César Henrique Bernabé

Mestre em Informática pela Universidade Federal do Espírito Santo, doutorando em Bioinformática pela Leiden University Medical Center.

Informações coletadas do Lattes em 13/11/2025

Acadêmico

Formação acadêmica

Doutorado em Bioinformatics

2020 - 2025

Leiden University Medical Center
Título: Advancing FAIR practices in biomedical research: challenges, methods and innovations for sustainable data management
Orientador: Marco Roos
Coorientador: Annika Jacobsen, Luiz Olavo Bonino da Silva Santos. Palavras-chave: Princípios FAIR; Ontologias; Dados de Saúde; Gestão de Dados.Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Mestrado em Informática

2018 - 2020

Universidade Federal do Espírito Santo
Título: GORO: uma ontologia sobre requisitos orientados aobjetivos., Ano de Obtenção: 2020
Vitor Estevão Silva Souza.Coorientador: Carla Taciana Lima Lourenco Silva Schuenemann. Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil. Palavras-chave: Ontologia; Engenharia de Requisitos Orientada a Objetivos.Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Graduação em Ciência da Computação

2012 - 2017

Universidade Federal do Espírito Santo
Título: Evolução da Arquitetura do Zanshin ? um framework para análise de requisitos em tempo de execução
Orientador: Vitor Estevão Silva Souza
com Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES, Brasil.

Curso técnico/profissionalizante em Construção de Edifícios

2007 - 2011

Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espírito Santo

Ensino Médio (2º grau)

2007 - 2011

Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espírito Santo

Idiomas

Inglês

Compreende Razoavelmente, Fala Razoavelmente, Lê Razoavelmente, Escreve Razoavelmente.

Português

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Engenharia de Software.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Bioinformática.

Participação em bancas

Aluno: Vinícius Berger

SOUZA, V. E. S.; BARCELLOS, MONALESSA P.;BERNABÉ, C. H.. Aplicação do método FrameWeb no desenvolvimento de um sistema de informação utilizando os frameworks Yii e Symfony. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Espírito Santo.

Aluno: Iagoh Ribeiro Lima

SOUZA, V. E. S.;BERNABÉ, C. H.; ALMEIDA, J. P.; LOUZADA, S.. Criação de uma DSL e Integração das Ferramentas Unagi e Zanshin para apoiar o desenvolvimento de Sistemas Adaptativos baseados em Requisitos. 2021. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Espírito Santo.

Aluno: Luiz Couto Meirelles

SOUZA, V. E. S.; CURY, D.;BERNABÉ, C. H.. Aplicação do método FrameWeb no desenvolvimento de um sistema de informação utilizando os frameworks Codeigniter e NodeJS. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Espírito Santo.

Aluno: Rodrigo Bittencourt Pimenta

SOUZA, V. E. S.; CURY, D.;BERNABÉ, C. H.. SIGME - Sistema de Informação Gerencial do Movimento Espírita. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Espírito Santo.

Aluno: Rômulo de Angelis Vitoi

SOUZA, V. E. S.; FALBO, R. A.;BERNABÉ, C. H.. SisPreço: Sistema de Preços do Incaper. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Espírito Santo.

Aluno: Renan Vitor Henker Regis

SOUZA, V. E. S.; CATABRIGA, L.;BERNABÉ, C. H.. Desenvolvimento do Núcleo do Sistema de Informação Gerencial do Movimento Espírita. 2018. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal do Espírito Santo.

Orientou

Roza Zwart

Foundational Ontologies to Improve the Explain- ability of Explainable AI Algorithms; 2024; Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Leiden University, ; Coorientador: César Henrique Bernabé;

Produções bibliográficas

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BERNABÉ, CÉSAR H. ; THIELEMANS, LIEZE ; KALIYAPERUMAL, RAJARAM ; CARTA, CLAUDIO ; ZHANG, SHUXIN ; VAN GELDER, CELIA W.G. ; BENIS, NIRUPAMA ; DA SILVA SANTOS, LUIZ OLAVO BONINO ; CORNET, RONALD ; DOS SANTOS VIEIRA, BRUNA ; LALOUT, NAWEL ; HENRIQUES, INES ; BALLESTEROS, ALBERTO CÁMARA ; BURGER, KEES ; KERSLOOT, MARTIJN G. ; EHRHART, FRIEDERIKE ; VAN ENCKEVORT, ESTHER ; EVELO, CHRIS T. ; GRAY, ALASDAIR J. G. ; HANAUER, MARC ; et.al . Building Expertise on FAIR Through Evolving Bring Your Own Data (BYOD) Workshops: Describing the Data, Software, and Management-focused Approaches and Their Evolution. Data Intelligence , v. 6, p. 429-456, 2024.
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