Victor Ramos

Formação complementar

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Participação em eventos

Produções bibliográficas

• HÄGGLÖF, THOMAS ; CIPOLLA, MELISSA ; LOEWE, MAXIMILIAN ; CHEN, SPENCER T. ; MESIN, LUKA ; HARTWEGER, HARALD ; ELTANBOULY, MOHAMED A. ; CHO, ALICE ; GAZUMYAN, ANNA ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; STAMATATOS, LEONIDAS ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; VIANT, CHARLOTTE . Continuous germinal center invasion contributes to the diversity of the immune response. CELL , v. 186, p. 147-161.e15, 2023.

• SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS WANG, ZIJUN MUECKSCH, FRAUKE CHO, ALICE LOEWE, MAXIMILIAN CIPOLLA, MELISSA RASPE, RAPHAEL JOHNSON, BRIANNA CANIS, MARIE DASILVA, JUSTIN RAMOS, VICTOR RAMOS, V. TURROJA, MARTINA MILLARD, KATRINA G. SCHMIDT, FABIAN WITTE, LEANDER DIZON, JUAN SHIMELIOVICH, IRINA YAO, KAI-HUI OLIVEIRA, THIAGO Y. GAZUMYAN, ANNA GAEBLER, CHRISTIAN BIENIASZ, PAUL D. HATZIIOANNOU, THEODORA CASKEY, MARINA , et al. NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Antibody feedback regulates immune memory after SARS-CoV-2 mRNA vaccination. NATURE , v. 613, p. 735-742, 2023.

• GRISTICK, HARRY B. HARTWEGER, HARALD LOEWE, MAXIMILIAN VAN SCHOOTEN, JELLE RAMOS, VICTOR RAMOS, V. OLIVEIRA, THIAGO Y. NISHIMURA, YOSHIAKI KORANDA, NICHOLAS S. WALL, ABIGAIL YAO, KAI-HUI POSTON, DANIEL GAZUMYAN, ANNA WIATR, MARIE HORNING, MARCEL KEEFFE, JENNIFER R. HOFFMANN, MAGNUS A. G. YANG, ZHI ABERNATHY, MORGAN E. DAM, KIM-MARIE A. GAO, HAN GNANAPRAGASAM, PRIYANTHI N. P. KAKUTANI, LEESA M. PAVLOVITCH-BEDZYK, ANA JIMENA SEAMAN, MICHAEL S. , et al. HOWARTH, MARK MCGUIRE, ANDREW T. STAMATATOS, LEONIDAS MARTIN, MALCOLM A. WEST, ANTHONY P. NUSSENZWEIG, MICHEL C. BJORKMAN, PAMELA J. ; CD4 binding site immunogens elicit heterologous anti-HIV-1 neutralizing antibodies in transgenic and wild-type animals. Science Immunology , v. 8, p. 1-1, 2023.

• CHEONG, JIN-GYU RAVISHANKAR, ARJUN SHARMA, SIDDHARTHA PARKHURST, CHRISTOPHER N. GRASSMANN, SIMON A. WINGERT, CLAIRE K. LAURENT, PAOLINE MA, SAI PADDOCK, LUCINDA MIRANDA, ISABELLA C. KARAKASLAR, EMIN ONUR NEHAR-BELAID, DJAMEL THIBODEAU, ASA BALE, MICHAEL J. KARTHA, VINAY K. YEE, JIM K. MAYS, MINH Y. JIANG, CHENYANG DAMAN, ANDREW W. MARTINEZ DE PAZ, ALEXIA AHIMOVIC, DUGHAN RAMOS, VICTOR RAMOS, V. LERCHER, ALEXANDER NIELSEN, ERIK , et al. ALVAREZ-MULETT, SERGIO ZHENG, LING EARL, ANDREW YALLOWITZ, ALISHA ROBBINS, LEXI LAFOND, ELYSE WEIDMAN, KARISSA L. RACINE-BRZOSTEK, SABRINA YANG, HE S. PRICE, DAVID R. LEYRE, LOUISE RENDEIRO, ANDRÉ F. RAVICHANDRAN, HIRANMAYI KIM, JUNBUM BORCZUK, ALAIN C. RICE, CHARLES M. JONES, R. BRAD SCHENCK, EDWARD J. KANER, ROBERT J. CHADBURN, AMY ZHAO, ZHEN PASCUAL, VIRGINIA ELEMENTO, OLIVIER SCHWARTZ, ROBERT E. BUENROSTRO, JASON D. NIEC, RACHEL E. BARRAT, FRANCK J. LIEF, LINDSAY SUN, JOSEPH C. UCAR, DUYGU JOSEFOWICZ, STEVEN Z. ; Epigenetic memory of coronavirus infection in innate immune cells and their progenitors. CELL , v. 186, p. 3882-3902.e24, 2023.

• GUNST, JESPER D. HØJEN, JESPER F. PAHUS, MARIE H. ROSÁS-UMBERT, MIRIAM STIKSRUD, BIRGITTE MCMAHON, JAMES H. DENTON, PAUL W. NIELSEN, HENRIK JOHANSEN, ISIK S. BENFIELD, THOMAS LETH, STEFFEN GERSTOFT, JAN ØSTERGAARD, LARS SCHLEIMANN, MARIANE H. OLESEN, RIKKE STØVRING, HENRIK VIBHOLM, LINE WEIS, NINA DYRHOL-RIISE, ANNE M. PEDERSEN, KAREN B. H. LAU, JILLIAN S. Y. COPERTINO, DENNIS C. LINDEN, NOEMI HUYNH, TAN T. RAMOS, VICTOR , et al. RAMOS, V. JONES, R. BRAD LEWIN, SHARON R. TOLSTRUP, MARTIN RASMUSSEN, THOMAS A. NUSSENZWEIG, MICHEL C. CASKEY, MARINA REIKVAM, DAG HENRIK SØGAARD, OLE S. ; Impact of a TLR9 agonist and broadly neutralizing antibodies on HIV-1 persistence: the randomized phase 2a TITAN trial. NATURE MEDICINE , v. 1, p. 1-1, 2023.

• CHO, ALICE ; GAEBLER, CHRISTIAN ; OLVEIRA, THIAGO ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; SAAD, MARWA ; LORENZI, JULIO C. C. ; GAZUMYAN, ANNA ; MOIR, SUSAN ; CASKEY, MARINA ; CHUN, TAE-WOOK ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Longitudinal clonal dynamics of HIV-1 latent reservoirs measured by combination quadruplex polymerase chain reaction and sequencing. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , v. 119, p. 1--, 2022.

• WANG, ZIJUN MUECKSCH, FRAUKE CHO, ALICE GAEBLER, CHRISTIAN HOFFMANN, HANS-HEINRICH RAMOS, VICTOR RAMOS, V. ZONG, SHUAI CIPOLLA, MELISSA JOHNSON, BRIANA SCHMIDT, FABIAN DASILVA, JUSTIN BEDNARSKI, EVA BEN TANFOUS, TAREK RASPE, RAPHAEL YAO, KAIHUI LEE, YU E. CHEN, TERESIA TURROJA, MARTINA MILARD, KATRINA G. DIZON, JUAN KACZYNSKA, ANNA GAZUMYAN, ANNA OLIVEIRA, THIAGO Y. RICE, CHARLES M. , et al. CASKEY, MARINA BIENIASZ, PAUL D. HATZIIOANNOU, THEODORA BARNES, CHRISTOPHER O. NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Analysis of memory B cells identifies conserved neutralizing epitopes on the N-terminal domain of variant SARS-Cov-2 spike proteins. IMMUNITY , v. 55, p. 998-1012.e8, 2022.

• GAEBLER, CHRISTIAN ; NOGUEIRA, LILIAN ; STOFFEL, ELINA ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; BRETON, GAE'LLE ; MILLARD, KATRINA G. ; TURROJA, MARTINA ; BUTLER, ALLISON ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; SEAMAN, MICHAEL S. ; REEVES, JACQUELINE D. ; PETROUPOULOS, CHRISTOS J. ; SHIMELIOVICH, IRINA ; GAZUMYAN, ANNA ; JIANG, CAROLINE S. ; JILG, NIKOLAUS ; SCHEID, JOHANNES F. ; GANDHI, RAJESH ; WALKER, BRUCE D. ; SNELLER, MICHAEL C. ; FAUCI, ANTHONY ; CHUN, TAE-WOOK ; CASKEY, MARINA ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Prolonged viral suppression with anti-HIV-1 antibody therapy. NATURE , v. 606, p. 368-374, 2022.

• MUECKSCH, FRAUKE WANG, ZIJUN CHO, ALICE GAEBLER, CHRISTIAN BEN TANFOUS, TAREK DASILVA, JUSTIN BEDNARSKI, EVA RAMOS, VICTOR RAMOS, V. ZONG, SHUAI JOHNSON, BRIANNA RASPE, RAPHAEL SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS SHIMELIOVICH, IRINA DAGA, MRIDUSHI YAO, KAI-HUI SCHMIDT, FABIAN MILLARD, KATRINA G. TURROJA, MARTINA JANKOVIC, MILA OLIVEIRA, THIAGO Y. GAZUMYAN, ANNA CASKEY, MARINA HATZIIOANNOU, THEODORA BIENIASZ, PAUL D. , et al. NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Increased memory B cell potency and breadth after a SARS-CoV-2 mRNA boost. NATURE , v. 607, p. 128-134, 2022.

• CHO, ALICE ; MUECKSCH, FRAUKE ; WANG, ZIJUN ; BEN TANFOUS, TAREK ; DASILVA, JUSTIN ; RASPE, RAPHAEL ; JOHNSON, BRIANNA ; BEDNARSKI, EVA ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS ; SHIMELIOVICH, IRINA ; DIZON, JUAN P. ; YAO, KAI-HUI ; SCHMIDT, FABIAN ; MILLARD, KATRINA G. ; TURROJA, MARTINA ; JANKOVIC, MILA ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; GAZUMYAN, ANNA ; GAEBLER, CHRISTIAN ; CASKEY, MARINA ; HATZIIOANNOU, THEODORA ; BIENIASZ, PAUL D. ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Antibody evolution to SARS-CoV-2 after single-dose Ad26.COV2.S vaccine in humans. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE , v. 219, p. 1--, 2022.

• WEYMAR, GEORG H.J. ; BAR-ON, YOTAM ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; GAEBLER, CHRISTIAN ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; HARTWEGER, HARALD ; BRETON, GAËLLE ; CASKEY, MARINA ; COHN, LILLIAN B. ; JANKOVIC, MILA ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Distinct gene expression by expanded clones of quiescent memory CD4+ T cells harboring intact latent HIV-1 proviruses. Cell Reports , v. 40, p. 111311--, 2022.

• GUNST, JESPER D. PAHUS, MARIE H. ROSÁS-UMBERT, MIRIAM LU, I-NA BENFIELD, THOMAS NIELSEN, HENRIK JOHANSEN, ISIK S. MOHEY, RAJESH ØSTERGAARD, LARS KLASTRUP, VIBEKE KHAN, MARYAM SCHLEIMANN, MARIANE H. OLESEN, RIKKE STØVRING, HENRIK DENTON, PAUL W. KINLOCH, NATALIE N. COPERTINO, DENNIS C. WARD, ADAM R. ALBERTO, WINIFFER D. CONCE NIELSEN, SILKE D. PUERTAS, MARIA C. RAMOS, VICTOR RAMOS, V. REEVES, JACQUELINE D. PETROPOULOS, CHRISTOS J. , et al. MARTINEZ-PICADO, JAVIER BRUMME, ZABRINA L. JONES, R. BRAD FOX, JULIE TOLSTRUP, MARTIN NUSSENZWEIG, MICHEL C. CASKEY, MARINA FIDLER, SARAH SØGAARD, OLE S. ; Early intervention with 3BNC117 and romidepsin at antiretroviral treatment initiation in people with HIV-1: a phase 1b/2a, randomized trial. NATURE MEDICINE , v. 1, p. 1--, 2022.

• WANG, ZIJUN ZHOU, PENGCHENG MUECKSCH, FRAUKE CHO, ALICE BEN TANFOUS, TAREK CANIS, MARIE WITTE, LEANDER JOHNSON, BRIANNA RASPE, RAPHAEL SCHMIDT, FABIAN BEDNARSKI, EVA DA SILVA, JUSTIN RAMOS, VICTOR RAMOS, V. ZONG, SHUAI TURROJA, MARTINA MILLARD, KATRINA G. YAO, KAI-HUI SHIMELIOVICH, IRINA DIZON, JUAN KACZYNSKA, ANNA JANKOVIC, MILA GAZUMYAN, ANNA OLIVEIRA, THIAGO Y. CASKEY, MARINA , et al. GAEBLER, CHRISTIAN BIENIASZ, PAUL D. HATZIIOANNOU, THEODORA NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Memory B cell responses to Omicron subvariants after SARS-CoV-2 mRNA breakthrough infection in humans. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE , v. 219, p. 1--, 2022.

• WANG, ZIJUN MUECKSCH, FRAUKE MUENN, FRIEDERIKE CHO, ALICE ZONG, SHUAI RASPE, RAPHAEL RAMOS, VICTOR RAMOS, V. JOHNSON, BRIANNA BEN TANFOUS, TAREK DASILVA, JUSTIN BEDNARSKI, EVA GUZMAN-CARDOZO, CAMILA TURROJA, MARTINA MILLARD, KATRINA G. TOBER-LAU, PINKUS HILLUS, DAVID YAO, KAI-HUI SHIMELIOVICH, IRINA DIZON, JUAN KACZYNSKA, ANNA JANKOVIC, MILA GAZUMYAN, ANNA OLIVEIRA, THIAGO Y. CASKEY, MARINA , et al. BIENIASZ, PAUL D. HATZIIOANNOU, THEODORA KURTH, FLORIAN SANDER, LEIF ERIK NUSSENZWEIG, MICHEL C. GAEBLER, CHRISTIAN ; Humoral immunity to SARS-CoV-2 elicited by combination COVID-19 vaccination regimens. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE , v. 219, p. 1--, 2022.

• GAEBLER, CHRISTIAN WANG, ZIJUN LORENZI, JULIO C. C. MUECKSCH, FRAUKE FINKIN, SHLOMO TOKUYAMA, MINAMI CHO, ALICE JANKOVIC, MILA SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS OLIVEIRA, THIAGO Y. CIPOLLA, MELISSA VIANT, CHARLOTTE BARNES, CHRISTOPHER O. BRAM, YARON BRETON, GAËLLE HA'GGLO'F, THOMAS MENDOZA, PILAR HURLEY, ARLENE TURROJA, MARTINA GORDON, KRISTIE MILLARD, KATRINA G. RAMOS, VICTOR RAMOS, V. SCHMIDT, FABIAN WEISBLUM, YISKA , et al. JHA, DIVYA TANKELEVICH, MICHAEL MARTINEZ-DELGADO, GUSTAVO YEE, JIM PATEL, ROSHNI DIZON, JUAN UNSON-O?BRIEN, CECILLE SHIMELIOVICH, IRINA ROBBIANI, DAVIDE F. ZHAO, ZHEN GAZUMYAN, ANNA SCHWARTZ, ROBERT E. HATZIIOANNOU, THEODORA BJORKMAN, PAMELA J. MEHANDRU, SAURABH BIENIASZ, PAUL D. CASKEY, MARINA NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Evolution of antibody immunity to SARS-CoV-2. Nature , v. -, p. 1-33, 2021.

• MERKENSCHLAGER, JULIA ; FINKIN, SHLOMO ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; KRAFT, JULIAN ; CIPOLLA, MELISSA ; NOWOSAD, CARLA R. ; HARTWEGER, HARALD ; ZHANG, WENZHU ; OLINARES, PAUL DOMINIC B. ; GAZUMYAN, ANNA ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; CHAIT, BRIAN T. ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Dynamic regulation of TFH selection during the germinal centre reaction. Nature , v. 1, p. 1-23, 2021.

• WANG, ZIJUN SCHMIDT, FABIAN WEISBLUM, YISKA MUECKSCH, FRAUKE BARNES, CHRISTOPHER O. FINKIN, SHLOMO SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS CIPOLLA, MELISSA GAEBLER, CHRISTIAN LIEBERMAN, JENNA A. OLIVEIRA, THIAGO Y. YANG, ZHI ABERNATHY, MORGAN E. HUEY-TUBMAN, KATHRYN E. HURLEY, ARLENE TURROJA, MARTINA WEST, KAMILLE A. GORDON, KRISTIE MILLARD, KATRINA G. RAMOS, VICTOR RAMOS, V. SILVA, JUSTIN DA XU, JIANLIANG COLBERT, ROBERT A. PATEL, ROSHNI , et al. DIZON, JUAN UNSON-O?BRIEN, CECILLE SHIMELIOVICH, IRINA GAZUMYAN, ANNA CASKEY, MARINA BJORKMAN, PAMELA J. CASELLAS, RAFAEL HATZIIOANNOU, THEODORA BIENIASZ, PAUL D. NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; mRNA vaccine-elicited antibodies to SARS-CoV-2 and circulating variants. Nature , v. 3, p. 1-25, 2021.

• VIANT, CHARLOTTE ; WIRTHMILLER, TOBIAS ; ELTANBOULY, MOHAMED A. ; CHEN, SPENCER T. ; CIPOLLA, MELISSA ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; STAMATATOS, LEONIDAS ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Germinal center-dependent and -independent memory B cells produced throughout the immune response. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE , v. 218, p. 1, 2021.

• WANG, ZIJUN MUECKSCH, FRAUKE SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS FINKIN, SHLOMO VIANT, CHARLOTTE GAEBLER, CHRISTIAN HOFFMANN, HANS- HEINRICH BARNES, CHRISTOPHER O. CIPOLLA, MELISSA RAMOS, VICTOR RAMOS, V. OLIVEIRA, THIAGO Y. CHO, ALICE SCHMIDT, FABIAN DA SILVA, JUSTIN BEDNARSKI, EVA AGUADO, LAUREN YEE, JIM DAGA, MRIDUSHI TURROJA, MARTINA MILLARD, KATRINA G. JANKOVIC, MILA GAZUMYAN, ANNA ZHAO, ZHEN RICE, CHARLES M. , et al. BIENIASZ, PAUL D. CASKEY, MARINA HATZIIOANNOU, THEODORA NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Naturally enhanced neutralizing breadth against SARS-CoV-2 one year after infection. NATURE , v. 1, p. 1, 2021.

• CHO, ALICE MUECKSCH, FRAUKE SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS WANG, ZIJUN FINKIN, SHLOMO GAEBLER, CHRISTIAN RAMOS, VICTOR RAMOS, V. CIPOLLA, MELISSA MENDOZA, PILAR AGUDELO, MARIANNA BEDNARSKI, EVA DASILVA, JUSTIN SHIMELIOVICH, IRINA DIZON, JUAN DAGA, MRIDUSHI MILLARD, KATRINA TURROJA, MARTINA SCHMIDT, FABIAN ZHANG, FENGWEN TANFOUS, TAREK BEN JANKOVIC, MILA OLIVERIA, THIAGO Y. GAZUMYAN, ANNA CASKEY, MARINA , et al. BIENIASZ, PAUL D. HATZIIOANNOU, THEODORA NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Anti-SARS-CoV-2 receptor binding domain antibody evolution after mRNA vaccination. NATURE , v. 1, p. 1--, 2021.

• MUECKSCH, FRAUKE WEISBLUM, YISKA BARNES, CHRISTOPHER O. SCHMIDT, FABIAN SCHAEFER-BABAJEW, DENNIS WANG, ZIJUN C. LORENZI, JULIO C. FLYAK, ANDREW I. DELAITSCH, ANDREW T. HUEY-TUBMAN, KATHRYN E. HOU, SHURONG SCHIFFER, CELIA A. GAEBLER, CHRISTIAN DA SILVA, JUSTIN POSTON, DANIEL FINKIN, SHLOMO CHO, ALICE CIPOLLA, MELISSA OLIVEIRA, THIAGO Y. MILLARD, KATRINA G. RAMOS, VICTOR RAMOS, V. GAZUMYAN, ANNA RUTKOWSKA, MAGDALENA CASKEY, MARINA , et al. NUSSENZWEIG, MICHEL C. BJORKMAN, PAMELA J. HATZIIOANNOU, THEODORA BIENIASZ, PAUL D. ; Affinity maturation of SARS-CoV-2 neutralizing antibodies confers potency, breadth, and resilience to viral escape mutations. IMMUNITY , v. 54, p. 1853-1868.e7, 2021.

• HUANG, AMY S. ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; GAEBLER, CHRISTIAN ; JANKOVIC, MILA ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; COHN, LILLIAN B. . Integration features of intact latent HIV-1 in CD4+ T cell clones contribute to viral persistence. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE , v. 218, p. 1--, 2021.

• ESCOLANO, AMELIA GRISTICK, HARRY B. GAUTAM, RAJEEV DELAITSCH, ANDREW T. ABERNATHY, MORGAN E. YANG, ZHI WANG, HAOQING HOFFMANN, MAGNUS A.G. NISHIMURA, YOSHIAKI WANG, ZIJUN KORANDA, NICHOLAS KAKUTANI, LEESA M. GAO, HAN GNANAPRAGASAM, PRIYANTHI N. P. RAINA, HENNA GAZUMYAN, ANA CIPOLLA, MELISSA OLIVEIRA, THIAGO Y. RAMOS, VICTOR RAMOS, V. IRVINE, DARRELL J. SILVA, MURILLO WEST, ANTHONY P. KEEFFE, JENNIFER R. BARNES, CHRISTOPHER O. , et al. SEAMAN, MICHAEL S. NUSSENZWEIG, MICHEL C. MARTIN, MALCOLM A. BJORKMAN, PAMELA J. ; Sequential immunization of macaques elicits heterologous neutralizing antibodies targeting the V3-glycan patch of HIV-1 Env. Science Translational Medicine , v. 13, p. 1--, 2021.

• MENDOZA, PILAR ; JACKSON, JULIA R. ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; GAEBLER, CHRISTIAN ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; CASKEY, MARINA ; JANKOVIC, MILA ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; COHN, LILLIAN B. . Antigen-responsive CD4+ T cell clones contribute to the HIV-1 latent reservoir. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE , v. 217, p. 1-10, 2020.

• WANG, ZIJUN ; BARNES, CHRISTOPHER O ; GAUTAM, RAJEEV ; CETRULO LORENZI, JULIO C ; MAYER, CHRISTIAN T ; OLIVEIRA, THIAGO Y ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; CIPOLLA, MELISSA ; GORDON, KRISTIE M ; GRISTICK, HARRY B ; WEST, ANTHONY P ; NISHIMURA, YOSHIAKI ; RAINA, HENNA ; SEAMAN, MICHAEL S ; GAZUMYAN, ANNA ; MARTIN, MALCOLM ; BJORKMAN, PAMELA J ; NUSSENZWEIG, MICHEL C ; ESCOLANO, AMELIA . A broadly neutralizing macaque monoclonal antibody against the HIV-1 V3-Glycan patch. eLife , v. 9, p. 1-27, 2020.

• MAYER, CHRISTIAN T. ; NIEKE, JAN P. ; GAZUMYAN, ANNA ; CIPOLLA, MELISSA ; WANG, QIAO ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; MONETTE, SÉBASTIEN ; LI, QUAN-ZHEN ; GERSHWIN, M. ERIC ; KASHKAR, HAMID ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . An apoptosis-dependent checkpoint for autoimmunity in memory B and plasma cells. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA , v. 117, p. 24957-24963, 2020.

• ROBBIANI, DAVIDE F. GAEBLER, CHRISTIAN MUECKSCH, FRAUKE LORENZI, JULIO C. C. WANG, ZIJUN CHO, ALICE AGUDELO, MARIANNA BARNES, CHRISTOPHER O. GAZUMYAN, ANNA FINKIN, SHLOMO HÄGGLÖF, THOMAS OLIVEIRA, THIAGO Y. VIANT, CHARLOTTE HURLEY, ARLENE HOFFMANN, HANS-HEINRICH MILLARD, KATRINA G. KOST, RHONDA G. CIPOLLA, MELISSA GORDON, KRISTIE BIANCHINI, FILIPPO CHEN, SPENCER T. RAMOS, VICTOR RAMOS, V. PATEL, ROSHNI DIZON, JUAN , et al. SHIMELIOVICH, IRINA MENDOZA, PILAR HARTWEGER, HARALD NOGUEIRA, LILIAN PACK, MAGGI HOROWITZ, JILL SCHMIDT, FABIAN WEISBLUM, YISKA MICHAILIDIS, ELEFTHERIOS ASHBROOK, ALISON W. WALTARI, ERIC PAK, JOHN E. HUEY-TUBMAN, KATHRYN E. KORANDA, NICHOLAS HOFFMAN, PAULINE R. WEST, ANTHONY P. RICE, CHARLES M. HATZIIOANNOU, THEODORA BJORKMAN, PAMELA J. BIENIASZ, PAUL D. CASKEY, MARINA NUSSENZWEIG, MICHEL C. ; Convergent antibody responses to SARS-CoV-2 in convalescent individuals. NATURE , v. -, p. 1-25, 2020.

• WANG, ZIJUN ; LORENZI, JULIO C. C. ; MUECKSCH, FRAUKE ; FINKIN, SHLOMO ; VIANT, CHARLOTTE ; GAEBLER, CHRISTIAN ; CIPOLLA, MELISSA ; HOFFMANN, HANS-HEINRICH ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; OREN, DEENA A. ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; NOGUEIRA, LILIAN ; MICHAILIDIS, ELEFTHERIOS ; ROBBIANI, DAVIDE F. ; GAZUMYAN, ANNA ; RICE, CHARLES M. ; HATZIIOANNOU, THEODORA ; BIENIASZ, PAUL D. ; CASKEY, MARINA ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Enhanced SARS-CoV-2 neutralization by dimeric IgA. Science Translational Medicine , v. -, p. eabf1555-17, 2020.

• GAEBLER, CHRISTIAN ; FALCINELLI, SHANE D. ; STOFFEL, ELINA ; READ, JENNA ; MURTAGH, ROSS ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; LORENZI, JULIO C. C. ; KIRCHHERR, JENNIFER ; JAMES, KATHERINE S. ; ALLARD, BRIGITTE ; BAKER, CAROLINE ; KURUC, JOANN D. ; CASKEY, MARINA ; ARCHIN, NANCIE M. ; SILICIANO, ROBERT F. ; MARGOLIS, DAVID M. ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Sequence evaluation and comparative analysis of novel assays for intact proviral HIV-1 DNA. JOURNAL OF VIROLOGY , v. -, p. 1-36, 2020.

• GAEBLER, CHRISTIAN ; LORENZI, JULIO C.C. ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; NOGUEIRA, LILIAN ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; LU, CHING-LAN ; PAI, JOY A. ; MENDOZA, PILAR ; JANKOVIC, MILA ; CASKEY, MARINA ; NUSSENZWEIG, MICHEL C. . Combination of quadruplex qPCR and next-generation sequencing for qualitative and quantitative analysis of the HIV-1 latent reservoir. JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE , v. 216, p. jem.20190896, 2019.

• DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; SANTOS E SILVA, JUAN CARLO ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; CÔRTES MARTINS, YASMMIN ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; SIMÕES CARNIVALI, GUSTAVO ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Pervasive Inter-Individual Variation in Allele-Specific Expression in Monozygotic Twins. Frontiers in Genetics , v. 10, p. 1/1178, 2019.

• WANG, ZIJUN ; MERKENSCHLAGER, JULIA ; CHEN, SPENCER T. ; OLIVEIRA, THIAGO Y. ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; GORDON, KRISTIE M. ; YAO, KAI-HUI ; JANKOVIC, MILA ; GAZUMYAN, ANNA ; NUSSENZWEIG, MICHEL ; ESCOLANO, AMELIA . Isolation of single HIV-1 Envelope specific B cells and antibody cloning from immunized rhesus macaques. JOURNAL OF IMMUNOLOGICAL METHODS , v. 112734, p. 112734, 2019.

• DE SÁ MACHADO ARAÚJO, GRAZIELA ; DA SILVA FRANCISCO JUNIOR, RONALDO ; DOS SANTOS FERREIRA, CRISTINA ; MOZER RODRIGUES, PEDRO THYAGO ; TERRA MACHADO, DOUGLAS ; LOUVAIN DE SOUZA, THAIS ; TEIXEIRA DE SOUZA, JOZIMARA ; FIGUEIREDO OSORIO DA SILVA, CLEITON ; ALVES DA SILVA, ANTÔNIO FRANCISCO ; ANDRADE, CLAUDIA CAIXETA FRANCO ; DA SILVA, ALAN TARDIN ; RAMOS, VICTOR ; RAMOS, V. ; GARCIA, ANA BEATRIZ ; MACHADO, FILIPE BRUM ; MEDINA-ACOSTA, ENRIQUE . Maternal 5mCpG Imprints at the PARD6G-AS1 and GCSAML Differentially Methylated Regions Are Decoupled From Parent-of-Origin Expression Effects in Multiple Human Tissues. Frontiers in Genetics , v. 9, p. 1-17, 2018.

• RAMOS, V. ; VENCIO, R. Z. N. ; KOIDE, T. . Mapeamento e caracterização in silico de RNAs Circulares em Halobacterium salinarum. In: 25º Simpósio Internacional de Iniciação Científica, 2017, Ribeirão Preto. Mapeamento e caracterização in silico de RNAs Circulares em Halobacterium salinarum, 2017.

• RAMOS, V. ; VENCIO, R. Z. N. ; KOIDE, T. . Mapeamento e caracterização in silico de RNAs circulares em Halobacterium salinarum.. In: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da USP, 2016, Riberião Preto - São Paulo. Mapeamento e caracterização in silico de RNAs circulares em Halobacterium salinarum., 2016.

• RAMOS, V. ; OLIVEIRA, T. Y. K. ; GAEBLER, CHRISTIAN ; MENDOZA, PILAR ; NUSSENZWEIG, MICHEL . Defective and Intact HIV genome Assembler (DIHIVA), a pipeline to annotate and classify HIV genomes based on Next-Generation Sequencing Data. 2020. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• SILVA, C. F. O. ; SOUZA, J. T. ; FRANCISCO JUNIOR, R. S. ; FERREIRA, C. S. ; RAMOS, V. ; RAMOS, V. ; ACOSTA, E. M. . Candidate genomic imprinting status of the human Retro-HNRNPA1 gene based on Pervasive Evidence of Monoallelic Expression in Multiple Tissues. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• RAMOS, V. ; GOMES-FILHO, J. V. ; VENCIO, R. Z. N. ; KOIDE, T. . Mapeamento e caracterização in silico de RNAs circulares na archaea extremófila Halobacterium salinarum. 2017. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• RAMOS, V. ; KOIDE, T. ; VENCIO, R. Z. N. . Mapeamento e caracterização in silico de RNAs circulares na archaea extremófila Halobacterium salinarum. 2016. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

Projetos de pesquisa

• 2017 - 2018

  miRNAPath2, um pacote R integrativo para análise de miRNA, Descrição: Micro-RNAs (miRNAs) são moléculas de 20-25 nucleotídeos amplamente estudadas por atuarem na modulação de circuitos moleculares que regulam processos biológicos como, proliferação celular, apoptose, diferenciação celular e metástase, e sua desregulação está associada também com a tumorigênese. Os miRNAs também agem na regulação de processos associados com doenças cardiovasculares, neurológicas, diabetes obesidade, etc. Uma das principais questões relativas ao estudo dos miRNAs está na identificação e validação de seus alvos (mRNAs) e na verificação do processo em que estas moléculas estão envolvidas. Nesse contexto, há diversos algoritmos sendo utilizados por plataformas on-line que possibilitam a predição de alvos, enriquecimento de vias e análise de correlação inversa entre miRNA-mRNA para ajudar na validação dos alvos preditos. Tais plataformas, apesar de informativas, tem deficiências e precisam ser mais assertivas, para aumentar sua confiabilidade com a redução de resultados falso-positivos. Em resumo, propomos o desenvolvimento de um pacote em R nos moldes do Bioconductor que integre diferentes módulos funcionais hierarquizados, visando avaliar o papel dos miRNAs na regulação de diferentes sistemas biológicos. Integrantes: Victor Ramos, Thiago Yukio Kikuchi Oliveira Coordenadores: Wilson Araujo da Silva Jr. Projeto CNPQ 101048/2018-1. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Victor Ramos - Integrante / Thiago Yukio Kikuchi Oliveira - Integrante / Wilson Araújo da Silva Junior - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2016 - 2017

  Mapeamento e caracterização in silico de RNAs circulares em Halobacterium salinarum, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Tie Koide em 18/10/2022., Descrição: A abundância de RNAs circulares (circRNAs) tem sido reportada recentemente em organismos de todos os domínios da vida, indicando a sua importância nas redes de regulação gênica. No domínio Archaea, Halobacterium salinarum tem se consolidado como um organismo modelo, visto a facilidade de cultivo e manipulação em laboratório, aliada a abundância de dados em escala genômica, o que permitiu estabelecer um modelo de rede de regulação gênica global. Nosso laboratório vem trabalhando na identificação e caracterização de RNAs não-codificantes neste organismo de modo a refinar os modelos de regulação gênica. Através da aquisição de dados experimentais de RNAseq, foi possível constatar a presença de um grande número de circRNAs em H. salinarum, alguns deles com possível atuação como RNAs antisense a genes importantes no metabolismo celular. Porém, para o mapeamento mais preciso dessas moléculas e exclusão de falsos positivos, faz-se necessária uma análise mais minuciosa dos dados experimentais já obtidos. Neste projeto, propõe-se a utilização de ferramentas de bioinformática para refinar o mapeamento de circRNAs e iniciar uma caracterização in silico dessas moléculas, incluindo propriedades estruturais. Estas informações deverão enriquecer o conjunto de ncRNAs identificados em H. salinarum para futuramente refinar o modelo global de regulação gênica, incluindo os circRNAs.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Victor Ramos - Integrante / Tie Koide - Coordenador / Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio - Integrante.

Prêmios