DANILO LOPES MARTINS

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Participação em eventos

Produções bibliográficas

• MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, A. L. F. ; SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. . Continuação das implementações/estudos de métodos para analise de genes diferencialmente expressos.. In: XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017, Natal. XXVIII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2017.

• MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, A. L. F. ; SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. . Estudo e implementação e métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas.. In: XXVII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2016, Natal. XXVII CICT Congresso de Iniciação Científica e Tecnológica da UFRN, 2016.

• ALVES SOBRINHO, P. A. ; MARTINS, D. L. ; FONSECA, A. L. F. ; SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. . R-Peridot: A Dynamic, Expansible and User Friendly Tool For Differential Expression Analysis of RNA-Seq and Gene Ontology. In: 9th IUPAP International Conference on Biological Physics - Systems Biology Satellite, 2017, Natal. 9th IUPAP International Conference on Biological Physics - Systems Biology Satellite, 2017.

• MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, A. L. F. ; SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. . SGS: Statistical Gene Signature For RNA-Seq Analysis. In: SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease: Translational research in bioinformatics and systems biology, 2016, Natal. SB-Meeting 2016 - From Algorithms to Disease: Translational research in bioinformatics and systems biology, 2016.

• MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, A. L. F. ; SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. . Continuação das implementações/estudos de métodos para analise de genes diferencialmente expressos.. 2017. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, A. L. F. ; SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. . Estudo e implementação e métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas.. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• MARTINS, D. L. ; ALVES SOBRINHO, P. A. ; FONSECA, A. L. F. ; SOUZA, S. J. ; SOUZA, J. E. S. . SGS: Statistical Gene Signature For RNA-Seq Analysis. 2016. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2017 - Atual

  Estudos de métodos para analise e identificação de genes diferencialmente expressos, Descrição: Desenvolver interfaces para a análise de expressão gênica e obtenção de assinaturas estáveis de expressão a partir de dados de obtidos de experimentos de microarray e/ou de sequenciamento do transcriptoma por tecnologias de segunda geração (RNA-seq). Nos últimos anos houveram muitos avanços na área e muitas metodologias e técnicas têm sido propostas para avaliação de expressão gênica, vide o repositório do Bioconductor (projeto que disponibiliza pacotes R para a análise de dados genômicos), porém ferramentas com design amigáveis precisam ser desenvolvidas para possibilitar a análise de dados por profissionais com pouca experiência em análise computacional de grande volume de dados, com pouco conhecimento em estatística e programação. Desta forma a ferramenta proposta pelo presente trabalho deve oferecer ao usuário o suporte necessário para uma correta analise de seus dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Danilo Lopes Martins - Integrante / Pitágoras de Azevedo Alves Sobrinho - Integrante / Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador.

• 2016 - 2017

  Continuação das implementações/estudos de métodos para analise de genes diferencialmente expressos., Descrição: O trabalho consiste na continuação de um projeto que visa o estudo e implementação de módulos de métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas, tais módulos serão componentes que servirão para o desenvolvimento de interfaces para a análise de expressão gênica e obtenção de assinaturas estáveis de expressão a partir de dados obtidos de experimentos de microarray e/ou de sequenciamento do transcriptoma por tecnologias de segunda geração (RNA-seq). No primeiro ano de projeto implementamos 3 módulos bem conhecidos da área de bioinformática (DESeq, edgeR e EBSeq), no entanto, existem muitos outros módulos que pretendemos implementar e assim aumentar a funcionalidade de nossa aplicação Este plano de trabalho faz parte de um projeto de estudo e implementação de interfaces para análise de expressão gênica que visa o desenvolvimento de ferramentas com design amigáveis que precisam ser desenvolvidas para possibilitar a análise de dados por profissionais com pouca experiência em análise computacional de grande volume de dados, com pouco conhecimento em estatística e programação. Desta forma a ferramenta proposta pelo presente trabalho deve oferecer os métodos necessários para o de desenvolvimento de uma interface amigável a analise dados oriundos de experimentos de microarray e/ou de sequenciamento do transcriptoma.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Danilo Lopes Martins - Integrante / Pitágoras de Azevedo Alves Sobrinho - Integrante / Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador.

• 2016 - 2016

  Estudo e implementação e métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas., Descrição: O trabalho consiste no estudo e implementação de módulos de métodos computacionais/estatísticos para obtenção de assinaturas gênicas, tais módulos serão componentes que servirão para o desenvolvimento de interfaces para a análise de expressão gênica e obtenção de assinaturas estáveis de expressão a partir de dados de obtidos de experimentos de microarray e/ou de sequenciamento do transcriptoma por tecnologias de segunda geração (RNA-seq). Este plano de trabalho faz parte de um projeto de estudo e implementação de interfaces para análise de expressão gênica que visa o desenvolvimento de ferramentas com design amigáveis que precisam ser desenvolvidas para possibilitar a análise de dados por profissionais com pouca experiência em análise computacional de grande volume de dados, com pouco conhecimento em estatística e programação. Desta forma a ferramenta proposta pelo presente trabalho deve oferecer os métodos necessários para o de desenvolvimento de uma interface amigável a analise dados oriundos de experimentos de microarray e/ou de sequenciamento do transcriptoma.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Danilo Lopes Martins - Integrante / Jorge Estefano Santana de Souza - Coordenador.