Rodrigo Drummond Couto Duarte

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Produções bibliográficas

• SCHIAVON, BEATRIZ NUNES ; CARVALHO, KATIA CANDIDO ; COUTINHO-CAMILLO, CLÁUDIA MALHEIROS ; BAIOCCHI, GLAUCO ; VALIERIS, RENAN ; Drummond, Rodrigo ; DA SILVA, ISRAEL TOJAL ; DE BROT, LOUISE ; SOARES, FERNANDO AUGUSTO ; DA CUNHA, ISABELA WERNECK . miRNAs 144-3p, 34a-5p, and 206 are a useful signature for distinguishing uterine leiomyosarcoma from other smooth muscle tumors. Surgical and Experimental Pathology , v. 2, p. 5, 2019.

• ROSALES, RAFAEL A. ; Drummond, Rodrigo D. ; VALIERIS, RENAN ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; DA SILVA, ISRAEL T. . signeR: an empirical Bayesian approach to mutational signature discovery. BIOINFORMATICS , v. 33, p. 8-16, 2017.

• AMORIM, MARIA G. ; VALIERIS, RENAN ; Drummond, Rodrigo D. ; PIZZI, MELISSA P. ; FREITAS, VANESSA M. ; SINIGAGLIA-COIMBRA, RITA ; CALIN, GEORGE A. ; PASQUALINI, RENATA ; ARAP, WADIH ; SILVA, ISRAEL T. ; DIAS-NETO, EMMANUEL ; NUNES, DIANA N. . A total transcriptome profiling method for plasma-derived extracellular vesicles: applications for liquid biopsies. Scientific Reports , v. 7, p. 14395, 2017.

• HONÓRIO, BRUNO C. Z. ; Drummond, Rodrigo D. ; VIDAL, ALEXANDRE C. ; SANCHETTA, ALEXANDRE C. ; LEITE, EMILSON P. . Well log denoising and geological enhancement based on discrete wavelet transform and hybrid thresholding. Energy Exploration & Exploitation , v. 30, p. 417-434, 2012.

• KURODA, M. C. ; VIDAL, ALEXANDRE CAMPANE ; LEITE, EMILSON P. ; DRUMMOND, R. D. . Electrofacies characterization using Self-Organizing Maps. Revista Brasileira de Geofísica (Impresso) , v. 30, p. 287-299, 2012.

• Drummond, R.D. ; VIDAL, A. C. . Comparação entre as técnicas multivariadas MAF e PCA aplicadas na classificação de eletrofácies. Revista Brasileira de Geofísica (Impresso) , v. 29, p. 497-509, 2011.

• BUENO, JULIANA FINOTO ; Drummond, Rodrigo Duarte ; VIDAL, ALEXANDRE CAMPANE ; SANCEVERO, SéRGIO SACANI . Constraining uncertainty in volumetric estimation: A case study from Namorado Field, Brazil. Journal of Petroleum Science & Engineering , v. 77, p. 200-208, 2011.

• MATIOLLI, C. C. ; VIANA, A. J. C. ; DEL BEM, L. E. V. ; CORREA, L. G. G. ; MASCIO, P. D. ; DUARTE, G. T. ; MEYER, C. ; SILVEIRA, A. B. ; DRUMOND, R. D. ; TOMAZ, J. P. ; GAUER, L. ; VINCENTZ, M. G. A. ; PRADO, F. M. . The Arabidopsis bZIP gene AtbZIP63 is a sensitive integrator of transient ABA and glucose signals. Plant Physiology (Bethesda) , v. -, p. -, 2011.

• ABREU, G.C.G. ; PINHEIRO, A. ; DRUMMOND, R. D. ; CAMARGO, S. R. ; CAMARGO, SANDRA RODRIGUES ; MENOSSI, M. . Some Statistical Properties of Gene Expression Clustering for Array Data. Advances and Applications in Statistics , v. 14, p. 191-204, 2010.

• COSTA NETTO, ANTÔNIO PAULINO DA ; Drummond, Rodrigo Duarte ; FELIX, Juliana de Maria ; JORGE, RENATO ATÍLIO ; MENOSSI, Marcelo . Evaluation of the performance of different plastics used to seal nylon cDNA arrays. Ciência e Agrotecnologia (UFLA) , v. 33, p. 1883-1887, 2009.

• Schlögl, Paulo Sérgio ; Nogueira, Fábio Tebaldi S. ; Drummond, Rodrigo ; Felix, Juliana M. ; Rosa, Vicente E. ; VICENTINI, Renato ; Leite, Adilson ; Ulian, Eugênio C. ; MENOSSI, Marcelo . Identification of new ABA- and MEJA-activated sugarcane bZIP genes by data mining in the SUCEST database. Plant Cell Reports , v. 27, p. 335-345, 2008.

• CANÇADO, G. M. A. ; NOGUEIRA, F. T. S. ; CAMARGO, S. R. ; DRUMMOND, R. D. ; JORGE, R. A. ; MENOSSI, M. . Gene expression profiling in maize roots under aluminum stress. Biologia Plantarum (Praha) , v. 52, p. 475-485, 2008.

• Rocha, Flávia R ; Papini-Terzi, Flávia S ; Nishiyama, Milton Y ; Vêncio, Ricardo ZN ; VICENTINI, Renato ; Drummond, R.D. ; de Rosa, Vicente E ; Vinagre, Fabiano ; Barsalobres, Carla ; Medeiros, Ane H ; Rodrigues, Fabiana A ; ULIAN, Eugênio C ; Zingaretti, Sônia M ; Galbiatti, João A ; Almeida, Raul S ; Figueira, Antonio VO ; Hemerly, Adriana S ; Silva-Filho, Marcio C ; MENOSSI, Marcelo ; Souza, Gláucia M . Signal transduction-related responses to phytohormones and environmental challenges in sugarcane. BMC Genomics , v. 8, p. 71, 2007.

• MONDEGO, Jorge Maurício Costa ; GUERREIRO FILHO, Oliveiro ; BENGTSON, Mário Henrique ; Drummond, R.D. ; FELIX, Juliana de Maria ; DUARTE, Melina Pasini ; RAMIRO, Daniel ; MALUF, Mirian Perez ; SOGAYAR, Mari Cleide ; MENOSSI, Marcelo . Isolation and characterization of Coffea genes induced during coffe leaf miner (Leucoptera coffeella) infestation. Plant Science (Limerick) , Ireland, v. 169, n.2, p. 351-360, 2005.

• Drummond, R.D. ; PINHEIRO, Aluisio ; ROCHA, Cristiane de Souza ; MENOSSI, Marcelo . ISER: Selection of differentially expressed genes from DNA array data by nonlinear data transformations and local fitting. Bioinformatics (Oxford) , England, 2005.

• ARAÚJO, Paula G de ; ROSSI, Magdalena ; JESUS, Erika M de ; SACCARO JR, Nilo L ; KAJIHARA, Daniela ; MASSA, Rogério ; FELIX, Juliana Maria de ; Drummond, R.D. ; FALCO, Maria C ; CHABREGAS, Sabrina M ; ULIAN, Eugênio C ; MENOSSI, Marcelo ; SLUYS, Marie Anne Van . Transcriptionally active transposable elements in recent hybrid sugarcane. Plant Journal , UK, v. 44, p. 707-717, 2005.

• MARQUES, Everaldo dos Reis ; FERREIRA, M.e.s ; Drummond, R.D. ; FELIX, Juliana de Maria ; MENOSSI, Marcelo ; SAVOLDI, M ; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho Raja Gabaglia ; PUCCIA, Rosana ; BATISTA, W L ; CARVALHO, K C ; GOLDMAN, Maria Helena de Souza ; GOLDMAN, Gustavo Henrique . Identification of genes preferentially expressed in the pathogenic yeast phase of Paracoccidioides brasiliensis using suppression subtraction hybridization and macroarray differential analysis.. Molecular Genetics and Genomics , v. 271, n.6, p. 667-677, 2004.

• FELIX, Juliana de Maria ; Drummond, R.D. ; NOGUEIRA, Fabio Tebaldi S ; ROSA JUNIOR, Vicente e de ; ARRUDA, Paulo ; MENOSSI, Marcelo . Genoma Funcional : Uso de arranjos de DNA em nailon para a análise de expressão gênica em larga escala.. Biotecnologia Ciência & Desenvolvimento , Brasil, v. 24, p. 60-67, 2002.

• Drummond, R.D. ; GUIMARÃES, C. T. ; FELIX, Juliana de Maria ; NINAMANGOCÁRDENAS, Fernando Enrique ; CARNEIRO, Newton Portilho ; PAIVA, e ; MENOSSI, Marcelo . Prospecting sugarcane genes involved in aluminum tolerance. Genetics and Molecular Biology , Ribeirão Preto, v. 24, n.1-4, p. 221-230, 2001.

• FELIX, Juliana de Maria ; Drummond, R.D. ; JORGE, Renato A ; ARRUDA, Paulo ; MENOSSI, Marcelo . Using macroarrays containing sugarcane ESTS do identify aluminium-induced genes in maize.. In: W J Horst. (Org.). Plant Nutrition. Food security and sustainability of agro-ecosystems through basic and applied research. : Kluwer Academic Publishers, 2001, v. , p. 40-41.

• Drummond, R.D. ; PINHEIRO, Aluisio ; ROCHA, Cristiane S ; MENOSSI, Marcelo . Selection of differentially expressed genes from DNA arrays data by nonlinear data transformations and local fitting. In: Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú. Resumos da 33ª Reunião Anual da SBBq, 2004.

• CANÇADO, Geraldo M A ; NOGUEIRA, Fabio Tebaldi S ; FELIX, Juliana de Maria ; Drummond, R.D. ; VICENTINI, Renato ; ROCHA, Cristiane S ; JORGE, Renato A ; MENOSSI, Marcelo . Identification and expression analysis of aluminum-responsive genes in maize. In: Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú. Resumos da 33ª Reunião Anual da SBBq, 2004.

• MONDEGO, Jorge M C ; GUERREIRO, O ; BENGTSON, M H ; Drummond, R.D. ; FELIX, Juliana de Maria ; DUARTE, Melina P ; COLIN, C ; RAMIRO, D ; MALUF, M ; SOGAYAR, M C ; MENOSSI, Marcelo . Unraveling the defense against leaf miners: Characterization of Coffea genes involved in resistance to coffe leaf miner (Leucoptera coffeella). In: Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú. Resumos da 33ª Reunião Anual da SBBq, 2004.

• MARQUES, Everaldo dos Reis ; Drummond, R.D. ; FELIX, Juliana de Maria ; MENOSSI, Marcelo ; SAVOLDI, M ; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho Raja Gabaglia ; PUCCIA, Rosana ; BATISTA, W L ; CARVALHO, K C ; GOLDMAN, Maria Helena de Souza ; GOLDMAN, Gustavo Henrique . Identification of genes preferentially expressed in the pathogenic yeast phase of Paracoccidioides brasiliensis using suppression subtraction hybridization and macroarray differential analysis. In: Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú. Resumos da 33ª Reunião Anual da SBBq, 2004.

• VICENTINI, Renato ; ROCHA, Cristiane S ; Drummond, R.D. ; MENOSSI, Marcelo . Use of Pipeline for Macro and microarray Analysis (PMma) for analyze expression profile of sugarcane genes in macroarrays. In: Reunião Anual da SBBq, 2004, Caxambú. Resumos da 33ª Reunião Anual da SBBq, 2004.

• Drummond, R.D. ; ROCHA, Cristiane S ; PINHEIRO, Aluisio ; MENOSSI, Marcelo . Identificação de genes diferencialmente expressos em arranjos de DNA utilizando ttransformações não lineares e ajuste local. In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindóia. Resumos do 49º Congresso Brasilerio de Genética, 2003.

• COSTA-NETTO, Antônio Paulino ; Drummond, R.D. ; FELIX, Juliana de Maria ; MENOSSI, Marcelo . ANÁLISE DA INTERFERÊNCIA DE DIFERENTES TIPOS DE PLÁSTICO NA CAPTAÇÃO DE SINAL EM MACROARRANJOS DE DNA. In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindóia. Resumos do 49º Congresso Ncional de Genética, 2003.

• MONDEGO, Jorge M C ; Drummond, R.D. ; FELIX, Juliana de Maria ; BENGTSON, M H ; COLIN, C ; RAMIRO, D ; DUARTE, Melina P ; VICENTINI, Renato ; ROCHA, Cristiane S ; MALUF, M ; SOGAYAR, M C ; GUERREIRO, O ; MENOSSI, Marcelo . CHARACTERIZATION OF COFFEA GENES EXPRESSED DURING RESISTANCE TO THE COFFEE LEAF MINER (LEUCOPTERA COFFEELLA). In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de lindóia. Resumos do 49º Congresso Nacional de Genética, 2003.

• MENOSSI, Marcelo ; FELIX, Juliana de Maria ; Drummond, R.D. ; CAMARGO, Sandra C ; REIS, C P ; VICENTINI, Renato ; ROCHA, Cristiane S . CROSS-SPECIES HYBRIDIZATION OF NYLON ARRAYS CONTAINING SUGARCANE ESTs TO IDENTIFY ROOT SPECIFIC GENES FROM MAIZE. In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Águas de Lindóia. 49º Congresso Nacional de Genética, 2003.

• FELIX, Juliana de Maria ; Drummond, R.D. ; MONDEGO, Jorge M C ; VICENTINI, Renato ; ROCHA, Cristiane S ; ULIAN, Eugênio C ; MENOSSI, Marcelo . EXPRESSION ANALYSIS of genes involved in sucrose accumulation IN SUGARCANE. In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Aguas de Lindóia. Resumos do 49º Congresso Nacional de Genética, 2003.

• ROCHA, Cristiane S ; VICENTINI, Renato ; Drummond, R.D. ; MENOSSI, Marcelo . FERRAMENTAS E SISTEMAS PARA ANÁLISE DE ARRANJOS DE DNA. In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Aguas de Lindóia. Resumos do 49º Congresso Nacional de Genética, 2003.

• MARQUES, Everaldo dos Reis ; CAPELLARO, J L ; MALAVAZI, I ; MENOSSI, Marcelo ; Drummond, R.D. ; TRAVASSOS, Luiz Rodolpho Raja Gabaglia ; PUCCIA, Rosana ; BATISTA, W L ; GOLDMAN, Maria Helena de Souza ; GOLDMAN, Gustavo Henrique . IDENTIFICATION OF GENES PREFERENTIALLY EXPRESSED IN THE PATOGENIC YEAST PHASE OF PARACOCCIDIOIDES BRASILIENSIS BY USING MACROARRAY AND SUPPRESSION SUBTRACTIVE HYBRIDIZATION. In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Aguas de lindóia. Resumos do 49º Congresso Nacional de Genética, 2003.

• CAMARGO, Sandra C ; SILVA, T G M ; FELIX, Juliana de Maria ; RODRIGUES, F A ; ROSSI, J ; Drummond, R.D. ; VICENTINI, Renato ; MAURO, Sonia M Z Di ; MENOSSI, Marcelo . ESTRATÉGIAS PARA AUMENTO DO SINAL NOS MACROARRANJOS DE DNA. In: Congresso Nacional de Genética, 2003, Aguas de lindóia. Resumos do 49º Congresso Nacional de Genética, 2003.

• Drummond, R.D. ; LEITE, E. P. ; BUENO, J. F. ; VIDAL, A. C. . Maximum Autocorrelation Factors applied to electrofacies classification. 2010. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

Projetos de pesquisa

• 2016 - Atual

  Epidemiologia e Genômica de Adenocarcinomas Gástricos no Brasil, Descrição: O adenocarcinoma gástrico (AdG) é um dos tumores com maiores índices de mortalidade. Apesar de possuir patogenia bem determinada, o conhecimento atual dos mecanismos moleculares que promovem sua gênese e evolução ainda não se traduziu em impacto significante sobre o diagnóstico, tratamento ou novas modalidades terapêuticas que fossem capazes de alterar o curso natural da doença. Este projeto visa aumentar de modo significativo o conhecimento acerca desta patologia, com enfoque na população brasileira, atualizando a sua epidemiologia. Agregaremos informação multidisciplinar relativa a novos agentes etiológicos e buscaremos alterações moleculares da doença familiar ou de ocorrência em idades precoces, investigando marcadores de resposta à quimioterapia neoadjuvante e pesquisando fatores relacionados ao prognóstico e diversidade de seus diferentes tipos histopatológicos - sempre buscando obter algum impacto no diagnóstico e na terapia dos pacientes. Para tal, estruturamos uma rede colaborativa envolvendo centros em São Paulo, Fortaleza, e Belém, onde coletaremos dados epidemiológicos detalhados de mais de 2000 pessoas. Para as amostras do AC Camargo além dos questionários, coletaremos fluidos biológicos e tecidos que serão analisados com técnicas modernas de patologia, metagenômica, genômica, epigenômica. Analisaremos vesículas extracelulares e células tumorais circulantes e todos os dados serão avaliados dentro de um contexto de ancestralidade genômica, fundamental para uma população miscigenada como a brasileira. Nosso objetivo final é contribuir para que os pacientes desta doença, com desfecho atual quase sempre letal, tenham tratamento mais eficiente.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Drummond Couto Duarte - Integrante / DIAS-NETO, EMMANUEL - Coordenador / DA SILVA, ISRAEL TOJAL - Integrante / Maria Isabel Alves de Souza Waddington Achatz - Integrante / Vilma Regina Martins - Integrante.

• 2016 - Atual

  Retrotransposons e enzimas de edição de ácidos nucléicos: ativação, eventos somáticos e associação com o câncer, Descrição: Os retrotransponíveis ou elementos móveis (MEs), representam uma constante ameaça à integridade do genoma hospedeiro pela sua capacidade mutagênica. Como mecanismo que busca assegurar esta integridade, um conjunto de enzimas de edição de ácidos nucléicos atua para inibir a atividade deletéria desses MEs. No entanto, este mesmo mecanismo de proteção à integridade do genoma, acaba sendo uma fonte crônica de danos pois é capaz de induzir mutações no DNA. A relação entre a ativação dos MEs e as mutações colaterais resultantes destas enzimas ainda não é totalmente esclarecida e precisa ser melhor explorada. Este projeto visa identificar e fornecer informações críticas para deduzir os agentes prejudiciais ao DNA, mecanismos moleculares casuais e, portanto, sugerir alvos terapêuticos adicionais para evitar eventos mutacionais desta natureza. Para alcançar esse objetivo, estruturaremos uma abordagem integrativa para interrogar o transcriptoma de 75 linhagens celulares, genoma e exoma total de 207 amostras (normal vs tumor) de pacientes com linfoma. No final, prentendemos expandir nosso conhecimento a respeito dos danos molelulares, apontando para novas alterações genômicas determinantes durante a formação e progressão nos tumores de células B.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Drummond Couto Duarte - Integrante / ROSALES, RAFAEL A. - Integrante / VALIERIS, RENAN - Integrante / DIAS-NETO, EMMANUEL - Integrante / SILVA, ISRAEL T. - Coordenador / NUNES, DIANA N. - Integrante.

• 2012 - 2013

  Métodos quantitativos aplicados ao estudo de reservatórios carbonáticos, Descrição: O projeto tem como objetivo a aplicação de métodos matemáticos e geofísicos na caracterização de reservatórios e, com isso, a geração de uma série de parâmetros para auxiliar na construção de modelos geológicos direcionados à análise de incerteza. A base de dados e objeto de estudo são os reservatórios carbonáticos do Albinado denominados de campos A e B.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Rodrigo Drummond Couto Duarte - Integrante / Alexandre Campane Vidal - Coordenador / Emilson Pereira Leite - Integrante / Juliana Finoto Bueno - Integrante / HONÓRIO, BRUNO C. Z. - Integrante / Michelle Chaves Kuroda - Integrante.

• 2009 - 2012

  Modelagem de parâmetros dinâmicos na caracterização de reservatórios, Descrição: O objetivo principal desse projeto é a caracterização de variáveis dinâmicas em rocha reservatório. A pesquisa tem característica ampla, com início na definição de fácies e geração do modelo geológico, para, posteriormente, serem aplicados métodos específicos na avaliação da reposta sísmica às mudanças da saturação de fluidos. Com isso, os objetivos do trabalho podem ser subdivididos em três itens: 1.Integração de dados estáticos e dinâmicos por meio da utilização de métodos de estatística multivariada, tais como o Principal Component Analysis (PCA), Independent Component Analysis (ICA), Maximum Autocorrelation Factors (MAF) e Análise Fuzzy; 2.Aplicação de métodos geoestatísticos para modelar a distribuição das variáveis originais, como também as geradas na utilização da estatística multivariada; 3.Aplicação de métodos de inversão sísmica e análise de atributos para a obtenção de variáveis relacionadas a saturação de fluidos.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (3) . , Integrantes: Rodrigo Drummond Couto Duarte - Integrante / Alexandre Campane Vidal - Coordenador / Emilson Pereira Leite - Integrante / Juliana Finoto Bueno - Integrante / Moacir Cornetti - Integrante.

• 2004 - 2007

  Transcriptoma da cana-de-açúcar, Descrição: Este projeto tem como objetivo a análise transcriptômica de variedades elite de cana-de-açúcar, plantadas e processadas pela COPERSUCAR em colaboração com a Destilaria Central de Álcool Lucélia LTDA utilizando-se a tecnologia de microarrays e macroarrays de cDNAs. Dada a possibilidade já existente na COPERSUCAR de manipulação de genes por engenharia genética de modo a produzir novas variedades de cana transgênica nas quais uma característica desejada seja introduzida, ou uma característica indesejada seja anulada, o trabalho de pesquisa proposto neste projeto deverá abrir novas fronteiras para o melhoramento da cana na era da genômica. Pretende-se unir esforços entre grupos de pesquisa do sistema universitário público paulista (pesquisadores da USP, UNICAMP e UNESP), fomentados pela FAPESP, e pela iniciativa privada na figura da Central de Alcool Lucélia e COPERSUCAR, para analisar o transcriptoma da cana-de-açúcar como descrito a seguir. O presente estudo pretende revelar um conjunto de genes e dados de suas funções que possa ser usado para a manipulação genética via melhoramento convencional ou engenharia genética permitindo o patenteamento de genes para este fim, a proteção de novas variedades e o aporte de recursos pela venda de licenças.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Rodrigo Drummond Couto Duarte - Integrante / Marcelo Menossi - Integrante / Juliana de Maria Felix - Integrante / Glaucia Mendes Souza - Coordenador / Eugênio César Ulian - Integrante / Carlos Nomura - Integrante., Financiador(es): Cooperativa de Álcool Lucélia - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Cooperativa de Produtores de Cana-de-Açúcar, Açúcar e Álcool de São Paulo - Auxílio financeiro.

• 2001 - 2007

  Análise da expressão gênica induzida em cana-de-açúcar por deficiência de fosfato, Descrição: Este trabalho visa identificar genes de cana-de-açúcar envolvidos na resposta desta planta à privação de fosfato. Para isso cultivamos plântulas em hidroponia em diferentes regimes de fosfato, extraindo amostras de tecido das raízes em vários momentos do tratamento. Utilizamos microarranjos de DNA em lâmina de vidro ("chips" de DNA) para quantificar a expressão de cerca de 1600 ESTs de cana-de-açúcar selecionados por corresponderem a genes envolvidos na transdução de sinais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (0) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (0) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Rodrigo Drummond Couto Duarte - Integrante / Marcelo Menossi - Coordenador / Aluísio Pinheiro - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa.

• 2000 - 2001

  Prospecting sugarcane genes involved in aluminum tolerance, Descrição: Aluminum (Al) is one of the major factors that affect plant development in acid soils, causing substantial yield reduction in many crops. In South America, around 66% of the land surface comprise acid soils, where the high aluminum saturation is one of the main limitation for the widely use for agriculture. Despite the growing number of studies, a complete knowledge on the biochemical and molecular basis of Al tolerance in plants is far from being achieved. In the case of sugarcane, there are virtually no reports on the gene regulation upon Al stress. The objective of this work was to prospect, in the SUCEST Data Bank, sugarcane genes related to several pathways that are known to be involved in the responses to the Al toxicity in other plant species and yeast. We identified sugarcane genes similar to most of these genes, as those coding for enzymes that alleviates the oxidative stress or combat pathogen infection, and proteins responsible for exudation of organic acids and signal transduction. The role of these genes on the Al tolerance mechanisms is reviewed. Due to the high level of genomic conservation among related grasses as maize, barley, sorghum and sugarcane, these genes may be valuable tools to better understand and to manipulate the Al tolerance in these species.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Especialização: (0) / Mestrado acadêmico: (1) / Mestrado profissional: (0) / Doutorado: (0) . , Integrantes: Rodrigo Drummond Couto Duarte - Integrante / Marcelo Menossi - Coordenador / Juliana de Maria Felix - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.