Jorge dos Santos Ferreira

Pós-doutorado

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Organização de eventos

Participação em bancas

Produções bibliográficas

• J. SANTOS ; R. Lozano ; A. Friboulet . Identifying feedback mechanisms behind cell networks.. In: Sereno Alberto.. (Org.). Book AlBan of Projects Completed 06-07.. Portugal: Ed. Associação Grupo Santander, 2009, v. , p. -.

• J. SANTOS ; R. Lozano ; A. Friboulet ; E. Castellanos ; S. Mondie . Modelling an enzymatic diffusion-reaction process in one dimensional space.. Modeling and Control in Biomedical Systems. 1ed.France: Elsevier Science Publisher, 2006, v. 6, p. 435-440.

• J. SANTOS ; R. Lozano ; S. Mondie ; A. Friboulet . Bifurcation Analysis of a Biochemical Network. Lecture Notes in Control and Information Sciences, Book of Positive Systems.. : Springer Berlin/Heidelberg, 2006, v. 341, p. 279-286.

• J. SANTOS ; CORDERO, A. O. . Assessment of the performance of a nonlinear plant-observer control scheme.. In: S. Mondié. (Org.). System, Structure and Control. Mexico: Elsevier Science and Technology Publisher, 2005, v. , p. 240-245.

• J. SANTOS ; R. Middleton . An In-silico analysis of the SMART study of HIV infection.. In: Modelling and Control in Biomedical Systems, 2009, Aalborg-Denmark. 7th IFAC Symposium on Modelling and Control in Biomedical Systems, 2009. v. 7. p. 336-341.

• J. SANTOS ; ODONOGHUE, Y. ; R. Middleton . Analysis of HIV mutation dynamics for a linear mutation tree. In: 48th IEEE Conference on Decision and Control and 28th Chinese Control Conference, 2009, Shanghai. Proceedings of the 48th IEEE CDC and 28th CCC, 2009. v. 48. p. 1-6.

• J. SANTOS ; R. Lozano ; A. Friboulet . Dynamic analysis of an enzymatic membrane reactor. In: 47th IEEE Conference on Decision and Control, 2008, Cancun. Decision and Control, 2008. CDC 2008. 47th IEEE Conference, 2008. p. 1864-1869.

• J. SANTOS ; R. Middleton . Preliminary analysis of HIV infection dynamics.. In: 16th IET Irish Signals and Systems, 2008, Galway. Signals and Systems Conference, 2008. (ISSC 2008). IET Irish, 2008. p. 230-235.

• J. SANTOS ; I. Gosselin ; O. Wattraint ; A. Friboulet ; R. Lozano . Modelling and simulation of the central metabolic pathways of Sinorhizobium meliloti bacterium. In: Foundations of Systems Biology in Engineering, 2007, Stuttgart. FOSBE 2007, 2007. p. 219-224.

• S. Rihana ; J. SANTOS ; S. Mondie ; C. Marque . Dynamical analysis of uterine electrical activity model. In: IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, 2006, New York. EMBS '06. 28th Annual International Conference of the IEEE, 2006. p. 4179-4182.

• J. SANTOS ; A. Friboulet ; R. Lozano . Modelling of Acetylcholinesterase immobilized into artificial membrane. In: IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, 2006, New York. EMBS '06. 28th Annual International Conference of the IEEE, 2006. p. 4187-4191.

• J. SANTOS ; R. Lozano ; A. Friboulet ; S. Mondie . Prediction of unstable behavior in enzymatic. In: 45th IEEE Conference on Decision an Control, 2006, San Diego. 45th IEEE Conference on Decision an Control, 2006. v. 45. p. 2082-2087.

• J. SANTOS ; R. Lozano ; A. Friboulet ; S. Mondie . Mathematical modelling of dynamics in enzymatic mechanisms, a case study. In: Trends in Enzymology, Jun 7 10, 2006, Como, Itália. Trends in Enzymology, 2006.

• J. SANTOS ; A. Friboulet ; S. Mondie ; R. Lozano ; E. Castellanos . Computer simulation of qualitative behavior resulting from the immobilization of Acetylcholinesterase. In: MGMS international meeting on biomolecular simulation, Sep. 11th-14th, 2005, Dublin, Irlanda. MGMS international meeting on biomolecular simulation, 2005.

• J. SANTOS ; S. Mondie ; R. Lozano ; A. Friboulet . Search of the Instrumental Feedback Mechanism in Biochemical Networks: A simple Linear Approach. In: 45th Annual Meeting of the American Society for Cell Biology, Dec. 10-14, 2005, San Francisco, USA. 45th Annual Meeting of the American Society for Cell Biology, 2005.

Projetos de pesquisa

• 2008 - Atual

  Análise matemática das dinâmicas de Síndrome da Imunodeficiência Adquirida, Descrição: O objetivo deste projeto é a modelagem matemática das dinâmicas da infecção pelo HIV. Particularmente, se deseja compreender como e porque o sistema imunológico de certos indivíduos soropositivos é capaz de se adaptar à presença do vírus, sem entretanto ser afetado por ele. A possibilidade de desenvolver novas estratégias de tratamento que possam permitir a outros pacientes restituir suas próprias defesas e diminuir a dependência de antiretrovirais é a principal motivação deste projeto. A metodologia consiste em aplicar análise matemática/computacional aos diferentes estágios da infecção durante o curso da enfermidade. Dados clínicos de aidéticos são utilizados para calibrar os modelos concebidos e torná-los mais realísticos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge dos Santos Ferreira - Integrante / Ernesto Castellanos Velasco - Integrante / Rick Middleton - Coordenador / Wilhelm Huisinga - Integrante / Max von Kleist - Integrante / Yoann O'Donoghue - Integrante., Financiador(es): Science Foundation Ireland - Auxílio financeiro / Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología de Mexico - Cooperação.

• 2004 - Atual

  Aproximação sistema para a compreensão de redes metabólicas e sua modificação em vista de sua exploração racional, Descrição: O objetivo deste projeto é responder a questão de como utilizar as modificações globais observadas nos sistemas vivos para comprender e/ou deduzir as interações existentes a nível dos pontos chaves de suas vias metabólicas. Um grupo multidisplinar de trabalho foi formado, associando biologia, matemáticas aplicadas, informática e teoria de controle. Se elaborarão modelos matemáticos originais que permitam hierarquizar os dados experimentais, visando compreender a complexidade de sistemas vivos a partir de uma aproximação sistêmica. Este projeto está organizado de acordo a níveis crescentes de complexidade: i) análise do comportamento de uma único enzima (acetylcolinesterase) conduzindo a um modelo funcional capaz de predizer as modificações observadas em experimentos. ii) análise de uma via metabólica bacteriana que permita conceber e desenvolver ferramentas genéricas de modelagem de redes metabólicas. iii) análise de uma rede metabólica compartimentada (síntese de lipídios em embriões de plantas oleaginosas) utilizada para identificar os elementos de base necessários para estabelecer um modelo global de análise de fluxos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Jorge dos Santos Ferreira - Integrante / Rogelio Lozano Leal - Integrante / Alain Friboulet - Integrante / Sabine Mondie - Integrante / Isabelle Gosselin - Integrante / Olivier Wattraint - Integrante / Brigitte Thomasset - Coordenador / Albrecht Roscher - Integrante / Corinne Pau-Roblot - Integrante / Hervé Adenier - Integrante / Abdelghani Idrissi - Integrante / Ghislaine Joly-Blanchard - Integrante / Abdellatif El Badia - Integrante / Marc Dambrine - Integrante / Lilianne Denis-Vidal - Integrante / Djalil Kateb - Integrante / Stéphane Mottelet - Integrante / Nathalie Vediere - Integrante., Financiador(es): Programa Alban da Comissão Europeia - Bolsa.

Projetos de desenvolvimento

• 2007 - Atual

  Estudo do comportamento de sistemas em rede: protótipos de prova., Descrição: A capacidade de comunicação rápida e confiável entre dispositivos e o uso de mecanismos padronizados são, hoje em dia, fatores indispensáveis no conceito de produtividade industrial. Neste sentido, redes de comunicação de campo (também conhecidas como Fieldbus), estão sendo largamente utilizadas desde as indústrias de processo e manufatura até prédios e sistemas logísticos. Neste contexto, este projeto consiste do estudo do comportamiento dessas redes de dados, compostas por vários elementos interagindo entre eles. O objetivo e desenvolver modelos e estratégias de controle que contribuam para assegurar: i) propriedades de estabilidade na conectividade dos nós da rede; ii) robustez na comunicação entre suas diferentes células, particularmente em situações de falhas, tais como rupturas de laços e queda de servidores. Serão realiazados estudos paralelos de modelos redes de reações bioquímicas, cuja análise matemática e computacional das principais proteínas e interações, servirão de referência para identificação e análise dos elementos críticos de uma rede física, composta por instrumentos inteligentes de campo, controladores lógicos programáveis, entre outros dispositivos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Integrantes: Jorge dos Santos Ferreira - Integrante / Ernesto Castellanos Velasco - Coordenador / Jesús Acosta Elías - Integrante / Pedro Gilberto Alvarado Leyva - Integrante / Valdemar Emigdio Arce Guevara - Integrante / Isaac Campos Cantón - Integrante / Gustavo Moreno Domínguez - Integrante / Juan Carlos Galván Chávez - Integrante., Financiador(es): Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología de Mexico - Auxílio financeiro.