Ana Paula de Oliveira Sales

Pós-doutorado

Idiomas

Áreas de atuação

Produções bibliográficas

• Feng, F. ; SALES, A. P. ; Kepler, T. B. . A Bayesian approach for estimating calibration curves and unknown concentrations in immunoassays. Bioinformatics (Oxford. Print) , v. 27, p. 707-712, 2011.

• SALES, A. P. ; Kepler, Thomas B . Improving peptide-MHC class I binding prediction for unbalanced datasets. BMC Bioinformatics , v. 9, p. 385, 2008.

• Sales, Ana Paula ; Feng, F. ; Kepler, Thomas B . Analizing the Temporal Gene Expression Profiles of Dendritic Cells in Response to LPS. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SALES, A. P. ; Feng, F. ; Kepler, Thomas B . Clustering of Temporal Gene Expression Data with a Bayesian Nonparametric Mixture Model. 2009. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Sales, Ana Paula ; Feng, F. ; Kepler, T. B. . Clustering of Dendritic Cell Temporal Gene Expression Data with Dirichlet and Gaussian Processes Mixture Model. 2009. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• SALES, A. P. ; Feng, F. ; Kepler, T. B. . Clustering of Temporal Gene Expression Data with a Bayesian Nonparametric Mixture Model. 2009. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

• SALES, A. P. ; Feng, F. ; Kepler, T. B. . Analysis of Dendritic Cell Temporal Gene Expression Profiles Using a Dirichlet and Gaussian Processes Mixture Model. 2008. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Sales, Ana Paula ; Feng, F. ; Kepler, Thomas B . Analysis of Dendritic Cell Temporal Gene Expression Profiles Using a Dirichlet and Gaussian Processes Mixture Model. 2008. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Sales, Ana Paula ; Kepler, Thomas B . Clustering Temporal Gene Expression Data with a Dirichlet Process Mixture Model. 2008. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• Sales, Ana Paula ; Kepler, Thomas B . Prediction of MHC-peptide binding with decision trees. 2007. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

• SALES, A. P. ; Kepler, Thomas B . A Decision-Theoretic Approach to MHC Epitope Discovery. 2007. (Apresentação de Trabalho/Outra).

• Sales, Ana Paula ; GEORGIA, T. ; Kepler, Thomas B . Prediction of peptide binding to MHC I using a regression tree algorithm. 2006. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

• Sales, Ana Paula . Finding a minimum set of primers: A graph approach. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

Projetos de pesquisa

• 2011 - Atual

  Desenvolvimento de diagnóstico para determinar exposição de humanos a agentes infecciosos, Descrição: Projeto interdisciplinario para desenvolvimento de diagnóstico para determinar exposição de seres humanos a agentes infecciosos. Estamos desenvolvendo uma tecnologia nova baseada em arrays de peptídeos e Dra. Sales é responsável pela análize de dados.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Ana Paula de Oliveira Sales - Coordenador.

• 2011 - Atual

  Desenvolvimento de métodos para a análise de "streaming data", Descrição: Desenvolvimento de métodos baseados em modelos Bayesianos, em particular "particle filtering", para análize de "streaming data", ou seja, dados em grandes quantidades, cuja produção é contínua.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Ana Paula de Oliveira Sales - Integrante / Dan Merl - Coordenador.

• 2010 - 2011

  Agrupamento de múltiplos experimentos simultaneamente usando processos Dirichlet hierárquicos, Descrição: Desenvolvimento e aprimoramento de um modelo de processor Dirichlet hierárquico para o agrupamento de vários experimentos de citometria de fluxo simultaneamente. Esse modelo permitiu a identificação de uma pequena subpopulação de células T com importância bioloógica significativa que não havia sido previamente identificada por nenhum outro método.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Ana Paula de Oliveira Sales - Coordenador / Mike West - Integrante / Cliburn Chan - Integrante.

• 2008 - 2011

  Análise de expressão gênica temporal de células dendríticas estimuladas com LPS e DNA CpG, Descrição: Estudo dos elementos genéticos, incluindo fatores de transcrição, envolvidos na resposta de células dendríticas a moléculas com potencial para serem usadas como adjuvantes de vacinas, como LPS e DNA CpG. Células dendríticas de ratos foram estimuladas com uma dessas moléculas e mRNA foi coletado durante 48 horas, em 8 pontos diferentes. Nós desenvolvemos modelos estatísticos e computacionais baseasos em processos Dirichlet e processors Gaussianos para analizar esses dados. Identificamos vários genes, incluindo genes para citoquinas e fators de transcrição, envolvidos na resposta diferencial de células dendríticas a LPS ou CpG.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Ana Paula de Oliveira Sales - Integrante / Kepler, Thomas B - Coordenador / Feng, F. - Integrante.

• 2005 - 2008

  Predição de ligamento entre peptídios e MHC de classe I, Descrição: Desenvolvimento e implementação de um algorítimo de árvores de decisões para a predição de ligação entre peptídios e MHC. Esse método foi utilizado para selecionar peptídios com potencial para serem usados como epitopos em vacinas para serem testados em laboratório. Nosso foco foi em peptídios para vacinas contra agentes infecciosos, tais como vírus ebola e Micobacterium tuberculosis.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Ana Paula de Oliveira Sales - Coordenador / Kepler, Thomas B - Integrante / Tomaras, Georgia D - Integrante.

Prêmios