Aline Vianna Bernardi

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• BERNARDI, ALINE V. ; GEROLAMO, LUIS E. ; DINAMARCO, TAISA MAGNANI ; TAPIA'BLÁCIDO, DELIA RITA . Optimization of biomass saccharification processes with experimental design tools for 2G ethanol production: a review. Biofuels Bioproducts & Biorefining-Biofpr , v. 17, p. 1789-1806, 2023.

• PEREIRA, LUCAS MATHEUS SOARES ; BERNARDI, ALINE VIANNA ; GEROLAMO, LUIS EDUARDO ; PEDERSOLI, WELLINGTON RAMOS ; CARRARO, CLÁUDIA BATISTA ; SILVA, ROBERTO DO NASCIMENTO ; UYEMURA, SERGIO AKIRA ; DINAMARCO, TAÍSA MAGNANI . Characterization of a New Glucose-Tolerant GH1 β-Glycosidase from Aspergillus fumigatus with Transglycosylation Activity. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 24, p. 4489, 2023.

• BERNARDI, ALINE VIANNA ; GEROLAMO, LUIS EDUARDO ; DE GOUVÊA, PAULA FAGUNDES ; YONAMINE, DEBORAH KIMIE ; PEREIRA, LUCAS MATHEUS SOARES ; DE OLIVEIRA, ARTHUR HENRIQUE CAVALCANTE ; UYEMURA, SÉRGIO AKIRA ; DINAMARCO, TAISA MAGNANI . LPMO AfAA9_B and Cellobiohydrolase AfCel6A from A. fumigatus Boost Enzymatic Saccharification Activity of Cellulase Cocktail. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 22, p. 276, 2021.

• BERNARDI, ALINE VIANNA ; GEROLAMO, LUIS EDUARDO ; UYEMURA, SERGIO AKIRA ; DINAMARCO, TAISA MAGNANI . A thermophilic, pH-tolerant, and highly active GH10 xylanase from Aspergillus fumigatus boosted pre-treated sugarcane bagasse saccharification by cellulases. INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS , v. 170, p. 113697, 2021.

• DE GOUVÊA, PAULA FAGUNDES ; GEROLAMO, LUIS EDUARDO ; BERNARDI, ALINE VIANNA ; PEREIRA, LUCAS MATHEUS SOARES ; UYEMURA, SERGIO AKIRA ; DINAMARCO, TAISA MAGNANI . Lytic Polysaccharide Monooxygenase from Aspergillus fumigatus can Improve Enzymatic Cocktail Activity During Sugarcane Bagasse Hydrolysis. PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS , v. 26, p. 377-385, 2019.

• Bernardi A. V. ; Yonamine, D. K. ; Uyemura, S. A. ; DINAMARCO, T. M. . A Thermostable Aspergillus fumigatus GH7 Endoglucanase Over-Expressed in Pichia pastoris Stimulates Lignocellulosic Biomass Hydrolysis. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 20, p. 2261, 2019.

• BERNARDI, ALINE VIANNA ; DE GOUVÊA, PAULA FAGUNDES ; GEROLAMO, LUIS EDUARDO ; YONAMINE, DEBORAH KIMIE ; DE LOURDES DE LIMA BALICO, LAÍS ; UYEMURA, SERGIO AKIRA ; DINAMARCO, TAISA MAGNANI . Functional characterization of GH7 endo-1,4-β-glucanase from Aspergillus fumigatus and its potential industrial application. PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION , v. 150, p. 1-11, 2018.

• DE GOUVÊA, PAULA FAGUNDES ; BERNARDI, ALINE VIANNA ; GEROLAMO, LUIS EDUARDO ; DE SOUZA SANTOS, EMERSON ; RIAÑO-PACHÓN, DIEGO MAURICIO ; UYEMURA, SERGIO AKIRA ; DINAMARCO, TAISA MAGNANI . Transcriptome and secretome analysis of Aspergillus fumigatus in the presence of sugarcane bagasse. BMC GENOMICS , v. 19, p. 1-18, 2018.

• Yonamine, D. K. ; BERNARDI, ALINE VIANNA ; UYEMURA, SERGIO AKIRA ; DINAMARCO, TAISA MAGNANI . Biochemical characterization of a GH7 Endo-1,4-β-glucanase from Aspergillus fumigatus after expression in P. pastoris. In: 48th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2019, Águas de Lindóia. 48th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2019.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; Yonamine, D. K. ; GEROLAMO, L. E. ; BALICO, L. L. L. ; Uyemura, S. A. ; DINAMARCO, T. M. . Cloning, Expression and Characterization of a Novel GH7 Endo-1,4-β-glucanase from Aspergillus fumigatus Involved in Biomass Hydrolysis. In: 47th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2018, Joinville. Livro de resumos do 47th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2018.

• Pereira, L. M. S. ; BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; DINAMARCO, T. M. . Clonagem, expressão e purificação de uma LPMO de Aspergillus fumigatus. In: 3º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2019, Ribeirão Preto. Livro de Resumos do 3º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2019.

• BERNARDI, A. V. ; Yonamine, D. K. ; DINAMARCO, T. M. . Avaliação da hidrólise de biomassas pela endoglucanase Af-EGL7 de A. Fumigatus. In: 3º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2019, Ribeirão Preto. Livro de Resumos do 3º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2019.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; DINAMARCO, T. M. . Biochemical characterization of a novel GH7 endoglucanase (Af-EGL7) from Aspergillus fumigatus. In: 40th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, 2018, Clearwater. Livro de resumos do 40th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, 2018.

• GEROLAMO, L. E. ; Gouvêa, P. F. ; BERNARDI, A. V. ; DINAMARCO, T. M. . Characterization of new LPMOs from Aspergillus fumigatus and their application in lignocellulose breakdown. In: Second LPMO Symposium, 2018, Marseille. Second LPMO Symposium, 2018.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; DINAMARCO, T. M. . Biochemical characterization of a novel GH7 endoglucanase (Af-EGL7) from Aspergillus fumigatus. In: 40th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, 2018, Clearwater. 40th Symposium on Biotechnology for Fuels and Chemicals, 2018.

• Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; BERNARDI, A. V. ; DINAMARCO, T. M. . Characterization of two Lytic Polyssacharide Monooxygenases (LPMO) from Aspergillus fumigatus involved in sugarcane bagasssse saccharification. In: XIII Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática, 2018, Florianópolis. XIII Seminário Brasileiro de Tecnologia Enzimática, 2018.

• GEROLAMO, L. E. ; BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; BALICO, L. L. L. ; DINAMARCO, T. M. . Clonagem, purificação e análise bioinformática de duas LPMOs de Aspergillus fumigatus envolvidas na desconstrução do bagaço de cana-de-açúcar. In: 2º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2017, Ribeirão Preto. Livro de resumos do 2º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2017.

• GEROLAMO, L. E. ; BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; DINAMARCO, T. M. . Cloning, purification and bioinformatics analysis of two Aspergillus fumigatus LPMOs involved on sugarcane bagasse deconstruction. In: Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2017, Campos do Jordão. Livro de resumos do Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2017.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; DINAMARCO, T. M. . Clonagem, expressão e purificação de uma xilanase GH10 de Aspergillus fumigatus envolvida na hidrólise de biomassas lignocelulósicas. In: 2º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2017, Ribeirão Preto. Livro de resumos do 2º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2017.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; DINAMARCO, T. M. . Cloning, expression and purification of GH10 xylanase gene from Aspergillus fumigatus involved in biomass hydrolysis. In: Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2017, Campos do Jordão. Livro de resumos do Brazilian Bioenergy Science and Technology Conference, 2017.

• GEROLAMO, L. E. ; Gouvêa, P. F. ; BERNARDI, A. V. ; DINAMARCO, T. M. . Identification of LPMOs in Aspergillus fumigatus secretome when grown in sugarcane bagasse. In: Workshop on Second Generation Bioethanol, 2016, Campinas. Livro de resumos do Workshop on Second Generation Bioethanol, 2016.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; PACHON, D. M. R. ; GEROLAMO, L. E. ; DINAMARCO, T. M. . Transcriptome analysis of Aspergillus fumigatus grown on sugarcane bagasse using RNA-Seq. In: Workshop on Second Generation Bioethanol, 2016, Campinas. Livro de resumos do Workshop on Second Generation Bioethanol, 2016.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; SANTOS, E. S. ; GEROLAMO, L. E. ; DINAMARCO, T. M. . Identificação de enzimas hidrolíticas seccretadas por Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana de açúcar, por técnica de RNAseq. In: 1º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2015, Ribeirão Preto. Livro de resumos do 1º Encontro Nacional de Química Biotecnológica e Agroindustrial, 2015.

• GEROLAMO, L. E. ; Gouvêa, P. F. ; BERNARDI, A. V. ; DINAMARCO, T. M. . Análise do secretoma de Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar. In: Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP (SIICUSP), 2015, Ribeirão Preto. Livro de resumos do Simpósio Internacional de Iniciação Científica e Tecnológica da USP, 2015.

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; Yonamine, D. K. ; GEROLAMO, L. E. ; BALICO, L. L. L. ; Uyemura, S. A. ; DINAMARCO, T. M. . Cloning, Expression and Characterization of a Novel GH7 Endo-1,4-β-glucanase from Aspergillus fumigatus Involved in Biomass Hydrolysis. 2018. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; BALICO, L. L. L. ; Magnani, T. . Clonagem, expressão e purificação de uma xilanase GH10 de Aspergillus fumigatus envolvida na hidrólise de biomassas lignocelulósicas. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; GEROLAMO, L. E. ; Magnani, T. . Cloning, expression and purification of GH10 xylanase gene from Aspergillus fumigatus involved in biomass hydrolysis. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• BERNARDI, A. V. ; Gouvêa, P. F. ; SANTOS, E. S. ; PACHON, D. M. R. ; GEROLAMO, L. E. ; Magnani, T. . Identificação de enzimas hidrolíticas secretadas por Aspergillus fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar, por ténicas de RNA-Seq. 2015. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2017 - 2021

  Clonagem, expressão e caracterização de três enzimas hidrolíticas de Aspergillus fumigatus envolvidas na desconstrução de bagaço de cana-de-açúcar, Descrição: Um dos investimentos necessários para tornar o etanol de segunda geração um produto economicamente competitivo é a otimização dos coquetéis enzimáticos utilizados na etapa de hidrólise da biomassa. Para tanto, estudos envolvendo novos microrganismos produtores de enzimas lignocelulolíticas e a caracterização dessas enzimas devem ser realizados. Nesse sentido, os resultados de transcriptoma e secretoma do A. fumigatus crescido na presença de bagaço de cana-de-açúcar explodido (SEB) revelaram a produção de importantes enzimas hidrolíticas e acessórias envolvidas na degradação de celulose e hemicelulose, das quais foram selecionadas uma endo-1,4-β-glucanase (Afu6g01800), uma celobiohidrolase (Afu3g01910) e uma endo-1,4-β-xilanase (Afu6g13610) para caracterização das atividades. As endoglucanases catalisam a clivagem randômica de ligações glicosídicas entre os açúcares nas regiões amorfas da cadeia de celulose, resultando na liberação de oligossacarídeos. As celobiohidrolases atuam nas extremidades redutoras (GH7) e não-redutoras (GH6) desse polímero liberando moléculas de celobiose. As endoxilanases, por sua vez, atuam na despolimerização da molécula de xilana, catalisando a hidrólise randômica de ligações glicosídicas presentes nas regiões internas da cadeia principal e liberando xilo-oligossacarídeos. Assim, tendo em vista a importância dessas enzimas para a degradação da biomassa vegetal, as mesmas serão clonadas e heterologamente expressas nos sistemas procarioto E.coli RosettaTM(DE3)pLysS e eucarioto P. pastoris X-33, purificadas e caracterizadas. Dependendo dos resultados obtidos, essas enzimas poderão se tornar potenciais alvos para a otimização dos coquetéis enzimáticos empregados na produção do etanol 2G.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Aline Vianna Bernardi - Integrante / taisa magnani dinamarco - Coordenador / Deborah Kimie Yonamine - Integrante.

• 2015 - 2017

  Identificação das principais enzimas hidrolíticas de A. fumigatus quando crescido em bagaço de cana-de-açúcar, Descrição: Atualmente, o Brasil produz mais de 25 bilhões de litros de etanol por ano a partir da cana-de-açúcar, o que representa aproximadamente 33% de toda produção mundial, destacando-o em um importante papel na futura demanda deste combustível. Para manter estes índices, são necessários investimentos compatíveis para geração de novas tecnologias na conversão da cana-de-açúcar para etanol. Atualmente, a produção de etanol ocorre a partir de tecnologias de primeira geração que utilizam a sacarose da cana-de-açúcar como fonte energética. Cerca de um terço da energia da planta é usado para a produção de etanol e açúcar, enquanto que o restante permanece no campo na forma de bagaço e palha, produzindo o maior resíduo da agroindústria brasileira. A grande quantidade de bagaço gerado, a fácil disponibilidade e o baixo custo estimulam os estudos para a produção de etanol, podendo o Brasil se tornar uma grande potência no desenvolvimento de etanol de segunda geração. Biocombustíveis de segunda geração podem ser produzidos a partir dos açúcares liberados da parede celular dos resíduos de origem vegetal, como o bagaço de cana-de-açúcar. A biomassa da cana-de-açúcar é constituída de material lignocelulósico, principalmente celulose e hemicelulose, que são polissacarídeos de açúcares de alta energia e que podem ser convertidos a etanol. No entanto, a associação entre a celulose, hemicelulose e pectina impõe grandes dificuldades para recuperar os açúcares constituintes sob a forma de monômeros com elevado grau de pureza. Devido a essa característica recalcitrante do bagaço, um grande desafio na produção de combustíveis de segunda geração é a conversão de substratos lignocelulósicos em açúcares fermentáveis. Com isso se tornam necessários pré-tratamentos mecânico ou químico eficazes, que visam destruir a estrutura celular do bagaço, para posterior hidrólise enzimática. Na natureza, os fungos e bactérias desempenham uma importante função na degradação da biomassa de plantas, pois secretam diferentes enzimas específicas para os polissacarídeos constituintes. Muitas destas enzimas são estudadas, caracterizadas e catalogadas no banco de dados CAZy, sendo as mais abundantes da classe das glicosil hidrolases (GH) e carboidrato esterases (CE). No entanto, pouco ainda é conhecido sobre a resposta dos fungos aos diferentes materiais lignocelulósicos e sobre a produção de enzimas e proteínas acessórias necessárias à quebra da biomassa vegetal. Atualmente, estas enzimas são mais estudadas em fungos como Aspergillus niger e Trichoderma reesei. Porém, outros membros do gênero Aspergillus são capazes de secretar enzimas hidrolíticas de extrema importância, dentre eles o A. fumigatus. Apesar do A. fumigatus ser um fungo patogênico, é considerado um importante produtor de enzimas como celulases, lipases e xilanases, cujo efeito sinérgico aumenta a eficiência hidrolítica das enzimas secretadas, mas ainda pouco se sabe sobre essas enzimas, fato que ressalta a importância do melhor entendimento deste mecanismo em A. fumigatus. Nesse sentido, os principais objetivos deste trabalho são as análises do perfil transcricional e do secretoma de A. fumigatus quando crescido na presença de bagaço de cana-de-açúcar, através de técnicas de RNA-seq e espectrometria de massas LC/MS, respectivamente. A análise dos dados de transcriptoma e secretoma poderão trazer novos conhecimentos das enzimas hidrolíticas que favoreçam sua aplicabilidade industrial, com ênfase no etanol de segunda geração.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Aline Vianna Bernardi - Integrante / Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador / Luis Eduardo Gerolamo - Integrante / Paula Fagundes de Gouvêa - Integrante.

• 2014 - 2014

  Padronização do crescimento de A. fumigatus em bagaço de cana-de-açúcar explodido, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Aline Vianna Bernardi - Integrante / Taisa Magnani Dinamarco - Coordenador.

• 2013 - 2014

  Determinação de fósforo total e solúvel em fertilizantes via molécula de PO por espectrometria de absorção molecular de alta resolução com fonte contínua, Descrição: O uso de fertilizantes faz-se necessário quando se pretende melhorar a produção agrícola, seja de forma qualitativa ou quantitativa. A obtenção de resultados positivos com a utilização de fertilizantes, contudo, está relacionada à concentração de determinados elementos presentes no mesmo. Alguns elementos, quando em concentrações elevadas, podem causar desde danos à agricultura até danos ao meio ambiente em geral. Da mesma forma, quando em concentrações muito baixas, os elementos presentes não são suficientes para suprir as necessidades da produção e os fertilizantes, por consequência, tornam-se ineficazes no cumprimento da sua função. Este projeto tem, como objetivo principal, o desenvolvimento de um método de determinação de fósforo total e solúvel, em fertilizantes, através da técnica analítica de espectrometria de absorção molecular de alta resolução com fonte contínua (HR-CS MAS, high-resolution continuum source molecular absorption spectrometry). Esta determinação tem sua importância no fato de que o fósforo constitui um dos elementos essenciais, não somente às plantas, mas também aos animais e seres humanos, quando em quantidades adequadas. Ao contrário disto, o fósforo também pode agir como elemento altamente tóxico ao meio ambiente, dependendo da forma em que se apresenta e da sua concentração no mesmo. A utilização do método de análise por HR-CS MAS é importante para que se possa, dessa forma, realizar comparações entre esta técnica, ainda pouco utilizada na determinação de não-metais, e a técnica padrão de determinação de fósforo em fertilizantes, com relação às limitações e vantagens das mesmas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Aline Vianna Bernardi - Integrante / Flávio Venâncio Nakadi - Integrante / Márcia Andreia Mesquita Silva da Veiga - Coordenador.

• 2013 - 2013

  Estudo da toxicidade de nanopartículas de prata em plantas aquáticas da espécie Lemna minor, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Aline Vianna Bernardi - Integrante / Márcia Andreia Mesquita Silva da Veiga - Coordenador / Lilian Rodrigues Rosa - Integrante.

Prêmios