Juliana Reis Cortines

Pós-doutorado

Formação complementar

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Orientou

Produções bibliográficas

• NUNES, G. H. P. ; DOS SANTOS OLIVEIRA, JULIANA ; ESSUS, V. A. ; GUIMARAES, A. J. ; PONTES, B. ; CORTINES, J. R. . Cytopathic effects in mimivirus infection: understanding the kinetics of virus-cell interaction. MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ , v. 119, p. 1, 2024.

• CORTINES, JULIANA R. ; BRIDGES, CHARLES M. ; SUBRAMANIAN, SUNDHARRAMAN ; SCHRAD, JASON R. ; ARAÚJO, GLAUBER R. S. ; NUNES, GABRIEL HENRIQUE PEREIRA ; OLIVEIRA, JULIANA DOS SANTOS ; ESSUS, VICTOR ALEJANDRO ; ABRAHÃO, JÔNATAS S. ; WHITE, SIMON ; PARENT, KRISTIN N. ; TESCHKE, CAROLYN . Transition metals and oxidation reactions trigger stargate opening during the initial stages of the replicative cycle of the giant Tupanvirus. mBio , v. 13, p. e0219224, 2024.

• ESSUS, VICTOR ALEJANDRO ; SOUZA JÚNIOR, GETÚLIO SILVA E ; NUNES, GABRIEL HENRIQUE PEREIRA ; OLIVEIRA, JULIANA DOS SANTOS ; DE FARIA, BRUNA MAFRA ; ROMÃO, LUCIANA FERREIRA ; CORTINES, JULIANA REIS . Bacteriophage P22 Capsid as a Pluripotent Nanotechnology Tool. Viruses-Basel , v. 15, p. 516, 2023.

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• GONÇALVES, DIEGO DE SOUZA ; FERREIRA, MARINA DA SILVA ; LIEDKE, SUSIE COUTINHO ; GOMES, KAMILLA XAVIER ; DE OLIVEIRA, GABRIEL AFONSO ; LEÃO, PEDRO ERNESTO LOPES ; CESAR, GABRIELE VARGAS ; SEABRA, SERGIO H. ; CORTINES, JULIANA REIS ; CASADEVALL, ARTURO ; NIMRICHTER, LEONARDO ; DOMONT, GILBERTO BARBOSA ; JUNQUEIRA, MAGNO RODRIGUES ; PERALTA, JOSE MAURO ; GUIMARAES, ALLAN J. . Extracellular vesicles and vesicle-free secretome of the protozoa Acanthamoeba castellanii under homeostasis and nutritional stress and their damaging potential to host cells. Virulence , v. 21, p. 00-00, 2018.

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• CORTINES, J. R. ; GASPAR, L. P. ; TEREZAN, A. F. ; PREVELIGE, P. E. ; SILVA, J. L. . Thermodynamics and conformational changes analyses of amino and carboxyl-terminal domains of the hiv-1 capsid protein. In: I International Workshop on Spectroscopy for Biology, 2001, São Paulo. International Workshop on Spectroscopy for Biology Programs and abstracts, 2001. p. 51-51.

• FORNELLS, L. A. M. G. ; CORTINES, J. R. ; SILVA, J. L. . New perspectives on human adenovirus type 2 fiber stability. In: XXIX Reunião da Sociedade Brasileira da Bioquímica e Biologia Molecular - Sbbq, 2000, Caxambu. SBBq-Programa e Resumos da XXIX Reuniao Anual - 2000, 2000. p. 43-43.

• CORTINES, J. R. ; FORNELLS, L. A. M. G. ; SILVA, J. L. . High hydrostatic pressure as a tool to investigate human adenovirus type 2 fiber's stability. In: IV Congresso de Biofísica do Cone Sul, 2000, Campinas. Biofísica do Cone Sul 2000, 2000. p. 82-82.

• CORTINES, J. R. ; ISHIMARU, D. ; SILVA, J. L. . Pressure stability of the ?Velcro? coiled-coil leucine zipper. In: XXIX Reunião da Sociedade Brasileira da Bioquímica e Biologia Molecular - Sbbq, 2000, Caxambu. SBBq-Programa e Resumos da XXIX Reuniao Anual - 2000, 2000. p. 146-146.

• FERREIRA, R. O. ; CORTINES, J. R. ; FORNELLS, L. A. M. G. ; MORGADO, F. N. ; SILVA, J. L. . Hexon and fiber stability during adenovirus high hydrostatic pressure inativation. In: XXVIII Reunião da Sociedade Brasileira da Bioquímica e Biologia Molecular - SBBq, 1999, Caxambu. SBBq-Programa e Resumos da XXVIII Reuniao Anual - 1999, 1999. p. 48-48.

• FORNELLS, L. A. M. G. ; CORTINES, J. R. ; SILVA, J. L. . Effects of high pressure on adenovirus? fiber.. In: XXVII Reunião da Sociedade Brasileira da Bioquímica e Biologia Molecular SBBq, 1998, caxambu. SBBq-Programa e Resumos da XXVII Reuniao Anual - 1998, 1998. p. 56-56.

• FORNELLS, L. A. M. G. ; CORTINES, J. R. ; SILVA, J. L. . Effects of high pressure on adenovirus? fiber. In: IX Encontro Nacional de Virologia da Sociedade Brasileira de Virologia - SBV, 1998, São Lourenço. Virus Reviews & Research, 1998. v. 03. p. 69-69.

• CORTINES, J. R. . Giant viruses: the stargate saga. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. . A post-doc is born. 2022. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. . Dropping acid makes you see stars: tales of a metal band. 2021. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. ; PROSDOCIMI, F. ; TORRES, S. . Como chegamos até aqui? Um bate-papo sobre origem da vida e evolução. 2020. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• CORTINES, J. R. . A evolução da Terra contada pelos vírus. 2020. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• PARENT, K. N. ; SCHRAD, JASON ; YOUNG, ERIC ; ABRAHÃO, JÔNATAS SANTOS ; CORTINES, J. R. . A Gateway Into Understanding the Unique Vertex of Samba Virus. 2018. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• CORTINES, J. R. . Cinquenta bilhões de chances para curar doenças do sistema nervoso central: utilização de gaiolas proteicas derivadas do bacteriófago P22 para encapsulamento e direcionamento de compostos para células gliais. 2017. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• CORTINES, J. R. . Bacteriophage P22-derived nanoparticle as a tool to treat CNS diseases.. 2017. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. . Bacteriophage P22 virus-like particles in CNS disease treatment.. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. . Evolution of life on Earth as told by viruses. 2016. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. . Assembly of icosahedral viruses. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. . Assembly of icosahedral viruses. 2014. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• CORTINES, J. R. . Capsid protein and virus assembly. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• CORTINES, J. R. . Defining the interaction sites between bacteriophage P22 scaffolding protein and coat proteins. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• CORTINES, J. R. . Defining the interaction sites between bacteriophage P22 scaffolding protein and coat proteins. 2011. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

• CORTINES, J. R. . Capsid protein and virus assembly. 2011. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• CORTINES, J. R. ; TESCHKE, C.M. . Bacteriophage P22 scaffolding protein: identification of the C-terminal residues responsible for coat protein binding and assembly.. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. ; PREVELIGE, P. E. . Mutational analysis of HIV-1 capsid protein: role of the hairpin region on mature core formation. 2007. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• CORTINES, J. R. . Bases moleculares e estruturais do vírus HIV-1. 2005. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• ABRAHÃO, JÔNATAS ; CORTINES, J. R. . Fields Virology. Philadelphia: Wolters Klowe, 2023 (Colaboração em Capítulo de Livro).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2024 - Atual

  Vírus gigantes e a origem da vida na Terra, Descrição: Os vírus gigantes são entidades infecciosas únicas, pois apresentam codificados em seus genes proteínas surpreendentes como todas as 20 aminio acil tranferases, proteínas regulatórias de fotossíntese, entre outras. Nosso projeto visa estudar o ciclo replicativo em detalhes nos aspectos: celular, estrutural e bioquímico.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador / Gabriel Henrique Pereira Nunes - Integrante / Bruna Penides - Integrante.

• 2022 - Atual

  Biologia Estrutural de Vírus e Interação Vírus-Célula na Busca de Possíveis Estratégias Antivirais, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Andrea Cheble de Oliveira - Integrante / Andre Marco de Oliveira Gomes - Coordenador.

• 2021 - 2022

  Catalisa, Descrição: Produção de nanopartículas magnéticas para purificação de DNA. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Marcel Guimarães Martins - Coordenador / Victor Alejandro Essus - Integrante.

• 2019 - 2022

  Proteotoxicidade Amilóide e Neurodegeneração: papel da proteína alfa-sinucleína e de endotoxinas bacterianas na degeneração dos neurônios dopaminérgicos na doença de Parkinson, Projeto certificado pelo(a) coordenador(a) Cristian Follmer em 13/08/2020., Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Cristian Follmer - Coordenador / Gilda Angela Neves - Integrante / Luciana Ferreira Romão - Integrante / Monica Santos de Freitas - Integrante / Rodrigo da Silva Bitzer - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2019 - 2019

  Vírus gigantes e bacteriófagos: da origem da vida na Terra à nanotecnologia., Descrição: Agência do auxílio: FAPERJ. Termo de outorga não foi entregue, mesmo o auxílio tendo sido aprovado.. , Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador.

• 2018 - 2020

  Aspectos biológicos, bioquímicos e moleculares de biofilmes formados por espécies do complexo Scedosporium/Lomentospora, Descrição: A inegável relevância das infecções fúngicas aumentou consideravelmente nas últimas quatro décadas, tornando-se um sério problema de saúde pública. Neste cenário, várias espécies de fungos emergiram como patógenos humanos capazes de causar doenças em indivíduos imunocompetentes e imunocompetentes. Neste contexto, espécies pertencentes aos gêneros Scedosporium e Lomentospora estão despertando a atenção global devido à: distribuição ubíqua, principalmente em ambientes impactados pelo homem; multirresistência a antifúngicos e (iii) capacidade de causar doenças graves e debilitantes, que culminam em cuidados médicos laboriosos, substancial custo de tratamento e altas taxas de morbidade e mortalidade. Essas razões têm estimulado a comunidade científica internacional a trabalhar de forma árdua numa tentativa de contornar essas situações indesejáveis. Assim, os pesquisadores tentam decifrar os principais eventos fisiopatológicos por trás da capacidade bemsucedida dessas espécies de escapar das respostas do hospedeiro e de resistir às opções de tratamento disponíveis. Os principais quadros clínicos causados por estas espécies são o micetoma micótico e a bola fúngica pulmonar, que se caracterizam por fungos aderidos ao tecido do hospedeiro, envolvidos por uma matriz polissacarídica, caracterizando-os como um biofilme. Nosso grupo descreveu pela primeira vez que essas espécies são capazes de formar biofilmes in vitro em diferentes substratos abióticos (poliestireno, vidro, poli-L-lisina e cateteres feitos de polivinil, látex siliconado e poliuretano) e sobre monocamadas de células epiteliais pulmorares. Os biofilmes formados por estes fungos apresentam elevada resistência a antifúngicos poliênicos, azóis e equinocandinas. Tais resultados nos motivaram a desvendar os mecanismos de formação de biofilme, a composição das matrizes extracelulares, bem como os mecanismos de resistência associados ao biofilme destes emergentes, oportunistas e multirresistentes patógenos fúngicos.. , Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (3) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador / Fernanda de Ávila Abreu - Integrante / Marta Helena Branquinha de Sá - Integrante / Andrea Regina De Souza Baptista - Integrante / Livia Cristina Liporagi Lopes - Integrante / Marcos Pereira - Integrante / Lucimar Kneipp - Integrante / Manoel Marques Evangelista de Oliveira - Integrante / Vera Carolina Bordallo Bittencourt - Integrante / Cátia Lacerda Sodré Sodré - Integrante / Marcia Ribeiro Pinto Da Silva - Integrante / André Luis Souza dos Santos - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2018 - 2019

  Biophysical studies on giant viruses, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador / Carolyn Teschke - Integrante / Simon White - Integrante., Financiador(es): Fulbright International Educational Exchange Programs - Bolsa.

• 2016 - 2019

  Comunicação celular e o seu papel na patogênese de doenças infecciosas e câncer, Descrição: A comunicação é fundamental para o desenvolvimento de indivíduos de um mesmo grupo, mesmo em nível celular. A comunicação intercelular ocorre através de mecanismos que envolvem o contato direto célula-a-célula, a exportação de vesículas membranares e a produção de sinais moleculares difusíveis. Todos os tipos celulares são capazes de liberar para o meio extracelular vesículas membranares conhecidas como exossomos. Estas vesículas, compostas principalmente de lipídeos, proteínas e ácidos nucleicos, medeiam a comunicação através da transferência do seu conteúdo de uma célula para outra. Nas últimas décadas, tem sido demonstrado que os exossomos desempenham funções críticas na manutenção da homeostase e em diferentes estados patológicos, incluindo câncer, doenças infecciosas e neurodegenerativas. Em bactérias, fenótipos complexos, como virulência e biofilme, são coordenados através do acúmulo de sinais moleculares no meio extracelular em um mecanismo de comunicação denominado quorum sensing. Neste contexto, o presente projeto visa entender o papel dos mecanismos de comunicação celular em diferentes modelos celulares, tanto em condições fisiológicas quanto patológicas. Para isso, pretendemos estudar o papel dos exossomos (i) na infecção de amebas de vida livre por microrganismos patogênicos, como bactérias e vírus; (ii) na replicação dos vírus Zika e Chikungunya em células musculares; (iii) na progressão tumoral causada pelo efeito prionóide de mutantes da proteína p53. Além disso, pretendemos esclarecer os mecanismos moleculares de regulação de quorum sensing em Pseudomonas aeruginosa, um dos principais agentes causadores de infecções hospitalares, visando o desenvolvimento de novas terapias antimicrobianas.. , Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (4) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Anderson de Sá Pinheiro - Integrante / Allan Jefferson Guimarães - Coordenador / Fernanda de Ávila Abreu - Integrante / Iranaia Assunção Miranda - Integrante / Luciana Pereira Rangel - Integrante / Renato Sampaio Carvalho - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2016 - Atual

  INCT de Biologia Estrutural e Bioimagem, Descrição: INBEB Formado por 20 laboratórios associados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Jerson Lima da Silva - Coordenador / Andrea Cheble de Oliveira - Integrante / Andre Marco de Oliveira Gomes - Integrante / CORDEIRO, YRAIMA - Integrante / FOGUEL, DEBORA - Integrante.

• 2015 - 2017

  Cinquenta bilhões de chances para curar doenças do sistema nervoso central: utilização de gaiolas protéicas derivadas do bacteriófago P22 para encapsulamento e direcionamento de compostos para células gliais., Descrição: Células gliais formam de 50-90% do cérebro. Sabe-se que possuem papel anti-inflamatório, de proteção e suporte do sistema nervoso central. Diversas patologias as acometem, com Parkinson, Alzheimer, doença de Hungtinton, esclerose lateral amiotrófica, esclerose múltipla e câncer, afetando uma proporção significativa da população mundial. Nenhuma destas patologias tem tratamento eficaz e o glioma (câncer das células gliais) é um dos tipos de câncer mais agressivos. O corrente projeto tem como objetivo testar diferentes terapias para patologias que acometem o sistema nervoso central (SNC), incluindo a vitamina D, mas utilizando uma abordagem onde células neuronais e os cérebros de camundongos serão desafiados com partículas do tipo virais derivadas do bacteriófago P22 (VLPs) e complexos micelares. Estas partículastêm em seu interior um fluoróforo que permitirá o rastreamento destas em células de cultura primária neuronais; em um segundo momento, compostos que tenham ação contra patogenias do SNC serão incorporadas como carga nestas VLPs. Adicionalmente, será testado o encapsulamento e direcionamento de vitamina D incorporada à um complexo gp238-303-micela. O fragmento da proteína de alicerce potencialmente poderá ser usado como um peptídeo permeador de células, assim permitindo a entrega de moléculas hidrofóbicas às células de interesse, diferente das VLPs. Pretendemos ainda estudar as vias de sinalização disparadas pela vitamina D em células do SNC através de técnicas como siRNA e predição in silica das vias afetadas através do método de Grafos. A eficácia de ambas as abordagens (entrega de compostos utilizando VLPs ou complexos micelares) será testada in vitro em cultura de células embrionárias de cérebro de camundongos e in vivo através de injeção direta no SNC dos animais. Como resultado, espera-se que as VLPs atinjam majoritariamente células gliais, evitando, portanto, danos significativos em células saudáveis e consequentes efeitos irreversíveis.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador / Peter E. Prevelige - Integrante., Financiador(es): FAPERJ - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2016

  Understanding and Advancing Therapies for CNS Disorders, Descrição: Glial cells have been highly in vogue lately, since it is thought that they can constitute up to 80% of the human brain. They are involved in anti-inflammatory response and protection of the central nervous system (CNS). The glia is the target of many diseases, such as Parkinson´s, Alzheimer´s, Multiple Sclerosis and cancer. Effective treatment/cure for most CNS-related diseases are still non-existing and the prognostic for the patient is often pessimistic, creating a serious global health burden: neurodegenerative diseases affect almost 50 million people worldwide; autoimmune diseases usually renders the individual incapable of performing daily activities and glioblastoma patients, i.e., have a 5-year survival rate of 17% maximum. Therefore, effective therapies for CNS-related infirmities are in absolute need. The use of viral capsids as nanocages are a growing trend, since they are naturally on the ?nano-range? and building these nanocapsules requires almost no human manipulation. Bacteriophage P22 is an icosahedral non-enveloped virus with a very well understood capsid assembly mechanism, which can be easily reproduced in vitro. Previous results showed that enzymes can be incorporated and maintain their activities in the interior of the capsids by co-expression of viral and target proteins. The current work focuses on testing the following: accuracy of cell targeting (neuron vs. glia); effect of compounds tested on cell metabolism; effect of compounds on treating CNS diseases at the cellular level. To achieve these goals, we are studying the effectiveness of encapsulated compounds using mCHERRY-P22 virus-like particles (VLPs) as carriers. Preliminary results showed that the VLPs are not captured by astrocytes, but mainly (~90%) by glial cells. Our results are showing to be very promising in the treatment of yet incurable diseases of the CNS.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador., Financiador(es): Newton Fund UK - Auxílio financeiro.

• 2015 - 2015

  Microrganismos com relevância em microbiologia: meio ambiente, biotecnologia e microbiologia médica no Estado do Rio de Janeiro, Descrição: Os microrganismos representam grande parte da biomassa e diversidade da Terra e estimativas indicam que apenas 1% esteja caracterizada. Sua importância já está consolidada na ciclagem de nutrientes, biorremediação e produção de fármacos, dentre outros. Grande parte dessa diversidade compõe a microbiota rara, formada por diversas espécies que ocorrem em baixo número nos ambientes, como solo, águas ou hospedeiros humanos. Acredita-se que a sua ocorrência em baixo número esteja relacionada à capacidade de resiliência que esses organismos conferem a um ecossistema e que constituem-se numa reserva genética que pode ser acessada a fim de reestabelecer a homeostase de um organismo ou ecossistema. Neste projeto nos propusemos a estudar a microbiota rara em situações relevantes para o estado do Rio de Janeiro: solo e sedimentos sujeitos a impactos ambientais, águas e sua potencialidade na produção de compostos relevantes na área de biotecnologia, como enzimas bioativas, além de patógenos ligados `a doenças, incluindo o estudo de amebas, grandes agentes contaminantes de solos e água doce. Essas amebas são reservatórios para outros microrganismos potencialmente pertencentes `a biosfera rara e importantes patógenos humanos. Empregando a estratégia de microcosmos, pretendemos investigar a resposta dessa microbiota a um impacto ambiental (e vice-versa) e identificar potenciais novos microrganismos relevantes para a biorremediação. Microrganismos de interesse para a ciência médica serão buscados através da correlação entre a composição da microbiota e implicações na fisiologia dos hospedeiros e parasitas. Além de correlacionar os componentes da microbiota rara aos fatores ambientais e fisiológicos, esperamos caracterizar e isolar membros da microbiota rara dos ecossistemas estudados, fornecendo novas cepas para aplicações biotecnológicas e médicas e descrevendo mecanisticamente os passos de interação entre estes microrganismos e seus hospedeiros.. , Situação: Desativado; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (3) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador / Allan Jefferson Guimarães - Integrante / Fernanda de Ávila Abreu - Integrante / Ulysses Garcia Casado Lins - Integrante / Claudinei de Souza Guimarães - Integrante / Magali Christe Cammarota - Integrante / Melissa Limoeiro Estrada Gutarra - Integrante., Financiador(es): Universidade Federal do Rio de Janeiro - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  Análise da comunidade microbiana em ambientes impactados pela atividade petrolífera no Rio de Janeiro por metagenômica e transcriptômica, Descrição: O litoral brasileiro abriga biomas com inúmeras reentrâncias com praias, mangues, lagoas hipersalinas, recifes, baías e restingas de grande importância biológica. Alguns desses ambientes são considerados patrimônios nacionais e representam uma importante fonte de biodiversidade ainda inexplorada. Esses abrigam novos consórcios microbianos úteis para a aplicação em processos biotecnológicos de interesse econômico. O aumento da exploração de petróleo em plataformas offshore aumenta o risco da ocorrência de contaminações de ecossistemas litorâneos, podendo afetar a biodiversidade costeira. Em vista da importância e potencial da comunidade microbiana nos ecossistemas costeiros e do aumento da atividade petrolífera no litoral do Rio de Janeiro, pretendemos caracterizar a comunidade microbiana em ambientes não impactados e impactados por atividades relacionadas à produção de petróleo. Assim, o isolamento, a identificação e a caracterização de estirpes microbianas em conjunto com métodos moleculares baseados em sequenciamento de DNA (metagenoma) e RNA (metatranscriptoma) em larga escala poderão contribuir para um melhor conhecimento a cerca da diversidade microbiológica encontrada em ecossistemas do litoral brasileiro, bem como avaliar o potencial biotecnológico da comunidade microbiana desses locais. Em paralelo, amostras de diferentes ecossistemas litorâneos serão contaminadas in vitro com petróleo. Os resultados obtidos nesse estudo servirão de subsídios para a obtenção de ferramentas biotecnológicas para o biomonitoramento da qualidade ambiental e também, em caso de ambientes contaminados, acompanhar a população microbiana degradadora de hidrocarbonetos durante processos de biorremediação. O projeto ainda é o meio para o estabelecimento de novas linhas de pesquisa no Estado do Rio de Janeiro e para a formação de recursos humanos aptos a trabalhar com elas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado acadêmico: (4) / Doutorado: (4) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Raquel Silva Peixoto - Coordenador / Diogo de Azevedo Jurelevicius - Integrante / Fernanda de Ávila Abreu - Integrante / Fabio Faria da Mota - Integrante / Rodrigo Pires do Nascimento - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2014 - Atual

  Rede Multidisciplinar de Biologia Computacional, Descrição: A compreensão das complexas interações de uma célula hospedeira com um agente infeccioso no que tange a transcrição gênica, a secreção de proteínas e lipídeos, as alterações metabólicas requer abordagens experimentais, analíticas e de interpretação de dados que envolvem tecnologias de alto desempenho, bioinformática e estatística. Quando usamos esse tipo de abordagem, evitamos as distorções causadas pela expectativa prévia de que certas moléculas sofram variação da expressão, produção ou secreção, e passamos a trabalhar com todo um universo possível de alvos de um processo de sinalização que não era previsível a priori. O projeto científico proposto está articulado em forma de rede com diferentes subprojetos que se comunicam tanto no tema quanto nos seus participantes. Por sua natureza sincicial, o projeto permite ao longo de sua realização a inclusão de subprojetos e participantes, o que maximizará o uso dos recursos financeiros e a formação de recursos humanos. Acreditamos que com esses projetos que utilizam abordagens experimentais e de bioinformática, será possível obter uma compreensão global da relação parasito-hospedeiro permitindo a identificação de alvos terapêuticos, profiláticos ou de controle de transmissão.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Anderson de Sá Pinheiro - Integrante / Marcelo T. Bozza - Coordenador., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  Velhos parceiros em novas aplicações: inovações em nanotecnologia utilizando a montagem de vírus icosaédricos e cônicos como modelos, Descrição: As infecções virais são um dos maiores problemas de saúde pública no mundo e poucos fármacos antivirais específicos se encontram disponíveis. Estes são normalmente direcionados a proteínas virais e/ou proteínas do hospedeiro que façam parte do ciclo replicativo de dado vírus. Conhecendo-se o processo de montagem dos vírus é possível gerar compostos que irão inibir em última instância a infecção. Em outra vertente, pode-se manipulá-los como nanomateriais, gerando substrato para fabricação de biosensores e capsídeos funcionalizados, entre outros. Este projeto visa utilizar os vírus P22, HIV, Adenovírus e Mimivírus como modelos para a compreensão do ciclo viral de distintas famílias e caracterizar as suas proteínas e a montagem de seus capsídeos de forma a utilizá-las a nosso favor. Também é objetivo deste trabalho elucidar as funções biofísicas e bioquímicas das subunidades proteicas do Mimivírus, um vírus gigante descrito recentemente e que pode ser o elo perdido na evolução de células e vírus. Além de ensaios clássicos bioquímicos, a espectrometria de massas será de fundamental aplicação à este projeto. Através desta técnica, todos os vírus serão identificados quanto ao seu conteúdo proteico, o que auxiliará na caracterização minunciosa das proteínas formadoras de cada um deles, utilizando suas estruturas tridimensionais de alta e média resoluções para complementar nossos estudos.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador / Tayná Sequeira Valerio - Integrante / Jéssica Xavier da Silva Santos - Integrante / Max William Lisboa Gomes - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2013 - Atual

  Caracterização dos mecanismos moleculares de interação entre microrganismos patogênicos e Acanthamoeba castellanii como abordagem para origem de fatores de virulência e evolução de patógenos intracelulares, Descrição: De acordo com a Organização Mundial da Saúde, cerca de 3,4 milhões de pessoas morrem todos os anos devido à água contaminada, falta de saneamento básico e higiene. A contaminação microbiológica das águas tem grande contribuição de amebas de vida livre (AVLs). As AVLs são caracterizadas por serem bastante resistentes às adversidades do meio ambiente, bem como à germicidas. Portanto, são excelentes reservatórios para diversas bactérias e vírus encontrados no ambiente, como Legionella pneumophila, Mycobacterium sp., Escherichia coli e Adenovírus. Especificamente, AVLs Acanthamoeba castellanii tem sido descritas como possíveis hospedeiros ambientais para uma ampla variedade de patógenos fúngicos causadores de micoses endêmicas como Cryptococcus spp., Histoplasma capsulatum, Sporothrix schenkii e Blastomyces dermatitides. Além disso, estudos demonstram que a interação de diversos patógenos com A. castellanii é responsável pela pressão seletiva no ambiente, pela conservação de fatores de virulência e aumento da patogenicidade durante a infecção de hospedeiros vertebrados. Isto significa que as AVLs necessitam de um repertório de receptores bastante abrangentes ou uma classe universal destes para poder interagir com espécies de microrganismos tão distintos como os citados acima. O objetivo geral deste projeto de pesquisa é desafiar culturas de A. castellanii com amostras de Legionella spp., fungos patogênicos e não-patogênicos. e Sambavírus para determinar os receptores responsáveis pela internalização destes patógenos humanos relevantes. Assim, pretendemos caracterizar molecularmente as instâncias que tornam as AVLs carreadoras de patógenos humanos que podem emergir como causadores de epidemias.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Allan Jefferson Guimarães - Integrante / José Mauro Peralta - Coordenador / Regina Helena Saramago Peralta - Integrante., Financiador(es): Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do RJ - Auxílio financeiro.

• 2011 - 2013

  Estudo biofísico da RNA polimerase dependente de RNA do vírus da Hepatite C., Descrição: Como uma das poucas RNA-polimerase dependente de RNA (RpRd) conhecida, a NS5B tem papel crucial durante o ciclo viral do vírus da Hepatite C (HCV). Neste projeto, temos como objetivo principal testar novos compostos anti-virais para o tratamento de hepatite não-A não-B e avaliar o efeito destes compostos na estrutura da RpRd NS5B.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Ronaldo da Silva Mohana Borges - Coordenador / Estefania Aguilera - Integrante.

• 2011 - 2013

  Espectrometria de massa como ferramenta para desvendar o proteoma e mitocondrioma de células infectadas pelo vírus da Dengue tipo 2., Descrição: Uma vez que o fígado é o principal órgão de síntese de proteínas plasmáticas e dada a sua importância na resposta inflamatória, temos estudado os efeitos da infecção pelo vírus da dengue sobre a secreção de proteínas por células hepáticas. Inicialmente, estabelecemos um método de quantificação do RNA viral ao longo da infecção de diferentes tipos celulares com três sorotipos de vírus da dengue usando PCR em tempo real, e as condições para preparo de amostras de proteínas secretadas pelas células HepG2 e sua análise através de proteômica. Este projeto foi desenvolvido no âmbito da ?Rede Proteoma Rio? (http://www.bioinfo.ufrj.br/proteoma), uma rede criada no Estado do Rio de Janeiro, com o apoio financeiro da FAPERJ, e revelou várias alterações na secreção de proteínas em decorrência da infecção. O prosseguimento da identificação das proteínas secretadas pelas células infectadas é um dos objetivos do presente projeto e poderá permitir a identificação de marcadores protéicos para diagnóstico de dengue assim como de novos alvos moleculares para o desenvolvimento de terapias antivirais. O mapeamento dos diferentes componentes das mitocôndrias é de fundamental importância dado o papel central destas organelas na homeostase energética celular e no processo de apoptose, como já mostrado para casos de câncer. Nossos resultados prévios sugerem que a infecção pelo vírus da dengue interfere com a função mitocondrial de células HepG2, tanto através da modulação dos genes dos complexos protéicos da cadeia respiratória como através da alteração das propriedades respiratórias destas células. Portanto, o mapeamento das diferentes proteínas mitocondriais de células HepG2 infectadas ou transfectadas pelo vírus da dengue através de técnicas proteômicas apresenta-se potencialmente importante para o entendimento das bases da disfunção da fisiologia mitocondrial durante a infecção.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Coordenador.

• 2008 - 2011

  Como montar um vírus icosaédrico: análise das proteínas de alicerce e capsídica do bacteriófago P22., Descrição: O bateriófago P22 é um vírus icosaédrico, com simetria T=7. Durante a montagem viral, a proteína capsídica e a de alicerce e o complexo portal interagem para formar uma estrutura intermediária, denominada procapsídeo (PC). A proteína de alicerce se encontra localizada no interior destas estruturas e durante a mutaração, esta é liberta do interior dos PCs e ADN é empacotado através do canal do complexo portal. Utilizando experimentos in vitro e in vivo, como escaneamento de alanina, "recombineering" e microscopia eletrônica, fomos capazes de identificar os resíduos na proteína de alicerce responsáveis pela interação com a proteína capsídica. Estes achados estão submetidos para publicação no Journal of Molecular Biology. Em uma segunda parte do projeto, identificamos o resíduo na proteína capsídica que interage com a proteína de alicerce, utilizando os mesmos procedimentos descritos acima, além de espectrometria de massas acoplada a cromatografia líquida analisada por tempo de voo. Ainda, estamos estudando como o complexo portal interage com a proteína de alicerce e com a proteína capsídica. Para tal, estamos utilizando transcrição e tradução in vitro, cross-linking por UV entre ARN e proteínas, para evaluar quais componentes estão presentes na nucleação de montagem do bacteriófago P22. Estes projetos elucidam questões levantadas há mais de 4 décadas e representam um grande avanço para a compreensão da montagem de capsídeos icosaédricos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Carolyn Teschke - Coordenador., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro.

• 2006 - 2008

  Investigação do papel do grampo beta na proteína capsídica do HIV-1., Descrição: O vírus da imundeficiência humano do tipo 1 (HIV-1) é o agente causador da síndrome da imunodeficiência humana (SIDA), que atinge cerca de 33 milhões de pessoas mundialmente. Em 2009, cerca de 2 milhões de pessoas morreram devido à síndrome. Apesar de todos os avanços científicos das últimas décadas, ainda não há cura para a SIDA. O HIV-1 é um vírus envelopado, da família dos retrovírus e é formado primariamente por 15 proteínas e duas fitas de ARN. Essas proteínas são primariamente traduzidas em uma única poliproteína, denominada Gag. Durante o ciclo viral, o HIV se torna infeccioso após processo de maturação, onde a enzima viral protease cliva Gag em sítios específicos, gerando as proteínas estruturais, como a proteína capsídica (CA). O capsídeo viral maduro é formado unicamente por ~1500 cópias de CA. Durante a maturação, o capsídeo sofre drásticas mudanças morfológicas, governadas principalmente pela CA. A proteína capsídica possui 25602 daltons. É organizada em sua maioria em alfa-hélices. Pode ainda ser dividida em dois domínios funcionais e estruturais: o domínio C-terminal e o domínio N-terminal. Os primeiros 13 resíduos de CA (contidos no N-terminal) se rearranjam de uma volta desorndenada em um grampo beta durante o processo de maturação. Ainda, os resíduos prolina 1 e ácido aspártico 51 formam uma ponte salina, que estabiliza a CA. O foco deste projeto foi compreender a formação desta grampo beta através de técnicas bioquímicas como montagem viral in vitro e espectrometria de massas. Foram geradas mutações na região do grampo beta, onde esta estrutura foi substituída por uma sequência flexível de glicinas e serinas, prolina 1 foi deletado e o grampo do HIV-1 foi substituído pelo grampo beta do vírus de leucemia murino (MLV). Apenas o híbrido MLV:HIV foi capaz de formar capsídeos in vitro. Utilizando troca de hidrogênio deutério analisada por "Fourier-transform ion cyclotron mass spectrometry" identificamos mudança na dinâmica de CA.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (2) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Peter E. Prevelige - Coordenador., Financiador(es): National Institute Of Health - Auxílio financeiro.

Projetos de desenvolvimento

• 2020 - Atual

  Produção de kit diagnóstico reutilizável para infecções virais, Descrição: O projeto visa produzir, potencialmente em larga escala, um kit diagnóstico reutilizável para detecção de infecções virais, especialmente SARS-CoV-2 e arboviroses, e produção de anticorpos. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Allan Jefferson Guimarães - Integrante / Fabiana Carneiro - Integrante / Marcel Guimarães Martins - Coordenador.

• 2020 - Atual

  Produção de kit diagnóstico reutilizável para infecções virais, Descrição: O projeto visa produzir, potencialmente em larga escala, um kit diagnóstico reutilizável para detecção de infecções virais, especialmente SARS-CoV-2 e arboviroses, e produção de anticorpos. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Allan Jefferson Guimarães - Integrante / Fabiana Carneiro - Integrante / Marcel Guimarães Martins - Coordenador.

• 2020 - Atual

  Produção de kit diagnóstico reutilizável para infecções virais, Descrição: O projeto visa produzir, potencialmente em larga escala, um kit diagnóstico reutilizável para detecção de infecções virais, especialmente SARS-CoV-2 e arboviroses, e produção de anticorpos. , Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (2) . , Integrantes: Juliana Reis Cortines - Integrante / Allan Jefferson Guimarães - Integrante / Fabiana Carneiro - Integrante / Marcel Guimarães Martins - Coordenador.

Prêmios