Dino Rogério Coinete Franklin

Pós-doutorado

Idiomas

Áreas de atuação

Organização de eventos

Participação em bancas

Orientou

Produções bibliográficas

• Gaspari, Zoltan ; F. Angyan, Annamaria ; Dhir, Somdutta ; FRANKLIN, D. ; Perczel, Andras ; Pintar, Alessandro ; Pongor, Sandor . Probing Dynamic Protein Ensembles with Atomic Proximity Measures. Current Protein and Peptide Science , v. 11, p. 515-522, 2010.

• Dhir, Somdutta ; Pacurar, Mircea ; Franklin, Dino ; Gaspari, Zoltan ; Kertesz-Farkas, Attila ; Kocsor, Andras ; Eisenhaber, Frank ; Pongor, Sandor . Detecting Atypical Examples of Known Domain Types by Sequence Similarity Searching: The SBASE Domain Library Approach. Current Protein and Peptide Science , v. 11, p. 538-549, 2010.

• FRANKLIN, D. ; DHIR, S. ; Pongro, Sandor . Analysis of Kernel Based Protein Classification Strategies Using Pairwise Sequence Alignment Measures. Lecture Notes in Computer Science (LNCS) , v. 5488, p. 222-231, 2009.

• KAJAN, L. ; Kertesz-Farkas, A. ; FRANKLIN, D. ; Ivanova, N. ; Kocsor, A. ; Pongor, S. . Application of a simple likelihood ratio approximant to protein sequence classification. Bioinformatics (Oxford. Print) , v. 22, p. 2865-2869, 2006.

• FRANKLIN, D. ; FRANÇA, A. L. M. . Improving dynamic aggregation of induction motor models. IEEE Transactions on Power Systems , New York, USA, v. 9, n.4, p. 1934-1941, 1994.

• FRANKLIN, D. . Protein Blocks Versus Hydrogen Bonds Based Alphabets For Protein Structure Classification. In: ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine 2012, 2012, Orlando, USA. The ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine 2012 Proceedings. New York: ACM, 2012. v. 1. p. 139-146.

• FRANKLIN, D. ; Pongro, Sandor . Analysis of Kernel Based Protein classification Strategies Using Pairwise Sequence Alignment Measures. In: Fifth International meeting on COMPUTATIONAL INTELLIGENCE METHODS FOR BIOINFORMATICS AND BIOSTATISTICS, 2008, Vietri sul Mare, Salerno. Proceedings of the Fifth International meeting on COMPUTATIONAL INTELLIGENCE METHODS FOR BIOINFORMATICS AND BIOSTATISTICS, 2008.

• CARVALHO, C. L. ; FRANKLIN, D. ; COSTA, E. . Insertion of Control in Logic Specification. In: II Congresso de Lógica Aplicada à Tecnologia, 2001, São Paulo. Anais do LAPTEC'2001, 2001.

• FRANKLIN, D. ; ABRÃO, A. M. . Measuring Software Agent´s Intelligence. In: SSGRR 2000 Computer & Ebusiness Conference, 2000, L´Aquila, Abruzzo. Proceedings of SSGRR 2000 Computer & Ebusiness Conference. Roma, Itália, 2000.

• FRANKLIN, D. ; FRANÇA, A. L. M. . Dynamical Identification of Electrical Loads Using Partially Recurrent Neural Networks. In: Fourth World Congress on Expert Systems, 1998, México. 4th WCES Proceedings. México: Programas Educativos, SA de CV, 1998. v. 2. p. 842-847.

• FRANKLIN, D. ; FRANÇA, A. L. M. . Avaliação da Tensão Residual na Transferência de Barramento em Sistemas Elétricos Industriais. In: 3rd IEEE Conference of Industrial Applications, 1998, São Paulo, SP. Conference Records of 1998 IEEE INDUSCON. São Paulo, SP: Tec Art Editora, 1998. v. 1. p. 121-125.

• FRANKLIN, D. ; TEIXEIRA, E. P. ; FERNANDES, J. M. . Compensação de Forças de Atrito Utilizando Redes Neurais Artificiais. In: XII Congresso Brasileiro de Automação, 1998, Uberlândia, MG. XII CBA - Proceedings, 1998.

• FRANKLIN, D. ; TEIXEIRA, E. P. ; AZEVEDO, H. R. ; FARIA, E. B. . Computação Inteligente em Sistemas de Controle. In: IBP - International Seminar of Instrumentation and Automation´98, 1998, Rio de Janeiro, RJ. Proceedings of SINA´98. Rio de Janeiro, RJ, 1998.

• FRANKLIN, D. ; FRANÇA, A. L. M. . Identification of Induction Motor Load Model in Power Systems. In: The International Conference on Intelligent Systems Applications to Power Systems, 1997, Seul, Coréia. ISAP´97 Proceedings. Seul, Coréia: KIEE, 1997. v. 1. p. 555-559.

• FRANKLIN, D. ; SENDIN, I. S. . Analysis of Structure Prediction Tools in Mutated MeCP-2. In: Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2005, São Leopoldo. Anais BSB 2005, 2005.

• FRANKLIN, D. . Engenharia de Software - Teoria e Prática. São Paulo: Pearson Education do Brasil, 2001. (Tradução/Artigo).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2009 - 2009

  Caracterização Estrutural e Estudo das Propriedades Ópticas de Proteínas Usando a Abordagem Teórica QM/MM, Descrição: O principal objetivo deste trabalho é tentar fundamentar teoricamente dados experimentais referentes à absorção e fluorescência de proteínas que contém triptofano, bem como a influência do solvente nessas propriedades. Esta análise sará possível graças à estrutura computacional instalada na SISSA e à técnica QM/MM, que possibilita tratar qüânticamente (TDDFT) somente parte do sistema, enquanto que a grande parte dos átomos do sistema são tratados classicamente.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Dino Rogério Coinete Franklin - Coordenador.

• 2009 - Atual

  Desenvolvimento e Aplicação de Estratégias Computacionais para a Solução de Problemas Complexos da Biologia Computacional, Descrição: O objetivo geral deste projeto é estabelecer e consolidar uma infra-estrutura produtiva - em termos de recursos humanos, estrutura física, equipamentos e redes de colaboração - de desenvolvimento de estratégias computacionais para a solução de problemas biológicos relevantes. Em termos de objetivos específicos, pretende-se: I.Explorar representações computacionais alternativas para a estrutura de proteínas, particularmente: a.A representação por Mapas de Contato b.A representação por alfabetos de estruturas locais . , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) . , Integrantes: Dino Rogério Coinete Franklin - Coordenador / Thiago Fialho de Queiroz Lafetá - Integrante / Clarivando Francisco Belizário Júnior - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação - UFU - Auxílio financeiro.

• 2009 - Atual

  Estudo dos Efeitos das Mutações na Proteína MeCP2 que Causam a Síndrome de Rett Usando Dinâmica Molecular (Ab-initio e Clássica) e, em Conjunto com Técnicas Combinatórias da Biologia Molecular, Desenvolvimento de Aptâmeros ligantes às MeCP2 Mutantes, Descrição: Este projeto apresenta uma proposta para o desenvolvimento de pesquisas teóricas (modelagem e simulação) e experimentais (biologia molecular) que, se amparando mutuamente, têm como objetivo comum: elucidar os efeitos das mutações causadoras da Síndrome de Rett (SR) na proteína MeCP2 e selecionar peptídeos ligantes específicos às mutantes. Mutações na MeCP2 estão associadas à Síndrome de Rett - uma doença neurológica grave que afeta uma em cada dez mil meninas. Embora incurável, estudos recentes em cobaias sugerem que o (tempo de) convívio com a doença não acarreta em seqüelas nos neurônios. Portanto, a descoberta de uma cura para a SR melhoraria drasticamente a vida de milhares de pessoas. A MeCP2 é uma proteína expressa em grande quantidade no cérebro que participa do processo da modelagem da cromatina e, consequentemente, da regulação da expressão genética. A epigenética - ciência que estuda a expressão genética (ou as mudanças no fenótipo) devido a outros fatores que não a seqüência do DNA - tem se tornado cada vez mais relevante a medida que fornece modelos e explicações para uma série de doenças. Em linhas gerais, neste trabalho pretende-se analisar um problema de saúde importante usando duas abordagens que se complementam (a teórica e a experimental), de modo a melhor compreender os mecânismos moleculares envolvidos e, consequentemente, criar uma base sólida para o desenvolvimento racional de fármacos eficientes contra essa doença.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (2) . , Integrantes: Dino Rogério Coinete Franklin - Coordenador / Lara Vecchi - Integrante / Breno Costa Landim - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais - Auxílio financeiro.

• 2005 - 2007

  The Use of Machine Learning Techniques for the Classification and Prediction of proteins domains, Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Dino Rogério Coinete Franklin - Coordenador., Financiador(es): International Centre for Genetic Engineering and Biotechnology - Italy - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2