Michele de Cássia Pereira e Silva

PhD em Microbiologia pela Universidade de Groningen (RUG, Holanda), Mestre em Genética e Melhoramento de Plantas (Área de pesquisa: Genética de Microrganismos) pela Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (2008) e graduada em Farmácia pela Universidade Estadual de Londrina (2004). Tem ampla experiência na área de Microbiologia Ambiental, especificamente no estudo da diversidade microbiana de maneira independente de cultivo, novas técnicas de sequenciamento e bioinformática. É palestrante nas áreas de Metagenômica e Microbioma.

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ecologia microbiana e microbiologia de solos

2008 - 2013

Rijksuniversiteit Groningen
Título: The normal operating range of soil functioning: understanding the natural fluctuations of nitrogen cycling communities
Orientador: van Elsas, Jan Dirk
Coorientador: Joana Falcão Salles. Bolsista do(a): Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek, NWO, Holanda. Palavras-chave: biodiversity and ecosystem functioning; Normal operating range; nitrification; agricultural soil; nitrogen fixation; fluctuations. Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia de Ecossistemas. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos. Setores de atividade: Agricultura, Pecuária, Silvicultura e Exploração Florestal; Educação.

Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas

2006 - 2008

Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz
Título: Interação entre Methylobacterium extorquens e cana-de-açúcar (Saccharum sp.),Ano de Obtenção: 2008
Welington Luiz de Araújo.Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico, CNPq, Brasil. Palavras-chave: choque térmico; Methylobacterium spp.; interação planta-bactéria; Biofilme; Quorum sensing.Grande área: Ciências Biológicas

Graduação em Farmácia - Indústria

1999 - 2004

Universidade Estadual de Londrina
Título: Validação de sistema de água na indústria de medicamentos Nortis Farmaceutica Ltda.

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Pós-doutorado

2017

Pós-Doutorado. , Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia microbiana. , Grande Área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: Ciclo do Nitrogênio.

2014 - 2017

Pós-Doutorado. , Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, ESALQ, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: genômica. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia microbiana.

2013 - 2014

Pós-Doutorado. , Rijksuniversiteit Groningen, RUG, Holanda. , Bolsista do(a): BE-Basic, BE-BASIC, Holanda. , Grande área: Ciências Agrárias, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos / Especialidade: Biologia Molecular. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia microbiana.

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Formação complementar

2014 - 2014

Extensão universitária em Workshop Meta-Omics and Bioinormatics in Microbial. (Carga horária: 16h). , Centro de Energia Nuclear na Agricultura, CENA-USP, Brasil.

2013 - 2013

Extensão universitária em New Frontiers in Microbial Ecology. (Carga horária: 8h). , University of Groningen, RUG, Holanda.

2013 - 2013

Workshop on Bioinformatic tools for soil microbiol. (Carga horária: 8h). , Thünen Institute, THÜNEN INSTITUTE, Alemanha.

2012 - 2012

Introduction to R and Statistical Computing. (Carga horária: 16h). , Leiden University, LEIDEN, Holanda.

2010 - 2010

Extensão universitária em New Frontiers in Microbial Ecology. (Carga horária: 40h). , University of Groningen, RUG, Holanda.

2010 - 2010

How to publish your work effectively. (Carga horária: 24h). , University of Groningen, RUG, Holanda.

2009 - 2009

Extensão universitária em Current themes in Microbial Ecology. (Carga horária: 80h). , University of Groningen, RUG, Holanda.

2009 - 2009

Safe Microbiological Techniques. (Carga horária: 16h). , Medische Microbiologie UMCG, UMCG/ RUG, Holanda.

2009 - 2009

PCR Quantitativo em tempo real; Metodologias e Ap. (Carga horária: 24h). , Embrapa Soja, EMBRAPA, Brasil.

2005 - 2005

Programa de Treinamento Microbiológico. (Carga horária: 8h). , Visão Tecnica Assessoria e e Serviços ME, VISÃO TECNICA AS, Brasil.

2004 - 2004

Princípios e práticas de validação analítica. (Carga horária: 16h). , Schaffer Empreendimentos, SCHAFFER, Brasil.

2004 - 2004

Validação de procedimento de limpeza. (Carga horária: 8h). , Visão Tecnica Assessoria e e Serviços ME, VISÃO TECNICA AS, Brasil.

2003 - 2003

Tecnologia em fitoterápicos. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.

2003 - 2003

Novas formas farmacêuticas. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.

2002 - 2002

Seguimento Farmacoterapêutico: Metodologia Dader. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.

2001 - 2001

Biologia Molecular aplicada à saúde. (Carga horária: 3h). , Universidade Estadual de Londrina, UEL, Brasil.

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Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Espanhol

Compreende Razoavelmente, Fala Pouco, Lê Razoavelmente, Escreve Pouco.

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Áreas de atuação

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Ecologia / Subárea: Ecologia microbiana.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos/Especialidade: Biologia Molecular.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Microbiologia de Solos.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: Biodiversidade.

    Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biotecnologia / Subárea: Biotecnologia.

    Grande área: Ciências Agrárias / Área: Agronomia / Subárea: ciclos biogeoquímicos.

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Organização de eventos

QUECINE, M. C. ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; BELASQUES JUNIOR, J. ; AUGUSTO, P. E. D. ; VEASEY, E. A. ; DUARTE, S. N. ; MENDES, F. B. G. ; BRANCALION, P. H. S. ; DELGADO, E. F. ; MORAES, M. A. F. D. . 24 Simposio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP. 2016. (Outro).

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Participação em eventos

Peru com Ciência.A investigação científica no Brasil: Microbiologia de Solos. 2015. (Encontro).

Treinamento dos Coord de Assist Técnica da Microbiol.Biologia Molecular, no estudo do microbioma do solo. 2015. (Outra).

Netherlands Annual Ecology Meeting.Genetic diversity of archaeal amoA drives protential nitrification rates in agricultural soils. 2013. (Encontro).

Soil Metagenomics. 2013. (Simpósio).

14th International Symposium on Microbial Ecology.SEASONAL CHANGES IN COMMUNITY COMPOSITION OF N-CYCLING MICROORGANISMS ACROSS AGRICULTURAL SOILS. 2012. (Simpósio).

BAGECO11 - 11th Conference on Bacterial Genetics and Ecology. ABUNDANCE, DIVERSITY AND FUNCTIONAL ROLE OF AMMONIA OXIDIZING COMMUNITIES ACROSS DUTCH SOILS. 2011. (Congresso).

Netherlands Annual Ecology Meeting.Abundance, diversity and functional role of ammonia oxidizing communities across Dutch soils. 2011. (Encontro).

Netherlands Annual Ecology Meeting.Establishing the baseline of soil functioning in relation to key steps of the nitrogen cycle. 2010. (Encontro).

Soil Metagenomics. Seasonal variations in diversity and abundance of diazotrophic communities across soils and their proposed role as indicators of soil quality. 2010. (Congresso).

PCR quantitativo em tempo real: metodologias e aplicações. 2009. (Outra).

XXIVCongresso Brasileiro de Microbiologia. Estratégia Polifásica para o estudo da interação entre cana-de-açúcar (Saccharum sp.) por M. extorquens. 2007. (Congresso).

Programa de Treinamento Microbiológico. 2005. (Outra).

Curso: Princípios e práticas da validação de métodos analíticos. 2004. (Outra).

Curso: Validação do procedimento de limpeza em superfícies biocontaminadas em áreas limpas. 2004. (Outra).

I Encontro de Educação sobre medicamentos e I Mostra Farmacêutica de material para eduação sobre medicamentos.I Encontro de Educação sobre medicamentos e I Mostra Farmacêutica de material para eduação sobre medicamentos. 2003. (Encontro).

VI Jornada de Farmácia e Análises Clínicas de Londrina. 2003. (Encontro).

I Encontro de Farmácia Hospitalar de Londrina e Região. 2002. (Encontro).

Curso: Biologia molecular aplicada à saúde em IV Congresso Londrinense de Biologia Aplicada à Saúde e I Encontro Paranaense de Biomedicina. 2001. (Encontro).

Encontro Anual de Iniciaçao Científica.X Encontro Anual de iniciação Científica. 2001. (Encontro).

IV Congresso Londrinense de biologia Aplicada à Saúde e I Encontro Paranaense de Biomedicina. IV Congresso Londrinense de biologia Aplicada à Saúde e I Encontro Paranaense de Biomedicina. 2001. (Congresso).

XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia. XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia. 2001. (Congresso).

IV Jornada de Farmácia e Análises Clínicas de Londrina e III Forum Paranaense de Medicamentos. 2000. (Encontro).

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Participação em bancas

Aluno: Mariana de Oliveira Barcoto

RODRIGUES, A.;Pereira e Silva, MC; CORTES, M. C.. Fungus-growing insects host a convergent microbiome with functional similarities to other lignocellulose-feeding insects. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Campus Rio Claro.

Aluno: Alessandra Rigotto

ANDREOTE, F. D.; Siu Mui, T; CERRI, C. E. P.;Pereira e Silva, Michele C.. A interface entre a física e os aspectos microbiologicos do solo. 2017. Dissertação (Mestrado em Ciências) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Bruno Costa Evangelista de Souza

FIORE, M. F.;Pereira e Silva, M.C.; Siu Mui, T. Mapeamento de agrupamentos gênicos envolvidos na fixação biológica de nitrogênio em genomas de isolados brasileiros de cianobactérias. 2016. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Marta Alves Moitinho

TAKETANI, R. G.;PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA; VASCONCELLOS, R. L. F.. Avaliação da sucessão ecológica de comunidades microbianas em matéria orgânica vegetal em decomposição em manguezais do estado de São Paulo. 2016. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Adijailton Jose de Souza

REGITANO, J. B.;Pereira e Silva, MC; ANDREOTE, F. D.. Impacto da diversidade bacteriana sob a degradação clorotalonil no solo manejado com biochar. 2016. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: ALINE GIOVANA DA FRANÇA

Siu Mui, T;Pereira e Silva, MC; AZEVEDO, J. L.. Filo Actinobacteria e abundância do gene alkB em solos rizosféricos cultivados sob sistemas de colheita de cana-de-açúcar. 2016. Dissertação (Mestrado em Ciências) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura.

Aluno: Poliene Martins Costa

SILVA FILHO, M. C.; VITORELLO, C. B. M.; FIGUEIRA, A. V. O.;Pereira e Silva, MC; MACEDO, M. L. R.. Caracterização da comunidade bacteriana associada ao trato intestinal de Spodoptera frugiperda provenientes de diferentes dietas. 2016. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Marcus Venicius de Mello Lourenço

ANDREOTE, F. D.; ROSSMANN, M.;PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA; MENDES, R.. Contexto genômico e expressão de genes envolvidos na redução do sulfato em solos de manguezal. 2016. Tese (Doutorado em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Mylenne Calciolari Pinheiro da Silva

LIRA, S. P.; LIMA, A. O. S.;Pereira e Silva, M.C.; FRACETTO, G. G. M.. Bioprospecção de xilanase e alfa-amilase por meio de métodos independentes e dependentes de cultivo microbiano em um solo de manguezal. 2015. Tese (Doutorado em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Harold Alexander Hoyos Vargas

ANDREOTE, F. D.; VASCONCELLOS, R. L. F.;Pereira e Silva, M.C.. Actinomicetos isolados de solos de ecossistemas brasileiros: potenciais agentes de controle biológico de Sclerotinia sclerotiorum em cultivo de soja (Glycine max L. Merrill)?. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Danilo Tosta Souza

MENDES, R.; TAKETANI, R.;Pereira e Silva, MC. Metagenômica em esponjas do infralitoral brasileiro. 2014. Exame de qualificação (Doutorando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Gislene Roberta Manarim

AGUIAR, C. L.; MIRANDA, E. S.;PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA. Interferentes analíticos provenientes da colheita, carregamento e transporte nas analises tecnológicas do caldo de cana-de-açúcar. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Juanita Hernández Solano

Pereira e Silva, MC; DIAS, A. C. F.; TAKETANI, R. G.. Efeito das mudanças climáticas na decomposiçao de matéria orgânica e sucessão ecológica em manguezais. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Maiele Cintra Santana

CARDOSO, E. J. B. N.; COTTA, S.;PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA. Estrutura da comunidade fúngica de solo, rizosfera e raízes de Eucaliptus urograndis e Acacia Mangium. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Microbiologia Agrícola) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

Aluno: Juliana Carange Tischer

CAMARGO, P. B.;Pereira e Silva, M.C.; ANDRADE, C. A.. Carbono e nitrogenio em vegetação e solo de Manguezal em recuperação no semiárido. 2016. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura.

Aluno: Giulia Mazzero Inocêncio

Pereira e Silva, MC; MARCON, J.; QUECINE, M. C.. Diversidade e potencial biotecnológico de bactérias quitinolíticas provenientes de manguezal. 2016. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

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Comissão julgadora das bancas

Sergio Olavo Pinto da Costa

COSTA, S. O. P.; Araujo, W. L.; Pizzirani-Kleiner,A.P.. Interação entre methylobacterrium extorquens e cana-de-açúcar. 2008. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola Superior de Agronomia Luiz de Queiroz.

Monica Maruno

GIANOTTO, E. A. S.;MARUNO, M.. Validação do sistema de purificação de água e de limpeza. 2004. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Habilitação Farmácial Industrial) - Universidade Estadual de Londrina.

Fernando Dini Andreote

ANDREOTE, F. D.; VEEN, H. V.; ROU, X. L.; ELZENGA, J. T. M.; Salles, J. F.; van Elsas, J. D.. The normal operating range of soil functioning. 2013. Tese (Doutorado em Ciências Naturais) - University of Groningen.

Carlos Alberto Labate

ARAUJO, Welington Luiz de; KLEINER, A. P.; COSTA, S. O. P.;LABATE, C. A.. Interação entre Methylobacterium extorquens e cana-de-açúcar (Saccharum sp.). 2008. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.

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Orientou

Vanessa Neves Alves Santini

Cultura organizacional e Comunicação Interna em Ambiente Hospitalar; Início: 2016; Orientação de outra natureza; Instituto de Pesquisas e Educação Continuada Economia e Gestão de Empresas; (Orientador);

Joyce Ribeiro

Planejamento Estratégico para uma empesa de Fitness; Início: 2016; Orientação de outra natureza; Instituto de Pesquisas e Educação Continuada Economia e Gestão de Empresas; (Orientador);

Guilherme Nishizawa

Transformação Digital na área de saúde; Início: 2016; Orientação de outra natureza; Instituto de Pesquisas e Educação Continuada Economia e Gestão de Empresas; (Orientador);

Alessandra Martinelli

Posicionamento branding no mercado farmaceutico; Início: 2016; Orientação de outra natureza; Instituto de Pesquisas e Educação Continuada Economia e Gestão de Empresas; (Orientador);

Gustavo Henrique Silva Malard Neves

Plano de negócios sobre a idealização de uma indústria de produtos domissanitários, mais especificamente controle de pragas urbanas residenciais; ; Início: 2016; Orientação de outra natureza; Instituto de Pesquisas e Educação Continuada Economia e Gestão de Empresas; (Orientador);

Ricardo Carmo

ÉTICA NAS RELAÇÕES DE TRABALHO; Início: 2016; Orientação de outra natureza; Instituto de Pesquisas e Educação Continuada Economia e Gestão de Empresas; (Orientador);

Miaozhi Zhang

Plasmids of the IncP-1 and PromA groups as main drivers of bacterial behaviour and adaptation in the mycosphere; 2014; Tese (Doutorado em Ecologia Microbiana) - University of Groningen,; Coorientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Luana Bresciani

Análise metabólica e filogenética de Pseudomonas spp; fluorescentes isoladas de cana-de-açúcar; 2014; Iniciação Científica; (Graduando em Engenharia Agronômica) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Paul Vermeulen

Biogeography of whales - Microbial diversity in fecal plumes; 2013; Iniciação Científica - Rijksuniversiteit Groningen; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Ana Ceniceros

Microbial diversity in the island of Schiermonnikoog; 2010; Iniciação Científica - Rijksuniversiteit Groningen; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Amélie Guiot-Zimmermann

Quantitative analysis of the microbial community succession on the island of Schiermonnikoog, The Netherlands; 2010; Iniciação Científica - Rijksuniversiteit Groningen; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

David Matthias Ekkers

The baseline of soil microbial diversity in agricultural soils; 2009; Iniciação Científica - Rijksuniversiteit Groningen; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Tahir Naqqash

Biodiversity of diazotrophs in rhizosphere of potato; 2014; Orientação de outra natureza - Instituto Nacional de Biotecnologia e Engenharia Genética; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Sandy Sampaio Videira

Studying the diazotrophic bacterial community associated with elephant-grass; 2013; Orientação de outra natureza; (Agronomia) - Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Megga Ratnasari Pikoli

Biodessulfurization of subbituminous Coal by mixed culture bacteria isolated from coal mine soil of south Sumatera; 2013; Orientação de outra natureza - Escola de Ciências da vida e tecnologia; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Layanne Batista Souza

Physiologic characterisation and gene expression profile study of nitrogen transport system in contrasting cultivars of sugarcane (Saccharum spp); 2013; Orientação de outra natureza; (Doutorado) - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

Nguyen Esmeralda Lopez-Lozano

Denitrifying bacterial community display different temporal fluctuation patterns across agricultural soils; 2011; Orientação de outra natureza; (Ciências Biológicas) - Universidad Nacional Autónoma de Mexico; Orientador: Michele de Cássia Pereira e Silva;

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Foi orientado por

Elisabeth Aparecida dos Santos Gianotto

Elaboração de protocolo de validação do sistema de produção de água; 2003; 0 f; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual de Londrina; Orientador: Elisabeth Aparecida dos Santos Gianotto;

Joana Falcao Salles

The normal operating range of soil functioning - Understanding the natural fluctuations of nitrogen cycling communities; 2013; Tese (Doutorado em Ecologia Microbiana) - University of Groningen, Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk; Orientador: Joana Falcao Salles;

Monica Maruno

Validação do sistema de purificação de água e de limpeza; 2003; 0 f; Orientação de outra natureza - Universidade Estadual de Londrina; Orientador: Monica Maruno;

Janaina Braga do Carmo

2017; Universidade Federal de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Janaina Braga do Carmo;

Fernando Dini Andreote

2017; Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Fernando Dini Andreote;

Elisabete Yurie Sataque Ono

Avaliação de inibidores de amilase de F; moniliforme em híbridos de milho; 2001; Iniciação Científica - Universidade Estadual de Londrina, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Elisabete Yurie Sataque Ono;

Welington Luiz de Araújo

Interações entre Methylobacterium extorquens e cana-de-açúcar (Saccharum spp; ); 2006; Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Welington Luiz de Araújo;

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Produções bibliográficas

  • LOPES, LUCAS DANTAS ; WEISBERG, ALEXANDRA J. ; DAVIS, EDWARD W. ; VARIZE, CAMILA DE S. ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE C. ; CHANG, JEFF H. ; LOPER, JOYCE E. ; ANDREOTE, FERNANDO D. . Genomic and metabolic differences between Pseudomonas putida populations inhabiting sugarcane rhizosphere or bulk soil. PLoS One , v. 14, p. e0223269, 2019.

  • PAZ, ISABEL CRISTINA PADULA ; SANTIN, RITA DE CÁSSIA MADAIL ; GUIMARÃES, ALEXANDRE MARTINS ; ROSA, OSMAR PAULO PEREIRA DA ; QUECINE, MARIA CAROLINA ; SILVA, MICHELE DE CÁSSIA PEREIRA E ; AZEVEDO, JOÃO LÚCIO ; MATSUMURA, AIDA TEREZINHA SANTOS . Biocontrol of Botrytis cinerea and Calonectria gracilis by eucalypts growth promoters Bacillus spp.. MICROBIAL PATHOGENESIS , v. 121, p. 106-109, 2018.

  • LOPES, LUCAS DANTAS ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE C. ; WEISBERG, ALEXANDRA J. ; DAVIS, EDWARD W. ; YAN, QING ; VARIZE, CAMILA DE S. ; WU, CHIH-FENG ; CHANG, JEFF H. ; LOPER, JOYCE E. ; ANDREOTE, FERNANDO D. . Genome variations between rhizosphere and bulk soil ecotypes of a population. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY , v. 20, p. 4401-4414, 2018.

  • ARAÚJO, JULIANA ESCHHOLZ DE ; TAKETANI, RODRIGO GOUVÊA ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; LOURENÇO, MARCUS VENICIUS DE MELLO ; ANDREOTE, FERNANDO DINI . Draft Genome Sequence of Strain BR-MGV, a Planctomycete Isolated from Brazilian Mangrove Soil. Microbiology Resource Announcements , v. 7, p. e01102-18, 2018.

  • Salles, Joana Falcão ; Pereira e Silva, Michele C. ; DINI-ANDREOTE, FRANCISCO ; DIAS, ARMANDO C. F. ; GUILLAUMAUD, NADINE ; POLY, FRANCK ; van Elsas, Jan Dirk . Successional patterns of key genes and processes involved in the microbial nitrogen cycle in a salt marsh chronosequence. Biogeochemistry (Dordrecht) , v. 132, p. 185-201, 2017.

  • ANDREOTE, FERNANDO DINI ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA . Microbial communities associated with plants: learning from nature to apply it in agriculture. CURRENT OPINION IN MICROBIOLOGY , v. 37, p. 29-34, 2017.

  • L?PEZ-LOZANO, NGUYEN E. ; Pereira e Silva, Michele C. ; POLY, FRANCK ; GUILLAUMAUD, NADINE ; van Elsas, Jan Dirk ; SALLES, JOANA FALC?O . Denitrifying bacterial communities display different temporal fluctuation patterns across Dutch agricultural soils. ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY , v. 110, p. 1453-1465, 2017.

  • SOARES, FÁBIO ; MARCON, JOELMA ; Pereira e Silva, Michele ; KHAKHUM, NITTAYA ; CERDEIRA, LOUISE ; OTTONI, JÚLIA ; DOMINGOS, DANIELA ; TAKETANI, RODRIGO ; DE OLIVEIRA, VALÉRIA ; LIMA, ANDRÉ ; AZEVEDO, JOÃO ; RODRIGUES, JORGE ; ANDREOTE, FERNANDO . A Novel Multifunctional β-N-Acetylhexosaminidase Revealed through Metagenomics of an Oil-Spilled Mangrove. Bioengineering , v. 4, p. 62, 2017.

  • LOPES, LUCAS DANTAS ; DAVIS, EDWARD W. ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE C. ; WEISBERG, ALEXANDRA J. ; BRESCIANI, LUANA ; CHANG, JEFF H. ; LOPER, JOYCE E. ; ANDREOTE, FERNANDO D. . Tropical soils are a reservoir for fluorescent Pseudomonas spp. biodiversity. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY , v. 20, p. 62-74, 2017.

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  • LOPES, L. D. ; Pereira e Silva, MC ; ANDREOTE, F. D. . Bacterial Abilities and Adaptation Toward the Rhizosphere Colonization. Frontiers in Microbiology (Online) , v. 7, p. 10.3389/fmicb.2, 2016.

  • DURRER, ADEMIR ; GUMIERE, THIAGO ; TAKETANI, RODRIGO GOUVÊA ; COSTA, DIOGO PAES DA ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; ANDREOTE, FERNANDO DINI . The drivers underlying biogeographical patterns of bacterial communities in soils under sugarcane cultivation. Applied Soil Ecology (Print) , v. 110, p. 12-20, 2016.

  • Semenov, Alexander V. ; Pereira e Silva, MC ; Salles, Joana Falcão ; Schmitt, Heike ; van Elsas, Jan Dirk . Quantitative assessment of soil functioning across a representative range of Dutch soils. Ecological Indicators , v. 39, p. 88-93, 2014.

  • DINI-ANDREOTE, FRANCISCO ; DE CÁSSIA PEREIRA E SILVA, MICHELE ; TRIADÓ-MARGARIT, XAVIER ; CASAMAYOR, EMILIO O ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Dynamics of bacterial community succession in a salt marsh chronosequence: evidences for temporal niche partitioning. The ISME Journal (Print) , v. 9, p. 1989-2001, 2014.

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  • Zhang M ; WARMINCK, J. ; Pereira e Silva, Michele C. ; Brons J ; SMALLA, K. ; van Elsas, J. D. . IncP-1β Plasmids Are Important Carriers of Fitness Traits for Variovorax Species in the Mycosphere Two Novel Plasmids, pHB44 and pBS64, with Differential Effects Unveiled. Microbial Ecology , v. 70, p. 141-153, 2014.

  • SILVA, L. P. ; Pereira e Silva, Michele C. ; van ELSAS, J. D ; SELDIN, L. . Transcriptional profiling of genes involved in n-hexadecane compounds assimilation in the hydrocarbon degrading Dietzia cinnamea P4 strain. Brazilian Journal of Microbiology (Impresso) , v. 44, p. 639-647, 2013.

  • VIDEIRA, SANDY SAMPAIO ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; SOUZA GALISA, PÉRICLES ; DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; NISSINEN, RIITTA ; DIVAN, VERA LÚCIA BALDANI ; ELSAS, JAN DIRK ; BALDANI, JOSÉ IVO ; Salles, Joana Falcão . Culture-independent molecular approaches reveal a mostly unknown high diversity of active nitrogen-fixing bacteria associated with Pennisetum purpureum a bioenergy crop. Plant and Soil (Print) , v. 373, p. 737-754, 2013.

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  • DIAS, A. C. F. ; DINI-ANDREOTE, F. ; HANNULA, S. E. ; ANDREOTE, F. D. ; Pereira e Silva, Michele C. ; Salles, Joana Falcão ; BOER, W. ; VEEN, J. V. ; van Elsas, J. D. . Different Selective Effects on Rhizosphere Bacteria Exerted by Genetically Modified versus Conventional Potato Lines. Plos One , v. 8, p. e67948, 2013.

  • 2012 Pereira e Silva, Michele C. ; Poly, F. ; GUILLAUMAUD, N. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Fluctuations in ammonia oxidizing communities across agricultural soils are driven by soil structure and pH. Frontiers in Microbiology (Online) , v. 3, p. 1-22, 2012.

  • 2012 Semenov, Alexander V. ; Pereira e Silva, Michele C. ; Szturc-Koestsier, Agnieszka E. ; Schmitt, Heike ; Salles, Joana Falcão ; Dirk van Elsas, Jan . Impact of incorporated fresh 13C potato tissues on the bacterial and fungal community composition of soil. Soil Biology & Biochemistry , p. 88-95, 2012.

  • 2012 DIAS, A. C. F. ; HOOGWOUT, E. F. ; Pereira e Silva, MC ; SALLES, J. F. ; van OVERBEEK, L. S. ; van Elsas, Jan Dirk . Potato cultivar type affects the structure of ammonia oxidizer communities in field soil under potato beyond the rhizosphere. Soil Biology & Biochemistry , v. 50, p. 85-95, 2012.

  • 2012 DIAS, A. C. F. ; Pereira e Silva, Michele C. ; COTTA, S. ; DINI-ANDREOTE, F. ; SOARES JR, F. ; AZEVEDO, J. L. ; van ELSAS, J. D ; ANDREOTE, F. D. . Abundance and Genetic Diversity of nifH Gene Sequences in Anthropogenically Affected Brazilian Mangrove Sediments. Applied and Environmental Microbiology (Print) , v. 78, p. 7960-7967, 2012.

  • 2012 Pereira e Silva, Michele C. ; Semenov, Alexander V. ; Schmitt, Heike ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Microbe-mediated processes as indicators to establish the normal operating range of soil functioning. Soil Biology & Biochemistry , v. 000, p. 1-8, 2012.

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  • 2011 Pereira e Silva, Michele C. ; Semenov, Alexander V. ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Seasonal variations in the diversity and abundance of diazotrophic communities across soils. FEMS Microbiology, Ecology (Print) , v. 77, p. 57-68, 2011.

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  • DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; COTTA, S. ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; SOARES JUNIOR, F. L. ; AZEVEDO, J. L. ; MELO, I. S. ; van Elsas, J. D. ; ANDREOTE, F. D. . Diversidade de Bactérias Totais e Fixadoras de Nitrogênio em Sedimentos de Manguezais. In: FertBio, 2012, Maceió. FertBio 2012, 2012.

  • ARAUJO, J. E. ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; LOURENCO, M. V. M. ; ANDREOTE, F. D. . Genetic and functional characterization of Planctomycetes community of mangrove soils. In: ISME Conference, 2016, Montreal. Abstract Book ISME 2016, 2016.

  • Pereira e Silva, MC ; LOPES, L. D. ; BRESCIANI, L. ; ANDREOTE, F. D. . A pan genome analysis of fluorescent Pseudomonads in sugarcane soil and rhizosphere. In: 13th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 2015, Milao. BAGECO 13 - The microbial continuity across changing ecosystems, 2015.

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  • Pereira e Silva, Michele C. ; LOPES, L. D. ; BRESCIANI, L. ; ANDREOTE, F. D. . Studying the pangenome of fluorescent Peudomonas spp. obtained from soil and rhizosphere of sugarcane. In: XXVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianópolis. Anais do XXVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015.

  • LOPES, L. D. ; Pereira e Silva, Michele C. ; BRESCIANI, L. ; VARIZE, C. S. ; QUECINE, M. C. ; ANDREOTE, F. D. . Differential phylogenetic, genomic and physiological profiles of Pseudomonas from sugarcane rhizosphere and bulk soil. In: XXVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianópolis. Anais XXVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015.

  • LOPES, L. D. ; Pereira e Silva, M.D.C. ; BRESCIANI, L. ; ANDREOTE, F. D. . Contrasting sugarcane rhizosphere and bulk soil microbial communities based on taxonomic and functional traits. In: XXVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015, Florianópolis. Anais XXVIII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2015.

  • DURRER, A. ; GUMIERE, T. ; ANDRADE, P. A. M. ; COSTA, D. P. ; TAKETANI, R. G. ; LIMA, J. ; Pereira e Silva, M.C. ; MELO, I. S. ; ANDREOTE, F. D. . Soils properties outpaces agricultural practices in the determination of bacterial community structure in sugarcane fields. In: ISME 15, 2014, Seoul. Poster list, 2014.

  • PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; SCHLOTER-HAI, B. ; Poly, F. ; GUILLAUMAUD, N. ; SCHLOTER, M. ; van Elsas, J. D. ; Salles, Joana Falcão . The genetic diversity of archaeal ammonia oxidizers drives the potential nitrification rates in Dutch agricultural soils. In: 2nd Thünen Symposium on Soil Metagenomics, 2013, Braunschweig. Soil Metagenomics - Mining and learning from metagenomes, 2013.

  • DINI-ANDREOTE, FRANCISCO ; Pereira e Silva, M.C. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Bacterial succession in a developing salt marsh ecosystem. In: 12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology - BAGECO 12, 2013, Ljubljana. Networking and Plasticity of microbial communities: the secret to sucess, 2013.

  • Pereira e Silva, Michele C. ; SCHLOTER-HAI, B. ; Poly, F. ; GUILLAUMAUD, N. ; SCHLOTER, M. ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Temporal dynamics of archaeal ammonia oxidizers in agricultural soil in response to different environmental parameters. In: Netherlands Annual Ecology Meeting, 2013, Lunteren. NAEM 2013, 2013.

  • DINI-ANDREOTE, F. ; Pereira e Silva, Michele C. ; TRIADÓ-MARGARIT, XAVIER ; CASAMAYOR, EMILIO O ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Soil Bacterial community succession along a salt marsh chronosequence: insights into temporal niche segregation promoting phyotypes co-existence. In: 2nd Thünen Symposium on soil metagenomics, 2013, Braunsweig. 2nd Thünen Symposium on soil metagenomics - Mining and Learning from Metagenomes, 2013.

  • PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; SCHLOTER-HAI, B. ; Poly, F. ; GUILLAUMAUD, N. ; SCHLOTER, M. ; van Elsas, J. D. ; Salles, Joana Falcão . Genetic diversity of archaeal ammonia oxidizers drives potential nitrification rates in agricultural soils. In: 12 Symposium of Bacterial Genetics and Ecology - BAGECO, 2013, Lijbljana. BAGECO12, 2013.

  • Pereira e Silva, MC ; SCHLOTER-HAI, B. ; GUILLAUMAUD, N. ; SCHLOTER, M. ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . SEASONAL CHANGES IN ABUNDANCE AND DIVERSITY OF N-CYCLING MICROORGANISMS ACROSS AGRICULTURAL SOILS. In: 14th International symposium on microbial ecology, 2012, Copenhagen. Anais of the 14th International symposium on microbial ecology, 2012.

  • DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CÁSSIA ; Salles, Joana Falcão ; AZEVEDO, J. L. ; MELO, I. S. ; van Elsas, Jan Dirk ; ANDREOTE, F. D. . Linking the edges of microbially-mediated nitrogen transformations in mangrove sediments. In: 11 Symposium of Bacterial Genetics and Ecology - BAGECO 11, 2011, Corfu. BAGECO 11, 2011.

  • SEMENOV, A. ; Pereira e Silva, M.C. ; SALLES, J. F. ; van Elsas, J. D. . Quantitative assessment of soil functioning across a representative range of Dutch soils. In: BAGECO - Bacterial genetics and ecology, 2011, Corfu. BAGECO - Microbial Genetics and Ecology, 2011.

  • Pereira e Silva, MC ; GUILLAUMAUD, N. ; Poly, F. ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Abundance, diversity and functional role of ammonia oxidizing communities across Dutch soils. In: Netherlands Annual Ecology Meeting, 2011, Lunteren. List of Abstracts, 2011.

  • Pereira e Silva, Michele C. ; GUILLAUMAUD, N. ; Poly, F. ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Abundance, diversity and functional role of ammonia oxidizing communities across Dutch soils. In: Ecology of Soil Microorganisms, 2011, Praga. Abstract Book - Ecology of soil microorganisms, 2011.

  • Pereira e Silva, MC ; SEMENOV, A. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Establishing the baseline of soil functioning in relation to key steps of the N2 cycle. In: Netherlands Annual Ecology Meeting, 2010, Lunteren. Abstracts of the Netherlands Annual Ecology Meeting, 2010.

  • Pereira e Silva, MC ; QUECINE, M. C. ; ARAUJO, W. L. . Estratégia polifásica para o estudo da interação entre cana-de-açúcar (Saccharum sp.) e Methylobacterium extorquens. In: Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2007, Brasília DF. Anais do Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2007.

  • ONO, E. Y. ; MEIRELES, P. G. ; Pereira e Silva, MC ; HASHIMOTO, E. ; UENO, Y. ; HIROOKA, E. Y. . Efeito do teor de umidade sobre a microbiota fúngica e contaminação por fumonisinas durante a armazenagem de milho. In: XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2003, Florianópolis. XXII Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2003.

  • Pereira e Silva, MC ; HIROOKA, E. Y. ; ONO, E. Y. ; SASAKI, E. Y. ; KAWAMURA, O. ; UENO, Y. ; MEIRELES, P. G. . Performance of Indirect Competitive Elisa for Fumonisin Detection in Corn Based products. In: XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2001, Foz do Iguaçu - PR. XXI Congresso Brasileiro de Microbiologia - Resumos. Rio de Janeiro - RJ: Armazem das Letras - Gráfica e Editora, 2001. v. único. p. 293-293.

  • ONO, E. Y. ; MEIRELES, P. G. ; Pereira e Silva, MC ; SASAKI, E. Y. ; KAMOGAE, Y. ; UENO, Y. ; HIROOKA, E. Y. . Fumonisins and mycoflora profile in corn samples of the state of Paraná. In: Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2001, Foz de Iguaçú. XXI Congresso de Microbiologia - Resumos. Rio de Janeiro - RJ: Armazém das Letras - Gráfica e Editora, 2001. v. único. p. 294-294.

  • Pereira e Silva, M.C. . How the rhizosphere shapes bacterial communities and genomes. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva MC . Análises Metagenômicas. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, Michele C. . Estratégias de análise metagenômica. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, Michele C. . Indicadores de impacto no solo. 2016. (Apresentação de Trabalho/Outra).

  • ARAUJO, J. E. ; Pereira e Silva, MC ; LOURENCO, M. V. M. ; ANDREOTE, F. D. . 16th International Symposium on Microbial Ecology ISME 2016. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Pereira e Silva, MC ; ANDREOTE, F. D. . Pan-genomics in the rhizosphere. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, MC ; ANDREOTE, F. D. . Comunicação Microbiana - Quorum sensing. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva MC . La investigation cientifica no Brasil: Microbiologia de Suelos. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, Michele C. . Descrição de comunidades microbianas. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, Michele C. . Biologia Molecular no estudo do microbioma do solo. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, Michele C. ; LOPES, L. D. ; ANDREOTE, F. D. . Aplicação do conceito de pan-genoma na análise da diversidade ecológica e genética de Pseudomonas spp. isoladas da rizosfera de cana-de-açúcar. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • DURRER, A. ; GUMIERE, T. ; ANDRADE, P. A. M. ; LIMA, J. ; TAKETANI, R. G. ; Pereira e Silva, Michele C. ; MELO, I. S. ; ANDREOTE, F. D. . Soil properties outpace agricultural practices in the determination of bacterial community structure in sugarcane fields. 2014. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Pereira e Silva, MC ; ANDREOTE, F. D. . Introdução à Ecologia Microbiana. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, MC . Introdução à metagenômica. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, MC ; SCHLOTER-HAI, B. ; Poly, F. ; GUILLAUMAUD, N. ; SCHLOTER, M. ; van Elsas, Jan Dirk ; Salles, Joana Falcão . Genetic diversity of archaeal ammonia oxidizers drives potential nitrification rates in agricultural soils. 2013. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Pereira e Silva, Michele C. ; SCHLOTER-HAI, B. ; Poly, F. ; GUILLAUMAUD, N. ; SCHLOTER, M. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Genetic diversity of archaeal ammonia oxidizers drives potential nitrification rates in agricultural soils. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, Michele C. ; SCHLOTER-HAI, B. ; SCHLOTER, M. ; Poly, F. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . The genetic diversity of archaeal ammonia oxidizers drives the potential nitrification rates in Dutch agricultural soils. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, MC . Cloning methods and procedures. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Pereira e Silva, MC . Amplicon sequencing analysis. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Pereira e Silva, MC . Metagenomics of complex microbial communities. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, MC . Amplicon Sequencing Analysis:bioinformatic tools. 2013. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Pereira e Silva, MC ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Spatial and temporal dynamics of nitrogen cycling communities. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

  • Pereira e Silva, MC . Metagenomics of complex microbial communities. 2013. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Pereira e Silva, MC . Cloning methods and procedures. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Pereira e Silva, MC . Amplicon sequencing analysis. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Pereira e Silva, Michele C. . The normal operating range of soil functioning:ammonia oxidizers as a model group. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Pereira e Silva, MC . PCR amplification. 2012. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

  • Pereira e Silva, MC ; SEMENOV, A. ; GUILLAUMAUD, N. ; Poly, F. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Abundance, diversity and functional role of ammonia oxidizing communities across Dutch soils. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Pereira e Silva, MC ; SEMENOV, A. ; GUILLAUMAUD, N. ; Poly, F. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Establishing the baseline of soil functioning in relation to key steps of the nitrogen cycle. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Pereira e Silva, MC ; SEMENOV, A. ; van Elsas, J. D. ; SALLES, J. F. . Seasonal variations in diversity and abundance of diazotrophic communities across soils and their proposed role as indicators of soil quality. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Pereira e Silva, MC ; QUECINE, M. C. ; ARAUJO, W. L. . Estratégia polifásica para o estudo da colonização de cana-de-açúcar por Methylobacterium extorquens. 2007. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

  • Pereira e Silva, MC ; MEIRELES, P. G. ; ONO, E. Y. . Fumonisinas e Inibidor de amilase contra F. moniliforme em híbidos de milho. 2001. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

  • Pereira e Silva, MC . The normal operating range of soil functioning: understanding the natural fluctuations of the nitrogen cycling communities. Wöhrmann Print Service, 2013 (Tese de Doutorado).

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Projetos de pesquisa

  • 2014 - 2017

    Descrição do pan-genoma de Pseudomonas spp. fluorescentes na rizosfera de cana-de-açúcar, Descrição: O gênero Pseudomonas é um dos mais efetivos na colonização da rizosfera, podendo atuar como supressora de doença em plantas, além de ser um grupo altamente diverso ecologicamente. A vasta gama de variações ecológicas e metabólicas do gênero se reflete na diversidade genética que ocorre dentro das espécies pertencentes a esse gênero. Apesar da importância de Pseudomonas spp. no solo, até o momento poucos genomas encontram-se disponíveis. Neste projeto o pan-genoma (conjunto de genes relacionados a uma espécie) de Pseudomonas spp. fluorescentes (principalmente Pseudomonas fluorescens e P. putida) será estudado, com a finalidade de melhor entender as relações ecológicas que tais organismos estabelecem na rizosfera, e como tais genomas se moldam frente a diferentes ambientes encontrados no sistema solo-planta. Esse será o primeiro estudo de sequenciamento e comparação de genomas do grupo das Pseudomonas fluorescentes isoladas da rizosfera de cana-de-açúcar no Brasil. Assim, este estudo contribuirá para o conhecimento da complexa associação entre genética e ecologia dessas espécies, dando suporte a inferências inovadoras sobre o papel microbiano no desenvolvimento vegetal.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / Armando Cavalcante Franco Dias - Integrante / Fernando Dini Andreote - Coordenador / Simone Raposo Cotta - Integrante / Danielle Santos - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

  • 2014 - Atual

    Plasmidoma de solos de manguezais, Descrição: Os manguezais são áreas localizadas nas planícies de inundação das marés, compondo um dos ambientes naturais mais degradados no Brasil. O uso de metodologias que acessam a estrutura e o funcionamento dos grupos microbianos nos manguezais, bem como a descrição dos plasmídeos que hospedam genes relacionados a importantes transformações neste sistema, é importante no avanço do conhecimento sobre este ambiente diverso, encontrado apenas em regiões tropicais e subtropicais de nosso planeta. Este projeto tem como objetivo compreender os mecanismos adaptativos das comunidades microbianas presentes nos solos de manguezais por meio da descrição da composição dos plasmídeos desse sistema. Essas adaptações são vitais para a manutenção e para o funcionamento do sistema... , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / Fernando Dini Andreote - Integrante / DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO - Coordenador / Simone Raposo Cotta - Integrante.

  • 2010 - 2015

    O papel de plasmídios na adaptação e evolução de comunidades bacterianas da micosfera, Descrição: O objetivo deste projeto é avançar o atual conhecimento sobre o papel de plasmídios, principalmente dos grupos IncP-1 e PromA, na ecologia de bacterias presentes na micosfera, região em contato com fungos. As hipóteses são: (1) plasmídios dos grupos mencionados são importantes facilitadores de transferência horizontal de genes na micosfera, mas são diferencialmente importantes in diferentes tipos de fungos, (2) plasmídios do mesmo grupo evoluiram em diferentes direções, (3) plasmídios conferem certas características à comunidade bacteriana na micosfera, permitindo sua adaptação e aumentando o fitness, em comparação com bactérias sem plasmídios. Diferentes micosferas foram coletadas, gerando um mosaico de genomas plasmidiais,. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / Jan Dirk van Elsas - Coordenador / Jolanda Brons - Integrante / Miaozhi Zhang - Integrante., Financiador(es): University of Groningen - Bolsa.Número de orientações: 1

  • 2008 - 2012

    Establishing the normal operating range of Dutch soils (ERGO 2), Descrição: This proposal aims to assess the baseline variation (also called the normal operating range, or NOR) of soil function across an extended range of Dutch soils and crops typically used in agriculture. The ultimate aim is to provide experimental tools for use by regulatory agencies in order to assess the effects of transgenic plants, as well as a basic set of data on the variance of these parameters to weigh the effects against. As major effects on soil functioning are expected to come from the plant, and since soil microorganisms (bacteria, archaea, fungi and the next-higher trophic level protozoa) can be considered to represent the most important determinants in the (biogeochemical) functioning of soil as well as the trophic level that is most directly interacting with the plant, the emphasis of the work in this project will be on these microbial groups. We will apply, and partially finetune, a consolidated set of traditional and advanced tools to assess microbial function and diversity in agricultural soils. On top of this, we will use stable isotope probing as a tool that assesses the flow of carbon into the soil microbiota. Thus, a consolidated set of tools for ecological risk assessment will be applied across a range of field soils sampled over four growth seasons. This will yield both a toolbox and a dataset that allows risk assessers to weigh putative effects of GM plants against the baseline. The proposed work is closely connected to an existing ERGO project that assesses the baseline, as well as the effects of two transgenic plants, in a more limited study, in potato. It will effectively expand the work and the expertise, including a much larger range of soils, crops and tools for ecological endpoint assessment.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / Jan Dirk van Elsas - Coordenador / Joana Falcão salles - Integrante / Heike Schmitt - Integrante / Agniezka Szturc - Integrante., Financiador(es): University of Groningen - Remuneração., Número de produções C, T & A: 4

  • 2006 - 2008

    Interação entre Methylobacterium extorquens e cana-de-açúcar (Saccharum sp.), Descrição: As plantas quando colonizadas produzem diversas enzimas de defesa que podem impedir o estabelecimento de microrganismos. Esta condição adversa na planta hospedeira gera uma resposta do microrganismo, a qual está associada à síntese de proteínas e outras moléculas que atuam na sua interação com a planta e alteram a comunidade microbiana associada. Todos os organismos respondem a essa condição, estabelecendo biofilmes, ou sintetizando um grupo de moléculas e proteínas que os protegem de danos e facilita a recuperação. Estas são chamadas proteínas de choque térmico (HSPs), as quais não foram ainda estudadas na interação Methylobacterium ? planta. As bactérias do gênero Methylobacterium são metilotróficas facultativas da classe Alfa-proteobactéria, encontradas em relações epifíticas e endofíticas com diferentes espécies vegetais. Assim, o presente trabalho teve como objetivos avaliar o efeito da deficiência da produção de biofilme e de Acil-Homoserina-Lactonas (AHLs), e do estresse térmico de M. extorquens na colonização da planta hospedeira (Saccharum sp.). Para isso, foram usadas linhagens defectivas para produção de biofilme e AHLs, juntamente com a linhagem selvagem submetida ou não ao estresse térmico. Os resultados obtidos mostram a complexidade dos mecanismos envolvidos na produção de biofilme e moléculas AHLs. O estresse térmico não afetou a colonização das raízes nem de colmos após 5 dias de inóculo, porém causou uma diminuição da colonizacão do colmo após 15 dias. A mutação para produção de AHL não causou nenhuma diferença significativa na colonização da planta hospedeira, no entanto o mutante para biofilme apresentou uma diminuição significativa da colonização tanto de raízes quanto de colmos, mostrando a grande importância da formação de biofilme na colonização da planta hospedeira. Entretanto, quando esta linhagem foi coinoculada com uma linhagem transformada (ARGFP) este resultado não foi observado. Os demais tratamentos após co-inoculação com a linhagem ARGFP apresentaram o mesmo padrão de colonização. O estudo proteômico de M. extorquens detectou um grande número de proteínas induzidas ou suprimidas nos tratamentos avaliados que podem estar associadas às alterações no padrão de interação desta bactéria com a planta hospedeira. A identificação dessas proteínas auxiliará a compreensão e o maior entendimento dos fatores envolvidos na interação bactéria-planta.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / Welington Luiz Araujo - Coordenador.

  • 2000 - 2001

    Desenvolvimento e implementação de métodos imunológicos para a detecção de toxinas e patógenos microbianos, Descrição: Implementação de métodos imunológicos rápidos para a detecção direta de microrganismos patôgenicos e toxinas microbianas em alimentos e água para reduzir a dependênca atual da importância desses insumos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / E. Y. Ono - Coordenador / Paula Garcia meireles - Integrante / E. Y. Hirooka - Integrante., Financiador(es): Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 3

  • 2000 - 2001

    Bactérias, fungos e cianobactérias: estudo de microrganismos patogênico-toxigênicos visando controle e diagnóstic, Descrição: Controle biológico empregando mecanismo natural de defesa de planta, obtenção de microrganismos eficientes no controle biológico, identificação e desenvolvimento de processos tecnológicos que possam ser utilizados em nível industrial, incorporação de substâncias antagônicas em revestimentos comestíveis/biodgradáveis que impediriam o desenvolvimento de fungos micotoxigênicos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Michele de Cássia Pereira e Silva - Integrante / E. Y. Ono - Coordenador / Paula Garcia meireles - Integrante / E. Y. Hirooka - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 6

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  • Universidade Federal de São Carlos, Universidade Federal de São Carlos - Campus Sorocaba, Centro de Ciências e Tecnologias para a Sustentabilidade. , Rod. João Leme dos Santos, Km 110 - Sala CCTS 1143, Bairro do Itinga, 13418900 - Sorocaba, SP - Brasil, Telefone: (015) 32296000, URL da Homepage:

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Experiência profissional

  • 2012 - 2014

    University Of Groningen

    Vínculo: Pesquisador nivel 4 (RUG), Enquadramento Funcional: Pós doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2008 - 2013

    University Of Groningen

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Aluna de doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 01/2013 - 04/2014

      Pesquisa e desenvolvimento , Microbial Ecology, .,Linhas de pesquisa

    • 09/2008 - 01/2013

      Pesquisa e desenvolvimento , Biological Institute, .,Linhas de pesquisa

  • 2014 - 2017

    Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós doutorado, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

    Outras informações:
    Bolsista BJT Programa Atração de Jovem Talentos - Ciência sem Fronteiras

  • 2006 - 2008

    Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz

    Vínculo: Aluna de pós graduação, Enquadramento Funcional: Mestranda, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 04/2014

      Pesquisa e desenvolvimento , Escola superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Departamento de Ciência do Solo.,Linhas de pesquisa

  • 2000 - 2001

    Universidade Estadual de Londrina

    Vínculo: Bolsista CNPq, Enquadramento Funcional: Aluna de graduação, Carga horária: 20

  • 2005 - 2005

    Nortis Farmacêutica Ltda., .

    Vínculo: Funcionária empresa privada, Enquadramento Funcional: Analista do Controle de Qualidade, Carga horária: 44, Regime: Dedicação exclusiva.

  • 2004 - 2005

    Nortis Farmacêutica Ltda., .

    Vínculo: Funcionária de empresa privada, Enquadramento Funcional: Coordenadora de Controle de Qualidade, Carga horária: 44

    Outras informações:
    Laboratório de controle de qualidade fisico-químico e microbiológico: desenvolvimento de métodos analíticos, procedimentos, POPs, validação de métodos analíticos.

    Atividades

    • 02/2005 - 09/2005

      Direção e administração, Nortis Farmacêutica Ltda., .,Cargo ou função, Coordenação de Controle de Qualidade Físico-químico e Microbiológico.

    • 02/2004 - 02/2005

      Direção e administração, Nortis Farmacêutica Ltda., .,Cargo ou função, Analista de Controle de Qualidade Físico-químico e microbiológico.

    • 08/2003 - 12/2003

      Estágios , Nortis Farmacêutica Ltda., .,Estágio realizado, Estágio Supervisionado em Indústria Farmacêutica - requisito para graduação no Curso de Farmácia.

  • 2002 - 2002

    Farmácia de Manipulação Vale Verde, .

    Vínculo: Estagiária, Enquadramento Funcional: Estagiária, Carga horária: 20

    Outras informações:
    Estagiária na farmácia de Manipulação Vale Verde, em Londrina PR.

    Atividades

    • 03/2002 - 09/2002

      Estágios , Farmácia de Manipulação Vale Verde Ltda., .,Estágio realizado, Manipulação de fórmulas magistrais.

  • 2017 - Atual

    Universidade Federal de São Carlos

    Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pós doutoranda, Regime: Dedicação exclusiva.

    Atividades

    • 10/2017

      Pesquisa e desenvolvimento , Universidade Federal de São Carlos - Campus Sorocaba, Centro de Ciências e Tecnologias para a Sustentabilidade.,Linhas de pesquisa