César Augusto Prada Medina

Possui graduação em Biología - Universidad Industrial de Santander (Colombia, 2014) . Doutor pela Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade de São Paulo (Brasil, 2019). Atualmente, pesquisador posdoutoral no Intituto de Genetica Molecular do Max Planck (Alemanha).

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Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Doutorado

2016 - 2019

Universidade de São Paulo
Título: Studying Juvenile Idiopathic Arthritis through a Network Medicine Approach
Orientador: em European Bioinformatics Institute ( Irene Papatheodorou)
com Helder Takashi Imoto Nakaya. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Systems Biology; Juvenile Idiopathic Arthritis; Gene expression regulation.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Imunologia Aplicada. Setores de atividade: Pesquisa e desenvolvimento científico.

Graduação em Biología

2009 - 2014

Universidad Industrial de Santander
Título: Radiosensibilidad e inducción de la respuesta SOS por tratamiento con radiación ultravioleta B en células de Escherichia coli deficientes para la reparación del dao genético
Orientador: Jorge Luis Fuentes Lorenzo

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Pós-doutorado

2019

Pós-Doutorado. , Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, MOLGEN-MPI, Alemanha. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Biologia de sistemas. , Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Humana e Médica.

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Formação complementar

2016 - 2016

Biología Computacional Orientada al Diseño de Fármacos. (Carga horária: 100h). , Universidad de Buenos Aires, UBA, Argentina.

2015 - 2015

Dynamical Modelling in Systems Biology. (Carga horária: 56h). , Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Coursera), ISMMS, Estados Unidos.

2015 - 2015

Network Analysis in Systems Biology. (Carga horária: 64h). , Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Coursera), ISMMS, Estados Unidos.

2015 - 2015

Integrated Analysis in Systems Biology. (Carga horária: 40h). , Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Coursera), ISMMS, Estados Unidos.

2014 - 2015

Systems Biology Specialization. (Carga horária: 64h). , Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Coursera), ISMMS, Estados Unidos.

2014 - 2014

Experimental Methods in Systems Biology. (Carga horária: 64h). , Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Coursera), ISMMS, Estados Unidos.

2014 - 2014

II Curso Int. de intervención integral del DENGUE. (Carga horária: 34h). , Instituto Nacional de Salud, INS, Colômbia.

2014 - 2014

Introduction to Systems Biology. (Carga horária: 100h). , Icahn School of Medicine at Mount Sinai (Coursera), ISMMS, Estados Unidos.

2013 - 2013

Reconstrucción y análisis de redes biológicas. (Carga horária: 20h). , Centro de Bioinformática y Biología Computacional de Colombia, BIOS, Colômbia.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Espanhol

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Bandeira representando o idioma Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Biologia de sistemas.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Imunologia / Subárea: Systems Immunology.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Farmacologia Bioquímica e Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Bioprospecção.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Genética Molecular e de Microorganismos.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea: Mutagenese.

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Participação em eventos

Dissecting Biology at Single Cell Level. 2019. (Simpósio).

Latin American Strategy Forum for Research Infrastructure. 2019. (Outra).

XI International Conference on Systems Biology of Human Diseases. Inferring transcriptional regulators in JIA by coupling coexpression and phi-mixing coefficient networks. 2018. (Congresso).

Jamboré Brasuca. 2017. (Encontro).

Second International Symposium on Inflammatory Diseases - INFLAMMA II. 2016. (Simpósio).

The fourth International Society for Computational Biology Latin America Bioinformatics Conference (ISCB-LA). Regulatory molecular circuits in leukocytes of Juvenile Idiopathic Arthritis patients. 2016. (Congresso).

Workshop Beyond Zika - A Tripartite Initiative - USP/ Institut Pasteur/ FioCruz. 2016. (Encontro).

III Congreso Colombiano de Bioinformática y Biología Computacional. 2015. (Congresso).

XXII Congreso Latinoamericano de Microbiología. 2014. (Congresso).

VI Congreso Colombiano de Botánica. Acetogeninas de Annonaceae: relación estructura-actividad anticancerígena. 2011. (Congresso).

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Comissão julgadora das bancas

Helena Paula Brentani

NAKAYA, H. T. I.; SILVEIRA, E. L. V.;BRENTANI, H. P.; CARVALHO, B. S.. Estudando a Artrite Idiopática Juvenil mediante uma abordagem de Medicina de redes. 2019. Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo.

Helena Paula Brentani

BRENTANI, H. P.; FARSKY, S. H. P.; BRIONES, M. R. S.. Studying Juvenile Idiopathic Arthritis through a Network Medicine Approach,. 2017. Exame de qualificação (Doutorando em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo.

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Foi orientado por

Helder Takashi Imoto Nakaya

Studying Juvenile Idiopathic Arthritis through a Network Medicine Approach; 2019; Tese (Doutorado em Farmácia (Fisiopatologia e Toxicologia)) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Orientador: Helder Takashi Imoto Nakaya;

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Produções bibliográficas

  • PAPATHEODOROU, IRENE ; MORENO, PABLO ; MANNING, JONATHAN ; FUENTES, ALFONSO MUOZ-POMER ; GEORGE, NANCY ; FEXOVA, SILVIE ; FONSECA, NUNO A ; FÜLLGRABE, ANJA ; GREEN, MATTHEW ; HUANG, NI ; HUERTA, LAURA ; IQBAL, HAIDER ; JIANU, MONICA ; MOHAMMED, SUHAIB ; ZHAO, LINGYUN ; JARNUCZAK, ANDREW F ; JUPP, SIMON ; MARIONI, JOHN ; MEYER, KERSTIN ; PETRYSZAK, ROBERT ; PRADAMEDINA, CESAR AUGUSTO ; TALAVERA-LÓPEZ, CARLOS ; TEICHMANN, SARAH ; VIZCAINO, JUAN ANTONIO ; BRAZMA, ALVIS . Expression Atlas update: from tissues to single cells. NUCLEIC ACIDS RESEARCH , v. 48, p. D77-D83, 2019.

  • PRADA-MEDINA, CESAR A. ; FUKUTANI, KIYOSHI F. ; PAVAN KUMAR, NATHELLA ; GIL-SANTANA, LEONARDO ; BABU, SUBASH ; LICHTENSTEIN, FLÁVIO ; WEST, KIM ; SIVAKUMAR, SHANMUGAM ; MENON, PRADEEP A. ; VISWANATHAN, VIJAY ; ANDRADE, BRUNO B. ; NAKAYA, HELDER I. ; KORNFELD, HARDY . Systems Immunology of Diabetes-Tuberculosis Comorbidity Reveals Signatures of Disease Complications. Scientific Reports , v. 7, p. 1999, 2017.

  • FUENTES, J. L. ; GARCÍA FORERO, A. ; QUINTERO RUIZ, N. ; PRADA MEDINA, C. A. ; REY CASTELLANOS, N. ; FRANCO NIO, D. A. ; CONTRERAS GARCÍA, D. A. ; CÓRDOBA CAMPO, Y. ; STASHENKO, E. E. . The SOS Chromotest applied for screening plant antigenotoxic agents against ultraviolet radiation. PHOTOCHEMICAL & PHOTOBIOLOGICAL SCIENCES , v. 16, p. 1424-1434, 2017.

  • SANTAMARÍA ACEVEDO, LILIANA ; PRADA-MEDINA, CESAR AUGUSTO ; RONDÓN GONZÁLEZ, FERNANDO ; STASHENKO, ELENA E ; MARTÍNEZ PÉREZ, FRANCISCO JOSÉ ; LEVY, MORRIS ; LEVY, MARÍA MERCEDES ; FUENTES, JORGE LUIS . Interspecific variation and genetic relationship among Colombian . based on small ribosomal subunit gene sequence analysis. Journal of Herbs, Spices & Medicinal Plants , v. 24, p. 99-108, 2017.

  • PRADA MEDINA, CESAR AUGUSTO ; ARISTIZABAL TESSMER, ELKE TATJANA ; QUINTERO RUIZ, NATHALIA ; SERMENT-GUERRERO, JORGE ; FUENTES, JORGE LUIS . Survival and SOS response induction in ultraviolet B irradiated Escherichia coli cells with defective repair mechanisms. International Journal of Radiation Biology , v. 92, p. 1-8, 2016.

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Projetos de pesquisa

  • 2014 - 2015

    Estudio de la actividad biológica de plantas medicinales: enfoque hacia el descubrimiento de productos con uso potencial para control del dengue y su vector Aedes aegypti, Descrição: The project was focused on searching plant extracts and plant compounds with antiviral (anti-DENV) activity. Also, the mechanisms of action of the identified bioactive substances were studied. For those purposes, mammalian cell cultures were infected with dengue virus and cultured with the mentioned substances.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: César Augusto Prada Medina - Integrante / Raquel Elvira Ocazionez Jimenez - Coordenador / Maria Camila Flechas Alarcón - Integrante / Sindi Alejandra Velandia Cruz - Integrante.

  • 2012 - 2016

    Estudio del potencial antigenotóxico frente a la radiación ultravioleta de extractos SFE y aceites esenciales de especies vegetales de la biodiversidad colombiana., Descrição: The potential protective activity of several plant extracts againts UV-induced DNA-damage has been assessed through bacterial and mammalian in-vitro models.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: César Augusto Prada Medina - Integrante / Jorge Luis Fuentes Lorenzo - Coordenador / Nathalia Quintero Ruiz - Integrante / Elena Stashenko - Integrante / Nathalia Rey Castellanos - Integrante / Adriana García Forero - Integrante.

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Prêmios

2018

Capacity building for bioinformatics in Latin America (CABANA) research fellowship, European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute.

2016

Bioinformatics training fellowship, Centro Latinoamericano de Formación Interdisciplinaria (CELFI).

2014

Summa Cum Laude degree, Universidad Industrial de Santander.

2014

Laurate award for the Bachelor degree project., Universidad Industrial de Santander.

2013

Best Colombian students of natural sciences, Instituto Colombiano para la Evaluación de la Educación - ICFES.

Histórico profissional

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Experiência profissional

2014 - 2015

Universidad Industrial de Santander

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Young researcher, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Grupo de Investigación en Enfermedades Infecciosas y Metabólicas: http://scienti1.colciencias.gov.co:8080/gruplac/jsp/visualiza/visualizagr.jsp?nro=00000000012382

2013 - 2014

Universidad Industrial de Santander

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Microbiology teaching assistant, Carga horária: 8

2015 - 2015

Centro Nacional de Investigaciones para la Agroindustrialización de especie

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Young researcher, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Grupo de Investigación en Microbiología y Genética: http://scienti.colciencias.gov.co:8080/gruplac/jsp/visualiza/visualizagr.jsp?nro=00000000007670

2014 - 2014

Corpoeducación

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Open question assesor, Carga horária: 20

2011 - 2014

Grupo Educativo Marín & Rosales

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Biology teacher, Carga horária: 8

Outras informações:
Pre-universitary education.

2018 - 2019

European Bioinformatics Institute

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Research secondee, Carga horária: 40

2016 - 2019

Universidade de São Paulo

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: PhD candidate, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2019 - Atual

Max-Planck-Institut für Molekulare Genetik

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Postdoctoral researcher, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.