Ulisses Martins Dias

Possui Bacharelado em Ciência da Computação pela Universidade Federal do Pará (2000-2005), Mestrado em Modelagem Computacional de Conhecimento pela Universidade Federal de Alagoas (2005-2007), Doutorado em Ciência da Computação pela Universidade Estadual de Campinas (2007-2012) e Pós-Doutorado em Ciência da Computação pela Universidade Estadual de Campinas (2012-2015). Atualmente é professor da Faculdade de Tecnologia (FT) da Universidade Estadual de Campinas. Tem experiência na área de Ciência da Computação, com ênfase em Biologia Computacional e Bioinformática.

Informações coletadas do Lattes em 24/06/2020

Acadêmico

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Formação acadêmica

Doutorado em Ciência da Computação

2007 - 2012

Universidade Estadual de Campinas
Título: Problemas de Comparação de Genomas
Orientador: em Virginia Bioinformatics Institute ( João Carlos Setubal)
com Zanoni Dias. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. Palavras-chave: Reversões Simétricas; Rearranjo de Genomas; Distância de Transposição; Montagem de Scaffolds; Distância entre Genomas.Grande área: Ciências Exatas e da TerraGrande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação.

Mestrado em Modelagem Computacional de Conhecimento

2005 - 2007

Universidade Federal de Alagoas
Título: Predição da Função de Proteínas sem Alinhamentos usando Máquinas de Vetor de Suporte,Ano de Obtenção: 2007
Roberta Vilhena Vieira Lopes.Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas, FAPEAL, Brasil.

Graduação em Curso Bacharelado em Ciência da Computação

2000 - 2005

Universidade Federal do Pará
Título: Linguagem Proteômica: Uma Introdução às Gramáticas Livres de Contexto para Descrição de Dados Biológicos
Orientador: Roberta Vilhena Vieira Lopes

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Pós-doutorado

2012 - 2015

Pós-Doutorado. , Universidade Estadual de Campinas, UNICAMP, Brasil. , Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo, FAPESP, Brasil. , Grande área: Ciências Exatas e da Terra, Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Análise de Algoritmos e Complexidade de Computação. , Grande Área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação / Especialidade: Bioinformática.

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Idiomas

Bandeira representando o idioma Inglês

Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

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Áreas de atuação

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Teoria da Computação/Especialidade: Bioinformática.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Sistemas de Computação/Especialidade: Inteligência Artificial.

Grande área: Ciências Exatas e da Terra / Área: Ciência da Computação / Subárea: Metodologia e Técnicas da Computação/Especialidade: Banco de Dados.

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Participação em eventos

1st International Conference on Algorithms for Computational Biology (A. Heuristics for the Sorting by Length-Weighted Inversions Problem on Signed Permutations. 2014. (Congresso).

5th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics. An Improved Algorithm for the Sorting by Reversals and Transpositions Problem. 2014. (Congresso).

4th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedical Informatics. Greedy Randomized Search Procedure to Sort Genomes using Symmetric, Almost-Symmetric and Unitary Inversions. 2013. (Congresso).

4th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedical Informatics. Heuristics for the Sorting by Length-Weighted Inversion Problem. 2013. (Congresso).

5th International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Sorting Genomes Using Symmetric, Almost-Symmetric and Unitary Inversions. 2013. (Congresso).

Symposium on Applied Computing. Sorting genomes using almost-symmetric inversions. 2012. (Congresso).

Workshop in Bioinformatics and Algorithms.Sorting by almost-symmetrical reversals. 2012. (Encontro).

ACM International Conference on Bioinformatics and Computational Biology. Using inversion signatures to generate draft genome sequence scaffolds. 2011. (Congresso).

Brazilian Symposium on Bioinformatics. Two new whole-genome distance measures. 2011. (Congresso).

ACM International Conference on Bioinformatics and Computational Biology.An Improved 1.375-Approximation Algorithm for the Transposition Distance Problem. 2010. (Simpósio).

International Symposium on Biocomputing.Extending Bafna-Pevzner algorithm. 2010. (Simpósio).

RECOMB Satellite Workshop on Comparative Genomics.A Simulation Tool for the Study of Symmetric Inversions in Bacterial Genomes. 2010. (Simpósio).

Brazilian Symposium on Bioinformatics.Constraint Programming Models for Transposition Distance Problem. 2009. (Simpósio).

X-Meeting 2009. Extending Bafna-Pevzner Algorithm. 2009. (Congresso).

ISMB / X-MEETING 2006. Improving the Multiple Protein Alignment Using Genetic Algorithm Based on Abstract Data Types. 2006. (Congresso).

SEPAI 2006. Um Arcabouço para construção de Sistemas Baseados em Agentes Inteligentes. 2006. (Congresso).

I EPOMAC. 2005. (Encontro).

PROGRAMA DE VERÃO DO LNCC. 2005. (Outra).

XVI CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA CLÍNICA. 2004. (Congresso).

XXIII Congresso da SBC (JAI 1). 2003. (Congresso).

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Participação em bancas

Aluno: Rafael Henrique Pinto e Silva

HIDALGO, I. G.;Dias, Ulisses; WALTER, A. C. S.. Modelo de Programacao Linear para Alocacao dos Subprodutos da Soja. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Flavio Rubens Massaro Júnior

PEDRO, P. S. M.; LIMA, G. M. A.; FINAMORE, W. A.;Dias, Ulisses; BRUSCHI, S. M.. Proposta de um Modelo Flexivel e Proativo para Mudancas de Modo em Sistemas de Tempo Real com Criticalidade Mista. 2019. Tese (Doutorado em TECNOLOGIA) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: DAVI CARNAÚBA DE LIMA VIEIRA

TEDESCO, P. C. A. R.;Dias, Ulisses; RIBEIRO, C. H. C.; SANTANA JUNIOR, O. V.; BRAGA, A. P. S.. Modelo de Rede Neural Crescente de Aprendizagem por Reforço. 2016. Tese (Doutorado em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: João Paulo Pereira Zanetti

MEIDANIS, J.; WALTER, M. E. M. T.; MIRA, C. V. G.;Dias, Ulisses; Dias, Z. Methods for Phylogenetic Reconstruction. 2016. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciência da Computação - UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: DAVI CARNAÚBA DE LIMA VIEIRA

TEDESCO, P. C. A. R.;Dias, Ulisses; RIBEIRO, C. H. C.. Modelo de Rede Neural Crescente de Aprendizagem por Reforço. 2015. Exame de qualificação (Doutorando em Ciências da Computação) - Universidade Federal de Pernambuco.

Aluno: Rafael Jurado Neto

MEIRA, L. A. A.; COELHO, G. P.;Dias, Ulisses. Estudo Comparativo entre SPSA e CMA-ES para Otimizacao de Estratégia de Perfuracao em Campo de Petroleo. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Jonas Bodê

Dias, Ulisses; SILVA, C. G.; CARVALHO, M. A. G.. Gamificacao e Realidade Aumentada em Exposicoes Cientificas e Museus. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Rafael Henrique Pinto e Silva

HIDALGO, I. G.;Dias, Ulisses; HERNANDEZ, M. F. G.. Alocacao dos Subprodutos da Soja para Maximizacao do Lucro da Empresa Considerando Geracao de Energia. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Bruno Silvério de Freitas

Dias, Ulisses; COELHO, G. P.; PORTUGHEIS, J.. Otimizacao de Sistemas OAM de Feixes Laguerre- Gauss utilizando tecnicas de Aprendizado de Maquina. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: NATHALY MORENO AYALA

COELHO, G. P.; SCHIOZER, D. J.;Dias, Ulisses. Otimizacao Da Posicao de Pocos em Campos de Petroleo Em aguas Profundas com Baixo Numero de Simulacoes. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Leonardo Grando

PEDRO, P. S. M.;Dias, Ulisses; SILVA, C. G.. Utilizacao de Tecnicas de Predicao no Modelo El Farol Bar. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Eduardo Manarin Daguano

Dias, Ulisses; PEDRO, P. S. M.; CARVALHO, M. A. G.. Segmentacao de Imagens utilizando Tamanho e Forma dos Objetos por meio da Arvore dos Lagos Criticos. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Rafael Mazzoli Camargo

Dias, Ulisses; MEIRA, L. A. A.; VILELA, P.. Desenvolvimento de sistema para buffet. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Murilo Jubertoni Tin

ZAMBON, A. C.; BAIOCO, G. B.;Dias, Ulisses. Gerenciamento e Otimizacao das disciplinas por meio de Aplicativo Android. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Leonardo Viveiros Santos

ANGELIS, A. F.;Dias, Ulisses; PEDRO, P. S. M.. Impactos da Arquitetura Serverless nos Custos de Computacao em Nuvem. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Leonardo Kegel Porto Testa

VILELA, P.; MEIRA, L. A. A.;Dias, Ulisses. Desenvolvimento de umm Sistema de Apoio à Metodologia de Sala de Aula Invertida em Formato EAD. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: João Victor Ignacio

BERTINI JUNIOR, J. R.; COELHO, G. P.;Dias, Ulisses. Analise de Tecnicas de Reducao de Ruidos em Conjuntos de Dados para Tarefa de Classificacao utilizando Arvores de Decisao. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Caroline Vicente da Silva

Dias, Ulisses; COELHO, G. P.; MEIRA, L. A. A.. Agrupamento de Politicos por meio de Text Mining. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Allan Thales Amaral de Pontes

Dias, Ulisses; SILVA, C. G.; MEIRA, L. A. A.. Allergometrics - Aplicativo para Escore Clinico em Alergia e Imunologia Pediatrica. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Victor Hugo Gomes de Oliveira

VILELA, P.; CAMOLESI JUNIOR, L.;Dias, Ulisses. Estudo da Evolucao da Testabilidade de um Aplicativo Movel. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Otavio Passarelli Praça

SILVA, C. G.; CAMOLESI JUNIOR, L.;Dias, Ulisses. Avaliacao de Usabilidade e de Aspectos de Visualizacao de Informacao no Software CourseViewer. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Luís Ricardo Ferraz

COELHO, G. P.; SILVA, A. E. A.;Dias, Ulisses. Agrupamento Automatico de Livros por Meio de Processamento de Linguagem Natural e Aprendizado de Maquina Aplicados a seus Metadados. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Karina Sayuri Hagiwara

RICARTE, I. L. M.; SILVA, C. G.;Dias, Ulisses. Tecnologias da Web Semantica no Acesso e Uso à Informacao Aberta. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: João Victor Ignacio

BERTINI JUNIOR, J. R.; COELHO, G. P.;Dias, Ulisses. Analise de Tecnicas de Reducao de Ruidos em Conjuntos de Dados para Tarefa de Classificacao utilizando Arvores de Decisao e Maquinas de Suporte de Vetores. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Gabriel Paulo Turato

SILVA, C. G.; COELHO, G. P.;Dias, Ulisses. Desenvolvimento de Ferramenta de Visualizacao de Informacao para Apoio a Assimilacao de Dados em Processo de Desenvolvimento e Gerenciamento de Reservatorios de Petroleo. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Daniel Rodrigues De Biasi

COELHO, G. P.; VILELA, P.;Dias, Ulisses. Software para Gerenciamento e Acompanhamento de Consultas Odontologicas. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: André Luiz Rodrigues Estevam

Dias, Ulisses; COELHO, G. P.; BUENO, J.. Investimento Automatizado em Acoes: Estudo de Caso da Tecnica Long&Short. 2019 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Felipe Muhamed Ávila

A SANTOS, T. S.;Dias, Ulisses. Aplicacao de Internet das Coisas em Sistemas Autonomos Inteligentes. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Leandro Ferreira do Nascimento Junior

Dias, Ulisses; CARVALHO, M. A.; PEDRO, P. S. M.. Gamificacao para Estudo de Partituras Musicais. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Isadora Fonseca Garcia e Fernanda Martins Gravena

Dias, Ulisses; SILVA, A. E. A.; BARBOSA, V.. Aprendizado de Maquina para Deteccao de Explosoes Solares. 2018 - Università Campus Bio-Medico di Roma.

Aluno: Marco Sievers de Almeida

RICARTE, I. L. M.; COELHO, G. P.;Dias, Ulisses. Um Estudo sobre a Analise de Desempenho de Software no Ensino de Graduacao. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Caroline Resende Silveira

HIDALGO, I. G.;Dias, Ulisses; ROCHA, T.. Analise de Sensibilidade Aplicada ao Planejamento de Producao do Setor Sucroalcooleiro. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Rafael Demasi de Carvalho

CARVALHO, M. A.; VILELA, P.;Dias, Ulisses. A Interseccao da Tecnologia e da Arte: Captacao de Audio e Video para Producao de Efeitos. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Maria Victória da Silva

Dias, Ulisses; BUENO, J.; MEIRA, L. A. A.. Ferramenta de Predicao de Valores de Acoes de Renda Variavel. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Luan Carlos Martins dos Santos

Dias, Ulisses; RUNGE, C. J. R.; URSINI, E. L.. Solucao de Marketing Mobile para Lojas de Pequeno Porte. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Vitor Artoni de Marcio e Ana Carolina Guijarro Pedroso

Dias, Ulisses; ZAMBON, A. C.; BAIOCO, G. B.. Arcabouco para Sistema de Feedback Academico. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Erik Augusto Drago

Dias, Ulisses; BERTINI JUNIOR, J. R.; MEIRA, L. A. A.. Aplicativo para Determinacao de Concentracao de Compostos em Solucao Aquosa. 2018 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Douglas Corrêa de Araújo

Dias, Ulisses; COELHO, G. P.; SILVA, A. E. A.. Ferramenta de seleção de atributos utilizando algoritmo evolutivo com aplicação em previsão de explosões solares. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Luis Antonio Coelho

BUENO, J.;Dias, Ulisses. Em direção a uma Criptografia RSA Gaussiana. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Danilo André de Oliveira

BORGES, M. A. F.; CARVALHO, M. A. G.;Dias, Ulisses. Dinâmica e Apoio Escolar usando a Ferramenta Lego Mindstorms. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Renata Machado Guidali

Dias, Ulisses; COELHO, G. P.; BORGES, M. A. F.. Desenvolvimento de Aplicativo Dedicado a Automacao Residencial. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Gustavo Basso

Dias, Ulisses; BORGES, M. A. F.; NUNES, P. I. G.. O Gerenciamento de Projetos sob A Otica Do PMI e do SCRUM. 2017. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Natalia Calcina

ANGELIS, A. F.;Dias, Ulisses; RIBEIRO, L. C. L. J.. Caracterizacao do Consumo de Agua Urbano. 2017.

Aluno: Leonardo Peixoto Pinto de Carvalho e Felipe Amorim Silva

Dias, Ulisses; RUNGE, C. J. R.; BAIOCO, G. B.. Aplicativo Movel para Interacao entre os Membros da Faculdade de Tecnologia da Unicamp. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Ricardo Guiotto Favero

BAIOCO, G. B.; CAMOLESI JUNIOR, L.;Dias, Ulisses. Software de Integracao para Auditoria de Licitacao junto ao Tribunal de Contas do Estado de Sao Paulo. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Hector Gabriel Encinas

COELHO, G. P.; SILVA, C. G.;Dias, Ulisses. Sistema de Gerenciamento de Acervos Musicais. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Gabriella N

ZAMBON, A. C.; VILELA, P.;Dias, Ulisses. Barbosa Caio V. C. G. Forchesatto.Implementacao de Software para Identificacao de Estilos de Aprendizagem por Meio de VARK. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Erick Yuu Higaki

Dias, Ulisses; MEIRA, L. A. A.; PEDRO, P. S. M.. Correção Automática de Gabaritos via Segmentação de Imagens no Sistema Android. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Brandon Caires Nelsen

SILVA, C. G.; CAMOLESI JUNIOR, L.;Dias, Ulisses. Representacao de Reprovacao e Co-Requisitos no CourseViewer. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Diego Stewart Bueno Paulino

BORGES, M. A. F.; NUNES, P. I. G.;Dias, Ulisses. Um Estudo de Caso da Metodologia Scrum em um Pequeno Projeto. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Amanda Oliveira Santos e Adriel Cespedes Gamboa Aguirre

Dias, Ulisses; MEIRA, L. A. A.; BORGES, M. A. F.. Desenvolvimento de Aplicativo para Apoiar Docentes em Avaliacoes. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

Aluno: Fernando Zabin Santos

CARVALHO, M. A.; MEIRA, L. A. A.;Dias, Ulisses. Gamificacao: Um Estudo de Caso no Controle Biologico de Pragas na Agricultura. 2017 - Universidade Estadual de Campinas.

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Comissão julgadora das bancas

Roberta Vilhena Vieira Lopes

LOPES, R. V. V.; Almeida, E. S.. Predição da Função das Proteínas sem Alinhamento Usando Máquina de Vetor de Suporte. 2007. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional de Conhecimento) - Universidade Federal de Alagoas.

Maria Emília Machado Telles Walter

DIAS, ZanoniMEIDANIS, JoãoTELLES, Guilherme PimentelWALTER, M. E. M. T.. Heurísticas para problemas de rearranjo de genomas. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Doutorado em Ciência da Computação - UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas.

Guilherme Pimentel Telles

Zanoni DiasGuilherme P. Telles; João C. Setubal;João MeidanisNalvo F. Almeida. Problemas de comparação de genomas. 2012. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

Guilherme Pimentel Telles

João MeidanisMaria E. M. T. WalterGuilherme P. Telles. Heurísticas para problemas de rearranjo de genomas. 2009. Exame de qualificação (Doutorando em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

Nalvo Franco de Almeida Junior

DIAS, Z.;SETUBAL, J. C.; Meidanis, J.;Almeida, N.F.TELLES, Guilherme Pimentel. Problemas de comparação de genomas. 2011. Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas.

João Carlos Setubal

Dias, ZanoniAlmeida, Nalvo FTELLES, G.; MEIDANIS, J.;Setubal, Joao C. Problemas de Comparação de Genomas. 2012. Tese (Doutorado em Doutorado em Ciência da Computação - UNICAMP) - Universidade Estadual de Campinas.

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Orientou

Jonas Bodê

A definir; ; Início: 2018; Dissertação (Mestrado profissional em TECNOLOGIA) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

Bruno Silvério de Freitas

A definir; ; Início: 2018; Dissertação (Mestrado profissional em TECNOLOGIA) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

Eduardo Manarin Daguano

A definir; Início: 2017; Dissertação (Mestrado profissional em TECNOLOGIA) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

Tiago Silva Corrêa

A definir; ; Início: 2018; Tese (Doutorado em TECNOLOGIA) - Universidade Estadual de Campinas; (Orientador);

Andre Rodrigues Oliveira

Modelos Restritos e Intergênicos para a Ordenação por Reversões e Transposições; 2017; Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior; Coorientador: Ulisses Martins Dias;

Rafael Mazzoli Camargo

Desenvolvimento de Sistema para Buffet; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Caroline Vicente da Silva

Agrupamento de Politicos por meio de Text Mining; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

André Luiz Rodrigues Estevam

Investimento Automatizado em Ações; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Allan Thales Amaral de Pontes

"Allergometrics - Aplicativo para Escore Clinico em Alergia e Imunologia Pediatrica; 2019; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Isadora Fonseca Garcia

Aprendizado de Máquina para Detecção de Explosões Solares; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Fernanda Martins Gravena

Aprendizado de Máquina para Detecção de Explosões Solares; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Leandro Ferreira do Nascimento Jr

Gamificação para Estudo de Partituras Musicais; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Erik Augusto Drago

Aplicativo para determinação de concentração de compostos em solução aquosa; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Maria Victória da Silva

Ferramenta de Predição de Valores de Ações de Renda Variável; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Vitor Artoni de Marcio

Vitor Artoni de Marcio; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Ana Carolina Guijarro Pedroso

Arcabouço para sistema de feedback acadêmico; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Luan Carlos Martins dos Santos

Aplicativo de Folha Comercial; 2018; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Telecomunicações) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Gustavo Basso

O Gerenciamento de Projetos sob a Ótica do PMI e do Scrum; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Renata Machado Guidali

Desenvolvimento de Aplicativo para Automação Residencial Dedicada; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Allan Thales Amaral de Pontes

PocketLab - Plataforma para Criação de Laboratórios de Análise de Sinais em Dispositivos Móveis; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Victor Augusto dal Ava Gabriel

Framework de Automação Residencial usando Ferramentas de Baixo Custo; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Lucas Rodriguez Braghetti

Framework de Automação Residencial usando Ferramentas de Baixo Custo; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Leonardo Peixoto Pinto de Carvalho

Aplicativo Móvel para Facilitar a Interação dos Membros da Faculdade de Tecnologia da Unicamp com a Instituição; ; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Felipe Amorim Silva

Aplicativo Móvel para Facilitar a Interação dos Membros da Faculdade de Tecnologia da Unicamp com a Instituição; ; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Erick Yuu Higaki

Correção Automática de Gabaritos via Segmentação de Imagens em Sistemas Android; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Adriel Cespedes Gamboa Aguirre

Desenvolvimento de Aplicativo para Apoiar Docentes em Avaliações; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Amanda Oliveira Santos

Desenvolvimento de Aplicativo para Apoiar Docentes em Avaliações; 2017; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Davi Carnaúba de Lima Vieira e Carlos Eduardo Peixoto

Automatização de Processos utilizando Redes Neurais Artificiais; 2007; Trabalho de Conclusão de Curso; (Graduação em Ciência da Computação) - Faculdade Alagoana de Administração; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Ivo Queiroz de Oliveira Pereira

Sensores de Dispositivos Móveis e seu uso em Processamento de Sinais; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Análise e Desenvolvimento de Sistemas) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Erik Augusto Drago

Ferramenta portátil para determinação de compostos em solução aquosa; 2017; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Caroline Resende Silveira

Problemas de Distância de Rearranjo de Genomas; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ulisses Martins Dias;

Leandro Ferreira do Nascimento Junior

Desenvolvimento de uma Ferramenta de Auxílio ao Ensino de Música; 2016; Iniciação Científica; (Graduando em Sistemas de Informação) - Universidade Estadual de Campinas, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico; Orientador: Ulisses Martins Dias;

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Foi orientado por

Roberta Vilhena Vieira Lopes

Predição da Função das Proteínas Sem Alinhamento Usando Máquina de Vetor de Suporte; 2007; Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional de Conhecimento) - Universidade Federal de Alagoas,; Orientador: Roberta Vilhena Vieira Lopes;

Zanoni Dias

Problemas de Comparação de Genomas; 2012; Tese (Doutorado em Ciência da Computação) - Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Orientador: Zanoni Dias;

Zanoni Dias

2015; Universidade Estadual de Campinas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo; Zanoni Dias;

Eliana Silva de Almeida

Predição da função das proteínas sem alinhamentos usando máquinas de vetor de suporte; 2007; Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional de Conhecimento) - Universidade Federal de Alagoas, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas; Coorientador: Eliana Silva de Almeida;

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Produções bibliográficas

  • Brito, Klairton Lima ; Oliveira, Andre Rodrigues ; Dias, Ulisses ; Dias, Zanoni . Heuristics for the Reversal and Transposition Distance Problem. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics , v. 17, p. 2-13, 2020.

  • Brito, Klairton Lima ; JEAN, GÉRALDINE ; FERTIN, GUILLAUME ; Oliveira, Andre Rodrigues ; Dias, Ulisses ; Dias, Zanoni . Sorting by Genome Rearrangements on Both Gene Order and Intergenic Sizes. Journal of Computational Biology , v. 27, p. 156-174, 2020.

  • OLIVEIRA, ANDRE R. ; JEAN, GÉRALDINE ; FERTIN, GUILLAUME ; Dias, Ulisses ; Dias, Zanoni . Super short operations on both gene order and intergenic sizes. Algorithms for Molecular Biology , v. 14, p. 1-17, 2019.

  • DIAS, DANIELLE ; Dias, Ulisses ; MENINI, NATHALIA ; LAMPARELLI, RUBENS ; LE MAIRE, GUERRIC ; DA S. TORRES, RICARDO . Image-Based Time Series Representations for Pixelwise Eucalyptus Region Classification: A Comparative Study. IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters , v. P.99, p. 1-5, 2019.

  • OLIVEIRA, A. R. ; BRITO, KLAIRTON LIMA ; DIAS, U. ; DIAS, ZANONI . On the Complexity of Sorting by Reversals and Transpositions Problems. Journal of Computational Biology , v. 26, p. 1223-1229, 2019.

  • OLIVEIRA, A. R. ; LIMA BRITO, KLAIRTON ; DIAS, ZANONI ; DIAS, U. . Sorting by Weighted Reversals and Transpositions. Journal of Computational Biology , v. 26, p. 420-431, 2019.

  • ARRUDA, THIAGO DA SILVA ; Dias, Ulisses ; Dias, Zanoni . A GRASP-Based Heuristic for the Sorting by Length-Weighted Inversions Problem. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics , v. 15, p. 352-363, 2018.

  • OLIVEIRA, A. R. ; FERTIN, GUILLAUME ; DIAS, U. ; DIAS, ZANONI . Sorting signed circular permutations by super short operations. Algorithms for Molecular Biology , v. 13, p. 13-16, 2018.

  • Oliveira, A. R. ; Dias, Ulisses ; Dias, Z . On the Sorting by Reversals and Transpositions Problem. JOURNAL OF UNIVERSAL COMPUTER SCIENCE , v. 23, p. 868-906, 2017.

  • Dias, Zanoni ; Dias, Ulisses . Sorting by Prefix Reversals and Prefix Transpositions. DISCRETE APPLIED MATHEMATICS , v. 181, p. 78-89, 2015.

  • BAUDET, CHRISTIAN ; Dias, Ulisses ; Dias, Zanoni . Sorting by weighted inversions considering length and symmetry. BMC BIOINFORMATICS , v. 16, p. S3, 2015.

  • DIAS, U. ; GALVAO, G. R. ; LINTZMAYER, C. N. ; DIAS, Z. . A general heuristic for genome rearrangement problems. Journal of Bioinformatics and Computational Biology , v. 12, p. 1450012, 2014.

  • Dias, Ulisses ; Dias, Zanoni . HEURISTICS FOR THE TRANSPOSITION DISTANCE PROBLEM. Journal of Bioinformatics and Computational Biology , v. 11, p. 1350013, 2013.

  • Dias, Zanoni ; DIAS, U. ; Setubal, Joao C . SIS: a program to generate draft genome sequence scaffolds for prokaryotes. BMC BIOINFORMATICS , v. 13, p. 96, 2012.

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Projetos de pesquisa

  • 2017 - Atual

    Estudo de Distâncias de Rearranjos de Genomas em Problemas que Consideram Reversões e Transposições, Descrição: O projeto está inserido na área de Rearranjo de Genomas. Rearranjos de genomas são mutações que afetam grandes porções do genoma de um organismo. Na maioria dos casos, computar uma distância entre genomas considerando rearranjos de genomas resultam em problemas NP-Completos. Dois rearranjos de genomas conhecidos são reversões e transposições. Reversões ocorrem quando um segmento do genoma é cortado e inserido no mesmo lugar, mas invertido com relação à posição original. Transposições ocorrem quando um segmento do genoma é cortado e inserido em outra posição, com a ordem do segmento permanecendo a mesma. Existe uma grande quantidade de trabalhos para computar uma distância entre dois genomas considerando apenas reversões, e apenas transposições. Entretanto, muito menos trabalhos visam computar distância entre dois genomas considerando ao mesmo tempo reversões e transposições, sendo este um problema para o qual não é conhecida a complexidade. O foco do presente projeto de pesquisa está em heurísticas, algoritmos e provas formais para o problema de distância entre genomas quando reversões e transposições são permitidas.. , Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . , Integrantes: Ulisses Martins Dias - Coordenador / Zanoni Dias - Integrante., Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.

  • 2015 - Atual

    Problemas de Rearranjos de Genomas: Algoritmos e Complexidades, Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Doutorado: (6) . , Integrantes: Ulisses Martins Dias - Integrante / Zanoni Dias - Coordenador / João Meidanis - Integrante / Cleber Mira - Integrante / Guillaume Fertin - Integrante / Anthony Labarre - Integrante / Géraldine Jean - Integrante / Stéphane Vialette - Integrante., Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Cooperação / COFECUB - Cooperação.

  • 2013 - 2015

    Problemas de Distância de Rearranjo de Genomas, Descrição: Este projeto de pesquisa estuda um grupo de problemas NP-Difíceis ou de complexidade desconhecida relacionados à área de rearranjo de genomas. Nesse contexto, estamos interessados no estudo de heurísticas, provas e fatores de aproximação para os referidos problemas.. , Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. , Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . , Integrantes: Ulisses Martins Dias - Integrante / Zanoni Dias - Coordenador.

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Prêmios

2012

Highly Accessed Paper - "SIS: a program to generate draft genome sequence scaffolds for prokaryotes", BMC Bioinformatics.

2009

Thirt best full paper award of the BSB 2009, IV Brazilian Symposium on Bioinformatics.

Histórico profissional

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Endereço profissional

  • Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Tecnologia. , Rua Paschoal Marmo, Jardim Piratininga, 13484332 - Limeira, SP - Brasil, Telefone: (19) 983841800

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Experiência profissional

2015 - Atual

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: Servidor Público, Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.

2015 - 2015

Universidade Estadual de Campinas

Vínculo: , Enquadramento Funcional: Professor Doutor, Carga horária: 12

Atividades

  • 02/2018

    Conselhos, Comissões e Consultoria, Faculdade de Tecnologia, .,Cargo ou função, Membro da Comissão de Graduação.

  • 08/2018 - 12/2018

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, SI700 - Programação para Dispositivos Móveis, SI202 - Resolução de Problemas I

  • 03/2018 - 07/2018

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, SI010 - Estrutura de Dados II, SI700 - Programação para Dispositivos Móveis, TT004 - Tópicos em Sistemas de Informação IV

  • 03/2018 - 07/2018

    Ensino, TECNOLOGIA, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, FT045 - Tópicos em Tecnologia para a Informação I, FT060 - Matemática Discreta

  • 08/2017 - 12/2017

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, SI201 - Estrutura de Dados I, SI700 - Programação para Dispositivos Móveis

  • 08/2017 - 12/2017

    Ensino, TECNOLOGIA, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, FT043 - Tópicos em Tecnologia para a Informação I

  • 03/2017 - 07/2017

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, SI010 - Estrutura de Dados II, SI700 - Programação para Dispositivos Móveis, SI704 - Seminários II

  • 03/2017 - 07/2017

    Ensino, TECNOLOGIA, Nível: Pós-Graduação,Disciplinas ministradas, FT045 - Tópicos em Tecnologia para Informação II

  • 08/2016 - 12/2016

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, SI700 - Programação para Dispositivos Móveis, ST464 - Laboratório de Estrutura de Dados

  • 03/2016 - 07/2016

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, SI010 - Estrutura de Dados II, SI700 - Programação para Dispositivos Móveis, TT060 - Gestão de Projetos

  • 08/2015 - 12/2015

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, ST562 - Estrutura de Arquivos, ST662 - Linguagem e Técnicas de Programação III, SI700 - Programação para Dispositivos Móveis

  • 03/2015 - 07/2015

    Ensino, Sistemas de Informação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, SI010 - Estrutura de Dados II, SI100 - Fundamentos de Sistemas de Informação, TT-060 - Gestão de Projetos, TT001 - Tópicos em Sistemas de Informação

2006 - 2006

Faculdade Alagoana de Administração

Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Professor de Graduação, Carga horária: 5

Atividades

  • 03/2006 - 12/2006

    Ensino, Ciência da Computação, Nível: Graduação,Disciplinas ministradas, Compiladores, Inteligência Artificial II, Inteligência Artificial I

2002 - 2004

Universidade Federal do Pará

Vínculo: Bolsista de Graduação, Enquadramento Funcional: Aluno Orientado, Carga horária: 20

Outras informações:
Projeto do Centro de Lingüística para criação de um Curso Virtual de Línguas Estrangeiras (www.cursoslivresonline.com.br) coordenado pela Professora Dra. Megan Parry de Castro Duque Estrada

2001 - 2002

Universidade Federal do Pará

Vínculo: Bolsista de Graduação, Enquadramento Funcional: Aluno Orientado, Carga horária: 30

Outras informações:
Participação no Projeto de Iniciação Acadêmica (Proint 2001) coordenado pelo Professor Dr. Antônio Benedito Coimbra Sampaio sob o título: "Tecnologias na WEB para a Educação à Distância na UFPA"

Atividades

  • 07/2002 - 07/2004

    Estágios , CLIVRES, .,Estágio realizado, Curso Virtual de Línguas Estrangeiras.

  • 05/2001 - 06/2002

    Estágios , PROINT, .,Estágio realizado, Tecnologias na Web para a Educação a Distância na UFPA.