Marcos Tadeu Geraldo

Possui graduação em Ciências Biológicas (Licenciatura e Bacharelado) pela Universidade Federal de São Carlos (2008), Mestrado (2012) e Doutorado (2016) ambos em Ciências Biológicas (Genética) pela Universidade Estadual Paulista, campus de Botucatu, SP. Realizou estágio de pós-doutoramento (2018) vinculado ao Programa de Pós-Graduação em Biossistemas da Universidade Federal do ABC, campus Santo André/SP. Tem experiência em Genética e Bioinformática Estrutural e Evolutiva, especialmente em: (i) estudos estruturais de proteínas virais para determinação de alvos de drogas, (ii) estudos estruturais de proteínas de importação nuclear e reconhecimento de sequências de localização nuclear e (iii) estudos de evolução molecular e análises genômicas, nesse último item tendo ministrado palestras e cursos. Possui interesse direto em estudos que utilizam ferramentas em Bioinformática, principalmente modelagem molecular, simulações de dinâmica molecular, análise de modos normais e docking proteína-proteína. Atualmente leciona na Universidade do Oeste Paulista (UNOESTE), campus da Faculdade de Medicina de Jaú (SP) e na Faculdade Gran Tietê, campus de Barra Bonita (SP).

Informações coletadas do Lattes em 25/05/2022

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)

2012 - 2016

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-
Orientador: em École Normale Supérieure de Cachan ( David Perahia)
com Ney Lemke. Coorientador: Agnes Alessandra Sekijima Takeda. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)

2010 - 2012

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
Título: Evolução e organização genômica do gene FOXL2 em vertebrados,Ano de Obtenção: 2012
Cesar Martins.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: cópias parálogas; duplicação gênica; evolução molecular; Forkhead box L2; genoma de vertebrados.Grande área: Ciências BiológicasGrande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal / Especialidade: Biologia Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Especialização em MBA em Gestão Ambiental e Desenvolvimento Sustentável

2009 - 2010

Grupo UNINTER
Título: Responsabilidade socioambiental no agronegócio: práticas sustentáveis em propriedades rurais

Graduação em Ciências Biológicas

2004 - 2008

Universidade Federal de São Carlos
Título: Estudo da afinidade de receptores nucleares de hormônios tireoideanos aos seus elementos responsivos F2, TREpal, DR-4 e DR-1
Orientador: Igor Polikarpov
Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil.

Pós-doutorado

2018 - 2019

Pós-Doutorado. , Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil. , Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. , Grande área: Ciências Biológicas, Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Formação complementar

2020 - 2020

Extensão universitária em Encontro pedagógico dos docentes da Unoeste - Campus Jaú. (Carga horária: 26h). , Universidade do Oeste Paulista, UNOESTE, Brasil.

2020 - 2020

Extensão universitária em Encontro pedagógico dos docentes da Unoeste - Campus Jaú. (Carga horária: 24h). , Universidade do Oeste Paulista, UNOESTE, Brasil.

2014 - 2014

Protein Evolution Analysis: Phylogenetic Trees. (Carga horária: 8h). , Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications, LORIA, França.

2014 - 2014

Métodos para cálculos de energia livre. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2013 - 2013

Modeling electronic energy transfer. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.

2013 - 2013

Biomolecular modeling: spatial and temporal scales. (Carga horária: 10h). , Universidade Federal do ABC, UFABC, Brasil.

2012 - 2012

How to set up a high performance computer cluster. (Carga horária: 3h). , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil.

2012 - 2012

Curso Teórico-Prático: Dinâmica Molecular Básica. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2012 - 2012

Curso Prático: Predição de Estrutura de Proteínas. (Carga horária: 6h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2012 - 2012

Mini-Curso Teórico: Dinâmica Molecular. (Carga horária: 3h). , Laboratório Nacional de Computação Científica, LNCC, Brasil.

2011 - 2011

Extensão universitária em Toxicologia Aplicada. (Carga horária: 30h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2011 - 2011

Análise filogenética e modelos de evolução. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2006 - 2006

Extensão universitária em Manipulação de ácidos nucléicos. (Carga horária: 40h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2006 - 2006

Mecanismos moleculares da interação entre plantas e patógenos. (Carga horária: 3h). , Sociedade Brasileira de Genética, SBG, Brasil.

2006 - 2006

Hibridação cromossômica por fluorescência. (Carga horária: 24h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2005 - 2005

Farmacogenômica e câncer. (Carga horária: 8h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2005 - 2005

Proteínas Recombinantes e suas Aplicações. (Carga horária: 4h). , Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, UNESP, Brasil.

2004 - 2004

Novas pesquisas aplicadas no tratamento do câncer. (Carga horária: 4h). , Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.

2004 - 2004

Filogenia dos seres vivos. (Carga horária: 8h). , Universidade Federal de São Carlos, UFSCAR, Brasil.

Idiomas

Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Francês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Bem, Escreve Pouco.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Bioinformática.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Genética Animal/Especialidade: Biologia Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biofísica / Subárea: Biofísica Molecular.

Grande área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: Evolução.

Organização de eventos

GERALDO, M T . XIII Workshop da Pós-Graduação. 2014. (Outro).

GERALDO, M T . XII Workshop da Pós-Graduação. 2013. (Outro).

GERALDO, M.T. . XI Workshop de Genética. 2011. (Outro).

Participação em eventos

Encontro de Infectologia do Interior Paulista. 2019. (Encontro).

XVI Workshop da Genética.Navegando no mar de dados genômicos: naufrágio à vista?. 2016. (Simpósio).

Workshop on Integration of Cytogenetics and Genomics. 2015. (Simpósio).

European Conference on Computational Biology. The basis of nuclear import by importin-alpha based on molecular dynamics simulations and normal modes analysis. 2014. (Congresso).

VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos.As bases da interação de complexos de importação nuclear mediados por Importina-alfa: proteínas Ku70 e Nucleoplasmina como modelos de estudo. 2014. (Outra).

II Escola Brasileira de Modelagem Molecular - EBMM.Análise preliminar da interação entre resíduos da região NLS da proteína Ku70 e a Importina-alfa. 2013. (Outra).

II Jornada Interna de Capacitação do LBBC.Dinâmica molecular com o GROMACS. 2013. (Seminário).

International Conference of the AB3C and Brazilian Simposium on Bioinformatics - X-meeting BSB. Nuclear localization sequence recognition by Importin alpha: in silico modeling and dynamics evaluation. 2013. (Congresso).

3 Simpósio do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética).Interação do complexo Ku70NLS:Imp com base em docking e simulações de dinâmica molecular. 2012. (Simpósio).

8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting. Evolutionary study of the SOX9 gene based on a global phylogenetic analysis of the HMG-box superfamily. 2012. (Congresso).

International Plant & Animal Genome XX Conference. A Global Domain Phylogenetic Approach for Evolutionary Analysis of the Female Sex Determinant and Development Gene Foxl2 in Vertebrates. 2012. (Congresso).

VI Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos. 2012. (Outra).

57 Congresso Brasileiro de Genética. Characterization and comparative evolutionary analysis of the female sex determinant and development candidate gene Foxl2 in Chondrichthyes. 2011. (Congresso).

XI Workshop de Genética. 2011. (Outra).

1 Simpósio da Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Genética).Determinação e diferenciação sexual em vertebrados basais: análise comparativa de genes candidatos em Agnatha e Chondrichthyes. 2010. (Simpósio).

52 Congresso Brasileiro de Genética. 2006. (Congresso).

VI Workshop de Genética - Unesp. 2006. (Outra).

XIV Congresso de Iniciação Científica - UFSCar. Investigação sobre o manejo dos recursos pesqueiros e as formas de organização, cooperação e competição na atividade pesqueira em comunidades do alto-médio São Francisco, MG. 2006. (Congresso).

III Semana do Meio Ambiente e Sustentabilidade - UFSCar. 2005. (Outra).

Universidade Aberta - UFSCar. 2005. (Outra).

V Workshop de Genética - Unesp. 2005. (Outra).

3ª Semana da Biologia - UFSCar. 2004. (Outra).

Participação em bancas

Aluno: André Kliousoff Junior

LIMA, A. N.; KAMIENSKI, C. A.;GERALDO, M T. Uma nova abordagem para análise funcional e evolutiva de proteínas com região de desordem. 2019. Exame de qualificação (Doutorando em Engenharia da Informação) - Universidade Federal do ABC.

GERALDO, M.T.. Processo de avaliação de trabalhos (modalidade pôster) na I Fase do XXVI Congresso de Iniciação Científica da Unesp. 2014. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

GERALDO, M T. Processo de avaliação de trabalhos no XII Workshop da Pós-Graduação. 2013. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

GERALDO, M.T.. Processo de avaliação de trabalhos (modalidade pôster) no VIII Congresso de Física Aplicada à Medicina - CONFIAM. 2012. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Comissão julgadora das bancas

Guaracy Tadeu Rocha

MARTINS, Cesar;Rocha, Guaracy Tadeu; MAIA, I. G.. Evolução do gene Fox12 envolvido na determinalççao e diferenciação sexual em vertebrados. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas) - Instituto de Biociências UNESP, Botucatu.

Maria Célia Bertolini

BERTOLINI, Maria Célia; MAGRO, A. J.; SCOTT, L. P. B.; ZAMBUZZI, W. F.; LEMKE, N.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e importina-alfa. 2016. Tese (Doutorado em Ciencias Biológicas) - Instituto de Biociencias, UNESP, Rio Claro.

Marcos Roberto de Mattos Fontes

LEMKE, NEY;FONTES, M. R. M.; Simões, Rafael P.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequencias de localização nuclear e importina-alfa. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ana Lígia Barbour Scott

LAMKE, N.;SCOTT, L. P. B.; MAGRO, A. J.; BERTOLINI, M. C.; CARVALHO, R. F.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-alfa. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Angelo José Magro

Lemke, N.; Scott, L. P. B.;MAGRO, A. J.; Zambuzzi, W. F.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-alfa. 2016. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Igor Ignácio

IGNÁCIO, I.GODOY, D. C.. Responsabilidade ambiental no agronegócio: práticas sustentáveis em propriedades rurais. 2011. Monografia (Aperfeiçoamento/Especialização em MBA Gestão Ambiental Desenvolvimento Sustentávell) - Faculdade Uninter.

Ney Lemke

LEMKE, N.; Scott, L. P. B.; MAGRO, ANGELO J.; M. C. Bertolini; Zambuzzi, W. F.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e importina-alpha. 2016. Tese (Doutorado em Ciência Biológica AC.: Genética) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ney Lemke

LEMKE, N.; Fontes, M. R. M.; Simões, R. P.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização e importação nuclear. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência Biológica AC.: Genética) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Willian Fernando Zambuzzi

LEMKE, N.; SCOTT, L. P. B.; MAGRO, A. J.; BERTOLONI, M. C.; CARVALHO, R. F.;Zambuzzi, W.; COUNAGO, R. L. M.; SIMOES, R. P.. Caracterização in silício dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-Alfa. 2016. Tese (Doutorado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Willian Fernando Zambuzzi

LEMKE, N.; FONTES, M. R. M.; SIMOES, R. P.; MAGRO, A. J.;Zambuzzi, W.. Caracterização in silício dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência Biológica AC.: Genética) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ivan de Godoy Maia

Martins, C;MAIA, I. G.; ROCHA, G. T.. Evolução do gene FoxI2 envolvido na determinação e diferenciação sexual em vertebrados. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Ana Carolina Migliorini Figueira

FIGUEIRA, A. C. M.SANTOS, M. A. M.; Moraes, G. Estudo da afinidade dos receptores nucleares de hormônios tireoidianos aos seus elementos responsivos F2, TREpal, DR-4 e DR-1. 2007. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de São Carlos.

Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de Brito

Martins, C.;de Brito, Reinaldo A; Ribolla, P.E.M.. Evolução e organização genômica do gene FOXL2 em vertebrados. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Cesar Martins

MARTINS, C.. Evolução e organização genômica do gene FOXL2 em vertebrados. 2012. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Cesar Martins

MARTINS, C.. Exame de qualificação de mestrado. 2012. Exame de qualificação (Mestrando em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Rafael Plana Simões

LEMKE, N.; FONTES, M. R. M.;SIMÕES, R. P.. Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-a. 2016. Exame de qualificação (Doutorando em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho.

Orientou

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Caracterização in silico da interação da NS5 do DENV com proteínas humanas STAT2, TYK2, KPNB1 e XPO1; Início: 2018; Dissertação (Mestrado em Biossistemas) - Universidade Federal do ABC; (Coorientador);

Thábatta Karollynne Estevam Nakamura

Efeitos de deleções pontuais em resíduos da região linker das sequências de localização nuclear clássicas nas interações com a Importina-; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Biomedicina) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Marcos Tadeu Geraldo;

Foi orientado por

ADRIANE PINTO WASKO

Monitoria junto a curso de Extensão "Experimentando Genética"; 2011; Orientação de outra natureza; (PPG Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Adriane Pinto Wasko;

Danillo Pinhal

Determinação e diferenciação sexual em vertebrados basais: análise comparativa de genes candidatos em Agnatha e Chondrichthyes; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciencias Biologicas (Genetica)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Danillo Pinhal;

Luís Antonio Kioshi Aoki Inoue

Gasto energetico do matrinxa submetido ao manuseio e o anestesico eugenol; 2006; 18 f; Iniciação Científica; (Graduando em Biologia) - Universidade Federal de São Carlos; Orientador: Luís Antonio Kioshi Aoki Inoue;

Ivan de Godoy Maia

Estagio docência em curso de graduação do IBB - UNESP; 2014; Orientação de outra natureza; (Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho; Orientador: Ivan de Godoy Maia;

Agnes Alessandra Sekijima Takeda

Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-; 2016; Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Genética)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Agnes Alessandra Sekijima Takeda;

Ana Carolina Migliorini Figueira

Estudo da afinidade dos receptores nucleares de hormônios tireoidianos aos seus elementos responsivos F2, TREpal, DR-4 e DR-1; 2008; Iniciação Científica - Instituto de Física de São Carlos - USP, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Ana Carolina Migliorini Figueira;

Márcia Cristiane Kravetz Andrade

Responsabilidade Socioambiental no Agronegócio: Práticas Sustentáveis em Propriedades Rurais; 2011; Orientação de outra natureza; (MBA Gestão Ambiental e Desenvolvimento Sustentável) - Centro Universitário Internacional; Orientador: Márcia Cristiane Kravetz Andrade;

Igor Polikarpov

Estudo da afinidade dos receptores nucleares de hormônios tireoideanos aos seus elementos responsivos DR-1, DR-4 e TER PAL; 2008; Iniciação Científica; (Graduando em Física Biomolecular) - Instituto de Física de São Carlos, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Igor Polikarpov;

Cesar Martins

Evolução e organização genômica do gene FoxL2 em vertebrados; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas (Genética)) - Instituto de Biociências, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Cesar Martins;

Guilherme Targino Valente

Evolução e organização genômica do gene FOXL2 em vertebrados; 2012; Dissertação (Mestrado em Ciência Biológica AC; : Genética) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Coorientador: Guilherme Targino Valente;

Produções bibliográficas

GERALDO, M.T. ; TAKEDA, A. A. S. ; BRAZ, A. S. K. ; LEMKE, N. . Bending-Twisting Motions and Main Interactions in Nucleoplasmin Nuclear Import. Plos One , v. 11, p. e0157162, 2016.
GERALDO, M T ; VALENTE, G.T. ; NAKAJIMA, R. T. ; MARTINS, C . Dimerization and Transactivation Domains as Candidates for Functional Modulation and Diversity of Sox9. Plos One , v. 11, p. e0156199, 2016.
GERALDO, M T ; VALENTE, G T ; BRAZ, A SK ; MARTINS, C . The discovery of Foxl2 paralogs in chondrichthyan, coelacanth and tetrapod genomes reveals an ancient duplication in vertebrates. Heredity , v. 111, p. 57-65, 2013.
GERALDO, M.T. ; TAKEDA, A. A. S. ; BRAZ, A. S. K. ; LEMKE, N. . As bases da interação de complexos de importação nuclear mediados por Importina-alfa: proteínas Ku70 e Nucleoplasmina como modelos de estudo. In: VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2014, Petrópolis. VII Escola de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, 2014.
GERALDO, M.T. ; TAKEDA, A. A. S. ; BRAZ, A. S. K. ; LEMKE, N. . The basis of nuclear import by importin-alpha based on molecular dynamics simulations and normal modes analysis. In: European Conference on Computational Biology, 2014, Strasbourg. European Conference on Computational Biology, 2014.
GERALDO, M T ; TAKEDA, A. A. S. ; LEMKE, N. . Análise preliminar da interação entre resíduos da região NLS da proteína Ku70 e a Importina-alfa. In: II Escola Brasileira de Modelagem Molecular - EBMM, 2013, Santo André. II Escola Brasileira de Modelagem Molecular - EBMM, 2013.
TAKEDA, A. A. S. ; GERALDO, M.T. ; MADEIRA, A. G. ; BRAZ, A. S. K. . Evolutionary history of Importin alpha in Eukaryotes: early events of genetic gain and loss followed by independent gene duplication. In: 2013 Berlin ISMB & ECCB, 2013, Berlin. 2013 Berlin ISMB & ECCB. Berlin, 2013.
GERALDO, M.T. ; TAKEDA, A. A. S. ; BRAZ, A. S. K. ; LEMKE, N. . In silico studies of the interaction between the nuclear localization sequence from Ku70 and the Importin-. In: 2013 Berlin ISMB & ECCB, 2013, Berlin. 2013 Berlin ISMB & ECCB. Berlin, 2013.
GERALDO, M.T. ; TAKEDA, A. A. S. ; BRAZ, A. S. K. ; LEMKE, N. . Nuclear localization sequence recognition by Importin alpha: in silico modeling and dynamics evaluation. In: International Conference of the AB3C and Brazilian Simposium on Bioinformatics - X-meeting BSB, 2013, Recife. X-meeting/BSB 2013. Recife, 2013.
GERALDO, M.T. ; VALENTE, G.T. ; BRAZ, A. S. K. ; MARTINS, C. . A Global Domain Phylogenetic Approach for Evolutionary Analysis of the Female Sex Determinant and Development Gene Foxl2 in Vertebrates. In: International Plant & Animal Genome XX Conference, 2012, San Diego. International Plant & Animal Genome XX Conference - Abstracts 2012, 2012.
NAKAJIMA, R. T. ; GERALDO, M.T. ; VALENTE, G.T. ; MARTINS, C. ; CABRAL-DE-MELLO, D. C. . Integrating chromossome mapping and gemonic analysis to understanding organization and evolution of histone genes focus in Oreochromis niloticus. In: 58° Congresso Brasileiro de Genética, 2012, Foz do Iguaçu. Anais do 58° Congresso Brasileiro de Genética, 2012.
GERALDO, M T ; VALENTE, G T ; MARTINS, C . Evolutionary study of the SOX9 gene based on a global phylogenetic analysis of the HMG-box superfamily. In: 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2012, Campinas. 8th International Conference of the Brazilian Association for Bioinformatics and Computational Biology - X-Meeting, 2012.
GERALDO, M.T. ; VALENTE, G.T. ; PINHAL, D. ; MARTINS, C. . Characterization and comparative evolutionary analysis of the female sex determinant and development candidate gene Foxl2 in Chondrichthyes. In: 57° Congresso Brasileiro de Genética, 2011, Águas de Lindóia. 57° Congresso Brasileiro de Genética, 2011.
BARBOSA, L.M.G. ; MORAES, G. ; SILVA, A.B. ; GERALDO, M.T. ; INOUE, L.A.K. . Respostas metabólicas do matrinxã (Brycon cephalus) submetido a manuseio e anestesia. In: XIII Congresso de Iniciação Científica - UFSCar, 2005, São Carlos. XIII Congresso de Iniciação Científica - UFSCar, 2005.
GERALDO, M.T. . Princípios das análises filogenéticas e genômica comparativa. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M.T. . Modelagem de biomoléculas: proteínas. 2015. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M T . Análises globais de genes e genômica comparativa. 2014. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M.T. . Análises globais de genes e genômica comparativa. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M T . Predição de estruturas de proteínas e suas aplicações. 2013. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M.T. . Interação do complexo Ku70NLS:Imp com base em docking e simulações de dinâmica molecular. 2012. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
GERALDO, M T . Análises Globais de Genes. 2012. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M.T. ; VALENTE, G.T. . Análises computacionais no estudo evolutivo de genes de determinação sexual em vertebrados. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M T . Explorando bancos de dados genômicos e introdução à Bioinformática. 2011. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M.T. . Determinação e diferenciação sexual em vertebrados basais: análise comparativa de genes candidatos em Agnatha e Chondrichthyes. 2010. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).
GERALDO, M.T. . Determinação e diferenciação sexual em vertebrados basais: análise comparativa de genes candidatos em Agnatha e Chondrichthyes. 2010. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).
GERALDO, M.T. ; NORDI, N. ; THE, A. P. G. . Investigação sobre o manejo dos recursos pesqueiros e as formas de organização, cooperação e competição na atividade pesqueira em comunidades do alto-médio São Francisco, MG. 2006. (Apresentação de Trabalho/Congresso).

Outras produções

GERALDO, M T . Avaliação de resumos (parecerista) no XIV Workshop da Pós-Graduação. 2015.

GERALDO, M T . Avaliação de resumos (parecerista) no XIII Workshop da Pós-Graduação. 2014.

GERALDO, M.T. . Avaliação de resumos (parecerista) no XII Workshop da Pós-Graduação. 2013.

GERALDO, M T . A aplicação da Bioinformática no estudo evolutivo e estrutural de proteínas. 2017. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

GERALDO, M T ; NAKAJIMA, R. T. ; COAN, R. B. . Navegando no mar de dados genômicos: naufrágio à vista?. 2016. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

GERALDO, M T . Ferramentas para análises de sequências. 2014. (Curso de curta duração ministrado/Extensão).

GERALDO, M.T. . Análises de sequências: uso de ferramentas básicas em Bioinformática. 2011. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

Projetos de pesquisa

2014 - Atual

Estudo da flexibilidade das proteínas NS3 e NS5 do dengue vírus (DENV) através de análise de modos normais e dinâmica molecular, Descrição: Estima-se que aproximadamente 300 milhões de pessoas anualmente sejam acometidas pela dengue no mundo. No Brasil, ela é uma das doenças que causa mais impacto na Saúde Pública. Entretanto, a despeito dos numerosos esforços e métodos empregados por diversos grupos de pesquisa, atualmente nem antivirais nem vacina aprovados estão disponíveis para o tratamento ou prevenção da dengue. Nesse sentido, há um crescente interesse internacional na caracterização de alvos de drogas contra a dengue. O genoma do DENV codifica uma poliproteína que é processada por uma protease dando origem a 3 proteínas estruturais (S) 7 não estruturais (NS). Duas delas, NS3 e NS5, são particularmente interessantes por participarem do complexo de replicação viral e serem determinantes de patogenicidade ao interagirem com dezenas de proteínas do hospedeiro. Dentre as proteínas alvo do hospedeiro destacam-se proteínas envolvidas na sinalização por interferon (STAT2 e TYK2) e proteínas envolvidas no trafico nuclear (KPNB1 e XPO1).O presente projeto deve fornecer informações sobre movimentos das proteínas virais NS3 e NS5 e as suas proteínas humanas alvo (STAT2, TYK 2, KPNB1 e XPO1). Procuramos por movimentos cujas principais características físicas são uma grande amplitude e uma baixa frequência. Esse tipo de movimento, normalmente está associado a mecanismos de regulação alostérica. Além disso, essas informações serão muito úteis em futuros trabalhos de Docking proteína x proteína e virtual screening para o desenvolvimento de novos inibidores alostéricos contra NS3 e NS5 para os diversos sorotipos do DENV.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcos Tadeu Geraldo - Integrante / Antonio Sergio Kimus Braz - Coordenador.
2012 - Atual

Caracterização in silico dos mecanismos de interação entre sequências de localização nuclear e Importina-, Descrição: Os sistemas de importação nuclear são responsáveis pelo intercâmbio entre citoplasma- núcleo, permitindo que proteínas com função nuclear migrem através da membrana que separa as duas regiões da célula. A via de importação mais estudada é a via clássica de importação nuclear mediada pela Importina- (Imp). A Imp é uma proteína solenóide, composta por repetições em tandem do motivo Armadillo (ARM) que formam uma es- trutura longa e contorcida, com pequenos arcabouços ao longo do eixo da proteína. As sequências de localização nuclear clássicas (cNLS - nuclear localization sequence) presentes nas proteínas alvo de importação são compostas por resíduos carregados positivamente e estabelecem pontes salinas, ligações de hidrogênio e contatos hidrofóbicos com esses arcabouços da Imp. Esse reconhecimento pode ocorrer em um ou em dois sítios da Imp, caracterizando a NLS como monopartida ou bipartida, respectivamente. A maioria dos dados estruturais do complexo NLS-Imp provém de dados de cristalografia de raio-x e pouco se sabe sobre a dinâmica conformacional deste sistema. Uma abordagem para tratar da dinâmica de um sistema é o uso de técnicas computacionais envolvendo a simulação de biomoléculas, tais como Dinâmica Molecular (MD) e Análise de Modos Normais (NMA). Com base nessas técnicas de simulação, o presente projeto tem como objetivo compreender os mecanismos de interação e dinâmica conformacional envolvidos no reconhecimento de cNLSs pela Imp.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcos Tadeu Geraldo - Integrante / Agnes Alessandra Sekijima Takeda - Integrante / Ney Lemke - Coordenador., Número de produções C, T & A: 1
2010 - 2012

Evolução e organização genômica do gene FOXL2 em vertebrados, Descrição: FOXL2 representa um importante gene membro da família do domínio forkhead, responsável principalmente pelo desenvolvimento de ovários durante a determinação e diferenciação sexual de fêmeas. Os estudos evolutivos realizados anteriormente foram limitados considerando o número de cópias gênicas e unidades taxonômicas analisadas. Para analisar um grande número de sequências de FOXL2 e contribuir para um cenário mais claro da história evolutiva do gene, será realizada uma ampla análise evolutiva do domínio forkhead e do gene FOXL2. Portanto, o objetivo do presente projeto é utilizar organismos basais como modelos de estudo para a identificação e caracterização completa do gene FOXL2, candidato à determinação e diferenciação sexual em tetrápodas e teleósteos. Esse estudo poderá fornecer informações importantes acerca da evolução desse gene, bem como dos mecanismos genéticos envolvidos nos processos de desenvolvimento dos caracteres sexuais em vertebrados.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . , Integrantes: Marcos Tadeu Geraldo - Integrante / Cesar Martins - Coordenador / Guilherme Targino Valente - Integrante / Antonio Sergio Kimus Braz - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro., Número de produções C, T & A: 4
2006 - 2008

Estudo da afinidade dos receptores nucleares de hormônios tireoidianos aos seus elementos responsivos F2, TREpal, DR-4 e DR-1, Descrição: O objetivo deste estudo é verificar a afinidade de ligação de três construções de receptores ao hormônio da tireóide, buscando avaliar a importância de cada domínio modular do receptor na formação do complexo proteína-DNA.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcos Tadeu Geraldo - Integrante / Igor Polikarpov - Coordenador / Ana Carolina Migliorini Figueira - Integrante., Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
2005 - 2006

Investigação sobre as formas de organização, cooperação e competição na atividade pesqueira em comunidades do Alto-Médio São Francisco, Descrição: Este sub-projeto está contido em um projeto denominado "Peixes e Pedras no Desenvolvimento da Gestão Participativa da Pesca no Alto-Médio São Francisco, Minas Gerais" que tem como objetivo avaliar o processo de desenvolvimento da gestão participativa da pesca, concebida pelo projeto de pesquisa e extensão ?Rumo à Co-Gestão da Pesca no Vale do São Francisco?, de responsabilidade da UFSCar, em parceria com o Instituto Amazônico de Manejo dos Recursos Ambientais e com financiamento do órgão canadense International Development Research Centre ? IDRC. Os objetivos do estudo são: investigar a organização social da pesca e sua relação com as práticas locais de manejo e com o conhecimento ecológico local; investigar as relações de cooperação e competição na atividade da pesca artesanal e na organização comunitária dos pescadores artesanais (colônias e associações de pescadores), destacando as condições geradoras de tais relações; investigar a importância das relações de parentesco na organização da pesca artesanal, e analisar a compreensão dos pescadores sobre o papel do projeto de pesquisa e extensão UFSCar/IARA no fortalecimento na organização dos pescadores artesanais.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Integrantes: Marcos Tadeu Geraldo - Integrante / Nivaldo Nordi - Coordenador / Ana P. G. Thé - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa., Número de produções C, T & A: 2

Prêmios

2021

Honra ao Mérito - Destaque na Avaliação Institucional Docente (CPA) obtendo conceito Excelente (2020/2), Faculdade Gran Tietê.

2020

Honra ao Mérito - Destaque na Avaliação Institucional Docente (CPA) obtendo conceito Excelente (2020/1), Faculdade Gran Tietê.

2019

Honra ao Mérito - Destaque na Avaliação Institucional Docente (CPA) obtendo conceito Excelente (2019/1)), Faculdade Gran Tietê.

2012

Menção honrosa - Prêmio Iniciação Científica - Oral, 58 Congresso Brasileiro de Genética.

Histórico profissional

Endereço profissional

Universidade do Oeste Paulista, Universidade do Oeste Paulista - UNOESTE. , Praça Doutor Adolfo Bezerra de Menezes, Jardim Estádio, 17203481 - Jaú, SP - Brasil, Telefone: (14) 36241109

Experiência profissional

2020 - Atual

Universidade do Oeste Paulista

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 24

Outras informações:
Professor da disciplina: Bases Biológicas II - Genética, Curso de Medicina.

Atividades

08/2020
Extensão universitária , Universidade do Oeste Paulista - UNOESTE.,Atividade de extensão realizada, Docente orientador da Liga Acadêmica de Biologia Molecular e Biotecnologia para o curso de Medicina, com carga horária de 2h mensais..
02/2020
Ensino, Medicina, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bases Biológicas II - Genética

2019 - Atual

Faculdade Gran Tietê

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 4

Atividades

02/2020
Ensino, Nutrição, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Bioquímica, carga horária: 72h/a
08/2019
Ensino, Engenharia Agronômica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Anatomia e Fisiologia Animal, carga horária: 36h/a, Biologia celular, carga horária: 36h/a, Bioquímica e Biotecnologia, carga horária: 36h/a., Genética Aplicada, carga horária: 72h/a., Melhoramento vegetal, carga horária: 72h/a
02/2019
Ensino, Enfermagem, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biofísica, carga horária: 36h/a

2012 - 2016

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Doutorando, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2010 - 2012

Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

Vínculo: Mestrando, Enquadramento Funcional: Bolsista, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Atividades

11/2015 - 11/2015
Ensino, Abi - Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Aula como convidado na disciplina de Bioinformática intitulada (Análise filogenética), perfazendo 4 horas, sob a supervisão do Prof. Dr. Ney Lemke
09/2015 - 09/2015
Ensino, Abi - Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Aula como convidado na disciplina de Genômica, intitulada Predição de Estrutura de Proteínas e suas aplicações, perfazendo um total de 4 horas, sob supervisão do Prof. Dr. Cesar Martins
03/2014 - 07/2014
Ensino, Abi - Ciências Biológicas, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Biologia Molecular (PCR, RT-PCR e suas aplicações)
03/2014 - 07/2014
Estágios , Instituto de Biociências de Botucatu.,Estágio realizado, Estágio docência na disciplina de Biologia Molecular: Genética Molecular, sob a supervisão do Prof. Dr. Ivan de Godoy Maia.
11/2011 - 11/2011
Extensão universitária , Colégio La Salle.,Atividade de extensão realizada, Atuação como monitor do evento de extensão da mostra cultural na escola de ensino básico La Salle, coordenado por professores desse colégio e da UNESP.
01/2011 - 01/2011
Extensão universitária , Instituto de Biociências, Departamento de Genética.,Atividade de extensão realizada, Participou como monitor do curso Experimentando Genética (carga horária: 48 horas), como parte das atividades do Programa de Extensão Universitária "Difundindo e Popularizando a Ciência na UNESP: Interação entre Pós-Graduação e Ensino Básico".

2013 - 2013

Universidade Federal do ABC

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 40

2011 - 2011

Universidade Federal do ABC

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estagiário, Carga horária: 48

Atividades

04/2013 - 04/2013
Estágios , Centro de Ciências Naturais e Humanas.,Estágio realizado, Aprendizado de análise de modos normais no programa Charmm e análise de dados estruturais no programa MatLab.
10/2011 - 10/2011
Estágios , Centro de Ciências Naturais e Humanas.,Estágio realizado, Treinamento no uso de metodologias de data mining, reconstrução de árvores por BI e ML aplicados à evolução molecular e uso desses programas em GPU.

2015 - 2015

École Normale Supérieure de Cachan, ENS/Cachan

Vínculo: Estagiário, Enquadramento Funcional: Estágio de Doutorado Sanduíche, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

Outras informações:
Realizou estágio de Doutorado Sanduíche com bolsa BEPE da Fapesp por um período de 5 meses no "Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée" sob supervisão do Prof Dr David Perahia. O estágio envolveu o aprendizado e aplicação do método de "Molecular dynamics with excited normal modes (MDeNM)" para estudos de reconhecimento de sequências de importação nuclear pela Importina-alfa.

2005 - 2006

Universidade Federal de São Carlos

Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário de iniciação científica, Carga horária: 16

Atividades

05/2005 - 03/2006
Estágios , Centro de Ciências Biológicas e da Saúde da UFSCAR, Departamento de Hidrobiologia.,Estágio realizado, Ecologia Humana.

2017 - 2017

Centro Universitário Sagrado Coração

Vínculo: Professor convidado, Enquadramento Funcional: Convite à disciplina, Carga horária: 2

Outras informações:
Aula como professor convidado sobre o tema "Média, variância, distribuição normal e histograma" na disciplina de Genética para o curso de Engenharia Agronômica (noturno) com carga horária de 2 horas, à convite do Prof. Dr. Marcos Siqueira.

2006 - 2008

Universidade de São Paulo

Vínculo: Estagiário - Bolsista, Enquadramento Funcional: Estagiário de iniciação científica, Carga horária: 16

Atividades

10/2006 - 07/2008
Estágios , Instituto de Física de São Carlos.,Estágio realizado, Bioquímica de Proteínas - Grupo de Cristalografia.

2021 - Atual

FACULDADE GALILEU

Vínculo: Celetista, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 8

Atividades

03/2021
Ensino, Engenharia Agronômica, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Genética, carga horária: 72h/a, Biologia celular, carga horária: 36h/a, Anatomia e Fisiologia Animal, carga horária: 36/a