Anelis Maria Marin

Pós-doutorado

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• WOSNIAKI, DENISE KUSMA ; MARIN, Anelis Maria ; OLIVEIRA, RAFAELA NOGA ; KOERICH, GABRIELA MARINO ; MUNHOZ, EDUARDO CILIÃO ; FARIAS, JOÃO SAMUEL DE HOLANDA ; BELTRAME, MIRIAM PERLINGEIRO ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; AOKI, MATEUS NÓBREGA . The Screening of microRNAs in Chronic Myeloid Leukemia: A Clinical Evaluation. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 25, p. 3363, 2024.

• PRADO, NAYRA OLIVEIRA ; MARIN, Anelis Maria ; LALLI, LARISSA ARAUJO ; SANCHUKI, HELOISA BRUNA SOLIGO ; WOSNIAKI, DENISE KUSMA ; NARDIN, JEANINE MARIE ; MORALES, HUGO MANOEL PAZ ; BLANES, LUCAS ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; AOKI, MATEUS NÓBREGA . Development and evaluation of a lyophilization protocol for colorimetric RT-LAMP diagnostic assay for COVID-19. Scientific Reports , v. 14, p. 10612, 2024.

• Benevides, APK ; MARIN, A.M. ; WOSNIAKI, DENISE KUSMA ; OLIVEIRA, R. N. ; KOERICH, GABRIELA MARINO ; NICHELE, B. K. ; MUNHOZ, EDUARDO CILIÃO ; ZANETTE, D. L. ; AOKI, M. N. . Expression of HOTAIR and PTGS2 as potential biomarkers in chronic myeloid leukemia patients in Brazil.. FRONTIERS IN ONCOLOGY , v. 14, p. 1443346, 2024.

• COELHO, C. B. C. A. ; WOSNIAKI, DENISE KUSMA ; MARIN, A.M. ; FABRIS, L. ; REIS, R. B. ; AOKI, M. N. ; ZANETTE, D. L. . Urinary mRNA-based biomarkers for non-muscle-invasive bladder cancer: a mini-review. FRONTIERS IN ONCOLOGY , v. 14, p. 1441883, 2024.

• MARIN, Anelis Maria ; SANCHUKI, HELOISA BRUNA SOLIGO ; NAMUR, GUILHERME NACCACHE ; UNO, MIYUKI ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; AOKI, MATEUS NÓBREGA . Circulating Cell-Free Nucleic Acids as Biomarkers for Diagnosis and Prognosis of Pancreatic Cancer. Biomedicines , v. 11, p. 1069, 2023.

• MARIN, Anelis Maria ; WOSNIAKI, DENISE KUSMA ; SANCHUKI, HELOISA BRUNA SOLIGO ; MUNHOZ, EDUARDO CILIÃO ; NARDIN, JEANINE MARIE ; SOARES, GABRIELA SILVA ; ESPINACE, DHIENIFER CAROLINE ; DE HOLANDA FARIAS, JOÃO SAMUEL ; VERONEZE, BRUNA ; BECKER, LUIZ FELIPE ; COSTA, GUILHERME LIMA ; BELTRAME, OLAIR CARLOS ; DE OLIVEIRA, JAQUELINE CARVALHO ; CAMBRI, GEISON ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; AOKI, MATEUS NÓBREGA . Molecular BCR::ABL1 Quantification and ABL1 Mutation Detection as Essential Tools for the Clinical Management of Chronic Myeloid Leukemia Patients: Results from a Brazilian Single-Center Study. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 24, p. 10118, 2023.

• MARIA MARIN, ANELIS ; MARIN, A. M. ; MARIN, ANELIS M. . microRNA-based Genetic Therapy in Leukemia: Properties, Delivery, and Experimental Models. Current Gene Therapy , v. 23, p. 245-260, 2023.

• MATHIAS, CAROLINA ; MARIN, Anelis Maria ; KOHLER, ANA FLÁVIA ; SANCHUKI, HELOISA BRUNA SOLIGO ; SUKOW, NATALIE ; BELTRAME, MARCIA HOLSBACH ; BAAL, SUELEN CRISTINA SOARES ; SEBASTIÃO, ANA PAULA MARTINS ; DE SOUZA FONSECA RIBEIRO, ENILZE MARIA ; GRADIA, DANIELA FIORI ; AOKI, MATEUS NÓBREGA ; CARVALHO DE OLIVEIRA, JAQUELINE . LncRNA-SNPs in a Brazilian Breast Cancer Cohort: A Case-Control Study. Genes , v. 14, p. 971, 2023.

• MARIN, Anelis Maria ; BATISTA, MICHEL ; KORTE DE AZEVEDO, ALEXANDRE LUIZ ; BOMBARDELLI GOMIG, TALITA HELEN ; SOARES CALDEIRA BRANT, RODRIGO ; CHAMMAS, ROGER ; UNO, MIYUKI ; DIAS ARAÚJO, DIOGO ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; NÓBREGA AOKI, MATEUS . Screening of Exosome-Derived Proteins and Their Potential as Biomarkers in Diagnostic and Prognostic for Pancreatic Cancer. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , v. 24, p. 12604, 2023.

• MARIN, Anelis Maria ; MATTAR, SIBELLE BOTOGOSQUE ; AMATUZZI, RAFAELA FERREIRA ; CHAMMAS, ROGER ; UNO, MIYUKI ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; AOKI, MATEUS NÓBREGA . Plasma Exosome-Derived microRNAs as Potential Diagnostic and Prognostic Biomarkers in Brazilian Pancreatic Cancer Patients. BIOMOLECULES , v. 12, p. 769, 2022.

• CONIGLIO, ANAHÍ ; LARAMA, GIOVANNI ; MOLINA, ROMINA ; MORA, VERÓNICA ; TORRES, DANIELA ; MARIN, Anelis Maria ; AVILA, ANDRÉS IGNACIO ; LEDE NOIRCARLAN, COLINE ; ERIJMAN, LEONARDO ; FIGUEROLA, EVA LUCÍA ; SOUZA, E. M. ; CASSÁN, FABRICIO . Modulation of Maize Rhizosphere Microbiota Composition by Inoculation with Azospirillum argentinense Az39 (Formerly A. brasilense Az39). JOURNAL OF SOIL SCIENCE AND PLANT NUTRITION , v. 22, p. 3553-3567, 2022.

• WOSNIAKI, D.K. ; MARIN, A.M. ; SOARES, G.S. ; ZANETTE, D.L. ; BLANES, L. ; MUNHOZ, E.C. ; AOKI, M. . Research Article GSTM1/GSTT1-null genotyping role in leukemia development in Brazilian patients. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , v. 21, p. 1, 2022.

• MARIN, Anelis Maria ; ZANETTE, DALILA LUCIOLA ; NARDIN, JEANINE MARIE ; MUNHOZ, EDUARDO CILIÃO ; BLANES, LUCAS ; SOLIGO SANCHUKI, HELOISA BRUNA ; BOÇON DE ARAÚJO MUNHOZ, FRANCIELLE ; DE OLIVEIRA COELHO, BRUNA ; AOKI, MATEUS NÓBREGA . Fluorescent and colorimetric RT-LAMP as a rapid and specific qualitative method for chronic myeloid leukemia diagnosis. ANALYTICAL BIOCHEMISTRY , v. 641, p. 114541, 2022.

• AOKI, MATEUS NÓBREGA ; STEIN, ANGELIKA ; DE OLIVEIRA, JAQUELINE CARVALHO ; CHAMMAS, ROGER ; UNO, MIYUKI ; MUNHOZ, FRANCIELLE BOÇON DE ARAÚJO ; MARIN, Anelis Maria ; CANZIAN, FEDERICO . Susceptibility loci for pancreatic cancer in the Brazilian population. BMC Medical Genomics , v. 14, p. 111, 2021.

• MARIN, A.M. ; SOARES, GABRIELA SILVA ; ZANETTE, D. L. ; AOKI, M. N. . Molecular Biology for BCR-ABL1 Quantification for Chronic Myeloid Leukemia Monitorization and Evaluation.. Archives of Cancer Biology and Therapy , v. 2, p. 40, 2021.

• Wassem, R. ; MARIN, Anelis Maria ; DADDAOUA, A. ; MONTEIRO, R. A. ; CHUBATSU, L. S. ; RAMOS, J.L. ; DEAKIN, W. J. ; BROUGHTON, W. J. ; PEDROSA, F. O. ; SOUZA, E. M. . A NodD-like protein activates transcription of genes involved with naringenin degradation in a flavonoid-dependent manner in Herbaspirillum seropedicae. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY , v. 19, p. 1030-1040, 2017.

• MARIN, Anelis Maria ; DE LA TORRE, JÉSUS ; OLIVEIRA, ALFREDO RICARDO MARQUES ; BARISON, ANDERSSON ; CHUBATSU, LEDA SATIE ; MONTEIRO, ROSE ADELE ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FABIO ; DE SOUZA, EMANUEL MALTEMPI ; WASSEM, ROSELI ; DUQUE, ESTRELLA ; RAMOS, JUAN LUIS . Genetic and functional characterisation of a novel meta-pathway for degradation of naringenin in Herbaspirillum seropedicae SmR1. Environmental Microbiology (Print) , v. 00, p. 00, 2016.

• Molina-Santiago C ; Udaondo Z ; MARIN, A.M. ; García-Salamanca A ; Michán C ; Daniels C ; Molina L ; Ramos JL . Evolution of antibiotic resistance, catabolic pathways and niche colonization. Microbial Biotechnology (Online) , v. 5, p. 452-454, 2012.

• Rose Adele Monteiro ; Eduardo Balsanelli ; Roseli Wassem ; MARIN, A.M. ; Liziane C.C.Brusamarello-Santos ; Maria Augusta Schmidt ; Michelle Z. Tadra-Sfeir ; Vânia C. S. Pankievicz ; Leonardo M. Cruz ; Leda S. Chubatsu ; Fabio O. Pedrosa ; Emanuel M Souza . Herbaspirillum-plant interactions: microscopical, histological and molecular aspects. Plant and Soil (Dordrecht. Online) , v. xx, p. 01-xx, 2012.

• MARIN, Anelis Maria ; SOUZA, E. M. ; Pedrosa, F. O. ; Souza, L. M. ; SASSAKI, G. L. ; Baura, V. A. ; Yates, M. G. ; WASSEM, Roseli ; Monteiro, R. A. . Naringenin degradation by the endophytic diazotroph Herbaspirillum seropedicae SmR1. Microbiology (Reading. Print) , v. 159, p. 167-175, 2012.

• Anelis Marin ; MARIN, A.M. . Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a Specialized Diazotrophic Endophyte of Tropical Grasses. PLOS Genetics (Online) , v. 7, p. e1002064, 2011.

• MARIN, A. M. . Proteomic characterization of plasmatic exosomes from pancreatic cancer patients for diagnostic and prognostic biomarkers identification. In: X-Meeting / BSB 2023, 2023, Curitiba. X-metting presentations, 2023.

• MARIN, A. M. . Characterization of ipdC, flcA and narL-like mutant strains of Azospirillum brasilense in the interaction with grasses. In: XVI symposium on biological nitrogen fixation with non-legumes, 2018, Foz do Iguaçu. XVI symposium on biological nitrogen fixation with non-legumes. Seropedica: Embrapa Agrobiologia, 2018.

• MARIN, A. M. . PERFIL TRANSCRIPTÓMICO DE Azospirillum brasilense Az39 CRECIDO EN DOS MEDIOS DE CULTIVO NUTRICIONALMENTE DIFERENCIADOS. In: PGPR Latinoamericano 2016 / III Taller Latinoamericano de PGPR, 2016, Pucon. LIBRO DE RESÚMENES, 2016.

• MARIN, A. M. ; Michelle Z. Tadra-Sfeir ; Leda S. Chubatsu ; SOUZA, E. M. ; DE OLIVEIRA PEDROSA, FABIO . RNA-SEQ analyses of Herbaspirillum seropedicae SmR1 cultivated with indole-3-acetic acid (IAA) or with tryptophan, the IAA precursor.. In: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2015, Foz do Iguaçu. XXXXIV Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2015.

• MARIN, A. M. ; WASSEM, R. ; MONTEIRO, R. A. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O. ; Barisson, A. ; Duque, E. ; de la Torre, J. ; Ramos JL . Identification of naringenin degradation metabolites in Herbaspirillum seropedicae SmR1. In: 11th European Nitrogen Fixation Conference, 2014, Santa Cruz de Tenerife. 11th European Nitrogen Fixation Conference, 2014.

• MARIN, ANELIS M. ; WASSEM, R. ; SECCON, D. M. ; Emanuel M Souza ; PEDROSA, F. O. ; MONTEIRO, R. A. . The binding of Herbaspirillum seropedicae SmR1 NodD protein to its promoter region is modulate by flavonoids. In: 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010, Búzios, RJ. 12th International Symposium on Biological Nitrogen Fixation with Non-Legumes, 2010.

• WASSEM, R. ; MARIN, A. M. ; PEDROSA, F. O. ; Deakin, W.J ; BROUGHTON, W. J. ; MONTEIRO, R. A. ; SOUZA, E. M. . A NodD-like protein activates transcription in a flavonoid-dependent manner in the non-symbiotic bacterium Herbaspirillum seropedicae. In: 9th European Nitrogen Fixation Conference, 2010, Genebra, Suiça. 9th European Nitrogen Fixation Conference, 2010.

• MARIN, A. M. ; WASSEM, R. ; SASSAKI, G.L. ; YATES, G. M. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O. ; MONTEIRO, R. A. . The NodD-like protein of Herbaspirillum seropedicae SmR1 activated naringenin degradation genes. In: XXXIX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 2010, Foz do Iguaçu. Livro de Resumos, 2010.

• MARIN, A.M. ; WASSEM, R. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O. ; MONTEIRO, R. A. . Mutagenesis and Expression Analysis of a Probable Phenol Degrading Operon in Herbaspirillum seropedicae. In: XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2008, Águas de Lindóia. XXXVII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2008.

• GARCIA, L. H. A. ; OLIVEIRA, D. A. ; MARIN, A.M. ; MANVAILER, L.F.S. ; TARARTHUCH, A. L. . Antinflamatory effects of the fish oil in the acute renal failure. In: Congress of Brazilian Physiological Society & Joint Meeting with The Physiological Society, 2006, Ribeirão Preto, SP. 41st Congress of Brazilian Physiological Society & Joint Meeting with The Physiological Society, 2006.

• MARIN, A.M. ; CORAL, J. ; SECCON, D. M. ; KARP, S. G. ; MONTEIRO, R. A. ; PEDROSA, F. O. ; SOUZA, E. M. ; WASSEM, R. . In vivo and in vitro analysis of the Herbaspirillum seropedicae NodD protein activity. In: SBBq - Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006.

• WASSEM, R. ; MARIN, A.M. ; MONTEIRO, R. A. ; SOUZA, E. M. ; BROUGHTON, W. J. ; PEDROSA, F. O. . Transcriptional activity of the NodD protein of Herbaspirillum seropedicae. In: 7th European Nitrogen Fixation Conference, 2006, Aarhus. Book of Abstracts of the 7th European Nitrogen Fixation Conference., 2006.

• MARIN, A.M. ; MONTEIRO, R. A. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O. ; WASSEM, R. . Obtenção da estirpe mutante nodD- de Herbaspirillum seropedicae marcada com a proteína fluorescente dsRED (RAM4). In: EVINCI - Evento da Iniciação Científica, 2006, Curitiba. 14º Evento da Iniciação Cientifica (EVINCI), 2006.

• MARIN, A.M. ; GARCIA, L. H. A. ; TARARTHUCH, A. L. . Efeito protetor do óleo de peixe sobre a Insuficiência Renal Aguda. In: Fesbe - Federação das Sociedades de Biologia Experimental, 2005, Águas de Lindóia. XX Reunião Anual da Federação de Sociedades de Biologia Experimental, 2005.

• NICHELE, B. K. ; WOSNIAKI, DENISE KUSMA ; MARIN, A.M. ; MUNHOZ, EDUARDO CILIÃO ; FARIAS, J. S. H. ; MENDES, E. B. ; AOKI, M. N. ; ZANETTE, D. L. . Divergent gene expression of PTGS1 and PTGS2 along the disease course of chronic myeloid leukaemia. FRONTIERS IN ONCOLOGY , 2025.

• MARIN, A.M. ; Roseli Wassem ; SECCON, D. M. ; SOUZA, E. M. ; PEDROSA, F. O. ; MONTEIRO, R. A. . The binding of Herbaspirillum seropedicae SmR1 NodD protein to its promoter region is modulate by flavonoids.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• MARIN, A. M. . Relab - Rede Latino Americana de Ciências Biológicas. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

• MARIN, A. M. ; Bonato, P. ; Marques, E. ; Sacks, S. . Biologia Molecular Básica. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

• Oliveira, M.A.S ; MARIN, A. M. ; Stefanello, A.A. . Biologia Molecular Básica. 2015. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

• Oliveira, M.A.S ; MARIN, A.M. ; Stefanello, A.A. . Biologia Molecular Básica. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

• MARIN, A.M. ; Eduardo Balsanelli ; Maria Augusta Schmidt ; Vânia C. S. Pankievicz . Interação Planta-Bactéria. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

Projetos de pesquisa

• 2025 - Atual

  Validação da eficácia clínica e aplicação da biópsia líquida para diagnóstico de câncer de pâncreas por NGS através da detecção de mutações em KRAS, SMAD4, TP53 e CDKN2A em cell-free DNA, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / CHAMMAS, ROGER - Integrante / UNO, MIYUKI - Integrante / AOKI, M. - Coordenador / DIAS ARAÚJO, DIOGO - Integrante / Branca Engel Timoner - Integrante / Maria Jose Ferreira Alves - Integrante / Guilherme Naccache Namur - Integrante / Aoarecido Divino da Cruz - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2025 - Atual

  Avaliação in vitro dos mecanismos moleculares de resposta e resistência em adenocarcinoma pancreático submetido ao tratamento com FOLFIRNOX, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Coordenador / BATISTA, MICHEL - Integrante / Mateus Nóbrega Aoki - Integrante / Dalila Luciola Zanette - Integrante / Micheli de Marchi - Integrante / Alessandra de Melo Aguiar - Integrante / Ana Paula Ressetti Abud - Integrante / Matheus dos Santos Dias - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

• 2024 - Atual

  Manipulação do microRNA-27b-3p como terapia gênica para câncer de pâncreas, Descrição: O microRNA-27b-3p é o alvo selecionado para esse projeto pois em resultados prévios do nosso grupo observamos sua expressão plasmática reduzida em pacientes com câncer de pâncreas. Esse microRNA tem como alvo validado o mRNA de insulin-like growth factor binding protein 2 (IGFBP2), que codifica proteína secretada de mesmo nome. De forma interessante, nosso grupo observou que a proteína IGFBP2 estava com expressão elevada no plasma de pacientes com câncer de pâncreas em análises proteômicas. Com base nesses dados prévios, a associação entre redução da expressão de microRNA-27b-3p e aumento da expressão de IGFBP2 será explorada neste projeto, focando em terapia gênica para a manipulação da expressão in vitro do microRNA-27b-3p, investigando a iniciação e progressão em células de câncer de pâncreas por ensaios celulares e molecular. Com isso, pretendemos obter evidências se a terapia gênica baseada no microRNA-27b-3p pode auxiliar no controle do câncer de pâncreas, gerando subsídios para pesquisa in vivo e clínica como opção de terapia avançada. Também iremos gerar produtos científicos como artigos, além de gerar conhecimento essencial ao desenvolvimento de terapias avançadas visando a aplicação ao SUS a médio/longo prazo.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Coordenador / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante / Ana Paula Kubaski Benevides - Integrante., Financiador(es): Instituto Carlos Chagas - Auxílio financeiro.

• 2022 - Atual

  ANÁLISE DAS SUBPOPULAÇÕES LINFOCITÁRIAS POR CITOMETRIA DE FLUXO EM PACIENTES COM LMC EM TRATAMENTO COM INIBIDORES DA TIROSINA QUINASE, Descrição: A leucemia mieloide crônica (LMC) é uma neoplasia mieloproliferativa caracterizada por desvio à esquerda, esplenomegalia e presença do cromossomo Philadelphia, o que resulta na formação da oncoproteína BCR-ABL. Tal proteína desencadeia a proliferação celular e inibição da apoptose, criando um ciclo celular descontrolado. O tratamento com inibidores da tirosina quinase, como o imatinib, melhorou drasticamente o prognóstico da doença, porém o alto custo e efeitos adversos a longo prazo motivaram outros estudos para avaliar a descontinuação segura desses fármacos com a aquisição da remissão livre de tratamento. Entretanto, muitos pacientes tornam-se resistentes ao tratamento de primeira escolha, o que impossibilita a descontinuação segura, ou ainda, recaem na doença mesmo após uma boa resposta inicial. Os mecanismos envolvidos nesse processo podem estar relacionados com as células-tronco leucêmicas, mutações e atividade do sistema imune. Dessa forma, considerando a resistência ao tratamento com inibidores da tirosina quinase e a possibilidade de recaída após descontinuação e remissão da doença, estudos que indiquem marcadores de prognóstico podem auxiliar o clínico na tomada de decisões e evitar a interrupção inadequada do tratamento. O presente trabalho pretende avaliar e relacionar as subpopulações linfocitárias e características genéticas dos pacientes em questão, buscando possíveis marcadores que diferenciem as respostas ao tratamento, e comparar com os dados da literatura. Serão avaliadas amostras de pacientes acompanhados no Hospital Erasto Gaertner que apresentam suspeita clínica e exames compatíveis com LMC e outros pacientes já diagnosticados anteriormente que realizam tratamento com inibidores de tirosina-quinase. A análise das subpopulações linfocitárias será realizada através da imunofenotipagem por citometria de fluxo. Os dados obtidos serão comparados com a quantificação do BCR-ABL e outros dados clínicos, o que possibilitará a divisão dos pacientes em diferentes grupos: aqueles que apresentam boa resposta ao tratamento com Imatinib e os que desenvolveram resistência, necessitando de fármacos de geração mais avançada. Análises estatísticas serão realizadas para avaliar possíveis correlações entre os dados obtidos (diferentes populações linfocitárias, quantificação do BCR-ABL, sensibilidade ou resistência ao tratamento e dados de hemograma seriados). , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Integrante / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Coordenador.

• 2022 - Atual

  DualQuant BCR-ABL: biologia molecular para quantificação do transcrito BCR-ABL para aplicação clínica direta em pacientes com leucemia mieloide crônica, Descrição: Este projeto tem como finalidade a validação final e produção de lotes de consistência de produto baseado em RT-qPCR para quantificação do transcrito BCR-ABL t(9;22) em pacientes com leucemia mieloide crônica (LMC). Esse teste não é disponibilizado pelo Sistema Único de Saúde Brasileiro e é de extrema importância para o diagnóstico e principalmente acompanhamento e escolha da conduta terapêutica, além de ter papel direto no prognóstico da doença. Através dele a equipe médica poderá avaliar a resposta terapêutica dos pacientes frente ao inibidor de tirosina quinase (TKI) em uso, proporcionando adaptação ao tratamento tanto em questão da dose quanto ao TKI de uso, buscando uma terapia personalizada, adequada e mais econômica para todo o sistema. A quantificação desta translocação é restrita devido principalmente a questões econômicas nos hospitais públicos brasileiros, sendo realizadas por laboratórios particulares a um custo elevado. A quantificação sensível doBCR-ABL também é essencial para protocolos de acompanhamento em retirada de TKI (remission-free) em pacientes com LMC molecularmente indetectável. O início do desenvolvimento deste produto foi contemplado pelo 2 Edital de Produtos Inovadores e passou pelas etapas de prova de conceito, otimização, determinação de propriedades analíticas, mostrando 100 de sensibilidade e especificidade. Também foi parcialmente validado em amostras clínicas e atualmente encontra-se em fase de validação diagnóstica e posterior produção de lotes de consistência, além da realização de teste de estabilidade e escalonamento dos insumos. Uma importante etapa é a geração de fator internacional de calibração através de painel comercial para padronização de resultados em diferentes laboratórios e protocolos. A geração do fator de calibração já foi realizada, entretanto é necessária sua reprodutibilidade e repetibilidade, além de teste em diferentes plataformas de qPCR. Estamos prospectando novos parceiros para avaliação diagnóstica, como Hospital do Câncer de Londrina e Hospital Universitário de Santa Maria da UFSM. Também iremos avaliar o DualQant BCR-ABL em comparação com a técnica molecular de PCR digital, que se caracteriza por uma ferramenta alternativa para quantificação de BCR-ABL em pacientes com LMC. Ao finalizar esse projeto pretendemos obter um dossiê completo para o produto DualQant BCR-ABL, demonstrando sua robustez para aplicaçãona saúde pública para aprimorar o tratamento de pacientes com LMC.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Coordenador / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante.

• 2022 - Atual

  terminação de um painel RNAs não-codificantes como biomarcadores em biópsia líquida urinária para diagnóstico e prognóstico de câncer de bexiga, Descrição: O câncer de bexiga (CB) é o câncer urológico mais comum e o décimo mais prevalente no mundo. Dados do GLOBOCCAN 2020 estimaram 573.278 casos e 212.536 mortes por CB no mundo. No Brasil, o Instituto Nacional de Câncer (INCA) estimou 10.640 novos casos de CB para cada ano do triênio 2020/2022. Existem duas subdivisões principais de CB, sendo a maioria (70) não-músculo invasivo (NMIBC) e o restante são (30) músculo-invasivos (MIBC). O NMIBC tem bom prognóstico, mas o MICB é o tipo de câncer com maior custo, chegando a 150.000 dólares por paciente nos EUA. Portanto, a detecção e tratamento precoce são fundamentais para evitar a evolução para MIBC. Porém, os métodos padrão-ouro, a citologia e a cistoscopia, tem baixa sensibilidade. A urina é o material de biópsia líquida ideal para o diagnóstico de CB pois é obtida de forma não-invasiva e contém informações genéticas do tumor, devido ao seu contato direto com as células uroteliais. Apesar disso, a literatura sobre os biomarcadores de urinários de CB é discrepante e os testes comerciais disponíveis apresentam baixa sensibilidade. Assim, o projeto propõe um teste baseado em RT-qPCR para quantificar um painel de biomarcadores proposto com base em extensa busca na literatura científica e em bancos de dados públicos de transcriptoma. A combinação dos biomarcadores confere o caráter inovador da proposta, embasada em conhecimentos prévios e técnica amplamente reconhecida pela alta sensibilidade e especificidade. A testagem simultânea de 81 biomarcadores em uma coorte de descoberta seguida de testagem em coorte de validação permitirá selecionar um painel reduzido de biomarcadores de diagnóstico no CB, que, aliado a dados de seguimento dos pacientes, poderá também indicar biomarcadores de prognóstico. Assim, vislumbra-se aprimorar a detecção precoce e aumentar a qualidade de vida dos pacientes, além de evitar a evolução para doença invasiva, que apresenta alto custo para o SUS e alta taxa de mortalidade. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Integrante / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Coordenador.

• 2022 - Atual

  Biópsia líquida para diagnóstico de câncer de pâncreas por NGS através da detecção de mutações em KRAS, SMAD4, TP53 e CDKN2A em cell-free DNA, Descrição: câncer de pâncreas ocupa o 13 lugar em incidência no Brasil e 6 em mortalidade entre todos os tumores, sendo responsável por 4 das mortes relacionadas a câncer no país, com onze mil óbitos anuais. Apesar dos avanços recentes, a sobrevida em 5 anos continua extremamente baixa, de 10 mesmo em países desenvolvidos. Além disso, a sua incidência quase dobrou nas duas últimas décadas e há projeção de se tornar a segunda maior causa de morte por câncer nos EUA em 2030. Os fatores de risco não-hereditários ainda não são totalmente esclarecidos, descritas associações com fumo, diabetes, obesidade e pancreatite crônica. Em relação a alterações genéticas somáticas destacam-se 4 genes com maiores taxas de mutações: KRAS, TP53, SMAD4 e CDKN2A. Além da alta agressividade, outro ponto chave na elevada taxa e mortalidade nesta doença remete ao seu difícil e tardio diagnóstico. Este diagnóstico é auxiliado por exames de imagem como ressonância magnética e tomografia computadorizada, entretanto a confirmação ocorre por biópsia ou mesmo cirurgicamente. Por isso, o desenvolvimento de métodos diagnósticos sensíveis e não-invasivos utilizando sequenciamento de nova geração (NGS) em plasma são essenciais para a evolução científica e clínica. Com isso, o diagnóstico será realizado de forma precoce, possibilitando melhor conduta terapêutica, clínica e elevando a sobrevida dos pacientes com câncer de pâncreas. Esse projeto tem como objetivo desenvolver um teste molecular para biópsia líquida por NGS para detecção de mutação nos genes KRAS, TP53, SMAD4 e CDKN2A em cell-free DNA em pacientes com câncer de pâncreas. Além do conceito de diagnóstico molecular, esse teste poderá ser utilizado para avaliação de prognóstico da doença, com a detecção de acúmulo dede mutações nestes genes ao longo da doença. Com isso, apresentaremos uma solução sensível, moderna e aplicável a prática clínica em câncer de pâncreas, que representará um avanço substancial no seu diagnóstico e prognóstico.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Coordenador / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante.

• 2022 - Atual

  Investigação de fatores preditivos de sucesso e descontinuação segura do tratamento da leucemia mieloide crônica com inibidores de tirosina-quinase, Descrição: A decisão pela interrupção do tratamento com TKIs na LMC ainda é muito difícil pois faltam critérios sólidos para a escolha dos pacientes que realmente se beneficiariam, apesar de estudos relatarem que quase 50 dos pacientes conseguem a TFR de forma segura e sustentada ao interromper o tratamento. Além disso, há melhoria da qualidade de vida, por deixar de expor aos efeitos colaterais persistentes; e diminuição considerável de custos para os sistemas de saúde, decorrentes do uso de TKI por longos prazos. Estudos em alguns países revelaram economias substanciais, em torno de 50, que se mantiveram neste patamar ao longo do período analisado. Assim, a descontinuação segura do tratamento, com obtenção da TFR sustentada é o grande objetivo atual no manejo da LMC (11). Assim, buscam-se marcadores de prognóstico, ou seja, marcadores preditivos do sucesso da TFR. Porém ainda não existem marcadores estabelecidos nem mesmo para predizer a resistência aos TKIs, sendo grande a heterogeneidade dos estudos realizados até hoje. Neste projeto, utilizaremos amostras de pacientes com LMC que usam um mesmo TKI há pelo menos 5 anos para analisar os marcadores já descritos nos estudos, juntamente com outros candidatos identificados a partir de dados públicos de expressão gênica e de miRNAs. Esperamos encontrar um ou mais marcadores associados à eficiência do tratamento com TKIs e, por associação, esses marcadores serão candidatos a ser utilizados na predição de sucesso da TFR.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Integrante / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Coordenador.

• 2020 - 2022

  DualQuant BCR-ABL: biologia molecular para quantificação do transcrito BCR-ABL para aplicação clínica direta em pacientes com leucemia, Descrição: O referido projeto tem como finalidade a validação final e produção de lotes de consistência de um produto baseado em RT-qPCR para quantificação do transcrito BCR-ABL ? t(9;22) - em pacientes com leucemia mieloide crônica (LMC). Esse teste não é disponibilizado pelo Sistema Único de Saúde brasileiro para pacientes com esse tipo de leucemia e é de extrema importância para o correto diagnóstico e principalmente acompanhamento terapêutico e prognóstico da doença. Atraves dele a equipe médica poderá avaliar a resposta terapêutica dos pacientes frente ao inibidor de tirosina quinase (TKI) em uso, e com isso proporcionar uma adaptação ao tratamento tanto em questão da dose quanto ao TKI de uso, buscando uma terapia personalizada, adequada e mais econômica para todo o sistema. O desenvolvimento deste produto já passou pelas etapas de prova de conceito, otimização, determinação de propriedades analíticas, mostrando 100 de sensibilidade e especificidade com a utilização de 20 linhagens celulares. Atualmente encontra-se em fase de validação diagnóstica e posterior produção de lotes de consistência, além da perspectiva de realização de teste de estabilidade e escalonamento dos insumos. De forma geral, ao finalizar esse projeto temos a pretensão de se obter um dossiê completo para o produto, demonstrando sua robustez para aplicação na saúde pública de pacientes com leucemia mieloide crônica.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Coordenador / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante.

• 2019 - Atual

  Estudo de alterações genéticas e microRNA plasmáticos em pacientes com câncer de pâncreas no Brasil, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Coordenador / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante.

• 2018 - Atual

  Genome-wide association study em amostras de câncer de pâncreas no Brasil, Descrição: O câncer de pâncreas é dos líderes de mortalidade na área oncológica mundial, sendo caracterizado pelo baixo grau de sobrevida dos pacientes após 5 anos. Seu diagnóstico é normalmente tardio, sendo que intervenções cirúrgicas muitas vezes são ineficientes devido a metástases, podendo ser realizadas somente cirurgias paliativas e intervenção medicamentosa. A caracterização molecular desta neoplasia ainda é limitada, sendo reconhecidamente relevantes mutações no proto oncogene KRAS, entretanto com pouca ou nenhuma efetividade no prognóstico. Portanto torna-se essencial a caracterização molecular desta patologia, principalmente no que se diz respeito ao genoma germinativo e não a mutações adquiridas, como ocorre com o oncogene KRAS. Essa caracterização pode direcionar ao entendimento da etiologia molecular do câncer de pâncreas, elucidando vias e moléculas importantes na iniciação e promoção tumoral, e com isso fortalecer a medicina preventiva de acordo com o perfil genético dos pacientes. Portanto, este projeto tem como objetivo geral elucidar o perfil genético germinativo de pacientes com câncer de pâncreas de amostras brasileiras através de testes moleculares de amplo espectro com tecnologia Illumina Global Survey Array (Illumina), os quais detectam principalmente single nucleotide polymorphism (SNPs). Será realizada a extração de DNA de amostras de sangue de pacientes com câncer de pâncreas provenientes do Instituto do Câncer do Estado de São Paulo, e como controle amostras de sangue de indivíduos saudáveis provenientes do Instituto de Medicina Tropical da USP. Com isso, será possível analisar o perfil genético germinativo de pacientes com câncer de pâncreas do Brasil e com isso propor genes que são cruciais na sua etiologia patológica, gerando substrato para pesquisas básicas e também para medicina preventiva personalizada. Mais do que isso, esse projeto insere amostras de câncer de pâncreas do Brasil no Consórcio Internacional Pancreatic Disease Research Consortium (PANDoRA), o que fortalece os resultados obtidos pela comparação do perfil genético destas amostras com os presentes neste consórcio, podendo ampliar a forma de análise e conclusões.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Coordenador / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante.

• 2018 - Atual

  Análise das Principais Translocações de Impacto Clínico em Leucemias e Buscas de Novos biomarcadores, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Anelis Maria Marin - Integrante / AOKI, MATEUS NÓBREGA - Coordenador / ZANETTE, DALILA LUCIOLA - Integrante.