 - 2005

Educação: Ensinando Ciência com Arte e Emoção. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2005 - 2005

Células Tronco e Terapia Gênica. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Razoavelmente.

Bandeira representando o idioma Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Ciclo Celular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Reparo de DNA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Telômeros.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Replicação de DNA.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Parasitologia / Subárea: Biologia Celular de Tripanosomatídeos.

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Participação em eventos

Kinetoplastid Molecular and Cellular Biology Metting 2019.Transcription activity contributes to the firing of non-constitutive origins in Trypanosoma brucei maintaining the robustness of the S phase duration. 2019. (Encontro).

Mapping the Human Body: Introducing the Human Cell Atlas to the Brazilian Scientific Community. 2019. (Simpósio).

XXXV Annual Meeting of the Brazilian Society of ProtozoologyI. An overlooked important post-translational modification: The beginning of an evolutionary study on inositol pyrophosphates and its role in kinetoplastid DNA metabolism. 2019. (Congresso).

14th International Congress of Parasitology (ICOPA). Transcription activity contributes to the activation of dormant origins maintaining the robustness of the S phase in African trypanosomes. 2018. (Congresso).

EMBO/EMBL Symposium - DNA Replication: From Biology to disease.Replication-transcription conflicts contribute to the activation of DNA replication origins above the minimum required to complete S phase in African trypanosomes. 2018. (Simpósio).

Explorathon '18. Parasites Tatoo Parlour. 2018. (Feira).

Scottish DNA Replication Network Meeting 2018.Transcription activity contributes to the activation of DNA replication origins above the minimum required to complete S phase in African trypanosomes. 2018. (Encontro).

19° Reunião Científica Anual do Instituto Butantan.Replication-transcription conflicts in eukaryotes that perform polycistronic transcription contribute to the activation of dormant replication origins. 2017. (Outra).

2nd Mini Symposium Implications of survival and death mechanisms for the interactions of pathogenic protozoa with their hosts ho. 2017. (Simpósio).

Kinetoplastid Molecular and Cellular Biology Metting 2017.The elucidation of DNA replication monitoring in trypanosomatids allows the obtainment of more accurate values for the duration of cell cycle phases. 2017. (Encontro).

VI International Workshop of Molecular Biology of Trypanosomatids.DNA replication and cell cycle. 2017. (Simpósio).

Workshop Internacional Telomeres in health, aging and disease.Consequences of acute oxidative stress in Leishmania spp. proliferation and telomere maintenance. 2017. (Simpósio).

XII Congresso da MUTAGEN BRASIL. Trypanosomatids use more DNA replication origins than the theoretical required minima probably due to replication-transcription conflicts. 2017. (Congresso).

XXXIII Annual Meeting of the Brazilian Society of ProtozoologyI.Trypanosomatids use more origins than the minimum required to complete DNA replication within S-phase period due to replication-transcription conflicts. 2017. (Encontro).

18° Reunião Científica Anual do Instituto Butantan.Differences in the detection of BrdU/EdU incorporation assays alter the calculation for cell cycle in trypanosomatid parasites. 2016. (Encontro).

1st Mini Symposium Implications of survival and death mechanism. 2016. (Simpósio).

Implications of survival and death mechanisms for the interactions of pathogenic protozoa with their hosts.Differences in the detection of BrdU/EdU incorporation assays alter the estimative of the cell cycle duration in trypanosomatids. 2016. (Simpósio).

XXXII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology.Differences in the detection of BrdU/EdU incorporation assays alter the calculation for cell cycle in Trypanosomatid parasites. 2016. (Encontro).

Eukaryotic DNA replication and genome maintenance.Modulation of Trypanosoma brucei Orc1/Cdc6 by ATP hydrolysis. 2015. (Encontro).

FEBRACE (Feira Brasileira de Ciências e Engenharia). Comissão de Avaliação. 2015. (Feira).

XXXI Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology.Trypanosoma brucei Orc1/Cdc6 (TbOrc1/Cdc6) requires binding to and hydrolysis of ATP to license DNA replication. 2015. (Encontro).

7th Congress of the Federation of the Israel Societies for Experimental Biology. Oxidative stress alters Leishmania amazonensis replication protein A-1 (LaRPA-1) interactions. 2014. (Congresso).

XXX Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology.Oxidative stress in Leishmania (L.) amazonensis promastigotes causes telomere shortening and displacement of LaRPA-1 from 3? G-overhang. 2014. (Encontro).

V Ciclo de Palestras do IBB-UNESP.Ciclo celular de L. amazonensis: Quem divide primeiro, núcleo ou cinetoplasto?. 2013. (Seminário).

10th International Congress on Cell Biology. The Leishmania (L.) amazonensis cell cycle: Who duplicates first, kinetoplast or nucleus?. 2012. (Congresso).

XXVIII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology.Oxidative stress alters the interaction of Leishmania amazonensis RPA-1 with telomeres. 2012. (Encontro).

XL Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. The Leishmania amazonensis Cell Cycle: Total and Telomeric DNA Replication, Morphological Changes and Protein Distribution. 2011. (Congresso).

XXVII Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology. PRELIMINARY RESULTS SHOW THAT OXIDATIVE STRESS INDUCES CHANGES IN THE EXPRESSION LEVELS OF LEISHMANIA AMAZONENSIS RPA-1. 2011. (Congresso).

56 Congresso Brasileiro de Genética. Construindo o Complexo Telomérico de Leishmania spp.: Uma Visão Preliminar. 2010. (Congresso).

The XIIth International Congress of Parasitology. Building up the Leishmania spp. telomeric complex: A preliminary view. 2010. (Congresso).

XXVI Annual Meeting of the Brazilian Society of Protozoology. UNVEILING PROTEIN:PROTEIN INTERACTIONS AT LEISHMANIA SPP. TELOMERES. 2010. (Congresso).

17 Simpósio Internacional de Iniciação Científica.A proteína LaTRF de Leishmania amazonensis, homóloga à TTAGGG repeat-binding factor (TRF), interage e co-localiza com telômeros. 2009. (Simpósio).

VIII Workshop da Pós-Graduação. 2009. (Simpósio).

XXXVIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Um Complexo Multi-Protéico nos Telômeros de Leishmania amazonensis: Resultados Preliminares. 2009. (Congresso).

III Seminário de Extenção Universitária do Instituto de Biociências.Cursinho CAVJ-IB UNESP-Botucatu Período Diurno. 2008. (Seminário).

XII Semana da Biologia. 2008. (Simpósio).

XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Expressiom and Characterization of the Leishmania amazonensis TTAGGG Repeat-Binding Factor 2 (LaTRF2) in Escherichia coli. 2008. (Congresso).

V Encontro de Filosofia e História da Biologia. 2007. (Encontro).

XI Semana da Biologia. 2007. (Simpósio).

XIX Congresso de Iniciação Científica UNESP. Identificação e Caracterização da Proteína TRF2 em Leishmania amazonensis. 2007. (Congresso).

XXXVI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq. Characterization of the Leishmania amazonensis Telomere Repeat-Binding Factor 2 (LaTRF2). 2007. (Congresso).

III Simpósio de Biologia Humana. 2006. (Simpósio).

VII Workshop de Plantas Medicinais. 2006. (Simpósio).

Congresso Aberto aos Estudantes de Biologia (CAEB). 2005. (Congresso).

IX Semana da Biologia. 2005. (Simpósio).

V Workshop de Genética. 2005. (Simpósio).

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Participação em bancas

Aluno: Marina Roveri Vieira

SANTOS DA SILVA, MARCELO; FONTES, MARCOS ROBERTO DE MATTOS; CANO, MARIA ISABEL. Estudos sobre a manutenção dos telômeros durante o ciclo de desenvolvimento de Leishmania amazonensis. 2019. Dissertação (Mestrado em Pós-Graduação em Ciências Biológicas - Genética, Mestrado acadêmico) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP.

Aluno: Nathaly Gregório

CERUTTI, J. M.;DA SILVA, M.S.; TONELLI, R. R.. O papel da AMPK no Trypanosoma cruzi. 2020. Exame de qualificação (Mestrando em Programa de Pós-graduação em Biologia Estrutural e Funcional) - Universidade Federal de São Paulo.

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Comissão julgadora das bancas

Maria Carolina Quartim Barbosa Elias-Sabbaga

CANO, M. I.;Elias, M Carolina. estresse oxidativo em Leishmania amazonensis: do encurtamento dos telômeros ao deslocamento da LaRPA-1 do complexo telomérico. 2014 - Universidade Estadual de Campinas.

Nadja Cristhina de Souza Pinto

SOUZA-PINTO, N. C.; KOBARG, J.; GIORGIO, S.. Dinamica de interações da proteina telomérica RPA-1 de Leishmania Amazonensis (La RPA-1) frente a diferentes níveis de estresse oxidativo.. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Maria Isabel Nogueira Cano

CANO, M. I. N.; KOBARG, J.; BARROS, M. H.; ELIAS, MCQB; Borges, JC. Estresse oxidativo em Leishmania amazonensis: Do encurtamento dos telômeros ao deslocamento de LaRPA-1 do complexo telomérico. 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Maria Isabel Nogueira Cano

CANO, M. I. N.; KOBARG, J.; BARROS, M. H.. Estresse oxidativo em Leishmania amazonensis: do encurtamento dos telômeros ao deslocamento de LaRPA-1 do complexo telomérico. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Julio Cesar Borges

BORGES, JULIO CESAR; CANO, M.I.N.; KOBARG, Jorg; BARROS, M.H.; SABRAGA, M.C.Q.B.E.. Estresse oxidativo emLeishmania amazonensis: Do encurtamento dos telômeros ao deslocamento de LaRPA-1 do complexo telomérico. 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Instituto de Biologia - UNICAMP.

Jörg Kobarg

CANO, M. I.;Kobarg, Jörg; BARROS, M.;Borges, Julio C; Sabbaga M. Estresse oxidativo em Leishmania amazonensis: do encurtamento dos telômeros ao deslocamento de LaRPA-1 do complexo telomérico. 2014. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Jörg Kobarg

CANO, M. I.; BARROS, M.;Kobarg, Jörg. Estresse oxidativo em Leishmania amazonensis: Do encurtamento dos telômeros ao descolamento de LaRPA-1 do complexo telomérico. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Jörg Kobarg

KOBARG, JKOBARG, J.; Giorgio S; de souza Pinto NC. Dinâmica de interações da proteína telomérica RPA-1 de Leishmania amazonensis (LaRPA-1) frente a diferentes níveis de estresse oxidativo. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

Jörg Kobarg

GIORGIO, S.; PINTO, N.;Jörg Kobarg. Telômeros em T. cruzi. 2011. Exame de qualificação (Doutorando em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas.

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Orientou

Whisnayder Martins Gentil

Caracterização Funcional do Componente TERT da telomerase de Leishmania major; Início: 2019; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; (Coorientador);

Paula Andrea Marin Munoz

Recruitment kinetics of the homologous recombination pathway in procyclic forms of T; brucei after ionizing radiation treatment; 2017; Tese (Doutorado em Biologia da Relação Patógeno Hospedeiro) - Instituto de Ciências Biomédicas - USP, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Marcelo Santos da Silva;

Luis Eduardo Lazarim

Analise funcional dos homólogos Ataxia-telangiectasia mutated (ATM) e a Ataxia-telangiectasia and RAD3-related (ATR) na sinalização de dano ao DNA em Trypanosoma cruzi; 2016; Iniciação Científica - Instituto Butantan; Orientador: Marcelo Santos da Silva;

Eliandra Nunes da Silva

Programa para Aquisição de Competências Específicas do Departamento de Genética do Instituto de Biociências da UNESP, Campus de Botucatu; 2014; Orientação de outra natureza; (Ciências Biomédicas) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP; Orientador: Marcelo Santos da Silva;

Gabriel Arantes Dias dos Santos

Programa para Aquisição de Competências Específicas do Departamento de Genética do Instituto de Biociências da UNESP, Campus de Botucatu; 2013; Orientação de outra natureza; (Ciências Biomédicas) - Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP; Orientador: Marcelo Santos da Silva;

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Foi orientado por

Maria Carolina Quartim Barbosa Elias-Sabbaga

2019; Instituto Butantan, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Maria Carolina Quartim Barbosa Elias-Sabbaga;

Maria Isabel Nogueira Cano

Estresse oxidativo em Leishmania amazonensis: Do encurtamento dos telômeros ao deslocamento de LaRPA-1 do complexo telomérico; 2014; Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Isabel Nogueira Cano;

Maria Isabel Nogueira Cano

Clonagem e caracterização da proteína telomérica TRF2 de Leishmania amazonensis; 2009; 0 f; Iniciação Científica; (Graduando em Genética) - Universidade Julio de Mesquita Filho, Botucatu, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Maria Isabel Nogueira Cano;

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Outras produções

DA SILVA, M. S. . Pesquisando, Experienciando e Vivenciando. 2015. .

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Projetos de pesquisa

  • 2018 - 2019

    Structural analysis of the origin recognition complex (ORC) in Trypanosoma brucei using cryo-electron microscopy and single-particle analysis, Descrição: DNA replication is a biological process of paramount importance, mainly because it drives the propagation of all living organisms, being the basis of genetic inheritance. The earliest step of DNA replication is the establishment of origins, which are defined as genomic loci where DNA synthesis initiates, being preceded by the binding of a replication initiation factor. The binding of the initiator establishes replication initiation by the recruitment and activation of the replisome. In prokaryotes, a single initiator binds each origin, whereas in eukaryotes a six-protein origin recognition complex, termed Origin Recognition Complex (ORC), play this function in conjunction with a related factor called Cdc6. The evolutionary pathways that led eukaryotes to evolve a multisubunit initiator are unknown, as well as the roles played by each ORC subunit. One way to address this is to functionally characterize ORC from a diverged eukaryote since most studies to date have been limited in phylogenetic breadth. Trypanosoma brucei, a unicellular eukaryote parasite with peculiar genetic tools, provides a means to tackle this question. Sequence?based searches failed to identify ORC components in T. brucei, but biochemical approaches have now described four putative ORC subunits (ORC1/CDC6, ORC4, Tb3120, and Tb7980). At least two are present in a high molecular complex and all act in nuclear DNA replication, but each one displays considerable sequence divergence from ?model? ORC subunits. Moreover, another ORC-like replication factor (ORC1B) has been identified as a non-static constituent of ORC, displaying highly unusual S-phase restricted nuclear localization or expression, suggesting a possible new model to regulate the replication. These findings raise questions about the constitution and mode of action of ORC in T. brucei that may shed light on ORC evolution, which may provide a route for future drug development. Thus, this project aims to determine the complete architecture of ORC in T. brucei, comparing it to previously published structures from humans and Drosophila. To achieve this aim, we will perform immunoprecipitation (IP) of native ORC from T. brucei followed by cryo-electron microscopy (cryo-EM) and single-particle analysis (SPEM). Additionally, we will co-express and purify the known T. brucei ORC components, and use cryo-EM to ask how these interact, comparing them with known ORCs. Of note, cryo-EM and SPEM applied to determine structures with high resolution (< 4) from IP is a labor-intensive technique still not very widespread in Brazil, which makes this project an excellent opportunity to bring this approach to my host country and apply it to other trypanosomatids that cause endemic diseases, such as Chagas disease.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Santos da Silva - Integrante / Maria Carolina Elias - Coordenador / MCCULLOCH, RICHARD - Integrante / Laura Spagnolo - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 5

  • 2015 - 2019

    Dinâmica da replicação do DNA em Trypanosoma cruzi: caracterização do licenciamento e da taxa de replicação, Descrição: Trypanosoma cruzi é um protozoário flagelado, pertencente à família Trypanosomatidae, e agente etiológico da doença de Chagas, uma doença neglicenciada que afeta milhões de pessoas em todo o mundo. Para sobreviver, este parasito necessita replicar adequadamente seu DNA e isso envolve a ação coordenada de um complexo de variadas proteínas. A replicação do DNA inicia-se com o licenciamento de uma maquinaria de pré-replicação (pré-RC) em regiões específicas do DNA denominadas origens de replicação. A dinâmica e as proteínas envolvidas na maquinaria pré-RC ainda não estão bem definidas nos tripanosomatídeos. Deste modo, pretendemos identificar e caracterizar possíveis interatores da proteína TcOrc1/Cdc6, a qual é responsável pelo reconhecimento e ativação de origens de replicação em T. cruzi. Para tal, pretendemos realizar ensaios de captura (imunoprecipitação e co-imunoprecipitação), identificar os possíveis interatores em SDS-PAGE e espectrômetro de massas, e confirmar suas funções na replicação através de knockout em T. cruzi. Em paralelo, pretendemos realizar ensaios de pull down utilizando TcOrc1/Cdc6 recombinante marcada com diferentes tags (6xHis e Maltose Binding Protein - MBP) para verificar se esta proteína oligomeriza. Em caso positivo, esta oligomerização será confirmada in vitro por ultracentrifugação analítica e in vivo utilizando parasitas transfectados com Orc1/Cdc6 contendo diferentes caudas. Além disso, pretendemos também avaliar o quanto os processos de metabolismo de DNA (transcrição e reparo) influenciam a taxa de replicação em T. cruzi. Para isto iremos inibir a transcrição (utilizando -manitina) e causar danos no DNA (utilizando radiação U.V. e tratamento com H2O2) e verificar, através da técnica denominada SMARD (Single Molecule Analisys of Replicated DNA), se a taxa de replicação das forquilhas é alterada. Vale ressaltar que este conhecimento poderá auxiliar futuras estratégias antiparasitárias, já que a replicação do DNA está diretamente relacionada à manutenção cromossômica e viabilidade celular.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcelo Santos da Silva - Integrante / Maria Carolina Elias - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 21

  • 2013 - 2013

    Interações da proteína telomérica RPA-1 de Leishmania amazonensis (LaRPA-1) frente a diferentes níveis de estresse oxidativo, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Isabel Nogueira Cano em 14/11/2017., Descrição: A leishmaniose é um espectro de doenças causado por parasitas do gênero Leishmania, afligindo mais de 15 milhões de pessoas e apresentando outras 350 milhões em regiões de risco. No Brasil, a doença afeta seres humanos e ocorre em todas as regiões do país com predominância de casos nas regiões Norte e Nordeste. A infecção ocorre durante a picada de mosquitos flebotomíneos infectados, no momento da hematofagia. Para sobreviver, os parasitas precisam superar inúmeras barreiras, dentre as quais estão a exposição à ROS e RNS. Para superar estas barreiras os parasitas dispõem de diversos mecanismos, como as maquinarias de reparo a danos ao DNA e manutenção dos telômeros, sendo que ambas estão interconectados devido à utilização em comum de diversas proteínas. As proteínas teloméricas podem regular a atividade da telomerase e manter a estabilidade dos telômeros. Dentre estas proteínas encontra-se LaRPA-1, a proteína alvo deste estudo, que cumpre importante papel em ambas as maquinarias citadas. Nosso objetivo é estudar a dinâmica de interações desta proteína frente a diferentes concentrações subletais de H2O2, responsáveis diretos por danos ao DNA telomérico. Verificaremos possíveis alterações nas interações entre LaRPA-1 e suas parceiras (por ex: LaRbp38 e telomerase) usando ensaios de imunoprecipitação e pull down, suas co-localizações subcelulares por imunofluorescência indireta (IF), alterações na expressão do gene e da proteína utilizando PCR em Tempo Real e Western blot, respectivamente. As misturas de proteínas capturadas por pull down também serão analisadas por espectrometria de massa para identificação de novos fatores de interação. Possíveis alterações no tamanho do DNA telomérico (3?G overhang) serão verificadas através de técnicas modernas, que serão desenvolvidas em organismos modelo (S. cerevisiae, C. glabrata) para posterior aplicação em L. amazonensis em diferentes condições de estresse. Esta atividade será realizada em colaboração com a Dra. Maria Teresa Teixeira do Institut de Biologie PhysicoChimique no Centre National de Recherche Scientifique (CNRS), Paris, França. O conhecimento contido nesse projeto poderá facilitar a descoberta de novos alvos antiparasitários e auxiliar a busca de futuras estratégias no tratamento da leishmaniose.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Santos da Silva - Integrante / Maria Isabel Nogueira Cano - Coordenador / Maria Teresa Teixeira - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa., Número de produções C, T & A: 1

  • 2010 - 2014

    Dinâmica de interações da proteína telomérica RPA-1 de Leishmania amazonensis (LaRPA-1) frente a diferentes níveis de estresse oxidativo, Descrição: A leishmaniose é uma doença causada por parasitas do gênero Leishmania, afligindo mais de 15 milhões de pessoas e apresentando outras 350 milhões em regiões de risco. No Brasil, a doença afeta seres humanos e ocorre em todas as regiões do país com predominância de casos nas regiões Norte e Nordeste. A infecção ocorre durante a picada de mosquitos flebotomíneos infectados, no momento da hematofagia. Para sobreviver, os parasitas precisam superar inúmeras barreiras, dentre as quais estão a exposição à ROS e RNS. Para superar estas barreiras os parasitas dispõem de diversos mecanismos, como as maquinarias de reparo a danos ao DNA e manutenção dos telômeros, sendo que ambas estão interconectados devido à utilização em comum de diversas proteínas. As proteínas teloméricas podem regular a atividade da telomerase e manter a estabilidade dos telômeros. Dentre estas proteínas encontra-se LaRPA-1, a proteína alvo deste estudo, que cumpre importante papel em ambas as maquinarias citadas. Nosso objetivo é estudar a dinâmica de interações desta proteína frente a diferentes concentrações subletais de H2O2, responsáveis diretos por danos ao DNA telomérico. Verificaremos possíveis alterações nas interações entre LaRPA-1 e suas parceiras (por ex: LaRbp38 e telomerase) usando ensaios de imunoprecipitação e pull down, suas co-localizações subcelulares por imunofluorescência indireta (IF), alterações na expressão do gene e da proteína utilizando PCR em Tempo Real e Western blot, respectivamente. Possíveis alterações no tamanho do DNA telomérico serão verificadas por Southern blot não desnaturante. As misturas de proteínas capturadas por pull down também serão analisadas por espectrometria de massa para identificação de novos fatores de interação. Esse conhecimento poderá facilitar a descoberta de novos alvos antiparasitários e auxiliar na busca de futuras estratégias no tratamento da leishmaniose.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Santos da Silva - Integrante / Maria Isabel Nogueira Cano - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 8

  • 2007 - 2010

    Identificação do gene, clonagem e expressão da proteína TRF2 de Leishmania amazonensis (LaTRF2), Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Maria Isabel Nogueira Cano em 05/10/2015., Descrição: Telomeres are specialized structures at the end of chromosomes essential for maintaining genome stability and cell viability. The importance of telomeric proteins for telomere maintenance has increased our interest in the identification of homologues within the genus Leishmania. The mammalian TRF1 and TRF2 proteins, for example, bind double-stranded telomeres via a Myb-like DNA-binding domain and are involved with telomere length regulation and chromosome end protection. In addition, TRF2 can modulate the activity of several enzymes and influence the conformation of telomeric DNA. In this work, we identified and characterized a Leishmania protein (LaTRF) homologous to both mammalian TRF1 and TRF2. LaTRF was cloned using a PCR-based strategy. ClustalW and bl2seq sequence analysis showed that LaTRF shared sequence identity with the Trypanosoma brucei TRF (TbTRF) protein and had the same degree of sequence similarities with the dimerization (TRFH) and the canonical DNA-binding Myb-like domains of both mammalian TRFs. LaTRF was predicted to be an 82.5 kDa protein, indicating that it is double the size of the trypanosome TRF homologues. Western blot and indirect immunofluorescence combined with fluorescence in situ hybridization showed that LaTRF, similarly to hTRF2, is a nuclear protein that also associates with parasite telomeres. Native and full length LaTRF and a mutant bearing the putative Myb-like domain expressed in bacteria bound double-stranded telomeric DNA in vitro. Chromatin immunoprecipitation showed that LaTRF interacted specifically with telomeres in vivo. The nuclear localization of LaTRF, its association and co-localization with parasite telomeres and its high identity with TbTRF protein, support the hypothesis that LaTRF is a Leishmania telomeric protein.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcelo Santos da Silva - Integrante / Maria Isabel Nogueira Cano - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa., Número de produções C, T & A: 20

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Prêmios

2019

Top downloaded article 2017-2018 - top 20 most read paper in Journal of Eukaryotic Microbiology, Wiley.

2017

Best Poster Award, Mutation Research - Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis.

2017

Melhor trabalho da área Intabilidade Genômica e reparo do DNA, Mutation Research - Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis.

2017

Walter Colli Award (best oral presentation), Brazilian Society of Protozoology.

2016

Zigman Brener Award (best poster presentation), Brazilian Society of Protozoology (SBPz).

2015

Menção Honrosa, Brazilian Society of Protozoology (SBPz).

2009

Mérito Acadêmico, Instituto de Biociências - UNESP.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Instituto Butantan, Laboratório Especial de Ciclo Celular. , Instituto Butantã, Butantã, 05503900 - São Paulo, SP - Brasil - Caixa-postal: 55, Telefone: (11) 26279300, Ramal: 9731, URL da Homepage:

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Experiência profissional

2017 - Atual

University of Glasgow

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2015 - Atual

Instituto Butantan

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: pós-doutorando, Carga horária: 60, Regime: Dedicação exclusiva.

2013 - 2013

Centre National de la Recherche Scientifique

Vínculo: , Enquadramento Funcional:

2010 - 2014

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Outro (especifique), Enquadramento Funcional: Doutorando, Regime: Dedicação exclusiva.

2006 - 2009

Instituto de Biociências de Botucatu - UNESP - Botucatu/SP

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: iniciação científica, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

  • 03/2006 - 12/2009

    Estágios , Departamento de Genética, .,Estágio realizado, Laboratório de Telômeros: Genética de Microrganimos; Identificação e Caracterização de Proteínas em Leishmania sp..

  • 01/2006 - 01/2009

    Extensão universitária , Centro Acadêmico V de Junho, .,Atividade de extensão realizada, Coordenador Geral e Professor do Cursinho Pré-Vestibular CAVJ-IB.

  • 03/2005 - 03/2006

    Estágios , Departamento de Genética, .,Estágio realizado, Genética de microorganismos: Fungos e Leveduras.