Isabela Brunozi de Oliveira

Formação complementar

Idiomas

Áreas de atuação

Participação em eventos

Produções bibliográficas

• PRIYANKHA, SRIDHAR ; POLK, SHAHRAZAD ; THILAGAVATHI, RAMASAMY ; PRAKASH, MUTHURAMALINGAM ; KATHIRAVAN, M. K. ; LAKSHMANA PRABHU, SAKTHIVEL ; BRUNOZI DE OLIVEIRA, ISABELA ; SELVAM, CHELLIAH . The Virtual Screening of Compounds from the ZINC Database against PARP-1 in Triple-Negative Breast Cancer. ChemistrySelect , v. 9, p. e202304729, 2024.

• Jéssica de Araujo Zanoni ; Isabela Brunozi de Oliveira ; Olavo Micali Perrone ; Julieth Orduña Ortega ; Maurício Boscolo ; Eleni Gomes ; Gustavo Orlando Bonilla-Rodriguez . Production and biochemical characterization of xylanases synthesized by the thermophilic fungus Rasamsonia emersonii S10 by solid-state cultivation. Ecl¿tica Qu¿mica Journal , v. 46, p. 53-67, 2021.

• OLIVEIRA, I. B. ; LUIZ, M. Z. ; FERREIRA JUNIOR, S. L. ; CILLI, E. M. ; FOSSEY, M. A. ; SOUZA, F. P. ; ALMEIDA, F. C. L. ; Caruso, I. P. . RELAXATION DISPERSION NMR SPECTROSCOPY FOR THE STUDY OF DYNAMICS OF THE ENCOUNTER COMPLEX FORMED BY THE GLOBULAR DOMAIN OF M2-1 PROTEIN AND THE REGION OF RESIDUES 90-110 OF THE PHOSPHOPROTEIN OF HRSV. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, I. B. ; FERREIRA JUNIOR, S. L. ; CILLI, E. M. ; FOSSEY, M. A. ; SOUZA, F. P. ; ALMEIDA, F. C. L. ; Caruso, I. P. . Study of conformational dynamics of the encounter complex formed between the core domain of hRSV M2-1 protein and the intrinsically disordered region of viral phosphoprotein P using NMR spectroscopy. 2023. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, I. B. ; BEZERRA, P. R. ; PEREIRA, V. A. R. ; CALDEIRA, M. M. ; BRAGA, V. L. A. ; OLIVEIRA, A. C. ; GOMES, A. M. O. ; SOUZA, F. P. ; ALMEIDA, F. C. L. ; Caruso, I. P. . In Vitro Antiviral Activity and FRET Based Inhibition of SARS-CoV-2 N-NTD Double Stranded RNA Unfolding Activity by Computationally Identified Natural Compounds. 2022. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, I. B. ; ALMEIDA, F. C. L. ; Caruso, I. P. . Triagem virtual, modelagem e simulação computacional para a seleção de compostos naturais como potenciais fármacos de ação no domínio N-terminal da nucleoproteína do SARS-CoV-2. 2021. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• OLIVEIRA, I. B. ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O. ; Caruso, I. P. . Estudo da estabilidade térmica da Beta-galactosidase proveniente de Kluyveromyces marxianus URM 7404. 2019. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Projetos de pesquisa

• 2023 - Atual

  Ligand-based pharmacophore mapping, molecular docking and pharmacokinetic characterization studies of natural inhibitors targeting the SARS-CoV-2 Mpro protein, Descrição: In December 2019, the outbreak of a new species of coronavirus, called SARS-CoV-2, was responsible for a pandemic that in three years affected more than 755 million people and caused more than 6 million deaths. Chemotrypsin-like protease (3CLpro or Mpro), papain-like protease (PLpro), RNA-dependent polymerase (RdRp) and Spike protein (S) are the crucial proteins of SARS-CoV-2 that infect the host cell. The functional importance of Mpro in the viral life cycle, combined with the absence of closely related homologues in humans, identifies Mpro as an attractive target for the development of antiviral drugs. The aim of this project is the virtual screening based on ligands by pharmacophore mapping applied to the Mpro with subsequent molecular dockings and obtaining the ADMET and PAINS pharmacokinetic characteristics.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Isabela Brunozi de Oliveira - Coordenador / Icaro Putinhon Caruso - Integrante / Selvam Chelliah - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2021 - Atual

  Caracterização estrutural e dinâmica da ligação de compostos naturais ao domínio N-terminal da nucleoproteína do SARS-CoV-2 como potenciais antivirais, Descrição: Em dezembro de 2019 o surgimento de uma nova espécie de coronavírus, denominada SARS-CoV-2, foi a responsável por uma pandemia que em um ano e meio afetou mais de 187 milhões de pessoas e causou mais de 4 milhões de mortes. Os fármacos antivirais disponíveis atualmente contra o SARS-CoV-2 agem, em sua maioria, na proteína spike (S) ou em proteases virais, sendo pouco efetivos devido às mutações frequentes que a proteína S apresenta ou por causarem toxicidade celular quando focados nas proteases. Por outro lado, a proteína nucleocapsídica (N) viral é a mais abundante em células infectadas e anticorpos produzidos contra ela possuem uma maior persistência e especificidade. No projeto de mestrado foram selecionados 16 compostos naturais capazes de competir pelo sítio de ligação de RNA no domínio N-terminal da proteína N (N-NTD) do SARS-CoV-2, por meio de triagem virtual utilizando cálculos de docking e dinâmica molecular. Destes, 14 passaram por uma primeira etapa experimental envolvendo ensaios de FRET que apresentou resultados promissores de inibição da atividade do N-NTD. No presente projeto de doutorado pretende-se caracterizar experimentalmente utilizando uma combinação de métodos biofísicos, com foco em ressonância magnética nuclear, a interação entre os compostos naturais selecionados e o N-NTD do SARS-CoV-2 e de suas variantes Beta, Gama e Delta. A caracterização dessa interação, além de possibilitar uma melhor compreensão da atividade de inibição dos compostos e destacar os mais promissores, pode fornecer uma base molecular para eventuais modificações químicas que deem origem a novos compostos de maior potencial antiviral.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Isabela Brunozi de Oliveira - Integrante / Icaro Putinhon Caruso - Coordenador / Fabio Ceneviva Lacerda de Almeida - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2019 - 2021

  Identificação de pequenos ligantes de origem natural como potenciais antivirais para o domínio N-terminal da nucleoproteína do SARS-CoV-2, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Ícaro Putinhon Caruso em 24/05/2021., Descrição: Coronavírus (CoVs) são vírus envelopados de RNA de fita simples e sentido positivo, pertencentes à ordem Nidovirales, que infectam mamíferos e aves. Em dezembro de 2019 o surgimento de uma nova espécie do vírus, denominada SARS-CoV-2, foi a responsável por uma pandemia que em um ano e meio afetou mais de 187 milhões de pessoas e causou mais de 4 milhões de mortes. Os fármacos antivirais disponíveis atualmente contra o SARS-CoV-2 agem, em sua maioria, na proteína spike (S) ou em proteases virais, sendo pouco efetivos devido às mutações frequentes que a proteína S apresenta ou por causarem toxicidade celular quando focados nas proteases. Por outro lado, a proteína nucleocapsídica (N) viral é a mais abundante em células infectadas e anticorpos produzidos contra ela possuem uma maior persistência e especificidade. No presente estudo foi realizada a triagem virtual de 270.530 compostos naturais obtidos do banco de dados ZINC15, com posteriores cálculos de docking e simulações de dinâmica molecular que resultaram em uma seleção final de 17 compostos naturais com maior potencial de ligação ao domínio N-terminal da proteína N (N-NTD) do SARS-CoV-2. Destes, destacaram-se 3 compostos por apresentarem maior estabilidade estrutural e afinidade de interação, que tiveram suas ligações de hidrogênio e contatos hidrofóbicos analisados por meio de diagramas bidimensionais de interação proteína-ligante, nos quais os resíduos Tyr109 e Ala42 foram apontados como dois possíveis resíduos essenciais para o sítio de ligação do N-NTD. Foi realizada uma primeira etapa experimental com 15 dos 17 compostos naturais selecionados por meio de experimentos de FRET em ensaios de espectroscopia de fluorescência, nos quais estes apresentaram inibição da atividade de desenovelamento de duplas fitas de RNA promovida pelo N-NTD. Os resultados obtidos evidenciam a capacidade do método em facilitar a identificação de potenciais fármacos e na economia de gastos com uma abordagem experimental.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Isabela Brunozi de Oliveira - Integrante / Icaro Putinhon Caruso - Coordenador / Fabio Ceneviva Lacerda de Almeida - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.

• 2018 - 2019

  Estudo da estabilidade térmica da beta-galactosidase proveniente de Kluyveromyces marxianus URM 7404, Descrição: A enzima beta-D-galactosidase, também denominada lactase, catalisa a hidrólise do açúcar do leite (lactose), que não é absorvido diretamente pela corrente sanguínea, liberando D-galactose e D-glicose. Baixos níveis dessa enzima no intestino delgado produzem a intolerância à lactose, condição que atinge aproximadamente 65% das pessoas em algum nível, causando cólicas, distensão abdominal, diarréia, entre outras complicações. Os usos dessa enzima incluem o processamento de alimentos para melhora do sabor, solubilidade, textura e digestibilidade, e a produção de galactooligosacarídeos, considerados alimentos funcionais. Entre suas fontes destacam-se as leveduras, notavelmente aquelas que são consideradas seguras para uso industrial, entre elas a Kluyveromyces marxianus. A beta-galactosidase obtida dessa fonte, entretanto, não possui sua estabilidade térmica devidamente analisada, pois a maioria das pesquisas com foco estrutural ocorreram com a enzima retirada de E. coli, havendo na literatura majoritariamente estudos relativos à sua cinética enzimática. O projeto tem como foco compreender como ocorre a desnaturação térmica dessa enzima através dos ensaios de atividade e por dicroísmo circular, além de otimizar a atividade enzimática com lactose da cepa URM 7404 isolada do soro de queijo, e comparar com os resultados já obtidos na literatura.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Isabela Brunozi de Oliveira - Integrante / Gustavo Orlando Bonilla Rodríguez - Coordenador., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.

Prêmios