Viviani Akemi Kasahara

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Produções bibliográficas

• KASAHARA, VIVIANI A. ; DO CARMO NICOLETTI, MARIA . Graph-based Clustering of miRNA Sequences. MicroRNA , v. 6, p. 166-186, 2017.

Projetos de pesquisa

• 2015 - 2016

  Agrupamento de sequências de MiRNA utilizando aprendizado não supervisionado baseado em grafos, Descrição: A análise de agrupamento é uma organização de coleção de padrões em grupos, baseando-se na similaridade das propriedades pertencentes aos dados. A técnica de agrupamento pode ser utilizado em muitas áreas de conhecimento como biotecnologia, visão computacional, recuperação de documentos, entre outras. Uma área interessante da biologia envolve o conceito de microRNAs (miRNAs), que são moléculas não-codificadas de RNA com aproximadamente 22 nucleotídeos e que desempenham um papel importante na regulação dos genes. O agrupamento de sequências de miRNA podem ajudar em sua exploração e entendimento, pois as sequências que pertencem ao mesmo grupo possuem uma função biológica similar. Esse trabalho explora e investiga sete algoritmos de agrupamentos não-supervisionados baseados em grafos que podem ser divididos em três categorias: algoritmos baseados em região de influência, algoritmos baseados em árvore spanning minimal e algoritmo espectral. Para avaliar a contribuição dos algoritmos propostos, os experimentos conduzidos utilizaram os dados das famílias de miRNAs disponíveis no banco de dados denominado miRBase. Os resultados dos experimentos foram apresentados, analisados e avaliados usando índices de validação de agrupamento e análise visual.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Viviani Akemi Kasahara - Integrante / DO CARMO NICOLETTI, MARIA - Coordenador.

• 2008 - 2008

  Algoritmos de agrupamento baseados em morfologia binária e em árvores, Descrição: Este trabalho de graduação objetivou o estudo e a investigação de dois algoritmos de agrupamento, mais especificamente, (1) o algoritmo BMCA [Postaire et al. 1993], que realiza agrupamento com base no conceito de morfologia binária e (2) o algoritmo baseado no conceito de árvore, proposto em [Koontz et al. 1976]. É importante enfatizar que o trabalho de graduação realizado pode ser caracterizado como pesquisa subjacente ao trabalho que vem desenvolvido pela aluna em seu projeto de Iniciação Científica (agosto 2007-julho 2008). O trabalho de graduação teve como objetivos específicos: 1) identificação e caracterização das potencialidades de ambos os algoritmos e 2) expansão do ambiente computacional sendo desenvolvido durante o projeto de IC, com a agregação de dois novos sistemas que implementam tais algoritmos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Viviani Akemi Kasahara - Integrante / Maria do Carmo Nicoletti - Coordenador.

• 2007 - 2008

  Técnicas de Agrupamento Baseadas em Grafos para o Aprendizado não Supervisionado de Conceitos, Descrição: Esse projeto focaliza a investigação empírica de algoritmos aglomerativos, especificamente a subcategoria de algoritmos baseados em conceitos da Teoria dos Grafos, com ênfase em algoritmos baseados em árvores spanning minimais, conectividade, componentes conexas e partição. Algoritmos desta família são capazes de detectar agrupamentos com vários formatos, pelo menos nos casos em que estão bem separados. A detecção de agrupamentos de vários formatos é compartilhada apenas por poucos algoritmos de agrupamento. Serão investigadas as propostas que contemplarem algoritmos implementáveis, uma vez que um dos principais objetivos do projeto é desenvolver um ambiente computacional para experimentação, que vai disponibilizar técnicas de agrupamento baseadas em grafos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Viviani Akemi Kasahara - Integrante / Maria do Carmo Nicoletti - Coordenador., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

Prêmios